Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-196b-5p | NS5A |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0001080 | NS5A |
Organism | Homo sapiens | Hepacivirus C (Hepatitis C virus JFH-1,HCV) |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | - |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | |||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-196b-5p |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-196b-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ncDR | hsa-miR-196b-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNAInter | hsa-miR-196b-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID |
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NoncoRNA | hsa-miR-196b-5p |
Interactor1: hsa-miR-196b-5p | Interactor2: NS5A |
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Strong-Evidence | Luciferase reporter assay//qPCR//qRT-PCR//Western blot | |
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Weak-Evidence | Microarray | |
Prediction-Evidence | Targetscan | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 17943132 | Target region | NS5A CDS |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | Upregulation |
Tissue or cell line | Huh7 cells//Huh7.5.1c2 cells//JFH-1 cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | As anticipated, miR-196 was effective against JFH1, but not against J6/JFH, which contained the 'mutant' target site. Similarly, miR-448 only inhibited the replication of JFH1 containing the 'correct' target site, but was ineffective against J6/JFH (Fig. 3b). |