Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00108421

  Virus:  

SARS-CoV-2 (NC_045512.2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-548d-5p:           SAMD8:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-548d-5p SAMD8
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0004812 142891
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - HEL-177//SMSr

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-548d-5p
rs1240978917 chr8:123348085    G/A
rs1370161434 chr8:123348096    C/A
rs1423052174 chr8:123348086    G/A
rs1039169216 chr17:67471540    G/A
rs1039169216 chr17:67471540    G/T
rs543252291 chr17:67471553    A/G
rs1196924094 chr8:123348101    A/G
rs756308753 chr8:123348103    T/C
rs768094101 chr17:67471554    T/G
rs899430888 chr17:67471556    A/T

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR SAMD8
chr10:76894633(+) A-I      intronic
chr10:76876680(+) A-I      intronic
chr10:76882326(+) A-I      intronic
chr10:76877089(+) A-I      intronic
chr10:76930612(+) A-I      intronic
chr10:76940059(+) A-I      3'UTR
chr10:76882256(+) A-I      intronic
chr10:76878259(+) A-I      intronic
chr10:76878244(+) A-I      intronic
chr10:76940161(+) A-I      3'UTR
chr10:76913300(+) A-I      intronic
chr10:76898822(+) A-I      intronic
chr10:76894639(+) A-I      intronic
chr10:76878226(+) A-I      intronic
chr10:76930636(+) A-I      intronic
chr10:76931528(+) A-I      intronic
chr10:76877253(+) A-I      intronic
chr10:76915874(+) A-I      intronic
chr10:76882299(+) A-I      intronic
chr10:76913304(+) A-I      intronic
chr10:76877239(+) A-I      intronic
chr10:76930626(+) A-I      intronic
chr10:76915923(+) A-I      intronic
chr10:76931536(+) A-I      intronic
chr10:76882292(+) A-I      intronic
chr10:76877240(+) A-I      intronic
chr10:76915893(+) A-I      intronic
chr10:76882214(+) A-I      intronic
chr10:76931527(+) A-I      intronic
chr10:76931549(+) A-I      intronic
chr10:76938707(+) A-I      3'UTR
chr10:76878251(+) A-I      intronic
chr10:76940212(+) A-I      3'UTR
chr10:76940162(+) A-I      3'UTR
chr10:76932304(+) A-I      intronic
chr10:76895536(+) A-I      intronic
chr10:76895406(+) A-I      intronic
chr10:76875974(+) A-I      intronic
chr10:76932192(+) A-I      intronic
chr10:76932153(+) A-I      intronic
chr10:76913216(+) A-I      intronic
chr10:76931768(+) A-I      intronic
chr10:76931510(+) A-I      intronic
chr10:76931704(+) A-I      intronic
chr10:76918999(+) A-I      intronic
chr10:76931664(+) A-I      intronic
chr10:76931663(+) A-I      intronic
chr10:76879089(+) A-I      intronic
chr10:76931657(+) A-I      intronic
chr10:76923321(+) A-I      intronic
chr10:76931581(+) A-I      intronic
chr10:76889257(+) A-I      intronic
chr10:76889227(+) A-I      intronic
chr10:76889184(+) A-I      intronic
chr10:76889128(+) A-I      intronic
chr10:76888262(+) A-I      intronic
chr10:76888160(+) A-I      intronic
chr10:76879042(+) A-I      intronic
chr10:76888091(+) A-I      intronic
chr10:76888084(+) A-I      intronic
chr10:76886892(+) A-I      intronic
chr10:76886891(+) A-I      intronic
chr10:76888014(+) A-I      intronic
chr10:76931199(+) A-I      intronic
chr10:76886826(+) A-I      intronic
chr10:76884283(+) A-I      intronic
chr10:76886800(+) A-I      intronic
chr10:76886315(+) A-I      intronic
chr10:76884218(+) A-I      intronic
chr10:76884206(+) A-I      intronic
chr10:76884146(+) A-I      intronic
chr10:76887924(+) A-I      intronic
chr10:76931161(+) A-I      intronic
chr10:76893050(+) A-I      intronic
chr10:76931132(+) A-I      intronic
chr10:76884124(+) A-I      intronic
chr10:76883738(+) A-I      intronic
chr10:76882321(+) A-I      intronic
chr10:76882244(+) A-I      intronic
chr10:76901806(+) A-I      intronic
chr10:76931005(+) A-I      intronic
chr10:76882141(+) A-I      intronic
chr10:76929624(+) A-I      intronic
chr10:76917654(+) A-I      intronic
chr10:76877296(+) A-I      intronic
chr10:76887970(+) A-I      intronic
chr10:76929617(+) A-I      intronic
chr10:76928809(+) A-I      intronic
chr10:76882106(+) A-I      intronic
chr10:76881642(+) A-I      intronic
chr10:76880825(+) A-I      intronic
chr10:76888066(+) A-I      intronic
chr10:76888020(+) A-I      intronic
chr10:76880608(+) A-I      intronic
chr10:76928802(+) A-I      intronic
chr10:76880147(+) A-I      intronic
chr10:76880123(+) A-I      intronic
chr10:76880110(+) A-I      intronic
chr10:76880091(+) A-I      intronic
chr10:76879783(+) A-I      intronic
chr10:76879663(+) A-I      intronic
chr10:76877313(+) A-I      intronic
chr10:76879638(+) A-I      intronic
chr10:76928681(+) A-I      intronic
chr10:76879637(+) A-I      intronic
chr10:76879074(+) A-I      intronic
chr10:76878357(+) A-I      intronic
chr10:76878343(+) A-I      intronic
chr10:76912353(+) A-I      intronic
chr10:76912939(+) A-I      intronic
chr10:76878334(+) A-I      intronic
chr10:76878281(+) A-I      intronic
chr10:76878279(+) A-I      intronic
chr10:76878190(+) A-I      intronic
chr10:76877381(+) A-I      intronic
chr10:76877132(+) A-I      intronic
chr10:76877124(+) A-I      intronic
chr10:76877073(+) A-I      intronic
chr10:76877031(+) A-I      intronic
chr10:76877020(+) A-I      intronic
chr10:76877003(+) A-I      intronic
chr10:76876994(+) A-I      intronic
chr10:76875998(+) A-I      intronic
chr10:76875654(+) A-I      intronic
chr10:76875510(+) A-I      intronic
chr10:76927872(+) A-I      intronic
chr10:76875466(+) A-I      intronic
chr10:76874049(+) A-I      intronic
chr10:76873852(+) A-I      intronic
chr10:76873816(+) A-I      intronic
chr10:76927855(+) A-I      intronic
chr10:76927586(+) A-I      intronic
chr10:76927414(+) A-I      intronic
chr10:76927412(+) A-I      intronic
chr10:76883596(+) A-I      intronic
chr10:76927068(+) A-I      intronic
chr10:76894214(+) A-I      intronic
chr10:76881589(+) A-I      intronic
chr10:76925667(+) A-I      intronic
chr10:76925484(+) A-I      intronic
chr10:76925417(+) A-I      intronic
chr10:76932688(+) A-I      intronic
chr10:76924794(+) A-I      intronic
chr10:76923738(+) A-I      intronic
chr10:76923730(+) A-I      intronic
chr10:76887930(+) A-I      intronic
chr10:76923715(+) A-I      intronic
chr10:76927108(+) A-I      intronic
chr10:76923699(+) A-I      intronic
chr10:76923272(+) A-I      intronic
chr10:76922882(+) A-I      intronic
chr10:76875449(+) A-I      intronic
chr10:76918256(+) A-I      intronic
chr10:76899992(+) A-I      intronic
chr10:76927523(+) A-I      intronic
chr10:76918164(+) A-I      intronic
chr10:76918163(+) A-I      intronic
chr10:76918144(+) A-I      intronic
chr10:76894669(+) A-I      intronic
chr10:76912517(+) A-I      intronic
chr10:76901015(+) A-I      intronic
chr10:76876769(+) A-I      intronic
chr10:76932138(+) A-I      intronic
chr10:76880050(+) A-I      intronic
chr10:76929546(+) A-I      intronic
chr10:76884172(+) A-I      intronic
chr10:76918121(+) A-I      intronic
chr10:76918111(+) A-I      intronic
chr10:76917797(+) A-I      intronic
chr10:76898767(+) A-I      intronic
chr10:76917774(+) A-I      intronic
chr10:76922758(+) A-I      intronic
chr10:76917770(+) A-I      intronic
chr10:76922179(+) A-I      intronic
chr10:76922100(+) A-I      intronic
chr10:76921956(+) A-I      intronic
chr10:76917732(+) A-I      intronic
chr10:76900847(+) A-I      intronic
chr10:76917728(+) A-I      intronic
chr10:76913000(+) A-I      intronic
chr10:76923811(+) A-I      intronic
chr10:76923770(+) A-I      intronic
chr10:76917716(+) A-I      intronic
chr10:76921675(+) A-I      intronic
chr10:76915871(+) A-I      intronic
chr10:76876943(+) A-I      intronic
chr10:76887976(+) A-I      intronic
chr10:76919036(+) A-I      intronic
chr10:76918275(+) A-I      intronic
chr10:76918271(+) A-I      intronic
chr10:76918270(+) A-I      intronic
chr10:76922260(+) A-I      intronic
chr10:76914870(+) A-I      intronic
chr10:76914737(+) A-I      intronic
chr10:76877030(+) A-I      intronic
chr10:76876672(+) A-I      intronic
chr10:76875444(+) A-I      intronic
chr10:76879054(+) A-I      intronic
chr10:76927184(+) A-I      intronic
chr10:76913767(+) A-I      intronic
chr10:76901886(+) A-I      intronic
chr10:76925582(+) A-I      intronic
chr10:76913722(+) A-I      intronic
chr10:76881554(+) A-I      intronic
chr10:76913715(+) A-I      intronic
chr10:76888011(+) A-I      intronic
chr10:76913705(+) A-I      intronic
chr10:76913622(+) A-I      intronic
chr10:76887948(+) A-I      intronic
chr10:76913566(+) A-I      intronic
chr10:76913293(+) A-I      intronic
chr10:76912809(+) A-I      intronic
chr10:76913278(+) A-I      intronic
chr10:76913154(+) A-I      intronic
chr10:76894294(+) A-I      intronic
chr10:76880668(+) A-I      intronic
chr10:76912975(+) A-I      intronic
chr10:76912949(+) A-I      intronic
chr10:76877174(+) A-I      intronic
chr10:76912923(+) A-I      intronic
chr10:76895398(+) A-I      intronic
chr10:76912869(+) A-I      intronic
chr10:76915825(+) A-I      intronic
chr10:76912839(+) A-I      intronic
chr10:76912378(+) A-I      intronic
chr10:76912361(+) A-I      intronic
chr10:76894996(+) A-I      intronic
chr10:76911656(+) A-I      intronic
chr10:76911647(+) A-I      intronic
chr10:76911173(+) A-I      intronic
chr10:76902945(+) A-I      intronic
chr10:76883666(+) A-I      intronic
chr10:76894690(+) A-I      intronic
chr10:76901911(+) A-I      intronic
chr10:76912783(+) A-I      intronic
chr10:76889982(+) A-I      intronic
chr10:76931505(+) A-I      intronic
chr10:76901906(+) A-I      intronic
chr10:76894680(+) A-I      intronic
chr10:76890021(+) A-I      intronic
chr10:76928808(+) A-I      intronic
chr10:76894672(+) A-I      intronic
chr10:76898775(+) A-I      intronic
chr10:76901871(+) A-I      intronic
chr10:76901506(+) A-I      intronic
chr10:76901481(+) A-I      intronic
chr10:76890074(+) A-I      intronic
chr10:76890144(+) A-I      intronic
chr10:76892891(+) A-I      intronic
chr10:76900872(+) A-I      intronic
chr10:76898929(+) A-I      intronic
chr10:76898916(+) A-I      intronic
chr10:76898858(+) A-I      intronic
chr10:76915763(+) A-I      intronic
chr10:76923895(+) A-I      intronic
chr10:76876070(+) A-I      intronic
chr10:76932653(+) A-I      intronic
chr10:76886313(+) A-I      intronic
chr10:76893005(+) A-I      intronic
chr10:76932627(+) A-I      intronic
chr10:76882498(+) A-I      intronic
chr10:76898848(+) A-I      intronic
chr10:76932478(+) A-I      intronic
chr10:76900831(+) A-I      intronic
chr10:76932439(+) A-I      intronic
chr10:76884291(+) A-I      intronic
chr10:76879177(+) A-I      intronic
chr10:76873255(+) A-I      intronic
chr10:76898820(+) A-I      intronic
chr10:76898737(+) A-I      intronic
chr10:76898818(+) A-I      intronic
chr10:76883677(+) A-I      intronic
chr10:76932113(+) A-I      intronic
chr10:76876102(+) A-I      intronic
chr10:76933952(+) A-I      intronic
chr10:76877034(+) A-I      intronic
chr10:76932430(+) A-I      intronic
chr10:76932275(+) A-I      intronic
chr10:76932108(+) A-I      intronic
chr10:76876116(+) A-I      intronic
chr10:76889179(+) A-I      intronic
chr10:76927183(+) A-I      intronic
chr10:76927779(+) A-I      intronic
chr10:76932250(+) A-I      intronic
chr10:76882225(+) A-I      intronic
chr10:76877105(+) A-I      intronic
chr10:76930684(+) A-I      intronic
chr10:76932196(+) A-I      intronic
chr10:76938712(+) A-I      3'UTR
chr10:76940236(+) A-I      3'UTR
chr10:76940252(+) A-I      3'UTR
chr10:76940073(+) A-I      3'UTR
chr10:76940233(+) A-I      3'UTR
chr10:76940290(+) A-I      3'UTR
chr10:76940171(+) A-I      3'UTR
chr10:76940174(+) A-I      3'UTR
chr10:76938532(+) A-I      3'UTR
chr10:76940160(+) A-I      3'UTR
chr10:76938667(+) A-I      3'UTR
chr10:76940068(+) A-I      3'UTR
chr10:76940156(+) A-I      3'UTR
chr10:76940094(+) A-I      3'UTR
chr10:76938666(+) A-I      3'UTR
chr10:76938866(+) A-I      3'UTR
chr10:76938553(+) A-I      3'UTR
chr10:76938696(+) A-I      3'UTR
chr10:76940065(+) A-I      3'UTR
chr10:76940098(+) A-I      3'UTR
chr10:76890010(+) A-I      intronic
chr10:76928767(+) A-I      intronic
chr10:76918095(+) A-I      intronic
chr10:76932222(+) A-I      intronic
chr10:76923444(+) A-I      intronic
chr10:76876600(+) A-I      intronic
chr10:76913218(+) A-I      intronic
chr10:76920171(+) A-I      intronic
chr10:76893014(+) A-I      intronic
chr10:76932581(+) A-I      intronic
chr10:76876991(+) A-I      intronic
chr10:76911721(+) A-I      intronic
chr10:76930631(+) A-I      intronic
chr10:76931597(+) A-I      intronic
chr10:76928675(+) A-I      intronic
chr10:76878252(+) A-I      intronic
chr10:76886494(+) A-I      intronic
chr10:76880745(+) A-I      intronic
chr10:76874029(+) A-I      intronic
chr10:76913106(+) A-I      intronic
chr10:76879705(+) A-I      intronic
chr10:76922287(+) A-I      intronic
chr10:76877125(+) A-I      intronic
chr10:76880639(+) A-I      intronic
chr10:76876697(+) A-I      intronic
chr10:76922784(+) A-I      intronic
chr10:76912429(+) A-I      intronic
chr10:76901810(+) A-I      intronic
chr10:76875957(+) A-I      intronic
chr10:76876668(+) A-I      intronic
chr10:76880736(+) A-I      intronic
chr10:76879030(+) A-I      intronic
chr10:76882260(+) A-I      intronic
chr10:76878206(+) A-I      intronic
chr10:76889188(+) A-I      intronic
chr10:76881481(+) A-I      intronic
chr10:76880678(+) A-I      intronic
chr10:76931582(+) A-I      intronic
chr10:76900833(+) A-I      intronic
chr10:76927399(+) A-I      intronic
chr10:76879176(+) A-I      intronic
chr10:76927063(+) A-I      intronic
chr10:76925611(+) A-I      intronic
chr10:76882453(+) A-I      intronic
chr10:76881475(+) A-I      intronic
chr10:76882316(+) A-I      intronic
chr10:76876752(+) A-I      intronic
chr10:76876132(+) A-I      intronic
chr10:76878147(+) A-I      intronic
chr10:76874003(+) A-I      intronic
chr10:76877355(+) A-I      intronic
chr10:76921759(+) A-I      intronic
chr10:76901573(+) A-I      intronic
chr10:76877058(+) A-I      intronic
chr10:76883549(+) A-I      intronic
chr10:76929462(+) A-I      intronic
chr10:76880603(+) A-I      intronic
chr10:76878215(+) A-I      intronic
chr10:76876749(+) A-I      intronic
chr10:76927114(+) A-I      intronic
chr10:76878237(+) A-I      intronic
chr10:76882323(+) A-I      intronic
chr10:76885221(+) A-I      intronic
chr10:76883615(+) A-I      intronic
chr10:76902863(+) A-I      intronic
chr10:76928908(+) A-I      intronic
chr10:76880632(+) A-I      intronic
chr10:76913623(+) A-I      intronic
chr10:76882211(+) A-I      intronic
chr10:76927395(+) A-I      intronic
chr10:76932654(+) A-I      intronic
chr10:76911224(+) A-I      intronic
chr10:76879733(+) A-I      intronic
chr10:76876613(+) A-I      intronic
chr10:76878985(+) A-I      intronic
chr10:76875911(+) A-I      intronic
chr10:76897243(+) A-I      intronic
chr10:76881712(+) A-I      intronic
chr10:76928950(+) A-I      intronic
chr10:76930585(+) A-I      intronic
chr10:76918965(+) A-I      intronic
chr10:76875986(+) A-I      intronic
chr10:76878174(+) A-I      intronic
chr10:76912905(+) A-I      intronic
chr10:76875443(+) A-I      intronic
chr10:76876648(+) A-I      intronic
chr10:76925492(+) A-I      intronic
chr10:76901008(+) A-I      intronic
chr10:76906208(+) A-I      intronic
chr10:76928768(+) A-I      intronic
chr10:76914871(+) A-I      intronic
chr10:76882251(+) A-I      intronic
chr10:76913265(+) A-I      intronic
chr10:76877115(+) A-I      intronic
chr10:76887934(+) A-I      intronic
chr10:76923744(+) A-I      intronic
chr10:76923767(+) A-I      intronic
chr10:76882291(+) A-I      intronic
chr10:76898812(+) A-I      intronic
chr10:76923868(+) A-I      intronic
chr10:76931637(+) A-I      intronic
chr10:76878225(+) A-I      intronic
chr10:76883706(+) A-I      intronic
chr10:76873977(+) A-I      intronic
chr10:76893110(+) A-I      intronic
chr10:76921855(+) A-I      intronic
chr10:76879569(+) A-I      intronic
chr10:76911649(+) A-I      intronic
chr10:76930632(+) A-I      intronic
chr10:76921926(+) A-I      intronic
chr10:76883541(+) A-I      intronic
chr10:76913217(+) A-I      intronic
chr10:76922822(+) A-I      intronic
chr10:76884292(+) A-I      intronic
chr10:76873990(+) A-I      intronic
chr10:76880289(+) A-I      intronic
chr10:76876803(+) A-I      intronic
chr10:76876667(+) A-I      intronic
chr10:76902250(+) A-I      intronic
chr10:76877328(+) A-I      intronic
chr10:76915705(+) A-I      intronic
chr10:76915759(+) A-I      intronic
chr10:76876766(+) A-I      intronic
chr10:76882155(+) A-I      intronic
chr10:76879052(+) A-I      intronic
chr10:76888099(+) A-I      intronic
chr10:76913760(+) A-I      intronic
chr10:76902954(+) A-I      intronic
chr10:76929592(+) A-I      intronic
chr10:76880742(+) A-I      intronic
chr10:76879767(+) A-I      intronic
chr10:76880778(+) A-I      intronic
chr10:76935487(+) A-I      intronic
chr10:76886360(+) A-I      intronic
chr10:76873950(+) A-I      intronic
chr10:76912539(+) A-I      intronic
chr10:76882303(+) A-I      intronic
chr10:76900919(+) A-I      intronic
chr10:76883523(+) A-I      intronic
chr10:76923458(+) A-I      intronic
chr10:76935360(+) A-I      intronic
chr10:76923216(+) A-I      intronic
chr10:76878188(+) A-I      intronic
chr10:76875425(+) A-I      intronic
chr10:76902336(+) A-I      intronic
chr10:76931568(+) A-I      intronic
chr10:76875996(+) A-I      intronic
chr10:76882250(+) A-I      intronic
chr10:76888053(+) A-I      intronic
chr10:76920751(+) A-I      intronic
chr10:76912575(+) A-I      intronic
chr10:76915894(+) A-I      intronic
chr10:76931596(+) A-I      intronic
chr10:76895463(+) A-I      intronic
chr10:76878193(+) A-I      intronic
chr10:76913261(+) A-I      intronic
chr10:76933936(+) A-I      intronic
chr10:76877211(+) A-I      intronic
chr10:76881567(+) A-I      intronic
chr10:76914833(+) A-I      intronic
chr10:76884228(+) A-I      intronic
chr10:76884170(+) A-I      intronic
chr10:76876138(+) A-I      intronic
chr10:76932395(+) A-I      intronic
chr10:76877060(+) A-I      intronic
chr10:76931627(+) A-I      intronic
chr10:76873232(+) A-I      intronic
chr10:76913640(+) A-I      intronic
chr10:76915722(+) A-I      intronic
chr10:76876831(+) A-I      intronic
chr10:76914744(+) A-I      intronic
chr10:76932109(+) A-I      intronic
chr10:76890050(+) A-I      intronic
chr10:76922787(+) A-I      intronic
chr10:76932528(+) A-I      intronic
chr10:76880764(+) A-I      intronic
chr10:76880704(+) A-I      intronic
chr10:76914731(+) A-I      intronic
chr10:76879568(+) A-I      intronic
chr10:76920679(+) A-I      intronic
chr10:76923468(+) A-I      intronic
chr10:76882145(+) A-I      intronic
chr10:76882421(+) A-I      intronic
chr10:76877272(+) A-I      intronic
chr10:76932161(+) A-I      intronic
chr10:76879016(+) A-I      intronic
chr10:76918886(+) A-I      intronic
chr10:76879149(+) A-I      intronic
chr10:76903005(+) A-I      intronic
chr10:76931573(+) A-I      intronic
chr10:76883502(+) A-I      intronic
chr10:76876707(+) A-I      intronic
chr10:76886769(+) A-I      intronic
chr10:76913662(+) A-I      intronic
chr10:76912840(+) A-I      intronic
chr10:76923467(+) A-I      intronic
chr10:76931625(+) A-I      intronic
chr10:76889124(+) A-I      intronic
chr10:76932232(+) A-I      intronic
chr10:76928727(+) A-I      intronic
chr10:76920735(+) A-I      intronic
chr10:76914872(+) A-I      intronic
chr10:76880782(+) A-I      intronic
chr10:76928728(+) A-I      intronic
chr10:76880719(+) A-I      intronic
chr10:76923480(+) A-I      intronic
chr10:76880066(+) A-I      intronic
chr10:76882286(+) A-I      intronic
chr10:76900925(+) A-I      intronic
chr10:76880301(+) A-I      intronic
chr10:76881583(+) A-I      intronic
chr10:76884813(+) A-I      intronic
chr10:76877217(+) A-I      intronic
chr10:76912563(+) A-I      intronic
chr10:76911338(+) A-I      intronic
chr10:76876995(+) A-I      intronic
chr10:76923502(+) A-I      intronic
chr10:76924793(+) A-I      intronic
chr10:76931602(+) A-I      intronic
chr10:76912906(+) A-I      intronic
chr10:76920705(+) A-I      intronic
chr10:76923808(+) A-I      intronic
chr10:76911468(+) A-I      intronic
chr10:76918917(+) A-I      intronic
chr10:76884185(+) A-I      intronic
chr10:76912793(+) A-I      intronic
chr10:76881659(+) A-I      intronic
chr10:76930593(+) A-I      intronic
chr10:76878980(+) A-I      intronic
chr10:76914682(+) A-I      intronic
chr10:76885227(+) A-I      intronic
chr10:76927137(+) A-I      intronic
chr10:76911372(+) A-I      intronic
chr10:76878255(+) A-I      intronic
chr10:76876804(+) A-I      intronic
chr10:76912581(+) A-I      intronic
chr10:76922101(+) A-I      intronic
chr10:76873205(+) A-I      intronic
chr10:76940081(+) A-I      3'UTR
chr10:76938762(+) A-I      3'UTR
chr10:76880770(+) A-I      intronic
chr10:76927454(+) A-I      intronic
chr10:76877095(+) A-I      intronic
chr10:76883904(+) A-I      intronic
chr10:76878242(+) A-I      intronic
chr10:76877100(+) A-I      intronic
chr10:76878996(+) A-I      intronic
chr10:76893399(+) A-I      intronic
chr10:76940206(+) A-I      3'UTR
chr10:76893772(+) A-I      intronic
chr10:76880797(+) A-I      intronic
chr10:76913759(+) A-I      intronic
chr10:76880988(+) A-I      intronic
chr10:76893296(+) A-I      intronic
chr10:76940159(+) A-I      3'UTR
chr10:76883647(+) A-I      intronic
chr10:76938516(+) A-I      3'UTR
chr10:76883529(+) A-I      intronic
chr10:76940235(+) A-I      3'UTR
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED SAMD8
chr10:76893772(+) A-I intron -    22327324
chr10:76887924(+) A-I intron -    22028664
chr10:76887930(+) A-I intron -    22028664
chr10:76887943(+) A-I intron -    22028664
chr10:76887948(+) A-I intron -    22028664
chr10:76887970(+) A-I intron -    22028664
chr10:76887976(+) A-I intron -    22028664
chr10:76888011(+) A-I intron -    22028664
chr10:76888014(+) A-I intron -    22028664
chr10:76888020(+) A-I intron -    22028664
chr10:76888066(+) A-I intron -    22028664
chr10:76888099(+) A-I intron -    22028664
chr10:76941398(+) A-G intron -    21725310
chr10:76883904(+) A-G intron -    22484847
chr10:76893296(+) A-G intron -    22484847
chr10:76893399(+) A-G intron -    22484847
chr10:76876116(+) A-G intron -    22484847
chr10:76876132(+) A-G intron -    22484847
chr10:76880797(+) A-G intron -    22484847
chr10:76921926(+) A-G intron -    22484847
chr10:76923767(+) A-G intron -    22484847
chr10:76923868(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase SAMD8
chr10:76871415-76871416(+) m6A 5'UTR//CDS//intron       24981863
chr10:76871471-76871472(+) m6A 5'UTR//CDS//intron       25456834//24981863//22608085
chr10:76910322-76910323(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr10:76910377-76910378(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr10:76910476-76910477(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr10:76910608-76910609(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr10:76910648-76910649(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr10:76910698-76910699(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr10:76910722-76910723(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//22608085
chr10:76910739-76910740(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//22608085
chr10:76910829-76910830(+) m6A CDS       22608085
chr10:76936230-76936231(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//26404942//22608085
chr10:76936275-76936276(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//26404942//22608085
chr10:76936863-76936864(+) m6A 3'UTR       24981863
chr10:76936894-76936895(+) m6A 3'UTR       24981863
chr10:76936932-76936933(+) m6A 3'UTR       22608085
chr10:76936972-76936973(+) m6A 3'UTR       26404942//22608085
chr10:76940316-76940317(+) m6A 3'UTR       24981863
chr10:76940332-76940333(+) m6A 3'UTR       24981863
chr10:76940337-76940338(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-548d-5p
Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Colon cancer cell line (LIM1863)|Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
SAMD8
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HeLa-S3 cells     -
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus K562 cells     -

Related Drug Information:


Resource Symbol Drug Name PubChem
ID
Function Link  
RNAInter hsa-miR-548d-5p
Atorvastatin 60823 Drug interaction    RC00007234
D-Glucose 5793 Drug interaction    RC00007233
cis-Diaminedichloroplatinum 2767 Drug interaction    RC00007232
Resource Symbol Drug Name PubChem ID PMID
NoncoRNA hsa-miR-548d-5p

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-548d-5p
Interactor2: SAMD8

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRDB
Support Database ViRBase

References:


PMID 33201341 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line None Interactor2 expression None
Description By custom target prediction, a panel of miRNA sequences able to recognize the SARS-CoV-2 sequence was collected. Only targets with a very high score (95-100) were retained for further analyses.

Starting a new search, please wait ...