Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00108319

  Virus:  

SARS-CoV-2 (NC_045512.2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-548c-5p:           BTF3L4:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-548c-5p BTF3L4
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0004806 91408
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - -

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-548c-5p
rs1188707087 chr12:64622544    C/A
rs1188707087 chr12:64622544    C/T
rs1371697031 chr12:64622552    G/A
rs1391518567 chr12:64622541    T/C
rs750959106 chr12:64622554    C/T
rs1202383522 chr12:64622535    A/G
rs374151873 chr12:64622540    A/G
rs540698062 chr12:64622545    G/A
rs764336601 chr12:64622536    A/C

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR BTF3L4
chr1:52531660(+) A-I      intronic
chr1:52543970(+) A-I      intronic
chr1:52543946(+) A-I      intronic
chr1:52543996(+) A-I      intronic
chr1:52545587(+) A-I      intronic
chr1:52550058(+) A-I      intronic
chr1:52543837(+) A-I      intronic
chr1:52542093(+) A-I      intronic
chr1:52542086(+) A-I      intronic
chr1:52542059(+) A-I      intronic
chr1:52541976(+) A-I      intronic
chr1:52541959(+) A-I      intronic
chr1:52541955(+) A-I      intronic
chr1:52538626(+) A-I      intronic
chr1:52541962(+) A-I      intronic
chr1:52541954(+) A-I      intronic
chr1:52541949(+) A-I      intronic
chr1:52539989(+) A-I      intronic
chr1:52539949(+) A-I      intronic
chr1:52538631(+) A-I      intronic
chr1:52538572(+) A-I      intronic
chr1:52551428(+) A-I      intronic
chr1:52544999(+) A-I      intronic
chr1:52544986(+) A-I      intronic
chr1:52544981(+) A-I      intronic
chr1:52544964(+) A-I      intronic
chr1:52544940(+) A-I      intronic
chr1:52549953(+) A-I      intronic
chr1:52549929(+) A-I      intronic
chr1:52545618(+) A-I      intronic
chr1:52545600(+) A-I      intronic
chr1:52550796(+) A-I      intronic
chr1:52550797(+) A-I      intronic
chr1:52550858(+) A-I      intronic
chr1:52550865(+) A-I      intronic
chr1:52550882(+) A-I      intronic
chr1:52550890(+) A-I      intronic
chr1:52550968(+) A-I      intronic
chr1:52551272(+) A-I      intronic
chr1:52551288(+) A-I      intronic
chr1:52551293(+) A-I      intronic
chr1:52551361(+) A-I      intronic
chr1:52538553(+) A-I      intronic
chr1:52538555(+) A-I      intronic
chr1:52538615(+) A-I      intronic
chr1:52538619(+) A-I      intronic
chr1:52538682(+) A-I      intronic
chr1:52538718(+) A-I      intronic
chr1:52538911(+) A-I      intronic
chr1:52539439(+) A-I      intronic
chr1:52539505(+) A-I      intronic
chr1:52539514(+) A-I      intronic
chr1:52539563(+) A-I      intronic
chr1:52539614(+) A-I      intronic
chr1:52539656(+) A-I      intronic
chr1:52539743(+) A-I      intronic
chr1:52539757(+) A-I      intronic
chr1:52539944(+) A-I      intronic
chr1:52539969(+) A-I      intronic
chr1:52540012(+) A-I      intronic
chr1:52540129(+) A-I      intronic
chr1:52540175(+) A-I      intronic
chr1:52540181(+) A-I      intronic
chr1:52540243(+) A-I      intronic
chr1:52540302(+) A-I      intronic
chr1:52540308(+) A-I      intronic
chr1:52540663(+) A-I      intronic
chr1:52540664(+) A-I      intronic
chr1:52540676(+) A-I      intronic
chr1:52540689(+) A-I      intronic
chr1:52541045(+) A-I      intronic
chr1:52541120(+) A-I      intronic
chr1:52541409(+) A-I      intronic
chr1:52541410(+) A-I      intronic
chr1:52541436(+) A-I      intronic
chr1:52541517(+) A-I      intronic
chr1:52541963(+) A-I      intronic
chr1:52541965(+) A-I      intronic
chr1:52550779(+) A-I      intronic
chr1:52541986(+) A-I      intronic
chr1:52542087(+) A-I      intronic
chr1:52542099(+) A-I      intronic
chr1:52542589(+) A-I      intronic
chr1:52542594(+) A-I      intronic
chr1:52542610(+) A-I      intronic
chr1:52542615(+) A-I      intronic
chr1:52542628(+) A-I      intronic
chr1:52542746(+) A-I      intronic
chr1:52542748(+) A-I      intronic
chr1:52542981(+) A-I      intronic
chr1:52543049(+) A-I      intronic
chr1:52543052(+) A-I      intronic
chr1:52543056(+) A-I      intronic
chr1:52543067(+) A-I      intronic
chr1:52543093(+) A-I      intronic
chr1:52543120(+) A-I      intronic
chr1:52549803(+) A-I      intronic
chr1:52543828(+) A-I      intronic
chr1:52543864(+) A-I      intronic
chr1:52543919(+) A-I      intronic
chr1:52543997(+) A-I      intronic
chr1:52544916(+) A-I      intronic
chr1:52545024(+) A-I      intronic
chr1:52545049(+) A-I      intronic
chr1:52545563(+) A-I      intronic
chr1:52545613(+) A-I      intronic
chr1:52545683(+) A-I      intronic
chr1:52545701(+) A-I      intronic
chr1:52545787(+) A-I      intronic
chr1:52546581(+) A-I      intronic
chr1:52546651(+) A-I      intronic
chr1:52546946(+) A-I      intronic
chr1:52546972(+) A-I      intronic
chr1:52546980(+) A-I      intronic
chr1:52546993(+) A-I      intronic
chr1:52547016(+) A-I      intronic
chr1:52547073(+) A-I      intronic
chr1:52548166(+) A-I      intronic
chr1:52548174(+) A-I      intronic
chr1:52548220(+) A-I      intronic
chr1:52548221(+) A-I      intronic
chr1:52549532(+) A-I      intronic
chr1:52549541(+) A-I      intronic
chr1:52549558(+) A-I      intronic
chr1:52549647(+) A-I      intronic
chr1:52550321(+) A-I      intronic
chr1:52549881(+) A-I      intronic
chr1:52549886(+) A-I      intronic
chr1:52549911(+) A-I      intronic
chr1:52549912(+) A-I      intronic
chr1:52550062(+) A-I      intronic
chr1:52528146(+) A-I      intronic
chr1:52531012(+) A-I      intronic
chr1:52531454(+) A-I      intronic
chr1:52550099(+) A-I      intronic
chr1:52550262(+) A-I      intronic
chr1:52550265(+) A-I      intronic
chr1:52550268(+) A-I      intronic
chr1:52550317(+) A-I      intronic
chr1:52531455(+) A-I      intronic
chr1:52531524(+) A-I      intronic
chr1:52531532(+) A-I      intronic
chr1:52531533(+) A-I      intronic
chr1:52531550(+) A-I      intronic
chr1:52531589(+) A-I      intronic
chr1:52531611(+) A-I      intronic
chr1:52532027(+) A-I      intronic
chr1:52532063(+) A-I      intronic
chr1:52532094(+) A-I      intronic
chr1:52532109(+) A-I      intronic
chr1:52532112(+) A-I      intronic
chr1:52532254(+) A-I      intronic
chr1:52532260(+) A-I      intronic
chr1:52532363(+) A-I      intronic
chr1:52532391(+) A-I      intronic
chr1:52532403(+) A-I      intronic
chr1:52532497(+) A-I      intronic
chr1:52532647(+) A-I      intronic
chr1:52532662(+) A-I      intronic
chr1:52532694(+) A-I      intronic
chr1:52532722(+) A-I      intronic
chr1:52532833(+) A-I      intronic
chr1:52535634(+) A-I      intronic
chr1:52535679(+) A-I      intronic
chr1:52535687(+) A-I      intronic
chr1:52535735(+) A-I      intronic
chr1:52535768(+) A-I      intronic
chr1:52536482(+) A-I      intronic
chr1:52551383(+) A-I      intronic
chr1:52540455(+) A-I      intronic
chr1:52536488(+) A-I      intronic
chr1:52536528(+) A-I      intronic
chr1:52537879(+) A-I      intronic
chr1:52537882(+) A-I      intronic
chr1:52537925(+) A-I      intronic
chr1:52537998(+) A-I      intronic
chr1:52538469(+) A-I      intronic
chr1:52538471(+) A-I      intronic
chr1:52538478(+) A-I      intronic
chr1:52536465(+) A-I      intronic
chr1:52545037(+) A-I      intronic
chr1:52550330(+) A-I      intronic
chr1:52549624(+) A-I      intronic
chr1:52527049(+) A-I      intronic
chr1:52531017(+) A-I      intronic
chr1:52549581(+) A-I      intronic
chr1:52532397(+) A-I      intronic
chr1:52548317(+) A-I      intronic
chr1:52549467(+) A-I      intronic
chr1:52549540(+) A-I      intronic
chr1:52548248(+) A-I      intronic
chr1:52539417(+) A-I      intronic
chr1:52536463(+) A-I      intronic
chr1:52531946(+) A-I      intronic
chr1:52549530(+) A-I      intronic
chr1:52549637(+) A-I      intronic
chr1:52539902(+) A-I      intronic
chr1:52537746(+) A-I      intronic
chr1:52542088(+) A-I      intronic
chr1:52549571(+) A-I      intronic
chr1:52549496(+) A-I      intronic
chr1:52541953(+) A-I      intronic
chr1:52549577(+) A-I      intronic
chr1:52542223(+) A-I      intronic
chr1:52542719(+) A-I      intronic
chr1:52532787(+) A-I      intronic
chr1:52542958(+) A-I      intronic
chr1:52538623(+) A-I      intronic
chr1:52549516(+) A-I      intronic
chr1:52549612(+) A-I      intronic
chr1:52549633(+) A-I      intronic
chr1:52531063(+) A-I      intronic
chr1:52539933(+) A-I      intronic
chr1:52536372(+) A-I      intronic
chr1:52549428(+) A-I      intronic
chr1:52549514(+) A-I      intronic
chr1:52546936(+) A-I      intronic
chr1:52548357(+) A-I      intronic
chr1:52546909(+) A-I      intronic
chr1:52541101(+) A-I      intronic
chr1:52551438(+) A-I      intronic
chr1:52540072(+) A-I      intronic
chr1:52539778(+) A-I      intronic
chr1:52540539(+) A-I      intronic
chr1:52532654(+) A-I      intronic
chr1:52536542(+) A-I      intronic
chr1:52537933(+) A-I      intronic
chr1:52551401(+) A-I      intronic
chr1:52543858(+) A-I      intronic
chr1:52550357(+) A-I      intronic
chr1:52548329(+) A-I      intronic
chr1:52536480(+) A-I      intronic
chr1:52545670(+) A-I      intronic
chr1:52550308(+) A-I      intronic
chr1:52541385(+) A-I      intronic
chr1:52546306(+) A-I      intronic
chr1:52544934(+) A-I      intronic
chr1:52550077(+) A-I      intronic
chr1:52532443(+) A-I      intronic
chr1:52541993(+) A-I      intronic
chr1:52532699(+) A-I      intronic
chr1:52532261(+) A-I      intronic
chr1:52549515(+) A-I      intronic
chr1:52554700(+) A-I      3'UTR
chr1:52545729(+) A-I      intronic
chr1:52542103(+) A-I      intronic
chr1:52540690(+) A-I      intronic
chr1:52528057(+) A-I      intronic
chr1:52551366(+) A-I      intronic
chr1:52546962(+) A-I      intronic
chr1:52538876(+) A-I      intronic
chr1:52544908(+) A-I      intronic
chr1:52546299(+) A-I      intronic
chr1:52551402(+) A-I      intronic
chr1:52541611(+) A-I      intronic
chr1:52539269(+) A-I      intronic
chr1:52542170(+) A-I      intronic
chr1:52542160(+) A-I      intronic
chr1:52542693(+) A-I      intronic
chr1:52540697(+) A-I      intronic
chr1:52538535(+) A-I      intronic
chr1:52541071(+) A-I      intronic
chr1:52542566(+) A-I      intronic
chr1:52550343(+) A-I      intronic
chr1:52542090(+) A-I      intronic
chr1:52548332(+) A-I      intronic
chr1:52546262(+) A-I      intronic
chr1:52540703(+) A-I      intronic
chr1:52535809(+) A-I      intronic
chr1:52536491(+) A-I      intronic
chr1:52539334(+) A-I      intronic
chr1:52539702(+) A-I      intronic
chr1:52547003(+) A-I      intronic
chr1:52540135(+) A-I      intronic
chr1:52530989(+) A-I      intronic
chr1:52542129(+) A-I      intronic
chr1:52536389(+) A-I      intronic
chr1:52540612(+) A-I      intronic
chr1:52551375(+) A-I      intronic
chr1:52532083(+) A-I      intronic
chr1:52542155(+) A-I      intronic
chr1:52547058(+) A-I      intronic
chr1:52531018(+) A-I      intronic
chr1:52539523(+) A-I      intronic
chr1:52546831(+) A-I      intronic
chr1:52545567(+) A-I      intronic
chr1:52541828(+) A-I      intronic
chr1:52551267(+) A-I      intronic
chr1:52543759(+) A-I      intronic
chr1:52550050(+) A-I      intronic
chr1:52543180(+) A-I      intronic
chr1:52542827(+) A-I      intronic
chr1:52548343(+) A-I      intronic
chr1:52550767(+) A-I      intronic
chr1:52550231(+) A-I      intronic
chr1:52542975(+) A-I      intronic
chr1:52543754(+) A-I      intronic
chr1:52541566(+) A-I      intronic
chr1:52554612(+) A-I      3'UTR
chr1:52542085(+) A-I      intronic
chr1:52531077(+) A-I      intronic
chr1:52541416(+) A-I      intronic
chr1:52548157(+) A-I      intronic
chr1:52551363(+) A-I      intronic
chr1:52539963(+) A-I      intronic
chr1:52543854(+) A-I      intronic
chr1:52541443(+) A-I      intronic
chr1:52541151(+) A-I      intronic
chr1:52532788(+) A-I      intronic
chr1:52550832(+) A-I      intronic
chr1:52545643(+) A-I      intronic
chr1:52551467(+) A-I      intronic
chr1:52551437(+) A-I      intronic
chr1:52549569(+) A-I      intronic
chr1:52531055(+) A-I      intronic
chr1:52543787(+) A-I      intronic
chr1:52551368(+) A-I      intronic
chr1:52532057(+) A-I      intronic
chr1:52532013(+) A-I      intronic
chr1:52546832(+) A-I      intronic
chr1:52538574(+) A-I      intronic
chr1:52542084(+) A-I      intronic
chr1:52543987(+) A-I      intronic
chr1:52548270(+) A-I      intronic
chr1:52531469(+) A-I      intronic
chr1:52539825(+) A-I      intronic
chr1:52532003(+) A-I      intronic
chr1:52539292(+) A-I      intronic
chr1:52545749(+) A-I      intronic
chr1:52540002(+) A-I      intronic
chr1:52546989(+) A-I      intronic
chr1:52536413(+) A-I      intronic
chr1:52543053(+) A-I      intronic
chr1:52536545(+) A-I      intronic
chr1:52550790(+) A-I      intronic
chr1:52532005(+) A-I      intronic
chr1:52549892(+) A-I      intronic
chr1:52543819(+) A-I      intronic
chr1:52535705(+) A-I      intronic
chr1:52542685(+) A-I      intronic
chr1:52540542(+) A-I      intronic
chr1:52543775(+) A-I      intronic
chr1:52550293(+) A-I      intronic
chr1:52536410(+) A-I      intronic
chr1:52549888(+) A-I      intronic
chr1:52541860(+) A-I      intronic
chr1:52531064(+) A-I      intronic
chr1:52549436(+) A-I      intronic
chr1:52545796(+) A-I      intronic
chr1:52544975(+) A-I      intronic
chr1:52531981(+) A-I      intronic
chr1:52542825(+) A-I      intronic
chr1:52541827(+) A-I      intronic
chr1:52541902(+) A-I      intronic
chr1:52536585(+) A-I      intronic
chr1:52531557(+) A-I      intronic
chr1:52539723(+) A-I      intronic
chr1:52547064(+) A-I      intronic
chr1:52532723(+) A-I      intronic
chr1:52535688(+) A-I      intronic
chr1:52535739(+) A-I      intronic
chr1:52536151(+) A-I      intronic
chr1:52544009(+) A-I      intronic
chr1:52538532(+) A-I      intronic
chr1:52542075(+) A-I      intronic
chr1:52539509(+) A-I      intronic
chr1:52543129(+) A-I      intronic
chr1:52550004(+) A-I      intronic
chr1:52549916(+) A-I      intronic
chr1:52548356(+) A-I      intronic
chr1:52537807(+) A-I      intronic
chr1:52540543(+) A-I      intronic
chr1:52531138(+) A-I      intronic
chr1:52531438(+) A-I      intronic
chr1:52540619(+) A-I      intronic
chr1:52530994(+) A-I      intronic
chr1:52548231(+) A-I      intronic
chr1:52526906(+) A-I      intronic
chr1:52551369(+) A-I      intronic
chr1:52549898(+) A-I      intronic
chr1:52542643(+) A-I      intronic
chr1:52535818(+) A-I      intronic
chr1:52541834(+) A-I      intronic
chr1:52549889(+) A-I      intronic
chr1:52540347(+) A-I      intronic
chr1:52550943(+) A-I      intronic
chr1:52536449(+) A-I      intronic
chr1:52538560(+) A-I      intronic
chr1:52543201(+) A-I      intronic
chr1:52551108(+) A-I      intronic
chr1:52539762(+) A-I      intronic
chr1:52539276(+) A-I      intronic
chr1:52531945(+) A-I      intronic
chr1:52536152(+) A-I      intronic
chr1:52538583(+) A-I      intronic
chr1:52542128(+) A-I      intronic
chr1:52541520(+) A-I      intronic
chr1:52531993(+) A-I      intronic
chr1:52531649(+) A-I      intronic
chr1:52531549(+) A-I      intronic
chr1:52545644(+) A-I      intronic
chr1:52549980(+) A-I      intronic
chr1:52547070(+) A-I      intronic
chr1:52543859(+) A-I      intronic
chr1:52551070(+) A-I      intronic
chr1:52541028(+) A-I      intronic
chr1:52531485(+) A-I      intronic
chr1:52549915(+) A-I      intronic
chr1:52531889(+) A-I      intronic
chr1:52544935(+) A-I      intronic
chr1:52531884(+) A-I      intronic
chr1:52538609(+) A-I      intronic
chr1:52531655(+) A-I      intronic
chr1:52537791(+) A-I      intronic
chr1:52550773(+) A-I      intronic
chr1:52531118(+) A-I      intronic
chr1:52536383(+) A-I      intronic
chr1:52539493(+) A-I      intronic
chr1:52540202(+) A-I      intronic
chr1:52531037(+) A-I      intronic
chr1:52550873(+) A-I      intronic
chr1:52539254(+) A-I      intronic
chr1:52551466(+) A-I      intronic
chr1:52543755(+) A-I      intronic
chr1:52532328(+) A-I      intronic
chr1:52531590(+) A-I      intronic
chr1:52531914(+) A-I      intronic
chr1:52531581(+) A-I      intronic
chr1:52538571(+) A-I      intronic
chr1:52539894(+) A-I      intronic
chr1:52539970(+) A-I      intronic
chr1:52551360(+) A-I      intronic
chr1:52544944(+) A-I      intronic
chr1:52542749(+) A-I      intronic
chr1:52550084(+) A-I      intronic
chr1:52544961(+) A-I      intronic
chr1:52545592(+) A-I      intronic
chr1:52531897(+) A-I      intronic
chr1:52538610(+) A-I      intronic
chr1:52536474(+) A-I      intronic
chr1:52539494(+) A-I      intronic
chr1:52538836(+) A-I      intronic
chr1:52550263(+) A-I      intronic
chr1:52550822(+) A-I      intronic
chr1:52532434(+) A-I      intronic
chr1:52536473(+) A-I      intronic
chr1:52538835(+) A-I      intronic
chr1:52535769(+) A-I      intronic
chr1:52543094(+) A-I      intronic
chr1:52542725(+) A-I      intronic
chr1:52538636(+) A-I      intronic
chr1:52531892(+) A-I      intronic
chr1:52551480(+) A-I      intronic
chr1:52538580(+) A-I      intronic
chr1:52538639(+) A-I      intronic
chr1:52539652(+) A-I      intronic
chr1:52542980(+) A-I      intronic
chr1:52549572(+) A-I      intronic
chr1:52550817(+) A-I      intronic
chr1:52532774(+) A-I      intronic
chr1:52531481(+) A-I      intronic
chr1:52542945(+) A-I      intronic
chr1:52538494(+) A-I      intronic
chr1:52550876(+) A-I      intronic
chr1:52539299(+) A-I      intronic
chr1:52532054(+) A-I      intronic
chr1:52537962(+) A-I      intronic
chr1:52531940(+) A-I      intronic
chr1:52535742(+) A-I      intronic
chr1:52550024(+) A-I      intronic
chr1:52538477(+) A-I      intronic
chr1:52545806(+) A-I      intronic
chr1:52548152(+) A-I      intronic
chr1:52545727(+) A-I      intronic
chr1:52539950(+) A-I      intronic
chr1:52544957(+) A-I      intronic
chr1:52550953(+) A-I      intronic
chr1:52531121(+) A-I      intronic
chr1:52536340(+) A-I      intronic
chr1:52541998(+) A-I      intronic
chr1:52550772(+) A-I      intronic
chr1:52539649(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED BTF3L4
chr1:52549428(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549436(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549467(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549496(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549514(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549515(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549516(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549530(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549540(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549569(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549571(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549572(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549577(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549581(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549612(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549624(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549633(+) A-I intron -    22028664
chr1:52549637(+) A-I intron -    22028664
chr1:52527049(+) A-G intron -    22484847
chr1:52528057(+) A-G intron -    22484847
chr1:52530989(+) A-G intron -    22484847
chr1:52530994(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531017(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531018(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531055(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531063(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531077(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531118(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531121(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531438(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531469(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531481(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531557(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531581(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531590(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531649(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531655(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531884(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531889(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531892(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531897(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531914(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531940(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531945(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531946(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531981(+) A-G intron -    22484847
chr1:52531993(+) A-G intron -    22484847
chr1:52532003(+) A-G intron -    22484847
chr1:52532005(+) A-G intron -    22484847
chr1:52532013(+) A-G intron -    22484847
chr1:52532057(+) A-G intron -    22484847
chr1:52532083(+) A-G intron -    22484847
chr1:52532261(+) A-G intron -    22484847
chr1:52532328(+) A-G intron -    22484847
chr1:52532397(+) A-G intron -    22484847
chr1:52532443(+) A-G intron -    22484847
chr1:52532774(+) A-G intron -    22484847
chr1:52532787(+) A-G intron -    22484847
chr1:52532788(+) A-G intron -    22484847
chr1:52535705(+) A-G intron -    22484847
chr1:52535742(+) A-G intron -    22484847
chr1:52536323(+) G-T intron -    22484847
chr1:52536340(+) A-G intron -    22484847
chr1:52536372(+) A-G intron -    22484847
chr1:52536383(+) A-G intron -    22484847
chr1:52536410(+) A-G intron -    22484847
chr1:52536413(+) A-G intron -    22484847
chr1:52536449(+) A-G intron -    22484847
chr1:52536473(+) A-G intron -    22484847
chr1:52536474(+) A-G intron -    22484847
chr1:52536480(+) A-G intron -    22484847
chr1:52536491(+) A-G intron -    22484847
chr1:52536542(+) A-G intron -    22484847
chr1:52537746(+) A-G intron -    22484847
chr1:52537933(+) A-G intron -    22484847
chr1:52537962(+) A-G intron -    22484847
chr1:52538477(+) A-G intron -    22484847
chr1:52538583(+) A-G intron -    22484847
chr1:52538609(+) A-G intron -    22484847
chr1:52538610(+) A-G intron -    22484847
chr1:52538623(+) A-G intron -    22484847
chr1:52538636(+) A-G intron -    22484847
chr1:52538639(+) A-G intron -    22484847
chr1:52539299(+) A-G intron -    22484847
chr1:52539762(+) A-G intron -    22484847
chr1:52539825(+) A-G intron -    22484847
chr1:52539894(+) A-G intron -    22484847
chr1:52539902(+) A-G intron -    22484847
chr1:52539933(+) A-G intron -    22484847
chr1:52539963(+) A-G intron -    22484847
chr1:52539970(+) A-G intron -    22484847
chr1:52540072(+) A-G intron -    22484847
chr1:52540542(+) A-G intron -    22484847
chr1:52540543(+) A-G intron -    22484847
chr1:52540619(+) A-G intron -    22484847
chr1:52540690(+) A-G intron -    22484847
chr1:52540697(+) A-G intron -    22484847
chr1:52541101(+) A-G intron -    22484847
chr1:52541416(+) A-G intron -    22484847
chr1:52541443(+) A-G intron -    22484847
chr1:52541828(+) A-G intron -    22484847
chr1:52541902(+) A-G intron -    22484847
chr1:52541998(+) A-G intron -    22484847
chr1:52542129(+) A-G intron -    22484847
chr1:52542566(+) A-G intron -    22484847
chr1:52542945(+) A-G intron -    22484847
chr1:52543754(+) A-G intron -    22484847
chr1:52543775(+) A-G intron -    22484847
chr1:52543819(+) A-G intron -    22484847
chr1:52543858(+) A-G intron -    22484847
chr1:52543859(+) A-G intron -    22484847
chr1:52543987(+) A-G intron -    22484847
chr1:52544935(+) A-G intron -    22484847
chr1:52545070(+) G-A intron -    22484847
chr1:52545534(+) C-T intron -    22484847
chr1:52545643(+) A-G intron -    22484847
chr1:52545644(+) A-G intron -    22484847
chr1:52545670(+) A-G intron -    22484847
chr1:52545749(+) A-G intron -    22484847
chr1:52546831(+) A-G intron -    22484847
chr1:52546885(+) C-A intron -    22484847
chr1:52546886(+) T-C intron -    22484847
chr1:52546887(+) G-T intron -    22484847
chr1:52546962(+) A-G intron -    22484847
chr1:52546989(+) A-G intron -    22484847
chr1:52547003(+) A-G intron -    22484847
chr1:52548332(+) A-G intron -    22484847
chr1:52549436(+) A-G intron -    22484847
chr1:52549515(+) A-G intron -    22484847
chr1:52549569(+) A-G intron -    22484847
chr1:52549572(+) A-G intron -    22484847
chr1:52549915(+) A-G intron -    22484847
chr1:52550004(+) A-G intron -    22484847
chr1:52550050(+) A-G intron -    22484847
chr1:52550293(+) A-G intron -    22484847
chr1:52550357(+) A-G intron -    22484847
chr1:52550943(+) A-G intron -    22484847
chr1:52550953(+) A-G intron -    22484847
chr1:52551091(+) A-C intron -    22484847
chr1:52551360(+) A-G intron -    22484847
chr1:52551366(+) A-G intron -    22484847
chr1:52551375(+) A-G intron -    22484847
chr1:52551402(+) A-G intron -    22484847
chr1:52551437(+) A-G intron -    22484847
chr1:52551466(+) A-G intron -    22484847
chr1:52554604(+) G-T intron -    22484847
chr1:52554700(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase BTF3L4
chr1:52530532-52530533(+) m6A 3'UTR//5'UTR//CDS//exon       24981863
chr1:52530576-52530577(+) m6A 3'UTR//5'UTR//CDS//exon       24981863
chr1:52549196-52549197(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625
chr1:52551789-52551790(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625
chr1:52551805-52551806(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//22575960//22608085
chr1:52551813-52551814(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//22575960//22608085
chr1:52551862-52551863(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//22608085
chr1:52552457-52552458(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr1:52552500-52552501(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr1:52552509-52552510(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr1:52553040-52553041(+) Y 3'UTR       26075521

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-548c-5p
Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Urine     -
BTF3L4
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HeLa-S3 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Related Drug Information:


Resource Symbol Drug Name PubChem
ID
Function Link  
RNAInter hsa-miR-548c-5p
Emodin 3220 Drug interaction    RC00007211
Sorafenib 216239 Drug interaction    RC00007212
Resource Symbol Drug Name PubChem ID
RNAactDrug hsa-miR-548c-5p

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-548c-5p
Interactor2: BTF3L4

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRDB
Support Database ViRBase

References:


PMID 33201341 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line None Interactor2 expression None
Description By custom target prediction, a panel of miRNA sequences able to recognize the SARS-CoV-2 sequence was collected. Only targets with a very high score (95-100) were retained for further analyses.

Starting a new search, please wait ...