Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00107954

  Virus:  

SARS-CoV-2 (NC_045512.2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-548b-5p:           MAGT1:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-548b-5p MAGT1
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0004798 84061
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - bA217H1.1//CDG1CC//IAP//MRX95//OST3B//PRO0756//SLC58A1//XMEN

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-548b-5p
rs1180266201 chr6:119069102    A/G
rs1338611711 chr6:119069100    C/T
rs188182113 chr6:119069098    G/A
rs188182113 chr6:119069098    G/C
rs1158490090 chr6:119069118    T/C
rs1414502200 chr6:119069112    T/A
rs1472929879 chr6:119069115    C/A

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR MAGT1
chrX:77107049(-) A-I      intronic
chrX:77107050(-) A-I      intronic
chrX:77107053(-) A-I      intronic
chrX:77107150(-) A-I      intronic
chrX:77107472(-) A-I      intronic
chrX:77107481(-) A-I      intronic
chrX:77107588(-) A-I      intronic
chrX:77107595(-) A-I      intronic
chrX:77107603(-) A-I      intronic
chrX:77107672(-) A-I      intronic
chrX:77108173(-) A-I      intronic
chrX:77108257(-) A-I      intronic
chrX:77108367(-) A-I      intronic
chrX:77110045(-) A-I      intronic
chrX:77110073(-) A-I      intronic
chrX:77111325(-) A-I      intronic
chrX:77111364(-) A-I      intronic
chrX:77111365(-) A-I      intronic
chrX:77111470(-) A-I      intronic
chrX:77111471(-) A-I      intronic
chrX:77111544(-) A-I      intronic
chrX:77111753(-) A-I      intronic
chrX:77135514(-) A-I      intronic
chrX:77111811(-) A-I      intronic
chrX:77111888(-) A-I      intronic
chrX:77113961(-) A-I      intronic
chrX:77114450(-) A-I      intronic
chrX:77114622(-) A-I      intronic
chrX:77115264(-) A-I      intronic
chrX:77115277(-) A-I      intronic
chrX:77115288(-) A-I      intronic
chrX:77115617(-) A-I      intronic
chrX:77115649(-) A-I      intronic
chrX:77115650(-) A-I      intronic
chrX:77115669(-) A-I      intronic
chrX:77115689(-) A-I      intronic
chrX:77115692(-) A-I      intronic
chrX:77115697(-) A-I      intronic
chrX:77116179(-) A-I      intronic
chrX:77116203(-) A-I      intronic
chrX:77116216(-) A-I      intronic
chrX:77116273(-) A-I      intronic
chrX:77116277(-) A-I      intronic
chrX:77116528(-) A-I      intronic
chrX:77116632(-) A-I      intronic
chrX:77116671(-) A-I      intronic
chrX:77119289(-) A-I      intronic
chrX:77119397(-) A-I      intronic
chrX:77124193(-) A-I      intronic
chrX:77124195(-) A-I      intronic
chrX:77124205(-) A-I      intronic
chrX:77126970(-) A-I      intronic
chrX:77127039(-) A-I      intronic
chrX:77127041(-) A-I      intronic
chrX:77127217(-) A-I      intronic
chrX:77127227(-) A-I      intronic
chrX:77127256(-) A-I      intronic
chrX:77127282(-) A-I      intronic
chrX:77127664(-) A-I      intronic
chrX:77129515(-) A-I      intronic
chrX:77129520(-) A-I      intronic
chrX:77129605(-) A-I      intronic
chrX:77129654(-) A-I      intronic
chrX:77129658(-) A-I      intronic
chrX:77129744(-) A-I      intronic
chrX:77129925(-) A-I      intronic
chrX:77129927(-) A-I      intronic
chrX:77129968(-) A-I      intronic
chrX:77129976(-) A-I      intronic
chrX:77129981(-) A-I      intronic
chrX:77130031(-) A-I      intronic
chrX:77130036(-) A-I      intronic
chrX:77093871(-) A-I      intronic
chrX:77085732(-) A-I      intronic
chrX:77085950(-) A-I      intronic
chrX:77130419(-) A-I      intronic
chrX:77130420(-) A-I      intronic
chrX:77131407(-) A-I      intronic
chrX:77133664(-) A-I      intronic
chrX:77134757(-) A-I      intronic
chrX:77134758(-) A-I      intronic
chrX:77134825(-) A-I      intronic
chrX:77135444(-) A-I      intronic
chrX:77135515(-) A-I      intronic
chrX:77135518(-) A-I      intronic
chrX:77135539(-) A-I      intronic
chrX:77135555(-) A-I      intronic
chrX:77136237(-) A-I      intronic
chrX:77136243(-) A-I      intronic
chrX:77136300(-) A-I      intronic
chrX:77136392(-) A-I      intronic
chrX:77136398(-) A-I      intronic
chrX:77136419(-) A-I      intronic
chrX:77138295(-) A-I      intronic
chrX:77139330(-) A-I      intronic
chrX:77139568(-) A-I      intronic
chrX:77139590(-) A-I      intronic
chrX:77140437(-) A-I      intronic
chrX:77140848(-) A-I      intronic
chrX:77140857(-) A-I      intronic
chrX:77141049(-) A-I      intronic
chrX:77141050(-) A-I      intronic
chrX:77141078(-) A-I      intronic
chrX:77141160(-) A-I      intronic
chrX:77142028(-) A-I      intronic
chrX:77142045(-) A-I      intronic
chrX:77142056(-) A-I      intronic
chrX:77142138(-) A-I      intronic
chrX:77142793(-) A-I      intronic
chrX:77143338(-) A-I      intronic
chrX:77143372(-) A-I      intronic
chrX:77143483(-) A-I      intronic
chrX:77143533(-) A-I      intronic
chrX:77147235(-) A-I      intronic
chrX:77147244(-) A-I      intronic
chrX:77086004(-) A-I      intronic
chrX:77086012(-) A-I      intronic
chrX:77086653(-) A-I      intronic
chrX:77089969(-) A-I      intronic
chrX:77090032(-) A-I      intronic
chrX:77090116(-) A-I      intronic
chrX:77090581(-) A-I      intronic
chrX:77090585(-) A-I      intronic
chrX:77090591(-) A-I      intronic
chrX:77090617(-) A-I      intronic
chrX:77090694(-) A-I      intronic
chrX:77090724(-) A-I      intronic
chrX:77091368(-) A-I      intronic
chrX:77091391(-) A-I      intronic
chrX:77091398(-) A-I      intronic
chrX:77091412(-) A-I      intronic
chrX:77091582(-) A-I      intronic
chrX:77092293(-) A-I      intronic
chrX:77093071(-) A-I      intronic
chrX:77093404(-) A-I      intronic
chrX:77093438(-) A-I      intronic
chrX:77093707(-) A-I      intronic
chrX:77093819(-) A-I      intronic
chrX:77094168(-) A-I      intronic
chrX:77094556(-) A-I      intronic
chrX:77094557(-) A-I      intronic
chrX:77094685(-) A-I      intronic
chrX:77094749(-) A-I      intronic
chrX:77095116(-) A-I      intronic
chrX:77095133(-) A-I      intronic
chrX:77095143(-) A-I      intronic
chrX:77095182(-) A-I      intronic
chrX:77095184(-) A-I      intronic
chrX:77095199(-) A-I      intronic
chrX:77095250(-) A-I      intronic
chrX:77095299(-) A-I      intronic
chrX:77095662(-) A-I      intronic
chrX:77095809(-) A-I      intronic
chrX:77096217(-) A-I      intronic
chrX:77096294(-) A-I      intronic
chrX:77096296(-) A-I      intronic
chrX:77105244(-) A-I      intronic
chrX:77096240(-) A-I      intronic
chrX:77097336(-) A-I      intronic
chrX:77097405(-) A-I      intronic
chrX:77097466(-) A-I      intronic
chrX:77097718(-) A-I      intronic
chrX:77097809(-) A-I      intronic
chrX:77105320(-) A-I      intronic
chrX:77105333(-) A-I      intronic
chrX:77105873(-) A-I      intronic
chrX:77098224(-) A-I      intronic
chrX:77103219(-) A-I      intronic
chrX:77104454(-) A-I      intronic
chrX:77098241(-) A-I      intronic
chrX:77098277(-) A-I      intronic
chrX:77098845(-) A-I      intronic
chrX:77103193(-) A-I      intronic
chrX:77104650(-) A-I      intronic
chrX:77104780(-) A-I      intronic
chrX:77105861(-) A-I      intronic
chrX:77105929(-) A-I      intronic
chrX:77107038(-) A-I      intronic
chrX:77107047(-) A-I      intronic
chrX:77107048(-) A-I      intronic
chrX:77103339(-) A-I      intronic
chrX:77103354(-) A-I      intronic
chrX:77104318(-) A-I      intronic
chrX:77104344(-) A-I      intronic
chrX:77103184(-) A-I      intronic
chrX:77104685(-) A-I      intronic
chrX:77105223(-) A-I      intronic
chrX:77105254(-) A-I      intronic
chrX:77105285(-) A-I      intronic
chrX:77105738(-) A-I      intronic
chrX:77105756(-) A-I      intronic
chrX:77105805(-) A-I      intronic
chrX:77105851(-) A-I      intronic
chrX:77105891(-) A-I      intronic
chrX:77106596(-) A-I      intronic
chrX:77106599(-) A-I      intronic
chrX:77106789(-) A-I      intronic
chrX:77106809(-) A-I      intronic
chrX:77106818(-) A-I      intronic
chrX:77106824(-) A-I      intronic
chrX:77106841(-) A-I      intronic
chrX:77106931(-) A-I      intronic
chrX:77105176(-) A-I      intronic
chrX:77106956(-) A-I      intronic
chrX:77106999(-) A-I      intronic
chrX:77107009(-) A-I      intronic
chrX:77107031(-) A-I      intronic
chrX:77104399(-) A-I      intronic
chrX:77083920(-) A-I      3'UTR
chrX:77083925(-) A-I      3'UTR
chrX:77084002(-) A-I      3'UTR
chrX:77084058(-) A-I      3'UTR
chrX:77083941(-) A-I      3'UTR
chrX:77083859(-) A-I      3'UTR
chrX:77083071(-) A-I      3'UTR
chrX:77083060(-) A-I      3'UTR
chrX:77083047(-) A-I      3'UTR
chrX:77083218(-) A-I      3'UTR
chrX:77083044(-) A-I      3'UTR
chrX:77083895(-) A-I      3'UTR
chrX:77083491(-) A-I      3'UTR
chrX:77083226(-) A-I      3'UTR
chrX:77083077(-) A-I      3'UTR
chrX:77083533(-) A-I      3'UTR
chrX:77083543(-) A-I      3'UTR
chrX:77083598(-) A-I      3'UTR
chrX:77083552(-) A-I      3'UTR
chrX:77083035(-) A-I      3'UTR
chrX:77083028(-) A-I      3'UTR
chrX:77083001(-) A-I      3'UTR
chrX:77083966(-) A-I      3'UTR
chrX:77083931(-) A-I      3'UTR
chrX:77083678(-) A-I      3'UTR
chrX:77082978(-) A-I      3'UTR
chrX:77083565(-) A-I      3'UTR
chrX:77082954(-) A-I      3'UTR
chrX:77084040(-) A-I      3'UTR
chrX:77084031(-) A-I      3'UTR
chrX:77083108(-) A-I      3'UTR
chrX:77083204(-) A-I      3'UTR
chrX:77082977(-) A-I      3'UTR
chrX:77083114(-) A-I      3'UTR
chrX:77082962(-) A-I      3'UTR
chrX:77082953(-) A-I      3'UTR
chrX:77083655(-) A-I      3'UTR
chrX:77083680(-) A-I      3'UTR
chrX:77082942(-) A-I      3'UTR
chrX:77083210(-) A-I      3'UTR
chrX:77083174(-) A-I      3'UTR
chrX:77083166(-) A-I      3'UTR
chrX:77083142(-) A-I      3'UTR
chrX:77083140(-) A-I      3'UTR
chrX:77083701(-) A-I      3'UTR
chrX:77083871(-) A-I      3'UTR
chrX:77083977(-) A-I      3'UTR
chrX:77083115(-) A-I      3'UTR
chrX:77083065(-) A-I      3'UTR
chrX:77082986(-) A-I      3'UTR
chrX:77082996(-) A-I      3'UTR
chrX:77083004(-) A-I      3'UTR
chrX:77083084(-) A-I      3'UTR
chrX:77083036(-) A-I      3'UTR
chrX:77083733(-) A-I      3'UTR
chrX:77083727(-) A-I      3'UTR
chrX:77083112(-) A-I      3'UTR
chrX:77083201(-) A-I      3'UTR
chrX:77083819(-) A-I      3'UTR
chrX:77083841(-) A-I      3'UTR
chrX:77083572(-) A-I      3'UTR
chrX:77083609(-) A-I      3'UTR
chrX:77129923(-) A-I      intronic
chrX:77092281(-) A-I      intronic
chrX:77106608(-) A-I      intronic
chrX:77107241(-) A-I      intronic
chrX:77105188(-) A-I      intronic
chrX:77098080(-) A-I      intronic
chrX:77107227(-) A-I      intronic
chrX:77109734(-) A-I      intronic
chrX:77092209(-) A-I      intronic
chrX:77097860(-) A-I      intronic
chrX:77111891(-) A-I      intronic
chrX:77091438(-) A-I      intronic
chrX:77105793(-) A-I      intronic
chrX:77104475(-) A-I      intronic
chrX:77109799(-) A-I      intronic
chrX:77107560(-) A-I      intronic
chrX:77097710(-) A-I      intronic
chrX:77111480(-) A-I      intronic
chrX:77105312(-) A-I      intronic
chrX:77085058(-) A-I      intronic
chrX:77149278(-) A-I      intronic
chrX:77110096(-) A-I      intronic
chrX:77107166(-) A-I      intronic
chrX:77097297(-) A-I      intronic
chrX:77115146(-) A-I      intronic
chrX:77108289(-) A-I      intronic
chrX:77095433(-) A-I      intronic
chrX:77129993(-) A-I      intronic
chrX:77097311(-) A-I      intronic
chrX:77139566(-) A-I      intronic
chrX:77098858(-) A-I      intronic
chrX:77104702(-) A-I      intronic
chrX:77104755(-) A-I      intronic
chrX:77139155(-) A-I      intronic
chrX:77115171(-) A-I      intronic
chrX:77115252(-) A-I      intronic
chrX:77139676(-) A-I      intronic
chrX:77094973(-) A-I      intronic
chrX:77104459(-) A-I      intronic
chrX:77106632(-) A-I      intronic
chrX:77104416(-) A-I      intronic
chrX:77093940(-) A-I      intronic
chrX:77108181(-) A-I      intronic
chrX:77135438(-) A-I      intronic
chrX:77085059(-) A-I      intronic
chrX:77092387(-) A-I      intronic
chrX:77116594(-) A-I      intronic
chrX:77135487(-) A-I      intronic
chrX:77097202(-) A-I      intronic
chrX:77108296(-) A-I      intronic
chrX:77107492(-) A-I      intronic
chrX:77104738(-) A-I      intronic
chrX:77141084(-) A-I      intronic
chrX:77085703(-) A-I      intronic
chrX:77105824(-) A-I      intronic
chrX:77146908(-) A-I      intronic
chrX:77107567(-) A-I      intronic
chrX:77094978(-) A-I      intronic
chrX:77095731(-) A-I      intronic
chrX:77118540(-) A-I      intronic
chrX:77097808(-) A-I      intronic
chrX:77098283(-) A-I      intronic
chrX:77130441(-) A-I      intronic
chrX:77095039(-) A-I      intronic
chrX:77141176(-) A-I      intronic
chrX:77108253(-) A-I      intronic
chrX:77087213(-) A-I      intronic
chrX:77129901(-) A-I      intronic
chrX:77109778(-) A-I      intronic
chrX:77106798(-) A-I      intronic
chrX:77095857(-) A-I      intronic
chrX:77104754(-) A-I      intronic
chrX:77129614(-) A-I      intronic
chrX:77093699(-) A-I      intronic
chrX:77111538(-) A-I      intronic
chrX:77103322(-) A-I      intronic
chrX:77106667(-) A-I      intronic
chrX:77093694(-) A-I      intronic
chrX:77093767(-) A-I      intronic
chrX:77116593(-) A-I      intronic
chrX:77098242(-) A-I      intronic
chrX:77139158(-) A-I      intronic
chrX:77107533(-) A-I      intronic
chrX:77147148(-) A-I      intronic
chrX:77093377(-) A-I      intronic
chrX:77103927(-) A-I      intronic
chrX:77107152(-) A-I      intronic
chrX:77130071(-) A-I      intronic
chrX:77119484(-) A-I      intronic
chrX:77103279(-) A-I      intronic
chrX:77083654(-) A-I      3'UTR
chrX:77084017(-) A-I      3'UTR
chrX:77083964(-) A-I      3'UTR
chrX:77083103(-) A-I      3'UTR
chrX:77084026(-) A-I      3'UTR
chrX:77083880(-) A-I      3'UTR
chrX:77082999(-) A-I      3'UTR
chrX:77083641(-) A-I      3'UTR
chrX:77083107(-) A-I      3'UTR
chrX:77083659(-) A-I      3'UTR
chrX:77083041(-) A-I      3'UTR
chrX:77083117(-) A-I      3'UTR
chrX:77083653(-) A-I      3'UTR
chrX:77083988(-) A-I      3'UTR
chrX:77083517(-) A-I      3'UTR
chrX:77083644(-) A-I      3'UTR
chrX:77083232(-) A-I      3'UTR
chrX:77083697(-) A-I      3'UTR
chrX:77083116(-) A-I      3'UTR
chrX:77084007(-) A-I      3'UTR
chrX:77083617(-) A-I      3'UTR
chrX:77083879(-) A-I      3'UTR
chrX:77083915(-) A-I      3'UTR
chrX:77083704(-) A-I      3'UTR
chrX:77083133(-) A-I      3'UTR
chrX:77083574(-) A-I      3'UTR
chrX:77083015(-) A-I      3'UTR
chrX:77083956(-) A-I      3'UTR
chrX:77083118(-) A-I      3'UTR
chrX:77083585(-) A-I      3'UTR
chrX:77083846(-) A-I      3'UTR
chrX:77083673(-) A-I      3'UTR
chrX:77083006(-) A-I      3'UTR
chrX:77082975(-) A-I      3'UTR
chrX:77083109(-) A-I      3'UTR
chrX:77083670(-) A-I      3'UTR
chrX:77083179(-) A-I      3'UTR
chrX:77084001(-) A-I      3'UTR
chrX:77083132(-) A-I      3'UTR
chrX:77083897(-) A-I      3'UTR
chrX:77083614(-) A-I      3'UTR
chrX:77084060(-) A-I      3'UTR
chrX:77083615(-) A-I      3'UTR
chrX:77083939(-) A-I      3'UTR
chrX:77083121(-) A-I      3'UTR
chrX:77083011(-) A-I      3'UTR
chrX:77083818(-) A-I      3'UTR
chrX:77083914(-) A-I      3'UTR
chrX:77083709(-) A-I      3'UTR
chrX:77083592(-) A-I      3'UTR
chrX:77083723(-) A-I      3'UTR
chrX:77083900(-) A-I      3'UTR
chrX:77083982(-) A-I      3'UTR
chrX:77083605(-) A-I      3'UTR
chrX:77083183(-) A-I      3'UTR
chrX:77083067(-) A-I      3'UTR
chrX:77083031(-) A-I      3'UTR
chrX:77083188(-) A-I      3'UTR
chrX:77140957(-) A-I      intronic
chrX:77127678(-) A-I      intronic
chrX:77127637(-) A-I      intronic
chrX:77097796(-) A-I      intronic
chrX:77105810(-) A-I      intronic
chrX:77108245(-) A-I      intronic
chrX:77088071(-) A-I      intronic
chrX:77097878(-) A-I      intronic
chrX:77091482(-) A-I      intronic
chrX:77129584(-) A-I      intronic
chrX:77098960(-) A-I      intronic
chrX:77106619(-) A-I      intronic
chrX:77107488(-) A-I      intronic
chrX:77108248(-) A-I      intronic
chrX:77127704(-) A-I      intronic
chrX:77105926(-) A-I      intronic
chrX:77090729(-) A-I      intronic
chrX:77136363(-) A-I      intronic
chrX:77095142(-) A-I      intronic
chrX:77129971(-) A-I      intronic
chrX:77106967(-) A-I      intronic
chrX:77092216(-) A-I      intronic
chrX:77104307(-) A-I      intronic
chrX:77130011(-) A-I      intronic
chrX:77097763(-) A-I      intronic
chrX:77110727(-) A-I      intronic
chrX:77111540(-) A-I      intronic
chrX:77147182(-) A-I      intronic
chrX:77108374(-) A-I      intronic
chrX:77114658(-) A-I      intronic
chrX:77097454(-) A-I      intronic
chrX:77146998(-) A-I      intronic
chrX:77107568(-) A-I      intronic
chrX:77110141(-) A-I      intronic
chrX:77105202(-) A-I      intronic
chrX:77104773(-) A-I      intronic
chrX:77085817(-) A-I      intronic
chrX:77105910(-) A-I      intronic
chrX:77098216(-) A-I      intronic
chrX:77116422(-) A-I      intronic
chrX:77096299(-) A-I      intronic
chrX:77106845(-) A-I      intronic
chrX:77097317(-) A-I      intronic
chrX:77097783(-) A-I      intronic
chrX:77093760(-) A-I      intronic
chrX:77092156(-) A-I      intronic
chrX:77097639(-) A-I      intronic
chrX:77136372(-) A-I      intronic
chrX:77090120(-) A-I      intronic
chrX:77097270(-) A-I      intronic
chrX:77107563(-) A-I      intronic
chrX:77120925(-) A-I      intronic
chrX:77095090(-) A-I      intronic
chrX:77105728(-) A-I      intronic
chrX:77143477(-) A-I      intronic
chrX:77097406(-) A-I      intronic
chrX:77124785(-) A-I      intronic
chrX:77134718(-) A-I      intronic
chrX:77085956(-) A-I      intronic
chrX:77097815(-) A-I      intronic
chrX:77129512(-) A-I      intronic
chrX:77105260(-) A-I      intronic
chrX:77104280(-) A-I      intronic
chrX:77107604(-) A-I      intronic
chrX:77141068(-) A-I      intronic
chrX:77107450(-) A-I      intronic
chrX:77097337(-) A-I      intronic
chrX:77090110(-) A-I      intronic
chrX:77115278(-) A-I      intronic
chrX:77104750(-) A-I      intronic
chrX:77087363(-) A-I      intronic
chrX:77105185(-) A-I      intronic
chrX:77105211(-) A-I      intronic
chrX:77087270(-) A-I      intronic
chrX:77097459(-) A-I      intronic
chrX:77110589(-) A-I      intronic
chrX:77106850(-) A-I      intronic
chrX:77116507(-) A-I      intronic
chrX:77113960(-) A-I      intronic
chrX:77142843(-) A-I      intronic
chrX:77105151(-) A-I      intronic
chrX:77139433(-) A-I      intronic
chrX:77142151(-) A-I      intronic
chrX:77105124(-) A-I      intronic
chrX:77106780(-) A-I      intronic
chrX:77095183(-) A-I      intronic
chrX:77093700(-) A-I      intronic
chrX:77105807(-) A-I      intronic
chrX:77127222(-) A-I      intronic
chrX:77105109(-) A-I      intronic
chrX:77147553(-) A-I      intronic
chrX:77105123(-) A-I      intronic
chrX:77094969(-) A-I      intronic
chrX:77109748(-) A-I      intronic
chrX:77121063(-) A-I      intronic
chrX:77110065(-) A-I      intronic
chrX:77115673(-) A-I      intronic
chrX:77110176(-) A-I      intronic
chrX:77105747(-) A-I      intronic
chrX:77108256(-) A-I      intronic
chrX:77105848(-) A-I      intronic
chrX:77141014(-) A-I      intronic
chrX:77143580(-) A-I      intronic
chrX:77106851(-) A-I      intronic
chrX:77098872(-) A-I      intronic
chrX:77105303(-) A-I      intronic
chrX:77096137(-) A-I      intronic
chrX:77116554(-) A-I      intronic
chrX:77105296(-) A-I      intronic
chrX:77136373(-) A-I      intronic
chrX:77111408(-) A-I      intronic
chrX:77119353(-) A-I      intronic
chrX:77135503(-) A-I      intronic
chrX:77085947(-) A-I      intronic
chrX:77095886(-) A-I      intronic
chrX:77104435(-) A-I      intronic
chrX:77109815(-) A-I      intronic
chrX:77135433(-) A-I      intronic
chrX:77111322(-) A-I      intronic
chrX:77096265(-) A-I      intronic
chrX:77124317(-) A-I      intronic
chrX:77087362(-) A-I      intronic
chrX:77149284(-) A-I      intronic
chrX:77104753(-) A-I      intronic
chrX:77105205(-) A-I      intronic
chrX:77107008(-) A-I      intronic
chrX:77111479(-) A-I      intronic
chrX:77106541(-) A-I      intronic
chrX:77095101(-) A-I      intronic
chrX:77098831(-) A-I      intronic
chrX:77120488(-) A-I      intronic
chrX:77108337(-) A-I      intronic
chrX:77133848(-) A-I      intronic
chrX:77105156(-) A-I      intronic
chrX:77105890(-) A-I      intronic
chrX:77141615(-) A-I      intronic
chrX:77104429(-) A-I      intronic
chrX:77119409(-) A-I      intronic
chrX:77104411(-) A-I      intronic
chrX:77139176(-) A-I      intronic
chrX:77097668(-) A-I      intronic
chrX:77129679(-) A-I      intronic
chrX:77113959(-) A-I      intronic
chrX:77098079(-) A-I      intronic
chrX:77109809(-) A-I      intronic
chrX:77105825(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED MAGT1
chrX:77083109(-) A-I exon 3'UTR    15258596
chrX:77083117(-) A-I exon 3'UTR    15258596
chrX:77083132(-) A-I exon 3'UTR    15258596
chrX:77083179(-) A-I exon 3'UTR    15258596
chrX:77083183(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chrX:77083575(-) A-I exon 3'UTR    15258596
chrX:77083614(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chrX:77083615(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chrX:77083617(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //21960545
chrX:77083641(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chrX:77083645(-) A-I exon 3'UTR    15258596
chrX:77083653(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chrX:77083697(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chrX:77083723(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chrX:77083828(-) A-I exon 3'UTR    15258596
chrX:77083846(-) A-I exon 3'UTR    15258596
chrX:77083914(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chrX:77083915(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chrX:77083041(-) A-I exon 3'UTR    21960545
chrX:77083548(-) A-I exon 3'UTR    21960545
chrX:77083955(-) A-I exon 3'UTR    21960545
chrX:77083981(-) A-I exon 3'UTR    21960545
chrX:77083007(-) A-G exon 3'UTR    21725310   //22484847
chrX:77083673(-) A-G exon 3'UTR    21725310   //22484847
chrX:77083915(-) A-G exon 3'UTR    21725310   //22484847
chrX:77082975(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083006(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083011(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083015(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083041(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083054(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083063(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083067(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083076(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083103(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083106(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083107(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083116(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083118(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083121(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083132(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083179(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083183(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083187(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083209(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083517(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083538(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083575(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083592(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083614(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083615(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083617(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083641(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083644(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083645(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083653(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083654(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083670(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083690(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083704(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083723(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083828(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083845(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083891(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083897(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083900(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083914(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083939(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083955(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083964(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77083982(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77084001(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77084060(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:77092216(-) A-G intron -    22484847
chrX:77092387(-) A-G intron -    22484847
chrX:77093940(-) A-G intron -    22484847
chrX:77096265(-) A-G intron -    22484847
chrX:77096299(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097202(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097270(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097297(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097311(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097383(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097639(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097710(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097775(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097783(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097796(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097808(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097815(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097872(-) A-G intron -    22484847
chrX:77097878(-) A-G intron -    22484847
chrX:77098932(-) A-G intron -    22484847
chrX:77103336(-) A-G intron -    22484847
chrX:77103927(-) A-G intron -    22484847
chrX:77104307(-) A-G intron -    22484847
chrX:77104411(-) A-G intron -    22484847
chrX:77104416(-) A-G intron -    22484847
chrX:77104435(-) A-G intron -    22484847
chrX:77104499(-) A-G intron -    22484847
chrX:77104754(-) A-G intron -    22484847
chrX:77105123(-) A-G intron -    22484847
chrX:77105124(-) A-G intron -    22484847
chrX:77105202(-) A-G intron -    22484847
chrX:77105250(-) A-G intron -    22484847
chrX:77105260(-) A-G intron -    22484847
chrX:77105747(-) A-G intron -    22484847
chrX:77106541(-) A-G intron -    22484847
chrX:77106605(-) A-G intron -    22484847
chrX:77106608(-) A-G intron -    22484847
chrX:77106619(-) A-G intron -    22484847
chrX:77106632(-) A-G intron -    22484847
chrX:77106845(-) A-G intron -    22484847
chrX:77106967(-) A-G intron -    22484847
chrX:77107008(-) A-G intron -    22484847
chrX:77107488(-) A-G intron -    22484847
chrX:77107492(-) A-G intron -    22484847
chrX:77107560(-) A-G intron -    22484847
chrX:77107567(-) A-G intron -    22484847
chrX:77108248(-) A-G intron -    22484847
chrX:77108374(-) A-G intron -    22484847
chrX:77113730(-) A-G intron -    22484847
chrX:77115788(-) A-G intron -    22484847
chrX:77127575(-) A-G intron -    22484847
chrX:77142151(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase MAGT1
chrX:77082925-77082926(-) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chrX:77082966-77082967(-) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chrX:77083034-77083035(-) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chrX:77083744-77083745(-) m6A 3'UTR       -
chrX:77083754-77083755(-) m6A 3'UTR       -
chrX:77083892-77083893(-) m6A 3'UTR       -
chrX:77096760-77096761(-) Gm CDS       -
chrX:77131020-77131021(-) m6A CDS//exon       24981863
chrX:77131043-77131044(-) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863
chrX:77131054-77131055(-) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863
chrX:77150908-77150909(-) m6A 5'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085
chrX:77150952-77150953(-) m6A CDS       24284625//24209618//24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-548b-5p
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Cell lines(GBM46|GBM8|HaCaT|K562|MCF-10A|MCF-7|MGG75)|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocytes     -
MAGT1
Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-548b-5p
Interactor2: MAGT1

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRDB
Support Database ViRBase

References:


PMID 33201341 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line None Interactor2 expression None
Description By custom target prediction, a panel of miRNA sequences able to recognize the SARS-CoV-2 sequence was collected. Only targets with a very high score (95-100) were retained for further analyses.

Starting a new search, please wait ...