Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00107933

  Virus:  

SARS-CoV-2 (NC_045512.2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-548b-5p:  MIMAT0004798          ADAM22:  NM_001324419     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-548b-5p	ADAM22
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004798	53616
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ADAM 22//DEE61//EIEE61//MDC2

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-548b-5p	rs1180266201 chr6:119069102    A/G rs1338611711 chr6:119069100    C/T rs188182113 chr6:119069098    G/A rs188182113 chr6:119069098    G/C rs1158490090 chr6:119069118    T/C rs1414502200 chr6:119069112    T/A rs1472929879 chr6:119069115    C/A

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ADAM22	chr7:87737034(+) A-I      intronic chr7:87737171(+) A-I      intronic chr7:87737894(+) A-I      intronic chr7:87744549(+) A-I      intronic chr7:87818247(+) A-I      intronic chr7:87825008(+) A-I      intronic chr7:87798509(+) A-I      intronic chr7:87798496(+) A-I      intronic chr7:87798476(+) A-I      intronic chr7:87798470(+) A-I      intronic chr7:87798440(+) A-I      intronic chr7:87798412(+) A-I      intronic chr7:87819649(+) A-I      intronic chr7:87598084(+) A-I      intronic chr7:87679437(+) A-I      intronic chr7:87679466(+) A-I      intronic chr7:87818229(+) A-I      intronic chr7:87818230(+) A-I      intronic chr7:87618967(+) A-I      intronic chr7:87698595(+) A-I      intronic chr7:87698615(+) A-I      intronic chr7:87698638(+) A-I      intronic chr7:87698644(+) A-I      intronic chr7:87698646(+) A-I      intronic chr7:87569438(+) A-I      intronic chr7:87569270(+) A-I      intronic chr7:87614039(+) A-I      intronic chr7:87614070(+) A-I      intronic chr7:87614176(+) A-I      intronic chr7:87614373(+) A-I      intronic chr7:87614374(+) A-I      intronic chr7:87614379(+) A-I      intronic chr7:87614466(+) A-I      intronic chr7:87798552(+) A-I      intronic chr7:87798546(+) A-I      intronic chr7:87568106(+) A-I      intronic chr7:87568065(+) A-I      intronic chr7:87614469(+) A-I      intronic chr7:87614489(+) A-I      intronic chr7:87614535(+) A-I      intronic chr7:87614549(+) A-I      intronic chr7:87614556(+) A-I      intronic chr7:87627775(+) A-I      intronic chr7:87616593(+) A-I      intronic chr7:87616594(+) A-I      intronic chr7:87618975(+) A-I      intronic chr7:87618976(+) A-I      intronic chr7:87620078(+) A-I      intronic chr7:87620114(+) A-I      intronic chr7:87642953(+) A-I      intronic chr7:87643002(+) A-I      intronic chr7:87643867(+) A-I      intronic chr7:87643908(+) A-I      intronic chr7:87643938(+) A-I      intronic chr7:87643961(+) A-I      intronic chr7:87643964(+) A-I      intronic chr7:87648977(+) A-I      intronic chr7:87652918(+) A-I      intronic chr7:87652973(+) A-I      intronic chr7:87668647(+) A-I      intronic chr7:87669496(+) A-I      intronic chr7:87672653(+) A-I      intronic chr7:87672673(+) A-I      intronic chr7:87672679(+) A-I      intronic chr7:87672685(+) A-I      intronic chr7:87673901(+) A-I      intronic chr7:87673968(+) A-I      intronic chr7:87674450(+) A-I      intronic chr7:87674472(+) A-I      intronic chr7:87674474(+) A-I      intronic chr7:87674478(+) A-I      intronic chr7:87674516(+) A-I      intronic chr7:87674553(+) A-I      intronic chr7:87678794(+) A-I      intronic chr7:87678813(+) A-I      intronic chr7:87798555(+) A-I      intronic chr7:87798558(+) A-I      intronic chr7:87678814(+) A-I      intronic chr7:87678817(+) A-I      intronic chr7:87678831(+) A-I      intronic chr7:87568051(+) A-I      intronic chr7:87798530(+) A-I      intronic chr7:87798518(+) A-I      intronic chr7:87678840(+) A-I      intronic chr7:87798513(+) A-I      intronic chr7:87798500(+) A-I      intronic chr7:87568029(+) A-I      intronic chr7:87798499(+) A-I      intronic chr7:87567603(+) A-I      intronic chr7:87567590(+) A-I      intronic chr7:87798887(+) A-I      intronic chr7:87798857(+) A-I      intronic chr7:87798847(+) A-I      intronic chr7:87798761(+) A-I      intronic chr7:87798744(+) A-I      intronic chr7:87679421(+) A-I      intronic chr7:87679443(+) A-I      intronic chr7:87679628(+) A-I      intronic chr7:87683275(+) A-I      intronic chr7:87683287(+) A-I      intronic chr7:87683290(+) A-I      intronic chr7:87683300(+) A-I      intronic chr7:87683313(+) A-I      intronic chr7:87689831(+) A-I      intronic chr7:87689930(+) A-I      intronic chr7:87830075(+) A-I      3'UTR chr7:87826471(+) A-I      3'UTR chr7:87826432(+) A-I      3'UTR chr7:87826472(+) A-I      3'UTR chr7:87826443(+) A-I      3'UTR chr7:87826452(+) A-I      3'UTR chr7:87826450(+) A-I      3'UTR chr7:87826451(+) A-I      3'UTR chr7:87826440(+) A-I      3'UTR chr7:87830076(+) A-I      3'UTR chr7:87830114(+) A-I      3'UTR chr7:87830115(+) A-I      3'UTR chr7:87830120(+) A-I      3'UTR chr7:87569253(+) A-I      intronic chr7:87620107(+) A-I      intronic chr7:87818219(+) A-I      intronic chr7:87681703(+) A-I      intronic chr7:87679605(+) A-I      intronic chr7:87569280(+) A-I      intronic chr7:87598013(+) A-I      intronic chr7:87569254(+) A-I      intronic chr7:87652968(+) A-I      intronic chr7:87568226(+) A-I      intronic chr7:87643902(+) A-I      intronic chr7:87679642(+) A-I      intronic chr7:87651288(+) A-I      intronic chr7:87679517(+) A-I      intronic chr7:87569412(+) A-I      intronic chr7:87673891(+) A-I      intronic chr7:87819782(+) A-I      intronic chr7:87629170(+) A-I      intronic chr7:87679633(+) A-I      intronic chr7:87740267(+) A-I      intronic chr7:87646178(+) A-I      intronic chr7:87678947(+) A-I      intronic chr7:87737994(+) A-I      intronic chr7:87627799(+) A-I      intronic chr7:87681713(+) A-I      intronic chr7:87678942(+) A-I      intronic chr7:87619125(+) A-I      intronic chr7:87819775(+) A-I      intronic chr7:87614075(+) A-I      intronic chr7:87819802(+) A-I      intronic chr7:87614096(+) A-I      intronic chr7:87614015(+) A-I      intronic chr7:87679601(+) A-I      intronic chr7:87614250(+) A-I      intronic chr7:87740223(+) A-I      intronic chr7:87619045(+) A-I      intronic chr7:87642840(+) A-I      intronic chr7:87569245(+) A-I      intronic chr7:87623546(+) A-I      intronic chr7:87737882(+) A-I      intronic chr7:87674205(+) A-I      intronic chr7:87674533(+) A-I      intronic chr7:87643015(+) A-I      intronic chr7:87691211(+) A-I      intronic chr7:87614530(+) A-I      intronic chr7:87640679(+) A-I      intronic chr7:87674432(+) A-I      intronic chr7:87818243(+) A-I      intronic chr7:87740197(+) A-I      intronic chr7:87825106(+) A-I      intronic chr7:87614073(+) A-I      intronic chr7:87819694(+) A-I      intronic chr7:87691283(+) A-I      intronic chr7:87689960(+) A-I      intronic chr7:87649045(+) A-I      intronic chr7:87678951(+) A-I      intronic chr7:87618792(+) A-I      intronic chr7:87819595(+) A-I      intronic chr7:87819727(+) A-I      intronic chr7:87643786(+) A-I      intronic chr7:87691378(+) A-I      intronic chr7:87614465(+) A-I      intronic chr7:87679470(+) A-I      intronic chr7:87679606(+) A-I      intronic chr7:87569247(+) A-I      intronic chr7:87818261(+) A-I      intronic chr7:87818252(+) A-I      intronic chr7:87569417(+) A-I      intronic chr7:87825071(+) A-I      intronic chr7:87678777(+) A-I      intronic chr7:87679444(+) A-I      intronic chr7:87569418(+) A-I      intronic chr7:87620095(+) A-I      intronic chr7:87674490(+) A-I      intronic chr7:87648667(+) A-I      intronic chr7:87679485(+) A-I      intronic chr7:87678986(+) A-I      intronic chr7:87740089(+) A-I      intronic chr7:87668208(+) A-I      intronic chr7:87614507(+) A-I      intronic chr7:87679657(+) A-I      intronic chr7:87818209(+) A-I      intronic chr7:87569356(+) A-I      intronic chr7:87620001(+) A-I      intronic chr7:87643796(+) A-I      intronic chr7:87569357(+) A-I      intronic chr7:87737819(+) A-I      intronic chr7:87643794(+) A-I      intronic chr7:87618973(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	ADAM22	chr7:87598092(+) A-I intron -    22327324 chr7:87598253(+) A-I intron -    22327324 chr7:87598092(+) A-G intron -    22484847 chr7:87598106(+) A-G intron -    22484847 chr7:87598122(+) A-G intron -    22484847 chr7:87598199(+) A-G intron -    22484847 chr7:87598253(+) A-G intron -    22484847 chr7:87568226(+) A-G intron -    22484847 chr7:87569247(+) A-G intron -    22484847 chr7:87569254(+) A-G intron -    22484847 chr7:87569280(+) A-G intron -    22484847 chr7:87614015(+) A-G intron -    22484847 chr7:87614052(+) A-G intron -    22484847 chr7:87614073(+) A-G intron -    22484847 chr7:87614075(+) A-G intron -    22484847 chr7:87614081(+) A-G intron -    22484847 chr7:87614096(+) A-G intron -    22484847 chr7:87614185(+) A-G intron -    22484847 chr7:87614250(+) A-G intron -    22484847 chr7:87614261(+) A-G intron -    22484847 chr7:87614465(+) A-G intron -    22484847 chr7:87614507(+) A-G intron -    22484847 chr7:87614530(+) A-G intron -    22484847 chr7:87618792(+) A-G intron -    22484847 chr7:87618973(+) A-G intron -    22484847 chr7:87619045(+) A-G intron -    22484847 chr7:87620001(+) A-G intron -    22484847 chr7:87620047(+) A-G intron -    22484847 chr7:87620095(+) A-G intron -    22484847 chr7:87620107(+) A-G intron -    22484847 chr7:87623503(+) G-A intron -    22484847 chr7:87623530(+) G-A intron -    22484847 chr7:87623546(+) A-G intron -    22484847 chr7:87623578(+) C-G intron -    22484847 chr7:87642854(+) A-G intron -    22484847 chr7:87642857(+) A-G intron -    22484847 chr7:87643786(+) A-G intron -    22484847 chr7:87643794(+) A-G intron -    22484847 chr7:87643796(+) A-G intron -    22484847 chr7:87649045(+) A-G intron -    22484847 chr7:87649058(+) A-G intron -    22484847 chr7:87652968(+) A-G intron -    22484847 chr7:87660452(+) C-A intron -    22484847 chr7:87673793(+) A-G intron -    22484847 chr7:87673891(+) A-G intron -    22484847 chr7:87674386(+) A-G intron -    22484847 chr7:87674490(+) A-G intron -    22484847 chr7:87674533(+) A-G intron -    22484847 chr7:87678777(+) A-G intron -    22484847 chr7:87678778(+) A-G intron -    22484847 chr7:87678947(+) A-G intron -    22484847 chr7:87678951(+) A-G intron -    22484847 chr7:87679601(+) A-G intron -    22484847 chr7:87679633(+) A-G intron -    22484847 chr7:87689836(+) A-G intron -    22484847 chr7:87689960(+) A-G intron -    22484847 chr7:87691378(+) A-G intron -    22484847 chr7:87737882(+) A-G intron -    22484847 chr7:87737897(+) A-G intron -    22484847 chr7:87737994(+) A-G intron -    22484847 chr7:87740267(+) A-G intron -    22484847 chr7:87818192(+) A-G intron -    22484847 chr7:87818209(+) A-G intron -    22484847 chr7:87818219(+) A-G intron -    22484847 chr7:87818243(+) A-G intron -    22484847 chr7:87818244(+) A-G intron -    22484847 chr7:87818252(+) A-G intron -    22484847 chr7:87818261(+) A-G intron -    22484847 chr7:87819592(+) A-G intron -    22484847 chr7:87819595(+) A-G intron -    22484847 chr7:87824835(+) A-G intron -    22484847 chr7:87824911(+) A-G intron -    22484847 chr7:87765970(+) A-G intron -    22484847 chr7:87798886(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	ADAM22	chr7:87563690-87563691(+) m6A 5'UTR       25456834 chr7:87563719-87563720(+) m6A 5'UTR       24209618//25456834 chr7:87563834-87563835(+) m6A CDS       24209618 chr7:87564379-87564380(+) m6A CDS       - chr7:87704970-87704971(+) m6A CDS       - chr7:87704979-87704980(+) m6A CDS       - chr7:87704992-87704993(+) m6A CDS       - chr7:87705005-87705006(+) Am CDS       - chr7:87719289-87719290(+) m6A exon//intron       - chr7:87719323-87719324(+) m6A exon//intron       - chr7:87737530-87737531(+) m6A CDS//exon       - chr7:87737567-87737568(+) m6A CDS//exon       - chr7:87743918-87743919(+) m6A CDS//exon       - chr7:87822525-87822526(+) m6A CDS       24284625 chr7:87822537-87822538(+) m6A CDS       24284625//22608085 chr7:87825794-87825795(+) m6A CDS       24284625//22608085 chr7:87825836-87825837(+) m6A 3'UTR       24284625//22608085 chr7:87825861-87825862(+) m6A 3'UTR       22608085 chr7:87825903-87825904(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr7:87825914-87825915(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr7:87826012-87826013(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr7:87826041-87826042(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr7:87826165-87826166(+) m6A 3'UTR       22608085 chr7:87826197-87826198(+) m6A 3'UTR       22608085 chr7:87826251-87826252(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr7:87826311-87826312(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr7:87826355-87826356(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr7:87826414-87826415(+) m6A 3'UTR       22608085 chr7:87827000-87827001(+) m6A 3'UTR       22608085 chr7:87827083-87827084(+) Am 3'UTR       - chr7:87828656-87828657(+) m6A 3'UTR       22608085 chr7:87828720-87828721(+) m6A 3'UTR       25456834//22608085 chr7:87828736-87828737(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//22608085 chr7:87828763-87828764(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085 chr7:87828803-87828804(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085 chr7:87828816-87828817(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085 chr7:87828927-87828928(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085 chr7:87828983-87828984(+) m6A 3'UTR       22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-548b-5p	Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Cell lines(GBM46|GBM8|HaCaT|K562|MCF-10A|MCF-7|MGG75)|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocytes     -
	ADAM22	Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-548b-5p
Interactor2: ADAM22

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRDB
Support Database	ViRBase

References:

PMID	33201341	Target region	None
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	None	Interactor2 expression	None
Description	By custom target prediction, a panel of miRNA sequences able to recognize the SARS-CoV-2 sequence was collected. Only targets with a very high score (95-100) were retained for further analyses.