Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
---|---|---|
Symbol | hsa-let-7b-5p | TMPRSS2 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000063 | 7113 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | PRSS10 |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
miRNASNP-v3 | hsa-let-7b-5p |
|
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RADAR | TMPRSS2 |
|
Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DARNED | TMPRSS2 |
|
Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RMBase | TMPRSS2 |
|
Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RNALocate | hsa-let-7b-5p |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TMPRSS2 |
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ncDR | hsa-let-7b-5p |
|
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RNAInter | hsa-let-7b-5p |
|
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID |
---|---|---|---|---|
NoncoRNA | hsa-let-7b-5p |
Interactor1: hsa-let-7b-5p | Interactor2: TMPRSS2 |
---|
Prediction-Evidence | microT//miRanda//miRBase//miRDB//miRMap//miRWalk//PicTar//PITA//Targetscan | |
---|---|---|
Support Database | ViRBase |
[1]PMID | 33428154 | Target region | None |
---|---|---|---|
Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | None | Interactor2 expression | None |
Description | To explore the regulatory relationship between the 5 key genes, 3 coronavirus-related genes (ACE2, TMPRSS2, BSG), and their target miRNA, we used 6 miRNA target prediction databases to predict the target miRNA of these genes. |
[2]PMID | 32992681 | Target region | None |
---|---|---|---|
Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | None | Interactor2 expression | None |
Description | Table 2 shows a list of novel potential candidate miRNAs against TMPRSS2 gene which were not studied previously. |
[3]PMID | 33359190 | Target region | 3'UTR |
---|---|---|---|
Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | None | Interactor2 expression | None |
Description | Albeit, list of putative miRNAs (11 miRNAs) retrieved as result from all the three prediction tools is represented in Fig. 2f. |
[4]PMID | 32814446 | Target region | None |
---|---|---|---|
Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | None | Interactor2 expression | None |
Description | Considering the significance of ACE2 and TMPRSS2 in SARS-CoV-2 infection, we also performed a TargetScan (http://www.targetscan.org/vert_72/) search for the miRNAs that could target these two receptors, and the analysis revealed a list of miRNAs such as, hsa-miRNA 200b-3p, hsa-miRNA 200c-3p and miRNA 429 for ACE2, and hsa-let 7c-5p, hsa-miRNA 98-5p, hsa-let 7f-5p, hsa-let 7a-5p, hsa-let 7g-5p, hsa-let 7b-5p, hsa-miRNA 4458, hsa-let 7e-5p, hsa-let 7i-5p, hsa-let 7d-5p, and hsa-miRNA 4500 for TMPRSS2. |