Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-619-5p | VPS4A |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0026622 | 27183 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | SKD1//SKD1A//SKD2//VPS4//VPS4-1 |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | |||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-619-5p |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | VPS4A |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | VPS4A |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | VPS4A |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID |
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RNALocate | hsa-miR-619-5p | |||
VPS4A |
Interactor1: hsa-miR-619-5p | Interactor2: VPS4A |
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Weak-Evidence | Illumina sequencing | |
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Prediction-Evidence | miRanda | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 32223537 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | Calu-3 cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | The miRNA-mRNA pairs with strong correlations were selected for miRNA-mRNA binding site prediction using miRanda. |