Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-1275 | ATXN1L |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0005929 | 342371 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | BOAT//BOAT1 |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-1275 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | ||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | ATXN1L |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||
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DARNED | ATXN1L |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | ATXN1L |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-1275 |
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ATXN1L |
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||
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RNAInter | hsa-miR-1275 |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | ||
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RNAactDrug | hsa-miR-1275 |
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Interactor1: hsa-miR-1275 | Interactor2: ATXN1L |
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Weak-Evidence | Illumina sequencing | |
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Prediction-Evidence | miRanda | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 32223537 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | Calu-3 cells | Interactor2 expression | Upregulation |
Description | The miRNA-mRNA pairs with strong correlations were selected for miRNA-mRNA binding site prediction using miRanda. |