Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00098965

  Virus:  

Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.5711

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-26a-1-3p SSBP2
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0004499 23635
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - HSPC116//SOSS-B2

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-26a-1-3p
rs182070256 chr3:37969473    G/A
rs771522629 chr3:37969472    C/T

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR SSBP2
chr5:80878581(-) A-I      intronic
chr5:80878572(-) A-I      intronic
chr5:80878569(-) A-I      intronic
chr5:80878551(-) A-I      intronic
chr5:80878510(-) A-I      intronic
chr5:80871010(-) A-I      intronic
chr5:80854898(-) A-I      intronic
chr5:80846766(-) A-I      intronic
chr5:80975117(-) A-I      intronic
chr5:81025042(-) A-I      intronic
chr5:81025033(-) A-I      intronic
chr5:81025027(-) A-I      intronic
chr5:81025007(-) A-I      intronic
chr5:81025006(-) A-I      intronic
chr5:80844654(-) A-I      intronic
chr5:80844593(-) A-I      intronic
chr5:80843581(-) A-I      intronic
chr5:80843519(-) A-I      intronic
chr5:80843495(-) A-I      intronic
chr5:80843453(-) A-I      intronic
chr5:80843450(-) A-I      intronic
chr5:80843424(-) A-I      intronic
chr5:80843343(-) A-I      intronic
chr5:80838709(-) A-I      intronic
chr5:80832700(-) A-I      intronic
chr5:80796970(-) A-I      intronic
chr5:80796567(-) A-I      intronic
chr5:80796506(-) A-I      intronic
chr5:80796457(-) A-I      intronic
chr5:80796408(-) A-I      intronic
chr5:80796356(-) A-I      intronic
chr5:80796227(-) A-I      intronic
chr5:80796161(-) A-I      intronic
chr5:80796067(-) A-I      intronic
chr5:80796066(-) A-I      intronic
chr5:80792192(-) A-I      intronic
chr5:80792163(-) A-I      intronic
chr5:80792118(-) A-I      intronic
chr5:80789467(-) A-I      intronic
chr5:80789393(-) A-I      intronic
chr5:80789381(-) A-I      intronic
chr5:80789345(-) A-I      intronic
chr5:80778044(-) A-I      intronic
chr5:80778000(-) A-I      intronic
chr5:80777982(-) A-I      intronic
chr5:80777967(-) A-I      intronic
chr5:80777929(-) A-I      intronic
chr5:80777828(-) A-I      intronic
chr5:80777392(-) A-I      intronic
chr5:80777340(-) A-I      intronic
chr5:80777275(-) A-I      intronic
chr5:80759883(-) A-I      intronic
chr5:80759855(-) A-I      intronic
chr5:80759764(-) A-I      intronic
chr5:80759397(-) A-I      intronic
chr5:80753727(-) A-I      intronic
chr5:80753685(-) A-I      intronic
chr5:80753684(-) A-I      intronic
chr5:80753631(-) A-I      intronic
chr5:80753570(-) A-I      intronic
chr5:80751225(-) A-I      intronic
chr5:80750512(-) A-I      intronic
chr5:80750388(-) A-I      intronic
chr5:80750257(-) A-I      intronic
chr5:80750230(-) A-I      intronic
chr5:80749556(-) A-I      intronic
chr5:80749547(-) A-I      intronic
chr5:80749112(-) A-I      intronic
chr5:80748896(-) A-I      intronic
chr5:80748219(-) A-I      intronic
chr5:80748205(-) A-I      intronic
chr5:80748192(-) A-I      intronic
chr5:80747440(-) A-I      intronic
chr5:80747428(-) A-I      intronic
chr5:80747416(-) A-I      intronic
chr5:80747414(-) A-I      intronic
chr5:80740916(-) A-I      intronic
chr5:80740895(-) A-I      intronic
chr5:80740890(-) A-I      intronic
chr5:80740880(-) A-I      intronic
chr5:80740856(-) A-I      intronic
chr5:80740855(-) A-I      intronic
chr5:80740842(-) A-I      intronic
chr5:80740820(-) A-I      intronic
chr5:80740818(-) A-I      intronic
chr5:80740793(-) A-I      intronic
chr5:80740759(-) A-I      intronic
chr5:80740750(-) A-I      intronic
chr5:80740697(-) A-I      intronic
chr5:80740685(-) A-I      intronic
chr5:80739662(-) A-I      intronic
chr5:80739653(-) A-I      intronic
chr5:80739610(-) A-I      intronic
chr5:80739601(-) A-I      intronic
chr5:80739492(-) A-I      intronic
chr5:80739450(-) A-I      intronic
chr5:80739449(-) A-I      intronic
chr5:80735785(-) A-I      intronic
chr5:80735629(-) A-I      intronic
chr5:80735619(-) A-I      intronic
chr5:80735602(-) A-I      intronic
chr5:80735413(-) A-I      intronic
chr5:80735388(-) A-I      intronic
chr5:80734048(-) A-I      intronic
chr5:80734035(-) A-I      intronic
chr5:80734032(-) A-I      intronic
chr5:80734007(-) A-I      intronic
chr5:80734004(-) A-I      intronic
chr5:80733990(-) A-I      intronic
chr5:80733977(-) A-I      intronic
chr5:80728524(-) A-I      intronic
chr5:80728502(-) A-I      intronic
chr5:80728483(-) A-I      intronic
chr5:80728482(-) A-I      intronic
chr5:80728456(-) A-I      intronic
chr5:80728443(-) A-I      intronic
chr5:80728381(-) A-I      intronic
chr5:80728372(-) A-I      intronic
chr5:80728367(-) A-I      intronic
chr5:80727694(-) A-I      intronic
chr5:80727684(-) A-I      intronic
chr5:80727612(-) A-I      intronic
chr5:80727604(-) A-I      intronic
chr5:80727564(-) A-I      intronic
chr5:80727542(-) A-I      intronic
chr5:80727496(-) A-I      intronic
chr5:80727420(-) A-I      intronic
chr5:80717200(-) A-I      intronic
chr5:80956177(-) A-I      intronic
chr5:80836173(-) A-I      intronic
chr5:80836154(-) A-I      intronic
chr5:80836143(-) A-I      intronic
chr5:80957698(-) A-I      intronic
chr5:80957693(-) A-I      intronic
chr5:80957690(-) A-I      intronic
chr5:80734070(-) A-I      intronic
chr5:80957705(-) A-I      intronic
chr5:80957689(-) A-I      intronic
chr5:80883425(-) A-I      intronic
chr5:80957688(-) A-I      intronic
chr5:80796071(-) A-I      intronic
chr5:80759772(-) A-I      intronic
chr5:80759766(-) A-I      intronic
chr5:80759462(-) A-I      intronic
chr5:80957704(-) A-I      intronic
chr5:81008723(-) A-I      intronic
chr5:81008696(-) A-I      intronic
chr5:81008636(-) A-I      intronic
chr5:81008552(-) A-I      intronic
chr5:80994459(-) A-I      intronic
chr5:80968927(-) A-I      intronic
chr5:80958113(-) A-I      intronic
chr5:80884832(-) A-I      intronic
chr5:80883993(-) A-I      intronic
chr5:80883945(-) A-I      intronic
chr5:80728489(-) A-I      intronic
chr5:80883492(-) A-I      intronic
chr5:80883486(-) A-I      intronic
chr5:80879402(-) A-I      intronic
chr5:80879367(-) A-I      intronic
chr5:80879349(-) A-I      intronic
chr5:80879327(-) A-I      intronic
chr5:80879301(-) A-I      intronic
chr5:80879300(-) A-I      intronic
chr5:80748995(-) A-I      intronic
chr5:80748941(-) A-I      intronic
chr5:80879244(-) A-I      intronic
chr5:80879014(-) A-I      intronic
chr5:80878860(-) A-I      intronic
chr5:80878823(-) A-I      intronic
chr5:80883933(-) A-I      intronic
chr5:80883917(-) A-I      intronic
chr5:80857952(-) A-I      intronic
chr5:80857944(-) A-I      intronic
chr5:80857938(-) A-I      intronic
chr5:80857929(-) A-I      intronic
chr5:80857928(-) A-I      intronic
chr5:80857921(-) A-I      intronic
chr5:80857918(-) A-I      intronic
chr5:80857904(-) A-I      intronic
chr5:80759371(-) A-I      intronic
chr5:80750443(-) A-I      intronic
chr5:80750418(-) A-I      intronic
chr5:80750417(-) A-I      intronic
chr5:80750400(-) A-I      intronic
chr5:80727550(-) A-I      intronic
chr5:80727513(-) A-I      intronic
chr5:80727512(-) A-I      intronic
chr5:80796226(-) A-I      intronic
chr5:80711950(-) A-I      3'UTR
chr5:80711978(-) A-I      3'UTR
chr5:80711475(-) A-I      3'UTR
chr5:80711506(-) A-I      3'UTR
chr5:80711991(-) A-I      3'UTR
chr5:80712002(-) A-I      3'UTR
chr5:80712013(-) A-I      3'UTR
chr5:80712733(-) A-I      3'UTR
chr5:80712753(-) A-I      3'UTR
chr5:80711550(-) A-I      3'UTR
chr5:80712804(-) A-I      3'UTR
chr5:80712783(-) A-I      3'UTR
chr5:80712841(-) A-I      3'UTR
chr5:80712848(-) A-I      3'UTR
chr5:80712777(-) A-I      3'UTR
chr5:80712773(-) A-I      3'UTR
chr5:80711564(-) A-I      3'UTR
chr5:80711583(-) A-I      3'UTR
chr5:80712850(-) A-I      3'UTR
chr5:80712854(-) A-I      3'UTR
chr5:80712858(-) A-I      3'UTR
chr5:80711729(-) A-I      3'UTR
chr5:80711684(-) A-I      3'UTR
chr5:80711894(-) A-I      3'UTR
chr5:80712813(-) A-I      3'UTR
chr5:80712849(-) A-I      3'UTR
chr5:80712851(-) A-I      3'UTR
chr5:80712856(-) A-I      3'UTR
chr5:80711538(-) A-I      3'UTR
chr5:80712879(-) A-I      3'UTR
chr5:80712887(-) A-I      3'UTR
chr5:80712897(-) A-I      3'UTR
chr5:80712900(-) A-I      3'UTR
chr5:80712916(-) A-I      3'UTR
chr5:80711876(-) A-I      3'UTR
chr5:80712950(-) A-I      3'UTR
chr5:80712770(-) A-I      3'UTR
chr5:80712926(-) A-I      3'UTR
chr5:80712888(-) A-I      3'UTR
chr5:80711674(-) A-I      3'UTR
chr5:80711669(-) A-I      3'UTR
chr5:80711668(-) A-I      3'UTR
chr5:80711662(-) A-I      3'UTR
chr5:80711644(-) A-I      3'UTR
chr5:80711850(-) A-I      3'UTR
chr5:80712877(-) A-I      3'UTR
chr5:80712805(-) A-I      3'UTR
chr5:80712819(-) A-I      3'UTR
chr5:80711959(-) A-I      3'UTR
chr5:80712859(-) A-I      3'UTR
chr5:80712860(-) A-I      3'UTR
chr5:80712863(-) A-I      3'UTR
chr5:80711914(-) A-I      3'UTR
chr5:80711923(-) A-I      3'UTR
chr5:80711612(-) A-I      3'UTR
chr5:80711609(-) A-I      3'UTR
chr5:80711596(-) A-I      3'UTR
chr5:80711587(-) A-I      3'UTR
chr5:80712878(-) A-I      3'UTR
chr5:80759699(-) A-I      intronic
chr5:80759820(-) A-I      intronic
chr5:80843426(-) A-I      intronic
chr5:80796983(-) A-I      intronic
chr5:80975092(-) A-I      intronic
chr5:80846726(-) A-I      intronic
chr5:80777382(-) A-I      intronic
chr5:80748173(-) A-I      intronic
chr5:81008681(-) A-I      intronic
chr5:80789512(-) A-I      intronic
chr5:80878617(-) A-I      intronic
chr5:80988960(-) A-I      intronic
chr5:80884761(-) A-I      intronic
chr5:80949915(-) A-I      intronic
chr5:80878640(-) A-I      intronic
chr5:80759744(-) A-I      intronic
chr5:80878509(-) A-I      intronic
chr5:80939604(-) A-I      intronic
chr5:80796206(-) A-I      intronic
chr5:80753583(-) A-I      intronic
chr5:80883923(-) A-I      intronic
chr5:80960056(-) A-I      intronic
chr5:80883417(-) A-I      intronic
chr5:80843538(-) A-I      intronic
chr5:80777318(-) A-I      intronic
chr5:80846757(-) A-I      intronic
chr5:80759456(-) A-I      intronic
chr5:80789242(-) A-I      intronic
chr5:80759436(-) A-I      intronic
chr5:80759275(-) A-I      intronic
chr5:80759419(-) A-I      intronic
chr5:80759725(-) A-I      intronic
chr5:80759763(-) A-I      intronic
chr5:80748201(-) A-I      intronic
chr5:80777989(-) A-I      intronic
chr5:80759410(-) A-I      intronic
chr5:80749034(-) A-I      intronic
chr5:80958534(-) A-I      intronic
chr5:80759711(-) A-I      intronic
chr5:80749548(-) A-I      intronic
chr5:80759274(-) A-I      intronic
chr5:80838771(-) A-I      intronic
chr5:80878550(-) A-I      intronic
chr5:81023246(-) A-I      intronic
chr5:80975024(-) A-I      intronic
chr5:80777966(-) A-I      intronic
chr5:80878995(-) A-I      intronic
chr5:80884716(-) A-I      intronic
chr5:80879032(-) A-I      intronic
chr5:80750328(-) A-I      intronic
chr5:80778042(-) A-I      intronic
chr5:80878595(-) A-I      intronic
chr5:80749065(-) A-I      intronic
chr5:80739571(-) A-I      intronic
chr5:80739654(-) A-I      intronic
chr5:80748241(-) A-I      intronic
chr5:80759844(-) A-I      intronic
chr5:80796788(-) A-I      intronic
chr5:80840007(-) A-I      intronic
chr5:80759839(-) A-I      intronic
chr5:80883357(-) A-I      intronic
chr5:81030626(-) A-I      intronic
chr5:80748931(-) A-I      intronic
chr5:80759370(-) A-I      intronic
chr5:80712956(-) A-I      3'UTR
chr5:80711542(-) A-I      3'UTR
chr5:80711567(-) A-I      3'UTR
chr5:80712903(-) A-I      3'UTR
chr5:80712902(-) A-I      3'UTR
chr5:80711807(-) A-I      3'UTR
chr5:80711935(-) A-I      3'UTR
chr5:80711692(-) A-I      3'UTR
chr5:80712818(-) A-I      3'UTR
chr5:80712935(-) A-I      3'UTR
chr5:80759771(-) A-I      intronic
chr5:80759660(-) A-I      intronic
chr5:80884695(-) A-I      intronic
chr5:81030668(-) A-I      intronic
chr5:80995912(-) A-I      intronic
chr5:80878795(-) A-I      intronic
chr5:80796130(-) A-I      intronic
chr5:80884834(-) A-I      intronic
chr5:80883984(-) A-I      intronic
chr5:80759685(-) A-I      intronic
chr5:80747342(-) A-I      intronic
chr5:80878952(-) A-I      intronic
chr5:80789407(-) A-I      intronic
chr5:80796867(-) A-I      intronic
chr5:80958499(-) A-I      intronic
chr5:80878783(-) A-I      intronic
chr5:80844629(-) A-I      intronic
chr5:80844641(-) A-I      intronic
chr5:80748870(-) A-I      intronic
chr5:80727446(-) A-I      intronic
chr5:80949846(-) A-I      intronic
chr5:80883421(-) A-I      intronic
chr5:80785725(-) A-I      intronic
chr5:80748232(-) A-I      intronic
chr5:80777376(-) A-I      intronic
chr5:80923784(-) A-I      intronic
chr5:80759726(-) A-I      intronic
chr5:80748879(-) A-I      intronic
chr5:80924866(-) A-I      intronic
chr5:80878523(-) A-I      intronic
chr5:80796914(-) A-I      intronic
chr5:80750509(-) A-I      intronic
chr5:80878873(-) A-I      intronic
chr5:80975100(-) A-I      intronic
chr5:81026204(-) A-I      intronic
chr5:80739586(-) A-I      intronic
chr5:80759630(-) A-I      intronic
chr5:80759815(-) A-I      intronic
chr5:80931519(-) A-I      intronic
chr5:80844617(-) A-I      intronic
chr5:80777363(-) A-I      intronic
chr5:80923762(-) A-I      intronic
chr5:80734113(-) A-I      intronic
chr5:80879337(-) A-I      intronic
chr5:80878984(-) A-I      intronic
chr5:80739582(-) A-I      intronic
chr5:80777278(-) A-I      intronic
chr5:80878616(-) A-I      intronic
chr5:80878480(-) A-I      intronic
chr5:80753708(-) A-I      intronic
chr5:80759307(-) A-I      intronic
chr5:80883366(-) A-I      intronic
chr5:80727501(-) A-I      intronic
chr5:80939600(-) A-I      intronic
chr5:80739559(-) A-I      intronic
chr5:80878822(-) A-I      intronic
chr5:80739542(-) A-I      intronic
chr5:80846815(-) A-I      intronic
chr5:80759765(-) A-I      intronic
chr5:80777829(-) A-I      intronic
chr5:80843400(-) A-I      intronic
chr5:80796776(-) A-I      intronic
chr5:80843471(-) A-I      intronic
chr5:81008710(-) A-I      intronic
chr5:81008707(-) A-I      intronic
chr5:80759301(-) A-I      intronic
chr5:80734156(-) A-I      intronic
chr5:81026314(-) A-I      intronic
chr5:80990537(-) A-I      intronic
chr5:80727528(-) A-I      intronic
chr5:80740920(-) A-I      intronic
chr5:80749120(-) A-I      intronic
chr5:80988857(-) A-I      intronic
chr5:80748989(-) A-I      intronic
chr5:80777316(-) A-I      intronic
chr5:81023206(-) A-I      intronic
chr5:81008654(-) A-I      intronic
chr5:80878684(-) A-I      intronic
chr5:80924902(-) A-I      intronic
chr5:80753760(-) A-I      intronic
chr5:80796109(-) A-I      intronic
chr5:80883949(-) A-I      intronic
chr5:80759437(-) A-I      intronic
chr5:80789672(-) A-I      intronic
chr5:80728441(-) A-I      intronic
chr5:81026195(-) A-I      intronic
chr5:80789228(-) A-I      intronic
chr5:81023329(-) A-I      intronic
chr5:80759302(-) A-I      intronic
chr5:80759351(-) A-I      intronic
chr5:80796129(-) A-I      intronic
chr5:81011659(-) A-I      intronic
chr5:80879386(-) A-I      intronic
chr5:80883906(-) A-I      intronic
chr5:80739546(-) A-I      intronic
chr5:80878691(-) A-I      intronic
chr5:80844560(-) A-I      intronic
chr5:80929041(-) A-I      intronic
chr5:80777370(-) A-I      intronic
chr5:80759262(-) A-I      intronic
chr5:80958538(-) A-I      intronic
chr5:80796171(-) A-I      intronic
chr5:80884838(-) A-I      intronic
chr5:80995777(-) A-I      intronic
chr5:80994414(-) A-I      intronic
chr5:80878481(-) A-I      intronic
chr5:80759838(-) A-I      intronic
chr5:80883502(-) A-I      intronic
chr5:80879192(-) A-I      intronic
chr5:80843559(-) A-I      intronic
chr5:80884827(-) A-I      intronic
chr5:80949921(-) A-I      intronic
chr5:80751182(-) A-I      intronic
chr5:80750337(-) A-I      intronic
chr5:80750327(-) A-I      intronic
chr5:80750384(-) A-I      intronic
chr5:80815882(-) A-I      intronic
chr5:80777315(-) A-I      intronic
chr5:80878837(-) A-I      intronic
chr5:80949878(-) A-I      intronic
chr5:80759882(-) A-I      intronic
chr5:80759752(-) A-I      intronic
chr5:80796165(-) A-I      intronic
chr5:80883929(-) A-I      intronic
chr5:80778053(-) A-I      intronic
chr5:81011658(-) A-I      intronic
chr5:80796332(-) A-I      intronic
chr5:80878443(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED SSBP2
chr5:80759725(-) A-I intron -    21960545
chr5:80759726(-) A-I intron -    21960545
chr5:80897449(-) A-G intron -    22484847
chr5:81015799(-) A-C intron -    22484847
chr5:80748931(-) A-G intron -    22484847
chr5:80753583(-) A-G intron -    22484847
chr5:80759301(-) A-G intron -    22484847
chr5:80759302(-) A-G intron -    22484847
chr5:80759362(-) A-G intron -    22484847
chr5:80759395(-) A-G intron -    22484847
chr5:80759410(-) A-G intron -    22484847
chr5:80759419(-) A-G intron -    22484847
chr5:80759436(-) A-G intron -    22484847
chr5:80759478(-) A-G intron -    22484847
chr5:80759770(-) A-G intron -    22484847
chr5:80759820(-) A-G intron -    22484847
chr5:80759834(-) A-G intron -    22484847
chr5:80759838(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777249(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777278(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777315(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777316(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777318(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777363(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777370(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777376(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777382(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777821(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777829(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777899(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777966(-) A-G intron -    22484847
chr5:80777989(-) A-G intron -    22484847
chr5:80778042(-) A-G intron -    22484847
chr5:80778053(-) A-G intron -    22484847
chr5:80789242(-) A-G intron -    22484847
chr5:80789492(-) A-G intron -    22484847
chr5:80789512(-) A-G intron -    22484847
chr5:80789672(-) A-G intron -    22484847
chr5:80796165(-) A-G intron -    22484847
chr5:80796171(-) A-G intron -    22484847
chr5:80796332(-) A-G intron -    22484847
chr5:80796867(-) A-G intron -    22484847
chr5:80796914(-) A-G intron -    22484847
chr5:80816055(-) A-G intron -    22484847
chr5:80840007(-) A-G intron -    22484847
chr5:80843383(-) A-G intron -    22484847
chr5:80844552(-) A-G intron -    22484847
chr5:80844560(-) A-G intron -    22484847
chr5:80844577(-) A-G intron -    22484847
chr5:80844617(-) A-G intron -    22484847
chr5:80844641(-) A-G intron -    22484847
chr5:80846757(-) A-G intron -    22484847
chr5:80871068(-) G-T intron -    22484847
chr5:80878480(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878523(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878539(-) T-C intron -    22484847
chr5:80878550(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878595(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878616(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878617(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878640(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878684(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878685(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878691(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878783(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878795(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878822(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878837(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878941(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878952(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878984(-) A-G intron -    22484847
chr5:80878995(-) A-G intron -    22484847
chr5:80879024(-) A-G intron -    22484847
chr5:80879032(-) A-G intron -    22484847
chr5:80879386(-) A-G intron -    22484847
chr5:80883467(-) A-G intron -    22484847
chr5:80883502(-) A-G intron -    22484847
chr5:80883515(-) A-G intron -    22484847
chr5:80883896(-) G-A intron -    22484847
chr5:80883897(-) T-C intron -    22484847
chr5:80883922(-) A-G intron -    22484847
chr5:80883929(-) A-G intron -    22484847
chr5:80884004(-) A-G intron -    22484847
chr5:80884695(-) A-G intron -    22484847
chr5:80884834(-) A-G intron -    22484847
chr5:80884838(-) A-G intron -    22484847
chr5:80931519(-) A-G intron -    22484847
chr5:80958449(-) G-A intron -    22484847
chr5:80975024(-) A-G intron -    22484847
chr5:80975092(-) A-G intron -    22484847
chr5:80975100(-) A-G intron -    22484847
chr5:80982531(-) C-T intron -    22484847
chr5:80995777(-) A-G intron -    22484847
chr5:81008710(-) A-G intron -    22484847
chr5:81023206(-) A-G intron -    22484847
chr5:81023246(-) A-G intron -    22484847
chr5:81030626(-) A-G intron -    22484847
chr5:81030668(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase SSBP2
chr5:80715826-80715827(-) m6A 3'UTR//exon       27773535
chr5:80715879-80715880(-) m6A 3'UTR//exon       27773535
chr5:80715948-80715949(-) m6A 3'UTR//exon       27773535//22608085
chr5:80715996-80715997(-) m6A 3'UTR//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:80716027-80716028(-) m6A 3'UTR//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:80716098-80716099(-) m6A 3'UTR//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:80716103-80716104(-) m6A 3'UTR//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:80716139-80716140(-) m6A 3'UTR//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:80716205-80716206(-) m6A 3'UTR//exon       27773535
chr5:80716229-80716230(-) m6A 3'UTR//exon       27773535
chr5:80716270-80716271(-) m6A 3'UTR//exon       27773535
chr5:80716296-80716297(-) m6A 3'UTR//exon       24981863//27773535
chr5:80932420-80932421(-) m6A CDS//exon//intron       27773535
chr5:80946099-80946100(-) m6A 5'UTR//CDS//exon//intron       27773535
chr5:81046715-81046716(-) m6A exon//intron       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-26a-1-3p
Exosome Plasma     23663360
Exosome Plasma     24683445
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Mesenchymal stem cells     -
Mitochondrion Skeletal muscle myoblasts     21637849
SSBP2
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol K562 cells     -
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus K562 cells     -
Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-26a-1-3p
Interactor2: SSBP2

Evidence Support:


Weak-Evidence Illumina sequencing
Prediction-Evidence miRanda
Support Database ViRBase

References:


PMID 32223537 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line Calu-3 cells Interactor2 expression Upregulation
Description The miRNA-mRNA pairs with strong correlations were selected for miRNA-mRNA binding site prediction using miRanda.

Starting a new search, please wait ...