Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00098957

  Virus:  

Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.5711

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-26a-1-3p:  MIMAT0004499          CDKL5:  NM_001037343     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-26a-1-3p	CDKL5
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004499	6792
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CFAP247//DEE2//EIEE2//ISSX//STK9

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-26a-1-3p	rs182070256 chr3:37969473    G/A rs771522629 chr3:37969472    C/T

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	CDKL5	chrX:18450133(+) A-I      intronic chrX:18451101(+) A-I      intronic chrX:18477500(+) A-I      intronic chrX:18477462(+) A-I      intronic chrX:18474343(+) A-I      intronic chrX:18450636(+) A-I      intronic chrX:18474289(+) A-I      intronic chrX:18472919(+) A-I      intronic chrX:18470726(+) A-I      intronic chrX:18470712(+) A-I      intronic chrX:18470663(+) A-I      intronic chrX:18467979(+) A-I      intronic chrX:18467935(+) A-I      intronic chrX:18467187(+) A-I      intronic chrX:18467080(+) A-I      intronic chrX:18467079(+) A-I      intronic chrX:18466018(+) A-I      intronic chrX:18464351(+) A-I      intronic chrX:18464338(+) A-I      intronic chrX:18464239(+) A-I      intronic chrX:18464208(+) A-I      intronic chrX:18459409(+) A-I      intronic chrX:18456733(+) A-I      intronic chrX:18456723(+) A-I      intronic chrX:18456370(+) A-I      intronic chrX:18456369(+) A-I      intronic chrX:18454989(+) A-I      intronic chrX:18454866(+) A-I      intronic chrX:18454855(+) A-I      intronic chrX:18454849(+) A-I      intronic chrX:18454842(+) A-I      intronic chrX:18454756(+) A-I      intronic chrX:18450483(+) A-I      intronic chrX:18450470(+) A-I      intronic chrX:18450407(+) A-I      intronic chrX:18450122(+) A-I      intronic chrX:18450103(+) A-I      intronic chrX:18449082(+) A-I      intronic chrX:18449081(+) A-I      intronic chrX:18448725(+) A-I      intronic chrX:18448703(+) A-I      intronic chrX:18448681(+) A-I      intronic chrX:18448665(+) A-I      intronic chrX:18448664(+) A-I      intronic chrX:18448663(+) A-I      intronic chrX:18487195(+) A-I      intronic chrX:18449708(+) A-I      intronic chrX:18449681(+) A-I      intronic chrX:18449671(+) A-I      intronic chrX:18449245(+) A-I      intronic chrX:18449167(+) A-I      intronic chrX:18449164(+) A-I      intronic chrX:18655386(+) A-I      intronic chrX:18655249(+) A-I      intronic chrX:18636903(+) A-I      intronic chrX:18636893(+) A-I      intronic chrX:18636888(+) A-I      intronic chrX:18636833(+) A-I      intronic chrX:18636825(+) A-I      intronic chrX:18634598(+) A-I      intronic chrX:18634593(+) A-I      intronic chrX:18634587(+) A-I      intronic chrX:18633602(+) A-I      intronic chrX:18633561(+) A-I      intronic chrX:18585980(+) A-I      intronic chrX:18577474(+) A-I      intronic chrX:18577458(+) A-I      intronic chrX:18574883(+) A-I      intronic chrX:18574882(+) A-I      intronic chrX:18570377(+) A-I      intronic chrX:18570299(+) A-I      intronic chrX:18570238(+) A-I      intronic chrX:18570182(+) A-I      intronic chrX:18570174(+) A-I      intronic chrX:18564483(+) A-I      intronic chrX:18564482(+) A-I      intronic chrX:18564462(+) A-I      intronic chrX:18548194(+) A-I      intronic chrX:18546944(+) A-I      intronic chrX:18546807(+) A-I      intronic chrX:18546805(+) A-I      intronic chrX:18536735(+) A-I      intronic chrX:18536654(+) A-I      intronic chrX:18536642(+) A-I      intronic chrX:18536599(+) A-I      intronic chrX:18535978(+) A-I      intronic chrX:18535925(+) A-I      intronic chrX:18535001(+) A-I      intronic chrX:18534985(+) A-I      intronic chrX:18534982(+) A-I      intronic chrX:18534973(+) A-I      intronic chrX:18532952(+) A-I      intronic chrX:18532742(+) A-I      intronic chrX:18532676(+) A-I      intronic chrX:18532555(+) A-I      intronic chrX:18527133(+) A-I      intronic chrX:18527115(+) A-I      intronic chrX:18527106(+) A-I      intronic chrX:18527066(+) A-I      intronic chrX:18527057(+) A-I      intronic chrX:18527054(+) A-I      intronic chrX:18527053(+) A-I      intronic chrX:18527052(+) A-I      intronic chrX:18527051(+) A-I      intronic chrX:18527048(+) A-I      intronic chrX:18527003(+) A-I      intronic chrX:18505559(+) A-I      intronic chrX:18505512(+) A-I      intronic chrX:18502621(+) A-I      intronic chrX:18489629(+) A-I      intronic chrX:18489562(+) A-I      intronic chrX:18489557(+) A-I      intronic chrX:18488506(+) A-I      intronic chrX:18488271(+) A-I      intronic chrX:18488270(+) A-I      intronic chrX:18487573(+) A-I      intronic chrX:18487549(+) A-I      intronic chrX:18487203(+) A-I      intronic chrX:18454746(+) A-I      intronic chrX:18484895(+) A-I      intronic chrX:18484871(+) A-I      intronic chrX:18484748(+) A-I      intronic chrX:18452895(+) A-I      intronic chrX:18451582(+) A-I      intronic chrX:18451559(+) A-I      intronic chrX:18484733(+) A-I      intronic chrX:18484731(+) A-I      intronic chrX:18482470(+) A-I      intronic chrX:18482454(+) A-I      intronic chrX:18482436(+) A-I      intronic chrX:18482424(+) A-I      intronic chrX:18481037(+) A-I      intronic chrX:18478804(+) A-I      intronic chrX:18478650(+) A-I      intronic chrX:18478105(+) A-I      intronic chrX:18478093(+) A-I      intronic chrX:18478054(+) A-I      intronic chrX:18477925(+) A-I      intronic chrX:18477924(+) A-I      intronic chrX:18477899(+) A-I      intronic chrX:18477501(+) A-I      intronic chrX:18451152(+) A-I      intronic chrX:18451149(+) A-I      intronic chrX:18450158(+) A-I      intronic chrX:18450141(+) A-I      intronic chrX:18470609(+) A-I      intronic chrX:18451555(+) A-I      intronic chrX:18497621(+) A-I      intronic chrX:18459360(+) A-I      intronic chrX:18451576(+) A-I      intronic chrX:18532665(+) A-I      intronic chrX:18476816(+) A-I      intronic chrX:18483678(+) A-I      intronic chrX:18447825(+) A-I      intronic chrX:18454964(+) A-I      intronic chrX:18569818(+) A-I      intronic chrX:18484655(+) A-I      intronic chrX:18536070(+) A-I      intronic chrX:18478218(+) A-I      intronic chrX:18484760(+) A-I      intronic chrX:18458773(+) A-I      intronic chrX:18452838(+) A-I      intronic chrX:18490123(+) A-I      intronic chrX:18487306(+) A-I      intronic chrX:18634584(+) A-I      intronic chrX:18477631(+) A-I      intronic chrX:18497646(+) A-I      intronic chrX:18536007(+) A-I      intronic chrX:18454876(+) A-I      intronic chrX:18489729(+) A-I      intronic chrX:18634666(+) A-I      intronic chrX:18454861(+) A-I      intronic chrX:18450774(+) A-I      intronic chrX:18478132(+) A-I      intronic chrX:18456745(+) A-I      intronic chrX:18454841(+) A-I      intronic chrX:18451197(+) A-I      intronic chrX:18451276(+) A-I      intronic chrX:18477548(+) A-I      intronic chrX:18452980(+) A-I      intronic chrX:18452865(+) A-I      intronic chrX:18477986(+) A-I      intronic chrX:18458720(+) A-I      intronic chrX:18536709(+) A-I      intronic chrX:18451192(+) A-I      intronic chrX:18488377(+) A-I      intronic chrX:18464387(+) A-I      intronic chrX:18489676(+) A-I      intronic chrX:18451547(+) A-I      intronic chrX:18459380(+) A-I      intronic chrX:18487380(+) A-I      intronic chrX:18538974(+) A-I      intronic chrX:18449694(+) A-I      intronic chrX:18459362(+) A-I      intronic chrX:18528376(+) A-I      intronic chrX:18450115(+) A-I      intronic chrX:18457877(+) A-I      intronic chrX:18478282(+) A-I      intronic chrX:18464334(+) A-I      intronic chrX:18532662(+) A-I      intronic chrX:18505915(+) A-I      intronic chrX:18505978(+) A-I      intronic chrX:18487201(+) A-I      intronic chrX:18484770(+) A-I      intronic chrX:18532698(+) A-I      intronic chrX:18535924(+) A-I      intronic chrX:18451550(+) A-I      intronic chrX:18456803(+) A-I      intronic chrX:18633667(+) A-I      intronic chrX:18476779(+) A-I      intronic chrX:18569902(+) A-I      intronic chrX:18488292(+) A-I      intronic chrX:18558423(+) A-I      intronic chrX:18454805(+) A-I      intronic chrX:18452928(+) A-I      intronic chrX:18478110(+) A-I      intronic chrX:18477594(+) A-I      intronic chrX:18532734(+) A-I      intronic chrX:18505535(+) A-I      intronic chrX:18451201(+) A-I      intronic chrX:18453961(+) A-I      intronic chrX:18532651(+) A-I      intronic chrX:18563297(+) A-I      intronic chrX:18488300(+) A-I      intronic chrX:18489780(+) A-I      intronic chrX:18458612(+) A-I      intronic chrX:18507516(+) A-I      intronic chrX:18488413(+) A-I      intronic chrX:18451423(+) A-I      intronic chrX:18489940(+) A-I      intronic chrX:18487621(+) A-I      intronic chrX:18454871(+) A-I      intronic chrX:18532772(+) A-I      intronic chrX:18450358(+) A-I      intronic chrX:18569863(+) A-I      intronic chrX:18451258(+) A-I      intronic chrX:18505889(+) A-I      intronic chrX:18507555(+) A-I      intronic chrX:18488376(+) A-I      intronic chrX:18497520(+) A-I      intronic chrX:18450839(+) A-I      intronic chrX:18464421(+) A-I      intronic chrX:18459378(+) A-I      intronic chrX:18450999(+) A-I      intronic chrX:18453930(+) A-I      intronic chrX:18470610(+) A-I      intronic chrX:18459415(+) A-I      intronic chrX:18453787(+) A-I      intronic chrX:18570105(+) A-I      intronic chrX:18457869(+) A-I      intronic chrX:18459334(+) A-I      intronic chrX:18453816(+) A-I      intronic chrX:18482431(+) A-I      intronic chrX:18489723(+) A-I      intronic chrX:18449752(+) A-I      intronic chrX:18487312(+) A-I      intronic chrX:18481153(+) A-I      intronic chrX:18452892(+) A-I      intronic chrX:18451486(+) A-I      intronic chrX:18505693(+) A-I      intronic chrX:18470658(+) A-I      intronic chrX:18655202(+) A-I      intronic chrX:18450827(+) A-I      intronic chrX:18492210(+) A-I      intronic chrX:18464278(+) A-I      intronic chrX:18451615(+) A-I      intronic chrX:18533068(+) A-I      intronic chrX:18451092(+) A-I      intronic chrX:18464379(+) A-I      intronic chrX:18477499(+) A-I      intronic chrX:18457882(+) A-I      intronic chrX:18478281(+) A-I      intronic chrX:18459298(+) A-I      intronic chrX:18451635(+) A-I      intronic chrX:18502518(+) A-I      intronic chrX:18533102(+) A-I      intronic chrX:18505449(+) A-I      intronic chrX:18470585(+) A-I      intronic chrX:18454765(+) A-I      intronic chrX:18463343(+) A-I      intronic chrX:18507466(+) A-I      intronic chrX:18459359(+) A-I      intronic chrX:18453884(+) A-I      intronic chrX:18633721(+) A-I      intronic chrX:18451196(+) A-I      intronic chrX:18497534(+) A-I      intronic chrX:18451268(+) A-I      intronic chrX:18453826(+) A-I      intronic chrX:18535917(+) A-I      intronic chrX:18451589(+) A-I      intronic chrX:18488381(+) A-I      intronic chrX:18449744(+) A-I      intronic chrX:18454758(+) A-I      intronic chrX:18452927(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	CDKL5	chrX:18451589(+) A-G intron -    22484847 chrX:18454876(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	CDKL5	chrX:18443805-18443806(+) m6A 5'UTR       24981863 chrX:18460315-18460316(+) m6A 5'UTR//intron       24981863 chrX:18460363-18460364(+) m6A 5'UTR//intron       24981863 chrX:18593523-18593524(+) m6A CDS       24981863 chrX:18593539-18593540(+) m6A CDS       24981863 chrX:18622152-18622153(+) m6A CDS       24981863 chrX:18622190-18622191(+) m6A CDS       24981863 chrX:18622286-18622287(+) m6A CDS       24284625//24981863 chrX:18622334-18622335(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chrX:18622353-18622354(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chrX:18622371-18622372(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chrX:18622412-18622413(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085 chrX:18622493-18622494(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chrX:18622611-18622612(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chrX:18622645-18622646(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chrX:18622661-18622662(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chrX:18622710-18622711(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chrX:18622721-18622722(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chrX:18622732-18622733(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chrX:18622776-18622777(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chrX:18622828-18622829(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085 chrX:18626938-18626939(+) m6A CDS       24284625 chrX:18627640-18627641(+) m6A CDS       24981863 chrX:18643361-18643362(+) m6A CDS       24981863 chrX:18646669-18646670(+) m6A CDS       24284625 chrX:18646777-18646778(+) m6A CDS//intron       - chrX:18646823-18646824(+) m6A CDS//intron       - chrX:18646865-18646866(+) m6A CDS//intron       - chrX:18646903-18646904(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:18664148-18664149(+) m6A CDS       24284625 chrX:18664154-18664155(+) m6A CDS       24284625 chrX:18664166-18664167(+) m6A CDS       24284625

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-26a-1-3p	Exosome Plasma     23663360 Exosome Plasma     24683445 Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Mesenchymal stem cells     - Mitochondrion Skeletal muscle myoblasts     21637849
	CDKL5	Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-26a-1-3p
Interactor2: CDKL5

Evidence Support:

Weak-Evidence	Illumina sequencing
Prediction-Evidence	miRanda
Support Database	ViRBase

References:

PMID	32223537	Target region	None
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	Calu-3 cells	Interactor2 expression	Upregulation
Description	The miRNA-mRNA pairs with strong correlations were selected for miRNA-mRNA binding site prediction using miRanda.