Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00098953

  Virus:  

Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.5711

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-26a-1-3p:  MIMAT0004499          CREB1:  NR_135473     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-26a-1-3p	CREB1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004499	1385
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CREB//CREB-1

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-26a-1-3p	rs182070256 chr3:37969473    G/A rs771522629 chr3:37969472    C/T

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	CREB1	chr2:208412739(+) A-I      intronic chr2:208412745(+) A-I      intronic chr2:208457967(+) A-I      intronic chr2:208447506(+) A-I      intronic chr2:208447471(+) A-I      intronic chr2:208449262(+) A-I      intronic chr2:208449189(+) A-I      intronic chr2:208400789(+) A-I      intronic chr2:208401083(+) A-I      intronic chr2:208401132(+) A-I      intronic chr2:208401148(+) A-I      intronic chr2:208401158(+) A-I      intronic chr2:208401159(+) A-I      intronic chr2:208401168(+) A-I      intronic chr2:208401172(+) A-I      intronic chr2:208401616(+) A-I      intronic chr2:208401843(+) A-I      intronic chr2:208401848(+) A-I      intronic chr2:208401877(+) A-I      intronic chr2:208401878(+) A-I      intronic chr2:208403785(+) A-I      intronic chr2:208403869(+) A-I      intronic chr2:208403890(+) A-I      intronic chr2:208403891(+) A-I      intronic chr2:208403894(+) A-I      intronic chr2:208403906(+) A-I      intronic chr2:208403917(+) A-I      intronic chr2:208403952(+) A-I      intronic chr2:208404030(+) A-I      intronic chr2:208405823(+) A-I      intronic chr2:208405895(+) A-I      intronic chr2:208405934(+) A-I      intronic chr2:208410193(+) A-I      intronic chr2:208410209(+) A-I      intronic chr2:208412837(+) A-I      intronic chr2:208412854(+) A-I      intronic chr2:208412870(+) A-I      intronic chr2:208413219(+) A-I      intronic chr2:208413265(+) A-I      intronic chr2:208413289(+) A-I      intronic chr2:208413310(+) A-I      intronic chr2:208414490(+) A-I      intronic chr2:208414528(+) A-I      intronic chr2:208414534(+) A-I      intronic chr2:208414600(+) A-I      intronic chr2:208416506(+) A-I      intronic chr2:208461341(+) A-I      intronic chr2:208461237(+) A-I      intronic chr2:208461227(+) A-I      intronic chr2:208461221(+) A-I      intronic chr2:208458678(+) A-I      intronic chr2:208458584(+) A-I      intronic chr2:208458560(+) A-I      intronic chr2:208458465(+) A-I      intronic chr2:208457558(+) A-I      intronic chr2:208457557(+) A-I      intronic chr2:208457496(+) A-I      intronic chr2:208457481(+) A-I      intronic chr2:208457367(+) A-I      intronic chr2:208457016(+) A-I      intronic chr2:208413325(+) A-I      intronic chr2:208456984(+) A-I      intronic chr2:208456981(+) A-I      intronic chr2:208456903(+) A-I      intronic chr2:208456379(+) A-I      intronic chr2:208456340(+) A-I      intronic chr2:208456322(+) A-I      intronic chr2:208456170(+) A-I      intronic chr2:208413317(+) A-I      intronic chr2:208447523(+) A-I      intronic chr2:208447510(+) A-I      intronic chr2:208447502(+) A-I      intronic chr2:208447496(+) A-I      intronic chr2:208447467(+) A-I      intronic chr2:208417993(+) A-I      intronic chr2:208417857(+) A-I      intronic chr2:208417550(+) A-I      intronic chr2:208417504(+) A-I      intronic chr2:208417478(+) A-I      intronic chr2:208416718(+) A-I      intronic chr2:208416707(+) A-I      intronic chr2:208416673(+) A-I      intronic chr2:208416512(+) A-I      intronic chr2:208413332(+) A-I      intronic chr2:208413354(+) A-I      intronic chr2:208413355(+) A-I      intronic chr2:208413403(+) A-I      intronic chr2:208412809(+) A-I      intronic chr2:208457000(+) A-I      intronic chr2:208396993(+) A-I      intronic chr2:208400746(+) A-I      intronic chr2:208400758(+) A-I      intronic chr2:208403961(+) A-I      intronic chr2:208396816(+) A-I      intronic chr2:208396948(+) A-I      intronic chr2:208396964(+) A-I      intronic chr2:208447569(+) A-I      intronic chr2:208458169(+) A-I      intronic chr2:208443534(+) A-I      intronic chr2:208400726(+) A-I      intronic chr2:208414343(+) A-I      intronic chr2:208401207(+) A-I      intronic chr2:208458569(+) A-I      intronic chr2:208456290(+) A-I      intronic chr2:208447497(+) A-I      intronic chr2:208412927(+) A-I      intronic chr2:208410031(+) A-I      intronic chr2:208456954(+) A-I      intronic chr2:208413360(+) A-I      intronic chr2:208405165(+) A-I      intronic chr2:208401905(+) A-I      intronic chr2:208411347(+) A-I      intronic chr2:208400798(+) A-I      intronic chr2:208418067(+) A-I      intronic chr2:208400657(+) A-I      intronic chr2:208412796(+) A-I      intronic chr2:208401050(+) A-I      intronic chr2:208412840(+) A-I      intronic chr2:208397342(+) A-I      intronic chr2:208400757(+) A-I      intronic chr2:208458068(+) A-I      intronic chr2:208413236(+) A-I      intronic chr2:208414357(+) A-I      intronic chr2:208417893(+) A-I      intronic chr2:208456174(+) A-I      intronic chr2:208414620(+) A-I      intronic chr2:208400570(+) A-I      intronic chr2:208412887(+) A-I      intronic chr2:208443644(+) A-I      intronic chr2:208412822(+) A-I      intronic chr2:208458543(+) A-I      intronic chr2:208447456(+) A-I      intronic chr2:208408819(+) A-I      intronic chr2:208411202(+) A-I      intronic chr2:208456256(+) A-I      intronic chr2:208405285(+) A-I      intronic chr2:208408512(+) A-I      intronic chr2:208458555(+) A-I      intronic chr2:208414367(+) A-I      intronic chr2:208411196(+) A-I      intronic chr2:208410115(+) A-I      intronic chr2:208410166(+) A-I      intronic chr2:208461188(+) A-I      intronic chr2:208403988(+) A-I      intronic chr2:208397619(+) A-I      intronic chr2:208443654(+) A-I      intronic chr2:208456946(+) A-I      intronic chr2:208401577(+) A-I      intronic chr2:208397322(+) A-I      intronic chr2:208412888(+) A-I      intronic chr2:208443579(+) A-I      intronic chr2:208400772(+) A-I      intronic chr2:208417505(+) A-I      intronic chr2:208400684(+) A-I      intronic chr2:208457050(+) A-I      intronic chr2:208411286(+) A-I      intronic chr2:208418055(+) A-I      intronic chr2:208403904(+) A-I      intronic chr2:208405853(+) A-I      intronic chr2:208396908(+) A-I      intronic chr2:208412736(+) A-I      intronic chr2:208456177(+) A-I      intronic chr2:208414573(+) A-I      intronic chr2:208457411(+) A-I      intronic chr2:208412891(+) A-I      intronic chr2:208401069(+) A-I      intronic chr2:208412714(+) A-I      intronic chr2:208399061(+) A-I      intronic chr2:208456286(+) A-I      intronic chr2:208405257(+) A-I      intronic chr2:208396959(+) A-I      intronic chr2:208458632(+) A-I      intronic chr2:208405837(+) A-I      intronic chr2:208447457(+) A-I      intronic chr2:208416513(+) A-I      intronic chr2:208413407(+) A-I      intronic chr2:208412722(+) A-I      intronic chr2:208443692(+) A-I      intronic chr2:208416584(+) A-I      intronic chr2:208417896(+) A-I      intronic chr2:208410032(+) A-I      intronic chr2:208396898(+) A-I      intronic chr2:208413346(+) A-I      intronic chr2:208412786(+) A-I      intronic chr2:208403907(+) A-I      intronic chr2:208413298(+) A-I      intronic chr2:208414391(+) A-I      intronic chr2:208413297(+) A-I      intronic chr2:208456257(+) A-I      intronic chr2:208412915(+) A-I      intronic chr2:208403975(+) A-I      intronic chr2:208411358(+) A-I      intronic chr2:208400607(+) A-I      intronic chr2:208413328(+) A-I      intronic chr2:208396825(+) A-I      intronic chr2:208412914(+) A-I      intronic chr2:208456284(+) A-I      intronic chr2:208405757(+) A-I      intronic chr2:208405247(+) A-I      intronic chr2:208417430(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	CREB1	chr2:208434976(+) A-I exon CDS    15342557 chr2:208434997(+) A-I exon CDS    15342557 chr2:208435003(+) A-I exon CDS    15342557 chr2:208435025(+) A-I exon CDS    15342557 chr2:208435026(+) A-I exon CDS    15342557 chr2:208440032(+) A-I exon CDS    15342557 chr2:208440076(+) A-I exon CDS    15342557 chr2:208461817(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr2:208457010(+) A-I intron -    22327324 chr2:208463385(+) T-A intron -    21725310 chr2:208396825(+) A-G intron -    22484847 chr2:208396898(+) A-G intron -    22484847 chr2:208396908(+) A-G intron -    22484847 chr2:208396959(+) A-G intron -    22484847 chr2:208397619(+) A-G intron -    22484847 chr2:208399061(+) A-G intron -    22484847 chr2:208400570(+) A-G intron -    22484847 chr2:208400607(+) A-G intron -    22484847 chr2:208400645(+) A-G intron -    22484847 chr2:208400726(+) A-G intron -    22484847 chr2:208400757(+) A-G intron -    22484847 chr2:208400772(+) A-G intron -    22484847 chr2:208400799(+) A-G intron -    22484847 chr2:208400811(+) A-G intron -    22484847 chr2:208400814(+) A-G intron -    22484847 chr2:208401069(+) A-G intron -    22484847 chr2:208401436(+) A-G intron -    22484847 chr2:208401478(+) T-C intron -    22484847 chr2:208401577(+) A-G intron -    22484847 chr2:208401593(+) A-G intron -    22484847 chr2:208401905(+) A-G intron -    22484847 chr2:208403904(+) A-G intron -    22484847 chr2:208403907(+) A-G intron -    22484847 chr2:208403950(+) G-T intron -    22484847 chr2:208403975(+) A-G intron -    22484847 chr2:208403988(+) A-G intron -    22484847 chr2:208410031(+) A-G intron -    22484847 chr2:208410032(+) A-G intron -    22484847 chr2:208410115(+) A-G intron -    22484847 chr2:208410166(+) A-G intron -    22484847 chr2:208411202(+) A-G intron -    22484847 chr2:208411380(+) A-G intron -    22484847 chr2:208412722(+) A-G intron -    22484847 chr2:208412723(+) A-G intron -    22484847 chr2:208412736(+) A-G intron -    22484847 chr2:208412786(+) A-G intron -    22484847 chr2:208412796(+) A-G intron -    22484847 chr2:208412822(+) A-G intron -    22484847 chr2:208412840(+) A-G intron -    22484847 chr2:208412887(+) A-G intron -    22484847 chr2:208412888(+) A-G intron -    22484847 chr2:208412914(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413228(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413259(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413297(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413298(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413299(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413313(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413314(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413315(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413323(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413324(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413328(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413346(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413360(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413364(+) A-G intron -    22484847 chr2:208413407(+) A-G intron -    22484847 chr2:208414357(+) A-G intron -    22484847 chr2:208414620(+) A-G intron -    22484847 chr2:208417423(+) G-A intron -    22484847 chr2:208417896(+) A-G intron -    22484847 chr2:208418069(+) A-T intron -    22484847 chr2:208428560(+) C-T intron -    22484847 chr2:208434525(+) C-T intron -    22484847 chr2:208434550(+) A-T intron -    22484847 chr2:208437364(+) A-C intron -    22484847 chr2:208438288(+) T-C intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	CREB1	chr2:208394801-208394802(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625//24209618//24981863 chr2:208394832-208394833(+) Cm 5'UTR//exon//intron       - chr2:208399327-208399328(+) m6A 5'UTR//intron       24284625//24209618//24981863 chr2:208399337-208399338(+) m6A 5'UTR//intron       24284625//24209618//24981863 chr2:208420384-208420385(+) m6A CDS//exon//intron       - chr2:208420423-208420424(+) m6A CDS//exon//intron       - chr2:208434975-208434976(+) m6A CDS//exon       - chr2:208435026-208435027(+) m6A CDS//exon       - chr2:208435037-208435038(+) m6A CDS//exon       - chr2:208441880-208441881(+) m6A 3'UTR//intron       - chr2:208441889-208441890(+) m6A 3'UTR//intron       - chr2:208441941-208441942(+) m6A 3'UTR//intron       - chr2:208442248-208442249(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr2:208442375-208442376(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24209618//22608085 chr2:208461693-208461694(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:208461720-208461721(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:208461725-208461726(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:208461756-208461757(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:208461821-208461822(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:208461845-208461846(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:208461854-208461855(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:208461870-208461871(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr2:208461895-208461896(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr2:208461945-208461946(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr2:208462016-208462017(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr2:208462153-208462154(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:208462293-208462294(+) m6A 3'UTR//intron       22608085 chr2:208463491-208463492(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr2:208463866-208463867(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr2:208463898-208463899(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr2:208466773-208466774(+) m6A 3'UTR       - chr2:208466871-208466872(+) m6A 3'UTR       - chr2:208466887-208466888(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-26a-1-3p	Exosome Plasma     23663360 Exosome Plasma     24683445 Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Mesenchymal stem cells     - Mitochondrion Skeletal muscle myoblasts     21637849
	CREB1	Chromatin K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-26a-1-3p
Interactor2: CREB1

Evidence Support:

Weak-Evidence	Illumina sequencing
Prediction-Evidence	miRanda
Support Database	ViRBase

References:

PMID	32223537	Target region	None
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	Calu-3 cells	Interactor2 expression	Upregulation
Description	The miRNA-mRNA pairs with strong correlations were selected for miRNA-mRNA binding site prediction using miRanda.