Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00098952

  Virus:  

Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.5711

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-26a-1-3p:           ATRX:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-26a-1-3p ATRX
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0004499 546
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - JMS//MRX52//RAD54//RAD54L//XH2//XNP//ZNF-HX

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-26a-1-3p
rs182070256 chr3:37969473    G/A
rs771522629 chr3:37969472    C/T

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR ATRX
chrX:77017663(-) A-I      intronic
chrX:77018877(-) A-I      intronic
chrX:77019004(-) A-I      intronic
chrX:77019048(-) A-I      intronic
chrX:77019057(-) A-I      intronic
chrX:77019089(-) A-I      intronic
chrX:77019125(-) A-I      intronic
chrX:77019134(-) A-I      intronic
chrX:77019145(-) A-I      intronic
chrX:77019146(-) A-I      intronic
chrX:77019179(-) A-I      intronic
chrX:76856897(-) A-I      intronic
chrX:76856814(-) A-I      intronic
chrX:76856718(-) A-I      intronic
chrX:76846044(-) A-I      intronic
chrX:77033827(-) A-I      intronic
chrX:76846029(-) A-I      intronic
chrX:76822142(-) A-I      intronic
chrX:76822109(-) A-I      intronic
chrX:76822106(-) A-I      intronic
chrX:76819943(-) A-I      intronic
chrX:76819923(-) A-I      intronic
chrX:76811592(-) A-I      intronic
chrX:76791689(-) A-I      intronic
chrX:76791677(-) A-I      intronic
chrX:77014115(-) A-I      intronic
chrX:77014127(-) A-I      intronic
chrX:77014139(-) A-I      intronic
chrX:77014182(-) A-I      intronic
chrX:77016775(-) A-I      intronic
chrX:77016801(-) A-I      intronic
chrX:77016906(-) A-I      intronic
chrX:77038179(-) A-I      intronic
chrX:77025695(-) A-I      intronic
chrX:77014099(-) A-I      intronic
chrX:77013759(-) A-I      intronic
chrX:77013731(-) A-I      intronic
chrX:77013341(-) A-I      intronic
chrX:77036926(-) A-I      intronic
chrX:77036892(-) A-I      intronic
chrX:77036816(-) A-I      intronic
chrX:77036780(-) A-I      intronic
chrX:77036421(-) A-I      intronic
chrX:77036400(-) A-I      intronic
chrX:77036305(-) A-I      intronic
chrX:77036183(-) A-I      intronic
chrX:77036087(-) A-I      intronic
chrX:77016961(-) A-I      intronic
chrX:77017594(-) A-I      intronic
chrX:76791657(-) A-I      intronic
chrX:76791653(-) A-I      intronic
chrX:76791644(-) A-I      intronic
chrX:76782036(-) A-I      intronic
chrX:77017616(-) A-I      intronic
chrX:76904571(-) A-I      intronic
chrX:77019512(-) A-I      intronic
chrX:77024902(-) A-I      intronic
chrX:77025503(-) A-I      intronic
chrX:77013332(-) A-I      intronic
chrX:77013326(-) A-I      intronic
chrX:77013301(-) A-I      intronic
chrX:77013285(-) A-I      intronic
chrX:77013281(-) A-I      intronic
chrX:77012405(-) A-I      intronic
chrX:77012395(-) A-I      intronic
chrX:77002986(-) A-I      intronic
chrX:77002959(-) A-I      intronic
chrX:77002881(-) A-I      intronic
chrX:77002865(-) A-I      intronic
chrX:77002825(-) A-I      intronic
chrX:77002822(-) A-I      intronic
chrX:77026692(-) A-I      intronic
chrX:77029228(-) A-I      intronic
chrX:76799214(-) A-I      intronic
chrX:76799369(-) A-I      intronic
chrX:76844351(-) A-I      intronic
chrX:76999580(-) A-I      intronic
chrX:76844474(-) A-I      intronic
chrX:76844477(-) A-I      intronic
chrX:76844484(-) A-I      intronic
chrX:76999576(-) A-I      intronic
chrX:76999575(-) A-I      intronic
chrX:76999546(-) A-I      intronic
chrX:76997125(-) A-I      intronic
chrX:76997071(-) A-I      intronic
chrX:76997051(-) A-I      intronic
chrX:76996599(-) A-I      intronic
chrX:76996578(-) A-I      intronic
chrX:76994313(-) A-I      intronic
chrX:76994312(-) A-I      intronic
chrX:76993755(-) A-I      intronic
chrX:76992865(-) A-I      intronic
chrX:76992847(-) A-I      intronic
chrX:76992821(-) A-I      intronic
chrX:77001686(-) A-I      intronic
chrX:77001661(-) A-I      intronic
chrX:77001660(-) A-I      intronic
chrX:76832873(-) A-I      intronic
chrX:76832854(-) A-I      intronic
chrX:76832848(-) A-I      intronic
chrX:76832847(-) A-I      intronic
chrX:76832838(-) A-I      intronic
chrX:76832828(-) A-I      intronic
chrX:76832791(-) A-I      intronic
chrX:76992820(-) A-I      intronic
chrX:76992738(-) A-I      intronic
chrX:76985275(-) A-I      intronic
chrX:76984511(-) A-I      intronic
chrX:76984378(-) A-I      intronic
chrX:76984364(-) A-I      intronic
chrX:76984361(-) A-I      intronic
chrX:76973050(-) A-I      intronic
chrX:76973037(-) A-I      intronic
chrX:76971714(-) A-I      intronic
chrX:76962307(-) A-I      intronic
chrX:76962272(-) A-I      intronic
chrX:76961607(-) A-I      intronic
chrX:76956917(-) A-I      intronic
chrX:76956884(-) A-I      intronic
chrX:76956783(-) A-I      intronic
chrX:76932541(-) A-I      intronic
chrX:76926155(-) A-I      intronic
chrX:76926133(-) A-I      intronic
chrX:76926120(-) A-I      intronic
chrX:76925464(-) A-I      intronic
chrX:76925384(-) A-I      intronic
chrX:76925350(-) A-I      intronic
chrX:76919503(-) A-I      intronic
chrX:76919478(-) A-I      intronic
chrX:76919425(-) A-I      intronic
chrX:76919399(-) A-I      intronic
chrX:76919346(-) A-I      intronic
chrX:76918368(-) A-I      intronic
chrX:76918300(-) A-I      intronic
chrX:76915968(-) A-I      intronic
chrX:76915897(-) A-I      intronic
chrX:76915888(-) A-I      intronic
chrX:76915885(-) A-I      intronic
chrX:76915866(-) A-I      intronic
chrX:76907505(-) A-I      intronic
chrX:76907227(-) A-I      intronic
chrX:76907225(-) A-I      intronic
chrX:76907221(-) A-I      intronic
chrX:76907200(-) A-I      intronic
chrX:76906328(-) A-I      intronic
chrX:76906127(-) A-I      intronic
chrX:76906104(-) A-I      intronic
chrX:76904623(-) A-I      intronic
chrX:76904602(-) A-I      intronic
chrX:76904586(-) A-I      intronic
chrX:76904572(-) A-I      intronic
chrX:76904545(-) A-I      intronic
chrX:76904532(-) A-I      intronic
chrX:76899588(-) A-I      intronic
chrX:76899477(-) A-I      intronic
chrX:76899187(-) A-I      intronic
chrX:76865069(-) A-I      intronic
chrX:76859137(-) A-I      intronic
chrX:76859065(-) A-I      intronic
chrX:76859058(-) A-I      intronic
chrX:76859049(-) A-I      intronic
chrX:76859042(-) A-I      intronic
chrX:76857633(-) A-I      intronic
chrX:77016918(-) A-I      intronic
chrX:76857645(-) A-I      intronic
chrX:76857677(-) A-I      intronic
chrX:76857679(-) A-I      intronic
chrX:77023009(-) A-I      intronic
chrX:77023033(-) A-I      intronic
chrX:77023046(-) A-I      intronic
chrX:77023055(-) A-I      intronic
chrX:77023058(-) A-I      intronic
chrX:77023079(-) A-I      intronic
chrX:77023080(-) A-I      intronic
chrX:77023095(-) A-I      intronic
chrX:77024908(-) A-I      intronic
chrX:77024934(-) A-I      intronic
chrX:77024937(-) A-I      intronic
chrX:77025765(-) A-I      intronic
chrX:77025799(-) A-I      intronic
chrX:77025801(-) A-I      intronic
chrX:77031254(-) A-I      intronic
chrX:77031293(-) A-I      intronic
chrX:77031297(-) A-I      intronic
chrX:77031318(-) A-I      intronic
chrX:77035905(-) A-I      intronic
chrX:77019222(-) A-I      intronic
chrX:77019383(-) A-I      intronic
chrX:77019500(-) A-I      intronic
chrX:77019551(-) A-I      intronic
chrX:77020465(-) A-I      intronic
chrX:77020520(-) A-I      intronic
chrX:77020529(-) A-I      intronic
chrX:77020536(-) A-I      intronic
chrX:77020548(-) A-I      intronic
chrX:77020561(-) A-I      intronic
chrX:77020562(-) A-I      intronic
chrX:77020566(-) A-I      intronic
chrX:77020579(-) A-I      intronic
chrX:77020609(-) A-I      intronic
chrX:77020643(-) A-I      intronic
chrX:77023015(-) A-I      intronic
chrX:77023069(-) A-I      intronic
chrX:77023094(-) A-I      intronic
chrX:77023103(-) A-I      intronic
chrX:77024926(-) A-I      intronic
chrX:77024945(-) A-I      intronic
chrX:77024952(-) A-I      intronic
chrX:77025332(-) A-I      intronic
chrX:77025421(-) A-I      intronic
chrX:77025497(-) A-I      intronic
chrX:77025508(-) A-I      intronic
chrX:77035937(-) A-I      intronic
chrX:77034666(-) A-I      intronic
chrX:77034663(-) A-I      intronic
chrX:77034658(-) A-I      intronic
chrX:77034479(-) A-I      intronic
chrX:77034466(-) A-I      intronic
chrX:77025513(-) A-I      intronic
chrX:77025636(-) A-I      intronic
chrX:77025776(-) A-I      intronic
chrX:77025828(-) A-I      intronic
chrX:77026757(-) A-I      intronic
chrX:77026774(-) A-I      intronic
chrX:77026775(-) A-I      intronic
chrX:77026795(-) A-I      intronic
chrX:77026853(-) A-I      intronic
chrX:77034452(-) A-I      intronic
chrX:77033510(-) A-I      intronic
chrX:77033465(-) A-I      intronic
chrX:77033459(-) A-I      intronic
chrX:77033456(-) A-I      intronic
chrX:77033430(-) A-I      intronic
chrX:77033417(-) A-I      intronic
chrX:77031434(-) A-I      intronic
chrX:77031387(-) A-I      intronic
chrX:77031382(-) A-I      intronic
chrX:77031350(-) A-I      intronic
chrX:77031044(-) A-I      intronic
chrX:77030920(-) A-I      intronic
chrX:77030448(-) A-I      intronic
chrX:77030429(-) A-I      intronic
chrX:77030415(-) A-I      intronic
chrX:77030072(-) A-I      intronic
chrX:77030037(-) A-I      intronic
chrX:77029915(-) A-I      intronic
chrX:77029903(-) A-I      intronic
chrX:77029660(-) A-I      intronic
chrX:77029628(-) A-I      intronic
chrX:77029488(-) A-I      intronic
chrX:77028359(-) A-I      intronic
chrX:77028229(-) A-I      intronic
chrX:77028226(-) A-I      intronic
chrX:77028043(-) A-I      intronic
chrX:77028030(-) A-I      intronic
chrX:77027992(-) A-I      intronic
chrX:77035910(-) A-I      intronic
chrX:76857696(-) A-I      intronic
chrX:76857653(-) A-I      intronic
chrX:76857586(-) A-I      intronic
chrX:76857545(-) A-I      intronic
chrX:76856900(-) A-I      intronic
chrX:77012364(-) A-I      intronic
chrX:76884346(-) A-I      intronic
chrX:76870605(-) A-I      intronic
chrX:77018723(-) A-I      intronic
chrX:76918791(-) A-I      intronic
chrX:77019559(-) A-I      intronic
chrX:77031057(-) A-I      intronic
chrX:77028493(-) A-I      intronic
chrX:76876811(-) A-I      intronic
chrX:76857711(-) A-I      intronic
chrX:76958438(-) A-I      intronic
chrX:76979982(-) A-I      intronic
chrX:77012507(-) A-I      intronic
chrX:77028126(-) A-I      intronic
chrX:76919508(-) A-I      intronic
chrX:76918809(-) A-I      intronic
chrX:76904491(-) A-I      intronic
chrX:76780352(-) A-I      intronic
chrX:77036755(-) A-I      intronic
chrX:77036262(-) A-I      intronic
chrX:77025757(-) A-I      intronic
chrX:77034481(-) A-I      intronic
chrX:76926059(-) A-I      intronic
chrX:77036327(-) A-I      intronic
chrX:77033437(-) A-I      intronic
chrX:77020526(-) A-I      intronic
chrX:77019438(-) A-I      intronic
chrX:76961179(-) A-I      intronic
chrX:77036800(-) A-I      intronic
chrX:76958482(-) A-I      intronic
chrX:76858973(-) A-I      intronic
chrX:77019373(-) A-I      intronic
chrX:76865079(-) A-I      intronic
chrX:77013290(-) A-I      intronic
chrX:76997201(-) A-I      intronic
chrX:77034095(-) A-I      intronic
chrX:76918277(-) A-I      intronic
chrX:77019473(-) A-I      intronic
chrX:76958414(-) A-I      intronic
chrX:77036259(-) A-I      intronic
chrX:77030294(-) A-I      intronic
chrX:77025483(-) A-I      intronic
chrX:76985303(-) A-I      intronic
chrX:77024946(-) A-I      intronic
chrX:76907517(-) A-I      intronic
chrX:77030439(-) A-I      intronic
chrX:77034552(-) A-I      intronic
chrX:76919877(-) A-I      intronic
chrX:76856864(-) A-I      intronic
chrX:77034546(-) A-I      intronic
chrX:77019415(-) A-I      intronic
chrX:76932451(-) A-I      intronic
chrX:77028467(-) A-I      intronic
chrX:76856743(-) A-I      intronic
chrX:77035949(-) A-I      intronic
chrX:77018673(-) A-I      intronic
chrX:77034534(-) A-I      intronic
chrX:76985245(-) A-I      intronic
chrX:76857556(-) A-I      intronic
chrX:77030317(-) A-I      intronic
chrX:77030233(-) A-I      intronic
chrX:77027947(-) A-I      intronic
chrX:76896795(-) A-I      intronic
chrX:76904592(-) A-I      intronic
chrX:76794514(-) A-I      intronic
chrX:77036182(-) A-I      intronic
chrX:76918357(-) A-I      intronic
chrX:76906231(-) A-I      intronic
chrX:77014117(-) A-I      intronic
chrX:77028167(-) A-I      intronic
chrX:77025850(-) A-I      intronic
chrX:77018698(-) A-I      intronic
chrX:77034525(-) A-I      intronic
chrX:76856790(-) A-I      intronic
chrX:77030284(-) A-I      intronic
chrX:77025518(-) A-I      intronic
chrX:77002842(-) A-I      intronic
chrX:77025385(-) A-I      intronic
chrX:77025856(-) A-I      intronic
chrX:77016896(-) A-I      intronic
chrX:77019427(-) A-I      intronic
chrX:76925367(-) A-I      intronic
chrX:77024600(-) A-I      intronic
chrX:77035950(-) A-I      intronic
chrX:77026735(-) A-I      intronic
chrX:77030973(-) A-I      intronic
chrX:77034702(-) A-I      intronic
chrX:77023143(-) A-I      intronic
chrX:76925435(-) A-I      intronic
chrX:77018774(-) A-I      intronic
chrX:76925324(-) A-I      intronic
chrX:76893851(-) A-I      intronic
chrX:77031306(-) A-I      intronic
chrX:76924907(-) A-I      intronic
chrX:77033418(-) A-I      intronic
chrX:76900847(-) A-I      intronic
chrX:77033895(-) A-I      intronic
chrX:76974140(-) A-I      intronic
chrX:77018764(-) A-I      intronic
chrX:77034490(-) A-I      intronic
chrX:76933590(-) A-I      intronic
chrX:76822096(-) A-I      intronic
chrX:76924989(-) A-I      intronic
chrX:76822215(-) A-I      intronic
chrX:77027630(-) A-I      intronic
chrX:76958479(-) A-I      intronic
chrX:77016852(-) A-I      intronic
chrX:76971508(-) A-I      intronic
chrX:77034708(-) A-I      intronic
chrX:77027519(-) A-I      intronic
chrX:77036806(-) A-I      intronic
chrX:77029580(-) A-I      intronic
chrX:77025333(-) A-I      intronic
chrX:77036684(-) A-I      intronic
chrX:77025825(-) A-I      intronic
chrX:76919851(-) A-I      intronic
chrX:76856895(-) A-I      intronic
chrX:76919428(-) A-I      intronic
chrX:76856798(-) A-I      intronic
chrX:76962394(-) A-I      intronic
chrX:77028421(-) A-I      intronic
chrX:76900709(-) A-I      intronic
chrX:77030263(-) A-I      intronic
chrX:76802032(-) A-I      intronic
chrX:77026745(-) A-I      intronic
chrX:76870740(-) A-I      intronic
chrX:76876846(-) A-I      intronic
chrX:76924896(-) A-I      intronic
chrX:76924949(-) A-I      intronic
chrX:76979501(-) A-I      intronic
chrX:77030495(-) A-I      intronic
chrX:76918475(-) A-I      intronic
chrX:77028096(-) A-I      intronic
chrX:76793149(-) A-I      intronic
chrX:77036010(-) A-I      intronic
chrX:77029970(-) A-I      intronic
chrX:77031317(-) A-I      intronic
chrX:76961510(-) A-I      intronic
chrX:76857612(-) A-I      intronic
chrX:76859132(-) A-I      intronic
chrX:76993759(-) A-I      intronic
chrX:77023017(-) A-I      intronic
chrX:76821064(-) A-I      intronic
chrX:77019564(-) A-I      intronic
chrX:77024940(-) A-I      intronic
chrX:76993690(-) A-I      intronic
chrX:77016991(-) A-I      intronic
chrX:77036344(-) A-I      intronic
chrX:77027744(-) A-I      intronic
chrX:76919887(-) A-I      intronic
chrX:76856865(-) A-I      intronic
chrX:77016894(-) A-I      intronic
chrX:76994093(-) A-I      intronic
chrX:77030353(-) A-I      intronic
chrX:77033366(-) A-I      intronic
chrX:77036677(-) A-I      intronic
chrX:77029658(-) A-I      intronic
chrX:77027667(-) A-I      intronic
chrX:77036364(-) A-I      intronic
chrX:77013317(-) A-I      intronic
chrX:77023089(-) A-I      intronic
chrX:76971719(-) A-I      intronic
chrX:76900845(-) A-I      intronic
chrX:77024827(-) A-I      intronic
chrX:76925264(-) A-I      intronic
chrX:77031077(-) A-I      intronic
chrX:77002953(-) A-I      intronic
chrX:77030488(-) A-I      intronic
chrX:76942125(-) A-I      intronic
chrX:77013380(-) A-I      intronic
chrX:77025708(-) A-I      intronic
chrX:77019495(-) A-I      intronic
chrX:76925083(-) A-I      intronic
chrX:77024831(-) A-I      intronic
chrX:77036247(-) A-I      intronic
chrX:76996992(-) A-I      intronic
chrX:77029642(-) A-I      intronic
chrX:77033812(-) A-I      intronic
chrX:77033569(-) A-I      intronic
chrX:76856717(-) A-I      intronic
chrX:76856879(-) A-I      intronic
chrX:77031056(-) A-I      intronic
chrX:77019338(-) A-I      intronic
chrX:76994223(-) A-I      intronic
chrX:77036419(-) A-I      intronic
chrX:77019384(-) A-I      intronic
chrX:76907182(-) A-I      intronic
chrX:76780428(-) A-I      intronic
chrX:77019350(-) A-I      intronic
chrX:77029520(-) A-I      intronic
chrX:77030254(-) A-I      intronic
chrX:77018693(-) A-I      intronic
chrX:76919900(-) A-I      intronic
chrX:76865092(-) A-I      intronic
chrX:77015073(-) A-I      intronic
chrX:76824527(-) A-I      intronic
chrX:76961709(-) A-I      intronic
chrX:77026770(-) A-I      intronic
chrX:77025864(-) A-I      intronic
chrX:77031355(-) A-I      intronic
chrX:77018804(-) A-I      intronic
chrX:76992804(-) A-I      intronic
chrX:76994178(-) A-I      intronic
chrX:77034696(-) A-I      intronic
chrX:77036019(-) A-I      intronic
chrX:77030357(-) A-I      intronic
chrX:77036418(-) A-I      intronic
chrX:76897474(-) A-I      intronic
chrX:77013372(-) A-I      intronic
chrX:76918356(-) A-I      intronic
chrX:76956749(-) A-I      intronic
chrX:77029995(-) A-I      intronic
chrX:77012404(-) A-I      intronic
chrX:77025874(-) A-I      intronic
chrX:76994179(-) A-I      intronic
chrX:76925364(-) A-I      intronic
chrX:77036315(-) A-I      intronic
chrX:77013291(-) A-I      intronic
chrX:77024907(-) A-I      intronic
chrX:77000544(-) A-I      intronic
chrX:76822216(-) A-I      intronic
chrX:76918479(-) A-I      intronic
chrX:76962294(-) A-I      intronic
chrX:76993593(-) A-I      intronic
chrX:76883182(-) A-I      intronic
chrX:77014938(-) A-I      intronic
chrX:77002984(-) A-I      intronic
chrX:77036764(-) A-I      intronic
chrX:77032729(-) A-I      intronic
chrX:76883237(-) A-I      intronic
chrX:77036340(-) A-I      intronic
chrX:77033500(-) A-I      intronic
chrX:77013397(-) A-I      intronic
chrX:77018763(-) A-I      intronic
chrX:76900773(-) A-I      intronic
chrX:77028489(-) A-I      intronic
chrX:77031253(-) A-I      intronic
chrX:77025763(-) A-I      intronic
chrX:77025438(-) A-I      intronic
chrX:76932454(-) A-I      intronic
chrX:77019360(-) A-I      intronic
chrX:76900915(-) A-I      intronic
chrX:77031110(-) A-I      intronic
chrX:76907240(-) A-I      intronic
chrX:77027660(-) A-I      intronic
chrX:76961675(-) A-I      intronic
chrX:77025482(-) A-I      intronic
chrX:77036345(-) A-I      intronic
chrX:77018898(-) A-I      intronic
chrX:77030992(-) A-I      intronic
chrX:77026652(-) A-I      intronic
chrX:77031421(-) A-I      intronic
chrX:77030001(-) A-I      intronic
chrX:76821221(-) A-I      intronic
chrX:77030965(-) A-I      intronic
chrX:77031419(-) A-I      intronic
chrX:76822033(-) A-I      intronic
chrX:77026602(-) A-I      intronic
chrX:77031469(-) A-I      intronic
chrX:77029641(-) A-I      intronic
chrX:76924975(-) A-I      intronic
chrX:77033503(-) A-I      intronic
chrX:77018737(-) A-I      intronic
chrX:76919507(-) A-I      intronic
chrX:76994108(-) A-I      intronic
chrX:77019455(-) A-I      intronic
chrX:77036876(-) A-I      intronic
chrX:77025744(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED ATRX
chrX:76832666(-) A-I intron -    21960545
chrX:76832685(-) A-I intron -    21960545
chrX:76832729(-) A-I intron -    21960545
chrX:76832774(-) A-I intron -    21960545
chrX:76832791(-) A-I intron -    21960545
chrX:76832930(-) A-I intron -    21960545
chrX:76832931(-) A-I intron -    21960545
chrX:76844405(-) A-I intron -    21960545
chrX:76844406(-) A-I intron -    21960545
chrX:76844415(-) A-I intron -    21960545
chrX:76844695(-) A-I intron -    21960545
chrX:77036315(-) A-I intron -    21960545
chrX:76832613(-) A-G intron -    22484847
chrX:76832666(-) A-G intron -    22484847
chrX:76832685(-) A-G intron -    22484847
chrX:76832729(-) A-G intron -    22484847
chrX:76832774(-) A-G intron -    22484847
chrX:76832829(-) A-G intron -    22484847
chrX:76832832(-) A-G intron -    22484847
chrX:76832846(-) A-G intron -    22484847
chrX:76832849(-) A-G intron -    22484847
chrX:76832860(-) A-G intron -    22484847
chrX:76832867(-) A-G intron -    22484847
chrX:76832894(-) A-G intron -    22484847
chrX:76832903(-) A-G intron -    22484847
chrX:76833002(-) A-G intron -    22484847
chrX:76833022(-) A-G intron -    22484847
chrX:77001664(-) A-G intron -    22484847
chrX:76857638(-) A-G intron -    22484847
chrX:76870629(-) C-T intron -    22484847
chrX:77013290(-) A-G intron -    22484847
chrX:77013291(-) A-G intron -    22484847
chrX:77018763(-) A-G intron -    22484847
chrX:77019559(-) A-G intron -    22484847
chrX:77019564(-) A-G intron -    22484847
chrX:77024947(-) A-G intron -    22484847
chrX:77026661(-) A-G intron -    22484847
chrX:77030435(-) A-G intron -    22484847
chrX:77032912(-) C-T intron -    22484847
chrX:77033437(-) A-G intron -    22484847
chrX:77034552(-) A-G intron -    22484847
chrX:77036418(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase ATRX
chrX:76761226-76761227(-) m6A 3'UTR       27773535
chrX:76761232-76761233(-) m6A 3'UTR       27773535
chrX:76761321-76761322(-) m6A 3'UTR       27773535
chrX:76763749-76763750(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//27773535
chrX:76763852-76763853(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//28052920//27773535//22608085
chrX:76764075-76764076(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//27773535//27371828//22608085
chrX:76776274-76776275(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//27773535//27371828//22608085
chrX:76776337-76776338(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535
chrX:76776932-76776933(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       -
chrX:76777863-76777864(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535
chrX:76778802-76778803(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535
chrX:76778819-76778820(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535
chrX:76778840-76778841(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//27773535
chrX:76812982-76812983(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//22575960
chrX:76813002-76813003(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//22575960
chrX:76854889-76854890(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535
chrX:76854911-76854912(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535
chrX:76854918-76854919(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535
chrX:76855234-76855235(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535
chrX:76855272-76855273(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535//22575960
chrX:76891421-76891422(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535
chrX:76891463-76891464(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chrX:76891471-76891472(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chrX:76907683-76907684(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//28052920//27773535//27371828//22608085
chrX:76907689-76907690(-) m6A 3'UTR//CDS       25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//22608085
chrX:76907696-76907697(-) m6A 3'UTR//CDS       25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//22608085
chrX:76907826-76907827(-) m1A 3'UTR//CDS       26863196
chrX:76909591-76909592(-) m6A 3'UTR//CDS       25456834//24981863//28052920//27773535//22608085
chrX:76909644-76909645(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//28052920//27773535//22608085
chrX:76912053-76912054(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//28052920//27773535//22608085
chrX:76912066-76912067(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//28052920//27773535//22608085
chrX:76912088-76912089(-) m1A 3'UTR//CDS       26863196
chrX:76918881-76918882(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chrX:76918918-76918919(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chrX:76918979-76918980(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chrX:76920147-76920148(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chrX:76920161-76920162(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chrX:76920169-76920170(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535
chrX:76931451-76931452(-) m6A 3'UTR//intron       -
chrX:76931477-76931478(-) m6A 3'UTR//intron       -
chrX:76931539-76931540(-) m6A CDS//intron       24981863//27773535//22608085
chrX:76931547-76931548(-) m6A CDS//intron       24981863//27773535//22608085
chrX:76931601-76931602(-) m6A CDS//intron       24981863//27773535//22608085
chrX:76931625-76931626(-) m6A CDS//intron       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76931645-76931646(-) m6A CDS//intron       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76931659-76931660(-) m6A CDS//intron       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76931699-76931700(-) m6A CDS//intron       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76937078-76937079(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76937176-76937177(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76937187-76937188(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76937233-76937234(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76937363-76937364(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//28052920//27773535//22608085
chrX:76937435-76937436(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//28052920//27773535//22575960//22608085
chrX:76937590-76937591(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//28052920//27773535//22575960//22608085
chrX:76937632-76937633(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76937648-76937649(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76937729-76937730(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76937757-76937758(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76937765-76937766(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76937782-76937783(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76937818-76937819(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76937832-76937833(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chrX:76937890-76937891(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chrX:76937896-76937897(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chrX:76937923-76937924(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chrX:76938054-76938055(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//27371828//22608085
chrX:76938088-76938089(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//27371828//22608085
chrX:76938101-76938102(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//27371828//22608085
chrX:76938139-76938140(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//28052920//27773535//27371828//22608085
chrX:76938185-76938186(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//28052920//27773535//22608085
chrX:76938241-76938242(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//28052920//27773535//22608085
chrX:76938319-76938320(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chrX:76938442-76938443(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chrX:76938460-76938461(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chrX:76938468-76938469(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chrX:76938577-76938578(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76938677-76938678(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76938683-76938684(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76938697-76938698(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76938739-76938740(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76938766-76938767(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76938849-76938850(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76938857-76938858(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76938863-76938864(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76938885-76938886(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76938980-76938981(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863//27773535//22608085
chrX:76939015-76939016(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863//27773535//22608085
chrX:76939041-76939042(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chrX:76939088-76939089(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chrX:76939093-76939094(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chrX:76939147-76939148(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//27371828//22608085
chrX:76939167-76939168(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//27371828//22608085
chrX:76939206-76939207(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//27371828//22608085
chrX:76939232-76939233(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76939244-76939245(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76939271-76939272(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chrX:76939294-76939295(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chrX:76939301-76939302(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chrX:76939346-76939347(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chrX:76939358-76939359(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76939403-76939404(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76939426-76939427(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76939476-76939477(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76939512-76939513(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chrX:76939647-76939648(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76939663-76939664(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76939673-76939674(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76939789-76939790(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76939817-76939818(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76939883-76939884(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chrX:76939923-76939924(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76939968-76939969(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085
chrX:76940064-76940065(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//22575960//22608085
chrX:76949336-76949337(-) m6A CDS//intron       27773535
chrX:76949386-76949387(-) m6A CDS//intron       27773535
chrX:76954073-76954074(-) Cm CDS//exon       -
chrX:77041577-77041578(-) m6A 5'UTR//exon       24284625

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-26a-1-3p
Exosome Plasma     23663360
Exosome Plasma     24683445
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Mesenchymal stem cells     -
Mitochondrion Skeletal muscle myoblasts     21637849
ATRX
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm K562 cells     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-26a-1-3p
Interactor2: ATRX

Evidence Support:


Weak-Evidence Illumina sequencing
Prediction-Evidence miRanda
Support Database ViRBase

References:


PMID 32223537 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line Calu-3 cells Interactor2 expression Upregulation
Description The miRNA-mRNA pairs with strong correlations were selected for miRNA-mRNA binding site prediction using miRanda.

Starting a new search, please wait ...