Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00098945

  Virus:  

Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.5711

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-16-1-3p:           KCNQ5:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-16-1-3p KCNQ5
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0004489 56479
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - Kv7.5//MRD46

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-16-1-3p
rs377111580 chr13:50048986    C/T
rs769728617 chr13:50048992    CA/C
rs1460126106 chr13:50049003    C/A
rs1460126106 chr13:50049003    C/T
rs1468155921 chr13:50049001    T/C

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR KCNQ5
chr6:73342747(+) A-I      intronic
chr6:73553774(+) A-I      intronic
chr6:73477616(+) A-I      intronic
chr6:73562182(+) A-I      intronic
chr6:73557991(+) A-I      intronic
chr6:73477615(+) A-I      intronic
chr6:73557982(+) A-I      intronic
chr6:73557980(+) A-I      intronic
chr6:73557976(+) A-I      intronic
chr6:73477610(+) A-I      intronic
chr6:73557972(+) A-I      intronic
chr6:73553827(+) A-I      intronic
chr6:73553823(+) A-I      intronic
chr6:73553821(+) A-I      intronic
chr6:73553817(+) A-I      intronic
chr6:73553815(+) A-I      intronic
chr6:73553804(+) A-I      intronic
chr6:73553769(+) A-I      intronic
chr6:73553706(+) A-I      intronic
chr6:73508255(+) A-I      intronic
chr6:73508043(+) A-I      intronic
chr6:73508027(+) A-I      intronic
chr6:73500167(+) A-I      intronic
chr6:73474770(+) A-I      intronic
chr6:73474758(+) A-I      intronic
chr6:73404851(+) A-I      intronic
chr6:73379275(+) A-I      intronic
chr6:73352954(+) A-I      intronic
chr6:73352907(+) A-I      intronic
chr6:73352119(+) A-I      intronic
chr6:73352118(+) A-I      intronic
chr6:73477594(+) A-I      intronic
chr6:73408201(+) A-I      intronic
chr6:73408189(+) A-I      intronic
chr6:73408129(+) A-I      intronic
chr6:73408112(+) A-I      intronic
chr6:73408110(+) A-I      intronic
chr6:73407951(+) A-I      intronic
chr6:73407684(+) A-I      intronic
chr6:73393267(+) A-I      intronic
chr6:73393233(+) A-I      intronic
chr6:73393209(+) A-I      intronic
chr6:73393196(+) A-I      intronic
chr6:73393156(+) A-I      intronic
chr6:73389712(+) A-I      intronic
chr6:73389641(+) A-I      intronic
chr6:73384426(+) A-I      intronic
chr6:73384406(+) A-I      intronic
chr6:73374368(+) A-I      intronic
chr6:73374304(+) A-I      intronic
chr6:73374233(+) A-I      intronic
chr6:73368138(+) A-I      intronic
chr6:73368135(+) A-I      intronic
chr6:73368134(+) A-I      intronic
chr6:73368102(+) A-I      intronic
chr6:73368019(+) A-I      intronic
chr6:73355119(+) A-I      intronic
chr6:73344505(+) A-I      intronic
chr6:73344397(+) A-I      intronic
chr6:73342143(+) A-I      intronic
chr6:73342131(+) A-I      intronic
chr6:73883434(+) A-I      intronic
chr6:73342076(+) A-I      intronic
chr6:73342005(+) A-I      intronic
chr6:73341998(+) A-I      intronic
chr6:73341995(+) A-I      intronic
chr6:73341930(+) A-I      intronic
chr6:73883423(+) A-I      intronic
chr6:73883419(+) A-I      intronic
chr6:73883418(+) A-I      intronic
chr6:73629786(+) A-I      intronic
chr6:73629778(+) A-I      intronic
chr6:73629770(+) A-I      intronic
chr6:73629769(+) A-I      intronic
chr6:73629768(+) A-I      intronic
chr6:73629762(+) A-I      intronic
chr6:73629753(+) A-I      intronic
chr6:73408657(+) A-I      intronic
chr6:73408603(+) A-I      intronic
chr6:73670298(+) A-I      intronic
chr6:73446823(+) A-I      intronic
chr6:73439230(+) A-I      intronic
chr6:73519168(+) A-I      intronic
chr6:73519164(+) A-I      intronic
chr6:73518460(+) A-I      intronic
chr6:73518436(+) A-I      intronic
chr6:73517446(+) A-I      intronic
chr6:73517373(+) A-I      intronic
chr6:73517372(+) A-I      intronic
chr6:73517296(+) A-I      intronic
chr6:73498906(+) A-I      intronic
chr6:73496618(+) A-I      intronic
chr6:73496614(+) A-I      intronic
chr6:73381909(+) A-I      intronic
chr6:73389576(+) A-I      intronic
chr6:73417469(+) A-I      intronic
chr6:73439752(+) A-I      intronic
chr6:73447798(+) A-I      intronic
chr6:73454369(+) A-I      intronic
chr6:73454375(+) A-I      intronic
chr6:73577471(+) A-I      intronic
chr6:73667094(+) A-I      intronic
chr6:73670282(+) A-I      intronic
chr6:73674756(+) A-I      intronic
chr6:73496602(+) A-I      intronic
chr6:73495369(+) A-I      intronic
chr6:73495262(+) A-I      intronic
chr6:73495258(+) A-I      intronic
chr6:73489608(+) A-I      intronic
chr6:73489494(+) A-I      intronic
chr6:73488158(+) A-I      intronic
chr6:73454449(+) A-I      intronic
chr6:73447757(+) A-I      intronic
chr6:73447731(+) A-I      intronic
chr6:73895781(+) A-I      intronic
chr6:73895719(+) A-I      intronic
chr6:73888062(+) A-I      intronic
chr6:73885094(+) A-I      intronic
chr6:73878155(+) A-I      intronic
chr6:73875557(+) A-I      intronic
chr6:73875435(+) A-I      intronic
chr6:73873368(+) A-I      intronic
chr6:73873356(+) A-I      intronic
chr6:73873350(+) A-I      intronic
chr6:73873286(+) A-I      intronic
chr6:73873284(+) A-I      intronic
chr6:73873268(+) A-I      intronic
chr6:73872886(+) A-I      intronic
chr6:73871872(+) A-I      intronic
chr6:73871864(+) A-I      intronic
chr6:73871847(+) A-I      intronic
chr6:73871740(+) A-I      intronic
chr6:73871696(+) A-I      intronic
chr6:73866085(+) A-I      intronic
chr6:73837703(+) A-I      intronic
chr6:73785639(+) A-I      intronic
chr6:73785610(+) A-I      intronic
chr6:73785596(+) A-I      intronic
chr6:73785183(+) A-I      intronic
chr6:73785135(+) A-I      intronic
chr6:73785091(+) A-I      intronic
chr6:73759833(+) A-I      intronic
chr6:73745994(+) A-I      intronic
chr6:73735227(+) A-I      intronic
chr6:73684669(+) A-I      intronic
chr6:73684657(+) A-I      intronic
chr6:73447728(+) A-I      intronic
chr6:73447719(+) A-I      intronic
chr6:73447691(+) A-I      intronic
chr6:73447690(+) A-I      intronic
chr6:73447675(+) A-I      intronic
chr6:73447661(+) A-I      intronic
chr6:73447659(+) A-I      intronic
chr6:73447615(+) A-I      intronic
chr6:73446758(+) A-I      intronic
chr6:73446711(+) A-I      intronic
chr6:73446498(+) A-I      intronic
chr6:73446483(+) A-I      intronic
chr6:73684643(+) A-I      intronic
chr6:73446322(+) A-I      intronic
chr6:73446303(+) A-I      intronic
chr6:73444184(+) A-I      intronic
chr6:73444174(+) A-I      intronic
chr6:73444149(+) A-I      intronic
chr6:73444144(+) A-I      intronic
chr6:73444109(+) A-I      intronic
chr6:73444100(+) A-I      intronic
chr6:73439759(+) A-I      intronic
chr6:73684640(+) A-I      intronic
chr6:73684580(+) A-I      intronic
chr6:73676171(+) A-I      intronic
chr6:73676170(+) A-I      intronic
chr6:73674771(+) A-I      intronic
chr6:73673485(+) A-I      intronic
chr6:73671690(+) A-I      intronic
chr6:73671653(+) A-I      intronic
chr6:73671652(+) A-I      intronic
chr6:73670580(+) A-I      intronic
chr6:73670578(+) A-I      intronic
chr6:73670292(+) A-I      intronic
chr6:73665563(+) A-I      intronic
chr6:73665522(+) A-I      intronic
chr6:73629849(+) A-I      intronic
chr6:73629848(+) A-I      intronic
chr6:73629847(+) A-I      intronic
chr6:73629818(+) A-I      intronic
chr6:73629747(+) A-I      intronic
chr6:73594479(+) A-I      intronic
chr6:73594469(+) A-I      intronic
chr6:73594452(+) A-I      intronic
chr6:73439662(+) A-I      intronic
chr6:73439629(+) A-I      intronic
chr6:73439622(+) A-I      intronic
chr6:73344394(+) A-I      intronic
chr6:73439197(+) A-I      intronic
chr6:73439136(+) A-I      intronic
chr6:73436212(+) A-I      intronic
chr6:73436198(+) A-I      intronic
chr6:73436147(+) A-I      intronic
chr6:73436020(+) A-I      intronic
chr6:73436014(+) A-I      intronic
chr6:73428395(+) A-I      intronic
chr6:73428372(+) A-I      intronic
chr6:73428358(+) A-I      intronic
chr6:73428347(+) A-I      intronic
chr6:73428274(+) A-I      intronic
chr6:73418411(+) A-I      intronic
chr6:73418323(+) A-I      intronic
chr6:73418309(+) A-I      intronic
chr6:73417567(+) A-I      intronic
chr6:73577497(+) A-I      intronic
chr6:73577485(+) A-I      intronic
chr6:73577482(+) A-I      intronic
chr6:73577460(+) A-I      intronic
chr6:73577414(+) A-I      intronic
chr6:73576239(+) A-I      intronic
chr6:73576212(+) A-I      intronic
chr6:73576090(+) A-I      intronic
chr6:73563256(+) A-I      intronic
chr6:73563185(+) A-I      intronic
chr6:73563170(+) A-I      intronic
chr6:73563160(+) A-I      intronic
chr6:73556252(+) A-I      intronic
chr6:73556251(+) A-I      intronic
chr6:73556196(+) A-I      intronic
chr6:73888053(+) A-I      intronic
chr6:73576206(+) A-I      intronic
chr6:73498945(+) A-I      intronic
chr6:73454532(+) A-I      intronic
chr6:73871743(+) A-I      intronic
chr6:73489392(+) A-I      intronic
chr6:73673479(+) A-I      intronic
chr6:73577554(+) A-I      intronic
chr6:73644850(+) A-I      intronic
chr6:73878250(+) A-I      intronic
chr6:73684649(+) A-I      intronic
chr6:73368508(+) A-I      intronic
chr6:73436073(+) A-I      intronic
chr6:73670740(+) A-I      intronic
chr6:73408609(+) A-I      intronic
chr6:73517472(+) A-I      intronic
chr6:73439683(+) A-I      intronic
chr6:73366717(+) A-I      intronic
chr6:73673515(+) A-I      intronic
chr6:73576198(+) A-I      intronic
chr6:73374126(+) A-I      intronic
chr6:73785647(+) A-I      intronic
chr6:73577459(+) A-I      intronic
chr6:73436204(+) A-I      intronic
chr6:73407738(+) A-I      intronic
chr6:73759717(+) A-I      intronic
chr6:73366815(+) A-I      intronic
chr6:73344855(+) A-I      intronic
chr6:73759741(+) A-I      intronic
chr6:73517471(+) A-I      intronic
chr6:73374951(+) A-I      intronic
chr6:73489607(+) A-I      intronic
chr6:73393273(+) A-I      intronic
chr6:73785585(+) A-I      intronic
chr6:73374127(+) A-I      intronic
chr6:73354842(+) A-I      intronic
chr6:73489632(+) A-I      intronic
chr6:73670596(+) A-I      intronic
chr6:73629783(+) A-I      intronic
chr6:73671645(+) A-I      intronic
chr6:73527510(+) A-I      intronic
chr6:73488146(+) A-I      intronic
chr6:73527497(+) A-I      intronic
chr6:73489497(+) A-I      intronic
chr6:73354856(+) A-I      intronic
chr6:73517420(+) A-I      intronic
chr6:73368409(+) A-I      intronic
chr6:73397663(+) A-I      intronic
chr6:73670209(+) A-I      intronic
chr6:73517283(+) A-I      intronic
chr6:73354841(+) A-I      intronic
chr6:73488150(+) A-I      intronic
chr6:73577547(+) A-I      intronic
chr6:73677555(+) A-I      intronic
chr6:73670253(+) A-I      intronic
chr6:73408617(+) A-I      intronic
chr6:73489485(+) A-I      intronic
chr6:73666963(+) A-I      intronic
chr6:73397746(+) A-I      intronic
chr6:73595157(+) A-I      intronic
chr6:73895188(+) A-I      intronic
chr6:73399889(+) A-I      intronic
chr6:73527470(+) A-I      intronic
chr6:73898453(+) A-I      intronic
chr6:73389628(+) A-I      intronic
chr6:73389508(+) A-I      intronic
chr6:73518416(+) A-I      intronic
chr6:73576217(+) A-I      intronic
chr6:73499019(+) A-I      intronic
chr6:73519155(+) A-I      intronic
chr6:73439705(+) A-I      intronic
chr6:73872910(+) A-I      intronic
chr6:73439194(+) A-I      intronic
chr6:73354999(+) A-I      intronic
chr6:73439765(+) A-I      intronic
chr6:73399832(+) A-I      intronic
chr6:73366863(+) A-I      intronic
chr6:73439819(+) A-I      intronic
chr6:73381934(+) A-I      intronic
chr6:73439606(+) A-I      intronic
chr6:73759731(+) A-I      intronic
chr6:73338479(+) A-I      intronic
chr6:73408673(+) A-I      intronic
chr6:73577406(+) A-I      intronic
chr6:73432706(+) A-I      intronic
chr6:73408566(+) A-I      intronic
chr6:73557118(+) A-I      intronic
chr6:73517333(+) A-I      intronic
chr6:73895133(+) A-I      intronic
chr6:73895836(+) A-I      intronic
chr6:73447865(+) A-I      intronic
chr6:73447862(+) A-I      intronic
chr6:73439837(+) A-I      intronic
chr6:73366817(+) A-I      intronic
chr6:73517458(+) A-I      intronic
chr6:73595109(+) A-I      intronic
chr6:73759819(+) A-I      intronic
chr6:73777861(+) A-I      intronic
chr6:73872879(+) A-I      intronic
chr6:73873208(+) A-I      intronic
chr6:73407685(+) A-I      intronic
chr6:73495226(+) A-I      intronic
chr6:73397765(+) A-I      intronic
chr6:73885095(+) A-I      intronic
chr6:73670568(+) A-I      intronic
chr6:73432831(+) A-I      intronic
chr6:73408190(+) A-I      intronic
chr6:73389711(+) A-I      intronic
chr6:73895738(+) A-I      intronic
chr6:73895805(+) A-I      intronic
chr6:73756604(+) A-I      intronic
chr6:73439628(+) A-I      intronic
chr6:73368582(+) A-I      intronic
chr6:73439150(+) A-I      intronic
chr6:73368126(+) A-I      intronic
chr6:73495188(+) A-I      intronic
chr6:73488204(+) A-I      intronic
chr6:73418385(+) A-I      intronic
chr6:73527408(+) A-I      intronic
chr6:73366852(+) A-I      intronic
chr6:73519154(+) A-I      intronic
chr6:73527502(+) A-I      intronic
chr6:73489445(+) A-I      intronic
chr6:73436143(+) A-I      intronic
chr6:73517258(+) A-I      intronic
chr6:73576175(+) A-I      intronic
chr6:73519160(+) A-I      intronic
chr6:73797924(+) A-I      intronic
chr6:73673486(+) A-I      intronic
chr6:73439211(+) A-I      intronic
chr6:73873000(+) A-I      intronic
chr6:73517357(+) A-I      intronic
chr6:73880577(+) A-I      intronic
chr6:73517362(+) A-I      intronic
chr6:73671754(+) A-I      intronic
chr6:73495292(+) A-I      intronic
chr6:73338431(+) A-I      intronic
chr6:73785001(+) A-I      intronic
chr6:73577516(+) A-I      intronic
chr6:73517297(+) A-I      intronic
chr6:73576008(+) A-I      intronic
chr6:73447861(+) A-I      intronic
chr6:73444225(+) A-I      intronic
chr6:73488105(+) A-I      intronic
chr6:73517256(+) A-I      intronic
chr6:73707230(+) A-I      intronic
chr6:73527513(+) A-I      intronic
chr6:73393221(+) A-I      intronic
chr6:73408008(+) A-I      intronic
chr6:73903664(+) A-I      intronic
chr6:73344782(+) A-I      intronic
chr6:73487996(+) A-I      intronic
chr6:73374289(+) A-I      intronic
chr6:73872880(+) A-I      intronic
chr6:73885039(+) A-I      intronic
chr6:73446884(+) A-I      intronic
chr6:73591624(+) A-I      intronic
chr6:73556988(+) A-I      intronic
chr6:73488110(+) A-I      intronic
chr6:73883417(+) A-I      intronic
chr6:73439776(+) A-I      intronic
chr6:73454533(+) A-I      intronic
chr6:73389642(+) A-I      intronic
chr6:73875628(+) A-I      intronic
chr6:73408604(+) A-I      intronic
chr6:73439702(+) A-I      intronic
chr6:73389547(+) A-I      intronic
chr6:73894973(+) A-I      intronic
chr6:73489507(+) A-I      intronic
chr6:73374232(+) A-I      intronic
chr6:73895792(+) A-I      intronic
chr6:73368523(+) A-I      intronic
chr6:73408512(+) A-I      intronic
chr6:73788769(+) A-I      intronic
chr6:73517371(+) A-I      intronic
chr6:73576243(+) A-I      intronic
chr6:73439626(+) A-I      intronic
chr6:73577458(+) A-I      intronic
chr6:73868129(+) A-I      intronic
chr6:73670620(+) A-I      intronic
chr6:73895932(+) A-I      intronic
chr6:73432853(+) A-I      intronic
chr6:73518437(+) A-I      intronic
chr6:73756505(+) A-I      intronic
chr6:73874944(+) A-I      intronic
chr6:73355034(+) A-I      intronic
chr6:73488083(+) A-I      intronic
chr6:73556267(+) A-I      intronic
chr6:73874806(+) A-I      intronic
chr6:73898452(+) A-I      intronic
chr6:73366827(+) A-I      intronic
chr6:73368569(+) A-I      intronic
chr6:73671644(+) A-I      intronic
chr6:73446894(+) A-I      intronic
chr6:73576095(+) A-I      intronic
chr6:73498979(+) A-I      intronic
chr6:73671716(+) A-I      intronic
chr6:73399740(+) A-I      intronic
chr6:73495293(+) A-I      intronic
chr6:73868090(+) A-I      intronic
chr6:73885056(+) A-I      intronic
chr6:73389676(+) A-I      intronic
chr6:73368546(+) A-I      intronic
chr6:73498973(+) A-I      intronic
chr6:73895004(+) A-I      intronic
chr6:73591688(+) A-I      intronic
chr6:73489625(+) A-I      intronic
chr6:73495186(+) A-I      intronic
chr6:73439795(+) A-I      intronic
chr6:73408568(+) A-I      intronic
chr6:73670767(+) A-I      intronic
chr6:73366877(+) A-I      intronic
chr6:73594530(+) A-I      intronic
chr6:73488134(+) A-I      intronic
chr6:73439829(+) A-I      intronic
chr6:73670621(+) A-I      intronic
chr6:73407983(+) A-I      intronic
chr6:73903004(+) A-I      intronic
chr6:73895728(+) A-I      intronic
chr6:73673489(+) A-I      intronic
chr6:73580111(+) A-I      intronic
chr6:73496608(+) A-I      intronic
chr6:73576143(+) A-I      intronic
chr6:73673571(+) A-I      intronic
chr6:73498980(+) A-I      intronic
chr6:73368109(+) A-I      intronic
chr6:73527496(+) A-I      intronic
chr6:73576164(+) A-I      intronic
chr6:73576162(+) A-I      intronic
chr6:73576216(+) A-I      intronic
chr6:73399921(+) A-I      intronic
chr6:73556991(+) A-I      intronic
chr6:73374325(+) A-I      intronic
chr6:73393298(+) A-I      intronic
chr6:73489399(+) A-I      intronic
chr6:73673525(+) A-I      intronic
chr6:73577405(+) A-I      intronic
chr6:73498946(+) A-I      intronic
chr6:73399835(+) A-I      intronic
chr6:73436034(+) A-I      intronic
chr6:73439835(+) A-I      intronic
chr6:73556291(+) A-I      intronic
chr6:73495110(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED KCNQ5
chr6:73843194(+) A-I exon CDS    19478186
chr6:73352114(+) A-I intron -    22327324
chr6:73352131(+) A-I intron -    22327324
chr6:73352748(+) A-I intron -    22327324
chr6:73352923(+) A-I intron -    22327324
chr6:73352926(+) A-I intron -    22327324
chr6:73352949(+) A-I intron -    22327324
chr6:73477606(+) A-I intron -    22327324
chr6:73489509(+) A-I intron -    22327324
chr6:73501659(+) A-I intron -    22327324
chr6:73501664(+) A-I intron -    22327324
chr6:73558048(+) A-I intron -    22327324
chr6:73895738(+) A-I intron -    22327324
chr6:73352072(+) A-G intron -    22484847
chr6:73352073(+) A-G intron -    22484847
chr6:73352748(+) A-G intron -    22484847
chr6:73352890(+) A-G intron -    22484847
chr6:73352923(+) A-G intron -    22484847
chr6:73352926(+) A-G intron -    22484847
chr6:73352949(+) A-G intron -    22484847
chr6:73378524(+) A-G intron -    22484847
chr6:73378540(+) A-G intron -    22484847
chr6:73378549(+) A-G intron -    22484847
chr6:73474860(+) A-G intron -    22484847
chr6:73474882(+) A-G intron -    22484847
chr6:73477606(+) A-G intron -    22484847
chr6:73477614(+) A-G intron -    22484847
chr6:73477617(+) A-G intron -    22484847
chr6:73477708(+) A-G intron -    22484847
chr6:73500296(+) A-G intron -    22484847
chr6:73501591(+) A-G intron -    22484847
chr6:73501597(+) A-G intron -    22484847
chr6:73501640(+) A-G intron -    22484847
chr6:73501659(+) A-G intron -    22484847
chr6:73501664(+) A-G intron -    22484847
chr6:73508018(+) A-G intron -    22484847
chr6:73508047(+) A-G intron -    22484847
chr6:73508048(+) A-G intron -    22484847
chr6:73513934(+) A-G intron -    22484847
chr6:73514066(+) A-G intron -    22484847
chr6:73553802(+) A-G intron -    22484847
chr6:73557933(+) A-G intron -    22484847
chr6:73557934(+) A-G intron -    22484847
chr6:73557935(+) A-G intron -    22484847
chr6:73557946(+) A-G intron -    22484847
chr6:73558048(+) A-G intron -    22484847
chr6:73559031(+) A-G intron -    22484847
chr6:73562026(+) A-G intron -    22484847
chr6:73682149(+) A-G intron -    22484847
chr6:73719601(+) T-C intron -    22484847
chr6:73860557(+) G-A intron -    22484847
chr6:73341885(+) A-T intron -    22484847
chr6:73344777(+) G-T intron -    22484847
chr6:73344782(+) A-G intron -    22484847
chr6:73344803(+) A-G intron -    22484847
chr6:73344855(+) A-G intron -    22484847
chr6:73355128(+) A-C intron -    22484847
chr6:73366728(+) T-C intron -    22484847
chr6:73366815(+) A-G intron -    22484847
chr6:73366852(+) A-G intron -    22484847
chr6:73366855(+) T-C intron -    22484847
chr6:73366858(+) A-G intron -    22484847
chr6:73368108(+) A-G intron -    22484847
chr6:73368109(+) A-G intron -    22484847
chr6:73368126(+) A-G intron -    22484847
chr6:73368148(+) A-G intron -    22484847
chr6:73368513(+) A-G intron -    22484847
chr6:73368523(+) A-G intron -    22484847
chr6:73368546(+) A-G intron -    22484847
chr6:73374126(+) A-G intron -    22484847
chr6:73374127(+) A-G intron -    22484847
chr6:73374289(+) A-G intron -    22484847
chr6:73374325(+) A-G intron -    22484847
chr6:73384418(+) T-C intron -    22484847
chr6:73389628(+) A-G intron -    22484847
chr6:73389642(+) A-G intron -    22484847
chr6:73389711(+) A-G intron -    22484847
chr6:73393221(+) A-G intron -    22484847
chr6:73393298(+) A-G intron -    22484847
chr6:73397663(+) A-G intron -    22484847
chr6:73397743(+) A-G intron -    22484847
chr6:73397746(+) A-G intron -    22484847
chr6:73397765(+) A-G intron -    22484847
chr6:73399821(+) A-G intron -    22484847
chr6:73399832(+) A-G intron -    22484847
chr6:73399835(+) A-G intron -    22484847
chr6:73399836(+) A-G intron -    22484847
chr6:73399903(+) A-G intron -    22484847
chr6:73407685(+) A-G intron -    22484847
chr6:73407738(+) A-G intron -    22484847
chr6:73407758(+) A-G intron -    22484847
chr6:73408190(+) A-G intron -    22484847
chr6:73411709(+) T-C intron -    22484847
chr6:73435934(+) T-A intron -    22484847
chr6:73436034(+) A-G intron -    22484847
chr6:73436073(+) A-G intron -    22484847
chr6:73436075(+) A-G intron -    22484847
chr6:73436126(+) T-C intron -    22484847
chr6:73436204(+) A-G intron -    22484847
chr6:73439111(+) A-G intron -    22484847
chr6:73439150(+) A-G intron -    22484847
chr6:73439194(+) A-G intron -    22484847
chr6:73439211(+) A-G intron -    22484847
chr6:73439773(+) A-G intron -    22484847
chr6:73439795(+) A-G intron -    22484847
chr6:73439819(+) A-G intron -    22484847
chr6:73439835(+) A-G intron -    22484847
chr6:73439837(+) A-G intron -    22484847
chr6:73444125(+) A-G intron -    22484847
chr6:73446753(+) A-G intron -    22484847
chr6:73447607(+) A-G intron -    22484847
chr6:73447617(+) A-G intron -    22484847
chr6:73447861(+) A-G intron -    22484847
chr6:73447862(+) A-G intron -    22484847
chr6:73447865(+) A-G intron -    22484847
chr6:73454413(+) A-G intron -    22484847
chr6:73454466(+) A-G intron -    22484847
chr6:73488134(+) A-G intron -    22484847
chr6:73489445(+) A-G intron -    22484847
chr6:73489485(+) A-G intron -    22484847
chr6:73489509(+) A-G intron -    22484847
chr6:73489513(+) A-G intron -    22484847
chr6:73489632(+) A-G intron -    22484847
chr6:73495110(+) A-G intron -    22484847
chr6:73495186(+) A-G intron -    22484847
chr6:73495188(+) A-G intron -    22484847
chr6:73495252(+) A-G intron -    22484847
chr6:73495292(+) A-G intron -    22484847
chr6:73495293(+) A-G intron -    22484847
chr6:73498979(+) A-G intron -    22484847
chr6:73498980(+) A-G intron -    22484847
chr6:73517256(+) A-G intron -    22484847
chr6:73517258(+) A-G intron -    22484847
chr6:73517283(+) A-G intron -    22484847
chr6:73517333(+) A-G intron -    22484847
chr6:73517357(+) A-G intron -    22484847
chr6:73517362(+) A-G intron -    22484847
chr6:73517365(+) A-G intron -    22484847
chr6:73517371(+) A-G intron -    22484847
chr6:73517420(+) A-G intron -    22484847
chr6:73517471(+) A-G intron -    22484847
chr6:73517472(+) A-G intron -    22484847
chr6:73518416(+) A-G intron -    22484847
chr6:73518455(+) A-G intron -    22484847
chr6:73519154(+) A-G intron -    22484847
chr6:73519155(+) A-G intron -    22484847
chr6:73519160(+) A-G intron -    22484847
chr6:73527497(+) A-G intron -    22484847
chr6:73527502(+) A-G intron -    22484847
chr6:73527510(+) A-G intron -    22484847
chr6:73527513(+) A-G intron -    22484847
chr6:73546274(+) A-G intron -    22484847
chr6:73557118(+) A-G intron -    22484847
chr6:73576008(+) A-G intron -    22484847
chr6:73576095(+) A-G intron -    22484847
chr6:73576175(+) A-G intron -    22484847
chr6:73576178(+) A-G intron -    22484847
chr6:73576198(+) A-G intron -    22484847
chr6:73576206(+) A-G intron -    22484847
chr6:73576213(+) A-G intron -    22484847
chr6:73576217(+) A-G intron -    22484847
chr6:73577405(+) A-G intron -    22484847
chr6:73577406(+) A-G intron -    22484847
chr6:73577459(+) A-G intron -    22484847
chr6:73577554(+) A-G intron -    22484847
chr6:73594357(+) T-A intron -    22484847
chr6:73594541(+) A-G intron -    22484847
chr6:73595116(+) A-G intron -    22484847
chr6:73629783(+) A-G intron -    22484847
chr6:73648277(+) A-T intron -    22484847
chr6:73648278(+) T-A intron -    22484847
chr6:73665578(+) A-G intron -    22484847
chr6:73666963(+) A-G intron -    22484847
chr6:73670209(+) A-G intron -    22484847
chr6:73670253(+) A-G intron -    22484847
chr6:73670568(+) A-G intron -    22484847
chr6:73670596(+) A-G intron -    22484847
chr6:73670620(+) A-G intron -    22484847
chr6:73670621(+) A-G intron -    22484847
chr6:73670740(+) A-G intron -    22484847
chr6:73670779(+) G-A intron -    22484847
chr6:73671644(+) A-G intron -    22484847
chr6:73671645(+) A-G intron -    22484847
chr6:73671716(+) A-G intron -    22484847
chr6:73671754(+) A-G intron -    22484847
chr6:73671780(+) A-G intron -    22484847
chr6:73671790(+) A-G intron -    22484847
chr6:73673460(+) A-G intron -    22484847
chr6:73673479(+) A-G intron -    22484847
chr6:73673486(+) A-G intron -    22484847
chr6:73673489(+) A-G intron -    22484847
chr6:73673515(+) A-G intron -    22484847
chr6:73673525(+) A-G intron -    22484847
chr6:73677540(+) A-G intron -    22484847
chr6:73677555(+) A-G intron -    22484847
chr6:73684649(+) A-G intron -    22484847
chr6:73756505(+) A-G intron -    22484847
chr6:73777861(+) A-G intron -    22484847
chr6:73785001(+) A-G intron -    22484847
chr6:73785585(+) A-G intron -    22484847
chr6:73785625(+) A-G intron -    22484847
chr6:73785647(+) A-G intron -    22484847
chr6:73871688(+) A-G intron -    22484847
chr6:73871743(+) A-G intron -    22484847
chr6:73872958(+) T-A intron -    22484847
chr6:73872959(+) T-A intron -    22484847
chr6:73874944(+) A-G intron -    22484847
chr6:73875628(+) A-G intron -    22484847
chr6:73885039(+) A-G intron -    22484847
chr6:73885095(+) A-G intron -    22484847
chr6:73894973(+) A-G intron -    22484847
chr6:73895728(+) A-G intron -    22484847
chr6:73895738(+) A-G intron -    22484847
chr6:73895805(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase KCNQ5
chr6:73331636-73331637(+) m6A 5'UTR       -
chr6:73331659-73331660(+) m6A 5'UTR       -
chr6:73904293-73904294(+) m6A CDS       -
chr6:73904297-73904298(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr6:73904352-73904353(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr6:73904438-73904439(+) m6A CDS       24209618//24981863//22608085
chr6:73904538-73904539(+) m6A CDS       24209618//24981863//22608085
chr6:73904630-73904631(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:73904739-73904740(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:73904777-73904778(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:73904811-73904812(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:73904838-73904839(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:73904860-73904861(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:73904978-73904979(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:73904984-73904985(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:73904988-73904989(+) m6A CDS       25456834//24981863
chr6:73905039-73905040(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:73905050-73905051(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:73905127-73905128(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:73905194-73905195(+) m6A 3'UTR       24981863
chr6:73905244-73905245(+) m6A 3'UTR       24981863
chr6:73905932-73905933(+) m6A 3'UTR       22608085
chr6:73905949-73905950(+) m6A 3'UTR       22608085
chr6:73906050-73906051(+) m6A 3'UTR       22608085
chr6:73906065-73906066(+) m6A 3'UTR       22608085
chr6:73906078-73906079(+) m6A 3'UTR       22608085
chr6:73906104-73906105(+) m6A 3'UTR       22608085
chr6:73906112-73906113(+) m6A 3'UTR       22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-16-1-3p
Exosome Plasma     23663360
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
KCNQ5
Chromatin K562 cells     -
Cytosol K562 cells     -
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-16-1-3p
Interactor2: KCNQ5

Evidence Support:


Weak-Evidence Illumina sequencing
Prediction-Evidence miRanda
Support Database ViRBase

References:


PMID 32223537 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line Calu-3 cells Interactor2 expression Upregulation
Description The miRNA-mRNA pairs with strong correlations were selected for miRNA-mRNA binding site prediction using miRanda.

Starting a new search, please wait ...