Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00098944

  Virus:  

Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.5711

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-16-1-3p:  MIMAT0004489          MBD5:  NM_018328     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-16-1-3p	MBD5
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004489	55777
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	MRD1

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-16-1-3p	rs377111580 chr13:50048986    C/T rs769728617 chr13:50048992    CA/C rs1460126106 chr13:50049003    C/A rs1460126106 chr13:50049003    C/T rs1468155921 chr13:50049001    T/C

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	MBD5	chr2:148813022(+) A-I      intronic chr2:148811546(+) A-I      intronic chr2:148811541(+) A-I      intronic chr2:149256634(+) A-I      intronic chr2:149256680(+) A-I      intronic chr2:149075428(+) A-I      intronic chr2:148811589(+) A-I      intronic chr2:149168161(+) A-I      intronic chr2:149094203(+) A-I      intronic chr2:148811540(+) A-I      intronic chr2:148811576(+) A-I      intronic chr2:148811557(+) A-I      intronic chr2:148817239(+) A-I      intronic chr2:148817255(+) A-I      intronic chr2:148817263(+) A-I      intronic chr2:148894592(+) A-I      intronic chr2:148818936(+) A-I      intronic chr2:148817264(+) A-I      intronic chr2:148817265(+) A-I      intronic chr2:148817269(+) A-I      intronic chr2:148817300(+) A-I      intronic chr2:149036919(+) A-I      intronic chr2:149254999(+) A-I      intronic chr2:149255029(+) A-I      intronic chr2:149255055(+) A-I      intronic chr2:149255056(+) A-I      intronic chr2:149255073(+) A-I      intronic chr2:149036901(+) A-I      intronic chr2:149036933(+) A-I      intronic chr2:149037452(+) A-I      intronic chr2:149037453(+) A-I      intronic chr2:149037470(+) A-I      intronic chr2:149037478(+) A-I      intronic chr2:149037482(+) A-I      intronic chr2:149037492(+) A-I      intronic chr2:149038220(+) A-I      intronic chr2:149047632(+) A-I      intronic chr2:149047650(+) A-I      intronic chr2:149047651(+) A-I      intronic chr2:149047664(+) A-I      intronic chr2:149047761(+) A-I      intronic chr2:149047788(+) A-I      intronic chr2:149062497(+) A-I      intronic chr2:149062513(+) A-I      intronic chr2:149062554(+) A-I      intronic chr2:149074684(+) A-I      intronic chr2:149074698(+) A-I      intronic chr2:149074791(+) A-I      intronic chr2:149079357(+) A-I      intronic chr2:149091342(+) A-I      intronic chr2:149092028(+) A-I      intronic chr2:149092093(+) A-I      intronic chr2:149092757(+) A-I      intronic chr2:149092839(+) A-I      intronic chr2:149093102(+) A-I      intronic chr2:149093106(+) A-I      intronic chr2:149094013(+) A-I      intronic chr2:149094036(+) A-I      intronic chr2:149094085(+) A-I      intronic chr2:149094095(+) A-I      intronic chr2:149094105(+) A-I      intronic chr2:149111324(+) A-I      intronic chr2:149111347(+) A-I      intronic chr2:149111378(+) A-I      intronic chr2:149111384(+) A-I      intronic chr2:149111385(+) A-I      intronic chr2:149111402(+) A-I      intronic chr2:149116147(+) A-I      intronic chr2:149116742(+) A-I      intronic chr2:149116748(+) A-I      intronic chr2:149116757(+) A-I      intronic chr2:149128238(+) A-I      intronic chr2:149128293(+) A-I      intronic chr2:149128323(+) A-I      intronic chr2:149178349(+) A-I      intronic chr2:149178443(+) A-I      intronic chr2:149209825(+) A-I      intronic chr2:149254995(+) A-I      intronic chr2:149256008(+) A-I      intronic chr2:149256011(+) A-I      intronic chr2:149256036(+) A-I      intronic chr2:148962746(+) A-I      intronic chr2:148960580(+) A-I      intronic chr2:148960547(+) A-I      intronic chr2:148960543(+) A-I      intronic chr2:148958194(+) A-I      intronic chr2:148958115(+) A-I      intronic chr2:148958106(+) A-I      intronic chr2:148958097(+) A-I      intronic chr2:148958073(+) A-I      intronic chr2:148958032(+) A-I      intronic chr2:148958006(+) A-I      intronic chr2:148955618(+) A-I      intronic chr2:148955574(+) A-I      intronic chr2:148955570(+) A-I      intronic chr2:148955519(+) A-I      intronic chr2:148955407(+) A-I      intronic chr2:148938119(+) A-I      intronic chr2:148936908(+) A-I      intronic chr2:148936845(+) A-I      intronic chr2:148936844(+) A-I      intronic chr2:148936803(+) A-I      intronic chr2:148929510(+) A-I      intronic chr2:148921150(+) A-I      intronic chr2:148921047(+) A-I      intronic chr2:148916985(+) A-I      intronic chr2:148916984(+) A-I      intronic chr2:148916978(+) A-I      intronic chr2:148916971(+) A-I      intronic chr2:148904873(+) A-I      intronic chr2:148903907(+) A-I      intronic chr2:149256048(+) A-I      intronic chr2:149256059(+) A-I      intronic chr2:149256062(+) A-I      intronic chr2:149256072(+) A-I      intronic chr2:149256090(+) A-I      intronic chr2:149256107(+) A-I      intronic chr2:149256166(+) A-I      intronic chr2:149256666(+) A-I      intronic chr2:149256721(+) A-I      intronic chr2:149256724(+) A-I      intronic chr2:149256760(+) A-I      intronic chr2:149256764(+) A-I      intronic chr2:149256769(+) A-I      intronic chr2:148898439(+) A-I      intronic chr2:148895119(+) A-I      intronic chr2:148895075(+) A-I      intronic chr2:148895074(+) A-I      intronic chr2:148894396(+) A-I      intronic chr2:148894354(+) A-I      intronic chr2:148894352(+) A-I      intronic chr2:148894350(+) A-I      intronic chr2:148884735(+) A-I      intronic chr2:148884565(+) A-I      intronic chr2:148883726(+) A-I      intronic chr2:148877603(+) A-I      intronic chr2:148877571(+) A-I      intronic chr2:148877555(+) A-I      intronic chr2:148871896(+) A-I      intronic chr2:148871777(+) A-I      intronic chr2:148862881(+) A-I      intronic chr2:148837383(+) A-I      intronic chr2:148837299(+) A-I      intronic chr2:148837283(+) A-I      intronic chr2:148837276(+) A-I      intronic chr2:148828521(+) A-I      intronic chr2:148828520(+) A-I      intronic chr2:148824194(+) A-I      intronic chr2:148824164(+) A-I      intronic chr2:148824111(+) A-I      intronic chr2:148823629(+) A-I      intronic chr2:148821898(+) A-I      intronic chr2:148821891(+) A-I      intronic chr2:148821775(+) A-I      intronic chr2:148817861(+) A-I      intronic chr2:148817849(+) A-I      intronic chr2:148817812(+) A-I      intronic chr2:148817757(+) A-I      intronic chr2:148817669(+) A-I      intronic chr2:148817365(+) A-I      intronic chr2:148817364(+) A-I      intronic chr2:148817360(+) A-I      intronic chr2:148817205(+) A-I      intronic chr2:148813186(+) A-I      intronic chr2:148813102(+) A-I      intronic chr2:148813101(+) A-I      intronic chr2:148813081(+) A-I      intronic chr2:148800766(+) A-I      intronic chr2:148798643(+) A-I      intronic chr2:148798599(+) A-I      intronic chr2:148798582(+) A-I      intronic chr2:148797822(+) A-I      intronic chr2:148797787(+) A-I      intronic chr2:148963601(+) A-I      intronic chr2:148963416(+) A-I      intronic chr2:148963411(+) A-I      intronic chr2:148963397(+) A-I      intronic chr2:148962842(+) A-I      intronic chr2:148962792(+) A-I      intronic chr2:148962788(+) A-I      intronic chr2:148962775(+) A-I      intronic chr2:148962771(+) A-I      intronic chr2:148963621(+) A-I      intronic chr2:148963642(+) A-I      intronic chr2:148969379(+) A-I      intronic chr2:148969382(+) A-I      intronic chr2:148969408(+) A-I      intronic chr2:148969595(+) A-I      intronic chr2:148973284(+) A-I      intronic chr2:148973344(+) A-I      intronic chr2:148973366(+) A-I      intronic chr2:148993467(+) A-I      intronic chr2:148993480(+) A-I      intronic chr2:148993540(+) A-I      intronic chr2:148998075(+) A-I      intronic chr2:148998081(+) A-I      intronic chr2:149002816(+) A-I      intronic chr2:149002912(+) A-I      intronic chr2:149003094(+) A-I      intronic chr2:149003121(+) A-I      intronic chr2:149004303(+) A-I      intronic chr2:149009830(+) A-I      intronic chr2:149009871(+) A-I      intronic chr2:149009874(+) A-I      intronic chr2:149009886(+) A-I      intronic chr2:149010348(+) A-I      intronic chr2:149010353(+) A-I      intronic chr2:149094098(+) A-I      intronic chr2:149025898(+) A-I      intronic chr2:149033631(+) A-I      intronic chr2:149033824(+) A-I      intronic chr2:149033838(+) A-I      intronic chr2:149033876(+) A-I      intronic chr2:149036900(+) A-I      intronic chr2:148955482(+) A-I      intronic chr2:148784282(+) A-I      intronic chr2:149009882(+) A-I      intronic chr2:148817613(+) A-I      intronic chr2:149111186(+) A-I      intronic chr2:149093975(+) A-I      intronic chr2:148841371(+) A-I      intronic chr2:148877612(+) A-I      intronic chr2:149010302(+) A-I      intronic chr2:148960415(+) A-I      intronic chr2:149038101(+) A-I      intronic chr2:148917129(+) A-I      intronic chr2:149094056(+) A-I      intronic chr2:148884625(+) A-I      intronic chr2:148895097(+) A-I      intronic chr2:149036967(+) A-I      intronic chr2:148823832(+) A-I      intronic chr2:148963534(+) A-I      intronic chr2:148817811(+) A-I      intronic chr2:148973300(+) A-I      intronic chr2:148798590(+) A-I      intronic chr2:148877585(+) A-I      intronic chr2:149050697(+) A-I      intronic chr2:148938200(+) A-I      intronic chr2:148926275(+) A-I      intronic chr2:149036733(+) A-I      intronic chr2:149037437(+) A-I      intronic chr2:149256116(+) A-I      intronic chr2:149255231(+) A-I      intronic chr2:149111208(+) A-I      intronic chr2:148969455(+) A-I      intronic chr2:149010333(+) A-I      intronic chr2:148958207(+) A-I      intronic chr2:148850655(+) A-I      intronic chr2:148813208(+) A-I      intronic chr2:149181640(+) A-I      intronic chr2:149009944(+) A-I      intronic chr2:148810466(+) A-I      intronic chr2:149255147(+) A-I      intronic chr2:149010193(+) A-I      intronic chr2:148824120(+) A-I      intronic chr2:148824176(+) A-I      intronic chr2:148823724(+) A-I      intronic chr2:148889061(+) A-I      intronic chr2:149256007(+) A-I      intronic chr2:148955604(+) A-I      intronic chr2:149092001(+) A-I      intronic chr2:148797837(+) A-I      intronic chr2:149255293(+) A-I      intronic chr2:148817693(+) A-I      intronic chr2:148817755(+) A-I      intronic chr2:149032421(+) A-I      intronic chr2:149128310(+) A-I      intronic chr2:149255250(+) A-I      intronic chr2:148811738(+) A-I      intronic chr2:149047736(+) A-I      intronic chr2:149181590(+) A-I      intronic chr2:148963339(+) A-I      intronic chr2:149181699(+) A-I      intronic chr2:148916996(+) A-I      intronic chr2:148823665(+) A-I      intronic chr2:149181493(+) A-I      intronic chr2:149050769(+) A-I      intronic chr2:149021835(+) A-I      intronic chr2:148824112(+) A-I      intronic chr2:149047666(+) A-I      intronic chr2:149166943(+) A-I      intronic chr2:149116246(+) A-I      intronic chr2:148813132(+) A-I      intronic chr2:149021774(+) A-I      intronic chr2:149166814(+) A-I      intronic chr2:148958182(+) A-I      intronic chr2:148875940(+) A-I      intronic chr2:148810451(+) A-I      intronic chr2:148813167(+) A-I      intronic chr2:148969415(+) A-I      intronic chr2:148963532(+) A-I      intronic chr2:149003009(+) A-I      intronic chr2:148828610(+) A-I      intronic chr2:148894565(+) A-I      intronic chr2:149033833(+) A-I      intronic chr2:148813183(+) A-I      intronic chr2:148943289(+) A-I      intronic chr2:148963464(+) A-I      intronic chr2:149092771(+) A-I      intronic chr2:149002813(+) A-I      intronic chr2:148809873(+) A-I      intronic chr2:148797823(+) A-I      intronic chr2:149057654(+) A-I      intronic chr2:149091323(+) A-I      intronic chr2:148963636(+) A-I      intronic chr2:149111333(+) A-I      intronic chr2:148798662(+) A-I      intronic chr2:149091979(+) A-I      intronic chr2:148955523(+) A-I      intronic chr2:149033604(+) A-I      intronic chr2:148811532(+) A-I      intronic chr2:148813082(+) A-I      intronic chr2:148957248(+) A-I      intronic chr2:148817294(+) A-I      intronic chr2:148862905(+) A-I      intronic chr2:148797788(+) A-I      intronic chr2:148823838(+) A-I      intronic chr2:148824117(+) A-I      intronic chr2:148955463(+) A-I      intronic chr2:148884743(+) A-I      intronic chr2:148828538(+) A-I      intronic chr2:149163432(+) A-I      intronic chr2:148955605(+) A-I      intronic chr2:149010248(+) A-I      intronic chr2:148881683(+) A-I      intronic chr2:149166877(+) A-I      intronic chr2:148962786(+) A-I      intronic chr2:149181575(+) A-I      intronic chr2:148813275(+) A-I      intronic chr2:149009847(+) A-I      intronic chr2:148963563(+) A-I      intronic chr2:149009976(+) A-I      intronic chr2:148797792(+) A-I      intronic chr2:148813131(+) A-I      intronic chr2:149181734(+) A-I      intronic chr2:149092124(+) A-I      intronic chr2:148858781(+) A-I      intronic chr2:149092027(+) A-I      intronic chr2:148955406(+) A-I      intronic chr2:149092819(+) A-I      intronic chr2:148883924(+) A-I      intronic chr2:148963417(+) A-I      intronic chr2:148823771(+) A-I      intronic chr2:148817739(+) A-I      intronic chr2:148877625(+) A-I      intronic chr2:149094057(+) A-I      intronic chr2:149091971(+) A-I      intronic chr2:149092772(+) A-I      intronic chr2:148813168(+) A-I      intronic chr2:148962720(+) A-I      intronic chr2:148884718(+) A-I      intronic chr2:149256821(+) A-I      intronic chr2:149094012(+) A-I      intronic chr2:148797814(+) A-I      intronic chr2:148813128(+) A-I      intronic chr2:148938227(+) A-I      intronic chr2:148957223(+) A-I      intronic chr2:148963637(+) A-I      intronic chr2:149003076(+) A-I      intronic chr2:148817670(+) A-I      intronic chr2:148798631(+) A-I      intronic chr2:148823723(+) A-I      intronic chr2:149074818(+) A-I      intronic chr2:149255075(+) A-I      intronic chr2:149093046(+) A-I      intronic chr2:149093059(+) A-I      intronic chr2:148963362(+) A-I      intronic chr2:149033625(+) A-I      intronic chr2:148823809(+) A-I      intronic chr2:148798663(+) A-I      intronic chr2:148817680(+) A-I      intronic chr2:149181626(+) A-I      intronic chr2:148894477(+) A-I      intronic chr2:149036817(+) A-I      intronic chr2:148813020(+) A-I      intronic chr2:149256006(+) A-I      intronic chr2:149093979(+) A-I      intronic chr2:148960577(+) A-I      intronic chr2:149181528(+) A-I      intronic chr2:148963361(+) A-I      intronic chr2:148889218(+) A-I      intronic chr2:149181531(+) A-I      intronic chr2:149004084(+) A-I      intronic chr2:149255159(+) A-I      intronic chr2:148883789(+) A-I      intronic chr2:149256024(+) A-I      intronic chr2:148938153(+) A-I      intronic chr2:148962881(+) A-I      intronic chr2:149032492(+) A-I      intronic chr2:148889034(+) A-I      intronic chr2:149166734(+) A-I      intronic chr2:148798630(+) A-I      intronic chr2:148938239(+) A-I      intronic chr2:149255243(+) A-I      intronic chr2:148936763(+) A-I      intronic chr2:148850664(+) A-I      intronic chr2:148899392(+) A-I      intronic chr2:148875937(+) A-I      intronic chr2:149178319(+) A-I      intronic chr2:148798617(+) A-I      intronic chr2:148938174(+) A-I      intronic chr2:149004226(+) A-I      intronic chr2:148982151(+) A-I      intronic chr2:148883756(+) A-I      intronic chr2:149116715(+) A-I      intronic chr2:149036797(+) A-I      intronic chr2:148997400(+) A-I      intronic chr2:148962833(+) A-I      intronic chr2:148823755(+) A-I      intronic chr2:149091316(+) A-I      intronic chr2:148899336(+) A-I      intronic chr2:149004085(+) A-I      intronic chr2:148973224(+) A-I      intronic chr2:148877685(+) A-I      intronic chr2:149256763(+) A-I      intronic chr2:149197536(+) A-I      intronic chr2:148993418(+) A-I      intronic chr2:148823606(+) A-I      intronic chr2:149094009(+) A-I      intronic chr2:148962898(+) A-I      intronic chr2:148963545(+) A-I      intronic chr2:149092002(+) A-I      intronic chr2:149091934(+) A-I      intronic chr2:148881729(+) A-I      intronic chr2:149050641(+) A-I      intronic chr2:148817161(+) A-I      intronic chr2:148973190(+) A-I      intronic chr2:148895068(+) A-I      intronic chr2:149168030(+) A-I      intronic chr2:148798587(+) A-I      intronic chr2:148917713(+) A-I      intronic chr2:149036753(+) A-I      intronic chr2:149116629(+) A-I      intronic chr2:148916962(+) A-I      intronic chr2:149021820(+) A-I      intronic chr2:148809953(+) A-I      intronic chr2:148960567(+) A-I      intronic chr2:148877565(+) A-I      intronic chr2:149033612(+) A-I      intronic chr2:148960527(+) A-I      intronic chr2:149010222(+) A-I      intronic chr2:148955483(+) A-I      intronic chr2:149032472(+) A-I      intronic chr2:148823825(+) A-I      intronic chr2:149256637(+) A-I      intronic chr2:149256633(+) A-I      intronic chr2:148797852(+) A-I      intronic chr2:148824125(+) A-I      intronic chr2:148938186(+) A-I      intronic chr2:148798556(+) A-I      intronic chr2:149047779(+) A-I      intronic chr2:148993629(+) A-I      intronic chr2:149004147(+) A-I      intronic chr2:148877615(+) A-I      intronic chr2:148823670(+) A-I      intronic chr2:148896796(+) A-I      intronic chr2:148824119(+) A-I      intronic chr2:148884619(+) A-I      intronic chr2:148938039(+) A-I      intronic chr2:149033803(+) A-I      intronic chr2:148958164(+) A-I      intronic chr2:148894518(+) A-I      intronic chr2:149010339(+) A-I      intronic chr2:148800817(+) A-I      intronic chr2:148832214(+) A-I      intronic chr2:148798670(+) A-I      intronic chr2:149003059(+) A-I      intronic chr2:148962856(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	MBD5	chr2:149180751(+) A-I intron -    15342557 chr2:149181493(+) A-I intron -    15342557 chr2:149181523(+) A-I intron -    15342557 chr2:149181528(+) A-I intron -    15342557 chr2:149181531(+) A-I intron -    15342557 chr2:149181570(+) A-I intron -    15342557 chr2:149181575(+) A-I intron -    15342557 chr2:149181590(+) A-I intron -    15342557 chr2:149181626(+) A-I intron -    15342557 chr2:149181640(+) A-I intron -    15342557 chr2:149181699(+) A-I intron -    15342557 chr2:149181734(+) A-I intron -    15342557 chr2:148797792(+) A-I intron -    22327324 chr2:148797837(+) A-I intron -    22327324 chr2:148798631(+) A-I intron -    22327324 chr2:148962833(+) A-I intron -    22327324 chr2:148797823(+) A-I intron -    21960545 chr2:148823610(+) A-I intron -    21960545 chr2:148797788(+) A-G intron -    22484847 chr2:148797792(+) A-G intron -    22484847 chr2:148797814(+) A-G intron -    22484847 chr2:148797823(+) A-G intron -    22484847 chr2:148797837(+) A-G intron -    22484847 chr2:148797859(+) A-G intron -    22484847 chr2:148798556(+) A-G intron -    22484847 chr2:148798590(+) A-G intron -    22484847 chr2:148798617(+) A-G intron -    22484847 chr2:148798630(+) A-G intron -    22484847 chr2:148798631(+) A-G intron -    22484847 chr2:148798662(+) A-G intron -    22484847 chr2:148798663(+) A-G intron -    22484847 chr2:148798664(+) A-G intron -    22484847 chr2:148798670(+) A-G intron -    22484847 chr2:148809844(+) A-G intron -    22484847 chr2:148809873(+) A-G intron -    22484847 chr2:148810456(+) A-G intron -    22484847 chr2:148811479(+) C-T intron -    22484847 chr2:148811480(+) T-C intron -    22484847 chr2:148813010(+) A-T intron -    22484847 chr2:148813082(+) A-G intron -    22484847 chr2:148813132(+) A-G intron -    22484847 chr2:148813141(+) A-G intron -    22484847 chr2:148813183(+) A-G intron -    22484847 chr2:148817170(+) A-G intron -    22484847 chr2:148817613(+) A-G intron -    22484847 chr2:148823606(+) A-G intron -    22484847 chr2:148823665(+) A-G intron -    22484847 chr2:148823825(+) A-G intron -    22484847 chr2:148823832(+) A-G intron -    22484847 chr2:148823838(+) A-G intron -    22484847 chr2:148824081(+) A-G intron -    22484847 chr2:148824117(+) A-G intron -    22484847 chr2:148824119(+) A-G intron -    22484847 chr2:148824120(+) A-G intron -    22484847 chr2:148824125(+) A-G intron -    22484847 chr2:148824176(+) A-G intron -    22484847 chr2:148828538(+) A-G intron -    22484847 chr2:148828610(+) A-G intron -    22484847 chr2:148832214(+) A-G intron -    22484847 chr2:148837306(+) A-G intron -    22484847 chr2:148837381(+) G-A intron -    22484847 chr2:148877490(+) G-T intron -    22484847 chr2:148877586(+) A-G intron -    22484847 chr2:148884609(+) A-G intron -    22484847 chr2:148884718(+) A-G intron -    22484847 chr2:148884743(+) A-G intron -    22484847 chr2:148889034(+) A-G intron -    22484847 chr2:148889061(+) A-G intron -    22484847 chr2:148894518(+) A-G intron -    22484847 chr2:148894540(+) A-G intron -    22484847 chr2:148894605(+) A-G intron -    22484847 chr2:148895068(+) A-G intron -    22484847 chr2:148898415(+) A-G intron -    22484847 chr2:148899277(+) A-G intron -    22484847 chr2:148899392(+) A-G intron -    22484847 chr2:148916389(+) A-G intron -    22484847 chr2:148916962(+) A-G intron -    22484847 chr2:148916996(+) A-G intron -    22484847 chr2:148917098(+) A-G intron -    22484847 chr2:148917117(+) A-G intron -    22484847 chr2:148917129(+) A-G intron -    22484847 chr2:148917713(+) A-G intron -    22484847 chr2:148938039(+) A-G intron -    22484847 chr2:148938151(+) A-G intron -    22484847 chr2:148938153(+) A-G intron -    22484847 chr2:148938227(+) A-G intron -    22484847 chr2:148941687(+) T-C intron -    22484847 chr2:148955463(+) A-G intron -    22484847 chr2:148955482(+) A-G intron -    22484847 chr2:148955483(+) A-G intron -    22484847 chr2:148955605(+) A-G intron -    22484847 chr2:148958077(+) A-G intron -    22484847 chr2:148960567(+) A-G intron -    22484847 chr2:148960577(+) A-G intron -    22484847 chr2:148960623(+) A-G intron -    22484847 chr2:148962694(+) A-G intron -    22484847 chr2:148962710(+) A-G intron -    22484847 chr2:148962786(+) A-G intron -    22484847 chr2:148962856(+) A-G intron -    22484847 chr2:148962880(+) A-G intron -    22484847 chr2:148962881(+) A-G intron -    22484847 chr2:148962893(+) A-G intron -    22484847 chr2:148962906(+) A-G intron -    22484847 chr2:148963362(+) A-G intron -    22484847 chr2:148963366(+) A-G intron -    22484847 chr2:148963417(+) A-G intron -    22484847 chr2:148963636(+) A-G intron -    22484847 chr2:148963637(+) A-G intron -    22484847 chr2:148969415(+) A-G intron -    22484847 chr2:148969455(+) A-G intron -    22484847 chr2:148973190(+) A-G intron -    22484847 chr2:148973203(+) A-G intron -    22484847 chr2:148973224(+) A-G intron -    22484847 chr2:148982000(+) T-C intron -    22484847 chr2:149002716(+) A-G intron -    22484847 chr2:149002813(+) A-G intron -    22484847 chr2:149002814(+) A-G intron -    22484847 chr2:149002818(+) A-G intron -    22484847 chr2:149009847(+) A-G intron -    22484847 chr2:149009882(+) A-G intron -    22484847 chr2:149010193(+) A-G intron -    22484847 chr2:149010198(+) A-G intron -    22484847 chr2:149010222(+) A-G intron -    22484847 chr2:149010248(+) A-G intron -    22484847 chr2:149010302(+) A-G intron -    22484847 chr2:149010328(+) A-G intron -    22484847 chr2:149010333(+) A-G intron -    22484847 chr2:149010339(+) A-G intron -    22484847 chr2:149010388(+) A-G intron -    22484847 chr2:149032392(+) A-G intron -    22484847 chr2:149032472(+) A-G intron -    22484847 chr2:149032489(+) A-G intron -    22484847 chr2:149032492(+) A-G intron -    22484847 chr2:149033604(+) A-G intron -    22484847 chr2:149033612(+) A-G intron -    22484847 chr2:149036733(+) A-G intron -    22484847 chr2:149036891(+) A-G intron -    22484847 chr2:149037359(+) A-G intron -    22484847 chr2:149037360(+) A-G intron -    22484847 chr2:149037437(+) A-G intron -    22484847 chr2:149038062(+) A-G intron -    22484847 chr2:149038219(+) A-G intron -    22484847 chr2:149047666(+) A-G intron -    22484847 chr2:149047736(+) A-G intron -    22484847 chr2:149047779(+) A-G intron -    22484847 chr2:149052068(+) C-T intron -    22484847 chr2:149052069(+) A-T intron -    22484847 chr2:149052070(+) G-T intron -    22484847 chr2:149074818(+) A-G intron -    22484847 chr2:149077965(+) T-C intron -    22484847 chr2:149091323(+) A-G intron -    22484847 chr2:149091979(+) A-G intron -    22484847 chr2:149092001(+) A-G intron -    22484847 chr2:149092002(+) A-G intron -    22484847 chr2:149092027(+) A-G intron -    22484847 chr2:149092123(+) A-G intron -    22484847 chr2:149092124(+) A-G intron -    22484847 chr2:149092771(+) A-G intron -    22484847 chr2:149092772(+) A-G intron -    22484847 chr2:149093046(+) A-G intron -    22484847 chr2:149093059(+) A-G intron -    22484847 chr2:149093975(+) A-G intron -    22484847 chr2:149093979(+) A-G intron -    22484847 chr2:149094042(+) A-G intron -    22484847 chr2:149094056(+) A-G intron -    22484847 chr2:149094057(+) A-G intron -    22484847 chr2:149111186(+) A-G intron -    22484847 chr2:149111333(+) A-G intron -    22484847 chr2:149116629(+) A-G intron -    22484847 chr2:149148384(+) T-C intron -    22484847 chr2:149168030(+) A-G intron -    22484847 chr2:149178319(+) A-G intron -    22484847 chr2:149256007(+) A-G intron -    22484847 chr2:149256033(+) A-G intron -    22484847 chr2:149256091(+) A-G intron -    22484847 chr2:149256116(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	MBD5	chr2:148778606-148778607(+) m6A 5'UTR//exon       - chr2:148778896-148778897(+) m6A exon//intron       24981863 chr2:148778990-148778991(+) m6A exon//intron       24284625//24981863 chr2:148779014-148779015(+) m6A exon//intron       24284625 chr2:148779108-148779109(+) m6A exon//intron       24284625 chr2:148782594-148782595(+) m6A exon//intron       24209618//24981863 chr2:148782646-148782647(+) m6A exon//intron       - chr2:148782676-148782677(+) m6A exon//intron       - chr2:148782702-148782703(+) m6A exon//intron       - chr2:148798783-148798784(+) m6A exon//intron       24209618//24981863 chr2:148798831-148798832(+) m6A exon//intron       24209618 chr2:149215926-149215927(+) m6A 5'UTR//exon       24981863//22608085 chr2:149215938-149215939(+) m6A 5'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr2:149215976-149215977(+) m6A 5'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr2:149215987-149215988(+) m6A 5'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr2:149215994-149215995(+) m6A 5'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr2:149216021-149216022(+) m6A 5'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr2:149216086-149216087(+) m6A 5'UTR       24284625//24981863//22608085 chr2:149216169-149216170(+) m6A 5'UTR       24284625//24981863//22608085 chr2:149216181-149216182(+) m6A 5'UTR       24284625//24981863//22608085 chr2:149216225-149216226(+) m6A 5'UTR       24981863//22608085 chr2:149216318-149216319(+) m6A 5'UTR       24981863 chr2:149226066-149226067(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085 chr2:149226090-149226091(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085 chr2:149226132-149226133(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085 chr2:149226138-149226139(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085 chr2:149226232-149226233(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:149226322-149226323(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:149226394-149226395(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:149226447-149226448(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:149226504-149226505(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:149226612-149226613(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:149226626-149226627(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:149226750-149226751(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:149226853-149226854(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085 chr2:149226945-149226946(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr2:149227053-149227054(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:149227211-149227212(+) m6A CDS       24284625//24981863 chr2:149227286-149227287(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:149227359-149227360(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:149227373-149227374(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:149227491-149227492(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr2:149227524-149227525(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:149227557-149227558(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:149227563-149227564(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:149227745-149227746(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:149227763-149227764(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr2:149227805-149227806(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr2:149227886-149227887(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr2:149227988-149227989(+) m6A CDS       24284625//24981863 chr2:149228014-149228015(+) m6A CDS       24284625 chr2:149241326-149241327(+) m6A CDS//intron       24284625 chr2:149241443-149241444(+) m6A CDS//intron       - chr2:149247342-149247343(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:149247411-149247412(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:149247484-149247485(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:149247522-149247523(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:149247628-149247629(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr2:149247657-149247658(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr2:149247713-149247714(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr2:149247736-149247737(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr2:149247744-149247745(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr2:149247781-149247782(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr2:149247831-149247832(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr2:149247894-149247895(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:149247915-149247916(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:149247996-149247997(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr2:149248002-149248003(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr2:149248036-149248037(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr2:149248084-149248085(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22575960//22608085 chr2:149260025-149260026(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       22608085 chr2:149260071-149260072(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-16-1-3p	Exosome Plasma     23663360 Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
	MBD5	Chromatin K562 cells     - Cytosol K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-16-1-3p
Interactor2: MBD5

Evidence Support:

Weak-Evidence	Illumina sequencing
Prediction-Evidence	miRanda
Support Database	ViRBase

References:

PMID	32223537	Target region	None
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	Calu-3 cells	Interactor2 expression	Upregulation
Description	The miRNA-mRNA pairs with strong correlations were selected for miRNA-mRNA binding site prediction using miRanda.