Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-539-5p | ACVR2B |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0003163 | 93 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | ActR-IIB//ACTRIIB//HTX4 |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | |||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-539-5p |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | ACVR2B |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||
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DARNED | ACVR2B |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | ACVR2B |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-539-5p | ||||||||||||||||||||||||||
ACVR2B |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ncDR | hsa-miR-539-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||
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RNAInter | hsa-miR-539-5p |
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Interactor1: hsa-miR-539-5p | Interactor2: ACVR2B |
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Weak-Evidence | Illumina sequencing | |
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Prediction-Evidence | miRanda | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 32223537 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | Calu-3 cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | The miRNA-mRNA pairs with strong correlations were selected for miRNA-mRNA binding site prediction using miRanda. |