Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00098644

  Virus:  

Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa_circ_0002248 TLCD2
miRBase
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Organism Homo sapiens Homo sapiens
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RNA Modification:


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chr17:1611067-1611068(-) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//27773536//22608085
chr17:1611105-1611106(-) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//27773536//22608085
chr17:1611122-1611123(-) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//27773536//22608085
chr17:1611128-1611129(-) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//27773536//22608085
chr17:1611137-1611138(-) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//27773536//22608085
chr17:1613376-1613377(-) m6A CDS       27773536
chr17:1613414-1613415(-) m6A CDS       27773536
chr17:1613432-1613433(-) m6A CDS       27773536
chr17:1613564-1613565(-) m6A 5'UTR       27773536
chr17:1613574-1613575(-) m6A 5'UTR       27773536

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa_circ_0002248
Exosome Blood     -
TLCD2
Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa_circ_0002248
Interactor2: TLCD2

Evidence Support:


Weak-Evidence Illumina sequencing
Support Database ViRBase

References:


PMID 32223537 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line Calu-3 cells Interactor2 expression None
Description The mRNA-circRNA pairs with strong positive correlations were defined as those having r >0.7 and cP <0.05.

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