Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa_circ_0002248 | hsa-miR-539-5p |
miRBase Accession/Entrez ID |
hsa_circ_0002248 | MIMAT0003163 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | circRNA | miRNA |
Alias | - | - |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | |||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-539-5p |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||
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RNALocate | hsa_circ_0002248 |
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hsa-miR-539-5p |
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ncDR | hsa-miR-539-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||
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RNAInter | hsa-miR-539-5p |
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Interactor1: hsa_circ_0002248 | Interactor2: hsa-miR-539-5p |
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Weak-Evidence | Illumina sequencing | |
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Prediction-Evidence | miRanda | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 32223537 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | Downregulation |
Tissue or cell line | Calu-3 cells | Interactor2 expression | Upregulation |
Description | The circRNA-miRNA pairs with strong negative correlations were selected for circRNA-miRNA binding site prediction using miRanda (http://www.microrna.org/) v3.3a. |