Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00095779

  Virus:  

Human immunodeficiency virus (HIV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol LNC_004485 ST6GAL1
miRBase
Accession/Entrez ID		 LNC_004485 6480
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category lncRNA mRNA
Alias - SIAT1//ST6GalI//ST6N

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR ST6GAL1
chr3:186659622(+) A-I      intronic
chr3:186659617(+) A-I      intronic
chr3:186659613(+) A-I      intronic
chr3:186659608(+) A-I      intronic
chr3:186657064(+) A-I      intronic
chr3:186657038(+) A-I      intronic
chr3:186657002(+) A-I      intronic
chr3:186656989(+) A-I      intronic
chr3:186656924(+) A-I      intronic
chr3:186655756(+) A-I      intronic
chr3:186655685(+) A-I      intronic
chr3:186652697(+) A-I      intronic
chr3:186652682(+) A-I      intronic
chr3:186652620(+) A-I      intronic
chr3:186652236(+) A-I      intronic
chr3:186652212(+) A-I      intronic
chr3:186785881(+) A-I      intronic
chr3:186785875(+) A-I      intronic
chr3:186783040(+) A-I      intronic
chr3:186783031(+) A-I      intronic
chr3:186764924(+) A-I      intronic
chr3:186751151(+) A-I      intronic
chr3:186751079(+) A-I      intronic
chr3:186751031(+) A-I      intronic
chr3:186742011(+) A-I      intronic
chr3:186750970(+) A-I      intronic
chr3:186742084(+) A-I      intronic
chr3:186749403(+) A-I      intronic
chr3:186749304(+) A-I      intronic
chr3:186749298(+) A-I      intronic
chr3:186748322(+) A-I      intronic
chr3:186742143(+) A-I      intronic
chr3:186748291(+) A-I      intronic
chr3:186748302(+) A-I      intronic
chr3:186718270(+) A-I      intronic
chr3:186715398(+) A-I      intronic
chr3:186748347(+) A-I      intronic
chr3:186749243(+) A-I      intronic
chr3:186782887(+) A-I      intronic
chr3:186702758(+) A-I      intronic
chr3:186694318(+) A-I      intronic
chr3:186694269(+) A-I      intronic
chr3:186689062(+) A-I      intronic
chr3:186689059(+) A-I      intronic
chr3:186657144(+) A-I      intronic
chr3:186655743(+) A-I      intronic
chr3:186655740(+) A-I      intronic
chr3:186654681(+) A-I      intronic
chr3:186691632(+) A-I      intronic
chr3:186720723(+) A-I      intronic
chr3:186720741(+) A-I      intronic
chr3:186715366(+) A-I      intronic
chr3:186720637(+) A-I      intronic
chr3:186739408(+) A-I      intronic
chr3:186739532(+) A-I      intronic
chr3:186688263(+) A-I      intronic
chr3:186691594(+) A-I      intronic
chr3:186688072(+) A-I      intronic
chr3:186668922(+) A-I      intronic
chr3:186698432(+) A-I      intronic
chr3:186688202(+) A-I      intronic
chr3:186733362(+) A-I      intronic
chr3:186733354(+) A-I      intronic
chr3:186788485(+) A-I      intronic
chr3:186788473(+) A-I      intronic
chr3:186788472(+) A-I      intronic
chr3:186718295(+) A-I      intronic
chr3:186788277(+) A-I      intronic
chr3:186787027(+) A-I      intronic
chr3:186786971(+) A-I      intronic
chr3:186785967(+) A-I      intronic
chr3:186785958(+) A-I      intronic
chr3:186785953(+) A-I      intronic
chr3:186718271(+) A-I      intronic
chr3:186785951(+) A-I      intronic
chr3:186785947(+) A-I      intronic
chr3:186785927(+) A-I      intronic
chr3:186785902(+) A-I      intronic
chr3:186728887(+) A-I      intronic
chr3:186728880(+) A-I      intronic
chr3:186727699(+) A-I      intronic
chr3:186727646(+) A-I      intronic
chr3:186727643(+) A-I      intronic
chr3:186727637(+) A-I      intronic
chr3:186733370(+) A-I      intronic
chr3:186727631(+) A-I      intronic
chr3:186785971(+) A-I      intronic
chr3:186785975(+) A-I      intronic
chr3:186785977(+) A-I      intronic
chr3:186785999(+) A-I      intronic
chr3:186720695(+) A-I      intronic
chr3:186720694(+) A-I      intronic
chr3:186720688(+) A-I      intronic
chr3:186720669(+) A-I      intronic
chr3:186720643(+) A-I      intronic
chr3:186728976(+) A-I      intronic
chr3:186729034(+) A-I      intronic
chr3:186738851(+) A-I      intronic
chr3:186738881(+) A-I      intronic
chr3:186738891(+) A-I      intronic
chr3:186664309(+) A-I      intronic
chr3:186715388(+) A-I      intronic
chr3:186715386(+) A-I      intronic
chr3:186715385(+) A-I      intronic
chr3:186706551(+) A-I      intronic
chr3:186706550(+) A-I      intronic
chr3:186706537(+) A-I      intronic
chr3:186706524(+) A-I      intronic
chr3:186706518(+) A-I      intronic
chr3:186706492(+) A-I      intronic
chr3:186703491(+) A-I      intronic
chr3:186703489(+) A-I      intronic
chr3:186703465(+) A-I      intronic
chr3:186703456(+) A-I      intronic
chr3:186703406(+) A-I      intronic
chr3:186703405(+) A-I      intronic
chr3:186698452(+) A-I      intronic
chr3:186698433(+) A-I      intronic
chr3:186660751(+) A-I      intronic
chr3:186694279(+) A-I      intronic
chr3:186694282(+) A-I      intronic
chr3:186695878(+) A-I      intronic
chr3:186738952(+) A-I      intronic
chr3:186695924(+) A-I      intronic
chr3:186696013(+) A-I      intronic
chr3:186698416(+) A-I      intronic
chr3:186698442(+) A-I      intronic
chr3:186698473(+) A-I      intronic
chr3:186698478(+) A-I      intronic
chr3:186663918(+) A-I      intronic
chr3:186663591(+) A-I      intronic
chr3:186663528(+) A-I      intronic
chr3:186662849(+) A-I      intronic
chr3:186661383(+) A-I      intronic
chr3:186661312(+) A-I      intronic
chr3:186660712(+) A-I      intronic
chr3:186660652(+) A-I      intronic
chr3:186659775(+) A-I      intronic
chr3:186659623(+) A-I      intronic
chr3:186738989(+) A-I      intronic
chr3:186739011(+) A-I      intronic
chr3:186739372(+) A-I      intronic
chr3:186739381(+) A-I      intronic
chr3:186727630(+) A-I      intronic
chr3:186727606(+) A-I      intronic
chr3:186727325(+) A-I      intronic
chr3:186717462(+) A-I      intronic
chr3:186717433(+) A-I      intronic
chr3:186717396(+) A-I      intronic
chr3:186717382(+) A-I      intronic
chr3:186717317(+) A-I      intronic
chr3:186717299(+) A-I      intronic
chr3:186717231(+) A-I      intronic
chr3:186715806(+) A-I      intronic
chr3:186715520(+) A-I      intronic
chr3:186715452(+) A-I      intronic
chr3:186715414(+) A-I      intronic
chr3:186700569(+) A-I      intronic
chr3:186700595(+) A-I      intronic
chr3:186700650(+) A-I      intronic
chr3:186700653(+) A-I      intronic
chr3:186700670(+) A-I      intronic
chr3:186715395(+) A-I      intronic
chr3:186700679(+) A-I      intronic
chr3:186706436(+) A-I      intronic
chr3:186706520(+) A-I      intronic
chr3:186706525(+) A-I      intronic
chr3:186706531(+) A-I      intronic
chr3:186706604(+) A-I      intronic
chr3:186707891(+) A-I      intronic
chr3:186708024(+) A-I      intronic
chr3:186708510(+) A-I      intronic
chr3:186708529(+) A-I      intronic
chr3:186708553(+) A-I      intronic
chr3:186708558(+) A-I      intronic
chr3:186712684(+) A-I      intronic
chr3:186713446(+) A-I      intronic
chr3:186713461(+) A-I      intronic
chr3:186783593(+) A-I      intronic
chr3:186713467(+) A-I      intronic
chr3:186713470(+) A-I      intronic
chr3:186713521(+) A-I      intronic
chr3:186783585(+) A-I      intronic
chr3:186713564(+) A-I      intronic
chr3:186715334(+) A-I      intronic
chr3:186703452(+) A-I      intronic
chr3:186756133(+) A-I      intronic
chr3:186660671(+) A-I      intronic
chr3:186713147(+) A-I      intronic
chr3:186748321(+) A-I      intronic
chr3:186656992(+) A-I      intronic
chr3:186664026(+) A-I      intronic
chr3:186707896(+) A-I      intronic
chr3:186738935(+) A-I      intronic
chr3:186703442(+) A-I      intronic
chr3:186727402(+) A-I      intronic
chr3:186785973(+) A-I      intronic
chr3:186733467(+) A-I      intronic
chr3:186749358(+) A-I      intronic
chr3:186789360(+) A-I      intronic
chr3:186663541(+) A-I      intronic
chr3:186789350(+) A-I      intronic
chr3:186731490(+) A-I      intronic
chr3:186739024(+) A-I      intronic
chr3:186690218(+) A-I      intronic
chr3:186739033(+) A-I      intronic
chr3:186662962(+) A-I      intronic
chr3:186694423(+) A-I      intronic
chr3:186733480(+) A-I      intronic
chr3:186698484(+) A-I      intronic
chr3:186715411(+) A-I      intronic
chr3:186668962(+) A-I      intronic
chr3:186728967(+) A-I      intronic
chr3:186776697(+) A-I      intronic
chr3:186730146(+) A-I      intronic
chr3:186688096(+) A-I      intronic
chr3:186657124(+) A-I      intronic
chr3:186727772(+) A-I      intronic
chr3:186708521(+) A-I      intronic
chr3:186694344(+) A-I      intronic
chr3:186663943(+) A-I      intronic
chr3:186715418(+) A-I      intronic
chr3:186713134(+) A-I      intronic
chr3:186751040(+) A-I      intronic
chr3:186708513(+) A-I      intronic
chr3:186660676(+) A-I      intronic
chr3:186733516(+) A-I      intronic
chr3:186688273(+) A-I      intronic
chr3:186742155(+) A-I      intronic
chr3:186718151(+) A-I      intronic
chr3:186652761(+) A-I      intronic
chr3:186661510(+) A-I      intronic
chr3:186662829(+) A-I      intronic
chr3:186712609(+) A-I      intronic
chr3:186789282(+) A-I      intronic
chr3:186662897(+) A-I      intronic
chr3:186706445(+) A-I      intronic
chr3:186661377(+) A-I      intronic
chr3:186676653(+) A-I      intronic
chr3:186676650(+) A-I      intronic
chr3:186715358(+) A-I      intronic
chr3:186694438(+) A-I      intronic
chr3:186708533(+) A-I      intronic
chr3:186698347(+) A-I      intronic
chr3:186698381(+) A-I      intronic
chr3:186748241(+) A-I      intronic
chr3:186703460(+) A-I      intronic
chr3:186700491(+) A-I      intronic
chr3:186728961(+) A-I      intronic
chr3:186739273(+) A-I      intronic
chr3:186749406(+) A-I      intronic
chr3:186715365(+) A-I      intronic
chr3:186655851(+) A-I      intronic
chr3:186739363(+) A-I      intronic
chr3:186662975(+) A-I      intronic
chr3:186712654(+) A-I      intronic
chr3:186698310(+) A-I      intronic
chr3:186660681(+) A-I      intronic
chr3:186712499(+) A-I      intronic
chr3:186698420(+) A-I      intronic
chr3:186652070(+) A-I      intronic
chr3:186751090(+) A-I      intronic
chr3:186715438(+) A-I      intronic
chr3:186707915(+) A-I      intronic
chr3:186733506(+) A-I      intronic
chr3:186703392(+) A-I      intronic
chr3:186662900(+) A-I      intronic
chr3:186652740(+) A-I      intronic
chr3:186717697(+) A-I      intronic
chr3:186728904(+) A-I      intronic
chr3:186741982(+) A-I      intronic
chr3:186718299(+) A-I      intronic
chr3:186698337(+) A-I      intronic
chr3:186739441(+) A-I      intronic
chr3:186708011(+) A-I      intronic
chr3:186749323(+) A-I      intronic
chr3:186749357(+) A-I      intronic
chr3:186727309(+) A-I      intronic
chr3:186715788(+) A-I      intronic
chr3:186715490(+) A-I      intronic
chr3:186700744(+) A-I      intronic
chr3:186727633(+) A-I      intronic
chr3:186738809(+) A-I      intronic
chr3:186659643(+) A-I      intronic
chr3:186654680(+) A-I      intronic
chr3:186688272(+) A-I      intronic
chr3:186713577(+) A-I      intronic
chr3:186664295(+) A-I      intronic
chr3:186727632(+) A-I      intronic
chr3:186749353(+) A-I      intronic
chr3:186652736(+) A-I      intronic
chr3:186659679(+) A-I      intronic
chr3:186730175(+) A-I      intronic
chr3:186787062(+) A-I      intronic
chr3:186738869(+) A-I      intronic
chr3:186660753(+) A-I      intronic
chr3:186663685(+) A-I      intronic
chr3:186746730(+) A-I      intronic
chr3:186788313(+) A-I      intronic
chr3:186739479(+) A-I      intronic
chr3:186717245(+) A-I      intronic
chr3:186717404(+) A-I      intronic
chr3:186663626(+) A-I      intronic
chr3:186703483(+) A-I      intronic
chr3:186685257(+) A-I      intronic
chr3:186702716(+) A-I      intronic
chr3:186715295(+) A-I      intronic
chr3:186785876(+) A-I      intronic
chr3:186739022(+) A-I      intronic
chr3:186707948(+) A-I      intronic
chr3:186748351(+) A-I      intronic
chr3:186657049(+) A-I      intronic
chr3:186748229(+) A-I      intronic
chr3:186662925(+) A-I      intronic
chr3:186738792(+) A-I      intronic
chr3:186695776(+) A-I      intronic
chr3:186668961(+) A-I      intronic
chr3:186717458(+) A-I      intronic
chr3:186717654(+) A-I      intronic
chr3:186652204(+) A-I      intronic
chr3:186664007(+) A-I      intronic
chr3:186731512(+) A-I      intronic
chr3:186663520(+) A-I      intronic
chr3:186652071(+) A-I      intronic
chr3:186756181(+) A-I      intronic
chr3:186785976(+) A-I      intronic
chr3:186663624(+) A-I      intronic
chr3:186727536(+) A-I      intronic
chr3:186708504(+) A-I      intronic
chr3:186739366(+) A-I      intronic
chr3:186733379(+) A-I      intronic
chr3:186739256(+) A-I      intronic
chr3:186678903(+) A-I      intronic
chr3:186661367(+) A-I      intronic
chr3:186661259(+) A-I      intronic
chr3:186703440(+) A-I      intronic
chr3:186750977(+) A-I      intronic
chr3:186739352(+) A-I      intronic
chr3:186660656(+) A-I      intronic
chr3:186660640(+) A-I      intronic
chr3:186718239(+) A-I      intronic
chr3:186731396(+) A-I      intronic
chr3:186730185(+) A-I      intronic
chr3:186663519(+) A-I      intronic
chr3:186684999(+) A-I      intronic
chr3:186718300(+) A-I      intronic
chr3:186782988(+) A-I      intronic
chr3:186656957(+) A-I      intronic
chr3:186738917(+) A-I      intronic
chr3:186706628(+) A-I      intronic
chr3:186688218(+) A-I      intronic
chr3:186731535(+) A-I      intronic
chr3:186707902(+) A-I      intronic
chr3:186660711(+) A-I      intronic
chr3:186750924(+) A-I      intronic
chr3:186700526(+) A-I      intronic
chr3:186727635(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED ST6GAL1
chr3:186690448(+) A-I intron -    22327324
chr3:186691589(+) A-I intron -    22327324
chr3:186715365(+) A-I intron -    22327324
chr3:186715411(+) A-I intron -    22327324
chr3:186717652(+) A-I intron -    22327324
chr3:186717654(+) A-I intron -    22327324
chr3:186718299(+) A-I intron -    22327324
chr3:186720581(+) A-I intron -    22327324
chr3:186720585(+) A-I intron -    22327324
chr3:186720613(+) A-I intron -    22327324
chr3:186720634(+) A-I intron -    22327324
chr3:186720652(+) A-I intron -    22327324
chr3:186720655(+) A-I intron -    22327324
chr3:186720670(+) A-I intron -    22327324
chr3:186720672(+) A-I intron -    22327324
chr3:186720682(+) A-I intron -    22327324
chr3:186720685(+) A-I intron -    22327324
chr3:186720689(+) A-I intron -    22327324
chr3:186721435(+) A-I intron -    22327324
chr3:186721438(+) A-I intron -    22327324
chr3:186721443(+) A-I intron -    22327324
chr3:186746763(+) A-I intron -    22327324
chr3:186721339(+) A-I intron -    21960545
chr3:186690448(+) A-G intron -    22484847
chr3:186690474(+) A-G intron -    22484847
chr3:186690475(+) A-G intron -    22484847
chr3:186690476(+) A-G intron -    22484847
chr3:186690478(+) A-G intron -    22484847
chr3:186691648(+) A-G intron -    22484847
chr3:186721435(+) A-G intron -    22484847
chr3:186721438(+) A-G intron -    22484847
chr3:186721443(+) A-G intron -    22484847
chr3:186652132(+) A-G intron -    22484847
chr3:186652204(+) A-G intron -    22484847
chr3:186655676(+) A-G intron -    22484847
chr3:186656957(+) A-G intron -    22484847
chr3:186656992(+) A-G intron -    22484847
chr3:186660656(+) A-G intron -    22484847
chr3:186660671(+) A-G intron -    22484847
chr3:186660734(+) A-G intron -    22484847
chr3:186660753(+) A-G intron -    22484847
chr3:186662829(+) A-G intron -    22484847
chr3:186662897(+) A-G intron -    22484847
chr3:186663519(+) A-G intron -    22484847
chr3:186663658(+) A-G intron -    22484847
chr3:186663685(+) A-G intron -    22484847
chr3:186663903(+) A-G intron -    22484847
chr3:186684999(+) A-G intron -    22484847
chr3:186688003(+) C-T intron -    22484847
chr3:186688096(+) A-G intron -    22484847
chr3:186688218(+) A-G intron -    22484847
chr3:186688970(+) G-A intron -    22484847
chr3:186694423(+) A-G intron -    22484847
chr3:186694438(+) A-G intron -    22484847
chr3:186694473(+) T-C intron -    22484847
chr3:186698337(+) A-G intron -    22484847
chr3:186698484(+) A-G intron -    22484847
chr3:186700526(+) A-G intron -    22484847
chr3:186700570(+) A-G intron -    22484847
chr3:186706594(+) A-G intron -    22484847
chr3:186706628(+) A-G intron -    22484847
chr3:186707896(+) A-G intron -    22484847
chr3:186707901(+) A-G intron -    22484847
chr3:186707902(+) A-G intron -    22484847
chr3:186707915(+) A-G intron -    22484847
chr3:186707948(+) A-G intron -    22484847
chr3:186708011(+) A-G intron -    22484847
chr3:186708504(+) A-G intron -    22484847
chr3:186708513(+) A-G intron -    22484847
chr3:186708533(+) A-G intron -    22484847
chr3:186708535(+) A-G intron -    22484847
chr3:186712484(+) A-G intron -    22484847
chr3:186712609(+) A-G intron -    22484847
chr3:186712654(+) A-G intron -    22484847
chr3:186713134(+) A-G intron -    22484847
chr3:186713147(+) A-G intron -    22484847
chr3:186715358(+) A-G intron -    22484847
chr3:186715362(+) A-G intron -    22484847
chr3:186715365(+) A-G intron -    22484847
chr3:186715411(+) A-G intron -    22484847
chr3:186715424(+) A-G intron -    22484847
chr3:186715788(+) A-G intron -    22484847
chr3:186715797(+) A-G intron -    22484847
chr3:186717245(+) A-G intron -    22484847
chr3:186717339(+) A-G intron -    22484847
chr3:186717341(+) A-G intron -    22484847
chr3:186717379(+) A-G intron -    22484847
chr3:186717404(+) A-G intron -    22484847
chr3:186717652(+) A-G intron -    22484847
chr3:186717654(+) A-G intron -    22484847
chr3:186718151(+) A-G intron -    22484847
chr3:186718299(+) A-G intron -    22484847
chr3:186718300(+) A-G intron -    22484847
chr3:186727340(+) A-G intron -    22484847
chr3:186727536(+) A-G intron -    22484847
chr3:186727633(+) A-G intron -    22484847
chr3:186727635(+) A-G intron -    22484847
chr3:186727693(+) C-T intron -    22484847
chr3:186728904(+) A-G intron -    22484847
chr3:186728961(+) A-G intron -    22484847
chr3:186728967(+) A-G intron -    22484847
chr3:186728970(+) A-G intron -    22484847
chr3:186730146(+) A-G intron -    22484847
chr3:186730175(+) A-G intron -    22484847
chr3:186730185(+) A-G intron -    22484847
chr3:186731396(+) A-G intron -    22484847
chr3:186731490(+) A-G intron -    22484847
chr3:186731535(+) A-G intron -    22484847
chr3:186733371(+) A-G intron -    22484847
chr3:186733379(+) A-G intron -    22484847
chr3:186733506(+) A-G intron -    22484847
chr3:186738104(+) A-C intron -    22484847
chr3:186738792(+) A-G intron -    22484847
chr3:186738809(+) A-G intron -    22484847
chr3:186738852(+) A-G intron -    22484847
chr3:186738869(+) A-G intron -    22484847
chr3:186738917(+) A-G intron -    22484847
chr3:186738935(+) A-G intron -    22484847
chr3:186739256(+) A-G intron -    22484847
chr3:186739272(+) A-G intron -    22484847
chr3:186739273(+) A-G intron -    22484847
chr3:186739352(+) A-G intron -    22484847
chr3:186739363(+) A-G intron -    22484847
chr3:186739366(+) A-G intron -    22484847
chr3:186739434(+) A-G intron -    22484847
chr3:186739479(+) A-G intron -    22484847
chr3:186741982(+) A-G intron -    22484847
chr3:186742023(+) A-G intron -    22484847
chr3:186742155(+) A-G intron -    22484847
chr3:186746730(+) A-G intron -    22484847
chr3:186746763(+) A-G intron -    22484847
chr3:186746820(+) A-G intron -    22484847
chr3:186748229(+) A-G intron -    22484847
chr3:186748241(+) A-G intron -    22484847
chr3:186748245(+) A-G intron -    22484847
chr3:186748286(+) A-G intron -    22484847
chr3:186748321(+) A-G intron -    22484847
chr3:186748351(+) A-G intron -    22484847
chr3:186749323(+) A-G intron -    22484847
chr3:186749324(+) A-G intron -    22484847
chr3:186749353(+) A-G intron -    22484847
chr3:186749354(+) A-G intron -    22484847
chr3:186749357(+) A-G intron -    22484847
chr3:186749358(+) A-G intron -    22484847
chr3:186749406(+) A-G intron -    22484847
chr3:186749475(+) A-G intron -    22484847
chr3:186750924(+) A-G intron -    22484847
chr3:186750977(+) A-G intron -    22484847
chr3:186756007(+) C-T intron -    22484847
chr3:186776447(+) T-G intron -    22484847
chr3:186776697(+) A-G intron -    22484847
chr3:186782906(+) T-C intron -    22484847
chr3:186782988(+) A-G intron -    22484847
chr3:186783031(+) A-C intron -    22484847
chr3:186785876(+) A-G intron -    22484847
chr3:186785882(+) A-G intron -    22484847
chr3:186788313(+) A-G intron -    22484847
chr3:186690517(+) A-G intron -    22484847
chr3:186691608(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase ST6GAL1
chr3:186681656-186681657(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625
chr3:186760614-186760615(+) m6A CDS//intron       24284625
chr3:186760699-186760700(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr3:186760719-186760720(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr3:186760754-186760755(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr3:186760780-186760781(+) m6A CDS//intron       24284625//25456834//24981863//22608085
chr3:186760786-186760787(+) m6A CDS//intron       24284625//25456834//24981863//22608085
chr3:186760801-186760802(+) m6A CDS//intron       24284625//25456834//24981863//22608085
chr3:186760849-186760850(+) m6A CDS//intron       24284625//25456834//24981863//22608085
chr3:186760880-186760881(+) m6A CDS//intron       24284625//25456834//24981863//22608085
chr3:186760927-186760928(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085
chr3:186761016-186761017(+) m6A CDS//exon//intron       -
chr3:186790667-186790668(+) m6A CDS//exon       27773535
chr3:186790703-186790704(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535
chr3:186791236-186791237(+) m6A exon//intron       27773535
chr3:186791438-186791439(+) m6A exon//intron       -
chr3:186793417-186793418(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625
chr3:186793535-186793536(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186793576-186793577(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186793661-186793662(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186793673-186793674(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186793719-186793720(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186793728-186793729(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186793779-186793780(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186793841-186793842(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//22608085
chr3:186794397-186794398(+) m6A 3'UTR//exon       -
chr3:186795530-186795531(+) m6A 3'UTR//exon       24284625
chr3:186795630-186795631(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186795651-186795652(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186795662-186795663(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186795679-186795680(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186795689-186795690(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186795777-186795778(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186795902-186795903(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186795922-186795923(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085
chr3:186796011-186796012(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//27773535
chr3:186796038-186796039(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//27773535
chr3:186796196-186796197(+) m6A 3'UTR//exon       27773535
chr3:186796268-186796269(+) m6A 3'UTR//exon       27773535

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate ST6GAL1
Chromatin K562 cells     -
Cytosol K562 cells     -
Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: LNC_004485
Interactor2: ST6GAL1

Evidence Support:


Weak-Evidence RNA-Seq
Support Database ViRBase

References:


PMID 32341894 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line CD4 T cells Interactor2 expression None
Description Based on previous DE analysis, 1109 DE lncRNAs targeting DE mRNAs were identified In all correlations (Table S6).

Starting a new search, please wait ...