Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00095607

  Virus:  

Human immunodeficiency virus (HIV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol LNC_002351 DTNB
miRBase
Accession/Entrez ID		 LNC_002351 1838
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category lncRNA mRNA
Alias - -

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR DTNB
chr2:25651475(-) A-I      intronic
chr2:25651480(-) A-I      intronic
chr2:25651495(-) A-I      intronic
chr2:25651503(-) A-I      intronic
chr2:25651505(-) A-I      intronic
chr2:25803268(-) A-I      intronic
chr2:25803327(-) A-I      intronic
chr2:25833626(-) A-I      intronic
chr2:25833639(-) A-I      intronic
chr2:25833641(-) A-I      intronic
chr2:25833644(-) A-I      intronic
chr2:25833646(-) A-I      intronic
chr2:25833647(-) A-I      intronic
chr2:25833651(-) A-I      intronic
chr2:25833657(-) A-I      intronic
chr2:25833661(-) A-I      intronic
chr2:25833670(-) A-I      intronic
chr2:25833671(-) A-I      intronic
chr2:25850847(-) A-I      intronic
chr2:25850855(-) A-I      intronic
chr2:25704064(-) A-I      intronic
chr2:25704198(-) A-I      intronic
chr2:25850878(-) A-I      intronic
chr2:25638310(-) A-I      intronic
chr2:25645448(-) A-I      intronic
chr2:25645450(-) A-I      intronic
chr2:25622275(-) A-I      intronic
chr2:25622281(-) A-I      intronic
chr2:25622305(-) A-I      intronic
chr2:25622310(-) A-I      intronic
chr2:25638289(-) A-I      intronic
chr2:25638298(-) A-I      intronic
chr2:25638304(-) A-I      intronic
chr2:25645413(-) A-I      intronic
chr2:25645415(-) A-I      intronic
chr2:25645435(-) A-I      intronic
chr2:25645454(-) A-I      intronic
chr2:25867408(-) A-I      intronic
chr2:25812310(-) A-I      intronic
chr2:25803308(-) A-I      intronic
chr2:25803303(-) A-I      intronic
chr2:25803295(-) A-I      intronic
chr2:25822719(-) A-I      intronic
chr2:25822818(-) A-I      intronic
chr2:25822839(-) A-I      intronic
chr2:25832420(-) A-I      intronic
chr2:25803235(-) A-I      intronic
chr2:25832462(-) A-I      intronic
chr2:25834670(-) A-I      intronic
chr2:25834677(-) A-I      intronic
chr2:25803055(-) A-I      intronic
chr2:25803054(-) A-I      intronic
chr2:25803047(-) A-I      intronic
chr2:25802926(-) A-I      intronic
chr2:25799369(-) A-I      intronic
chr2:25799298(-) A-I      intronic
chr2:25799243(-) A-I      intronic
chr2:25799233(-) A-I      intronic
chr2:25795188(-) A-I      intronic
chr2:25795187(-) A-I      intronic
chr2:25795172(-) A-I      intronic
chr2:25793217(-) A-I      intronic
chr2:25787474(-) A-I      intronic
chr2:25787339(-) A-I      intronic
chr2:25834681(-) A-I      intronic
chr2:25850099(-) A-I      intronic
chr2:25867522(-) A-I      intronic
chr2:25867532(-) A-I      intronic
chr2:25869115(-) A-I      intronic
chr2:25872043(-) A-I      intronic
chr2:25786882(-) A-I      intronic
chr2:25626061(-) A-I      intronic
chr2:25622482(-) A-I      intronic
chr2:25622029(-) A-I      intronic
chr2:25620705(-) A-I      intronic
chr2:25620686(-) A-I      intronic
chr2:25620680(-) A-I      intronic
chr2:25613580(-) A-I      intronic
chr2:25613477(-) A-I      intronic
chr2:25611895(-) A-I      intronic
chr2:25611892(-) A-I      intronic
chr2:25785799(-) A-I      intronic
chr2:25611890(-) A-I      intronic
chr2:25611751(-) A-I      intronic
chr2:25872045(-) A-I      intronic
chr2:25626077(-) A-I      intronic
chr2:25626790(-) A-I      intronic
chr2:25880943(-) A-I      intronic
chr2:25773794(-) A-I      intronic
chr2:25773786(-) A-I      intronic
chr2:25772622(-) A-I      intronic
chr2:25768655(-) A-I      intronic
chr2:25761158(-) A-I      intronic
chr2:25746973(-) A-I      intronic
chr2:25746947(-) A-I      intronic
chr2:25872046(-) A-I      intronic
chr2:25746417(-) A-I      intronic
chr2:25746304(-) A-I      intronic
chr2:25880938(-) A-I      intronic
chr2:25626082(-) A-I      intronic
chr2:25746291(-) A-I      intronic
chr2:25739676(-) A-I      intronic
chr2:25738634(-) A-I      intronic
chr2:25724347(-) A-I      intronic
chr2:25626244(-) A-I      intronic
chr2:25626252(-) A-I      intronic
chr2:25719665(-) A-I      intronic
chr2:25719650(-) A-I      intronic
chr2:25719649(-) A-I      intronic
chr2:25718223(-) A-I      intronic
chr2:25718199(-) A-I      intronic
chr2:25626782(-) A-I      intronic
chr2:25627489(-) A-I      intronic
chr2:25627512(-) A-I      intronic
chr2:25718046(-) A-I      intronic
chr2:25718045(-) A-I      intronic
chr2:25718011(-) A-I      intronic
chr2:25627541(-) A-I      intronic
chr2:25627544(-) A-I      intronic
chr2:25822444(-) A-I      intronic
chr2:25822245(-) A-I      intronic
chr2:25822447(-) A-I      intronic
chr2:25820143(-) A-I      intronic
chr2:25812335(-) A-I      intronic
chr2:25627641(-) A-I      intronic
chr2:25627642(-) A-I      intronic
chr2:25627648(-) A-I      intronic
chr2:25628166(-) A-I      intronic
chr2:25688041(-) A-I      intronic
chr2:25637218(-) A-I      intronic
chr2:25637293(-) A-I      intronic
chr2:25637303(-) A-I      intronic
chr2:25637318(-) A-I      intronic
chr2:25637357(-) A-I      intronic
chr2:25637364(-) A-I      intronic
chr2:25637373(-) A-I      intronic
chr2:25637374(-) A-I      intronic
chr2:25638317(-) A-I      intronic
chr2:25718003(-) A-I      intronic
chr2:25704049(-) A-I      intronic
chr2:25704032(-) A-I      intronic
chr2:25688193(-) A-I      intronic
chr2:25688133(-) A-I      intronic
chr2:25688123(-) A-I      intronic
chr2:25641351(-) A-I      intronic
chr2:25641411(-) A-I      intronic
chr2:25679656(-) A-I      intronic
chr2:25688018(-) A-I      intronic
chr2:25688027(-) A-I      intronic
chr2:25850110(-) A-I      intronic
chr2:25867362(-) A-I      intronic
chr2:25746938(-) A-I      intronic
chr2:25725585(-) A-I      intronic
chr2:25645533(-) A-I      intronic
chr2:25811332(-) A-I      intronic
chr2:25673917(-) A-I      intronic
chr2:25750226(-) A-I      intronic
chr2:25724810(-) A-I      intronic
chr2:25769714(-) A-I      intronic
chr2:25637237(-) A-I      intronic
chr2:25790845(-) A-I      intronic
chr2:25722897(-) A-I      intronic
chr2:25690316(-) A-I      intronic
chr2:25627558(-) A-I      intronic
chr2:25627905(-) A-I      intronic
chr2:25626015(-) A-I      intronic
chr2:25865317(-) A-I      intronic
chr2:25690392(-) A-I      intronic
chr2:25638184(-) A-I      intronic
chr2:25613385(-) A-I      intronic
chr2:25662151(-) A-I      intronic
chr2:25627834(-) A-I      intronic
chr2:25626257(-) A-I      intronic
chr2:25622273(-) A-I      intronic
chr2:25657957(-) A-I      intronic
chr2:25628165(-) A-I      intronic
chr2:25795952(-) A-I      intronic
chr2:25638128(-) A-I      intronic
chr2:25739401(-) A-I      intronic
chr2:25673776(-) A-I      intronic
chr2:25643602(-) A-I      intronic
chr2:25631173(-) A-I      intronic
chr2:25827599(-) A-I      intronic
chr2:25634065(-) A-I      intronic
chr2:25734312(-) A-I      intronic
chr2:25786999(-) A-I      intronic
chr2:25639472(-) A-I      intronic
chr2:25876518(-) A-I      intronic
chr2:25614029(-) A-I      intronic
chr2:25745843(-) A-I      intronic
chr2:25651484(-) A-I      intronic
chr2:25639435(-) A-I      intronic
chr2:25622003(-) A-I      intronic
chr2:25802989(-) A-I      intronic
chr2:25651424(-) A-I      intronic
chr2:25637264(-) A-I      intronic
chr2:25619162(-) A-I      intronic
chr2:25615021(-) A-I      intronic
chr2:25671534(-) A-I      intronic
chr2:25641313(-) A-I      intronic
chr2:25718002(-) A-I      intronic
chr2:25811373(-) A-I      intronic
chr2:25796020(-) A-I      intronic
chr2:25620492(-) A-I      intronic
chr2:25783098(-) A-I      intronic
chr2:25619297(-) A-I      intronic
chr2:25769914(-) A-I      intronic
chr2:25628043(-) A-I      intronic
chr2:25628064(-) A-I      intronic
chr2:25627968(-) A-I      intronic
chr2:25724867(-) A-I      intronic
chr2:25628253(-) A-I      intronic
chr2:25778702(-) A-I      intronic
chr2:25628301(-) A-I      intronic
chr2:25628070(-) A-I      intronic
chr2:25671639(-) A-I      intronic
chr2:25628261(-) A-I      intronic
chr2:25626700(-) A-I      intronic
chr2:25628167(-) A-I      intronic
chr2:25613381(-) A-I      intronic
chr2:25759709(-) A-I      intronic
chr2:25628333(-) A-I      intronic
chr2:25628175(-) A-I      intronic
chr2:25628052(-) A-I      intronic
chr2:25628371(-) A-I      intronic
chr2:25638227(-) A-I      intronic
chr2:25627975(-) A-I      intronic
chr2:25628310(-) A-I      intronic
chr2:25639533(-) A-I      intronic
chr2:25715659(-) A-I      intronic
chr2:25638254(-) A-I      intronic
chr2:25724271(-) A-I      intronic
chr2:25850244(-) A-I      intronic
chr2:25607863(-) A-I      intronic
chr2:25628328(-) A-I      intronic
chr2:25690260(-) A-I      intronic
chr2:25627993(-) A-I      intronic
chr2:25628055(-) A-I      intronic
chr2:25742035(-) A-I      intronic
chr2:25628346(-) A-I      intronic
chr2:25627985(-) A-I      intronic
chr2:25628230(-) A-I      intronic
chr2:25722903(-) A-I      intronic
chr2:25628327(-) A-I      intronic
chr2:25627992(-) A-I      intronic
chr2:25822923(-) A-I      intronic
chr2:25627976(-) A-I      intronic
chr2:25627957(-) A-I      intronic
chr2:25777922(-) A-I      intronic
chr2:25628069(-) A-I      intronic
chr2:25628266(-) A-I      intronic
chr2:25671671(-) A-I      intronic
chr2:25627473(-) A-I      intronic
chr2:25638121(-) A-I      intronic
chr2:25639499(-) A-I      intronic
chr2:25734457(-) A-I      intronic
chr2:25867381(-) A-I      intronic
chr2:25853650(-) A-I      intronic
chr2:25770321(-) A-I      intronic
chr2:25613595(-) A-I      intronic
chr2:25746394(-) A-I      intronic
chr2:25615033(-) A-I      intronic
chr2:25638248(-) A-I      intronic
chr2:25680831(-) A-I      intronic
chr2:25868503(-) A-I      intronic
chr2:25690265(-) A-I      intronic
chr2:25722927(-) A-I      intronic
chr2:25611794(-) A-I      intronic
chr2:25651478(-) A-I      intronic
chr2:25645542(-) A-I      intronic
chr2:25638283(-) A-I      intronic
chr2:25712900(-) A-I      intronic
chr2:25643509(-) A-I      intronic
chr2:25770259(-) A-I      intronic
chr2:25619328(-) A-I      intronic
chr2:25742117(-) A-I      intronic
chr2:25627974(-) A-I      intronic
chr2:25626764(-) A-I      intronic
chr2:25639423(-) A-I      intronic
chr2:25673762(-) A-I      intronic
chr2:25782974(-) A-I      intronic
chr2:25658063(-) A-I      intronic
chr2:25682747(-) A-I      intronic
chr2:25638188(-) A-I      intronic
chr2:25641491(-) A-I      intronic
chr2:25824953(-) A-I      intronic
chr2:25803029(-) A-I      intronic
chr2:25613365(-) A-I      intronic
chr2:25704011(-) A-I      intronic
chr2:25681877(-) A-I      intronic
chr2:25796087(-) A-I      intronic
chr2:25709434(-) A-I      intronic
chr2:25724234(-) A-I      intronic
chr2:25863522(-) A-I      intronic
chr2:25844398(-) A-I      intronic
chr2:25622442(-) A-I      intronic
chr2:25761459(-) A-I      intronic
chr2:25796088(-) A-I      intronic
chr2:25638181(-) A-I      intronic
chr2:25641335(-) A-I      intronic
chr2:25622386(-) A-I      intronic
chr2:25824929(-) A-I      intronic
chr2:25772645(-) A-I      intronic
chr2:25643445(-) A-I      intronic
chr2:25761007(-) A-I      intronic
chr2:25627561(-) A-I      intronic
chr2:25863812(-) A-I      intronic
chr2:25759882(-) A-I      intronic
chr2:25822855(-) A-I      intronic
chr2:25694464(-) A-I      intronic
chr2:25690240(-) A-I      intronic
chr2:25682810(-) A-I      intronic
chr2:25868486(-) A-I      intronic
chr2:25704099(-) A-I      intronic
chr2:25639448(-) A-I      intronic
chr2:25745707(-) A-I      intronic
chr2:25622455(-) A-I      intronic
chr2:25613373(-) A-I      intronic
chr2:25872354(-) A-I      intronic
chr2:25863534(-) A-I      intronic
chr2:25627979(-) A-I      intronic
chr2:25615243(-) A-I      intronic
chr2:25868449(-) A-I      intronic
chr2:25770261(-) A-I      intronic
chr2:25622229(-) A-I      intronic
chr2:25631296(-) A-I      intronic
chr2:25637307(-) A-I      intronic
chr2:25876477(-) A-I      intronic
chr2:25643423(-) A-I      intronic
chr2:25850834(-) A-I      intronic
chr2:25629282(-) A-I      intronic
chr2:25637254(-) A-I      intronic
chr2:25769913(-) A-I      intronic
chr2:25671716(-) A-I      intronic
chr2:25611854(-) A-I      intronic
chr2:25613451(-) A-I      intronic
chr2:25658162(-) A-I      intronic
chr2:25772712(-) A-I      intronic
chr2:25790905(-) A-I      intronic
chr2:25622144(-) A-I      intronic
chr2:25643603(-) A-I      intronic
chr2:25613517(-) A-I      intronic
chr2:25689202(-) A-I      intronic
chr2:25876489(-) A-I      intronic
chr2:25643481(-) A-I      intronic
chr2:25639392(-) A-I      intronic
chr2:25854916(-) A-I      intronic
chr2:25785832(-) A-I      intronic
chr2:25724464(-) A-I      intronic
chr2:25744350(-) A-I      intronic
chr2:25658027(-) A-I      intronic
chr2:25787388(-) A-I      intronic
chr2:25724387(-) A-I      intronic
chr2:25721837(-) A-I      intronic
chr2:25864854(-) A-I      intronic
chr2:25785776(-) A-I      intronic
chr2:25863531(-) A-I      intronic
chr2:25619232(-) A-I      intronic
chr2:25749438(-) A-I      intronic
chr2:25638284(-) A-I      intronic
chr2:25629471(-) A-I      intronic
chr2:25628072(-) A-I      intronic
chr2:25628247(-) A-I      intronic
chr2:25634045(-) A-I      intronic
chr2:25845084(-) A-I      intronic
chr2:25704101(-) A-I      intronic
chr2:25844476(-) A-I      intronic
chr2:25690205(-) A-I      intronic
chr2:25613405(-) A-I      intronic
chr2:25725563(-) A-I      intronic
chr2:25626274(-) A-I      intronic
chr2:25626697(-) A-I      intronic
chr2:25867430(-) A-I      intronic
chr2:25806585(-) A-I      intronic
chr2:25845231(-) A-I      intronic
chr2:25788326(-) A-I      intronic
chr2:25637288(-) A-I      intronic
chr2:25638168(-) A-I      intronic
chr2:25638309(-) A-I      intronic
chr2:25845150(-) A-I      intronic
chr2:25788179(-) A-I      intronic
chr2:25800621(-) A-I      intronic
chr2:25638178(-) A-I      intronic
chr2:25673812(-) A-I      intronic
chr2:25638319(-) A-I      intronic
chr2:25845223(-) A-I      intronic
chr2:25770298(-) A-I      intronic
chr2:25795927(-) A-I      intronic
chr2:25745748(-) A-I      intronic
chr2:25662150(-) A-I      intronic
chr2:25639411(-) A-I      intronic
chr2:25721585(-) A-I      intronic
chr2:25690462(-) A-I      intronic
chr2:25724365(-) A-I      intronic
chr2:25806584(-) A-I      intronic
chr2:25634176(-) A-I      intronic
chr2:25822819(-) A-I      intronic
chr2:25611911(-) A-I      intronic
chr2:25803022(-) A-I      intronic
chr2:25803021(-) A-I      intronic
chr2:25651391(-) A-I      intronic
chr2:25639478(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED DTNB
chr2:25638128(-) A-I intron -    15342557
chr2:25638168(-) A-I intron -    15342557
chr2:25638178(-) A-I intron -    15342557
chr2:25638181(-) A-I intron -    15342557
chr2:25638183(-) A-I intron -    15342557
chr2:25638184(-) A-I intron -    15342557
chr2:25638188(-) A-I intron -    15342557
chr2:25638227(-) A-I intron -    15342557
chr2:25638244(-) A-I intron -    15342557
chr2:25638248(-) A-I intron -    15342557
chr2:25638254(-) A-I intron -    15342557
chr2:25638309(-) A-I intron -    15342557   //15258596
chr2:25638315(-) A-I intron -    15342557   //15258596
chr2:25639393(-) A-I intron -    15342557   //15258596
chr2:25639411(-) A-I intron -    15342557   //15258596
chr2:25639419(-) A-I intron -    15342557   //15258596
chr2:25639423(-) A-I intron -    15342557   //15258596
chr2:25639453(-) A-I intron -    15342557   //22327324
chr2:25639499(-) A-I intron -    15342557
chr2:25671534(-) A-I intron -    15258596
chr2:25671660(-) A-I intron -    15258596
chr2:25671666(-) A-I intron -    15258596
chr2:25671716(-) A-I intron -    15258596
chr2:25645455(-) A-I intron -    22327324
chr2:25645458(-) A-I intron -    22327324
chr2:25645477(-) A-I intron -    22327324
chr2:25645998(-) A-I intron -    22327324
chr2:25646015(-) A-I intron -    22327324
chr2:25646726(-) A-I intron -    22327324
chr2:25662328(-) A-I intron -    22327324
chr2:25627885(-) A-I intron -    22028664
chr2:25627905(-) A-I intron -    22028664
chr2:25627937(-) A-I intron -    22028664
chr2:25627957(-) A-I intron -    22028664
chr2:25627968(-) A-I intron -    22028664
chr2:25627975(-) A-I intron -    22028664
chr2:25627976(-) A-I intron -    22028664
chr2:25627979(-) A-I intron -    22028664
chr2:25627985(-) A-I intron -    22028664
chr2:25627992(-) A-I intron -    22028664
chr2:25627993(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628043(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628052(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628055(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628064(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628069(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628070(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628072(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628083(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628159(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628167(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628175(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628230(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628253(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628261(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628266(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628301(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628310(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628327(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628328(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628333(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628346(-) A-I intron -    22028664
chr2:25628371(-) A-I intron -    22028664
chr2:25604465(-) T-C intron -    22484847
chr2:25604497(-) T-C intron -    22484847
chr2:25604507(-) T-C intron -    22484847
chr2:25604519(-) T-C intron -    22484847
chr2:25606270(-) T-C intron -    22484847
chr2:25607767(-) C-A intron -    22484847
chr2:25607863(-) A-G intron -    22484847
chr2:25608025(-) C-A intron -    22484847
chr2:25627558(-) A-G intron -    22484847
chr2:25627561(-) A-G intron -    22484847
chr2:25627937(-) A-G intron -    22484847
chr2:25628083(-) A-G intron -    22484847
chr2:25628159(-) A-G intron -    22484847
chr2:25628165(-) A-G intron -    22484847
chr2:25628220(-) T-C intron -    22484847
chr2:25628247(-) A-G intron -    22484847
chr2:25634176(-) A-G intron -    22484847
chr2:25634192(-) A-G intron -    22484847
chr2:25637204(-) A-G intron -    22484847
chr2:25637254(-) A-G intron -    22484847
chr2:25637264(-) A-G intron -    22484847
chr2:25637288(-) A-G intron -    22484847
chr2:25637298(-) A-G intron -    22484847
chr2:25638254(-) A-G intron -    22484847
chr2:25638309(-) A-G intron -    22484847
chr2:25638315(-) A-G intron -    22484847
chr2:25638319(-) A-G intron -    22484847
chr2:25639392(-) A-G intron -    22484847
chr2:25639411(-) A-G intron -    22484847
chr2:25639419(-) A-G intron -    22484847
chr2:25639453(-) A-G intron -    22484847
chr2:25639472(-) A-G intron -    22484847
chr2:25639478(-) A-G intron -    22484847
chr2:25639499(-) A-G intron -    22484847
chr2:25639513(-) A-G intron -    22484847
chr2:25639533(-) A-G intron -    22484847
chr2:25651304(-) G-A intron -    22484847
chr2:25651333(-) T-C intron -    22484847
chr2:25651482(-) T-C intron -    22484847
chr2:25657921(-) T-C intron -    22484847
chr2:25657932(-) T-C intron -    22484847
chr2:25657950(-) T-C intron -    22484847
chr2:25657958(-) T-C intron -    22484847
chr2:25657963(-) T-C intron -    22484847
chr2:25657969(-) T-C intron -    22484847
chr2:25657988(-) T-C intron -    22484847
chr2:25657989(-) T-C intron -    22484847
chr2:25657992(-) T-C intron -    22484847
chr2:25657993(-) T-C intron -    22484847
chr2:25658018(-) T-C intron -    22484847
chr2:25658027(-) A-G intron -    22484847
chr2:25658028(-) T-C intron -    22484847
chr2:25658064(-) T-C intron -    22484847
chr2:25658070(-) T-C intron -    22484847
chr2:25658090(-) T-C intron -    22484847
chr2:25658092(-) T-C intron -    22484847
chr2:25658945(-) T-C intron -    22484847
chr2:25658951(-) T-C intron -    22484847
chr2:25659002(-) T-C intron -    22484847
chr2:25659003(-) T-C intron -    22484847
chr2:25659020(-) T-C intron -    22484847
chr2:25659039(-) T-C intron -    22484847
chr2:25659046(-) T-C intron -    22484847
chr2:25659084(-) T-C intron -    22484847
chr2:25659113(-) T-C intron -    22484847
chr2:25659143(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660154(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660157(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660175(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660205(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660210(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660230(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660231(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660248(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660260(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660270(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660273(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660276(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660328(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660331(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660405(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660407(-) T-C intron -    22484847
chr2:25660411(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662154(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662185(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662190(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662191(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662193(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662225(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662226(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662264(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662290(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662291(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662302(-) A-G intron -    22484847
chr2:25662316(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662326(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662328(-) T-C intron -    22484847
chr2:25662347(-) T-C intron -    22484847
chr2:25670500(-) T-C intron -    22484847
chr2:25670513(-) T-C intron -    22484847
chr2:25670578(-) T-C intron -    22484847
chr2:25670621(-) T-C intron -    22484847
chr2:25670652(-) T-C intron -    22484847
chr2:25672718(-) T-C intron -    22484847
chr2:25672725(-) T-C intron -    22484847
chr2:25672748(-) A-G intron -    22484847
chr2:25676872(-) T-C intron -    22484847
chr2:25676889(-) T-C intron -    22484847
chr2:25676908(-) T-C intron -    22484847
chr2:25680732(-) T-C intron -    22484847
chr2:25680751(-) T-C intron -    22484847
chr2:25680764(-) C-T intron -    22484847
chr2:25680777(-) T-C intron -    22484847
chr2:25681788(-) T-C intron -    22484847
chr2:25682546(-) T-C intron -    22484847
chr2:25682721(-) T-C intron -    22484847
chr2:25682722(-) T-C intron -    22484847
chr2:25682810(-) A-G intron -    22484847
chr2:25686839(-) T-C intron -    22484847
chr2:25686847(-) A-G intron -    22484847
chr2:25687982(-) T-C intron -    22484847
chr2:25687987(-) A-G intron -    22484847
chr2:25688015(-) T-C intron -    22484847
chr2:25688062(-) T-C intron -    22484847
chr2:25688977(-) T-C intron -    22484847
chr2:25688987(-) T-C intron -    22484847
chr2:25688992(-) T-C intron -    22484847
chr2:25689068(-) T-C intron -    22484847
chr2:25689085(-) T-C intron -    22484847
chr2:25689102(-) T-C intron -    22484847
chr2:25689125(-) T-C intron -    22484847
chr2:25689191(-) T-C intron -    22484847
chr2:25690199(-) T-C intron -    22484847
chr2:25690242(-) T-C intron -    22484847
chr2:25690247(-) T-C intron -    22484847
chr2:25692490(-) T-C intron -    22484847
chr2:25692536(-) T-C intron -    22484847
chr2:25694377(-) T-C intron -    22484847
chr2:25694391(-) T-C intron -    22484847
chr2:25694454(-) T-C intron -    22484847
chr2:25695498(-) T-C intron -    22484847
chr2:25695528(-) T-C intron -    22484847
chr2:25708068(-) T-C intron -    22484847
chr2:25708139(-) T-C intron -    22484847
chr2:25708140(-) T-C intron -    22484847
chr2:25708145(-) T-C intron -    22484847
chr2:25711591(-) T-C intron -    22484847
chr2:25711602(-) T-C intron -    22484847
chr2:25711661(-) T-C intron -    22484847
chr2:25711781(-) T-C intron -    22484847
chr2:25712955(-) T-C intron -    22484847
chr2:25713070(-) T-C intron -    22484847
chr2:25713094(-) T-C intron -    22484847
chr2:25715660(-) T-C intron -    22484847
chr2:25717999(-) T-C intron -    22484847
chr2:25718061(-) T-C intron -    22484847
chr2:25718074(-) T-C intron -    22484847
chr2:25718092(-) T-C intron -    22484847
chr2:25718203(-) T-C intron -    22484847
chr2:25718215(-) T-C intron -    22484847
chr2:25721610(-) T-C intron -    22484847
chr2:25721843(-) T-C intron -    22484847
chr2:25724271(-) A-G intron -    22484847
chr2:25724873(-) T-C intron -    22484847
chr2:25724938(-) T-C intron -    22484847
chr2:25724972(-) T-C intron -    22484847
chr2:25724973(-) T-C intron -    22484847
chr2:25725634(-) T-C intron -    22484847
chr2:25726529(-) T-C intron -    22484847
chr2:25726665(-) T-C intron -    22484847
chr2:25734342(-) T-C intron -    22484847
chr2:25796087(-) A-G intron -    22484847
chr2:25796088(-) A-G intron -    22484847
chr2:25867430(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase DTNB
chr2:25600326-25600327(-) m6A 3'UTR//exon       24209618//27371828//27773536
chr2:25602174-25602175(-) m6A 3'UTR//exon       24209618//27773535//27371828//27773536
chr2:25602237-25602238(-) m6A exon//intron       27773535//27773536
chr2:25606709-25606710(-) m6A CDS//exon//intron       -
chr2:25610234-25610235(-) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24209618
chr2:25611117-25611118(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24209618
chr2:25642354-25642355(-) m6A exon//intron       -
chr2:25642374-25642375(-) m6A exon//intron       -
chr2:25650484-25650485(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       27371828//27773536
chr2:25650658-25650659(-) m6A exon//intron       -
chr2:25650679-25650680(-) m6A exon//intron       -
chr2:25650713-25650714(-) m6A exon//intron       -
chr2:25875498-25875499(-) m6A CDS//exon       27371828
chr2:25875509-25875510(-) m6A CDS//exon       27371828
chr2:25875822-25875823(-) m6A 5'UTR//intron       27371828
chr2:25875860-25875861(-) m6A 5'UTR//intron       27371828
chr2:25896294-25896295(-) m6A 5'UTR//exon       24209618

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate DTNB
Cytosol HCC cell line (HepG2)     -
Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: LNC_002351
Interactor2: DTNB

Evidence Support:


Weak-Evidence RNA-Seq
Support Database ViRBase

References:


PMID 32341894 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line CD4 T cells Interactor2 expression None
Description Based on previous DE analysis, 1109 DE lncRNAs targeting DE mRNAs were identified In all correlations (Table S6).

Starting a new search, please wait ...