Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-155-5p | GALT |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000646 | 2592 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | - |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-155-5p |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||
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RADAR | GALT |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | GALT |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-155-5p |
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GALT |
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ncDR | hsa-miR-155-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNAInter | hsa-miR-155-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID |
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NoncoRNA | hsa-miR-155-5p |
Interactor1: hsa-miR-155-5p | Interactor2: GALT |
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Weak-Evidence | Microarray | |
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Prediction-Evidence | PicTar//Targetscan | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 18075594 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | BJAB cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Downregulated mRNAs carrying a >6 nt seed match to miR-K12-11 were considered candidate direct targets and are listed in Suppl. Table 1. Using gene set enrichment analysis19, we observed that computer-predicted targets for cellular miR-155 were significantly enriched in mRNAs downregulated by miR-K12-11 (false discovery rate <= 0.003; Suppl. Table 2). |