Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-146a-5p | CXCR4 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000449 | 7852 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | CD184//D2S201E//FB22//HM89//HSY3RR//LAP-3//LAP3//LCR1//LESTR//NPY3R//NPYR//NPYRL//NPYY3R//WHIM//WHIMS |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-146a-5p |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | CXCR4 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-146a-5p |
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CXCR4 |
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ncDR | hsa-miR-146a-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNAInter | hsa-miR-146a-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID | ||||||||||||
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NoncoRNA | hsa-miR-146a-5p |
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Interactor1: hsa-miR-146a-5p | Interactor2: CXCR4 |
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Strong-Evidence | Luciferase reporter assay//qPCR//Western blot | |
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Support Database | ViRBase |
PMID | 20023696 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | Upregulation |
Tissue or cell line | 293 cells//HeLa cells//SLK cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | We report that, in contrast to the situation with RDC-1/CXCR7, KSHV infection downregulates CXCR4 gene expression through a novel mechanism that involves K13-induced upregulation of miR-146a, a microRNA that was recently shown to suppress CXCR4 expression by binding to the 3'UTR of its mRNA (Labbaye et al., 2008). |