Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00076066

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-101-2-5p:  MIMAT0037312          ZNF557:  NM_024341     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-101-2-5p	ZNF557
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0037312	79230
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-101-2-5p	rs1189997653 chr9:4850323    C/G rs1411860402 chr9:4850328    G/C rs1472339708 chr9:4850325    G/A rs374692878 chr9:4850308    T/C rs752365347 chr9:4850320    G/C rs758036961 chr9:4850324    C/T rs777507775 chr9:4850326    A/G rs570832031 chr9:4850310    G/A rs570832031 chr9:4850310    G/T rs766953168 chr9:4850309    C/T rs779213487 chr9:4850315    T/C rs894878476 chr9:4850314    A/G

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ZNF557	chr19:7082320(+) A-I      intronic chr19:7086082(+) A-I      3'UTR chr19:7086886(+) A-I      3'UTR chr19:7086223(+) A-I      3'UTR chr19:7086890(+) A-I      3'UTR chr19:7086904(+) A-I      3'UTR chr19:7087022(+) A-I      3'UTR chr19:7070876(+) A-I      intronic chr19:7086127(+) A-I      3'UTR chr19:7070913(+) A-I      intronic chr19:7086121(+) A-I      3'UTR chr19:7086632(+) A-I      3'UTR chr19:7086860(+) A-I      3'UTR chr19:7071704(+) A-I      intronic chr19:7082301(+) A-I      intronic chr19:7082313(+) A-I      intronic chr19:7082319(+) A-I      intronic chr19:7086088(+) A-I      3'UTR chr19:7082321(+) A-I      intronic chr19:7086877(+) A-I      3'UTR chr19:7086065(+) A-I      3'UTR chr19:7086042(+) A-I      3'UTR chr19:7085977(+) A-I      3'UTR chr19:7085372(+) A-I      3'UTR chr19:7084599(+) A-I      3'UTR chr19:7084573(+) A-I      3'UTR chr19:7071705(+) A-I      intronic chr19:7086509(+) A-I      3'UTR chr19:7074216(+) A-I      intronic chr19:7074129(+) A-I      intronic chr19:7072225(+) A-I      intronic chr19:7072424(+) A-I      intronic chr19:7070880(+) A-I      intronic chr19:7071653(+) A-I      intronic chr19:7071679(+) A-I      intronic chr19:7071996(+) A-I      intronic chr19:7072006(+) A-I      intronic chr19:7074105(+) A-I      intronic chr19:7080057(+) A-I      intronic chr19:7080159(+) A-I      intronic chr19:7080160(+) A-I      intronic chr19:7080240(+) A-I      intronic chr19:7086207(+) A-I      3'UTR chr19:7086949(+) A-I      3'UTR chr19:7084553(+) A-I      3'UTR chr19:7086925(+) A-I      3'UTR chr19:7086798(+) A-I      3'UTR chr19:7086787(+) A-I      3'UTR chr19:7084584(+) A-I      3'UTR chr19:7086782(+) A-I      3'UTR chr19:7086144(+) A-I      3'UTR chr19:7086611(+) A-I      3'UTR chr19:7086490(+) A-I      3'UTR chr19:7086477(+) A-I      3'UTR chr19:7085438(+) A-I      3'UTR chr19:7085437(+) A-I      3'UTR chr19:7085409(+) A-I      3'UTR chr19:7086191(+) A-I      3'UTR chr19:7085359(+) A-I      3'UTR chr19:7086154(+) A-I      3'UTR chr19:7085329(+) A-I      3'UTR chr19:7085284(+) A-I      3'UTR chr19:7086147(+) A-I      3'UTR chr19:7086138(+) A-I      3'UTR chr19:7085247(+) A-I      3'UTR chr19:7086135(+) A-I      3'UTR chr19:7086131(+) A-I      3'UTR chr19:7085227(+) A-I      3'UTR chr19:7084640(+) A-I      3'UTR chr19:7087536(+) A-I      3'UTR chr19:7086092(+) A-I      3'UTR chr19:7087527(+) A-I      3'UTR chr19:7087497(+) A-I      3'UTR chr19:7086416(+) A-I      3'UTR chr19:7087463(+) A-I      3'UTR chr19:7086090(+) A-I      3'UTR chr19:7087377(+) A-I      3'UTR chr19:7086089(+) A-I      3'UTR chr19:7086083(+) A-I      3'UTR chr19:7087356(+) A-I      3'UTR chr19:7086081(+) A-I      3'UTR chr19:7087305(+) A-I      3'UTR chr19:7086398(+) A-I      3'UTR chr19:7086394(+) A-I      3'UTR chr19:7086212(+) A-I      3'UTR chr19:7086076(+) A-I      3'UTR chr19:7085994(+) A-I      3'UTR chr19:7087035(+) A-I      3'UTR chr19:7084602(+) A-I      3'UTR chr19:7085987(+) A-I      3'UTR chr19:7085451(+) A-I      3'UTR chr19:7085449(+) A-I      3'UTR chr19:7084417(+) A-I      3'UTR chr19:7087005(+) A-I      3'UTR chr19:7086952(+) A-I      3'UTR chr19:7078682(+) A-I      intronic chr19:7073189(+) A-I      intronic chr19:7082314(+) A-I      intronic chr19:7070960(+) A-I      intronic chr19:7086136(+) A-I      3'UTR chr19:7071690(+) A-I      intronic chr19:7086421(+) A-I      3'UTR chr19:7085264(+) A-I      3'UTR chr19:7084458(+) A-I      3'UTR chr19:7087010(+) A-I      3'UTR chr19:7086054(+) A-I      3'UTR chr19:7087457(+) A-I      3'UTR chr19:7074199(+) A-I      intronic chr19:7086759(+) A-I      3'UTR chr19:7084431(+) A-I      3'UTR chr19:7087480(+) A-I      3'UTR chr19:7087431(+) A-I      3'UTR chr19:7070846(+) A-I      intronic chr19:7085296(+) A-I      3'UTR chr19:7072356(+) A-I      intronic chr19:7086893(+) A-I      3'UTR chr19:7086909(+) A-I      3'UTR chr19:7086633(+) A-I      3'UTR chr19:7086119(+) A-I      3'UTR chr19:7085248(+) A-I      3'UTR chr19:7086835(+) A-I      3'UTR chr19:7084644(+) A-I      3'UTR chr19:7084386(+) A-I      3'UTR chr19:7070877(+) A-I      intronic chr19:7086514(+) A-I      3'UTR chr19:7087422(+) A-I      3'UTR chr19:7082338(+) A-I      intronic chr19:7086031(+) A-I      3'UTR chr19:7086157(+) A-I      3'UTR chr19:7086554(+) A-I      3'UTR chr19:7070943(+) A-I      intronic chr19:7086148(+) A-I      3'UTR chr19:7086091(+) A-I      3'UTR chr19:7086919(+) A-I      3'UTR chr19:7070957(+) A-I      intronic chr19:7086080(+) A-I      3'UTR chr19:7070961(+) A-I      intronic chr19:7085209(+) A-I      3'UTR chr19:7084466(+) A-I      3'UTR chr19:7086560(+) A-I      3'UTR chr19:7085986(+) A-I      3'UTR chr19:7084578(+) A-I      3'UTR chr19:7086929(+) A-I      3'UTR chr19:7087351(+) A-I      3'UTR chr19:7086960(+) A-I      3'UTR chr19:7070919(+) A-I      intronic chr19:7073401(+) A-I      intronic chr19:7086437(+) A-I      3'UTR chr19:7087537(+) A-I      3'UTR chr19:7086224(+) A-I      3'UTR chr19:7086192(+) A-I      3'UTR chr19:7086790(+) A-I      3'UTR chr19:7086522(+) A-I      3'UTR chr19:7086579(+) A-I      3'UTR chr19:7071626(+) A-I      intronic chr19:7085414(+) A-I      3'UTR chr19:7087003(+) A-I      3'UTR chr19:7086946(+) A-I      3'UTR chr19:7086424(+) A-I      3'UTR chr19:7086512(+) A-I      3'UTR chr19:7085333(+) A-I      3'UTR chr19:7086850(+) A-I      3'UTR chr19:7086222(+) A-I      3'UTR chr19:7087296(+) A-I      3'UTR chr19:7071900(+) A-I      intronic chr19:7086016(+) A-I      3'UTR chr19:7086122(+) A-I      3'UTR chr19:7085301(+) A-I      3'UTR chr19:7086466(+) A-I      3'UTR chr19:7087405(+) A-I      3'UTR chr19:7084441(+) A-I      3'UTR chr19:7084629(+) A-I      3'UTR chr19:7087538(+) A-I      3'UTR chr19:7084491(+) A-I      3'UTR chr19:7084461(+) A-I      3'UTR chr19:7085397(+) A-I      3'UTR chr19:7086861(+) A-I      3'UTR chr19:7087396(+) A-I      3'UTR chr19:7086392(+) A-I      3'UTR chr19:7084638(+) A-I      3'UTR chr19:7084465(+) A-I      3'UTR chr19:7085979(+) A-I      3'UTR chr19:7085309(+) A-I      3'UTR chr19:7086453(+) A-I      3'UTR chr19:7085234(+) A-I      3'UTR chr19:7084648(+) A-I      3'UTR chr19:7087498(+) A-I      3'UTR chr19:7084528(+) A-I      3'UTR chr19:7085205(+) A-I      3'UTR chr19:7085283(+) A-I      3'UTR chr19:7084564(+) A-I      3'UTR chr19:7086428(+) A-I      3'UTR chr19:7084393(+) A-I      3'UTR chr19:7071697(+) A-I      intronic chr19:7071892(+) A-I      intronic chr19:7086781(+) A-I      3'UTR chr19:7085396(+) A-I      3'UTR chr19:7084547(+) A-I      3'UTR chr19:7086172(+) A-I      3'UTR chr19:7087000(+) A-I      3'UTR chr19:7086603(+) A-I      3'UTR chr19:7086594(+) A-I      3'UTR chr19:7085985(+) A-I      3'UTR chr19:7086920(+) A-I      3'UTR chr19:7086194(+) A-I      3'UTR chr19:7086245(+) A-I      3'UTR chr19:7080236(+) A-I      intronic chr19:7085375(+) A-I      3'UTR chr19:7086997(+) A-I      3'UTR chr19:7086836(+) A-I      3'UTR chr19:7072274(+) A-I      intronic chr19:7071695(+) A-I      intronic chr19:7071888(+) A-I      intronic chr19:7082172(+) A-I      intronic chr19:7071693(+) A-I      intronic chr19:7074089(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	ZNF557	chr19:7071888(+) A-I intron -    15545495 chr19:7071892(+) A-I intron -    15545495 chr19:7071900(+) A-I intron -    15545495 chr19:7071939(+) A-I intron -    15545495 chr19:7070846(+) A-I intron -    22327324 chr19:7084393(+) A-I intron -    22327324 chr19:7084465(+) A-I intron -    22327324 chr19:7084501(+) A-I intron -    22327324 chr19:7085410(+) A-I intron -    22327324 chr19:7085983(+) A-I intron -    22327324 chr19:7086421(+) A-I intron -    22327324 chr19:7087431(+) A-I intron -    22327324 chr19:7084553(+) A-I intron -    21960545 chr19:7084501(+) A-G intron -    21725310 chr19:7085277(+) A-G intron -    21725310   //22484847 chr19:7085983(+) A-G intron -    21725310   //22484847 chr19:7086163(+) A-G intron -    21725310 chr19:7086172(+) A-G intron -    21725310 chr19:7086512(+) A-G intron -    21725310   //22484847 chr19:7086920(+) A-G intron -    21725310   //22484847 chr19:7087431(+) A-G intron -    21725310   //22484847 chr19:7070846(+) A-G intron -    22484847 chr19:7071626(+) A-G intron -    22484847 chr19:7084380(+) A-G intron -    22484847 chr19:7084393(+) A-G intron -    22484847 chr19:7084431(+) A-G intron -    22484847 chr19:7084441(+) A-G intron -    22484847 chr19:7084458(+) A-G intron -    22484847 chr19:7084461(+) A-G intron -    22484847 chr19:7084466(+) A-G intron -    22484847 chr19:7084503(+) A-G intron -    22484847 chr19:7084564(+) A-G intron -    22484847 chr19:7084638(+) A-G intron -    22484847 chr19:7084644(+) A-G intron -    22484847 chr19:7085209(+) A-G intron -    22484847 chr19:7085375(+) A-G intron -    22484847 chr19:7085410(+) A-G intron -    22484847 chr19:7085963(+) A-G intron -    22484847 chr19:7085986(+) A-G intron -    22484847 chr19:7086016(+) A-G intron -    22484847 chr19:7086040(+) A-G intron -    22484847 chr19:7086055(+) A-G intron -    22484847 chr19:7086119(+) A-G intron -    22484847 chr19:7086424(+) A-G intron -    22484847 chr19:7086466(+) A-G intron -    22484847 chr19:7086557(+) A-G intron -    22484847 chr19:7086850(+) A-G intron -    22484847 chr19:7086851(+) A-G intron -    22484847 chr19:7086909(+) A-G intron -    22484847 chr19:7086919(+) A-G intron -    22484847 chr19:7086969(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	ZNF557	chr19:7082995-7082996(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr19:7083079-7083080(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr19:7083107-7083108(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr19:7083163-7083164(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr19:7083191-7083192(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr19:7083217-7083218(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr19:7083247-7083248(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr19:7083443-7083444(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr19:7083482-7083483(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr19:7083499-7083500(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr19:7083640-7083641(+) m6A CDS       22608085 chr19:7083650-7083651(+) m6A CDS       22608085 chr19:7083667-7083668(+) m6A CDS       22608085 chr19:7083814-7083815(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr19:7083883-7083884(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr19:7083889-7083890(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr19:7083931-7083932(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr19:7083992-7083993(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr19:7084026-7084027(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr19:7084276-7084277(+) m6A 3'UTR       22608085 chr19:7084294-7084295(+) m6A 3'UTR       22608085 chr19:7084301-7084302(+) m6A 3'UTR       22608085 chr19:7084310-7084311(+) m6A 3'UTR       22608085 chr19:7084322-7084323(+) m6A 3'UTR       22608085 chr19:7084382-7084383(+) m6A 3'UTR       22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ZNF557	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-101-2-5p
Interactor2: ZNF557

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	None
Description	We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.