Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00073922

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-3678-3p:  MIMAT0018103          RAB1A:  NM_015543     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-3678-3p	RAB1A
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0018103	5861
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	RAB1//YPT1

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-3678-3p	rs1163369708 chr17:75406153    G/A rs1174219930 chr17:75406155    C/G rs1273558782 chr17:75406157    G/A rs1424776090 chr17:75406150    A/T rs1475188526 chr17:75406151    C/T rs755095016 chr17:75406158    G/T rs915488824 chr17:75406156    C/A rs915488824 chr17:75406156    C/T rs988363493 chr17:75406137    C/T rs753118178 chr17:75406141    A/C

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	RAB1A	chr2:65352653(-) A-I      intronic chr2:65344359(-) A-I      intronic chr2:65317004(-) A-I      intronic chr2:65354622(-) A-I      intronic chr2:65316975(-) A-I      intronic chr2:65352652(-) A-I      intronic chr2:65352623(-) A-I      intronic chr2:65352613(-) A-I      intronic chr2:65352603(-) A-I      intronic chr2:65339100(-) A-I      intronic chr2:65334337(-) A-I      intronic chr2:65329997(-) A-I      intronic chr2:65307145(-) A-I      intronic chr2:65351795(-) A-I      intronic chr2:65351776(-) A-I      intronic chr2:65329952(-) A-I      intronic chr2:65351755(-) A-I      intronic chr2:65351775(-) A-I      intronic chr2:65318830(-) A-I      intronic chr2:65318837(-) A-I      intronic chr2:65321280(-) A-I      intronic chr2:65316974(-) A-I      intronic chr2:65321298(-) A-I      intronic chr2:65321314(-) A-I      intronic chr2:65321317(-) A-I      intronic chr2:65321328(-) A-I      intronic chr2:65326057(-) A-I      intronic chr2:65326099(-) A-I      intronic chr2:65326131(-) A-I      intronic chr2:65326140(-) A-I      intronic chr2:65326142(-) A-I      intronic chr2:65311499(-) A-I      intronic chr2:65326169(-) A-I      intronic chr2:65326184(-) A-I      intronic chr2:65328198(-) A-I      intronic chr2:65317033(-) A-I      intronic chr2:65328218(-) A-I      intronic chr2:65317032(-) A-I      intronic chr2:65317025(-) A-I      intronic chr2:65317015(-) A-I      intronic chr2:65329998(-) A-I      intronic chr2:65335098(-) A-I      intronic chr2:65335111(-) A-I      intronic chr2:65327478(-) A-I      intronic chr2:65327489(-) A-I      intronic chr2:65327650(-) A-I      intronic chr2:65327677(-) A-I      intronic chr2:65327689(-) A-I      intronic chr2:65327728(-) A-I      intronic chr2:65327731(-) A-I      intronic chr2:65327746(-) A-I      intronic chr2:65327750(-) A-I      intronic chr2:65327754(-) A-I      intronic chr2:65327824(-) A-I      intronic chr2:65327846(-) A-I      intronic chr2:65328023(-) A-I      intronic chr2:65328035(-) A-I      intronic chr2:65328114(-) A-I      intronic chr2:65328117(-) A-I      intronic chr2:65328123(-) A-I      intronic chr2:65328156(-) A-I      intronic chr2:65328217(-) A-I      intronic chr2:65328223(-) A-I      intronic chr2:65328236(-) A-I      intronic chr2:65328276(-) A-I      intronic chr2:65328936(-) A-I      intronic chr2:65328944(-) A-I      intronic chr2:65328951(-) A-I      intronic chr2:65328976(-) A-I      intronic chr2:65328980(-) A-I      intronic chr2:65345708(-) A-I      intronic chr2:65328981(-) A-I      intronic chr2:65328989(-) A-I      intronic chr2:65328990(-) A-I      intronic chr2:65329012(-) A-I      intronic chr2:65329021(-) A-I      intronic chr2:65329022(-) A-I      intronic chr2:65329048(-) A-I      intronic chr2:65329056(-) A-I      intronic chr2:65329058(-) A-I      intronic chr2:65329086(-) A-I      intronic chr2:65329090(-) A-I      intronic chr2:65329096(-) A-I      intronic chr2:65330013(-) A-I      intronic chr2:65330049(-) A-I      intronic chr2:65327452(-) A-I      intronic chr2:65327435(-) A-I      intronic chr2:65327413(-) A-I      intronic chr2:65327391(-) A-I      intronic chr2:65327370(-) A-I      intronic chr2:65326217(-) A-I      intronic chr2:65326178(-) A-I      intronic chr2:65326138(-) A-I      intronic chr2:65326102(-) A-I      intronic chr2:65323397(-) A-I      intronic chr2:65323392(-) A-I      intronic chr2:65323340(-) A-I      intronic chr2:65323337(-) A-I      intronic chr2:65323201(-) A-I      intronic chr2:65323163(-) A-I      intronic chr2:65322887(-) A-I      intronic chr2:65322770(-) A-I      intronic chr2:65322762(-) A-I      intronic chr2:65322700(-) A-I      intronic chr2:65322690(-) A-I      intronic chr2:65322616(-) A-I      intronic chr2:65322581(-) A-I      intronic chr2:65322568(-) A-I      intronic chr2:65322552(-) A-I      intronic chr2:65322536(-) A-I      intronic chr2:65322521(-) A-I      intronic chr2:65322519(-) A-I      intronic chr2:65321717(-) A-I      intronic chr2:65321692(-) A-I      intronic chr2:65321679(-) A-I      intronic chr2:65321661(-) A-I      intronic chr2:65321636(-) A-I      intronic chr2:65321631(-) A-I      intronic chr2:65321603(-) A-I      intronic chr2:65321594(-) A-I      intronic chr2:65321583(-) A-I      intronic chr2:65321570(-) A-I      intronic chr2:65321536(-) A-I      intronic chr2:65321514(-) A-I      intronic chr2:65321371(-) A-I      intronic chr2:65321360(-) A-I      intronic chr2:65321354(-) A-I      intronic chr2:65321350(-) A-I      intronic chr2:65321344(-) A-I      intronic chr2:65321322(-) A-I      intronic chr2:65321307(-) A-I      intronic chr2:65321305(-) A-I      intronic chr2:65321268(-) A-I      intronic chr2:65321192(-) A-I      intronic chr2:65321162(-) A-I      intronic chr2:65321156(-) A-I      intronic chr2:65321142(-) A-I      intronic chr2:65320993(-) A-I      intronic chr2:65320990(-) A-I      intronic chr2:65320894(-) A-I      intronic chr2:65320859(-) A-I      intronic chr2:65320854(-) A-I      intronic chr2:65320853(-) A-I      intronic chr2:65320825(-) A-I      intronic chr2:65320824(-) A-I      intronic chr2:65319850(-) A-I      intronic chr2:65319393(-) A-I      intronic chr2:65319342(-) A-I      intronic chr2:65319307(-) A-I      intronic chr2:65319288(-) A-I      intronic chr2:65319272(-) A-I      intronic chr2:65318872(-) A-I      intronic chr2:65318841(-) A-I      intronic chr2:65318834(-) A-I      intronic chr2:65318792(-) A-I      intronic chr2:65318737(-) A-I      intronic chr2:65305967(-) A-I      intronic chr2:65305959(-) A-I      intronic chr2:65305906(-) A-I      intronic chr2:65305871(-) A-I      intronic chr2:65305866(-) A-I      intronic chr2:65305797(-) A-I      intronic chr2:65305700(-) A-I      intronic chr2:65345811(-) A-I      intronic chr2:65330372(-) A-I      intronic chr2:65331470(-) A-I      intronic chr2:65332380(-) A-I      intronic chr2:65332515(-) A-I      intronic chr2:65332644(-) A-I      intronic chr2:65334011(-) A-I      intronic chr2:65334034(-) A-I      intronic chr2:65334235(-) A-I      intronic chr2:65334237(-) A-I      intronic chr2:65334323(-) A-I      intronic chr2:65334364(-) A-I      intronic chr2:65334441(-) A-I      intronic chr2:65334449(-) A-I      intronic chr2:65335821(-) A-I      intronic chr2:65335828(-) A-I      intronic chr2:65335921(-) A-I      intronic chr2:65339001(-) A-I      intronic chr2:65339014(-) A-I      intronic chr2:65339026(-) A-I      intronic chr2:65339052(-) A-I      intronic chr2:65339095(-) A-I      intronic chr2:65339134(-) A-I      intronic chr2:65339141(-) A-I      intronic chr2:65339168(-) A-I      intronic chr2:65339327(-) A-I      intronic chr2:65339438(-) A-I      intronic chr2:65339474(-) A-I      intronic chr2:65339527(-) A-I      intronic chr2:65339547(-) A-I      intronic chr2:65339556(-) A-I      intronic chr2:65340108(-) A-I      intronic chr2:65340125(-) A-I      intronic chr2:65340505(-) A-I      intronic chr2:65340577(-) A-I      intronic chr2:65340614(-) A-I      intronic chr2:65341984(-) A-I      intronic chr2:65344323(-) A-I      intronic chr2:65344324(-) A-I      intronic chr2:65344929(-) A-I      intronic chr2:65345697(-) A-I      intronic chr2:65345760(-) A-I      intronic chr2:65345783(-) A-I      intronic chr2:65345839(-) A-I      intronic chr2:65346483(-) A-I      intronic chr2:65347387(-) A-I      intronic chr2:65347410(-) A-I      intronic chr2:65348168(-) A-I      intronic chr2:65348172(-) A-I      intronic chr2:65348173(-) A-I      intronic chr2:65348285(-) A-I      intronic chr2:65349570(-) A-I      intronic chr2:65349597(-) A-I      intronic chr2:65350407(-) A-I      intronic chr2:65350416(-) A-I      intronic chr2:65350433(-) A-I      intronic chr2:65350437(-) A-I      intronic chr2:65350476(-) A-I      intronic chr2:65350479(-) A-I      intronic chr2:65350482(-) A-I      intronic chr2:65350756(-) A-I      intronic chr2:65350788(-) A-I      intronic chr2:65350797(-) A-I      intronic chr2:65350841(-) A-I      intronic chr2:65350851(-) A-I      intronic chr2:65350860(-) A-I      intronic chr2:65350877(-) A-I      intronic chr2:65351189(-) A-I      intronic chr2:65351193(-) A-I      intronic chr2:65351218(-) A-I      intronic chr2:65351234(-) A-I      intronic chr2:65351678(-) A-I      intronic chr2:65351819(-) A-I      intronic chr2:65351872(-) A-I      intronic chr2:65352597(-) A-I      intronic chr2:65352618(-) A-I      intronic chr2:65352667(-) A-I      intronic chr2:65352804(-) A-I      intronic chr2:65353035(-) A-I      intronic chr2:65353041(-) A-I      intronic chr2:65353044(-) A-I      intronic chr2:65353066(-) A-I      intronic chr2:65353385(-) A-I      intronic chr2:65353391(-) A-I      intronic chr2:65354658(-) A-I      intronic chr2:65354854(-) A-I      intronic chr2:65354944(-) A-I      intronic chr2:65354983(-) A-I      intronic chr2:65355086(-) A-I      intronic chr2:65350469(-) A-I      intronic chr2:65318733(-) A-I      intronic chr2:65349567(-) A-I      intronic chr2:65339419(-) A-I      intronic chr2:65354813(-) A-I      intronic chr2:65349575(-) A-I      intronic chr2:65326889(-) A-I      intronic chr2:65349654(-) A-I      intronic chr2:65321141(-) A-I      intronic chr2:65339553(-) A-I      intronic chr2:65350794(-) A-I      intronic chr2:65328132(-) A-I      intronic chr2:65323254(-) A-I      intronic chr2:65323178(-) A-I      intronic chr2:65345763(-) A-I      intronic chr2:65308223(-) A-I      intronic chr2:65327329(-) A-I      intronic chr2:65321609(-) A-I      intronic chr2:65318828(-) A-I      intronic chr2:65318935(-) A-I      intronic chr2:65344550(-) A-I      intronic chr2:65355140(-) A-I      intronic chr2:65316485(-) A-I      intronic chr2:65340647(-) A-I      intronic chr2:65352693(-) A-I      intronic chr2:65321642(-) A-I      intronic chr2:65349447(-) A-I      intronic chr2:65351764(-) A-I      intronic chr2:65321281(-) A-I      intronic chr2:65350811(-) A-I      intronic chr2:65316568(-) A-I      intronic chr2:65320921(-) A-I      intronic chr2:65322388(-) A-I      intronic chr2:65338961(-) A-I      intronic chr2:65327291(-) A-I      intronic chr2:65345794(-) A-I      intronic chr2:65351720(-) A-I      intronic chr2:65329974(-) A-I      intronic chr2:65321323(-) A-I      intronic chr2:65327473(-) A-I      intronic chr2:65349690(-) A-I      intronic chr2:65323147(-) A-I      intronic chr2:65320849(-) A-I      intronic chr2:65319165(-) A-I      intronic chr2:65347456(-) A-I      intronic chr2:65335904(-) A-I      intronic chr2:65350812(-) A-I      intronic chr2:65328158(-) A-I      intronic chr2:65334382(-) A-I      intronic chr2:65316839(-) A-I      intronic chr2:65326243(-) A-I      intronic chr2:65344604(-) A-I      intronic chr2:65307024(-) A-I      intronic chr2:65348327(-) A-I      intronic chr2:65335893(-) A-I      intronic chr2:65354760(-) A-I      intronic chr2:65350543(-) A-I      intronic chr2:65318729(-) A-I      intronic chr2:65347423(-) A-I      intronic chr2:65350836(-) A-I      intronic chr2:65344565(-) A-I      intronic chr2:65351778(-) A-I      intronic chr2:65355064(-) A-I      intronic chr2:65319321(-) A-I      intronic chr2:65320895(-) A-I      intronic chr2:65323031(-) A-I      intronic chr2:65323367(-) A-I      intronic chr2:65322421(-) A-I      intronic chr2:65344311(-) A-I      intronic chr2:65328995(-) A-I      intronic chr2:65334399(-) A-I      intronic chr2:65322443(-) A-I      intronic chr2:65322608(-) A-I      intronic chr2:65344381(-) A-I      intronic chr2:65318757(-) A-I      intronic chr2:65339407(-) A-I      intronic chr2:65338245(-) A-I      intronic chr2:65349042(-) A-I      intronic chr2:65350484(-) A-I      intronic chr2:65323438(-) A-I      intronic chr2:65326141(-) A-I      intronic chr2:65321462(-) A-I      intronic chr2:65335121(-) A-I      intronic chr2:65344292(-) A-I      intronic chr2:65345885(-) A-I      intronic chr2:65350485(-) A-I      intronic chr2:65321474(-) A-I      intronic chr2:65322605(-) A-I      intronic chr2:65334414(-) A-I      intronic chr2:65327722(-) A-I      intronic chr2:65345791(-) A-I      intronic chr2:65346565(-) A-I      intronic chr2:65318854(-) A-I      intronic chr2:65345786(-) A-I      intronic chr2:65305924(-) A-I      intronic chr2:65309058(-) A-I      intronic chr2:65334114(-) A-I      intronic chr2:65334296(-) A-I      intronic chr2:65355052(-) A-I      intronic chr2:65318882(-) A-I      intronic chr2:65345642(-) A-I      intronic chr2:65323249(-) A-I      intronic chr2:65323044(-) A-I      intronic chr2:65320952(-) A-I      intronic chr2:65333166(-) A-I      intronic chr2:65319244(-) A-I      intronic chr2:65339446(-) A-I      intronic chr2:65337833(-) A-I      intronic chr2:65327279(-) A-I      intronic chr2:65323123(-) A-I      intronic chr2:65354965(-) A-I      intronic chr2:65322754(-) A-I      intronic chr2:65327423(-) A-I      intronic chr2:65333167(-) A-I      intronic chr2:65346541(-) A-I      intronic chr2:65350865(-) A-I      intronic chr2:65321346(-) A-I      intronic chr2:65347514(-) A-I      intronic chr2:65307063(-) A-I      intronic chr2:65322713(-) A-I      intronic chr2:65326205(-) A-I      intronic chr2:65323387(-) A-I      intronic chr2:65332504(-) A-I      intronic chr2:65353446(-) A-I      intronic chr2:65354777(-) A-I      intronic chr2:65329805(-) A-I      intronic chr2:65322660(-) A-I      intronic chr2:65323386(-) A-I      intronic chr2:65327778(-) A-I      intronic chr2:65322661(-) A-I      intronic chr2:65344605(-) A-I      intronic chr2:65316913(-) A-I      intronic chr2:65350820(-) A-I      intronic chr2:65326139(-) A-I      intronic chr2:65322954(-) A-I      intronic chr2:65322644(-) A-I      intronic chr2:65332640(-) A-I      intronic chr2:65350897(-) A-I      intronic chr2:65328211(-) A-I      intronic chr2:65334160(-) A-I      intronic chr2:65320938(-) A-I      intronic chr2:65322531(-) A-I      intronic chr2:65335933(-) A-I      intronic chr2:65330924(-) A-I      intronic chr2:65328244(-) A-I      intronic chr2:65319298(-) A-I      intronic chr2:65344265(-) A-I      intronic chr2:65345893(-) A-I      intronic chr2:65318839(-) A-I      intronic chr2:65321173(-) A-I      intronic chr2:65347405(-) A-I      intronic chr2:65327664(-) A-I      intronic chr2:65351286(-) A-I      intronic chr2:65319241(-) A-I      intronic chr2:65326250(-) A-I      intronic chr2:65333037(-) A-I      intronic chr2:65353170(-) A-I      intronic chr2:65326164(-) A-I      intronic chr2:65351702(-) A-I      intronic chr2:65331423(-) A-I      intronic chr2:65344384(-) A-I      intronic chr2:65354822(-) A-I      intronic chr2:65332475(-) A-I      intronic chr2:65321279(-) A-I      intronic chr2:65322576(-) A-I      intronic chr2:65321377(-) A-I      intronic chr2:65323327(-) A-I      intronic chr2:65322793(-) A-I      intronic chr2:65322677(-) A-I      intronic chr2:65350472(-) A-I      intronic chr2:65334090(-) A-I      intronic chr2:65322648(-) A-I      intronic chr2:65321606(-) A-I      intronic chr2:65334750(-) A-I      intronic chr2:65350757(-) A-I      intronic chr2:65328228(-) A-I      intronic chr2:65346474(-) A-I      intronic chr2:65323325(-) A-I      intronic chr2:65323120(-) A-I      intronic chr2:65326055(-) A-I      intronic chr2:65346888(-) A-I      intronic chr2:65321272(-) A-I      intronic chr2:65327649(-) A-I      intronic chr2:65322978(-) A-I      intronic chr2:65327331(-) A-I      intronic chr2:65316866(-) A-I      intronic chr2:65330277(-) A-I      intronic chr2:65346682(-) A-I      intronic chr2:65353336(-) A-I      intronic chr2:65339562(-) A-I      intronic chr2:65319227(-) A-I      intronic chr2:65353434(-) A-I      intronic chr2:65349682(-) A-I      intronic chr2:65326086(-) A-I      intronic chr2:65319188(-) A-I      intronic chr2:65346921(-) A-I      intronic chr2:65322340(-) A-I      intronic chr2:65319235(-) A-I      intronic chr2:65309034(-) A-I      intronic chr2:65334404(-) A-I      intronic chr2:65354738(-) A-I      intronic chr2:65327529(-) A-I      intronic chr2:65321260(-) A-I      intronic chr2:65321172(-) A-I      intronic chr2:65334426(-) A-I      intronic chr2:65344865(-) A-I      intronic chr2:65323366(-) A-I      intronic chr2:65319295(-) A-I      intronic chr2:65353103(-) A-I      intronic chr2:65321201(-) A-I      intronic chr2:65347507(-) A-I      intronic chr2:65332927(-) A-I      intronic chr2:65335112(-) A-I      intronic chr2:65318808(-) A-I      intronic chr2:65323240(-) A-I      intronic chr2:65354631(-) A-I      intronic chr2:65347347(-) A-I      intronic chr2:65318931(-) A-I      intronic chr2:65323187(-) A-I      intronic chr2:65355163(-) A-I      intronic chr2:65346493(-) A-I      intronic chr2:65329912(-) A-I      intronic chr2:65349644(-) A-I      intronic chr2:65326008(-) A-I      intronic chr2:65332517(-) A-I      intronic chr2:65339410(-) A-I      intronic chr2:65319164(-) A-I      intronic chr2:65348324(-) A-I      intronic chr2:65353326(-) A-I      intronic chr2:65349438(-) A-I      intronic chr2:65318784(-) A-I      intronic chr2:65321556(-) A-I      intronic chr2:65307263(-) A-I      intronic chr2:65354607(-) A-I      intronic chr2:65327747(-) A-I      intronic chr2:65316634(-) A-I      intronic chr2:65318858(-) A-I      intronic chr2:65320829(-) A-I      intronic chr2:65321274(-) A-I      intronic chr2:65335857(-) A-I      intronic chr2:65328197(-) A-I      intronic chr2:65321596(-) A-I      intronic chr2:65351856(-) A-I      intronic chr2:65319224(-) A-I      intronic chr2:65347521(-) A-I      intronic chr2:65353117(-) A-I      intronic chr2:65331140(-) A-I      intronic chr2:65308233(-) A-I      intronic chr2:65331394(-) A-I      intronic chr2:65322889(-) A-I      intronic chr2:65326266(-) A-I      intronic chr2:65350497(-) A-I      intronic chr2:65335136(-) A-I      intronic chr2:65350780(-) A-I      intronic chr2:65305814(-) A-I      intronic chr2:65323211(-) A-I      intronic chr2:65322725(-) A-I      intronic chr2:65347468(-) A-I      intronic chr2:65321219(-) A-I      intronic chr2:65338973(-) A-I      intronic chr2:65332926(-) A-I      intronic chr2:65329153(-) A-I      intronic chr2:65339322(-) A-I      intronic chr2:65322743(-) A-I      intronic chr2:65332527(-) A-I      intronic chr2:65349993(-) A-I      intronic chr2:65345750(-) A-I      intronic chr2:65345688(-) A-I      intronic chr2:65350453(-) A-I      intronic chr2:65347443(-) A-I      intronic chr2:65329115(-) A-I      intronic chr2:65334724(-) A-I      intronic chr2:65344977(-) A-I      intronic chr2:65328088(-) A-I      intronic chr2:65338413(-) A-I      intronic chr2:65323285(-) A-I      intronic chr2:65355135(-) A-I      intronic chr2:65322963(-) A-I      intronic chr2:65322942(-) A-I      intronic chr2:65346951(-) A-I      intronic chr2:65335749(-) A-I      intronic chr2:65339105(-) A-I      intronic chr2:65322691(-) A-I      intronic chr2:65344471(-) A-I      intronic chr2:65304036(-) A-I      intronic chr2:65326095(-) A-I      intronic chr2:65351824(-) A-I      intronic chr2:65344932(-) A-I      intronic chr2:65335135(-) A-I      intronic chr2:65354621(-) A-I      intronic chr2:65335032(-) A-I      intronic chr2:65318932(-) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	RAB1A	chr2:65318784(-) A-I intron -    15342557 chr2:65318798(-) A-I intron -    15342557   //22327324 chr2:65318808(-) A-I intron -    15342557 chr2:65318824(-) A-I intron -    15342557 chr2:65319164(-) A-I intron -    15342557 chr2:65319227(-) A-I intron -    15342557 chr2:65319235(-) A-I intron -    15342557 chr2:65319244(-) A-I intron -    15342557 chr2:65319258(-) A-I intron -    15342557 chr2:65319285(-) A-I intron -    15342557   //21960545   //22327324 chr2:65319295(-) A-I intron -    15342557 chr2:65319347(-) A-I intron -    15342557   //22327324 chr2:65319352(-) A-I intron -    15342557 chr2:65322889(-) A-I intron -    15258596 chr2:65322920(-) A-I intron -    15258596 chr2:65322928(-) A-I intron -    15258596 chr2:65322980(-) A-I intron -    15258596 chr2:65318882(-) A-I intron -    22327324 chr2:65319341(-) A-I intron -    22327324 chr2:65321346(-) A-I intron -    22327324 chr2:65354609(-) A-I intron -    22327324 chr2:65322420(-) A-I intron -    21960545 chr2:65318858(-) A-I intron -    21960545 chr2:65321606(-) A-I intron -    21960545 chr2:65322443(-) A-I intron -    21960545 chr2:65322605(-) A-I intron -    21960545 chr2:65323327(-) A-I intron -    21960545 chr2:65326895(-) A-I intron -    21960545 chr2:65331456(-) A-I intron -    21960545 chr2:65335901(-) A-I intron -    21960545 chr2:65346105(-) A-I intron -    21960545 chr2:65349483(-) A-I intron -    21960545 chr2:65351764(-) A-I intron -    21960545 chr2:65316913(-) A-G intron -    22484847 chr2:65317018(-) G-C intron -    22484847 chr2:65318757(-) A-G intron -    22484847 chr2:65318784(-) A-G intron -    22484847 chr2:65318798(-) A-G intron -    22484847 chr2:65318808(-) A-G intron -    22484847 chr2:65318824(-) A-G intron -    22484847 chr2:65318827(-) A-G intron -    22484847 chr2:65318828(-) A-G intron -    22484847 chr2:65318829(-) A-G intron -    22484847 chr2:65318858(-) A-G intron -    22484847 chr2:65318882(-) A-G intron -    22484847 chr2:65318931(-) A-G intron -    22484847 chr2:65318935(-) A-G intron -    22484847 chr2:65319164(-) A-G intron -    22484847 chr2:65319227(-) A-G intron -    22484847 chr2:65319235(-) A-G intron -    22484847 chr2:65319258(-) A-G intron -    22484847 chr2:65319259(-) A-G intron -    22484847 chr2:65319285(-) A-G intron -    22484847 chr2:65319295(-) A-G intron -    22484847 chr2:65319298(-) A-G intron -    22484847 chr2:65319341(-) A-G intron -    22484847 chr2:65319347(-) A-G intron -    22484847 chr2:65319408(-) C-T intron -    22484847 chr2:65319844(-) G-A intron -    22484847 chr2:65319885(-) A-G intron -    22484847 chr2:65320895(-) A-G intron -    22484847 chr2:65320921(-) A-G intron -    22484847 chr2:65320952(-) A-G intron -    22484847 chr2:65320962(-) A-G intron -    22484847 chr2:65320985(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321242(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321260(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321281(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321323(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321331(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321346(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321502(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321556(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321562(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321596(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321606(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321609(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321635(-) A-G intron -    22484847 chr2:65321642(-) A-G intron -    22484847 chr2:65322340(-) A-G intron -    22484847 chr2:65322388(-) A-G intron -    22484847 chr2:65322421(-) A-G intron -    22484847 chr2:65322445(-) A-G intron -    22484847 chr2:65322599(-) A-G intron -    22484847 chr2:65322622(-) A-G intron -    22484847 chr2:65322754(-) A-G intron -    22484847 chr2:65322779(-) A-G intron -    22484847 chr2:65322789(-) A-G intron -    22484847 chr2:65322793(-) A-G intron -    22484847 chr2:65322954(-) A-G intron -    22484847 chr2:65322980(-) A-G intron -    22484847 chr2:65323123(-) A-G intron -    22484847 chr2:65323178(-) A-G intron -    22484847 chr2:65323187(-) A-G intron -    22484847 chr2:65323205(-) A-G intron -    22484847 chr2:65323211(-) A-G intron -    22484847 chr2:65323240(-) A-G intron -    22484847 chr2:65323254(-) A-G intron -    22484847 chr2:65323367(-) A-G intron -    22484847 chr2:65326109(-) A-G intron -    22484847 chr2:65326205(-) A-G intron -    22484847 chr2:65327534(-) G-T intron -    22484847 chr2:65327702(-) A-G intron -    22484847 chr2:65327722(-) A-G intron -    22484847 chr2:65327747(-) A-G intron -    22484847 chr2:65327778(-) A-G intron -    22484847 chr2:65328088(-) A-G intron -    22484847 chr2:65328090(-) T-C intron -    22484847 chr2:65328197(-) A-G intron -    22484847 chr2:65328228(-) A-G intron -    22484847 chr2:65328244(-) A-G intron -    22484847 chr2:65328257(-) T-C intron -    22484847 chr2:65328291(-) C-T intron -    22484847 chr2:65329076(-) A-G intron -    22484847 chr2:65329115(-) A-G intron -    22484847 chr2:65329827(-) A-G intron -    22484847 chr2:65329855(-) A-G intron -    22484847 chr2:65329974(-) A-G intron -    22484847 chr2:65332456(-) A-G intron -    22484847 chr2:65332475(-) A-G intron -    22484847 chr2:65332926(-) A-G intron -    22484847 chr2:65332927(-) A-G intron -    22484847 chr2:65333037(-) A-G intron -    22484847 chr2:65333058(-) T-C intron -    22484847 chr2:65333166(-) A-G intron -    22484847 chr2:65333167(-) A-G intron -    22484847 chr2:65334062(-) G-A intron -    22484847 chr2:65334114(-) A-G intron -    22484847 chr2:65334138(-) A-G intron -    22484847 chr2:65334160(-) A-G intron -    22484847 chr2:65334296(-) A-G intron -    22484847 chr2:65334379(-) A-G intron -    22484847 chr2:65334426(-) A-G intron -    22484847 chr2:65334724(-) A-G intron -    22484847 chr2:65335121(-) A-G intron -    22484847 chr2:65335190(-) G-T intron -    22484847 chr2:65335489(-) A-T intron -    22484847 chr2:65335857(-) A-G intron -    22484847 chr2:65335904(-) A-G intron -    22484847 chr2:65338245(-) A-G intron -    22484847 chr2:65339105(-) A-G intron -    22484847 chr2:65339186(-) A-G intron -    22484847 chr2:65339309(-) A-G intron -    22484847 chr2:65339322(-) A-G intron -    22484847 chr2:65339407(-) A-G intron -    22484847 chr2:65339410(-) A-G intron -    22484847 chr2:65339419(-) A-G intron -    22484847 chr2:65339420(-) A-G intron -    22484847 chr2:65339446(-) A-G intron -    22484847 chr2:65339553(-) A-G intron -    22484847 chr2:65340124(-) A-G intron -    22484847 chr2:65343022(-) C-A intron -    22484847 chr2:65344310(-) A-G intron -    22484847 chr2:65345642(-) A-G intron -    22484847 chr2:65345684(-) A-G intron -    22484847 chr2:65345688(-) A-G intron -    22484847 chr2:65345750(-) A-G intron -    22484847 chr2:65345791(-) A-G intron -    22484847 chr2:65345794(-) A-G intron -    22484847 chr2:65345885(-) A-G intron -    22484847 chr2:65346457(-) A-G intron -    22484847 chr2:65346493(-) A-G intron -    22484847 chr2:65346541(-) A-G intron -    22484847 chr2:65346558(-) A-G intron -    22484847 chr2:65346565(-) A-G intron -    22484847 chr2:65346704(-) G-T intron -    22484847 chr2:65346921(-) A-G intron -    22484847 chr2:65347405(-) A-G intron -    22484847 chr2:65347423(-) A-G intron -    22484847 chr2:65347443(-) A-G intron -    22484847 chr2:65347514(-) A-G intron -    22484847 chr2:65347521(-) A-G intron -    22484847 chr2:65348327(-) A-G intron -    22484847 chr2:65348369(-) C-T intron -    22484847 chr2:65349447(-) A-G intron -    22484847 chr2:65349483(-) A-G intron -    22484847 chr2:65349567(-) A-G intron -    22484847 chr2:65349575(-) A-G intron -    22484847 chr2:65349654(-) A-G intron -    22484847 chr2:65349674(-) A-G intron -    22484847 chr2:65349682(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350443(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350453(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350469(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350472(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350483(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350484(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350485(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350497(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350498(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350528(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350543(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350757(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350794(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350811(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350812(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350820(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350836(-) A-G intron -    22484847 chr2:65350865(-) A-G intron -    22484847 chr2:65351260(-) A-G intron -    22484847 chr2:65351720(-) A-G intron -    22484847 chr2:65351824(-) A-G intron -    22484847 chr2:65351856(-) A-G intron -    22484847 chr2:65353068(-) A-G intron -    22484847 chr2:65353117(-) A-G intron -    22484847 chr2:65353365(-) A-G intron -    22484847 chr2:65353366(-) A-G intron -    22484847 chr2:65353434(-) A-G intron -    22484847 chr2:65354607(-) A-G intron -    22484847 chr2:65354609(-) A-G intron -    22484847 chr2:65354621(-) A-G intron -    22484847 chr2:65354678(-) A-G intron -    22484847 chr2:65354738(-) A-G intron -    22484847 chr2:65354760(-) A-G intron -    22484847 chr2:65354777(-) A-G intron -    22484847 chr2:65355000(-) A-G intron -    22484847 chr2:65355006(-) A-G intron -    22484847 chr2:65355052(-) A-G intron -    22484847 chr2:65355063(-) A-G intron -    22484847 chr2:65355135(-) A-G intron -    22484847 chr2:65355140(-) A-G intron -    22484847 chr2:65355141(-) A-G intron -    22484847 chr2:65355163(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	RAB1A	chr2:65297849-65297850(-) m6A exon       27773535 chr2:65297878-65297879(-) m6A exon       27773535 chr2:65298023-65298024(-) m6A exon       27773535 chr2:65298042-65298043(-) m6A exon       27773535 chr2:65298060-65298061(-) m6A exon       27773535 chr2:65298082-65298083(-) m6A exon       27773535 chr2:65315278-65315279(-) Y 3'UTR//intron       25219674 chr2:65315356-65315357(-) m6A 3'UTR//intron       - chr2:65315416-65315417(-) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr2:65315426-65315427(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//27371828//22608085 chr2:65315447-65315448(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//27371828//22608085 chr2:65315566-65315567(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//27371828//22575960//22608085 chr2:65315580-65315581(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//27371828//22575960//22608085 chr2:65315758-65315759(-) m6A CDS//intron       26404942//27371828 chr2:65315787-65315788(-) m6A CDS//intron       26404942//27371828 chr2:65316183-65316184(-) m6A CDS//intron       26404942 chr2:65318181-65318182(-) m6A CDS//intron       26404942 chr2:65318207-65318208(-) m6A CDS//intron       26404942//27773535 chr2:65325121-65325122(-) m6A CDS//intron       26404942//27773535 chr2:65325142-65325143(-) m6A CDS//intron       24209618//26404942//27773535 chr2:65357152-65357153(-) m6A 5'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//26404942//27773535//27371828//22575960//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-3678-3p	Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Cell lines(GBM46|GBM8|HaCaT|K562|MCF-10A|MCF-7|MGG75)|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocytes     -
	RAB1A	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-3678-3p
Interactor2: RAB1A

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	None
Description	We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.