Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00073858

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-3662:  MIMAT0018083          AEBP2:  NM_001363736     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-3662	AEBP2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0018083	121536
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-3662	rs1269591251 chr6:134979367    C/T rs1392974872 chr6:134979361    T/C rs779534942 chr6:134979360    G/A rs748588809 chr6:134979372    C/A rs748588809 chr6:134979372    C/T rs763349803 chr6:134979371    TC/T

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	AEBP2	chr12:19654035(+) A-I      intronic chr12:19603718(+) A-I      intronic chr12:19610649(+) A-I      intronic chr12:19654340(+) A-I      intronic chr12:19654385(+) A-I      intronic chr12:19610648(+) A-I      intronic chr12:19654016(+) A-I      intronic chr12:19654009(+) A-I      intronic chr12:19654000(+) A-I      intronic chr12:19603717(+) A-I      intronic chr12:19603669(+) A-I      intronic chr12:19610647(+) A-I      intronic chr12:19610634(+) A-I      intronic chr12:19610608(+) A-I      intronic chr12:19618162(+) A-I      intronic chr12:19640561(+) A-I      intronic chr12:19618165(+) A-I      intronic chr12:19618169(+) A-I      intronic chr12:19618170(+) A-I      intronic chr12:19593748(+) A-I      intronic chr12:19603705(+) A-I      intronic chr12:19654391(+) A-I      intronic chr12:19640453(+) A-I      intronic chr12:19640462(+) A-I      intronic chr12:19640498(+) A-I      intronic chr12:19640501(+) A-I      intronic chr12:19640505(+) A-I      intronic chr12:19640558(+) A-I      intronic chr12:19649735(+) A-I      intronic chr12:19649737(+) A-I      intronic chr12:19650490(+) A-I      intronic chr12:19650587(+) A-I      intronic chr12:19651851(+) A-I      intronic chr12:19651890(+) A-I      intronic chr12:19652322(+) A-I      intronic chr12:19654307(+) A-I      intronic chr12:19654407(+) A-I      intronic chr12:19654420(+) A-I      intronic chr12:19654434(+) A-I      intronic chr12:19654523(+) A-I      intronic chr12:19654526(+) A-I      intronic chr12:19569892(+) A-I      intronic chr12:19569899(+) A-I      intronic chr12:19569906(+) A-I      intronic chr12:19596110(+) A-I      intronic chr12:19596443(+) A-I      intronic chr12:19596550(+) A-I      intronic chr12:19596602(+) A-I      intronic chr12:19597405(+) A-I      intronic chr12:19598232(+) A-I      intronic chr12:19598233(+) A-I      intronic chr12:19599306(+) A-I      intronic chr12:19666642(+) A-I      intronic chr12:19666463(+) A-I      intronic chr12:19599331(+) A-I      intronic chr12:19662906(+) A-I      intronic chr12:19662871(+) A-I      intronic chr12:19662494(+) A-I      intronic chr12:19657310(+) A-I      intronic chr12:19657308(+) A-I      intronic chr12:19599409(+) A-I      intronic chr12:19650481(+) A-I      intronic chr12:19657298(+) A-I      intronic chr12:19657262(+) A-I      intronic chr12:19656902(+) A-I      intronic chr12:19599414(+) A-I      intronic chr12:19656895(+) A-I      intronic chr12:19656878(+) A-I      intronic chr12:19599564(+) A-I      intronic chr12:19655708(+) A-I      intronic chr12:19603490(+) A-I      intronic chr12:19603509(+) A-I      intronic chr12:19603615(+) A-I      intronic chr12:19655683(+) A-I      intronic chr12:19655657(+) A-I      intronic chr12:19655186(+) A-I      intronic chr12:19655169(+) A-I      intronic chr12:19654554(+) A-I      intronic chr12:19603686(+) A-I      intronic chr12:19603697(+) A-I      intronic chr12:19612347(+) A-I      intronic chr12:19612372(+) A-I      intronic chr12:19613016(+) A-I      intronic chr12:19613032(+) A-I      intronic chr12:19613058(+) A-I      intronic chr12:19613100(+) A-I      intronic chr12:19613429(+) A-I      intronic chr12:19613718(+) A-I      intronic chr12:19617577(+) A-I      intronic chr12:19617590(+) A-I      intronic chr12:19617595(+) A-I      intronic chr12:19617620(+) A-I      intronic chr12:19617792(+) A-I      intronic chr12:19617798(+) A-I      intronic chr12:19617800(+) A-I      intronic chr12:19617801(+) A-I      intronic chr12:19618191(+) A-I      intronic chr12:19618829(+) A-I      intronic chr12:19618906(+) A-I      intronic chr12:19618909(+) A-I      intronic chr12:19619279(+) A-I      intronic chr12:19619318(+) A-I      intronic chr12:19619337(+) A-I      intronic chr12:19597442(+) A-I      intronic chr12:19620253(+) A-I      intronic chr12:19620298(+) A-I      intronic chr12:19627788(+) A-I      intronic chr12:19631933(+) A-I      intronic chr12:19631996(+) A-I      intronic chr12:19632022(+) A-I      intronic chr12:19639526(+) A-I      intronic chr12:19640442(+) A-I      intronic chr12:19618855(+) A-I      intronic chr12:19596510(+) A-I      intronic chr12:19641157(+) A-I      intronic chr12:19657359(+) A-I      intronic chr12:19601714(+) A-I      intronic chr12:19662884(+) A-I      intronic chr12:19596469(+) A-I      intronic chr12:19654359(+) A-I      intronic chr12:19596454(+) A-I      intronic chr12:19662441(+) A-I      intronic chr12:19656947(+) A-I      intronic chr12:19654336(+) A-I      intronic chr12:19605136(+) A-I      intronic chr12:19596260(+) A-I      intronic chr12:19654428(+) A-I      intronic chr12:19618207(+) A-I      intronic chr12:19654131(+) A-I      intronic chr12:19648593(+) A-I      intronic chr12:19656952(+) A-I      intronic chr12:19654291(+) A-I      intronic chr12:19655130(+) A-I      intronic chr12:19621103(+) A-I      intronic chr12:19608127(+) A-I      intronic chr12:19567681(+) A-I      intronic chr12:19595078(+) A-I      intronic chr12:19596251(+) A-I      intronic chr12:19613331(+) A-I      intronic chr12:19601740(+) A-I      intronic chr12:19596448(+) A-I      intronic chr12:19631446(+) A-I      intronic chr12:19650590(+) A-I      intronic chr12:19620357(+) A-I      intronic chr12:19654404(+) A-I      intronic chr12:19632075(+) A-I      intronic chr12:19662425(+) A-I      intronic chr12:19654190(+) A-I      intronic chr12:19618826(+) A-I      intronic chr12:19640390(+) A-I      intronic chr12:19617650(+) A-I      intronic chr12:19640572(+) A-I      intronic chr12:19599555(+) A-I      intronic chr12:19599757(+) A-I      intronic chr12:19652382(+) A-I      intronic chr12:19655248(+) A-I      intronic chr12:19599591(+) A-I      intronic chr12:19658945(+) A-I      intronic chr12:19618523(+) A-I      intronic chr12:19598212(+) A-I      intronic chr12:19626469(+) A-I      intronic chr12:19596130(+) A-I      intronic chr12:19665797(+) A-I      intronic chr12:19662501(+) A-I      intronic chr12:19667073(+) A-I      intronic chr12:19598409(+) A-I      intronic chr12:19654145(+) A-I      intronic chr12:19605134(+) A-I      intronic chr12:19619243(+) A-I      intronic chr12:19619253(+) A-I      intronic chr12:19657363(+) A-I      intronic chr12:19667075(+) A-I      intronic chr12:19665121(+) A-I      intronic chr12:19655162(+) A-I      intronic chr12:19618825(+) A-I      intronic chr12:19605129(+) A-I      intronic chr12:19613392(+) A-I      intronic chr12:19596293(+) A-I      intronic chr12:19666971(+) A-I      intronic chr12:19667134(+) A-I      intronic chr12:19613036(+) A-I      intronic chr12:19650471(+) A-I      intronic chr12:19598164(+) A-I      intronic chr12:19667008(+) A-I      intronic chr12:19596212(+) A-I      intronic chr12:19656710(+) A-I      intronic chr12:19654382(+) A-I      intronic chr12:19670672(+) A-I      intronic chr12:19662939(+) A-I      intronic chr12:19667131(+) A-I      intronic chr12:19598330(+) A-I      intronic chr12:19596131(+) A-I      intronic chr12:19648534(+) A-I      intronic chr12:19666511(+) A-I      intronic chr12:19662964(+) A-I      intronic chr12:19626396(+) A-I      intronic chr12:19651888(+) A-I      intronic chr12:19597852(+) A-I      intronic chr12:19588355(+) A-I      intronic chr12:19666668(+) A-I      intronic chr12:19654185(+) A-I      intronic chr12:19619261(+) A-I      intronic chr12:19652437(+) A-I      intronic chr12:19603508(+) A-I      intronic chr12:19641943(+) A-I      intronic chr12:19603581(+) A-I      intronic chr12:19613085(+) A-I      intronic chr12:19608136(+) A-I      intronic chr12:19667014(+) A-I      intronic chr12:19596596(+) A-I      intronic chr12:19662601(+) A-I      intronic chr12:19618181(+) A-I      intronic chr12:19603582(+) A-I      intronic chr12:19601298(+) A-I      intronic chr12:19652333(+) A-I      intronic chr12:19596197(+) A-I      intronic chr12:19599545(+) A-I      intronic chr12:19667100(+) A-I      intronic chr12:19662989(+) A-I      intronic chr12:19654450(+) A-I      intronic chr12:19599395(+) A-I      intronic chr12:19654311(+) A-I      intronic chr12:19598348(+) A-I      intronic chr12:19662495(+) A-I      intronic chr12:19619259(+) A-I      intronic chr12:19640573(+) A-I      intronic chr12:19596252(+) A-I      intronic chr12:19603655(+) A-I      intronic chr12:19662426(+) A-I      intronic chr12:19668974(+) A-I      intronic chr12:19595096(+) A-I      intronic chr12:19668848(+) A-I      intronic chr12:19595160(+) A-I      intronic chr12:19619302(+) A-I      intronic chr12:19604925(+) A-I      intronic chr12:19662451(+) A-I      intronic chr12:19596209(+) A-I      intronic chr12:19596170(+) A-I      intronic chr12:19640432(+) A-I      intronic chr12:19666632(+) A-I      intronic chr12:19596536(+) A-I      intronic chr12:19596135(+) A-I      intronic chr12:19606747(+) A-I      intronic chr12:19596160(+) A-I      intronic chr12:19618511(+) A-I      intronic chr12:19665802(+) A-I      intronic chr12:19596092(+) A-I      intronic chr12:19598333(+) A-I      intronic chr12:19641801(+) A-I      intronic chr12:19662545(+) A-I      intronic chr12:19662933(+) A-I      intronic chr12:19612990(+) A-I      intronic chr12:19662606(+) A-I      intronic chr12:19666617(+) A-I      intronic chr12:19604762(+) A-I      intronic chr12:19606328(+) A-I      intronic chr12:19613405(+) A-I      intronic chr12:19650476(+) A-I      intronic chr12:19626479(+) A-I      intronic chr12:19647941(+) A-I      intronic chr12:19566153(+) A-I      intronic chr12:19667033(+) A-I      intronic chr12:19662867(+) A-I      intronic chr12:19640396(+) A-I      intronic chr12:19575570(+) A-I      intronic chr12:19596453(+) A-I      intronic chr12:19566054(+) A-I      intronic chr12:19654390(+) A-I      intronic chr12:19566101(+) A-I      intronic chr12:19667143(+) A-I      intronic chr12:19596292(+) A-I      intronic chr12:19618875(+) A-I      intronic chr12:19669811(+) A-I      intronic chr12:19667013(+) A-I      intronic chr12:19667071(+) A-I      intronic chr12:19640397(+) A-I      intronic chr12:19599750(+) A-I      intronic chr12:19664005(+) A-I      intronic chr12:19618071(+) A-I      intronic chr12:19596161(+) A-I      intronic chr12:19613295(+) A-I      intronic chr12:19666576(+) A-I      intronic chr12:19613022(+) A-I      intronic chr12:19654424(+) A-I      intronic chr12:19662866(+) A-I      intronic chr12:19657381(+) A-I      intronic chr12:19662484(+) A-I      intronic chr12:19603574(+) A-I      intronic chr12:19596250(+) A-I      intronic chr12:19595093(+) A-I      intronic chr12:19652387(+) A-I      intronic chr12:19596546(+) A-I      intronic chr12:19596444(+) A-I      intronic chr12:19596537(+) A-I      intronic chr12:19654008(+) A-I      intronic chr12:19601234(+) A-I      intronic chr12:19605132(+) A-I      intronic chr12:19613389(+) A-I      intronic chr12:19662947(+) A-I      intronic chr12:19597417(+) A-I      intronic chr12:19613006(+) A-I      intronic chr12:19657373(+) A-I      intronic chr12:19652318(+) A-I      intronic chr12:19651860(+) A-I      intronic chr12:19665153(+) A-I      intronic chr12:19578922(+) A-I      intronic chr12:19596062(+) A-I      intronic chr12:19623226(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	AEBP2	chr12:19595096(+) A-G intron -    22484847 chr12:19598348(+) A-G intron -    22484847 chr12:19599555(+) A-G intron -    22484847 chr12:19599591(+) A-G intron -    22484847 chr12:19603574(+) A-G intron -    22484847 chr12:19603581(+) A-G intron -    22484847 chr12:19603582(+) A-G intron -    22484847 chr12:19641224(+) A-T intron -    22484847 chr12:19662866(+) A-G intron -    22484847 chr12:19662867(+) A-G intron -    22484847 chr12:19595093(+) A-G intron -    22484847 chr12:19595095(+) G-C intron -    22484847 chr12:19596062(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596092(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596130(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596131(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596135(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596160(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596161(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596170(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596212(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596250(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596251(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596292(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596293(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596448(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596453(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596454(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596469(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596536(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596537(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596546(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596596(+) A-G intron -    22484847 chr12:19596630(+) G-T intron -    22484847 chr12:19597417(+) A-G intron -    22484847 chr12:19597852(+) A-G intron -    22484847 chr12:19598164(+) A-G intron -    22484847 chr12:19598212(+) A-G intron -    22484847 chr12:19598333(+) A-G intron -    22484847 chr12:19601234(+) A-G intron -    22484847 chr12:19601298(+) A-G intron -    22484847 chr12:19604762(+) A-G intron -    22484847 chr12:19604925(+) A-G intron -    22484847 chr12:19613006(+) A-G intron -    22484847 chr12:19613022(+) A-G intron -    22484847 chr12:19613036(+) A-G intron -    22484847 chr12:19613085(+) A-G intron -    22484847 chr12:19613331(+) A-G intron -    22484847 chr12:19613405(+) A-G intron -    22484847 chr12:19618071(+) A-G intron -    22484847 chr12:19618825(+) A-G intron -    22484847 chr12:19618826(+) A-G intron -    22484847 chr12:19618855(+) A-G intron -    22484847 chr12:19618875(+) A-G intron -    22484847 chr12:19619243(+) A-G intron -    22484847 chr12:19619253(+) A-G intron -    22484847 chr12:19619259(+) A-G intron -    22484847 chr12:19619302(+) A-G intron -    22484847 chr12:19623226(+) A-G intron -    22484847 chr12:19632075(+) A-G intron -    22484847 chr12:19640390(+) A-G intron -    22484847 chr12:19640396(+) A-G intron -    22484847 chr12:19640432(+) A-G intron -    22484847 chr12:19641801(+) A-G intron -    22484847 chr12:19641943(+) A-G intron -    22484847 chr12:19650590(+) A-G intron -    22484847 chr12:19654450(+) A-G intron -    22484847 chr12:19655162(+) A-G intron -    22484847 chr12:19656952(+) A-G intron -    22484847 chr12:19662451(+) A-G intron -    22484847 chr12:19662484(+) A-G intron -    22484847 chr12:19662495(+) A-G intron -    22484847 chr12:19662501(+) A-G intron -    22484847 chr12:19662933(+) A-G intron -    22484847 chr12:19662939(+) A-G intron -    22484847 chr12:19665153(+) A-G intron -    22484847 chr12:19665797(+) A-G intron -    22484847 chr12:19665802(+) A-G intron -    22484847 chr12:19665806(+) C-T intron -    22484847 chr12:19666511(+) A-G intron -    22484847 chr12:19666576(+) A-G intron -    22484847 chr12:19666632(+) A-G intron -    22484847 chr12:19667008(+) A-G intron -    22484847 chr12:19667013(+) A-G intron -    22484847 chr12:19667014(+) A-G intron -    22484847 chr12:19667033(+) A-G intron -    22484847 chr12:19667071(+) A-G intron -    22484847 chr12:19667073(+) A-G intron -    22484847 chr12:19667075(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	AEBP2	chr12:19593041-19593042(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27371828//22575960//22608085 chr12:19593121-19593122(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27371828//22575960//22608085 chr12:19593203-19593204(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27371828//22575960//22608085 chr12:19593274-19593275(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr12:19593291-19593292(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr12:19593300-19593301(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr12:19593563-19593564(+) m6A 5'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr12:19593588-19593589(+) m6A 5'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr12:19615469-19615470(+) m6A CDS       24284625//24209618 chr12:19615515-19615516(+) m6A CDS       24209618 chr12:19615568-19615569(+) m6A CDS       24209618

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-3662	Exosome B cell lymphoma cell lines|EBV-transformed lymphoblastoid B cells     25242326 Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Cell lines(GBM46|GBM8|HaCaT|K562|MCF-10A|MCF-7|MGG75)|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocytes     - Mitochondrion Cell line (HEK-293|HeLa)     22984580
	AEBP2	Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-3662
Interactor2: AEBP2

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	None
Description	We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.