Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00072657

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-3179:  MIMAT0015056          LRCH3:  NM_001365715     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-3179	LRCH3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0015056	84859
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-3179	rs1229893475 chr16:14901579    G/A rs1340262765 chr16:14901578    C/T rs1351100204 chr16:14901559    A/G rs1555527332 chr16:16300220    A/T rs1398613616 chr16:14901562    A/G rs1555527331 chr16:16300216    G/A

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	LRCH3	chr3:197534353(+) A-I      intronic chr3:197534361(+) A-I      intronic chr3:197534366(+) A-I      intronic chr3:197535505(+) A-I      intronic chr3:197535527(+) A-I      intronic chr3:197535558(+) A-I      intronic chr3:197535583(+) A-I      intronic chr3:197555823(+) A-I      intronic chr3:197555490(+) A-I      intronic chr3:197534240(+) A-I      intronic chr3:197531076(+) A-I      intronic chr3:197531084(+) A-I      intronic chr3:197531109(+) A-I      intronic chr3:197531127(+) A-I      intronic chr3:197562211(+) A-I      intronic chr3:197562235(+) A-I      intronic chr3:197521629(+) A-I      intronic chr3:197562242(+) A-I      intronic chr3:197562264(+) A-I      intronic chr3:197535613(+) A-I      intronic chr3:197572188(+) A-I      intronic chr3:197591693(+) A-I      intronic chr3:197522766(+) A-I      intronic chr3:197521711(+) A-I      intronic chr3:197521724(+) A-I      intronic chr3:197521801(+) A-I      intronic chr3:197558706(+) A-I      intronic chr3:197560214(+) A-I      intronic chr3:197522736(+) A-I      intronic chr3:197522761(+) A-I      intronic chr3:197522764(+) A-I      intronic chr3:197568816(+) A-I      intronic chr3:197535654(+) A-I      intronic chr3:197535671(+) A-I      intronic chr3:197536026(+) A-I      intronic chr3:197536062(+) A-I      intronic chr3:197536095(+) A-I      intronic chr3:197536101(+) A-I      intronic chr3:197536148(+) A-I      intronic chr3:197537129(+) A-I      intronic chr3:197537157(+) A-I      intronic chr3:197544868(+) A-I      intronic chr3:197560272(+) A-I      intronic chr3:197560298(+) A-I      intronic chr3:197560329(+) A-I      intronic chr3:197560330(+) A-I      intronic chr3:197562110(+) A-I      intronic chr3:197563571(+) A-I      intronic chr3:197563732(+) A-I      intronic chr3:197563801(+) A-I      intronic chr3:197563823(+) A-I      intronic chr3:197564810(+) A-I      intronic chr3:197564811(+) A-I      intronic chr3:197564816(+) A-I      intronic chr3:197566577(+) A-I      intronic chr3:197567160(+) A-I      intronic chr3:197567162(+) A-I      intronic chr3:197568790(+) A-I      intronic chr3:197568833(+) A-I      intronic chr3:197570461(+) A-I      intronic chr3:197570464(+) A-I      intronic chr3:197571569(+) A-I      intronic chr3:197571582(+) A-I      intronic chr3:197571638(+) A-I      intronic chr3:197571679(+) A-I      intronic chr3:197572109(+) A-I      intronic chr3:197572179(+) A-I      intronic chr3:197572254(+) A-I      intronic chr3:197572288(+) A-I      intronic chr3:197572629(+) A-I      intronic chr3:197587899(+) A-I      intronic chr3:197590373(+) A-I      intronic chr3:197590391(+) A-I      intronic chr3:197590977(+) A-I      intronic chr3:197590982(+) A-I      intronic chr3:197590994(+) A-I      intronic chr3:197591000(+) A-I      intronic chr3:197591002(+) A-I      intronic chr3:197591054(+) A-I      intronic chr3:197591098(+) A-I      intronic chr3:197591259(+) A-I      intronic chr3:197591289(+) A-I      intronic chr3:197591295(+) A-I      intronic chr3:197591317(+) A-I      intronic chr3:197591637(+) A-I      intronic chr3:197591727(+) A-I      intronic chr3:197591740(+) A-I      intronic chr3:197591742(+) A-I      intronic chr3:197592047(+) A-I      intronic chr3:197592080(+) A-I      intronic chr3:197592098(+) A-I      intronic chr3:197592121(+) A-I      intronic chr3:197554801(+) A-I      intronic chr3:197554863(+) A-I      intronic chr3:197554873(+) A-I      intronic chr3:197555260(+) A-I      intronic chr3:197555369(+) A-I      intronic chr3:197555398(+) A-I      intronic chr3:197555429(+) A-I      intronic chr3:197555438(+) A-I      intronic chr3:197555658(+) A-I      intronic chr3:197555678(+) A-I      intronic chr3:197555721(+) A-I      intronic chr3:197558694(+) A-I      intronic chr3:197524503(+) A-I      intronic chr3:197526504(+) A-I      intronic chr3:197526518(+) A-I      intronic chr3:197526582(+) A-I      intronic chr3:197526651(+) A-I      intronic chr3:197527779(+) A-I      intronic chr3:197527809(+) A-I      intronic chr3:197527812(+) A-I      intronic chr3:197527819(+) A-I      intronic chr3:197527872(+) A-I      intronic chr3:197530865(+) A-I      intronic chr3:197530987(+) A-I      intronic chr3:197555342(+) A-I      intronic chr3:197531144(+) A-I      intronic chr3:197532872(+) A-I      intronic chr3:197532897(+) A-I      intronic chr3:197533207(+) A-I      intronic chr3:197533218(+) A-I      intronic chr3:197533227(+) A-I      intronic chr3:197533476(+) A-I      intronic chr3:197533513(+) A-I      intronic chr3:197533855(+) A-I      intronic chr3:197534214(+) A-I      intronic chr3:197534291(+) A-I      intronic chr3:197611213(+) A-I      3'UTR chr3:197612366(+) A-I      3'UTR chr3:197612329(+) A-I      3'UTR chr3:197612322(+) A-I      3'UTR chr3:197612321(+) A-I      3'UTR chr3:197612977(+) A-I      3'UTR chr3:197611202(+) A-I      3'UTR chr3:197612971(+) A-I      3'UTR chr3:197611220(+) A-I      3'UTR chr3:197612960(+) A-I      3'UTR chr3:197612981(+) A-I      3'UTR chr3:197611105(+) A-I      3'UTR chr3:197612955(+) A-I      3'UTR chr3:197612320(+) A-I      3'UTR chr3:197612306(+) A-I      3'UTR chr3:197612296(+) A-I      3'UTR chr3:197612295(+) A-I      3'UTR chr3:197612390(+) A-I      3'UTR chr3:197612995(+) A-I      3'UTR chr3:197613000(+) A-I      3'UTR chr3:197613073(+) A-I      3'UTR chr3:197612946(+) A-I      3'UTR chr3:197612249(+) A-I      3'UTR chr3:197612262(+) A-I      3'UTR chr3:197612392(+) A-I      3'UTR chr3:197613195(+) A-I      3'UTR chr3:197612281(+) A-I      3'UTR chr3:197612283(+) A-I      3'UTR chr3:197613165(+) A-I      3'UTR chr3:197611304(+) A-I      3'UTR chr3:197612286(+) A-I      3'UTR chr3:197612323(+) A-I      3'UTR chr3:197611723(+) A-I      3'UTR chr3:197613499(+) A-I      3'UTR chr3:197613578(+) A-I      3'UTR chr3:197612292(+) A-I      3'UTR chr3:197613515(+) A-I      3'UTR chr3:197613549(+) A-I      3'UTR chr3:197611167(+) A-I      3'UTR chr3:197611081(+) A-I      3'UTR chr3:197612352(+) A-I      3'UTR chr3:197611100(+) A-I      3'UTR chr3:197612326(+) A-I      3'UTR chr3:197611178(+) A-I      3'UTR chr3:197550489(+) A-I      intronic chr3:197544756(+) A-I      intronic chr3:197561998(+) A-I      intronic chr3:197591109(+) A-I      intronic chr3:197580290(+) A-I      intronic chr3:197571675(+) A-I      intronic chr3:197554694(+) A-I      intronic chr3:197523822(+) A-I      intronic chr3:197594170(+) A-I      intronic chr3:197571521(+) A-I      intronic chr3:197591697(+) A-I      intronic chr3:197572143(+) A-I      intronic chr3:197555382(+) A-I      intronic chr3:197545772(+) A-I      intronic chr3:197533266(+) A-I      intronic chr3:197521717(+) A-I      intronic chr3:197568803(+) A-I      intronic chr3:197557153(+) A-I      intronic chr3:197572725(+) A-I      intronic chr3:197524955(+) A-I      intronic chr3:197531133(+) A-I      intronic chr3:197573200(+) A-I      intronic chr3:197591713(+) A-I      intronic chr3:197545909(+) A-I      intronic chr3:197591691(+) A-I      intronic chr3:197591638(+) A-I      intronic chr3:197572081(+) A-I      intronic chr3:197594215(+) A-I      intronic chr3:197519921(+) A-I      intronic chr3:197587298(+) A-I      intronic chr3:197555718(+) A-I      intronic chr3:197545742(+) A-I      intronic chr3:197531869(+) A-I      intronic chr3:197583387(+) A-I      intronic chr3:197592097(+) A-I      intronic chr3:197571588(+) A-I      intronic chr3:197554761(+) A-I      intronic chr3:197555297(+) A-I      intronic chr3:197562154(+) A-I      intronic chr3:197547559(+) A-I      intronic chr3:197591973(+) A-I      intronic chr3:197568864(+) A-I      intronic chr3:197554672(+) A-I      intronic chr3:197560288(+) A-I      intronic chr3:197533803(+) A-I      intronic chr3:197591361(+) A-I      intronic chr3:197588960(+) A-I      intronic chr3:197570480(+) A-I      intronic chr3:197591745(+) A-I      intronic chr3:197562155(+) A-I      intronic chr3:197545870(+) A-I      intronic chr3:197561904(+) A-I      intronic chr3:197561894(+) A-I      intronic chr3:197526824(+) A-I      intronic chr3:197569800(+) A-I      intronic chr3:197572153(+) A-I      intronic chr3:197587891(+) A-I      intronic chr3:197561956(+) A-I      intronic chr3:197572094(+) A-I      intronic chr3:197566602(+) A-I      intronic chr3:197592457(+) A-I      intronic chr3:197519358(+) A-I      intronic chr3:197527815(+) A-I      intronic chr3:197567159(+) A-I      intronic chr3:197571672(+) A-I      intronic chr3:197522638(+) A-I      intronic chr3:197545810(+) A-I      intronic chr3:197571389(+) A-I      intronic chr3:197521755(+) A-I      intronic chr3:197527705(+) A-I      intronic chr3:197572024(+) A-I      intronic chr3:197569862(+) A-I      intronic chr3:197526676(+) A-I      intronic chr3:197591794(+) A-I      intronic chr3:197533602(+) A-I      intronic chr3:197590233(+) A-I      intronic chr3:197522681(+) A-I      intronic chr3:197519895(+) A-I      intronic chr3:197548671(+) A-I      intronic chr3:197571364(+) A-I      intronic chr3:197563592(+) A-I      intronic chr3:197571302(+) A-I      intronic chr3:197555334(+) A-I      intronic chr3:197591708(+) A-I      intronic chr3:197613529(+) A-I      3'UTR chr3:197611263(+) A-I      3'UTR chr3:197611332(+) A-I      3'UTR chr3:197611208(+) A-I      3'UTR chr3:197612226(+) A-I      3'UTR chr3:197612982(+) A-I      3'UTR chr3:197611155(+) A-I      3'UTR chr3:197612218(+) A-I      3'UTR chr3:197611302(+) A-I      3'UTR chr3:197613155(+) A-I      3'UTR chr3:197611420(+) A-I      3'UTR chr3:197613561(+) A-I      3'UTR chr3:197613604(+) A-I      3'UTR chr3:197611143(+) A-I      3'UTR chr3:197613109(+) A-I      3'UTR chr3:197611048(+) A-I      3'UTR chr3:197611090(+) A-I      3'UTR chr3:197612426(+) A-I      3'UTR chr3:197613597(+) A-I      3'UTR chr3:197611669(+) A-I      3'UTR chr3:197613136(+) A-I      3'UTR chr3:197611745(+) A-I      3'UTR chr3:197611666(+) A-I      3'UTR chr3:197613556(+) A-I      3'UTR chr3:197611267(+) A-I      3'UTR chr3:197611250(+) A-I      3'UTR chr3:197613198(+) A-I      3'UTR chr3:197611051(+) A-I      3'UTR chr3:197612268(+) A-I      3'UTR chr3:197612460(+) A-I      3'UTR chr3:197611755(+) A-I      3'UTR chr3:197613489(+) A-I      3'UTR chr3:197613585(+) A-I      3'UTR chr3:197612243(+) A-I      3'UTR chr3:197613525(+) A-I      3'UTR chr3:197611192(+) A-I      3'UTR chr3:197611262(+) A-I      3'UTR chr3:197611718(+) A-I      3'UTR chr3:197612220(+) A-I      3'UTR chr3:197613555(+) A-I      3'UTR chr3:197612361(+) A-I      3'UTR chr3:197613518(+) A-I      3'UTR chr3:197611288(+) A-I      3'UTR chr3:197612334(+) A-I      3'UTR chr3:197611390(+) A-I      3'UTR chr3:197612488(+) A-I      3'UTR chr3:197613565(+) A-I      3'UTR chr3:197612954(+) A-I      3'UTR chr3:197613131(+) A-I      3'UTR chr3:197613500(+) A-I      3'UTR chr3:197611126(+) A-I      3'UTR chr3:197612406(+) A-I      3'UTR chr3:197611736(+) A-I      3'UTR chr3:197611289(+) A-I      3'UTR chr3:197611165(+) A-I      3'UTR chr3:197612393(+) A-I      3'UTR chr3:197611164(+) A-I      3'UTR chr3:197612227(+) A-I      3'UTR chr3:197611125(+) A-I      3'UTR chr3:197612401(+) A-I      3'UTR chr3:197612370(+) A-I      3'UTR chr3:197612430(+) A-I      3'UTR chr3:197613028(+) A-I      3'UTR chr3:197611763(+) A-I      3'UTR chr3:197611237(+) A-I      3'UTR chr3:197612257(+) A-I      3'UTR chr3:197526592(+) A-I      intronic chr3:197568797(+) A-I      intronic chr3:197519662(+) A-I      intronic chr3:197539463(+) A-I      intronic chr3:197572655(+) A-I      intronic chr3:197592124(+) A-I      intronic chr3:197547577(+) A-I      intronic chr3:197590922(+) A-I      intronic chr3:197572096(+) A-I      intronic chr3:197591771(+) A-I      intronic chr3:197550486(+) A-I      intronic chr3:197591807(+) A-I      intronic chr3:197569906(+) A-I      intronic chr3:197555635(+) A-I      intronic chr3:197571615(+) A-I      intronic chr3:197571689(+) A-I      intronic chr3:197591798(+) A-I      intronic chr3:197546332(+) A-I      intronic chr3:197535585(+) A-I      intronic chr3:197544772(+) A-I      intronic chr3:197568941(+) A-I      intronic chr3:197519785(+) A-I      intronic chr3:197592472(+) A-I      intronic chr3:197545811(+) A-I      intronic chr3:197572682(+) A-I      intronic chr3:197555346(+) A-I      intronic chr3:197591092(+) A-I      intronic chr3:197545815(+) A-I      intronic chr3:197572184(+) A-I      intronic chr3:197571628(+) A-I      intronic chr3:197544899(+) A-I      intronic chr3:197532854(+) A-I      intronic chr3:197564732(+) A-I      intronic chr3:197592032(+) A-I      intronic chr3:197534308(+) A-I      intronic chr3:197590165(+) A-I      intronic chr3:197591370(+) A-I      intronic chr3:197571332(+) A-I      intronic chr3:197572521(+) A-I      intronic chr3:197590214(+) A-I      intronic chr3:197555423(+) A-I      intronic chr3:197592135(+) A-I      intronic chr3:197534299(+) A-I      intronic chr3:197550543(+) A-I      intronic chr3:197526483(+) A-I      intronic chr3:197572155(+) A-I      intronic chr3:197594147(+) A-I      intronic chr3:197545801(+) A-I      intronic chr3:197544908(+) A-I      intronic chr3:197591318(+) A-I      intronic chr3:197590312(+) A-I      intronic chr3:197562194(+) A-I      intronic chr3:197557142(+) A-I      intronic chr3:197530874(+) A-I      intronic chr3:197533658(+) A-I      intronic chr3:197531026(+) A-I      intronic chr3:197555499(+) A-I      intronic chr3:197564833(+) A-I      intronic chr3:197573326(+) A-I      intronic chr3:197590232(+) A-I      intronic chr3:197560289(+) A-I      intronic chr3:197554695(+) A-I      intronic chr3:197533817(+) A-I      intronic chr3:197544968(+) A-I      intronic chr3:197561965(+) A-I      intronic chr3:197545735(+) A-I      intronic chr3:197590329(+) A-I      intronic chr3:197591057(+) A-I      intronic chr3:197563649(+) A-I      intronic chr3:197544883(+) A-I      intronic chr3:197524080(+) A-I      intronic chr3:197593588(+) A-I      intronic chr3:197590377(+) A-I      intronic chr3:197592069(+) A-I      intronic chr3:197550607(+) A-I      intronic chr3:197590185(+) A-I      intronic chr3:197569809(+) A-I      intronic chr3:197572685(+) A-I      intronic chr3:197526619(+) A-I      intronic chr3:197519934(+) A-I      intronic chr3:197530974(+) A-I      intronic chr3:197590927(+) A-I      intronic chr3:197534217(+) A-I      intronic chr3:197591360(+) A-I      intronic chr3:197561808(+) A-I      intronic chr3:197591929(+) A-I      intronic chr3:197564644(+) A-I      intronic chr3:197523825(+) A-I      intronic chr3:197537167(+) A-I      intronic chr3:197591714(+) A-I      intronic chr3:197591334(+) A-I      intronic chr3:197544821(+) A-I      intronic chr3:197524477(+) A-I      intronic chr3:197562116(+) A-I      intronic chr3:197555239(+) A-I      intronic chr3:197590258(+) A-I      intronic chr3:197521651(+) A-I      intronic chr3:197534227(+) A-I      intronic chr3:197524853(+) A-I      intronic chr3:197544874(+) A-I      intronic chr3:197590272(+) A-I      intronic chr3:197563610(+) A-I      intronic chr3:197545820(+) A-I      intronic chr3:197591433(+) A-I      intronic chr3:197545841(+) A-I      intronic chr3:197573093(+) A-I      intronic chr3:197555842(+) A-I      intronic chr3:197594080(+) A-I      intronic chr3:197519688(+) A-I      intronic chr3:197544715(+) A-I      intronic chr3:197530980(+) A-I      intronic chr3:197555754(+) A-I      intronic chr3:197572198(+) A-I      intronic chr3:197563678(+) A-I      intronic chr3:197572104(+) A-I      intronic chr3:197545866(+) A-I      intronic chr3:197555643(+) A-I      intronic chr3:197587392(+) A-I      intronic chr3:197567150(+) A-I      intronic chr3:197544831(+) A-I      intronic chr3:197591293(+) A-I      intronic chr3:197534354(+) A-I      intronic chr3:197524145(+) A-I      intronic chr3:197535528(+) A-I      intronic chr3:197590306(+) A-I      intronic chr3:197548639(+) A-I      intronic chr3:197527846(+) A-I      intronic chr3:197554827(+) A-I      intronic chr3:197592057(+) A-I      intronic chr3:197594028(+) A-I      intronic chr3:197590198(+) A-I      intronic chr3:197560182(+) A-I      intronic chr3:197592025(+) A-I      intronic chr3:197562276(+) A-I      intronic chr3:197561888(+) A-I      intronic chr3:197590274(+) A-I      intronic chr3:197572102(+) A-I      intronic chr3:197572135(+) A-I      intronic chr3:197550617(+) A-I      intronic chr3:197557139(+) A-I      intronic chr3:197594169(+) A-I      intronic chr3:197524079(+) A-I      intronic chr3:197591635(+) A-I      intronic chr3:197590406(+) A-I      intronic chr3:197571630(+) A-I      intronic chr3:197562184(+) A-I      intronic chr3:197566595(+) A-I      intronic chr3:197570475(+) A-I      intronic chr3:197522644(+) A-I      intronic chr3:197545725(+) A-I      intronic chr3:197527750(+) A-I      intronic chr3:197535582(+) A-I      intronic chr3:197590259(+) A-I      intronic chr3:197562257(+) A-I      intronic chr3:197545826(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	LRCH3	chr3:197544756(+) A-I intron -    15342557 chr3:197544772(+) A-I intron -    15342557 chr3:197544821(+) A-I intron -    15342557 chr3:197544831(+) A-I intron -    15342557 chr3:197544874(+) A-I intron -    15342557 chr3:197544883(+) A-I intron -    15342557 chr3:197544899(+) A-I intron -    15342557 chr3:197544908(+) A-I intron -    15342557 chr3:197544968(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545725(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545733(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545742(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545772(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545787(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545801(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545810(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545811(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545815(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545820(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545826(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545841(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545850(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545866(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545870(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545877(+) A-I intron -    15342557 chr3:197545909(+) A-I intron -    15342557 chr3:197591109(+) A-I intron -    22327324 chr3:197591635(+) A-I intron -    22327324 chr3:197591974(+) A-I intron -    22327324 chr3:197519785(+) A-G intron -    22484847 chr3:197526676(+) A-G intron -    22484847 chr3:197526708(+) C-A intron -    22484847 chr3:197526824(+) A-G intron -    22484847 chr3:197527705(+) A-G intron -    22484847 chr3:197527815(+) A-G intron -    22484847 chr3:197527846(+) A-G intron -    22484847 chr3:197531869(+) A-G intron -    22484847 chr3:197532015(+) T-C intron -    22484847 chr3:197532854(+) A-G intron -    22484847 chr3:197533256(+) T-C intron -    22484847 chr3:197533266(+) A-G intron -    22484847 chr3:197533658(+) A-G intron -    22484847 chr3:197533803(+) A-G intron -    22484847 chr3:197533817(+) A-G intron -    22484847 chr3:197534217(+) A-G intron -    22484847 chr3:197534227(+) A-G intron -    22484847 chr3:197534308(+) A-G intron -    22484847 chr3:197534354(+) A-G intron -    22484847 chr3:197535528(+) A-G intron -    22484847 chr3:197535582(+) A-G intron -    22484847 chr3:197535585(+) A-G intron -    22484847 chr3:197537167(+) A-G intron -    22484847 chr3:197544899(+) A-G intron -    22484847 chr3:197550214(+) G-C intron -    22484847 chr3:197554694(+) A-G intron -    22484847 chr3:197554695(+) A-G intron -    22484847 chr3:197554827(+) A-G intron -    22484847 chr3:197554833(+) A-G intron -    22484847 chr3:197555281(+) A-G intron -    22484847 chr3:197555297(+) A-G intron -    22484847 chr3:197555346(+) A-G intron -    22484847 chr3:197555382(+) A-G intron -    22484847 chr3:197555423(+) A-G intron -    22484847 chr3:197555635(+) A-G intron -    22484847 chr3:197555643(+) A-G intron -    22484847 chr3:197555679(+) A-G intron -    22484847 chr3:197555704(+) G-A intron -    22484847 chr3:197560236(+) G-A intron -    22484847 chr3:197561888(+) A-G intron -    22484847 chr3:197562099(+) A-G intron -    22484847 chr3:197562116(+) A-G intron -    22484847 chr3:197562154(+) A-G intron -    22484847 chr3:197562184(+) A-G intron -    22484847 chr3:197562194(+) A-G intron -    22484847 chr3:197562216(+) A-G intron -    22484847 chr3:197562257(+) A-G intron -    22484847 chr3:197563592(+) A-G intron -    22484847 chr3:197563610(+) A-G intron -    22484847 chr3:197563628(+) A-G intron -    22484847 chr3:197566602(+) A-G intron -    22484847 chr3:197568740(+) A-G intron -    22484847 chr3:197568797(+) A-G intron -    22484847 chr3:197568803(+) A-G intron -    22484847 chr3:197568804(+) A-G intron -    22484847 chr3:197568807(+) A-G intron -    22484847 chr3:197568983(+) A-G intron -    22484847 chr3:197569719(+) C-G intron -    22484847 chr3:197569858(+) C-A intron -    22484847 chr3:197570476(+) A-G intron -    22484847 chr3:197570555(+) G-A intron -    22484847 chr3:197571521(+) A-G intron -    22484847 chr3:197571606(+) A-G intron -    22484847 chr3:197571628(+) A-G intron -    22484847 chr3:197571630(+) A-G intron -    22484847 chr3:197571672(+) A-G intron -    22484847 chr3:197571675(+) A-G intron -    22484847 chr3:197571689(+) A-G intron -    22484847 chr3:197572102(+) A-G intron -    22484847 chr3:197572135(+) A-G intron -    22484847 chr3:197572143(+) A-G intron -    22484847 chr3:197572153(+) A-G intron -    22484847 chr3:197572155(+) A-G intron -    22484847 chr3:197572161(+) A-G intron -    22484847 chr3:197572198(+) A-G intron -    22484847 chr3:197572294(+) G-A intron -    22484847 chr3:197572725(+) A-G intron -    22484847 chr3:197587891(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590165(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590189(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590232(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590233(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590250(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590258(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590259(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590262(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590272(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590306(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590312(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590315(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590329(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590377(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590404(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590919(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590927(+) A-G intron -    22484847 chr3:197590948(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591001(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591057(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591092(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591109(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591293(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591318(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591320(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591334(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591360(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591361(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591370(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591433(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591624(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591635(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591708(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591713(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591714(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591745(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591771(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591794(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591798(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591967(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591973(+) A-G intron -    22484847 chr3:197591974(+) A-G intron -    22484847 chr3:197592032(+) A-G intron -    22484847 chr3:197592049(+) A-G intron -    22484847 chr3:197592094(+) A-G intron -    22484847 chr3:197592097(+) A-G intron -    22484847 chr3:197592111(+) A-G intron -    22484847 chr3:197592124(+) A-G intron -    22484847 chr3:197593667(+) T-C intron -    22484847 chr3:197593847(+) T-C intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	LRCH3	chr3:197559120-197559121(+) m6A CDS       24981863 chr3:197559126-197559127(+) m6A CDS       24981863 chr3:197559155-197559156(+) m6A CDS       24981863 chr3:197562548-197562549(+) m6A CDS       24981863 chr3:197562577-197562578(+) m6A CDS       24981863 chr3:197574850-197574851(+) m6A CDS//exon       24981863 chr3:197574881-197574882(+) m6A CDS//exon       24981863 chr3:197597109-197597110(+) Gm CDS//exon       - chr3:197610241-197610242(+) m6A 3'UTR//intron       25456834 chr3:197610491-197610492(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//25456834//24981863//22608085 chr3:197610572-197610573(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085 chr3:197610579-197610580(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085 chr3:197610584-197610585(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085 chr3:197610618-197610619(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085 chr3:197610646-197610647(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085 chr3:197612068-197612069(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-3179	Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
	LRCH3	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-3179
Interactor2: LRCH3

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	22291592	Target region	CDS
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	None
Description	We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.