Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00072062

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-3121-3p:           SMURF2:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-3121-3p SMURF2
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0014983 64750
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - -

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-3121-3p
rs1006143795 chr1:180438334    T/C
rs778817728 chr1:180438323    T/C
rs887772082 chr1:180438327    C/T
rs911596096 chr1:180438331    G/C

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR SMURF2
chr17:62580615(-) A-I      intronic
chr17:62580621(-) A-I      intronic
chr17:62580637(-) A-I      intronic
chr17:62580652(-) A-I      intronic
chr17:62623381(-) A-I      intronic
chr17:62623403(-) A-I      intronic
chr17:62634348(-) A-I      intronic
chr17:62642316(-) A-I      intronic
chr17:62642362(-) A-I      intronic
chr17:62642696(-) A-I      intronic
chr17:62642704(-) A-I      intronic
chr17:62642714(-) A-I      intronic
chr17:62642719(-) A-I      intronic
chr17:62651580(-) A-I      intronic
chr17:62549524(-) A-I      intronic
chr17:62572131(-) A-I      intronic
chr17:62622733(-) A-I      intronic
chr17:62623434(-) A-I      intronic
chr17:62625514(-) A-I      intronic
chr17:62628188(-) A-I      intronic
chr17:62629385(-) A-I      intronic
chr17:62631362(-) A-I      intronic
chr17:62640268(-) A-I      intronic
chr17:62644866(-) A-I      intronic
chr17:62646783(-) A-I      intronic
chr17:62646885(-) A-I      intronic
chr17:62647100(-) A-I      intronic
chr17:62647276(-) A-I      intronic
chr17:62642725(-) A-I      intronic
chr17:62565640(-) A-I      intronic
chr17:62544785(-) A-I      intronic
chr17:62544787(-) A-I      intronic
chr17:62558654(-) A-I      intronic
chr17:62558662(-) A-I      intronic
chr17:62558667(-) A-I      intronic
chr17:62563945(-) A-I      intronic
chr17:62563946(-) A-I      intronic
chr17:62565269(-) A-I      intronic
chr17:62565270(-) A-I      intronic
chr17:62565283(-) A-I      intronic
chr17:62565294(-) A-I      intronic
chr17:62565362(-) A-I      intronic
chr17:62565367(-) A-I      intronic
chr17:62572719(-) A-I      intronic
chr17:62573064(-) A-I      intronic
chr17:62573066(-) A-I      intronic
chr17:62573118(-) A-I      intronic
chr17:62564175(-) A-I      intronic
chr17:62564253(-) A-I      intronic
chr17:62564400(-) A-I      intronic
chr17:62564404(-) A-I      intronic
chr17:62564928(-) A-I      intronic
chr17:62565037(-) A-I      intronic
chr17:62565150(-) A-I      intronic
chr17:62565332(-) A-I      intronic
chr17:62565336(-) A-I      intronic
chr17:62634438(-) A-I      intronic
chr17:62565350(-) A-I      intronic
chr17:62565356(-) A-I      intronic
chr17:62633750(-) A-I      intronic
chr17:62633326(-) A-I      intronic
chr17:62631313(-) A-I      intronic
chr17:62631323(-) A-I      intronic
chr17:62632372(-) A-I      intronic
chr17:62632652(-) A-I      intronic
chr17:62633317(-) A-I      intronic
chr17:62633446(-) A-I      intronic
chr17:62633516(-) A-I      intronic
chr17:62633799(-) A-I      intronic
chr17:62633864(-) A-I      intronic
chr17:62633895(-) A-I      intronic
chr17:62634175(-) A-I      intronic
chr17:62565372(-) A-I      intronic
chr17:62571484(-) A-I      intronic
chr17:62571502(-) A-I      intronic
chr17:62571527(-) A-I      intronic
chr17:62571552(-) A-I      intronic
chr17:62634181(-) A-I      intronic
chr17:62634289(-) A-I      intronic
chr17:62634397(-) A-I      intronic
chr17:62634473(-) A-I      intronic
chr17:62634479(-) A-I      intronic
chr17:62634500(-) A-I      intronic
chr17:62634546(-) A-I      intronic
chr17:62634561(-) A-I      intronic
chr17:62634565(-) A-I      intronic
chr17:62634591(-) A-I      intronic
chr17:62635573(-) A-I      intronic
chr17:62648716(-) A-I      intronic
chr17:62648721(-) A-I      intronic
chr17:62648769(-) A-I      intronic
chr17:62648781(-) A-I      intronic
chr17:62648782(-) A-I      intronic
chr17:62648805(-) A-I      intronic
chr17:62648836(-) A-I      intronic
chr17:62635586(-) A-I      intronic
chr17:62638062(-) A-I      intronic
chr17:62638096(-) A-I      intronic
chr17:62650731(-) A-I      intronic
chr17:62651504(-) A-I      intronic
chr17:62638107(-) A-I      intronic
chr17:62638152(-) A-I      intronic
chr17:62640007(-) A-I      intronic
chr17:62651522(-) A-I      intronic
chr17:62651569(-) A-I      intronic
chr17:62651579(-) A-I      intronic
chr17:62651589(-) A-I      intronic
chr17:62651889(-) A-I      intronic
chr17:62651930(-) A-I      intronic
chr17:62654256(-) A-I      intronic
chr17:62654306(-) A-I      intronic
chr17:62654309(-) A-I      intronic
chr17:62640077(-) A-I      intronic
chr17:62640082(-) A-I      intronic
chr17:62640112(-) A-I      intronic
chr17:62640137(-) A-I      intronic
chr17:62640138(-) A-I      intronic
chr17:62640171(-) A-I      intronic
chr17:62640252(-) A-I      intronic
chr17:62640255(-) A-I      intronic
chr17:62640256(-) A-I      intronic
chr17:62640370(-) A-I      intronic
chr17:62641559(-) A-I      intronic
chr17:62641675(-) A-I      intronic
chr17:62641857(-) A-I      intronic
chr17:62641873(-) A-I      intronic
chr17:62642227(-) A-I      intronic
chr17:62642281(-) A-I      intronic
chr17:62642322(-) A-I      intronic
chr17:62642348(-) A-I      intronic
chr17:62642366(-) A-I      intronic
chr17:62642377(-) A-I      intronic
chr17:62642378(-) A-I      intronic
chr17:62642397(-) A-I      intronic
chr17:62642403(-) A-I      intronic
chr17:62642426(-) A-I      intronic
chr17:62642689(-) A-I      intronic
chr17:62643624(-) A-I      intronic
chr17:62643633(-) A-I      intronic
chr17:62643953(-) A-I      intronic
chr17:62644114(-) A-I      intronic
chr17:62644735(-) A-I      intronic
chr17:62644768(-) A-I      intronic
chr17:62644830(-) A-I      intronic
chr17:62645814(-) A-I      intronic
chr17:62646862(-) A-I      intronic
chr17:62646872(-) A-I      intronic
chr17:62647113(-) A-I      intronic
chr17:62647158(-) A-I      intronic
chr17:62647203(-) A-I      intronic
chr17:62647207(-) A-I      intronic
chr17:62647252(-) A-I      intronic
chr17:62647472(-) A-I      intronic
chr17:62647510(-) A-I      intronic
chr17:62647578(-) A-I      intronic
chr17:62640084(-) A-I      intronic
chr17:62544622(-) A-I      intronic
chr17:62544634(-) A-I      intronic
chr17:62544643(-) A-I      intronic
chr17:62544685(-) A-I      intronic
chr17:62544722(-) A-I      intronic
chr17:62544773(-) A-I      intronic
chr17:62545157(-) A-I      intronic
chr17:62545180(-) A-I      intronic
chr17:62545840(-) A-I      intronic
chr17:62546639(-) A-I      intronic
chr17:62546729(-) A-I      intronic
chr17:62546732(-) A-I      intronic
chr17:62546798(-) A-I      intronic
chr17:62549023(-) A-I      intronic
chr17:62549073(-) A-I      intronic
chr17:62549390(-) A-I      intronic
chr17:62549542(-) A-I      intronic
chr17:62555509(-) A-I      intronic
chr17:62555706(-) A-I      intronic
chr17:62556182(-) A-I      intronic
chr17:62557943(-) A-I      intronic
chr17:62557947(-) A-I      intronic
chr17:62572066(-) A-I      intronic
chr17:62572126(-) A-I      intronic
chr17:62572130(-) A-I      intronic
chr17:62572140(-) A-I      intronic
chr17:62572145(-) A-I      intronic
chr17:62572174(-) A-I      intronic
chr17:62572199(-) A-I      intronic
chr17:62572211(-) A-I      intronic
chr17:62572261(-) A-I      intronic
chr17:62572277(-) A-I      intronic
chr17:62572666(-) A-I      intronic
chr17:62572670(-) A-I      intronic
chr17:62572682(-) A-I      intronic
chr17:62572736(-) A-I      intronic
chr17:62572749(-) A-I      intronic
chr17:62573034(-) A-I      intronic
chr17:62573056(-) A-I      intronic
chr17:62573061(-) A-I      intronic
chr17:62573112(-) A-I      intronic
chr17:62573790(-) A-I      intronic
chr17:62574175(-) A-I      intronic
chr17:62574196(-) A-I      intronic
chr17:62574252(-) A-I      intronic
chr17:62574267(-) A-I      intronic
chr17:62578838(-) A-I      intronic
chr17:62578841(-) A-I      intronic
chr17:62579084(-) A-I      intronic
chr17:62580224(-) A-I      intronic
chr17:62565337(-) A-I      intronic
chr17:62583085(-) A-I      intronic
chr17:62583090(-) A-I      intronic
chr17:62583300(-) A-I      intronic
chr17:62586533(-) A-I      intronic
chr17:62608680(-) A-I      intronic
chr17:62608729(-) A-I      intronic
chr17:62612076(-) A-I      intronic
chr17:62612080(-) A-I      intronic
chr17:62612149(-) A-I      intronic
chr17:62612534(-) A-I      intronic
chr17:62612539(-) A-I      intronic
chr17:62612601(-) A-I      intronic
chr17:62612716(-) A-I      intronic
chr17:62620447(-) A-I      intronic
chr17:62620449(-) A-I      intronic
chr17:62558061(-) A-I      intronic
chr17:62563203(-) A-I      intronic
chr17:62563884(-) A-I      intronic
chr17:62563898(-) A-I      intronic
chr17:62563916(-) A-I      intronic
chr17:62564000(-) A-I      intronic
chr17:62564024(-) A-I      intronic
chr17:62564110(-) A-I      intronic
chr17:62564162(-) A-I      intronic
chr17:62564167(-) A-I      intronic
chr17:62620482(-) A-I      intronic
chr17:62620492(-) A-I      intronic
chr17:62620589(-) A-I      intronic
chr17:62620590(-) A-I      intronic
chr17:62620860(-) A-I      intronic
chr17:62622688(-) A-I      intronic
chr17:62622718(-) A-I      intronic
chr17:62622732(-) A-I      intronic
chr17:62622794(-) A-I      intronic
chr17:62622837(-) A-I      intronic
chr17:62623329(-) A-I      intronic
chr17:62623490(-) A-I      intronic
chr17:62625540(-) A-I      intronic
chr17:62625570(-) A-I      intronic
chr17:62628228(-) A-I      intronic
chr17:62628276(-) A-I      intronic
chr17:62628290(-) A-I      intronic
chr17:62628295(-) A-I      intronic
chr17:62628319(-) A-I      intronic
chr17:62629167(-) A-I      intronic
chr17:62629305(-) A-I      intronic
chr17:62629341(-) A-I      intronic
chr17:62629344(-) A-I      intronic
chr17:62629352(-) A-I      intronic
chr17:62583065(-) A-I      intronic
chr17:62613860(-) A-I      intronic
chr17:62558704(-) A-I      intronic
chr17:62572317(-) A-I      intronic
chr17:62549438(-) A-I      intronic
chr17:62641862(-) A-I      intronic
chr17:62564169(-) A-I      intronic
chr17:62633846(-) A-I      intronic
chr17:62555549(-) A-I      intronic
chr17:62564068(-) A-I      intronic
chr17:62625426(-) A-I      intronic
chr17:62565238(-) A-I      intronic
chr17:62573771(-) A-I      intronic
chr17:62633820(-) A-I      intronic
chr17:62631227(-) A-I      intronic
chr17:62545236(-) A-I      intronic
chr17:62565255(-) A-I      intronic
chr17:62640117(-) A-I      intronic
chr17:62632529(-) A-I      intronic
chr17:62642640(-) A-I      intronic
chr17:62651609(-) A-I      intronic
chr17:62571436(-) A-I      intronic
chr17:62633954(-) A-I      intronic
chr17:62640864(-) A-I      intronic
chr17:62633767(-) A-I      intronic
chr17:62564035(-) A-I      intronic
chr17:62644088(-) A-I      intronic
chr17:62565073(-) A-I      intronic
chr17:62640466(-) A-I      intronic
chr17:62625500(-) A-I      intronic
chr17:62640081(-) A-I      intronic
chr17:62648808(-) A-I      intronic
chr17:62572735(-) A-I      intronic
chr17:62641602(-) A-I      intronic
chr17:62564136(-) A-I      intronic
chr17:62632639(-) A-I      intronic
chr17:62544536(-) A-I      intronic
chr17:62632845(-) A-I      intronic
chr17:62648807(-) A-I      intronic
chr17:62644778(-) A-I      intronic
chr17:62640355(-) A-I      intronic
chr17:62646731(-) A-I      intronic
chr17:62556257(-) A-I      intronic
chr17:62634357(-) A-I      intronic
chr17:62556143(-) A-I      intronic
chr17:62633810(-) A-I      intronic
chr17:62622872(-) A-I      intronic
chr17:62620873(-) A-I      intronic
chr17:62638167(-) A-I      intronic
chr17:62635613(-) A-I      intronic
chr17:62604020(-) A-I      intronic
chr17:62564381(-) A-I      intronic
chr17:62642421(-) A-I      intronic
chr17:62651650(-) A-I      intronic
chr17:62572185(-) A-I      intronic
chr17:62573825(-) A-I      intronic
chr17:62642665(-) A-I      intronic
chr17:62571386(-) A-I      intronic
chr17:62647164(-) A-I      intronic
chr17:62646786(-) A-I      intronic
chr17:62555469(-) A-I      intronic
chr17:62555628(-) A-I      intronic
chr17:62646769(-) A-I      intronic
chr17:62644058(-) A-I      intronic
chr17:62563897(-) A-I      intronic
chr17:62544781(-) A-I      intronic
chr17:62547310(-) A-I      intronic
chr17:62629331(-) A-I      intronic
chr17:62640108(-) A-I      intronic
chr17:62634192(-) A-I      intronic
chr17:62634312(-) A-I      intronic
chr17:62565274(-) A-I      intronic
chr17:62556217(-) A-I      intronic
chr17:62548918(-) A-I      intronic
chr17:62571410(-) A-I      intronic
chr17:62623428(-) A-I      intronic
chr17:62646428(-) A-I      intronic
chr17:62612737(-) A-I      intronic
chr17:62648831(-) A-I      intronic
chr17:62633913(-) A-I      intronic
chr17:62651603(-) A-I      intronic
chr17:62633760(-) A-I      intronic
chr17:62640537(-) A-I      intronic
chr17:62642781(-) A-I      intronic
chr17:62641100(-) A-I      intronic
chr17:62644092(-) A-I      intronic
chr17:62632566(-) A-I      intronic
chr17:62612086(-) A-I      intronic
chr17:62622615(-) A-I      intronic
chr17:62638981(-) A-I      intronic
chr17:62632340(-) A-I      intronic
chr17:62565172(-) A-I      intronic
chr17:62625447(-) A-I      intronic
chr17:62572642(-) A-I      intronic
chr17:62651540(-) A-I      intronic
chr17:62642321(-) A-I      intronic
chr17:62623466(-) A-I      intronic
chr17:62651514(-) A-I      intronic
chr17:62651045(-) A-I      intronic
chr17:62623397(-) A-I      intronic
chr17:62642280(-) A-I      intronic
chr17:62646405(-) A-I      intronic
chr17:62642634(-) A-I      intronic
chr17:62580703(-) A-I      intronic
chr17:62564267(-) A-I      intronic
chr17:62641863(-) A-I      intronic
chr17:62622805(-) A-I      intronic
chr17:62564100(-) A-I      intronic
chr17:62622799(-) A-I      intronic
chr17:62613641(-) A-I      intronic
chr17:62565306(-) A-I      intronic
chr17:62629253(-) A-I      intronic
chr17:62640262(-) A-I      intronic
chr17:62545520(-) A-I      intronic
chr17:62648754(-) A-I      intronic
chr17:62651632(-) A-I      intronic
chr17:62584854(-) A-I      intronic
chr17:62544670(-) A-I      intronic
chr17:62632352(-) A-I      intronic
chr17:62633302(-) A-I      intronic
chr17:62549460(-) A-I      intronic
chr17:62641079(-) A-I      intronic
chr17:62644721(-) A-I      intronic
chr17:62643957(-) A-I      intronic
chr17:62622858(-) A-I      intronic
chr17:62612930(-) A-I      intronic
chr17:62622818(-) A-I      intronic
chr17:62544779(-) A-I      intronic
chr17:62622759(-) A-I      intronic
chr17:62648822(-) A-I      intronic
chr17:62642694(-) A-I      intronic
chr17:62558769(-) A-I      intronic
chr17:62644671(-) A-I      intronic
chr17:62622676(-) A-I      intronic
chr17:62555590(-) A-I      intronic
chr17:62639010(-) A-I      intronic
chr17:62634186(-) A-I      intronic
chr17:62556051(-) A-I      intronic
chr17:62642733(-) A-I      intronic
chr17:62612000(-) A-I      intronic
chr17:62577897(-) A-I      intronic
chr17:62632663(-) A-I      intronic
chr17:62544603(-) A-I      intronic
chr17:62544694(-) A-I      intronic
chr17:62646427(-) A-I      intronic
chr17:62632599(-) A-I      intronic
chr17:62620855(-) A-I      intronic
chr17:62644098(-) A-I      intronic
chr17:62632350(-) A-I      intronic
chr17:62649742(-) A-I      intronic
chr17:62564383(-) A-I      intronic
chr17:62573911(-) A-I      intronic
chr17:62634613(-) A-I      intronic
chr17:62574348(-) A-I      intronic
chr17:62564380(-) A-I      intronic
chr17:62634363(-) A-I      intronic
chr17:62648786(-) A-I      intronic
chr17:62641674(-) A-I      intronic
chr17:62635583(-) A-I      intronic
chr17:62572175(-) A-I      intronic
chr17:62635612(-) A-I      intronic
chr17:62647118(-) A-I      intronic
chr17:62545662(-) A-I      intronic
chr17:62634321(-) A-I      intronic
chr17:62641853(-) A-I      intronic
chr17:62573761(-) A-I      intronic
chr17:62640638(-) A-I      intronic
chr17:62564048(-) A-I      intronic
chr17:62638206(-) A-I      intronic
chr17:62573992(-) A-I      intronic
chr17:62633409(-) A-I      intronic
chr17:62563056(-) A-I      intronic
chr17:62640073(-) A-I      intronic
chr17:62629144(-) A-I      intronic
chr17:62565261(-) A-I      intronic
chr17:62612943(-) A-I      intronic
chr17:62646932(-) A-I      intronic
chr17:62558700(-) A-I      intronic
chr17:62638138(-) A-I      intronic
chr17:62544688(-) A-I      intronic
chr17:62555548(-) A-I      intronic
chr17:62633714(-) A-I      intronic
chr17:62565252(-) A-I      intronic
chr17:62544602(-) A-I      intronic
chr17:62612968(-) A-I      intronic
chr17:62649689(-) A-I      intronic
chr17:62645960(-) A-I      intronic
chr17:62629217(-) A-I      intronic
chr17:62650994(-) A-I      intronic
chr17:62640330(-) A-I      intronic
chr17:62564932(-) A-I      intronic
chr17:62613087(-) A-I      intronic
chr17:62545791(-) A-I      intronic
chr17:62572768(-) A-I      intronic
chr17:62565157(-) A-I      intronic
chr17:62565224(-) A-I      intronic
chr17:62573969(-) A-I      intronic
chr17:62572310(-) A-I      intronic
chr17:62640245(-) A-I      intronic
chr17:62641824(-) A-I      intronic
chr17:62648890(-) A-I      intronic
chr17:62549457(-) A-I      intronic
chr17:62641601(-) A-I      intronic
chr17:62633736(-) A-I      intronic
chr17:62563249(-) A-I      intronic
chr17:62638104(-) A-I      intronic
chr17:62633525(-) A-I      intronic
chr17:62572744(-) A-I      intronic
chr17:62651513(-) A-I      intronic
chr17:62651577(-) A-I      intronic
chr17:62564398(-) A-I      intronic
chr17:62633382(-) A-I      intronic
chr17:62571383(-) A-I      intronic
chr17:62636782(-) A-I      intronic
chr17:62632638(-) A-I      intronic
chr17:62651982(-) A-I      intronic
chr17:62633355(-) A-I      intronic
chr17:62651520(-) A-I      intronic
chr17:62634372(-) A-I      intronic
chr17:62580353(-) A-I      intronic
chr17:62625436(-) A-I      intronic
chr17:62572725(-) A-I      intronic
chr17:62583279(-) A-I      intronic
chr17:62544752(-) A-I      intronic
chr17:62636915(-) A-I      intronic
chr17:62612171(-) A-I      intronic
chr17:62556004(-) A-I      intronic
chr17:62613859(-) A-I      intronic
chr17:62564902(-) A-I      intronic
chr17:62651485(-) A-I      intronic
chr17:62640631(-) A-I      intronic
chr17:62556035(-) A-I      intronic
chr17:62626182(-) A-I      intronic
chr17:62636913(-) A-I      intronic
chr17:62625402(-) A-I      intronic
chr17:62644869(-) A-I      intronic
chr17:62642459(-) A-I      intronic
chr17:62649656(-) A-I      intronic
chr17:62633787(-) A-I      intronic
chr17:62645716(-) A-I      intronic
chr17:62640602(-) A-I      intronic
chr17:62563968(-) A-I      intronic
chr17:62563868(-) A-I      intronic
chr17:62564044(-) A-I      intronic
chr17:62651484(-) A-I      intronic
chr17:62651076(-) A-I      intronic
chr17:62649762(-) A-I      intronic
chr17:62642695(-) A-I      intronic
chr17:62634439(-) A-I      intronic
chr17:62572183(-) A-I      intronic
chr17:62632464(-) A-I      intronic
chr17:62565226(-) A-I      intronic
chr17:62651535(-) A-I      intronic
chr17:62642232(-) A-I      intronic
chr17:62556040(-) A-I      intronic
chr17:62642324(-) A-I      intronic
chr17:62572260(-) A-I      intronic
chr17:62564245(-) A-I      intronic
chr17:62579203(-) A-I      intronic
chr17:62580225(-) A-I      intronic
chr17:62580324(-) A-I      intronic
chr17:62628247(-) A-I      intronic
chr17:62639077(-) A-I      intronic
chr17:62564223(-) A-I      intronic
chr17:62614300(-) A-I      intronic
chr17:62564885(-) A-I      intronic
chr17:62579261(-) A-I      intronic
chr17:62546641(-) A-I      intronic
chr17:62563248(-) A-I      intronic
chr17:62641006(-) A-I      intronic
chr17:62650847(-) A-I      intronic
chr17:62630150(-) A-I      intronic
chr17:62629326(-) A-I      intronic
chr17:62632573(-) A-I      intronic
chr17:62547312(-) A-I      intronic
chr17:62631279(-) A-I      intronic
chr17:62556022(-) A-I      intronic
chr17:62641588(-) A-I      intronic
chr17:62565296(-) A-I      intronic
chr17:62563074(-) A-I      intronic
chr17:62564954(-) A-I      intronic
chr17:62634299(-) A-I      intronic
chr17:62563855(-) A-I      intronic
chr17:62563906(-) A-I      intronic
chr17:62646354(-) A-I      intronic
chr17:62628256(-) A-I      intronic
chr17:62555648(-) A-I      intronic
chr17:62641069(-) A-I      intronic
chr17:62644807(-) A-I      intronic
chr17:62644808(-) A-I      intronic
chr17:62633075(-) A-I      intronic
chr17:62563861(-) A-I      intronic
chr17:62634286(-) A-I      intronic
chr17:62564903(-) A-I      intronic
chr17:62622757(-) A-I      intronic
chr17:62564335(-) A-I      intronic
chr17:62642353(-) A-I      intronic
chr17:62544795(-) A-I      intronic
chr17:62638063(-) A-I      intronic
chr17:62620859(-) A-I      intronic
chr17:62632609(-) A-I      intronic
chr17:62564147(-) A-I      intronic
chr17:62633517(-) A-I      intronic
chr17:62640952(-) A-I      intronic
chr17:62622277(-) A-I      intronic
chr17:62613833(-) A-I      intronic
chr17:62641840(-) A-I      intronic
chr17:62572060(-) A-I      intronic
chr17:62640458(-) A-I      intronic
chr17:62633797(-) A-I      intronic
chr17:62641681(-) A-I      intronic
chr17:62573081(-) A-I      intronic
chr17:62620820(-) A-I      intronic
chr17:62641004(-) A-I      intronic
chr17:62577906(-) A-I      intronic
chr17:62644803(-) A-I      intronic
chr17:62622845(-) A-I      intronic
chr17:62649707(-) A-I      intronic
chr17:62547274(-) A-I      intronic
chr17:62565143(-) A-I      intronic
chr17:62639051(-) A-I      intronic
chr17:62580175(-) A-I      intronic
chr17:62559998(-) A-I      intronic
chr17:62564244(-) A-I      intronic
chr17:62633412(-) A-I      intronic
chr17:62549004(-) A-I      intronic
chr17:62646414(-) A-I      intronic
chr17:62565159(-) A-I      intronic
chr17:62647206(-) A-I      intronic
chr17:62572263(-) A-I      intronic
chr17:62565171(-) A-I      intronic
chr17:62565199(-) A-I      intronic
chr17:62563127(-) A-I      intronic
chr17:62651046(-) A-I      intronic
chr17:62584862(-) A-I      intronic
chr17:62549541(-) A-I      intronic
chr17:62572213(-) A-I      intronic
chr17:62572266(-) A-I      intronic
chr17:62645789(-) A-I      intronic
chr17:62572730(-) A-I      intronic
chr17:62641564(-) A-I      intronic
chr17:62563925(-) A-I      intronic
chr17:62545308(-) A-I      intronic
chr17:62580508(-) A-I      intronic
chr17:62556337(-) A-I      intronic
chr17:62613077(-) A-I      intronic
chr17:62580704(-) A-I      intronic
chr17:62645840(-) A-I      intronic
chr17:62549360(-) A-I      intronic
chr17:62580161(-) A-I      intronic
chr17:62545331(-) A-I      intronic
chr17:62643785(-) A-I      intronic
chr17:62563936(-) A-I      intronic
chr17:62622798(-) A-I      intronic
chr17:62620485(-) A-I      intronic
chr17:62565311(-) A-I      intronic
chr17:62651472(-) A-I      intronic
chr17:62641667(-) A-I      intronic
chr17:62571409(-) A-I      intronic
chr17:62620512(-) A-I      intronic
chr17:62642724(-) A-I      intronic
chr17:62622834(-) A-I      intronic
chr17:62642633(-) A-I      intronic
chr17:62629293(-) A-I      intronic
chr17:62623370(-) A-I      intronic
chr17:62578048(-) A-I      intronic
chr17:62545145(-) A-I      intronic
chr17:62634280(-) A-I      intronic
chr17:62555701(-) A-I      intronic
chr17:62634600(-) A-I      intronic
chr17:62565380(-) A-I      intronic
chr17:62544548(-) A-I      intronic
chr17:62577806(-) A-I      intronic
chr17:62563869(-) A-I      intronic
chr17:62633875(-) A-I      intronic
chr17:62631201(-) A-I      intronic
chr17:62623371(-) A-I      intronic
chr17:62565319(-) A-I      intronic
chr17:62613154(-) A-I      intronic
chr17:62640540(-) A-I      intronic
chr17:62623438(-) A-I      intronic
chr17:62628255(-) A-I      intronic
chr17:62612194(-) A-I      intronic
chr17:62640191(-) A-I      intronic
chr17:62651608(-) A-I      intronic
chr17:62647258(-) A-I      intronic
chr17:62642456(-) A-I      intronic
chr17:62563126(-) A-I      intronic
chr17:62623413(-) A-I      intronic
chr17:62641643(-) A-I      intronic
chr17:62612175(-) A-I      intronic
chr17:62612152(-) A-I      intronic
chr17:62635422(-) A-I      intronic
chr17:62571550(-) A-I      intronic
chr17:62651891(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED SMURF2
chr17:62564932(-) A-I intron -    22327324
chr17:62641559(-) A-I intron -    21960545
chr17:62547245(-) T-C intron -    22484847
chr17:62564136(-) A-G intron -    22484847
chr17:62564147(-) A-G intron -    22484847
chr17:62564169(-) A-G intron -    22484847
chr17:62564932(-) A-G intron -    22484847
chr17:62571386(-) A-G intron -    22484847
chr17:62571409(-) A-G intron -    22484847
chr17:62633517(-) A-G intron -    22484847
chr17:62633525(-) A-G intron -    22484847
chr17:62644808(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase SMURF2
chr17:62541526-62541527(-) m6A 3'UTR       27773535
chr17:62541583-62541584(-) m6A 3'UTR       27773535//22608085
chr17:62541591-62541592(-) m6A 3'UTR       27773535//22608085
chr17:62541654-62541655(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//27773535//22608085
chr17:62541714-62541715(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr17:62541728-62541729(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr17:62541805-62541806(-) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr17:62541823-62541824(-) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr17:62541868-62541869(-) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr17:62541941-62541942(-) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr17:62541988-62541989(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr17:62542050-62542051(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr17:62542439-62542440(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//27773535
chr17:62576923-62576924(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       27773535
chr17:62576945-62576946(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863//27773535
chr17:62577015-62577016(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863//27773535
chr17:62577035-62577036(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863//27773535
chr17:62577052-62577053(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863//27773535
chr17:62577078-62577079(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       27773535
chr17:62579603-62579604(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       27773535
chr17:62579617-62579618(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       27773535
chr17:62579645-62579646(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       27773535
chr17:62582239-62582240(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       27773535
chr17:62582250-62582251(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       27773535
chr17:62582269-62582270(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       27773535
chr17:62587211-62587212(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       27773535
chr17:62587244-62587245(-) m6A 3'UTR//CDS//intron       27773535
chr17:62658125-62658126(-) m6A 5'UTR       27773536

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-3121-3p
Exosome Plasma     23663360
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Mesenchymal stem cells     -
SMURF2
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     -
Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-3121-3p
Interactor2: SMURF2

Evidence Support:


Weak-Evidence PAR-CLIP
Support Database ViRBase

References:


PMID 22291592 Target region 3'UTR
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells Interactor2 expression None
Description We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.

Starting a new search, please wait ...