Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00072048

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-3121-3p:  MIMAT0014983          VEZT:  NM_001352107     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-3121-3p	VEZT
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014983	55591
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	VEZATIN

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-3121-3p	rs1006143795 chr1:180438334    T/C rs778817728 chr1:180438323    T/C rs887772082 chr1:180438327    C/T rs911596096 chr1:180438331    G/C

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	VEZT	chr12:95619780(+) A-I      intronic chr12:95666689(+) A-I      intronic chr12:95666665(+) A-I      intronic chr12:95613969(+) A-I      intronic chr12:95679908(+) A-I      intronic chr12:95679887(+) A-I      intronic chr12:95646701(+) A-I      intronic chr12:95619791(+) A-I      intronic chr12:95666664(+) A-I      intronic chr12:95646729(+) A-I      intronic chr12:95668039(+) A-I      intronic chr12:95619796(+) A-I      intronic chr12:95648226(+) A-I      intronic chr12:95679941(+) A-I      intronic chr12:95679930(+) A-I      intronic chr12:95665761(+) A-I      intronic chr12:95646682(+) A-I      intronic chr12:95679910(+) A-I      intronic chr12:95619805(+) A-I      intronic chr12:95646669(+) A-I      intronic chr12:95646687(+) A-I      intronic chr12:95646691(+) A-I      intronic chr12:95648264(+) A-I      intronic chr12:95687897(+) A-I      intronic chr12:95687826(+) A-I      intronic chr12:95648142(+) A-I      intronic chr12:95666721(+) A-I      intronic chr12:95687804(+) A-I      intronic chr12:95687794(+) A-I      intronic chr12:95658465(+) A-I      intronic chr12:95658442(+) A-I      intronic chr12:95687790(+) A-I      intronic chr12:95648154(+) A-I      intronic chr12:95648043(+) A-I      intronic chr12:95687765(+) A-I      intronic chr12:95687764(+) A-I      intronic chr12:95687759(+) A-I      intronic chr12:95684777(+) A-I      intronic chr12:95683143(+) A-I      intronic chr12:95683121(+) A-I      intronic chr12:95658313(+) A-I      intronic chr12:95683114(+) A-I      intronic chr12:95683105(+) A-I      intronic chr12:95681189(+) A-I      intronic chr12:95681127(+) A-I      intronic chr12:95679202(+) A-I      intronic chr12:95679077(+) A-I      intronic chr12:95679029(+) A-I      intronic chr12:95675422(+) A-I      intronic chr12:95675208(+) A-I      intronic chr12:95675203(+) A-I      intronic chr12:95675100(+) A-I      intronic chr12:95673494(+) A-I      intronic chr12:95648004(+) A-I      intronic chr12:95646661(+) A-I      intronic chr12:95683118(+) A-I      intronic chr12:95670097(+) A-I      intronic chr12:95646647(+) A-I      intronic chr12:95646583(+) A-I      intronic chr12:95646581(+) A-I      intronic chr12:95646477(+) A-I      intronic chr12:95644904(+) A-I      intronic chr12:95644268(+) A-I      intronic chr12:95644218(+) A-I      intronic chr12:95644213(+) A-I      intronic chr12:95644179(+) A-I      intronic chr12:95644172(+) A-I      intronic chr12:95644159(+) A-I      intronic chr12:95639704(+) A-I      intronic chr12:95639649(+) A-I      intronic chr12:95639622(+) A-I      intronic chr12:95639514(+) A-I      intronic chr12:95669285(+) A-I      intronic chr12:95636223(+) A-I      intronic chr12:95636070(+) A-I      intronic chr12:95635220(+) A-I      intronic chr12:95634958(+) A-I      intronic chr12:95634950(+) A-I      intronic chr12:95634881(+) A-I      intronic chr12:95630583(+) A-I      intronic chr12:95630560(+) A-I      intronic chr12:95630464(+) A-I      intronic chr12:95630372(+) A-I      intronic chr12:95627425(+) A-I      intronic chr12:95627331(+) A-I      intronic chr12:95638420(+) A-I      intronic chr12:95627288(+) A-I      intronic chr12:95626641(+) A-I      intronic chr12:95624268(+) A-I      intronic chr12:95618189(+) A-I      intronic chr12:95669200(+) A-I      intronic chr12:95613967(+) A-I      intronic chr12:95668131(+) A-I      intronic chr12:95668016(+) A-I      intronic chr12:95649490(+) A-I      intronic chr12:95666746(+) A-I      intronic chr12:95666745(+) A-I      intronic chr12:95666733(+) A-I      intronic chr12:95627328(+) A-I      intronic chr12:95675423(+) A-I      intronic chr12:95679135(+) A-I      intronic chr12:95657323(+) A-I      intronic chr12:95658447(+) A-I      intronic chr12:95633625(+) A-I      intronic chr12:95621001(+) A-I      intronic chr12:95685740(+) A-I      intronic chr12:95668225(+) A-I      intronic chr12:95646580(+) A-I      intronic chr12:95648252(+) A-I      intronic chr12:95623802(+) A-I      intronic chr12:95619764(+) A-I      intronic chr12:95648216(+) A-I      intronic chr12:95673507(+) A-I      intronic chr12:95647656(+) A-I      intronic chr12:95630637(+) A-I      intronic chr12:95648262(+) A-I      intronic chr12:95638387(+) A-I      intronic chr12:95642532(+) A-I      intronic chr12:95685850(+) A-I      intronic chr12:95657170(+) A-I      intronic chr12:95647637(+) A-I      intronic chr12:95621137(+) A-I      intronic chr12:95638388(+) A-I      intronic chr12:95679067(+) A-I      intronic chr12:95684952(+) A-I      intronic chr12:95626675(+) A-I      intronic chr12:95618160(+) A-I      intronic chr12:95621011(+) A-I      intronic chr12:95683099(+) A-I      intronic chr12:95675157(+) A-I      intronic chr12:95635246(+) A-I      intronic chr12:95621030(+) A-I      intronic chr12:95675174(+) A-I      intronic chr12:95647989(+) A-I      intronic chr12:95646594(+) A-I      intronic chr12:95618165(+) A-I      intronic chr12:95657325(+) A-I      intronic chr12:95648343(+) A-I      intronic chr12:95630504(+) A-I      intronic chr12:95634830(+) A-I      intronic chr12:95670095(+) A-I      intronic chr12:95630476(+) A-I      intronic chr12:95687688(+) A-I      intronic chr12:95639527(+) A-I      intronic chr12:95621379(+) A-I      intronic chr12:95634935(+) A-I      intronic chr12:95647647(+) A-I      intronic chr12:95685668(+) A-I      intronic chr12:95630572(+) A-I      intronic chr12:95657210(+) A-I      intronic chr12:95657244(+) A-I      intronic chr12:95647780(+) A-I      intronic chr12:95670123(+) A-I      intronic chr12:95635288(+) A-I      intronic chr12:95686575(+) A-I      intronic chr12:95684959(+) A-I      intronic chr12:95646693(+) A-I      intronic chr12:95687751(+) A-I      intronic chr12:95666654(+) A-I      intronic chr12:95666557(+) A-I      intronic chr12:95669281(+) A-I      intronic chr12:95647990(+) A-I      intronic chr12:95630584(+) A-I      intronic chr12:95670073(+) A-I      intronic chr12:95636217(+) A-I      intronic chr12:95647620(+) A-I      intronic chr12:95633459(+) A-I      intronic chr12:95679099(+) A-I      intronic chr12:95646576(+) A-I      intronic chr12:95635297(+) A-I      intronic chr12:95639574(+) A-I      intronic chr12:95622560(+) A-I      intronic chr12:95636071(+) A-I      intronic chr12:95645030(+) A-I      intronic chr12:95661607(+) A-I      intronic chr12:95684783(+) A-I      intronic chr12:95657162(+) A-I      intronic chr12:95682748(+) A-I      intronic chr12:95626681(+) A-I      intronic chr12:95690731(+) A-I      intronic chr12:95622538(+) A-I      intronic chr12:95636090(+) A-I      intronic chr12:95648306(+) A-I      intronic chr12:95681289(+) A-I      intronic chr12:95623588(+) A-I      intronic chr12:95618141(+) A-I      intronic chr12:95658834(+) A-I      intronic chr12:95619684(+) A-I      intronic chr12:95642543(+) A-I      intronic chr12:95624257(+) A-I      intronic chr12:95630528(+) A-I      intronic chr12:95648182(+) A-I      intronic chr12:95678956(+) A-I      intronic chr12:95621036(+) A-I      intronic chr12:95639577(+) A-I      intronic chr12:95657248(+) A-I      intronic chr12:95678715(+) A-I      intronic chr12:95684827(+) A-I      intronic chr12:95685804(+) A-I      intronic chr12:95614073(+) A-I      intronic chr12:95684917(+) A-I      intronic chr12:95685591(+) A-I      intronic chr12:95639530(+) A-I      intronic chr12:95619790(+) A-I      intronic chr12:95669343(+) A-I      intronic chr12:95684927(+) A-I      intronic chr12:95619777(+) A-I      intronic chr12:95683072(+) A-I      intronic chr12:95647909(+) A-I      intronic chr12:95633648(+) A-I      intronic chr12:95647621(+) A-I      intronic chr12:95687695(+) A-I      intronic chr12:95658487(+) A-I      intronic chr12:95648189(+) A-I      intronic chr12:95670255(+) A-I      intronic chr12:95658820(+) A-I      intronic chr12:95648016(+) A-I      intronic chr12:95637040(+) A-I      intronic chr12:95675543(+) A-I      intronic chr12:95646463(+) A-I      intronic chr12:95624258(+) A-I      intronic chr12:95648223(+) A-I      intronic chr12:95638913(+) A-I      intronic chr12:95675464(+) A-I      intronic chr12:95684763(+) A-I      intronic chr12:95619212(+) A-I      intronic chr12:95636471(+) A-I      intronic chr12:95658306(+) A-I      intronic chr12:95637987(+) A-I      intronic chr12:95666681(+) A-I      intronic chr12:95626803(+) A-I      intronic chr12:95669220(+) A-I      intronic chr12:95644926(+) A-I      intronic chr12:95665835(+) A-I      intronic chr12:95639501(+) A-I      intronic chr12:95633466(+) A-I      intronic chr12:95637103(+) A-I      intronic chr12:95658339(+) A-I      intronic chr12:95679869(+) A-I      intronic chr12:95647776(+) A-I      intronic chr12:95678581(+) A-I      intronic chr12:95639699(+) A-I      intronic chr12:95623665(+) A-I      intronic chr12:95618113(+) A-I      intronic chr12:95687857(+) A-I      intronic chr12:95647883(+) A-I      intronic chr12:95614108(+) A-I      intronic chr12:95677990(+) A-I      intronic chr12:95626676(+) A-I      intronic chr12:95658266(+) A-I      intronic chr12:95668086(+) A-I      intronic chr12:95636570(+) A-I      intronic chr12:95642508(+) A-I      intronic chr12:95647857(+) A-I      intronic chr12:95636491(+) A-I      intronic chr12:95624287(+) A-I      intronic chr12:95647869(+) A-I      intronic chr12:95630625(+) A-I      intronic chr12:95647667(+) A-I      intronic chr12:95622518(+) A-I      intronic chr12:95658422(+) A-I      intronic chr12:95647643(+) A-I      intronic chr12:95675198(+) A-I      intronic chr12:95619792(+) A-I      intronic chr12:95679028(+) A-I      intronic chr12:95647618(+) A-I      intronic chr12:95673448(+) A-I      intronic chr12:95630573(+) A-I      intronic chr12:95647605(+) A-I      intronic chr12:95665839(+) A-I      intronic chr12:95630502(+) A-I      intronic chr12:95677970(+) A-I      intronic chr12:95647886(+) A-I      intronic chr12:95657298(+) A-I      intronic chr12:95678512(+) A-I      intronic chr12:95657217(+) A-I      intronic chr12:95619724(+) A-I      intronic chr12:95647896(+) A-I      intronic chr12:95633486(+) A-I      intronic chr12:95646508(+) A-I      intronic chr12:95630543(+) A-I      intronic chr12:95647861(+) A-I      intronic chr12:95684948(+) A-I      intronic chr12:95690734(+) A-I      intronic chr12:95675447(+) A-I      intronic chr12:95658340(+) A-I      intronic chr12:95685805(+) A-I      intronic chr12:95677974(+) A-I      intronic chr12:95657171(+) A-I      intronic chr12:95626756(+) A-I      intronic chr12:95628345(+) A-I      intronic chr12:95657227(+) A-I      intronic chr12:95684932(+) A-I      intronic chr12:95677983(+) A-I      intronic chr12:95638433(+) A-I      intronic chr12:95624217(+) A-I      intronic chr12:95619701(+) A-I      intronic chr12:95618161(+) A-I      intronic chr12:95648358(+) A-I      intronic chr12:95658448(+) A-I      intronic chr12:95622511(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	VEZT	chr12:95624217(+) A-I intron -    21960545 chr12:95636217(+) A-G intron -    22484847 chr12:95647780(+) A-G intron -    22484847 chr12:95658266(+) A-G intron -    22484847 chr12:95665835(+) A-G intron -    22484847 chr12:95675423(+) A-G intron -    22484847 chr12:95678956(+) A-G intron -    22484847 chr12:95677974(+) A-G intron -    22484847 chr12:95677983(+) A-G intron -    22484847 chr12:95677990(+) A-G intron -    22484847 chr12:95614073(+) A-G intron -    22484847 chr12:95614108(+) A-G intron -    22484847 chr12:95618113(+) A-G intron -    22484847 chr12:95618141(+) A-G intron -    22484847 chr12:95618160(+) A-G intron -    22484847 chr12:95619212(+) A-G intron -    22484847 chr12:95622511(+) A-G intron -    22484847 chr12:95622538(+) A-G intron -    22484847 chr12:95623802(+) A-G intron -    22484847 chr12:95624217(+) A-G intron -    22484847 chr12:95624257(+) A-G intron -    22484847 chr12:95624287(+) A-G intron -    22484847 chr12:95626675(+) A-G intron -    22484847 chr12:95626676(+) A-G intron -    22484847 chr12:95630502(+) A-G intron -    22484847 chr12:95630528(+) A-G intron -    22484847 chr12:95630543(+) A-G intron -    22484847 chr12:95630572(+) A-G intron -    22484847 chr12:95630573(+) A-G intron -    22484847 chr12:95633459(+) A-G intron -    22484847 chr12:95633466(+) A-G intron -    22484847 chr12:95633486(+) A-G intron -    22484847 chr12:95635297(+) A-G intron -    22484847 chr12:95636570(+) A-G intron -    22484847 chr12:95638388(+) A-G intron -    22484847 chr12:95638433(+) A-G intron -    22484847 chr12:95639527(+) A-G intron -    22484847 chr12:95639530(+) A-G intron -    22484847 chr12:95639574(+) A-G intron -    22484847 chr12:95639577(+) A-G intron -    22484847 chr12:95645030(+) A-G intron -    22484847 chr12:95646463(+) A-G intron -    22484847 chr12:95646508(+) A-G intron -    22484847 chr12:95647637(+) A-G intron -    22484847 chr12:95647776(+) A-G intron -    22484847 chr12:95647857(+) A-G intron -    22484847 chr12:95647869(+) A-G intron -    22484847 chr12:95647883(+) A-G intron -    22484847 chr12:95647989(+) A-G intron -    22484847 chr12:95648182(+) A-G intron -    22484847 chr12:95648189(+) A-G intron -    22484847 chr12:95648216(+) A-G intron -    22484847 chr12:95655280(+) T-C intron -    22484847 chr12:95657162(+) A-G intron -    22484847 chr12:95657171(+) A-G intron -    22484847 chr12:95658306(+) A-G intron -    22484847 chr12:95658339(+) A-G intron -    22484847 chr12:95658447(+) A-G intron -    22484847 chr12:95658448(+) A-G intron -    22484847 chr12:95658487(+) A-G intron -    22484847 chr12:95669220(+) A-G intron -    22484847 chr12:95670073(+) A-G intron -    22484847 chr12:95670095(+) A-G intron -    22484847 chr12:95670123(+) A-G intron -    22484847 chr12:95670255(+) A-G intron -    22484847 chr12:95673448(+) A-G intron -    22484847 chr12:95673507(+) A-G intron -    22484847 chr12:95675157(+) A-G intron -    22484847 chr12:95675198(+) A-G intron -    22484847 chr12:95675464(+) A-G intron -    22484847 chr12:95679099(+) A-G intron -    22484847 chr12:95681289(+) A-G intron -    22484847 chr12:95684763(+) A-G intron -    22484847 chr12:95684789(+) T-C intron -    22484847 chr12:95684932(+) A-G intron -    22484847 chr12:95685591(+) A-G intron -    22484847 chr12:95686624(+) T-C intron -    22484847 chr12:95687857(+) A-G intron -    22484847 chr12:95690641(+) G-A intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	VEZT	chr12:95611533-95611534(+) m6A 5'UTR//exon       24981863 chr12:95612160-95612161(+) m6A exon//intron       24981863 chr12:95637756-95637757(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:95637773-95637774(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:95645750-95645751(+) m6A 3'UTR//5'UTR//CDS//exon       24981863 chr12:95645758-95645759(+) m6A 3'UTR//5'UTR//CDS//exon       24981863 chr12:95645790-95645791(+) m6A 3'UTR//5'UTR//CDS//exon       24981863 chr12:95645813-95645814(+) m6A 3'UTR//5'UTR//CDS//exon       24981863 chr12:95660326-95660327(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       26404942 chr12:95660379-95660380(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       26404942 chr12:95663859-95663860(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       - chr12:95663908-95663909(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       - chr12:95676337-95676338(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24981863 chr12:95676357-95676358(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24981863 chr12:95681460-95681461(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       27773535 chr12:95681488-95681489(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       27773535 chr12:95681496-95681497(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       27773535 chr12:95681526-95681527(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       27773535 chr12:95681604-95681605(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       27773535 chr12:95688071-95688072(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       27773535 chr12:95688122-95688123(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       27773535 chr12:95689905-95689906(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24981863//26404942//27773535 chr12:95689915-95689916(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24981863//26404942//27773535 chr12:95690093-95690094(+) m6A exon//intron       24284625//27773535//22608085 chr12:95693859-95693860(+) m6A 3'UTR//exon//intron       - chr12:95693967-95693968(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr12:95693977-95693978(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr12:95693995-95693996(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:95694072-95694073(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:95694089-95694090(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:95694108-95694109(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:95694205-95694206(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr12:95694255-95694256(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr12:95694379-95694380(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr12:95694406-95694407(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr12:95694451-95694452(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr12:95694511-95694512(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr12:95694576-95694577(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:95694671-95694672(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085 chr12:95694680-95694681(+) Y 3'UTR//exon       26075521

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-3121-3p	Exosome Plasma     23663360 Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Mesenchymal stem cells     -
	VEZT	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-3121-3p
Interactor2: VEZT

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	None
Description	We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.