Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00070763

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-1276:  MIMAT0005930          TLK1:  NM_012290     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-1276	TLK1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0005930	9874
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	PKU-beta

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-1276	rs372186220 chr15:85770551    C/T rs759704230 chr15:85770557    A/G rs949716743 chr15:85770550    T/C rs1469123493 chr15:85770565    T/C rs34381260 chr15:85770563    CT/C rs34381260 chr15:85770563    CT/CTT rs750237476 chr15:85770564    T/C rs764239400 chr15:85770562    T/C rs769744052 chr15:85770560    G/A rs775843960 chr15:85770561    C/A rs775843960 chr15:85770561    C/T

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	TLK1	chr2:172021396(-) A-I      intronic chr2:172021395(-) A-I      intronic chr2:172021386(-) A-I      intronic chr2:172021374(-) A-I      intronic chr2:171930953(-) A-I      intronic chr2:171901807(-) A-I      intronic chr2:171929143(-) A-I      intronic chr2:171859290(-) A-I      intronic chr2:172021413(-) A-I      intronic chr2:171855471(-) A-I      intronic chr2:171893868(-) A-I      intronic chr2:171856345(-) A-I      intronic chr2:171855472(-) A-I      intronic chr2:171856384(-) A-I      intronic chr2:171895899(-) A-I      intronic chr2:171856383(-) A-I      intronic chr2:171930921(-) A-I      intronic chr2:171874984(-) A-I      intronic chr2:172021420(-) A-I      intronic chr2:171960642(-) A-I      intronic chr2:171897324(-) A-I      intronic chr2:171908701(-) A-I      intronic chr2:171910005(-) A-I      intronic chr2:171919612(-) A-I      intronic chr2:171919728(-) A-I      intronic chr2:171919734(-) A-I      intronic chr2:171924756(-) A-I      intronic chr2:171927860(-) A-I      intronic chr2:171927883(-) A-I      intronic chr2:171927926(-) A-I      intronic chr2:171927930(-) A-I      intronic chr2:171927936(-) A-I      intronic chr2:171927946(-) A-I      intronic chr2:171927975(-) A-I      intronic chr2:171927978(-) A-I      intronic chr2:171927993(-) A-I      intronic chr2:171928002(-) A-I      intronic chr2:171928849(-) A-I      intronic chr2:171929017(-) A-I      intronic chr2:171929024(-) A-I      intronic chr2:171929156(-) A-I      intronic chr2:171929191(-) A-I      intronic chr2:171930514(-) A-I      intronic chr2:171930583(-) A-I      intronic chr2:171930602(-) A-I      intronic chr2:171930628(-) A-I      intronic chr2:171930633(-) A-I      intronic chr2:171930657(-) A-I      intronic chr2:171930895(-) A-I      intronic chr2:171930919(-) A-I      intronic chr2:171930926(-) A-I      intronic chr2:171930946(-) A-I      intronic chr2:171930972(-) A-I      intronic chr2:171936621(-) A-I      intronic chr2:171936693(-) A-I      intronic chr2:171937255(-) A-I      intronic chr2:171945492(-) A-I      intronic chr2:171945514(-) A-I      intronic chr2:172008020(-) A-I      intronic chr2:171872916(-) A-I      intronic chr2:171945538(-) A-I      intronic chr2:171855457(-) A-I      intronic chr2:171856843(-) A-I      intronic chr2:171858376(-) A-I      intronic chr2:171945559(-) A-I      intronic chr2:171945560(-) A-I      intronic chr2:171945562(-) A-I      intronic chr2:171945569(-) A-I      intronic chr2:171951256(-) A-I      intronic chr2:171951279(-) A-I      intronic chr2:171951283(-) A-I      intronic chr2:171951289(-) A-I      intronic chr2:171951300(-) A-I      intronic chr2:171951342(-) A-I      intronic chr2:171951360(-) A-I      intronic chr2:171954178(-) A-I      intronic chr2:171954187(-) A-I      intronic chr2:171954190(-) A-I      intronic chr2:171954191(-) A-I      intronic chr2:171858423(-) A-I      intronic chr2:171858429(-) A-I      intronic chr2:171858492(-) A-I      intronic chr2:171858515(-) A-I      intronic chr2:171858845(-) A-I      intronic chr2:171858866(-) A-I      intronic chr2:171858869(-) A-I      intronic chr2:171859013(-) A-I      intronic chr2:171859420(-) A-I      intronic chr2:171860557(-) A-I      intronic chr2:171860666(-) A-I      intronic chr2:171860764(-) A-I      intronic chr2:171860766(-) A-I      intronic chr2:171861999(-) A-I      intronic chr2:171862196(-) A-I      intronic chr2:171869726(-) A-I      intronic chr2:171869736(-) A-I      intronic chr2:171872479(-) A-I      intronic chr2:171872550(-) A-I      intronic chr2:171872902(-) A-I      intronic chr2:171872911(-) A-I      intronic chr2:171872917(-) A-I      intronic chr2:171872935(-) A-I      intronic chr2:171876485(-) A-I      intronic chr2:171876537(-) A-I      intronic chr2:171877960(-) A-I      intronic chr2:171877961(-) A-I      intronic chr2:171878050(-) A-I      intronic chr2:171884410(-) A-I      intronic chr2:171954290(-) A-I      intronic chr2:171954316(-) A-I      intronic chr2:171954323(-) A-I      intronic chr2:171954353(-) A-I      intronic chr2:171954359(-) A-I      intronic chr2:171954394(-) A-I      intronic chr2:171960568(-) A-I      intronic chr2:171960569(-) A-I      intronic chr2:171960583(-) A-I      intronic chr2:171884586(-) A-I      intronic chr2:172008015(-) A-I      intronic chr2:172008014(-) A-I      intronic chr2:172007802(-) A-I      intronic chr2:172007722(-) A-I      intronic chr2:172007708(-) A-I      intronic chr2:172007674(-) A-I      intronic chr2:172005148(-) A-I      intronic chr2:171999871(-) A-I      intronic chr2:171884551(-) A-I      intronic chr2:171980275(-) A-I      intronic chr2:171980239(-) A-I      intronic chr2:171980226(-) A-I      intronic chr2:171980152(-) A-I      intronic chr2:171979930(-) A-I      intronic chr2:171979871(-) A-I      intronic chr2:171978708(-) A-I      intronic chr2:171978639(-) A-I      intronic chr2:171978568(-) A-I      intronic chr2:171978553(-) A-I      intronic chr2:171978549(-) A-I      intronic chr2:171978525(-) A-I      intronic chr2:171977955(-) A-I      intronic chr2:171977946(-) A-I      intronic chr2:171977930(-) A-I      intronic chr2:171977924(-) A-I      intronic chr2:171886353(-) A-I      intronic chr2:171977885(-) A-I      intronic chr2:171977876(-) A-I      intronic chr2:171977870(-) A-I      intronic chr2:171897258(-) A-I      intronic chr2:171897075(-) A-I      intronic chr2:171973206(-) A-I      intronic chr2:171886420(-) A-I      intronic chr2:171886431(-) A-I      intronic chr2:171886474(-) A-I      intronic chr2:171897074(-) A-I      intronic chr2:171886506(-) A-I      intronic chr2:171886512(-) A-I      intronic chr2:171888515(-) A-I      intronic chr2:171973163(-) A-I      intronic chr2:171973134(-) A-I      intronic chr2:171973127(-) A-I      intronic chr2:171970039(-) A-I      intronic chr2:171970002(-) A-I      intronic chr2:171969919(-) A-I      intronic chr2:171969918(-) A-I      intronic chr2:171969894(-) A-I      intronic chr2:171969877(-) A-I      intronic chr2:171968677(-) A-I      intronic chr2:171968644(-) A-I      intronic chr2:171968577(-) A-I      intronic chr2:171968545(-) A-I      intronic chr2:171968019(-) A-I      intronic chr2:171968013(-) A-I      intronic chr2:171967901(-) A-I      intronic chr2:171888546(-) A-I      intronic chr2:171889455(-) A-I      intronic chr2:171967857(-) A-I      intronic chr2:171967840(-) A-I      intronic chr2:171967839(-) A-I      intronic chr2:171968655(-) A-I      intronic chr2:171965362(-) A-I      intronic chr2:171965285(-) A-I      intronic chr2:171965258(-) A-I      intronic chr2:171964531(-) A-I      intronic chr2:171964510(-) A-I      intronic chr2:171964455(-) A-I      intronic chr2:171964442(-) A-I      intronic chr2:171964422(-) A-I      intronic chr2:171964377(-) A-I      intronic chr2:171964312(-) A-I      intronic chr2:171961257(-) A-I      intronic chr2:171961208(-) A-I      intronic chr2:171960710(-) A-I      intronic chr2:171960693(-) A-I      intronic chr2:171960686(-) A-I      intronic chr2:171960662(-) A-I      intronic chr2:171892833(-) A-I      intronic chr2:171892847(-) A-I      intronic chr2:171889553(-) A-I      intronic chr2:171889664(-) A-I      intronic chr2:171889683(-) A-I      intronic chr2:171889684(-) A-I      intronic chr2:171892772(-) A-I      intronic chr2:171892812(-) A-I      intronic chr2:171892831(-) A-I      intronic chr2:172061340(-) A-I      intronic chr2:172061333(-) A-I      intronic chr2:172060528(-) A-I      intronic chr2:172054172(-) A-I      intronic chr2:172050508(-) A-I      intronic chr2:172050475(-) A-I      intronic chr2:172050323(-) A-I      intronic chr2:172045031(-) A-I      intronic chr2:172044917(-) A-I      intronic chr2:172044914(-) A-I      intronic chr2:172039426(-) A-I      intronic chr2:172039410(-) A-I      intronic chr2:172039282(-) A-I      intronic chr2:172008190(-) A-I      intronic chr2:171929166(-) A-I      intronic chr2:171929085(-) A-I      intronic chr2:171872893(-) A-I      intronic chr2:172006381(-) A-I      intronic chr2:171967971(-) A-I      intronic chr2:171908713(-) A-I      intronic chr2:171858419(-) A-I      intronic chr2:172008258(-) A-I      intronic chr2:171859283(-) A-I      intronic chr2:171892737(-) A-I      intronic chr2:171859323(-) A-I      intronic chr2:171895947(-) A-I      intronic chr2:171980075(-) A-I      intronic chr2:172005265(-) A-I      intronic chr2:171856401(-) A-I      intronic chr2:171954352(-) A-I      intronic chr2:171995905(-) A-I      intronic chr2:171980061(-) A-I      intronic chr2:171930965(-) A-I      intronic chr2:171859304(-) A-I      intronic chr2:171856826(-) A-I      intronic chr2:171859305(-) A-I      intronic chr2:171930580(-) A-I      intronic chr2:171859379(-) A-I      intronic chr2:171993615(-) A-I      intronic chr2:171980209(-) A-I      intronic chr2:171924928(-) A-I      intronic chr2:172002798(-) A-I      intronic chr2:171945540(-) A-I      intronic chr2:171930920(-) A-I      intronic chr2:171978517(-) A-I      intronic chr2:171855570(-) A-I      intronic chr2:171951413(-) A-I      intronic chr2:171892786(-) A-I      intronic chr2:171960046(-) A-I      intronic chr2:171859256(-) A-I      intronic chr2:171927998(-) A-I      intronic chr2:171872476(-) A-I      intronic chr2:171859727(-) A-I      intronic chr2:171859425(-) A-I      intronic chr2:171960025(-) A-I      intronic chr2:171945596(-) A-I      intronic chr2:171856806(-) A-I      intronic chr2:171928959(-) A-I      intronic chr2:171859030(-) A-I      intronic chr2:171872525(-) A-I      intronic chr2:171859340(-) A-I      intronic chr2:172049114(-) A-I      intronic chr2:171959912(-) A-I      intronic chr2:171928064(-) A-I      intronic chr2:171859350(-) A-I      intronic chr2:171931051(-) A-I      intronic chr2:171878531(-) A-I      intronic chr2:171929239(-) A-I      intronic chr2:171897286(-) A-I      intronic chr2:171859315(-) A-I      intronic chr2:171872910(-) A-I      intronic chr2:171943060(-) A-I      intronic chr2:172061709(-) A-I      intronic chr2:171965322(-) A-I      intronic chr2:171859306(-) A-I      intronic chr2:172007695(-) A-I      intronic chr2:172004580(-) A-I      intronic chr2:171897235(-) A-I      intronic chr2:171898835(-) A-I      intronic chr2:171856548(-) A-I      intronic chr2:171855443(-) A-I      intronic chr2:171931029(-) A-I      intronic chr2:171967995(-) A-I      intronic chr2:171859417(-) A-I      intronic chr2:171859316(-) A-I      intronic chr2:171859343(-) A-I      intronic chr2:171968600(-) A-I      intronic chr2:171978746(-) A-I      intronic chr2:171928976(-) A-I      intronic chr2:171964339(-) A-I      intronic chr2:171930638(-) A-I      intronic chr2:171930935(-) A-I      intronic chr2:171888522(-) A-I      intronic chr2:171892689(-) A-I      intronic chr2:171889550(-) A-I      intronic chr2:172006410(-) A-I      intronic chr2:171929196(-) A-I      intronic chr2:171980074(-) A-I      intronic chr2:172003998(-) A-I      intronic chr2:171889608(-) A-I      intronic chr2:171901910(-) A-I      intronic chr2:171900363(-) A-I      intronic chr2:171966759(-) A-I      intronic chr2:171930966(-) A-I      intronic chr2:171980073(-) A-I      intronic chr2:171859335(-) A-I      intronic chr2:171878365(-) A-I      intronic chr2:171965186(-) A-I      intronic chr2:171858949(-) A-I      intronic chr2:171968602(-) A-I      intronic chr2:171951247(-) A-I      intronic chr2:171979972(-) A-I      intronic chr2:171922202(-) A-I      intronic chr2:171855355(-) A-I      intronic chr2:172007801(-) A-I      intronic chr2:172004670(-) A-I      intronic chr2:171929226(-) A-I      intronic chr2:171967908(-) A-I      intronic chr2:171856788(-) A-I      intronic chr2:171929195(-) A-I      intronic chr2:171859672(-) A-I      intronic chr2:171862161(-) A-I      intronic chr2:171859322(-) A-I      intronic chr2:171970020(-) A-I      intronic chr2:171886394(-) A-I      intronic chr2:171872780(-) A-I      intronic chr2:171895995(-) A-I      intronic chr2:172004578(-) A-I      intronic chr2:171870012(-) A-I      intronic chr2:171937507(-) A-I      intronic chr2:171888516(-) A-I      intronic chr2:171859426(-) A-I      intronic chr2:172045301(-) A-I      intronic chr2:171922252(-) A-I      intronic chr2:171979835(-) A-I      intronic chr2:171855381(-) A-I      intronic chr2:171872406(-) A-I      intronic chr2:171978511(-) A-I      intronic chr2:171855351(-) A-I      intronic chr2:172005227(-) A-I      intronic chr2:172018997(-) A-I      intronic chr2:171908654(-) A-I      intronic chr2:171993778(-) A-I      intronic chr2:171930990(-) A-I      intronic chr2:171855347(-) A-I      intronic chr2:171872466(-) A-I      intronic chr2:171900365(-) A-I      intronic chr2:171858458(-) A-I      intronic chr2:171964402(-) A-I      intronic chr2:171978533(-) A-I      intronic chr2:172004584(-) A-I      intronic chr2:172007692(-) A-I      intronic chr2:171858455(-) A-I      intronic chr2:171927992(-) A-I      intronic chr2:171961240(-) A-I      intronic chr2:171884507(-) A-I      intronic chr2:171943014(-) A-I      intronic chr2:171855456(-) A-I      intronic chr2:171891816(-) A-I      intronic chr2:171856385(-) A-I      intronic chr2:171936597(-) A-I      intronic chr2:171928879(-) A-I      intronic chr2:171931038(-) A-I      intronic chr2:171872790(-) A-I      intronic chr2:172008123(-) A-I      intronic chr2:171878537(-) A-I      intronic chr2:172007723(-) A-I      intronic chr2:171858897(-) A-I      intronic chr2:171858953(-) A-I      intronic chr2:171856437(-) A-I      intronic chr2:171872714(-) A-I      intronic chr2:171856366(-) A-I      intronic chr2:171942973(-) A-I      intronic chr2:171859313(-) A-I      intronic chr2:171858354(-) A-I      intronic chr2:171901808(-) A-I      intronic chr2:171964505(-) A-I      intronic chr2:171856490(-) A-I      intronic chr2:171892738(-) A-I      intronic chr2:171967986(-) A-I      intronic chr2:171859626(-) A-I      intronic chr2:171892783(-) A-I      intronic chr2:171954373(-) A-I      intronic chr2:171859219(-) A-I      intronic chr2:171872863(-) A-I      intronic chr2:172004673(-) A-I      intronic chr2:171895946(-) A-I      intronic chr2:172045947(-) A-I      intronic chr2:171872512(-) A-I      intronic chr2:171892874(-) A-I      intronic chr2:171859310(-) A-I      intronic chr2:171931104(-) A-I      intronic chr2:171968678(-) A-I      intronic chr2:172050301(-) A-I      intronic chr2:171964562(-) A-I      intronic chr2:171872843(-) A-I      intronic chr2:171931093(-) A-I      intronic chr2:171901878(-) A-I      intronic chr2:171878023(-) A-I      intronic chr2:171859700(-) A-I      intronic chr2:171859528(-) A-I      intronic chr2:171942970(-) A-I      intronic chr2:171886535(-) A-I      intronic chr2:171908738(-) A-I      intronic chr2:171859198(-) A-I      intronic chr2:171961241(-) A-I      intronic chr2:171972994(-) A-I      intronic chr2:171937293(-) A-I      intronic chr2:171856631(-) A-I      intronic chr2:171855417(-) A-I      intronic chr2:171968733(-) A-I      intronic chr2:171889473(-) A-I      intronic chr2:171993576(-) A-I      intronic chr2:171978702(-) A-I      intronic chr2:171979783(-) A-I      intronic chr2:171978635(-) A-I      intronic chr2:172008257(-) A-I      intronic chr2:171999932(-) A-I      intronic chr2:171999852(-) A-I      intronic chr2:172006159(-) A-I      intronic chr2:171980278(-) A-I      intronic chr2:171991383(-) A-I      intronic chr2:171978630(-) A-I      intronic chr2:171859216(-) A-I      intronic chr2:171855362(-) A-I      intronic chr2:171980238(-) A-I      intronic chr2:171862068(-) A-I      intronic chr2:171968524(-) A-I      intronic chr2:171895873(-) A-I      intronic chr2:171959903(-) A-I      intronic chr2:171964491(-) A-I      intronic chr2:171931098(-) A-I      intronic chr2:171930497(-) A-I      intronic chr2:171929105(-) A-I      intronic chr2:171930934(-) A-I      intronic chr2:171862133(-) A-I      intronic chr2:171979877(-) A-I      intronic chr2:171979880(-) A-I      intronic chr2:171858387(-) A-I      intronic chr2:171979804(-) A-I      intronic chr2:172045744(-) A-I      intronic chr2:171888560(-) A-I      intronic chr2:171859181(-) A-I      intronic chr2:171986855(-) A-I      intronic chr2:171858383(-) A-I      intronic chr2:171996090(-) A-I      intronic chr2:171901837(-) A-I      intronic chr2:171937320(-) A-I      intronic chr2:172061654(-) A-I      intronic chr2:172001652(-) A-I      intronic chr2:171892873(-) A-I      intronic chr2:172045753(-) A-I      intronic chr2:171945483(-) A-I      intronic chr2:171928956(-) A-I      intronic chr2:172007824(-) A-I      intronic chr2:171892710(-) A-I      intronic chr2:171889568(-) A-I      intronic chr2:171895984(-) A-I      intronic chr2:171862129(-) A-I      intronic chr2:171872506(-) A-I      intronic chr2:171896047(-) A-I      intronic chr2:172006355(-) A-I      intronic chr2:171930646(-) A-I      intronic chr2:171976591(-) A-I      intronic chr2:172006294(-) A-I      intronic chr2:171924909(-) A-I      intronic chr2:171930461(-) A-I      intronic chr2:171945586(-) A-I      intronic chr2:171960542(-) A-I      intronic chr2:171931010(-) A-I      intronic chr2:171856470(-) A-I      intronic chr2:171856845(-) A-I      intronic chr2:171860597(-) A-I      intronic chr2:171889546(-) A-I      intronic chr2:171856813(-) A-I      intronic chr2:171931030(-) A-I      intronic chr2:171855425(-) A-I      intronic chr2:172007789(-) A-I      intronic chr2:172039309(-) A-I      intronic chr2:171986258(-) A-I      intronic chr2:171876527(-) A-I      intronic chr2:171856827(-) A-I      intronic chr2:171852647(-) A-I      intronic chr2:171991394(-) A-I      intronic chr2:171978634(-) A-I      intronic chr2:171872919(-) A-I      intronic chr2:171928939(-) A-I      intronic chr2:171945585(-) A-I      intronic chr2:171968530(-) A-I      intronic chr2:172044897(-) A-I      intronic chr2:171928872(-) A-I      intronic chr2:172004538(-) A-I      intronic chr2:172007732(-) A-I      intronic chr2:171978524(-) A-I      intronic chr2:171936624(-) A-I      intronic chr2:171862167(-) A-I      intronic chr2:171989341(-) A-I      intronic chr2:172005715(-) A-I      intronic chr2:172004025(-) A-I      intronic chr2:171930522(-) A-I      intronic chr2:171959908(-) A-I      intronic chr2:171966721(-) A-I      intronic chr2:171859366(-) A-I      intronic chr2:171980189(-) A-I      intronic chr2:171858437(-) A-I      intronic chr2:171922215(-) A-I      intronic chr2:171897251(-) A-I      intronic chr2:171855508(-) A-I      intronic chr2:171896027(-) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	TLK1	chr2:171855417(-) A-I intron -    21960545   //22327324 chr2:171856483(-) A-I intron -    22327324 chr2:171856827(-) A-I intron -    22327324 chr2:171856845(-) A-I intron -    22327324 chr2:171859216(-) A-I intron -    22028664   //22327324 chr2:171859283(-) A-I intron -    22028664   //22327324 chr2:171859284(-) A-I intron -    22028664   //22327324 chr2:171859310(-) A-I intron -    22028664   //22327324 chr2:171924928(-) A-I intron -    22327324 chr2:171928076(-) A-I intron -    22327324 chr2:171859215(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859278(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859304(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859305(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859306(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859315(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859316(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859321(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859322(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859323(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859335(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859343(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859350(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859366(-) A-I intron -    22028664 chr2:171859379(-) A-I intron -    22028664 chr2:171856564(-) A-G intron -    22484847 chr2:171961281(-) A-G intron -    22484847 chr2:171855395(-) A-G intron -    22484847 chr2:171855417(-) A-G intron -    22484847 chr2:171855443(-) A-G intron -    22484847 chr2:171855570(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856329(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856366(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856401(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856470(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856483(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856764(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856766(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856788(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856806(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856813(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856826(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856827(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856845(-) A-G intron -    22484847 chr2:171856850(-) A-G intron -    22484847 chr2:171858354(-) A-G intron -    22484847 chr2:171858383(-) A-G intron -    22484847 chr2:171858458(-) A-G intron -    22484847 chr2:171858949(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859030(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859063(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859181(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859198(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859203(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859215(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859216(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859219(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859278(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859283(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859284(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859310(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859313(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859343(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859417(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859425(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859426(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859528(-) A-G intron -    22484847 chr2:171859727(-) A-G intron -    22484847 chr2:171860597(-) A-G intron -    22484847 chr2:171860611(-) A-G intron -    22484847 chr2:171862011(-) A-G intron -    22484847 chr2:171862129(-) A-G intron -    22484847 chr2:171862133(-) A-G intron -    22484847 chr2:171862134(-) A-G intron -    22484847 chr2:171862167(-) A-G intron -    22484847 chr2:171862174(-) A-G intron -    22484847 chr2:171862181(-) A-G intron -    22484847 chr2:171870980(-) T-C intron -    22484847 chr2:171872406(-) A-G intron -    22484847 chr2:171872464(-) A-G intron -    22484847 chr2:171872466(-) A-G intron -    22484847 chr2:171872476(-) A-G intron -    22484847 chr2:171872506(-) A-G intron -    22484847 chr2:171872512(-) A-G intron -    22484847 chr2:171872525(-) A-G intron -    22484847 chr2:171872714(-) A-G intron -    22484847 chr2:171872780(-) A-G intron -    22484847 chr2:171872790(-) A-G intron -    22484847 chr2:171872863(-) A-G intron -    22484847 chr2:171872893(-) A-G intron -    22484847 chr2:171872910(-) A-G intron -    22484847 chr2:171872919(-) A-G intron -    22484847 chr2:171878445(-) A-G intron -    22484847 chr2:171878542(-) T-C intron -    22484847 chr2:171886535(-) A-G intron -    22484847 chr2:171886537(-) A-G intron -    22484847 chr2:171888457(-) T-C intron -    22484847 chr2:171888516(-) A-G intron -    22484847 chr2:171889616(-) A-G intron -    22484847 chr2:171889635(-) T-C intron -    22484847 chr2:171889640(-) A-G intron -    22484847 chr2:171892689(-) A-G intron -    22484847 chr2:171892710(-) A-G intron -    22484847 chr2:171892738(-) A-G intron -    22484847 chr2:171892783(-) A-G intron -    22484847 chr2:171892786(-) A-G intron -    22484847 chr2:171892812(-) A-T intron -    22484847 chr2:171892873(-) A-G intron -    22484847 chr2:171895941(-) G-A intron -    22484847 chr2:171897286(-) A-G intron -    22484847 chr2:171899035(-) G-A intron -    22484847 chr2:171900289(-) A-G intron -    22484847 chr2:171901738(-) G-A intron -    22484847 chr2:171901877(-) A-G intron -    22484847 chr2:171901947(-) A-T intron -    22484847 chr2:171908738(-) A-G intron -    22484847 chr2:171924928(-) A-G intron -    22484847 chr2:171927992(-) A-G intron -    22484847 chr2:171927998(-) A-G intron -    22484847 chr2:171928039(-) A-G intron -    22484847 chr2:171928064(-) A-G intron -    22484847 chr2:171928076(-) A-G intron -    22484847 chr2:171928879(-) A-G intron -    22484847 chr2:171928939(-) A-G intron -    22484847 chr2:171928956(-) A-G intron -    22484847 chr2:171928959(-) A-G intron -    22484847 chr2:171928976(-) A-G intron -    22484847 chr2:171929085(-) A-G intron -    22484847 chr2:171929099(-) A-G intron -    22484847 chr2:171929102(-) A-G intron -    22484847 chr2:171929105(-) A-G intron -    22484847 chr2:171929166(-) A-G intron -    22484847 chr2:171929195(-) A-G intron -    22484847 chr2:171929196(-) A-G intron -    22484847 chr2:171929226(-) A-G intron -    22484847 chr2:171929239(-) A-G intron -    22484847 chr2:171929339(-) A-G intron -    22484847 chr2:171929370(-) A-G intron -    22484847 chr2:171929439(-) C-T intron -    22484847 chr2:171930461(-) A-G intron -    22484847 chr2:171930497(-) A-G intron -    22484847 chr2:171930580(-) A-G intron -    22484847 chr2:171930589(-) A-G intron -    22484847 chr2:171930638(-) A-G intron -    22484847 chr2:171930646(-) A-G intron -    22484847 chr2:171930655(-) A-G intron -    22484847 chr2:171930920(-) A-G intron -    22484847 chr2:171930934(-) A-G intron -    22484847 chr2:171930935(-) A-G intron -    22484847 chr2:171930965(-) A-G intron -    22484847 chr2:171930966(-) A-G intron -    22484847 chr2:171930990(-) A-G intron -    22484847 chr2:171931029(-) A-G intron -    22484847 chr2:171931030(-) A-G intron -    22484847 chr2:171931038(-) A-G intron -    22484847 chr2:171931051(-) A-G intron -    22484847 chr2:171931093(-) A-G intron -    22484847 chr2:171931098(-) A-G intron -    22484847 chr2:171931104(-) A-G intron -    22484847 chr2:171933245(-) A-T intron -    22484847 chr2:171936597(-) A-G intron -    22484847 chr2:171937320(-) A-G intron -    22484847 chr2:171942956(-) A-G intron -    22484847 chr2:171942970(-) A-G intron -    22484847 chr2:171942973(-) A-G intron -    22484847 chr2:171943014(-) A-G intron -    22484847 chr2:171945484(-) A-G intron -    22484847 chr2:171945529(-) A-G intron -    22484847 chr2:171945540(-) A-G intron -    22484847 chr2:171945548(-) A-G intron -    22484847 chr2:171945572(-) C-T intron -    22484847 chr2:171945585(-) A-G intron -    22484847 chr2:171945586(-) A-G intron -    22484847 chr2:171945649(-) A-G intron -    22484847 chr2:171946296(-) G-A intron -    22484847 chr2:171951247(-) A-G intron -    22484847 chr2:171951286(-) A-G intron -    22484847 chr2:171951287(-) A-G intron -    22484847 chr2:171951407(-) A-G intron -    22484847 chr2:171951413(-) A-G intron -    22484847 chr2:171954200(-) A-G intron -    22484847 chr2:171954268(-) A-G intron -    22484847 chr2:171954352(-) A-G intron -    22484847 chr2:171954373(-) A-G intron -    22484847 chr2:171957749(-) T-C intron -    22484847 chr2:171959908(-) A-G intron -    22484847 chr2:171959912(-) A-G intron -    22484847 chr2:171959995(-) C-G intron -    22484847 chr2:171964339(-) A-G intron -    22484847 chr2:171964402(-) A-G intron -    22484847 chr2:171964491(-) A-G intron -    22484847 chr2:171964505(-) A-G intron -    22484847 chr2:171965211(-) A-G intron -    22484847 chr2:171965395(-) A-G intron -    22484847 chr2:171966721(-) A-G intron -    22484847 chr2:171966759(-) A-G intron -    22484847 chr2:171966808(-) A-G intron -    22484847 chr2:171966893(-) G-A intron -    22484847 chr2:171967908(-) A-G intron -    22484847 chr2:171967971(-) A-G intron -    22484847 chr2:171967973(-) A-G intron -    22484847 chr2:171967986(-) A-G intron -    22484847 chr2:171967995(-) A-G intron -    22484847 chr2:171968000(-) A-G intron -    22484847 chr2:171968600(-) A-G intron -    22484847 chr2:171968602(-) A-G intron -    22484847 chr2:171968678(-) A-G intron -    22484847 chr2:171968733(-) A-G intron -    22484847 chr2:171970020(-) A-G intron -    22484847 chr2:171972994(-) A-G intron -    22484847 chr2:171978511(-) A-G intron -    22484847 chr2:171978517(-) A-G intron -    22484847 chr2:171978533(-) A-G intron -    22484847 chr2:171978572(-) A-G intron -    22484847 chr2:171978585(-) A-G intron -    22484847 chr2:171978595(-) A-G intron -    22484847 chr2:171978630(-) A-G intron -    22484847 chr2:171978633(-) A-G intron -    22484847 chr2:171978634(-) A-G intron -    22484847 chr2:171978635(-) A-G intron -    22484847 chr2:171978636(-) A-G intron -    22484847 chr2:171978702(-) A-G intron -    22484847 chr2:171978746(-) A-G intron -    22484847 chr2:171979796(-) C-A intron -    22484847 chr2:171979835(-) A-G intron -    22484847 chr2:171979844(-) A-G intron -    22484847 chr2:171979880(-) A-G intron -    22484847 chr2:171979931(-) A-G intron -    22484847 chr2:171979972(-) A-G intron -    22484847 chr2:171979980(-) A-G intron -    22484847 chr2:171980073(-) A-G intron -    22484847 chr2:171980074(-) A-G intron -    22484847 chr2:171980189(-) A-G intron -    22484847 chr2:171980209(-) A-G intron -    22484847 chr2:171980238(-) A-G intron -    22484847 chr2:171980278(-) A-G intron -    22484847 chr2:171980286(-) A-G intron -    22484847 chr2:171986245(-) A-G intron -    22484847 chr2:171989341(-) A-G intron -    22484847 chr2:171993046(-) A-G intron -    22484847 chr2:171993615(-) A-G intron -    22484847 chr2:171993778(-) A-G intron -    22484847 chr2:171993802(-) T-C intron -    22484847 chr2:171996090(-) A-G intron -    22484847 chr2:171999932(-) A-G intron -    22484847 chr2:172001577(-) T-C intron -    22484847 chr2:172001897(-) G-A intron -    22484847 chr2:172003998(-) A-G intron -    22484847 chr2:172004473(-) A-G intron -    22484847 chr2:172004538(-) A-G intron -    22484847 chr2:172004575(-) A-G intron -    22484847 chr2:172004577(-) A-G intron -    22484847 chr2:172004578(-) A-G intron -    22484847 chr2:172004579(-) A-G intron -    22484847 chr2:172004580(-) A-G intron -    22484847 chr2:172004584(-) A-G intron -    22484847 chr2:172004620(-) A-G intron -    22484847 chr2:172004670(-) A-G intron -    22484847 chr2:172004673(-) A-G intron -    22484847 chr2:172005227(-) A-G intron -    22484847 chr2:172005343(-) A-G intron -    22484847 chr2:172005346(-) A-G intron -    22484847 chr2:172006355(-) A-G intron -    22484847 chr2:172006410(-) A-G intron -    22484847 chr2:172007666(-) A-G intron -    22484847 chr2:172007695(-) A-G intron -    22484847 chr2:172007732(-) A-G intron -    22484847 chr2:172007789(-) A-G intron -    22484847 chr2:172008123(-) A-G intron -    22484847 chr2:172008258(-) A-G intron -    22484847 chr2:172044897(-) A-G intron -    22484847 chr2:172045301(-) A-G intron -    22484847 chr2:172049114(-) A-G intron -    22484847 chr2:172061654(-) A-G intron -    22484847 chr2:172061709(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	TLK1	chr2:171848096-171848097(-) m6A 3'UTR       27773535 chr2:171848484-171848485(-) m6A 3'UTR       27773535 chr2:171848531-171848532(-) m6A 3'UTR       27773535 chr2:171848565-171848566(-) m6A 3'UTR       27773535 chr2:171849043-171849044(-) Y 3'UTR       26075521 chr2:171849854-171849855(-) m6A 3'UTR       27773535 chr2:171849873-171849874(-) m6A 3'UTR       27773535 chr2:171849892-171849893(-) m6A 3'UTR       27773535 chr2:171849980-171849981(-) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:171850031-171850032(-) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//28052920//27773535//22575960//22608085 chr2:171850103-171850104(-) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960//22608085 chr2:171850147-171850148(-) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960//22608085 chr2:171850158-171850159(-) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960//22608085 chr2:171850353-171850354(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:171862768-171862769(-) m6A 3'UTR//CDS       - chr2:171863341-171863342(-) m6A 3'UTR//CDS       27773535 chr2:171863365-171863366(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535 chr2:171863490-171863491(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535 chr2:171863555-171863556(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535 chr2:171871378-171871379(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535 chr2:171871434-171871435(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535 chr2:171879410-171879411(-) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr2:171879437-171879438(-) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr2:171879462-171879463(-) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr2:171879499-171879500(-) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr2:171879566-171879567(-) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr2:171884860-171884861(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535 chr2:171884866-171884867(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535 chr2:171884872-171884873(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535 chr2:171884890-171884891(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535 chr2:171901765-171901766(-) m6A exon//intron       27773535 chr2:171901776-171901777(-) m6A exon//intron       27773535 chr2:171901835-171901836(-) m6A exon//intron       27773535 chr2:171906588-171906589(-) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24981863 chr2:171906651-171906652(-) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24981863//27773535 chr2:171910310-171910311(-) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24981863//27773535 chr2:171910362-171910363(-) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24981863//27773535 chr2:171910407-171910408(-) m6A exon//intron       24981863//27773535 chr2:171911638-171911639(-) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24981863 chr2:171917610-171917611(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//28052920//27773535//27371828 chr2:171917651-171917652(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535//27371828 chr2:171923362-171923363(-) m6A CDS//intron       24981863//27773535//27371828 chr2:171938175-171938176(-) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr2:171938192-171938193(-) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr2:171938215-171938216(-) m6A CDS//intron       27773535 chr2:171948173-171948174(-) m6A exon//intron       27773535 chr2:172016312-172016313(-) m6A exon//intron       24209618//25456834 chr2:172087656-172087657(-) m6A 5'UTR       24209618 chr2:172087671-172087672(-) m6A 5'UTR       24209618

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-1276	Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Colon cancer cell line (LIM1863)|Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
	TLK1	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-1276
Interactor2: TLK1

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	None
Description	We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.