Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00070758

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-1276:           NCOA1:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-1276 NCOA1
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0005930 8648
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - bHLHe42//bHLHe74//F-SRC-1//KAT13A//RIP160//SRC1

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-1276
rs372186220 chr15:85770551    C/T
rs759704230 chr15:85770557    A/G
rs949716743 chr15:85770550    T/C
rs1469123493 chr15:85770565    T/C
rs34381260 chr15:85770563    CT/C
rs34381260 chr15:85770563    CT/CTT
rs750237476 chr15:85770564    T/C
rs764239400 chr15:85770562    T/C
rs769744052 chr15:85770560    G/A
rs775843960 chr15:85770561    C/A
rs775843960 chr15:85770561    C/T

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR NCOA1
chr2:24754070(+) A-I      intronic
chr2:24818456(+) A-I      intronic
chr2:24751933(+) A-I      intronic
chr2:24754072(+) A-I      intronic
chr2:24751937(+) A-I      intronic
chr2:24754075(+) A-I      intronic
chr2:24754078(+) A-I      intronic
chr2:24754094(+) A-I      intronic
chr2:24754109(+) A-I      intronic
chr2:24754118(+) A-I      intronic
chr2:24754224(+) A-I      intronic
chr2:24754069(+) A-I      intronic
chr2:24754229(+) A-I      intronic
chr2:24818437(+) A-I      intronic
chr2:24751940(+) A-I      intronic
chr2:24754950(+) A-I      intronic
chr2:24754012(+) A-I      intronic
chr2:24754914(+) A-I      intronic
chr2:24751962(+) A-I      intronic
chr2:24754909(+) A-I      intronic
chr2:24754228(+) A-I      intronic
chr2:24754227(+) A-I      intronic
chr2:24754021(+) A-I      intronic
chr2:24753984(+) A-I      intronic
chr2:24754066(+) A-I      intronic
chr2:24754059(+) A-I      intronic
chr2:24754058(+) A-I      intronic
chr2:24750623(+) A-I      intronic
chr2:24885796(+) A-I      intronic
chr2:24754040(+) A-I      intronic
chr2:24754038(+) A-I      intronic
chr2:24754026(+) A-I      intronic
chr2:24752326(+) A-I      intronic
chr2:24752330(+) A-I      intronic
chr2:24752336(+) A-I      intronic
chr2:24753989(+) A-I      intronic
chr2:24753970(+) A-I      intronic
chr2:24753983(+) A-I      intronic
chr2:24753931(+) A-I      intronic
chr2:24752362(+) A-I      intronic
chr2:24885787(+) A-I      intronic
chr2:24885804(+) A-I      intronic
chr2:24750692(+) A-I      intronic
chr2:24952763(+) A-I      intronic
chr2:24952779(+) A-I      intronic
chr2:24952832(+) A-I      intronic
chr2:24953819(+) A-I      intronic
chr2:24953835(+) A-I      intronic
chr2:24750664(+) A-I      intronic
chr2:24956525(+) A-I      intronic
chr2:24956535(+) A-I      intronic
chr2:24956555(+) A-I      intronic
chr2:24750660(+) A-I      intronic
chr2:24956562(+) A-I      intronic
chr2:24956563(+) A-I      intronic
chr2:24750655(+) A-I      intronic
chr2:24978968(+) A-I      intronic
chr2:24978976(+) A-I      intronic
chr2:24978987(+) A-I      intronic
chr2:24978994(+) A-I      intronic
chr2:24979002(+) A-I      intronic
chr2:24979003(+) A-I      intronic
chr2:24750624(+) A-I      intronic
chr2:24981706(+) A-I      intronic
chr2:24981730(+) A-I      intronic
chr2:24981742(+) A-I      intronic
chr2:24885806(+) A-I      intronic
chr2:24981769(+) A-I      intronic
chr2:24981778(+) A-I      intronic
chr2:24981840(+) A-I      intronic
chr2:24988834(+) A-I      intronic
chr2:24988844(+) A-I      intronic
chr2:24988989(+) A-I      intronic
chr2:24750653(+) A-I      intronic
chr2:24737006(+) A-I      intronic
chr2:24737028(+) A-I      intronic
chr2:24737042(+) A-I      intronic
chr2:24737046(+) A-I      intronic
chr2:24737083(+) A-I      intronic
chr2:24750652(+) A-I      intronic
chr2:24750640(+) A-I      intronic
chr2:24750636(+) A-I      intronic
chr2:24720335(+) A-I      intronic
chr2:24754067(+) A-I      intronic
chr2:24754068(+) A-I      intronic
chr2:24737120(+) A-I      intronic
chr2:24737125(+) A-I      intronic
chr2:24738219(+) A-I      intronic
chr2:24746288(+) A-I      intronic
chr2:24746312(+) A-I      intronic
chr2:24981753(+) A-I      intronic
chr2:24772638(+) A-I      intronic
chr2:24772646(+) A-I      intronic
chr2:24772647(+) A-I      intronic
chr2:24772653(+) A-I      intronic
chr2:24772682(+) A-I      intronic
chr2:24772722(+) A-I      intronic
chr2:24737000(+) A-I      intronic
chr2:24773795(+) A-I      intronic
chr2:24809335(+) A-I      intronic
chr2:24809480(+) A-I      intronic
chr2:24811080(+) A-I      intronic
chr2:24811083(+) A-I      intronic
chr2:24811187(+) A-I      intronic
chr2:24825121(+) A-I      intronic
chr2:24825182(+) A-I      intronic
chr2:24825187(+) A-I      intronic
chr2:24825209(+) A-I      intronic
chr2:24829137(+) A-I      intronic
chr2:24736980(+) A-I      intronic
chr2:24736941(+) A-I      intronic
chr2:24736929(+) A-I      intronic
chr2:24736894(+) A-I      intronic
chr2:24720313(+) A-I      intronic
chr2:24720292(+) A-I      intronic
chr2:24737010(+) A-I      intronic
chr2:24830407(+) A-I      intronic
chr2:24831249(+) A-I      intronic
chr2:24831318(+) A-I      intronic
chr2:24831321(+) A-I      intronic
chr2:24831383(+) A-I      intronic
chr2:24832371(+) A-I      intronic
chr2:24832421(+) A-I      intronic
chr2:24837288(+) A-I      intronic
chr2:24837299(+) A-I      intronic
chr2:24850905(+) A-I      intronic
chr2:24850983(+) A-I      intronic
chr2:24851048(+) A-I      intronic
chr2:24851049(+) A-I      intronic
chr2:24889601(+) A-I      intronic
chr2:24889602(+) A-I      intronic
chr2:24892782(+) A-I      intronic
chr2:24892825(+) A-I      intronic
chr2:24892842(+) A-I      intronic
chr2:24892845(+) A-I      intronic
chr2:24892948(+) A-I      intronic
chr2:24892949(+) A-I      intronic
chr2:24892952(+) A-I      intronic
chr2:24894287(+) A-I      intronic
chr2:24894298(+) A-I      intronic
chr2:24894347(+) A-I      intronic
chr2:24894473(+) A-I      intronic
chr2:24894530(+) A-I      intronic
chr2:24894547(+) A-I      intronic
chr2:24737030(+) A-I      intronic
chr2:24737411(+) A-I      intronic
chr2:24737435(+) A-I      intronic
chr2:24737549(+) A-I      intronic
chr2:24738176(+) A-I      intronic
chr2:24898496(+) A-I      intronic
chr2:24898498(+) A-I      intronic
chr2:24900036(+) A-I      intronic
chr2:24900373(+) A-I      intronic
chr2:24900396(+) A-I      intronic
chr2:24738227(+) A-I      intronic
chr2:24738241(+) A-I      intronic
chr2:24738344(+) A-I      intronic
chr2:24739123(+) A-I      intronic
chr2:24900419(+) A-I      intronic
chr2:24900479(+) A-I      intronic
chr2:24900575(+) A-I      intronic
chr2:24904112(+) A-I      intronic
chr2:24904113(+) A-I      intronic
chr2:24904165(+) A-I      intronic
chr2:24904710(+) A-I      intronic
chr2:24904714(+) A-I      intronic
chr2:24904723(+) A-I      intronic
chr2:24904770(+) A-I      intronic
chr2:24904782(+) A-I      intronic
chr2:24904835(+) A-I      intronic
chr2:24974049(+) A-I      intronic
chr2:24973961(+) A-I      intronic
chr2:24973956(+) A-I      intronic
chr2:24971329(+) A-I      intronic
chr2:24971295(+) A-I      intronic
chr2:24970964(+) A-I      intronic
chr2:24970896(+) A-I      intronic
chr2:24970882(+) A-I      intronic
chr2:24970881(+) A-I      intronic
chr2:24970820(+) A-I      intronic
chr2:24970792(+) A-I      intronic
chr2:24970720(+) A-I      intronic
chr2:24746414(+) A-I      intronic
chr2:24746381(+) A-I      intronic
chr2:24746360(+) A-I      intronic
chr2:24746326(+) A-I      intronic
chr2:24746324(+) A-I      intronic
chr2:24746322(+) A-I      intronic
chr2:24746315(+) A-I      intronic
chr2:24746313(+) A-I      intronic
chr2:24746296(+) A-I      intronic
chr2:24746264(+) A-I      intronic
chr2:24739323(+) A-I      intronic
chr2:24739246(+) A-I      intronic
chr2:24739237(+) A-I      intronic
chr2:24739179(+) A-I      intronic
chr2:24739155(+) A-I      intronic
chr2:24739142(+) A-I      intronic
chr2:24970459(+) A-I      intronic
chr2:24970299(+) A-I      intronic
chr2:24953895(+) A-I      intronic
chr2:24953894(+) A-I      intronic
chr2:24953877(+) A-I      intronic
chr2:24953851(+) A-I      intronic
chr2:24953813(+) A-I      intronic
chr2:24953796(+) A-I      intronic
chr2:24953786(+) A-I      intronic
chr2:24981274(+) A-I      intronic
chr2:24981737(+) A-I      intronic
chr2:24986420(+) A-I      intronic
chr2:24987804(+) A-I      intronic
chr2:24988156(+) A-I      intronic
chr2:24988161(+) A-I      intronic
chr2:24988169(+) A-I      intronic
chr2:24988229(+) A-I      intronic
chr2:24988318(+) A-I      intronic
chr2:24988355(+) A-I      intronic
chr2:24988895(+) A-I      intronic
chr2:24988897(+) A-I      intronic
chr2:24988922(+) A-I      intronic
chr2:24981231(+) A-I      intronic
chr2:24746425(+) A-I      intronic
chr2:24746457(+) A-I      intronic
chr2:24746564(+) A-I      intronic
chr2:24746585(+) A-I      intronic
chr2:24746586(+) A-I      intronic
chr2:24746608(+) A-I      intronic
chr2:24746617(+) A-I      intronic
chr2:24746619(+) A-I      intronic
chr2:24746644(+) A-I      intronic
chr2:24746645(+) A-I      intronic
chr2:24746648(+) A-I      intronic
chr2:24746715(+) A-I      intronic
chr2:24746716(+) A-I      intronic
chr2:24746745(+) A-I      intronic
chr2:24746747(+) A-I      intronic
chr2:24746755(+) A-I      intronic
chr2:24746765(+) A-I      intronic
chr2:24747275(+) A-I      intronic
chr2:24747335(+) A-I      intronic
chr2:24747427(+) A-I      intronic
chr2:24747740(+) A-I      intronic
chr2:24747741(+) A-I      intronic
chr2:24747753(+) A-I      intronic
chr2:24748480(+) A-I      intronic
chr2:24748515(+) A-I      intronic
chr2:24748592(+) A-I      intronic
chr2:24748598(+) A-I      intronic
chr2:24748639(+) A-I      intronic
chr2:24751271(+) A-I      intronic
chr2:24912428(+) A-I      intronic
chr2:24751779(+) A-I      intronic
chr2:24751787(+) A-I      intronic
chr2:24751836(+) A-I      intronic
chr2:24751885(+) A-I      intronic
chr2:24752256(+) A-I      intronic
chr2:24752297(+) A-I      intronic
chr2:24770602(+) A-I      intronic
chr2:24770654(+) A-I      intronic
chr2:24770815(+) A-I      intronic
chr2:24772621(+) A-I      intronic
chr2:24913362(+) A-I      intronic
chr2:24913371(+) A-I      intronic
chr2:24940991(+) A-I      intronic
chr2:24941452(+) A-I      intronic
chr2:24941644(+) A-I      intronic
chr2:24941659(+) A-I      intronic
chr2:24941670(+) A-I      intronic
chr2:24952815(+) A-I      intronic
chr2:24952818(+) A-I      intronic
chr2:24952819(+) A-I      intronic
chr2:24952841(+) A-I      intronic
chr2:24952887(+) A-I      intronic
chr2:24952895(+) A-I      intronic
chr2:24952898(+) A-I      intronic
chr2:24952912(+) A-I      intronic
chr2:24952915(+) A-I      intronic
chr2:24952975(+) A-I      intronic
chr2:24953661(+) A-I      intronic
chr2:24953717(+) A-I      intronic
chr2:24953718(+) A-I      intronic
chr2:24953776(+) A-I      intronic
chr2:24904768(+) A-I      intronic
chr2:24770616(+) A-I      intronic
chr2:24831397(+) A-I      intronic
chr2:24829306(+) A-I      intronic
chr2:24952844(+) A-I      intronic
chr2:24913338(+) A-I      intronic
chr2:24746387(+) A-I      intronic
chr2:24747654(+) A-I      intronic
chr2:24988131(+) A-I      intronic
chr2:24989049(+) A-I      intronic
chr2:24952917(+) A-I      intronic
chr2:24736902(+) A-I      intronic
chr2:24832388(+) A-I      intronic
chr2:24748519(+) A-I      intronic
chr2:24956889(+) A-I      intronic
chr2:24889627(+) A-I      intronic
chr2:24913336(+) A-I      intronic
chr2:24952727(+) A-I      intronic
chr2:24747662(+) A-I      intronic
chr2:24889144(+) A-I      intronic
chr2:24987850(+) A-I      intronic
chr2:24747188(+) A-I      intronic
chr2:24953784(+) A-I      intronic
chr2:24772565(+) A-I      intronic
chr2:24988247(+) A-I      intronic
chr2:24885790(+) A-I      intronic
chr2:24748631(+) A-I      intronic
chr2:24829235(+) A-I      intronic
chr2:24772699(+) A-I      intronic
chr2:24956858(+) A-I      intronic
chr2:24912341(+) A-I      intronic
chr2:24770754(+) A-I      intronic
chr2:24739335(+) A-I      intronic
chr2:24770670(+) A-I      intronic
chr2:24747643(+) A-I      intronic
chr2:24974364(+) A-I      intronic
chr2:24746325(+) A-I      intronic
chr2:24831343(+) A-I      intronic
chr2:24889085(+) A-I      intronic
chr2:24987841(+) A-I      intronic
chr2:24720381(+) A-I      intronic
chr2:24772678(+) A-I      intronic
chr2:24831359(+) A-I      intronic
chr2:24969291(+) A-I      intronic
chr2:24772499(+) A-I      intronic
chr2:24738121(+) A-I      intronic
chr2:24900442(+) A-I      intronic
chr2:24775336(+) A-I      intronic
chr2:24742540(+) A-I      intronic
chr2:24940978(+) A-I      intronic
chr2:24981810(+) A-I      intronic
chr2:24746609(+) A-I      intronic
chr2:24952789(+) A-I      intronic
chr2:24981342(+) A-I      intronic
chr2:24952729(+) A-I      intronic
chr2:24987886(+) A-I      intronic
chr2:24987893(+) A-I      intronic
chr2:24970338(+) A-I      intronic
chr2:24909054(+) A-I      intronic
chr2:24986554(+) A-I      intronic
chr2:24768843(+) A-I      intronic
chr2:24900217(+) A-I      intronic
chr2:24737110(+) A-I      intronic
chr2:24913260(+) A-I      intronic
chr2:24830371(+) A-I      intronic
chr2:24825101(+) A-I      intronic
chr2:24751849(+) A-I      intronic
chr2:24988821(+) A-I      intronic
chr2:24981462(+) A-I      intronic
chr2:24737501(+) A-I      intronic
chr2:24737417(+) A-I      intronic
chr2:24747433(+) A-I      intronic
chr2:24809532(+) A-I      intronic
chr2:24809561(+) A-I      intronic
chr2:24746740(+) A-I      intronic
chr2:24770669(+) A-I      intronic
chr2:24736994(+) A-I      intronic
chr2:24988213(+) A-I      intronic
chr2:24809090(+) A-I      intronic
chr2:24941819(+) A-I      intronic
chr2:24742456(+) A-I      intronic
chr2:24742420(+) A-I      intronic
chr2:24746364(+) A-I      intronic
chr2:24970400(+) A-I      intronic
chr2:24969261(+) A-I      intronic
chr2:24889157(+) A-I      intronic
chr2:24913374(+) A-I      intronic
chr2:24988869(+) A-I      intronic
chr2:24913414(+) A-I      intronic
chr2:24831267(+) A-I      intronic
chr2:24913367(+) A-I      intronic
chr2:24772500(+) A-I      intronic
chr2:24737607(+) A-I      intronic
chr2:24988170(+) A-I      intronic
chr2:24746707(+) A-I      intronic
chr2:24953688(+) A-I      intronic
chr2:24742427(+) A-I      intronic
chr2:24748618(+) A-I      intronic
chr2:24825139(+) A-I      intronic
chr2:24909146(+) A-I      intronic
chr2:24900092(+) A-I      intronic
chr2:24768841(+) A-I      intronic
chr2:24747302(+) A-I      intronic
chr2:24746396(+) A-I      intronic
chr2:24748520(+) A-I      intronic
chr2:24941573(+) A-I      intronic
chr2:24742425(+) A-I      intronic
chr2:24770587(+) A-I      intronic
chr2:24752245(+) A-I      intronic
chr2:24941808(+) A-I      intronic
chr2:24808998(+) A-I      intronic
chr2:24900093(+) A-I      intronic
chr2:24742507(+) A-I      intronic
chr2:24940843(+) A-I      intronic
chr2:24737575(+) A-I      intronic
chr2:24988839(+) A-I      intronic
chr2:24852852(+) A-I      intronic
chr2:24831250(+) A-I      intronic
chr2:24900037(+) A-I      intronic
chr2:24720549(+) A-I      intronic
chr2:24913473(+) A-I      intronic
chr2:24862637(+) A-I      intronic
chr2:24809533(+) A-I      intronic
chr2:24736880(+) A-I      intronic
chr2:24747546(+) A-I      intronic
chr2:24746290(+) A-I      intronic
chr2:24899957(+) A-I      intronic
chr2:24775401(+) A-I      intronic
chr2:24892908(+) A-I      intronic
chr2:24747184(+) A-I      intronic
chr2:24832412(+) A-I      intronic
chr2:24973957(+) A-I      intronic
chr2:24912468(+) A-I      intronic
chr2:24883674(+) A-I      intronic
chr2:24970433(+) A-I      intronic
chr2:24981594(+) A-I      intronic
chr2:24952987(+) A-I      intronic
chr2:24737433(+) A-I      intronic
chr2:24981476(+) A-I      intronic
chr2:24720382(+) A-I      intronic
chr2:24940866(+) A-I      intronic
chr2:24986590(+) A-I      intronic
chr2:24889036(+) A-I      intronic
chr2:24767396(+) A-I      intronic
chr2:24746420(+) A-I      intronic
chr2:24953645(+) A-I      intronic
chr2:24988870(+) A-I      intronic
chr2:24751266(+) A-I      intronic
chr2:24830422(+) A-I      intronic
chr2:24900573(+) A-I      intronic
chr2:24746323(+) A-I      intronic
chr2:24987894(+) A-I      intronic
chr2:24900476(+) A-I      intronic
chr2:24746542(+) A-I      intronic
chr2:24899958(+) A-I      intronic
chr2:24953709(+) A-I      intronic
chr2:24889090(+) A-I      intronic
chr2:24953000(+) A-I      intronic
chr2:24768932(+) A-I      intronic
chr2:24912512(+) A-I      intronic
chr2:24737036(+) A-I      intronic
chr2:24746547(+) A-I      intronic
chr2:24737510(+) A-I      intronic
chr2:24971440(+) A-I      intronic
chr2:24770609(+) A-I      intronic
chr2:24986691(+) A-I      intronic
chr2:24986615(+) A-I      intronic
chr2:24768892(+) A-I      intronic
chr2:24915938(+) A-I      intronic
chr2:24767537(+) A-I      intronic
chr2:24956558(+) A-I      intronic
chr2:24889619(+) A-I      intronic
chr2:24986768(+) A-I      intronic
chr2:24986753(+) A-I      intronic
chr2:24973950(+) A-I      intronic
chr2:24941043(+) A-I      intronic
chr2:24956939(+) A-I      intronic
chr2:24988118(+) A-I      intronic
chr2:24894448(+) A-I      intronic
chr2:24889082(+) A-I      intronic
chr2:24746596(+) A-I      intronic
chr2:24941777(+) A-I      intronic
chr2:24986192(+) A-I      intronic
chr2:24913361(+) A-I      intronic
chr2:24988030(+) A-I      intronic
chr2:24746243(+) A-I      intronic
chr2:24900502(+) A-I      intronic
chr2:24786661(+) A-I      intronic
chr2:24748490(+) A-I      intronic
chr2:24913476(+) A-I      intronic
chr2:24747616(+) A-I      intronic
chr2:24746318(+) A-I      intronic
chr2:24988221(+) A-I      intronic
chr2:24956868(+) A-I      intronic
chr2:24889606(+) A-I      intronic
chr2:24737566(+) A-I      intronic
chr2:24971368(+) A-I      intronic
chr2:24912443(+) A-I      intronic
chr2:24889135(+) A-I      intronic
chr2:24952784(+) A-I      intronic
chr2:24941790(+) A-I      intronic
chr2:24746541(+) A-I      intronic
chr2:24987789(+) A-I      intronic
chr2:24737462(+) A-I      intronic
chr2:24970450(+) A-I      intronic
chr2:24868183(+) A-I      intronic
chr2:24970332(+) A-I      intronic
chr2:24737567(+) A-I      intronic
chr2:24913285(+) A-I      intronic
chr2:24894451(+) A-I      intronic
chr2:24953719(+) A-I      intronic
chr2:24737076(+) A-I      intronic
chr2:24941472(+) A-I      intronic
chr2:24899951(+) A-I      intronic
chr2:24860812(+) A-I      intronic
chr2:24989029(+) A-I      intronic
chr2:24830380(+) A-I      intronic
chr2:24988997(+) A-I      intronic
chr2:24742474(+) A-I      intronic
chr2:24746611(+) A-I      intronic
chr2:24738141(+) A-I      intronic
chr2:24988966(+) A-I      intronic
chr2:24746354(+) A-I      intronic
chr2:24746734(+) A-I      intronic
chr2:24747533(+) A-I      intronic
chr2:24748693(+) A-I      intronic
chr2:24883932(+) A-I      intronic
chr2:24747230(+) A-I      intronic
chr2:24831292(+) A-I      intronic
chr2:24837379(+) A-I      intronic
chr2:24742543(+) A-I      intronic
chr2:24987899(+) A-I      intronic
chr2:24742598(+) A-I      intronic
chr2:24747246(+) A-I      intronic
chr2:24981845(+) A-I      intronic
chr2:24770803(+) A-I      intronic
chr2:24889644(+) A-I      intronic
chr2:24737026(+) A-I      intronic
chr2:24971385(+) A-I      intronic
chr2:24986655(+) A-I      intronic
chr2:24927658(+) A-I      intronic
chr2:24892909(+) A-I      intronic
chr2:24900567(+) A-I      intronic
chr2:24747234(+) A-I      intronic
chr2:24746720(+) A-I      intronic
chr2:24987967(+) A-I      intronic
chr2:24913262(+) A-I      intronic
chr2:24738340(+) A-I      intronic
chr2:24720318(+) A-I      intronic
chr2:24833074(+) A-I      intronic
chr2:24738381(+) A-I      intronic
chr2:24748638(+) A-I      intronic
chr2:24738288(+) A-I      intronic
chr2:24824638(+) A-I      intronic
chr2:24913398(+) A-I      intronic
chr2:24988903(+) A-I      intronic
chr2:24748555(+) A-I      intronic
chr2:24742480(+) A-I      intronic
chr2:24941587(+) A-I      intronic
chr2:24940870(+) A-I      intronic
chr2:24900318(+) A-I      intronic
chr2:24772454(+) A-I      intronic
chr2:24953828(+) A-I      intronic
chr2:24913335(+) A-I      intronic
chr2:24746519(+) A-I      intronic
chr2:24981837(+) A-I      intronic
chr2:24885760(+) A-I      intronic
chr2:24913370(+) A-I      intronic
chr2:24903994(+) A-I      intronic
chr2:24737069(+) A-I      intronic
chr2:24981691(+) A-I      intronic
chr2:24970418(+) A-I      intronic
chr2:24770680(+) A-I      intronic
chr2:24887430(+) A-I      intronic
chr2:24986516(+) A-I      intronic
chr2:24770808(+) A-I      intronic
chr2:24746701(+) A-I      intronic
chr2:24971332(+) A-I      intronic
chr2:24940891(+) A-I      intronic
chr2:24970854(+) A-I      intronic
chr2:24940860(+) A-I      intronic
chr2:24746297(+) A-I      intronic
chr2:24747432(+) A-I      intronic
chr2:24904162(+) A-I      intronic
chr2:24720380(+) A-I      intronic
chr2:24850982(+) A-I      intronic
chr2:24986765(+) A-I      intronic
chr2:24989008(+) A-I      intronic
chr2:24952808(+) A-I      intronic
chr2:24772577(+) A-I      intronic
chr2:24831398(+) A-I      intronic
chr2:24941813(+) A-I      intronic
chr2:24887325(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED NCOA1
chr2:24888924(+) A-I intron -    15342557
chr2:24888998(+) A-I intron -    15342557
chr2:24889006(+) A-I intron -    15342557
chr2:24889036(+) A-I intron -    15342557
chr2:24889082(+) A-I intron -    15342557
chr2:24889085(+) A-I intron -    15342557
chr2:24889090(+) A-I intron -    15342557
chr2:24889135(+) A-I intron -    15342557
chr2:24889144(+) A-I intron -    15342557
chr2:24889157(+) A-I intron -    15342557
chr2:24889606(+) A-I intron -    15342557
chr2:24889619(+) A-I intron -    15342557
chr2:24889627(+) A-I intron -    15342557
chr2:24889631(+) A-I intron -    15342557
chr2:24889644(+) A-I intron -    15342557
chr2:24940843(+) A-I intron -    15342557
chr2:24940845(+) A-I intron -    15342557
chr2:24940860(+) A-I intron -    15342557
chr2:24940865(+) A-I intron -    15342557
chr2:24940866(+) A-I intron -    15342557
chr2:24940869(+) A-I intron -    15342557
chr2:24940891(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr2:24940892(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr2:24940905(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr2:24940988(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr2:24941472(+) A-I intron -    15342557
chr2:24941572(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr2:24941573(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr2:24941777(+) A-I intron -    15342557
chr2:24941808(+) A-I intron -    15342557
chr2:24941813(+) A-I intron -    15342557
chr2:24809413(+) A-G intron -    22484847
chr2:24824638(+) A-G intron -    22484847
chr2:24825101(+) A-G intron -    22484847
chr2:24825139(+) A-G intron -    22484847
chr2:24829306(+) A-G intron -    22484847
chr2:24830320(+) A-G intron -    22484847
chr2:24830371(+) A-G intron -    22484847
chr2:24830380(+) A-G intron -    22484847
chr2:24830381(+) A-G intron -    22484847
chr2:24830422(+) A-G intron -    22484847
chr2:24830444(+) A-G intron -    22484847
chr2:24831250(+) A-G intron -    22484847
chr2:24831267(+) A-G intron -    22484847
chr2:24850913(+) A-G intron -    22484847
chr2:24850959(+) A-G intron -    22484847
chr2:24883932(+) A-G intron -    22484847
chr2:24887501(+) C-T intron -    22484847
chr2:24887502(+) G-A intron -    22484847
chr2:24889619(+) A-G intron -    22484847
chr2:24892908(+) A-G intron -    22484847
chr2:24892909(+) A-G intron -    22484847
chr2:24894448(+) A-G intron -    22484847
chr2:24894449(+) A-G intron -    22484847
chr2:24894451(+) A-G intron -    22484847
chr2:24895439(+) A-T intron -    22484847
chr2:24900037(+) A-G intron -    22484847
chr2:24900092(+) A-G intron -    22484847
chr2:24900093(+) A-G intron -    22484847
chr2:24900318(+) A-G intron -    22484847
chr2:24900432(+) A-G intron -    22484847
chr2:24900442(+) A-G intron -    22484847
chr2:24900458(+) A-G intron -    22484847
chr2:24900476(+) A-G intron -    22484847
chr2:24900502(+) A-G intron -    22484847
chr2:24900567(+) A-G intron -    22484847
chr2:24900573(+) A-G intron -    22484847
chr2:24903994(+) A-G intron -    22484847
chr2:24912341(+) A-G intron -    22484847
chr2:24912342(+) A-G intron -    22484847
chr2:24913374(+) A-G intron -    22484847
chr2:24940843(+) A-G intron -    22484847
chr2:24940860(+) A-G intron -    22484847
chr2:24940866(+) A-G intron -    22484847
chr2:24940870(+) A-G intron -    22484847
chr2:24940978(+) A-G intron -    22484847
chr2:24941012(+) A-G intron -    22484847
chr2:24941472(+) A-G intron -    22484847
chr2:24952808(+) A-G intron -    22484847
chr2:24952844(+) A-G intron -    22484847
chr2:24952899(+) A-G intron -    22484847
chr2:24952917(+) A-G intron -    22484847
chr2:24953787(+) A-G intron -    22484847
chr2:24957684(+) A-T intron -    22484847
chr2:24965451(+) G-A intron -    22484847
chr2:24969291(+) A-G intron -    22484847
chr2:24970332(+) A-G intron -    22484847
chr2:24970400(+) A-G intron -    22484847
chr2:24970418(+) A-G intron -    22484847
chr2:24970433(+) A-G intron -    22484847
chr2:24970450(+) A-G intron -    22484847
chr2:24981253(+) A-G intron -    22484847
chr2:24981594(+) A-G intron -    22484847
chr2:24981782(+) A-G intron -    22484847
chr2:24981837(+) A-G intron -    22484847
chr2:24981845(+) A-G intron -    22484847
chr2:24986590(+) A-G intron -    22484847
chr2:24986615(+) A-G intron -    22484847
chr2:24986759(+) A-G intron -    22484847
chr2:24988839(+) A-G intron -    22484847
chr2:24988870(+) A-G intron -    22484847
chr2:24989037(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase NCOA1
chr2:24881562-24881563(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       -
chr2:24881589-24881590(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       -
chr2:24881641-24881642(+) m6A exon//intron       -
chr2:24888662-24888663(+) m6A CDS//intron       24981863
chr2:24888716-24888717(+) m6A CDS//intron       24981863
chr2:24888721-24888722(+) m6A CDS//intron       24981863
chr2:24888744-24888745(+) m6A CDS//intron       24981863
chr2:24888779-24888780(+) m6A CDS//intron       24981863
chr2:24896270-24896271(+) m6A 5'UTR//CDS       24981863
chr2:24929612-24929613(+) m6A CDS       24981863
chr2:24929705-24929706(+) m6A CDS       24981863
chr2:24929712-24929713(+) m6A CDS       24981863
chr2:24929747-24929748(+) m6A CDS       24981863
chr2:24929811-24929812(+) m6A CDS       24981863
chr2:24929979-24929980(+) m6A CDS       22608085
chr2:24930156-24930157(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//22608085
chr2:24930192-24930193(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//22608085
chr2:24930206-24930207(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//22608085
chr2:24930223-24930224(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//22608085
chr2:24930234-24930235(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//22608085
chr2:24930264-24930265(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085
chr2:24930290-24930291(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085
chr2:24930476-24930477(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:24930507-24930508(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:24930521-24930522(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:24930534-24930535(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:24930540-24930541(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:24930572-24930573(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085
chr2:24930632-24930633(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr2:24930675-24930676(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr2:24964773-24964774(+) m6A CDS       24981863
chr2:24964795-24964796(+) m6A CDS       24284625//24981863
chr2:24964815-24964816(+) m6A CDS       24284625
chr2:24964863-24964864(+) m6A CDS       24284625
chr2:24985575-24985576(+) m6A CDS       -
chr2:24985624-24985625(+) m6A CDS       -
chr2:24985639-24985640(+) m6A CDS       -
chr2:24991150-24991151(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:24991162-24991163(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:24991182-24991183(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:24991202-24991203(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:24991209-24991210(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:24991294-24991295(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085
chr2:24991496-24991497(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr2:24991504-24991505(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//22608085
chr2:24991592-24991593(+) m6A 3'UTR       24981863
chr2:24991861-24991862(+) m6A 3'UTR       24209618//24981863//22608085
chr2:24991967-24991968(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr2:24992615-24992616(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085
chr2:24992624-24992625(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085
chr2:24992702-24992703(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085
chr2:24992810-24992811(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:24992830-24992831(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:24992836-24992837(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:24992912-24992913(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:24992929-24992930(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:24992983-24992984(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085
chr2:24992994-24992995(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085
chr2:24993008-24993009(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085
chr2:24993099-24993100(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085
chr2:24993149-24993150(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr2:24993220-24993221(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-1276
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Colon cancer cell line (LIM1863)|Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
NCOA1
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm K562 cells     -
Membrane K562 cells     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-1276
Interactor2: NCOA1

Evidence Support:


Weak-Evidence PAR-CLIP
Support Database ViRBase

References:


PMID 22291592 Target region CDS
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells Interactor2 expression None
Description We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.

Starting a new search, please wait ...