Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00069636

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-1294:  MIMAT0005884          SEC24A:  NM_021982     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-1294	SEC24A
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0005884	10802
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-1294	rs1162939290 chr5:154347163    G/T rs1179835339 chr5:154347171    G/GTATA rs1237976003 chr5:154347166    T/C rs1255234532 chr5:154347174    T/A rs1465013068 chr5:154347169    T/C rs189565536 chr5:154347168    G/T rs1211754242 chr5:154347158    G/A rs1341512450 chr5:154347155    T/G

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	SEC24A	chr5:134012343(+) A-I      intronic chr5:134012314(+) A-I      intronic chr5:134012237(+) A-I      intronic chr5:134010172(+) A-I      intronic chr5:134010168(+) A-I      intronic chr5:134010133(+) A-I      intronic chr5:134010088(+) A-I      intronic chr5:134010064(+) A-I      intronic chr5:134009743(+) A-I      intronic chr5:134009696(+) A-I      intronic chr5:134009673(+) A-I      intronic chr5:134009642(+) A-I      intronic chr5:134009638(+) A-I      intronic chr5:134009609(+) A-I      intronic chr5:134009570(+) A-I      intronic chr5:134009402(+) A-I      intronic chr5:134009287(+) A-I      intronic chr5:134009284(+) A-I      intronic chr5:134009277(+) A-I      intronic chr5:134009265(+) A-I      intronic chr5:134009260(+) A-I      intronic chr5:134008833(+) A-I      intronic chr5:134007820(+) A-I      intronic chr5:134007042(+) A-I      intronic chr5:134006691(+) A-I      intronic chr5:134006684(+) A-I      intronic chr5:134006661(+) A-I      intronic chr5:134006658(+) A-I      intronic chr5:134005877(+) A-I      intronic chr5:134005751(+) A-I      intronic chr5:134005435(+) A-I      intronic chr5:134005374(+) A-I      intronic chr5:134005305(+) A-I      intronic chr5:134005302(+) A-I      intronic chr5:134005228(+) A-I      intronic chr5:134005108(+) A-I      intronic chr5:134003757(+) A-I      intronic chr5:134003675(+) A-I      intronic chr5:134003289(+) A-I      intronic chr5:134003129(+) A-I      intronic chr5:134003124(+) A-I      intronic chr5:134003121(+) A-I      intronic chr5:134003086(+) A-I      intronic chr5:134002136(+) A-I      intronic chr5:134001780(+) A-I      intronic chr5:134001428(+) A-I      intronic chr5:134001388(+) A-I      intronic chr5:134001316(+) A-I      intronic chr5:134001302(+) A-I      intronic chr5:134001210(+) A-I      intronic chr5:134001207(+) A-I      intronic chr5:134001188(+) A-I      intronic chr5:134000712(+) A-I      intronic chr5:134000630(+) A-I      intronic chr5:134000592(+) A-I      intronic chr5:134000588(+) A-I      intronic chr5:134000537(+) A-I      intronic chr5:133999784(+) A-I      intronic chr5:133999567(+) A-I      intronic chr5:133998950(+) A-I      intronic chr5:133998818(+) A-I      intronic chr5:133998051(+) A-I      intronic chr5:133996486(+) A-I      intronic chr5:133996428(+) A-I      intronic chr5:133996380(+) A-I      intronic chr5:133996375(+) A-I      intronic chr5:133996346(+) A-I      intronic chr5:133995949(+) A-I      intronic chr5:133995802(+) A-I      intronic chr5:133993886(+) A-I      intronic chr5:133993794(+) A-I      intronic chr5:133993773(+) A-I      intronic chr5:133993758(+) A-I      intronic chr5:133993752(+) A-I      intronic chr5:133993544(+) A-I      intronic chr5:133993392(+) A-I      intronic chr5:133993367(+) A-I      intronic chr5:133992755(+) A-I      intronic chr5:133992729(+) A-I      intronic chr5:133992725(+) A-I      intronic chr5:133992307(+) A-I      intronic chr5:133991219(+) A-I      intronic chr5:133991192(+) A-I      intronic chr5:133991180(+) A-I      intronic chr5:133991163(+) A-I      intronic chr5:133991162(+) A-I      intronic chr5:133991137(+) A-I      intronic chr5:133990078(+) A-I      intronic chr5:133990077(+) A-I      intronic chr5:133989991(+) A-I      intronic chr5:133989479(+) A-I      intronic chr5:133989461(+) A-I      intronic chr5:133989221(+) A-I      intronic chr5:133988059(+) A-I      intronic chr5:133988015(+) A-I      intronic chr5:133986886(+) A-I      intronic chr5:134007793(+) A-I      intronic chr5:134009251(+) A-I      intronic chr5:134018446(+) A-I      intronic chr5:134018894(+) A-I      intronic chr5:134019330(+) A-I      intronic chr5:134019723(+) A-I      intronic chr5:134021396(+) A-I      intronic chr5:134022024(+) A-I      intronic chr5:134022079(+) A-I      intronic chr5:134027254(+) A-I      intronic chr5:134048205(+) A-I      intronic chr5:134030032(+) A-I      intronic chr5:134030029(+) A-I      intronic chr5:134030026(+) A-I      intronic chr5:134029991(+) A-I      intronic chr5:134029967(+) A-I      intronic chr5:134029960(+) A-I      intronic chr5:134029954(+) A-I      intronic chr5:134029952(+) A-I      intronic chr5:134019259(+) A-I      intronic chr5:134010184(+) A-I      intronic chr5:134008946(+) A-I      intronic chr5:134053082(+) A-I      intronic chr5:134052947(+) A-I      intronic chr5:134052749(+) A-I      intronic chr5:134052649(+) A-I      intronic chr5:134052626(+) A-I      intronic chr5:134052413(+) A-I      intronic chr5:134048530(+) A-I      intronic chr5:134047765(+) A-I      intronic chr5:134047699(+) A-I      intronic chr5:134047644(+) A-I      intronic chr5:134047619(+) A-I      intronic chr5:134047567(+) A-I      intronic chr5:134047564(+) A-I      intronic chr5:134047555(+) A-I      intronic chr5:134047531(+) A-I      intronic chr5:134046939(+) A-I      intronic chr5:134046899(+) A-I      intronic chr5:134046783(+) A-I      intronic chr5:134046758(+) A-I      intronic chr5:134046732(+) A-I      intronic chr5:134046711(+) A-I      intronic chr5:134046699(+) A-I      intronic chr5:134046674(+) A-I      intronic chr5:134046673(+) A-I      intronic chr5:134046667(+) A-I      intronic chr5:134046649(+) A-I      intronic chr5:134046026(+) A-I      intronic chr5:134045851(+) A-I      intronic chr5:134044914(+) A-I      intronic chr5:134044846(+) A-I      intronic chr5:134044700(+) A-I      intronic chr5:134043921(+) A-I      intronic chr5:134043911(+) A-I      intronic chr5:134043740(+) A-I      intronic chr5:134043712(+) A-I      intronic chr5:134043708(+) A-I      intronic chr5:134043688(+) A-I      intronic chr5:134042653(+) A-I      intronic chr5:134042626(+) A-I      intronic chr5:134042520(+) A-I      intronic chr5:134042510(+) A-I      intronic chr5:134042506(+) A-I      intronic chr5:134042481(+) A-I      intronic chr5:134042307(+) A-I      intronic chr5:134039860(+) A-I      intronic chr5:134039839(+) A-I      intronic chr5:134035128(+) A-I      intronic chr5:134034243(+) A-I      intronic chr5:134034180(+) A-I      intronic chr5:134034061(+) A-I      intronic chr5:134034055(+) A-I      intronic chr5:134034022(+) A-I      intronic chr5:134032395(+) A-I      intronic chr5:134032334(+) A-I      intronic chr5:134032210(+) A-I      intronic chr5:134031892(+) A-I      intronic chr5:134031882(+) A-I      intronic chr5:134031779(+) A-I      intronic chr5:134030415(+) A-I      intronic chr5:134030402(+) A-I      intronic chr5:134030389(+) A-I      intronic chr5:134030030(+) A-I      intronic chr5:134025970(+) A-I      intronic chr5:134025890(+) A-I      intronic chr5:134025765(+) A-I      intronic chr5:134025330(+) A-I      intronic chr5:134025324(+) A-I      intronic chr5:134025242(+) A-I      intronic chr5:134024579(+) A-I      intronic chr5:134022092(+) A-I      intronic chr5:134022005(+) A-I      intronic chr5:134021988(+) A-I      intronic chr5:134021986(+) A-I      intronic chr5:134021973(+) A-I      intronic chr5:134021636(+) A-I      intronic chr5:134021611(+) A-I      intronic chr5:134021604(+) A-I      intronic chr5:134021588(+) A-I      intronic chr5:134021572(+) A-I      intronic chr5:134021532(+) A-I      intronic chr5:134021527(+) A-I      intronic chr5:134021467(+) A-I      intronic chr5:134021410(+) A-I      intronic chr5:134020971(+) A-I      intronic chr5:134020901(+) A-I      intronic chr5:134020831(+) A-I      intronic chr5:134020323(+) A-I      intronic chr5:134020301(+) A-I      intronic chr5:134020282(+) A-I      intronic chr5:134019846(+) A-I      intronic chr5:134019303(+) A-I      intronic chr5:134019253(+) A-I      intronic chr5:134019252(+) A-I      intronic chr5:134018531(+) A-I      intronic chr5:134018518(+) A-I      intronic chr5:134018440(+) A-I      intronic chr5:134018377(+) A-I      intronic chr5:134017086(+) A-I      intronic chr5:134017081(+) A-I      intronic chr5:134016872(+) A-I      intronic chr5:134016275(+) A-I      intronic chr5:134016232(+) A-I      intronic chr5:134016220(+) A-I      intronic chr5:134016206(+) A-I      intronic chr5:134016203(+) A-I      intronic chr5:134016189(+) A-I      intronic chr5:134016140(+) A-I      intronic chr5:134016123(+) A-I      intronic chr5:134014643(+) A-I      intronic chr5:134013404(+) A-I      intronic chr5:134013351(+) A-I      intronic chr5:134013342(+) A-I      intronic chr5:134000771(+) A-I      intronic chr5:134000997(+) A-I      intronic chr5:134029961(+) A-I      intronic chr5:134031113(+) A-I      intronic chr5:134000764(+) A-I      intronic chr5:134022069(+) A-I      intronic chr5:134034872(+) A-I      intronic chr5:133994285(+) A-I      intronic chr5:134009358(+) A-I      intronic chr5:133989812(+) A-I      intronic chr5:134009591(+) A-I      intronic chr5:134000749(+) A-I      intronic chr5:134034166(+) A-I      intronic chr5:134000993(+) A-I      intronic chr5:134006636(+) A-I      intronic chr5:134019943(+) A-I      intronic chr5:134000983(+) A-I      intronic chr5:134000960(+) A-I      intronic chr5:133989782(+) A-I      intronic chr5:134047784(+) A-I      intronic chr5:134000941(+) A-I      intronic chr5:134000982(+) A-I      intronic chr5:134048125(+) A-I      intronic chr5:134052965(+) A-I      intronic chr5:134000986(+) A-I      intronic chr5:134019345(+) A-I      intronic chr5:134031912(+) A-I      intronic chr5:134000927(+) A-I      intronic chr5:134006518(+) A-I      intronic chr5:134000958(+) A-I      intronic chr5:133992733(+) A-I      intronic chr5:134026725(+) A-I      intronic chr5:134016435(+) A-I      intronic chr5:134007957(+) A-I      intronic chr5:134000988(+) A-I      intronic chr5:134048202(+) A-I      intronic chr5:134048139(+) A-I      intronic chr5:134005746(+) A-I      intronic chr5:134043905(+) A-I      intronic chr5:134016402(+) A-I      intronic chr5:134000919(+) A-I      intronic chr5:134046132(+) A-I      intronic chr5:134032586(+) A-I      intronic chr5:134045857(+) A-I      intronic chr5:134004229(+) A-I      intronic chr5:134019278(+) A-I      intronic chr5:134040372(+) A-I      intronic chr5:134000884(+) A-I      intronic chr5:134045613(+) A-I      intronic chr5:133993315(+) A-I      intronic chr5:133993837(+) A-I      intronic chr5:134002126(+) A-I      intronic chr5:134020928(+) A-I      intronic chr5:134040251(+) A-I      intronic chr5:134046920(+) A-I      intronic chr5:134042210(+) A-I      intronic chr5:134009646(+) A-I      intronic chr5:134040413(+) A-I      intronic chr5:134027440(+) A-I      intronic chr5:134004054(+) A-I      intronic chr5:134005716(+) A-I      intronic chr5:134053050(+) A-I      intronic chr5:134052071(+) A-I      intronic chr5:134053180(+) A-I      intronic chr5:134019956(+) A-I      intronic chr5:134025340(+) A-I      intronic chr5:134046892(+) A-I      intronic chr5:134000994(+) A-I      intronic chr5:134039940(+) A-I      intronic chr5:134020324(+) A-I      intronic chr5:133989476(+) A-I      intronic chr5:133989619(+) A-I      intronic chr5:134043904(+) A-I      intronic chr5:134025915(+) A-I      intronic chr5:134012317(+) A-I      intronic chr5:134048041(+) A-I      intronic chr5:134009393(+) A-I      intronic chr5:134006558(+) A-I      intronic chr5:134003784(+) A-I      intronic chr5:134001029(+) A-I      intronic chr5:134009599(+) A-I      intronic chr5:134000750(+) A-I      intronic chr5:134043768(+) A-I      intronic chr5:134031801(+) A-I      intronic chr5:134000673(+) A-I      intronic chr5:134010148(+) A-I      intronic chr5:134000948(+) A-I      intronic chr5:134018287(+) A-I      intronic chr5:134009332(+) A-I      intronic chr5:133992739(+) A-I      intronic chr5:134042245(+) A-I      intronic chr5:133988811(+) A-I      intronic chr5:134019333(+) A-I      intronic chr5:134048021(+) A-I      intronic chr5:134045963(+) A-I      intronic chr5:134043902(+) A-I      intronic chr5:134052925(+) A-I      intronic chr5:134021528(+) A-I      intronic chr5:134005173(+) A-I      intronic chr5:134016666(+) A-I      intronic chr5:134027368(+) A-I      intronic chr5:133989586(+) A-I      intronic chr5:134052980(+) A-I      intronic chr5:134000582(+) A-I      intronic chr5:134027921(+) A-I      intronic chr5:134042302(+) A-I      intronic chr5:133987260(+) A-I      intronic chr5:134043698(+) A-I      intronic chr5:134022025(+) A-I      intronic chr5:134007811(+) A-I      intronic chr5:134000740(+) A-I      intronic chr5:134025176(+) A-I      intronic chr5:134052367(+) A-I      intronic chr5:134044755(+) A-I      intronic chr5:133990493(+) A-I      intronic chr5:134018908(+) A-I      intronic chr5:133999250(+) A-I      intronic chr5:134027966(+) A-I      intronic chr5:134018264(+) A-I      intronic chr5:134020930(+) A-I      intronic chr5:134004254(+) A-I      intronic chr5:134020238(+) A-I      intronic chr5:134013371(+) A-I      intronic chr5:134001404(+) A-I      intronic chr5:134047360(+) A-I      intronic chr5:133993436(+) A-I      intronic chr5:134006935(+) A-I      intronic chr5:133986858(+) A-I      intronic chr5:134025211(+) A-I      intronic chr5:134000957(+) A-I      intronic chr5:134011947(+) A-I      intronic chr5:134002124(+) A-I      intronic chr5:134046666(+) A-I      intronic chr5:134030001(+) A-I      intronic chr5:134013781(+) A-I      intronic chr5:134021475(+) A-I      intronic chr5:134030040(+) A-I      intronic chr5:134052341(+) A-I      intronic chr5:134047457(+) A-I      intronic chr5:133993867(+) A-I      intronic chr5:134019872(+) A-I      intronic chr5:134020283(+) A-I      intronic chr5:134013434(+) A-I      intronic chr5:134009590(+) A-I      intronic chr5:134009726(+) A-I      intronic chr5:134006517(+) A-I      intronic chr5:134044719(+) A-I      intronic chr5:134004956(+) A-I      intronic chr5:133998577(+) A-I      intronic chr5:134057471(+) A-I      intronic chr5:134002070(+) A-I      intronic chr5:134046896(+) A-I      intronic chr5:134042450(+) A-I      intronic chr5:134018293(+) A-I      intronic chr5:134019938(+) A-I      intronic chr5:134008487(+) A-I      intronic chr5:134022207(+) A-I      intronic chr5:133999764(+) A-I      intronic chr5:133995524(+) A-I      intronic chr5:134016723(+) A-I      intronic chr5:134010161(+) A-I      intronic chr5:134005192(+) A-I      intronic chr5:134016832(+) A-I      intronic chr5:134020125(+) A-I      intronic chr5:134004429(+) A-I      intronic chr5:133990095(+) A-I      intronic chr5:134034084(+) A-I      intronic chr5:134030969(+) A-I      intronic chr5:134024553(+) A-I      intronic chr5:134044842(+) A-I      intronic chr5:134019304(+) A-I      intronic chr5:134020798(+) A-I      intronic chr5:134046751(+) A-I      intronic chr5:134020822(+) A-I      intronic chr5:133995958(+) A-I      intronic chr5:133992959(+) A-I      intronic chr5:134047972(+) A-I      intronic chr5:134045769(+) A-I      intronic chr5:134019842(+) A-I      intronic chr5:134024599(+) A-I      intronic chr5:134002086(+) A-I      intronic chr5:134018394(+) A-I      intronic chr5:134045609(+) A-I      intronic chr5:134026281(+) A-I      intronic chr5:134053019(+) A-I      intronic chr5:134034060(+) A-I      intronic chr5:134052995(+) A-I      intronic chr5:134024425(+) A-I      intronic chr5:134048438(+) A-I      intronic chr5:134052789(+) A-I      intronic chr5:134025399(+) A-I      intronic chr5:134040346(+) A-I      intronic chr5:134045732(+) A-I      intronic chr5:134018437(+) A-I      intronic chr5:134002168(+) A-I      intronic chr5:134019265(+) A-I      intronic chr5:134043784(+) A-I      intronic chr5:134044634(+) A-I      intronic chr5:134024474(+) A-I      intronic chr5:134013385(+) A-I      intronic chr5:134032449(+) A-I      intronic chr5:134005710(+) A-I      intronic chr5:133993703(+) A-I      intronic chr5:134052368(+) A-I      intronic chr5:134019873(+) A-I      intronic chr5:133989373(+) A-I      intronic chr5:133993763(+) A-I      intronic chr5:133991278(+) A-I      intronic chr5:134032450(+) A-I      intronic chr5:134030257(+) A-I      intronic chr5:134019394(+) A-I      intronic chr5:134049653(+) A-I      intronic chr5:134044641(+) A-I      intronic chr5:134046679(+) A-I      intronic chr5:134048515(+) A-I      intronic chr5:133987168(+) A-I      intronic chr5:134009424(+) A-I      intronic chr5:134020802(+) A-I      intronic chr5:134019273(+) A-I      intronic chr5:134034091(+) A-I      intronic chr5:134034148(+) A-I      intronic chr5:133998830(+) A-I      intronic chr5:133990038(+) A-I      intronic chr5:134004875(+) A-I      intronic chr5:134040382(+) A-I      intronic chr5:134042329(+) A-I      intronic chr5:134006524(+) A-I      intronic chr5:134031840(+) A-I      intronic chr5:134052803(+) A-I      intronic chr5:134010071(+) A-I      intronic chr5:134044744(+) A-I      intronic chr5:134049625(+) A-I      intronic chr5:134040252(+) A-I      intronic chr5:133998663(+) A-I      intronic chr5:134044751(+) A-I      intronic chr5:134045982(+) A-I      intronic chr5:133991186(+) A-I      intronic chr5:134012238(+) A-I      intronic chr5:134031289(+) A-I      intronic chr5:134009645(+) A-I      intronic chr5:133992300(+) A-I      intronic chr5:134034174(+) A-I      intronic chr5:134008863(+) A-I      intronic chr5:134012227(+) A-I      intronic chr5:133994170(+) A-I      intronic chr5:134044720(+) A-I      intronic chr5:134046021(+) A-I      intronic chr5:134025398(+) A-I      intronic chr5:134016979(+) A-I      intronic chr5:134009346(+) A-I      intronic chr5:134004093(+) A-I      intronic chr5:134016357(+) A-I      intronic chr5:133986899(+) A-I      intronic chr5:134027391(+) A-I      intronic chr5:134045786(+) A-I      intronic chr5:134026206(+) A-I      intronic chr5:134022066(+) A-I      intronic chr5:134025353(+) A-I      intronic chr5:134008476(+) A-I      intronic chr5:134009702(+) A-I      intronic chr5:134019321(+) A-I      intronic chr5:134006568(+) A-I      intronic chr5:133989346(+) A-I      intronic chr5:134043931(+) A-I      intronic chr5:134042229(+) A-I      intronic chr5:134013447(+) A-I      intronic chr5:134052663(+) A-I      intronic chr5:133989293(+) A-I      intronic chr5:134030216(+) A-I      intronic chr5:134016084(+) A-I      intronic chr5:134046051(+) A-I      intronic chr5:134010041(+) A-I      intronic chr5:133993476(+) A-I      intronic chr5:134003233(+) A-I      intronic chr5:134034088(+) A-I      intronic chr5:134040398(+) A-I      intronic chr5:134013266(+) A-I      intronic chr5:134034489(+) A-I      intronic chr5:134034488(+) A-I      intronic chr5:134036130(+) A-I      intronic chr5:133990572(+) A-I      intronic chr5:134052592(+) A-I      intronic chr5:134013760(+) A-I      intronic chr5:134031319(+) A-I      intronic chr5:134025463(+) A-I      intronic chr5:134016607(+) A-I      intronic chr5:133992619(+) A-I      intronic chr5:134049612(+) A-I      intronic chr5:133991286(+) A-I      intronic chr5:134032579(+) A-I      intronic chr5:134046593(+) A-I      intronic chr5:134046097(+) A-I      intronic chr5:134046106(+) A-I      intronic chr5:134046709(+) A-I      intronic chr5:133993851(+) A-I      intronic chr5:134031156(+) A-I      intronic chr5:134022018(+) A-I      intronic chr5:133993830(+) A-I      intronic chr5:133990012(+) A-I      intronic chr5:134021038(+) A-I      intronic chr5:134010142(+) A-I      intronic chr5:134003783(+) A-I      intronic chr5:134001127(+) A-I      intronic chr5:134016534(+) A-I      intronic chr5:133989209(+) A-I      intronic chr5:134047404(+) A-I      intronic chr5:134002140(+) A-I      intronic chr5:134030231(+) A-I      intronic chr5:134026568(+) A-I      intronic chr5:134027257(+) A-I      intronic chr5:134020169(+) A-I      intronic chr5:134049611(+) A-I      intronic chr5:134016297(+) A-I      intronic chr5:134016438(+) A-I      intronic chr5:134052797(+) A-I      intronic chr5:133992930(+) A-I      intronic chr5:134052798(+) A-I      intronic chr5:134027383(+) A-I      intronic chr5:133991179(+) A-I      intronic chr5:134049664(+) A-I      intronic chr5:134051891(+) A-I      intronic chr5:134049652(+) A-I      intronic chr5:134046937(+) A-I      intronic chr5:134044853(+) A-I      intronic chr5:134043672(+) A-I      intronic chr5:134006525(+) A-I      intronic chr5:134048370(+) A-I      intronic chr5:134016709(+) A-I      intronic chr5:134016054(+) A-I      intronic chr5:133989349(+) A-I      intronic chr5:134045707(+) A-I      intronic chr5:134003223(+) A-I      intronic chr5:134046089(+) A-I      intronic chr5:134030246(+) A-I      intronic chr5:134027406(+) A-I      intronic chr5:134003063(+) A-I      intronic chr5:134008875(+) A-I      intronic chr5:134011930(+) A-I      intronic chr5:134002084(+) A-I      intronic chr5:134016428(+) A-I      intronic chr5:134009273(+) A-I      intronic chr5:134006416(+) A-I      intronic chr5:133998819(+) A-I      intronic chr5:134025900(+) A-I      intronic chr5:134031776(+) A-I      intronic chr5:134046576(+) A-I      intronic chr5:134019307(+) A-I      intronic chr5:134043769(+) A-I      intronic chr5:134036107(+) A-I      intronic chr5:134048560(+) A-I      intronic chr5:133986833(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	SEC24A	chr5:134043698(+) A-I intron -    22327324 chr5:134043931(+) A-I intron -    22327324 chr5:134000740(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000749(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000750(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000764(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000771(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000884(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000919(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000927(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000941(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000948(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000957(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000958(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000960(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000982(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000983(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000986(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000988(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000993(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000994(+) A-I intron -    22028664 chr5:134000997(+) A-I intron -    22028664 chr5:134001029(+) A-I intron -    22028664 chr5:134044406(+) T-G exon CDS    21725310 chr5:134062868(+) A-C intron -    21725310 chr5:133986243(+) G-T intron -    22484847 chr5:133986858(+) A-G intron -    22484847 chr5:133986882(+) A-G intron -    22484847 chr5:133986899(+) A-G intron -    22484847 chr5:133986915(+) A-G intron -    22484847 chr5:133987168(+) A-G intron -    22484847 chr5:133989209(+) A-G intron -    22484847 chr5:133989293(+) A-G intron -    22484847 chr5:133989346(+) A-G intron -    22484847 chr5:133989373(+) A-G intron -    22484847 chr5:133989586(+) A-G intron -    22484847 chr5:133989742(+) A-G intron -    22484847 chr5:133990038(+) A-G intron -    22484847 chr5:133990095(+) A-G intron -    22484847 chr5:133991179(+) A-G intron -    22484847 chr5:133991186(+) A-G intron -    22484847 chr5:133992275(+) A-G intron -    22484847 chr5:133992300(+) A-G intron -    22484847 chr5:133992336(+) A-G intron -    22484847 chr5:133992733(+) A-G intron -    22484847 chr5:133992739(+) A-G intron -    22484847 chr5:133992740(+) A-G intron -    22484847 chr5:133992930(+) A-G intron -    22484847 chr5:133992959(+) A-G intron -    22484847 chr5:133993315(+) A-G intron -    22484847 chr5:133993436(+) A-G intron -    22484847 chr5:133993469(+) A-G intron -    22484847 chr5:133993703(+) A-G intron -    22484847 chr5:133993763(+) A-G intron -    22484847 chr5:133993772(+) A-G intron -    22484847 chr5:133993811(+) A-G intron -    22484847 chr5:133993830(+) A-G intron -    22484847 chr5:133993867(+) A-G intron -    22484847 chr5:133995524(+) A-G intron -    22484847 chr5:133998577(+) A-G intron -    22484847 chr5:133998663(+) A-G intron -    22484847 chr5:133998819(+) A-G intron -    22484847 chr5:134000582(+) A-G intron -    22484847 chr5:134000673(+) A-G intron -    22484847 chr5:134001404(+) A-G intron -    22484847 chr5:134001988(+) A-G intron -    22484847 chr5:134002084(+) A-G intron -    22484847 chr5:134002086(+) A-G intron -    22484847 chr5:134002124(+) A-G intron -    22484847 chr5:134002126(+) A-G intron -    22484847 chr5:134003183(+) A-G intron -    22484847 chr5:134004229(+) A-G intron -    22484847 chr5:134004956(+) A-G intron -    22484847 chr5:134005716(+) A-G intron -    22484847 chr5:134005746(+) A-G intron -    22484847 chr5:134006416(+) A-G intron -    22484847 chr5:134006516(+) A-G intron -    22484847 chr5:134006518(+) A-G intron -    22484847 chr5:134006525(+) A-G intron -    22484847 chr5:134006568(+) A-G intron -    22484847 chr5:134006636(+) A-G intron -    22484847 chr5:134006796(+) A-G intron -    22484847 chr5:134007797(+) T-C intron -    22484847 chr5:134007811(+) A-G intron -    22484847 chr5:134008484(+) A-G intron -    22484847 chr5:134008487(+) A-G intron -    22484847 chr5:134008863(+) A-G intron -    22484847 chr5:134008875(+) A-G intron -    22484847 chr5:134009218(+) A-G intron -    22484847 chr5:134009273(+) A-G intron -    22484847 chr5:134009346(+) A-G intron -    22484847 chr5:134009358(+) A-G intron -    22484847 chr5:134009385(+) A-G intron -    22484847 chr5:134009424(+) A-G intron -    22484847 chr5:134009571(+) A-G intron -    22484847 chr5:134009591(+) A-G intron -    22484847 chr5:134009595(+) A-G intron -    22484847 chr5:134009599(+) A-G intron -    22484847 chr5:134009645(+) A-G intron -    22484847 chr5:134009646(+) A-G intron -    22484847 chr5:134009726(+) A-G intron -    22484847 chr5:134010041(+) A-G intron -    22484847 chr5:134010065(+) A-G intron -    22484847 chr5:134010142(+) A-G intron -    22484847 chr5:134010148(+) A-G intron -    22484847 chr5:134011930(+) A-G intron -    22484847 chr5:134011947(+) A-G intron -    22484847 chr5:134012238(+) A-G intron -    22484847 chr5:134013250(+) A-G intron -    22484847 chr5:134013266(+) A-G intron -    22484847 chr5:134013362(+) A-G intron -    22484847 chr5:134013385(+) A-G intron -    22484847 chr5:134013434(+) A-G intron -    22484847 chr5:134013760(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016054(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016084(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016116(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016258(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016297(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016357(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016402(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016428(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016666(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016678(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016709(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016710(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016714(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016832(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016934(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016943(+) A-G intron -    22484847 chr5:134016979(+) A-G intron -    22484847 chr5:134017011(+) A-G intron -    22484847 chr5:134018287(+) A-G intron -    22484847 chr5:134019307(+) A-G intron -    22484847 chr5:134019321(+) A-G intron -    22484847 chr5:134019333(+) A-G intron -    22484847 chr5:134019343(+) A-G intron -    22484847 chr5:134019345(+) A-G intron -    22484847 chr5:134019394(+) A-G intron -    22484847 chr5:134021419(+) A-G intron -    22484847 chr5:134021475(+) A-G intron -    22484847 chr5:134021529(+) A-G intron -    22484847 chr5:134021600(+) A-G intron -    22484847 chr5:134021956(+) A-G intron -    22484847 chr5:134022018(+) A-G intron -    22484847 chr5:134022025(+) A-G intron -    22484847 chr5:134022042(+) A-G intron -    22484847 chr5:134022066(+) A-G intron -    22484847 chr5:134022069(+) A-G intron -    22484847 chr5:134024474(+) A-G intron -    22484847 chr5:134024553(+) A-G intron -    22484847 chr5:134025176(+) A-G intron -    22484847 chr5:134025211(+) A-G intron -    22484847 chr5:134025340(+) A-G intron -    22484847 chr5:134025353(+) A-G intron -    22484847 chr5:134025900(+) A-G intron -    22484847 chr5:134025915(+) A-G intron -    22484847 chr5:134026281(+) A-G intron -    22484847 chr5:134026663(+) T-C intron -    22484847 chr5:134027926(+) A-G intron -    22484847 chr5:134029947(+) A-G intron -    22484847 chr5:134030231(+) A-G intron -    22484847 chr5:134030878(+) A-G intron -    22484847 chr5:134032449(+) A-G intron -    22484847 chr5:134032450(+) A-G intron -    22484847 chr5:134034060(+) A-G intron -    22484847 chr5:134034084(+) A-G intron -    22484847 chr5:134034088(+) A-G intron -    22484847 chr5:134034091(+) A-G intron -    22484847 chr5:134034148(+) A-G intron -    22484847 chr5:134034188(+) A-G intron -    22484847 chr5:134034488(+) A-G intron -    22484847 chr5:134034489(+) A-G intron -    22484847 chr5:134034575(+) A-G intron -    22484847 chr5:134034872(+) A-G intron -    22484847 chr5:134036040(+) A-G intron -    22484847 chr5:134036107(+) A-G intron -    22484847 chr5:134036130(+) A-G intron -    22484847 chr5:134037278(+) G-A intron -    22484847 chr5:134039921(+) A-G intron -    22484847 chr5:134039940(+) A-G intron -    22484847 chr5:134039943(+) A-G intron -    22484847 chr5:134040251(+) A-G intron -    22484847 chr5:134040252(+) A-G intron -    22484847 chr5:134042210(+) A-G intron -    22484847 chr5:134042229(+) A-G intron -    22484847 chr5:134042245(+) A-G intron -    22484847 chr5:134042259(+) A-G intron -    22484847 chr5:134042264(+) A-G intron -    22484847 chr5:134042302(+) A-G intron -    22484847 chr5:134042329(+) A-G intron -    22484847 chr5:134042450(+) A-G intron -    22484847 chr5:134042461(+) A-G intron -    22484847 chr5:134042480(+) A-G intron -    22484847 chr5:134043698(+) A-G intron -    22484847 chr5:134043768(+) A-G intron -    22484847 chr5:134043769(+) A-G intron -    22484847 chr5:134043776(+) A-G intron -    22484847 chr5:134043886(+) A-G intron -    22484847 chr5:134043902(+) A-G intron -    22484847 chr5:134043904(+) A-G intron -    22484847 chr5:134043905(+) A-G intron -    22484847 chr5:134043931(+) A-G intron -    22484847 chr5:134044751(+) A-G intron -    22484847 chr5:134044755(+) A-G intron -    22484847 chr5:134044791(+) A-G intron -    22484847 chr5:134044842(+) A-G intron -    22484847 chr5:134044853(+) A-G intron -    22484847 chr5:134045648(+) A-G intron -    22484847 chr5:134045732(+) A-G intron -    22484847 chr5:134045769(+) A-G intron -    22484847 chr5:134045786(+) A-G intron -    22484847 chr5:134045857(+) A-G intron -    22484847 chr5:134045925(+) A-G intron -    22484847 chr5:134045963(+) A-G intron -    22484847 chr5:134046051(+) A-G intron -    22484847 chr5:134046067(+) A-G intron -    22484847 chr5:134046132(+) A-G intron -    22484847 chr5:134046576(+) A-G intron -    22484847 chr5:134046666(+) A-G intron -    22484847 chr5:134046709(+) A-G intron -    22484847 chr5:134046751(+) A-G intron -    22484847 chr5:134046896(+) A-G intron -    22484847 chr5:134048041(+) A-G intron -    22484847 chr5:134048107(+) A-G intron -    22484847 chr5:134048139(+) A-G intron -    22484847 chr5:134048370(+) A-G intron -    22484847 chr5:134048409(+) A-G intron -    22484847 chr5:134049653(+) A-G intron -    22484847 chr5:134052663(+) A-G intron -    22484847 chr5:134052699(+) A-G intron -    22484847 chr5:134052797(+) A-G intron -    22484847 chr5:134052798(+) A-G intron -    22484847 chr5:134052803(+) A-G intron -    22484847 chr5:134052965(+) A-G intron -    22484847 chr5:134053019(+) A-G intron -    22484847 chr5:134053050(+) A-G intron -    22484847 chr5:134057341(+) C-T intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	SEC24A	chr5:133996906-133996907(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr5:133996926-133996927(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr5:133996963-133996964(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:133996974-133996975(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:133997054-133997055(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:133997155-133997156(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr5:134060879-134060880(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085 chr5:134060938-134060939(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-1294	Exosome Plasma     23663360 Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Serum     24797360 Microvesicle Colon cancer cell line (LIM1863)|Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
	SEC24A	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-1294
Interactor2: SEC24A

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	None
Description	We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.