Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00067671

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-33b-3p:  MIMAT0004811          CANX:  NR_157048     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-33b-3p	CANX
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004811	821
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CNX//IP90//P90

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-33b-3p	rs1014636340 chr17:17813869    C/T rs1175344913 chr17:17813860    C/T rs1212055173 chr17:17813859    G/C rs1333766161 chr17:17813870    G/A rs1359466877 chr17:17813864    A/G rs751021350 chr17:17813857    G/A rs1272832890 chr17:17813873    G/A rs1296048342 chr17:17813872    G/A rs1399118390 chr17:17813874    C/T

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	CANX	chr5:179138604(+) A-I      intronic chr5:179137530(+) A-I      intronic chr5:179138352(+) A-I      intronic chr5:179138225(+) A-I      intronic chr5:179137895(+) A-I      intronic chr5:179137894(+) A-I      intronic chr5:179137615(+) A-I      intronic chr5:179137798(+) A-I      intronic chr5:179138302(+) A-I      intronic chr5:179131636(+) A-I      intronic chr5:179137893(+) A-I      intronic chr5:179137804(+) A-I      intronic chr5:179133710(+) A-I      intronic chr5:179152312(+) A-I      intronic chr5:179152308(+) A-I      intronic chr5:179152301(+) A-I      intronic chr5:179152287(+) A-I      intronic chr5:179142380(+) A-I      intronic chr5:179139011(+) A-I      intronic chr5:179138325(+) A-I      intronic chr5:179138312(+) A-I      intronic chr5:179138270(+) A-I      intronic chr5:179137946(+) A-I      intronic chr5:179137977(+) A-I      intronic chr5:179137989(+) A-I      intronic chr5:179137529(+) A-I      intronic chr5:179137209(+) A-I      intronic chr5:179135091(+) A-I      intronic chr5:179134937(+) A-I      intronic chr5:179134526(+) A-I      intronic chr5:179134464(+) A-I      intronic chr5:179134402(+) A-I      intronic chr5:179134361(+) A-I      intronic chr5:179132172(+) A-I      intronic chr5:179132104(+) A-I      intronic chr5:179131731(+) A-I      intronic chr5:179131730(+) A-I      intronic chr5:179131717(+) A-I      intronic chr5:179131660(+) A-I      intronic chr5:179131651(+) A-I      intronic chr5:179131650(+) A-I      intronic chr5:179131590(+) A-I      intronic chr5:179131448(+) A-I      intronic chr5:179139764(+) A-I      intronic chr5:179139655(+) A-I      intronic chr5:179139646(+) A-I      intronic chr5:179139565(+) A-I      intronic chr5:179131434(+) A-I      intronic chr5:179131289(+) A-I      intronic chr5:179130578(+) A-I      intronic chr5:179128450(+) A-I      intronic chr5:179128420(+) A-I      intronic chr5:179128419(+) A-I      intronic chr5:179152335(+) A-I      intronic chr5:179152334(+) A-I      intronic chr5:179151988(+) A-I      intronic chr5:179149244(+) A-I      intronic chr5:179149155(+) A-I      intronic chr5:179142374(+) A-I      intronic chr5:179131627(+) A-I      intronic chr5:179138683(+) A-I      intronic chr5:179142324(+) A-I      intronic chr5:179142009(+) A-I      intronic chr5:179141963(+) A-I      intronic chr5:179141955(+) A-I      intronic chr5:179141891(+) A-I      intronic chr5:179141865(+) A-I      intronic chr5:179141600(+) A-I      intronic chr5:179138670(+) A-I      intronic chr5:179138669(+) A-I      intronic chr5:179138540(+) A-I      intronic chr5:179141562(+) A-I      intronic chr5:179141282(+) A-I      intronic chr5:179141211(+) A-I      intronic chr5:179141145(+) A-I      intronic chr5:179140865(+) A-I      intronic chr5:179140238(+) A-I      intronic chr5:179128386(+) A-I      intronic chr5:179137548(+) A-I      intronic chr5:179137562(+) A-I      intronic chr5:179131381(+) A-I      intronic chr5:179132246(+) A-I      intronic chr5:179137626(+) A-I      intronic chr5:179137691(+) A-I      intronic chr5:179137684(+) A-I      intronic chr5:179140781(+) A-I      intronic chr5:179137492(+) A-I      intronic chr5:179137531(+) A-I      intronic chr5:179137523(+) A-I      intronic chr5:179137551(+) A-I      intronic chr5:179137696(+) A-I      intronic chr5:179137454(+) A-I      intronic chr5:179137497(+) A-I      intronic chr5:179137582(+) A-I      intronic chr5:179137554(+) A-I      intronic chr5:179137491(+) A-I      intronic chr5:179137489(+) A-I      intronic chr5:179137556(+) A-I      intronic chr5:179128130(+) A-I      intronic chr5:179149166(+) A-I      intronic chr5:179141074(+) A-I      intronic chr5:179137271(+) A-I      intronic chr5:179139545(+) A-I      intronic chr5:179138583(+) A-I      intronic chr5:179142284(+) A-I      intronic chr5:179153220(+) A-I      intronic chr5:179139824(+) A-I      intronic chr5:179140663(+) A-I      intronic chr5:179141931(+) A-I      intronic chr5:179138348(+) A-I      intronic chr5:179128794(+) A-I      intronic chr5:179152055(+) A-I      intronic chr5:179137360(+) A-I      intronic chr5:179137982(+) A-I      intronic chr5:179140794(+) A-I      intronic chr5:179140334(+) A-I      intronic chr5:179131274(+) A-I      intronic chr5:179153034(+) A-I      intronic chr5:179138008(+) A-I      intronic chr5:179132170(+) A-I      intronic chr5:179131366(+) A-I      intronic chr5:179142484(+) A-I      intronic chr5:179131376(+) A-I      intronic chr5:179140837(+) A-I      intronic chr5:179139864(+) A-I      intronic chr5:179138588(+) A-I      intronic chr5:179134481(+) A-I      intronic chr5:179153229(+) A-I      intronic chr5:179141846(+) A-I      intronic chr5:179139967(+) A-I      intronic chr5:179137889(+) A-I      intronic chr5:179140699(+) A-I      intronic chr5:179137313(+) A-I      intronic chr5:179140200(+) A-I      intronic chr5:179142381(+) A-I      intronic chr5:179152123(+) A-I      intronic chr5:179131367(+) A-I      intronic chr5:179140212(+) A-I      intronic chr5:179142277(+) A-I      intronic chr5:179141940(+) A-I      intronic chr5:179140245(+) A-I      intronic chr5:179151978(+) A-I      intronic chr5:179135038(+) A-I      intronic chr5:179140335(+) A-I      intronic chr5:179138163(+) A-I      intronic chr5:179141238(+) A-I      intronic chr5:179134891(+) A-I      intronic chr5:179142388(+) A-I      intronic chr5:179128357(+) A-I      intronic chr5:179138286(+) A-I      intronic chr5:179152842(+) A-I      intronic chr5:179137868(+) A-I      intronic chr5:179138407(+) A-I      intronic chr5:179137330(+) A-I      intronic chr5:179141139(+) A-I      intronic chr5:179140901(+) A-I      intronic chr5:179137598(+) A-I      intronic chr5:179151928(+) A-I      intronic chr5:179140263(+) A-I      intronic chr5:179128461(+) A-I      intronic chr5:179139520(+) A-I      intronic chr5:179142027(+) A-I      intronic chr5:179152642(+) A-I      intronic chr5:179137875(+) A-I      intronic chr5:179139014(+) A-I      intronic chr5:179137277(+) A-I      intronic chr5:179132042(+) A-I      intronic chr5:179142319(+) A-I      intronic chr5:179132174(+) A-I      intronic chr5:179140281(+) A-I      intronic chr5:179142441(+) A-I      intronic chr5:179137937(+) A-I      intronic chr5:179128410(+) A-I      intronic chr5:179152048(+) A-I      intronic chr5:179128376(+) A-I      intronic chr5:179139499(+) A-I      intronic chr5:179141276(+) A-I      intronic chr5:179137588(+) A-I      intronic chr5:179142283(+) A-I      intronic chr5:179152347(+) A-I      intronic chr5:179128320(+) A-I      intronic chr5:179140292(+) A-I      intronic chr5:179132126(+) A-I      intronic chr5:179137303(+) A-I      intronic chr5:179137281(+) A-I      intronic chr5:179142489(+) A-I      intronic chr5:179131351(+) A-I      intronic chr5:179132175(+) A-I      intronic chr5:179139546(+) A-I      intronic chr5:179142309(+) A-I      intronic chr5:179132090(+) A-I      intronic chr5:179131290(+) A-I      intronic chr5:179141185(+) A-I      intronic chr5:179131752(+) A-I      intronic chr5:179137396(+) A-I      intronic chr5:179152868(+) A-I      intronic chr5:179138316(+) A-I      intronic chr5:179151938(+) A-I      intronic chr5:179142375(+) A-I      intronic chr5:179139678(+) A-I      intronic chr5:179152419(+) A-I      intronic chr5:179131449(+) A-I      intronic chr5:179139953(+) A-I      intronic chr5:179152427(+) A-I      intronic chr5:179132258(+) A-I      intronic chr5:179130097(+) A-I      intronic chr5:179140320(+) A-I      intronic chr5:179149077(+) A-I      intronic chr5:179137936(+) A-I      intronic chr5:179129062(+) A-I      intronic chr5:179139476(+) A-I      intronic chr5:179129871(+) A-I      intronic chr5:179129016(+) A-I      intronic chr5:179152166(+) A-I      intronic chr5:179141866(+) A-I      intronic chr5:179137218(+) A-I      intronic chr5:179141892(+) A-I      intronic chr5:179140857(+) A-I      intronic chr5:179141202(+) A-I      intronic chr5:179141069(+) A-I      intronic chr5:179131661(+) A-I      intronic chr5:179140341(+) A-I      intronic chr5:179137326(+) A-I      intronic chr5:179138343(+) A-I      intronic chr5:179142445(+) A-I      intronic chr5:179141199(+) A-I      intronic chr5:179140176(+) A-I      intronic chr5:179139497(+) A-I      intronic chr5:179152136(+) A-I      intronic chr5:179127928(+) A-I      intronic chr5:179137799(+) A-I      intronic chr5:179142373(+) A-I      intronic chr5:179141780(+) A-I      intronic chr5:179137169(+) A-I      intronic chr5:179128340(+) A-I      intronic chr5:179137426(+) A-I      intronic chr5:179138992(+) A-I      intronic chr5:179149090(+) A-I      intronic chr5:179142385(+) A-I      intronic chr5:179137199(+) A-I      intronic chr5:179140660(+) A-I      intronic chr5:179149250(+) A-I      intronic chr5:179152124(+) A-I      intronic chr5:179134853(+) A-I      intronic chr5:179139768(+) A-I      intronic chr5:179140662(+) A-I      intronic chr5:179142363(+) A-I      intronic chr5:179153168(+) A-I      intronic chr5:179151897(+) A-I      intronic chr5:179152117(+) A-I      intronic chr5:179140737(+) A-I      intronic chr5:179128451(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	CANX	chr5:179151897(+) A-I intron -    15342557 chr5:179151928(+) A-I intron -    15342557 chr5:179151996(+) A-I intron -    15342557 chr5:179152048(+) A-I intron -    15342557 chr5:179152055(+) A-I intron -    15342557 chr5:179152063(+) A-I intron -    15342557 chr5:179152077(+) A-I intron -    15342557 chr5:179152117(+) A-I intron -    15342557 chr5:179137454(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137489(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137491(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137492(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137497(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137523(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137531(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137548(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137551(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137554(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137556(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137562(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137582(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137598(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137626(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137684(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137691(+) A-I intron -    22028664 chr5:179137696(+) A-I intron -    22028664 chr5:179128410(+) A-I intron -    21960545 chr5:179127928(+) A-G intron -    22484847 chr5:179128130(+) A-G intron -    22484847 chr5:179128340(+) A-G intron -    22484847 chr5:179128410(+) A-G intron -    22484847 chr5:179128490(+) A-G intron -    22484847 chr5:179130050(+) G-T intron -    22484847 chr5:179131273(+) A-G intron -    22484847 chr5:179131274(+) A-G intron -    22484847 chr5:179131290(+) A-G intron -    22484847 chr5:179131294(+) C-T intron -    22484847 chr5:179131318(+) A-G intron -    22484847 chr5:179131351(+) A-G intron -    22484847 chr5:179131366(+) A-G intron -    22484847 chr5:179131367(+) A-G intron -    22484847 chr5:179131381(+) A-G intron -    22484847 chr5:179131449(+) A-G intron -    22484847 chr5:179131661(+) A-G intron -    22484847 chr5:179131752(+) A-G intron -    22484847 chr5:179132042(+) A-G intron -    22484847 chr5:179132087(+) A-G intron -    22484847 chr5:179132090(+) A-G intron -    22484847 chr5:179132167(+) A-G intron -    22484847 chr5:179132170(+) A-G intron -    22484847 chr5:179132175(+) A-G intron -    22484847 chr5:179134481(+) A-G intron -    22484847 chr5:179134853(+) A-G intron -    22484847 chr5:179134891(+) A-G intron -    22484847 chr5:179134955(+) A-G intron -    22484847 chr5:179134979(+) A-G intron -    22484847 chr5:179135038(+) A-G intron -    22484847 chr5:179137174(+) A-G intron -    22484847 chr5:179137199(+) A-G intron -    22484847 chr5:179137238(+) A-G intron -    22484847 chr5:179137265(+) A-G intron -    22484847 chr5:179137271(+) A-G intron -    22484847 chr5:179137277(+) A-G intron -    22484847 chr5:179137303(+) A-G intron -    22484847 chr5:179137313(+) A-G intron -    22484847 chr5:179138212(+) T-C intron -    22484847 chr5:179138242(+) A-G intron -    22484847 chr5:179138343(+) A-G intron -    22484847 chr5:179138348(+) A-G intron -    22484847 chr5:179138407(+) A-G intron -    22484847 chr5:179138583(+) A-G intron -    22484847 chr5:179138588(+) A-G intron -    22484847 chr5:179138589(+) A-G intron -    22484847 chr5:179138889(+) A-G intron -    22484847 chr5:179138976(+) A-G intron -    22484847 chr5:179138992(+) A-G intron -    22484847 chr5:179139497(+) A-G intron -    22484847 chr5:179139609(+) A-G intron -    22484847 chr5:179139660(+) A-G intron -    22484847 chr5:179140176(+) A-G intron -    22484847 chr5:179140200(+) A-G intron -    22484847 chr5:179140209(+) A-G intron -    22484847 chr5:179140222(+) A-G intron -    22484847 chr5:179140245(+) A-G intron -    22484847 chr5:179140320(+) A-G intron -    22484847 chr5:179140334(+) A-G intron -    22484847 chr5:179140335(+) A-G intron -    22484847 chr5:179140341(+) A-G intron -    22484847 chr5:179140663(+) A-G intron -    22484847 chr5:179140709(+) A-G intron -    22484847 chr5:179140737(+) A-G intron -    22484847 chr5:179140763(+) T-A intron -    22484847 chr5:179140764(+) A-T intron -    22484847 chr5:179140766(+) T-A intron -    22484847 chr5:179141069(+) A-G intron -    22484847 chr5:179141074(+) A-G intron -    22484847 chr5:179141099(+) A-G intron -    22484847 chr5:179141100(+) A-G intron -    22484847 chr5:179141139(+) A-G intron -    22484847 chr5:179141165(+) A-G intron -    22484847 chr5:179141199(+) A-G intron -    22484847 chr5:179141202(+) A-G intron -    22484847 chr5:179141238(+) A-G intron -    22484847 chr5:179141254(+) A-G intron -    22484847 chr5:179141684(+) A-G intron -    22484847 chr5:179141866(+) A-G intron -    22484847 chr5:179141931(+) A-G intron -    22484847 chr5:179141940(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142027(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142028(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142277(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142283(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142309(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142355(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142363(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142369(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142372(+) T-A intron -    22484847 chr5:179142373(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142375(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142378(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142381(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142388(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142445(+) A-G intron -    22484847 chr5:179142451(+) A-G intron -    22484847 chr5:179149090(+) A-G intron -    22484847 chr5:179152055(+) A-G intron -    22484847 chr5:179152077(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	CANX	chr5:179106077-179106078(+) m6A intron       25456834//22608085 chr5:179106148-179106149(+) m6A intron       25456834//22575960//22608085 chr5:179106273-179106274(+) m6A intron       - chr5:179121260-179121261(+) m6A intron       - chr5:179121288-179121289(+) m6A intron       - chr5:179121338-179121339(+) m6A intron       27773535 chr5:179121418-179121419(+) m6A intron       27773535 chr5:179121525-179121526(+) m6A intron       - chr5:179126100-179126101(+) Gm 5'UTR//CDS//intron       - chr5:179126580-179126581(+) m6A 5'UTR//intron       24981863//22575960 chr5:179126585-179126586(+) m6A 5'UTR//intron       24981863//22575960 chr5:179126628-179126629(+) m6A 5'UTR//intron       24981863//22575960 chr5:179126646-179126647(+) m6A 5'UTR//intron       22575960 chr5:179126698-179126699(+) m6A 5'UTR//intron       22575960 chr5:179132724-179132725(+) m6A CDS//intron       26404942//27773535//22575960 chr5:179132750-179132751(+) m6A CDS//intron       26404942//27773535//22575960 chr5:179132812-179132813(+) m6A CDS//intron       26404942//27773535//22575960 chr5:179132819-179132820(+) m6A CDS//intron       26404942//27773535//22575960 chr5:179132824-179132825(+) Am CDS//intron       - chr5:179133321-179133322(+) m6A CDS//exon//intron       27773535//22575960 chr5:179135291-179135292(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942//27773535//22575960 chr5:179135336-179135337(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942//27773535//22575960 chr5:179135341-179135342(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942//27773535//22575960 chr5:179136029-179136030(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942//27773535 chr5:179136042-179136043(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942//27773535 chr5:179136050-179136051(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942//27773535 chr5:179136732-179136733(+) m6A exon//intron       27773535 chr5:179136891-179136892(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       26404942//27773535 chr5:179136934-179136935(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942//27773535 chr5:179136941-179136942(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942//27773535 chr5:179136967-179136968(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//26404942//27773535 chr5:179136995-179136996(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//26404942//27773535 chr5:179137026-179137027(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//26404942//27773535//22575960 chr5:179137047-179137048(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535//22575960 chr5:179142910-179142911(+) m6A CDS//intron       24981863//27773535//22575960 chr5:179142961-179142962(+) m6A CDS//intron       27773535 chr5:179143216-179143217(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942//27773535//22575960 chr5:179143222-179143223(+) Am 3'UTR//CDS//exon       - chr5:179143225-179143226(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942//27773535//22575960 chr5:179143253-179143254(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942//27773535//22575960 chr5:179146713-179146714(+) m6A 3'UTR//CDS       26404942//27773535//22575960 chr5:179146770-179146771(+) m6A 3'UTR//CDS       26404942//27773535//22575960 chr5:179147412-179147413(+) m6A 3'UTR//CDS       26404942//27773535//22575960 chr5:179149815-179149816(+) m6A 3'UTR//CDS       26404942//27773535 chr5:179149857-179149858(+) m6A 3'UTR//CDS       26404942//27773535 chr5:179150596-179150597(+) m6A exon//intron       22575960 chr5:179150630-179150631(+) m6A exon//intron       22575960 chr5:179151659-179151660(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085 chr5:179151687-179151688(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085 chr5:179151724-179151725(+) Am 3'UTR//CDS//exon       - chr5:179151724-179151725(+) m1A 3'UTR//CDS//exon       26863196//26863410 chr5:179151745-179151746(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       25456834//24981863//28052920//26404942//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085 chr5:179151779-179151780(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       25456834//24981863//28052920//26404942//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085 chr5:179153687-179153688(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       25456834//24981863//28052920//26404942//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085 chr5:179153707-179153708(+) m1A 3'UTR//CDS//exon       26863196//26863410 chr5:179153740-179153741(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       25456834//24981863//28052920//26404942//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085 chr5:179153747-179153748(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       25456834//24981863//28052920//26404942//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085 chr5:179155607-179155608(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834//24981863//28052920//26404942//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085 chr5:179155617-179155618(+) Am 3'UTR//CDS//intron       - chr5:179155622-179155623(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr5:179155646-179155647(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr5:179155713-179155714(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//26404942//27773535//22575960 chr5:179155744-179155745(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//26404942//27773535//22575960 chr5:179155752-179155753(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//26404942//27773535//22575960 chr5:179155779-179155780(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//26404942//27773535//22575960 chr5:179155801-179155802(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//26404942//27773535//22575960 chr5:179155839-179155840(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//26404942//27773535 chr5:179155862-179155863(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//26404942//27773535 chr5:179155901-179155902(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//26404942//27773535 chr5:179155950-179155951(+) m6A 3'UTR//intron       26404942//27773535 chr5:179156006-179156007(+) m6A 3'UTR//intron       26404942//27773535 chr5:179156088-179156089(+) m6A 3'UTR//intron       26404942//27773535 chr5:179156208-179156209(+) m6A 3'UTR//intron       26404942//27773535 chr5:179156302-179156303(+) m6A 3'UTR//intron       26404942 chr5:179156339-179156340(+) m6A 3'UTR//intron       26404942 chr5:179156777-179156778(+) m6A 3'UTR       26404942//27773535 chr5:179156803-179156804(+) m6A 3'UTR       26404942 chr5:179156829-179156830(+) m6A 3'UTR       26404942 chr5:179157204-179157205(+) m6A 3'UTR       27773535 chr5:179157433-179157434(+) m6A 3'UTR       27773535 chr5:179157452-179157453(+) m6A 3'UTR       27773535 chr5:179157650-179157651(+) m6A 3'UTR       27773535 chr5:179157762-179157763(+) m6A 3'UTR       27773535//22575960

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-33b-3p	Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
	CANX	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Cytosolic polysome Human T lymphocytes (Jurkat E6-1)     12923260 Endoplasmic reticulum Multidrug resistant cell line (NCI/ADR-RES)     20453113 Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 ER-bound polysome Human T lymphocytes (Jurkat E6-1)     12923260 Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Colon cancer cells     24393600 Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID	PMID
NoncoRNA	hsa-miR-33b-3p	Cisplatin 5702198       27559850

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-33b-3p
Interactor2: CANX

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	None
Description	We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.