Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00066313

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-374a-3p:           RNF4:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-374a-3p RNF4
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0004688 6047
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - RES4-26//SLX5//SNURF

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-374a-3p
rs766292977 chrX:74287300    C/T

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR RNF4
chr4:2479237(+) A-I      intronic
chr4:2479251(+) A-I      intronic
chr4:2479267(+) A-I      intronic
chr4:2485275(+) A-I      intronic
chr4:2508028(+) A-I      intronic
chr4:2477232(+) A-I      intronic
chr4:2477241(+) A-I      intronic
chr4:2477250(+) A-I      intronic
chr4:2477256(+) A-I      intronic
chr4:2477302(+) A-I      intronic
chr4:2477326(+) A-I      intronic
chr4:2477327(+) A-I      intronic
chr4:2477339(+) A-I      intronic
chr4:2478175(+) A-I      intronic
chr4:2485347(+) A-I      intronic
chr4:2485352(+) A-I      intronic
chr4:2485372(+) A-I      intronic
chr4:2485373(+) A-I      intronic
chr4:2485378(+) A-I      intronic
chr4:2485420(+) A-I      intronic
chr4:2485427(+) A-I      intronic
chr4:2485711(+) A-I      intronic
chr4:2489926(+) A-I      intronic
chr4:2489952(+) A-I      intronic
chr4:2489961(+) A-I      intronic
chr4:2490640(+) A-I      intronic
chr4:2492645(+) A-I      intronic
chr4:2492662(+) A-I      intronic
chr4:2492672(+) A-I      intronic
chr4:2492987(+) A-I      intronic
chr4:2493007(+) A-I      intronic
chr4:2493038(+) A-I      intronic
chr4:2493129(+) A-I      intronic
chr4:2478223(+) A-I      intronic
chr4:2478245(+) A-I      intronic
chr4:2478617(+) A-I      intronic
chr4:2495317(+) A-I      intronic
chr4:2493146(+) A-I      intronic
chr4:2493163(+) A-I      intronic
chr4:2493250(+) A-I      intronic
chr4:2493263(+) A-I      intronic
chr4:2493287(+) A-I      intronic
chr4:2493327(+) A-I      intronic
chr4:2493422(+) A-I      intronic
chr4:2472859(+) A-I      intronic
chr4:2474595(+) A-I      intronic
chr4:2474604(+) A-I      intronic
chr4:2474955(+) A-I      intronic
chr4:2475638(+) A-I      intronic
chr4:2475901(+) A-I      intronic
chr4:2475984(+) A-I      intronic
chr4:2475985(+) A-I      intronic
chr4:2475998(+) A-I      intronic
chr4:2476607(+) A-I      intronic
chr4:2476634(+) A-I      intronic
chr4:2476674(+) A-I      intronic
chr4:2476972(+) A-I      intronic
chr4:2477005(+) A-I      intronic
chr4:2477010(+) A-I      intronic
chr4:2477091(+) A-I      intronic
chr4:2477097(+) A-I      intronic
chr4:2477121(+) A-I      intronic
chr4:2477130(+) A-I      intronic
chr4:2477159(+) A-I      intronic
chr4:2477183(+) A-I      intronic
chr4:2477211(+) A-I      intronic
chr4:2478769(+) A-I      intronic
chr4:2493602(+) A-I      intronic
chr4:2493640(+) A-I      intronic
chr4:2493723(+) A-I      intronic
chr4:2493738(+) A-I      intronic
chr4:2478770(+) A-I      intronic
chr4:2479152(+) A-I      intronic
chr4:2493746(+) A-I      intronic
chr4:2493747(+) A-I      intronic
chr4:2493748(+) A-I      intronic
chr4:2493828(+) A-I      intronic
chr4:2493886(+) A-I      intronic
chr4:2495328(+) A-I      intronic
chr4:2495450(+) A-I      intronic
chr4:2496127(+) A-I      intronic
chr4:2496244(+) A-I      intronic
chr4:2493423(+) A-I      intronic
chr4:2499436(+) A-I      intronic
chr4:2499487(+) A-I      intronic
chr4:2499507(+) A-I      intronic
chr4:2499544(+) A-I      intronic
chr4:2499546(+) A-I      intronic
chr4:2499560(+) A-I      intronic
chr4:2499635(+) A-I      intronic
chr4:2499637(+) A-I      intronic
chr4:2499991(+) A-I      intronic
chr4:2500014(+) A-I      intronic
chr4:2500015(+) A-I      intronic
chr4:2500130(+) A-I      intronic
chr4:2500699(+) A-I      intronic
chr4:2500746(+) A-I      intronic
chr4:2500747(+) A-I      intronic
chr4:2500753(+) A-I      intronic
chr4:2500774(+) A-I      intronic
chr4:2501062(+) A-I      intronic
chr4:2501143(+) A-I      intronic
chr4:2485715(+) A-I      intronic
chr4:2485734(+) A-I      intronic
chr4:2495251(+) A-I      intronic
chr4:2495268(+) A-I      intronic
chr4:2495282(+) A-I      intronic
chr4:2495283(+) A-I      intronic
chr4:2495293(+) A-I      intronic
chr4:2495308(+) A-I      intronic
chr4:2495309(+) A-I      intronic
chr4:2495316(+) A-I      intronic
chr4:2479058(+) A-I      intronic
chr4:2495318(+) A-I      intronic
chr4:2495324(+) A-I      intronic
chr4:2495329(+) A-I      intronic
chr4:2495334(+) A-I      intronic
chr4:2495356(+) A-I      intronic
chr4:2496270(+) A-I      intronic
chr4:2496271(+) A-I      intronic
chr4:2478645(+) A-I      intronic
chr4:2478771(+) A-I      intronic
chr4:2478786(+) A-I      intronic
chr4:2479102(+) A-I      intronic
chr4:2479154(+) A-I      intronic
chr4:2479173(+) A-I      intronic
chr4:2479201(+) A-I      intronic
chr4:2504806(+) A-I      intronic
chr4:2504786(+) A-I      intronic
chr4:2504477(+) A-I      intronic
chr4:2504435(+) A-I      intronic
chr4:2504305(+) A-I      intronic
chr4:2504166(+) A-I      intronic
chr4:2501754(+) A-I      intronic
chr4:2501706(+) A-I      intronic
chr4:2501637(+) A-I      intronic
chr4:2501264(+) A-I      intronic
chr4:2501225(+) A-I      intronic
chr4:2501212(+) A-I      intronic
chr4:2477231(+) A-I      intronic
chr4:2516182(+) A-I      3'UTR
chr4:2516156(+) A-I      3'UTR
chr4:2481787(+) A-I      5'UTR
chr4:2516149(+) A-I      3'UTR
chr4:2516158(+) A-I      3'UTR
chr4:2516150(+) A-I      3'UTR
chr4:2516159(+) A-I      3'UTR
chr4:2516157(+) A-I      3'UTR
chr4:2472798(+) A-I      5'UTR
chr4:2495377(+) A-I      intronic
chr4:2496314(+) A-I      intronic
chr4:2501711(+) A-I      intronic
chr4:2504234(+) A-I      intronic
chr4:2475830(+) A-I      intronic
chr4:2496185(+) A-I      intronic
chr4:2485410(+) A-I      intronic
chr4:2493223(+) A-I      intronic
chr4:2505794(+) A-I      intronic
chr4:2500723(+) A-I      intronic
chr4:2499967(+) A-I      intronic
chr4:2475417(+) A-I      intronic
chr4:2479156(+) A-I      intronic
chr4:2500598(+) A-I      intronic
chr4:2475637(+) A-I      intronic
chr4:2500040(+) A-I      intronic
chr4:2508315(+) A-I      intronic
chr4:2504158(+) A-I      intronic
chr4:2489036(+) A-I      intronic
chr4:2501186(+) A-I      intronic
chr4:2504672(+) A-I      intronic
chr4:2494007(+) A-I      intronic
chr4:2495351(+) A-I      intronic
chr4:2476496(+) A-I      intronic
chr4:2493805(+) A-I      intronic
chr4:2500668(+) A-I      intronic
chr4:2508487(+) A-I      intronic
chr4:2500077(+) A-I      intronic
chr4:2501680(+) A-I      intronic
chr4:2495750(+) A-I      intronic
chr4:2500669(+) A-I      intronic
chr4:2479191(+) A-I      intronic
chr4:2498371(+) A-I      intronic
chr4:2493063(+) A-I      intronic
chr4:2475790(+) A-I      intronic
chr4:2493144(+) A-I      intronic
chr4:2493064(+) A-I      intronic
chr4:2493274(+) A-I      intronic
chr4:2478578(+) A-I      intronic
chr4:2504601(+) A-I      intronic
chr4:2504235(+) A-I      intronic
chr4:2475493(+) A-I      intronic
chr4:2492725(+) A-I      intronic
chr4:2485480(+) A-I      intronic
chr4:2500004(+) A-I      intronic
chr4:2493125(+) A-I      intronic
chr4:2500028(+) A-I      intronic
chr4:2504301(+) A-I      intronic
chr4:2485316(+) A-I      intronic
chr4:2501104(+) A-I      intronic
chr4:2500050(+) A-I      intronic
chr4:2474551(+) A-I      intronic
chr4:2485273(+) A-I      intronic
chr4:2477018(+) A-I      intronic
chr4:2500098(+) A-I      intronic
chr4:2475470(+) A-I      intronic
chr4:2500653(+) A-I      intronic
chr4:2493369(+) A-I      intronic
chr4:2493143(+) A-I      intronic
chr4:2475620(+) A-I      intronic
chr4:2492608(+) A-I      intronic
chr4:2504876(+) A-I      intronic
chr4:2481750(+) A-I      5'UTR
chr4:2481797(+) A-I      5'UTR
chr4:2472774(+) A-I      5'UTR
chr4:2472833(+) A-I      5'UTR
chr4:2481944(+) A-I      5'UTR
chr4:2472724(+) A-I      5'UTR
chr4:2472794(+) A-I      5'UTR
chr4:2472823(+) A-I      5'UTR
chr4:2500803(+) A-I      intronic
chr4:2504319(+) A-I      intronic
chr4:2499622(+) A-I      intronic
chr4:2476510(+) A-I      intronic
chr4:2475634(+) A-I      intronic
chr4:2475740(+) A-I      intronic
chr4:2504609(+) A-I      intronic
chr4:2479110(+) A-I      intronic
chr4:2499466(+) A-I      intronic
chr4:2500666(+) A-I      intronic
chr4:2476651(+) A-I      intronic
chr4:2475733(+) A-I      intronic
chr4:2501121(+) A-I      intronic
chr4:2504311(+) A-I      intronic
chr4:2479130(+) A-I      intronic
chr4:2475418(+) A-I      intronic
chr4:2493389(+) A-I      intronic
chr4:2478161(+) A-I      intronic
chr4:2477032(+) A-I      intronic
chr4:2504225(+) A-I      intronic
chr4:2504626(+) A-I      intronic
chr4:2490723(+) A-I      intronic
chr4:2485392(+) A-I      intronic
chr4:2495253(+) A-I      intronic
chr4:2477247(+) A-I      intronic
chr4:2504163(+) A-I      intronic
chr4:2505789(+) A-I      intronic
chr4:2505715(+) A-I      intronic
chr4:2488890(+) A-I      intronic
chr4:2492599(+) A-I      intronic
chr4:2504678(+) A-I      intronic
chr4:2490677(+) A-I      intronic
chr4:2498236(+) A-I      intronic
chr4:2478191(+) A-I      intronic
chr4:2505714(+) A-I      intronic
chr4:2504870(+) A-I      intronic
chr4:2508468(+) A-I      intronic
chr4:2504483(+) A-I      intronic
chr4:2500748(+) A-I      intronic
chr4:2501194(+) A-I      intronic
chr4:2492603(+) A-I      intronic
chr4:2485384(+) A-I      intronic
chr4:2501696(+) A-I      intronic
chr4:2492984(+) A-I      intronic
chr4:2504278(+) A-I      intronic
chr4:2472896(+) A-I      intronic
chr4:2476686(+) A-I      intronic
chr4:2505711(+) A-I      intronic
chr4:2489401(+) A-I      intronic
chr4:2504451(+) A-I      intronic
chr4:2476566(+) A-I      intronic
chr4:2499385(+) A-I      intronic
chr4:2500011(+) A-I      intronic
chr4:2493578(+) A-I      intronic
chr4:2496230(+) A-I      intronic
chr4:2501834(+) A-I      intronic
chr4:2499442(+) A-I      intronic
chr4:2474968(+) A-I      intronic
chr4:2495747(+) A-I      intronic
chr4:2476913(+) A-I      intronic
chr4:2501265(+) A-I      intronic
chr4:2495350(+) A-I      intronic
chr4:2504690(+) A-I      intronic
chr4:2499568(+) A-I      intronic
chr4:2475391(+) A-I      intronic
chr4:2479111(+) A-I      intronic
chr4:2501133(+) A-I      intronic
chr4:2478638(+) A-I      intronic
chr4:2504775(+) A-I      intronic
chr4:2501738(+) A-I      intronic
chr4:2476060(+) A-I      intronic
chr4:2500112(+) A-I      intronic
chr4:2508171(+) A-I      intronic
chr4:2476497(+) A-I      intronic
chr4:2475285(+) A-I      intronic
chr4:2493641(+) A-I      intronic
chr4:2492668(+) A-I      intronic
chr4:2475621(+) A-I      intronic
chr4:2501107(+) A-I      intronic
chr4:2509605(+) A-I      intronic
chr4:2495670(+) A-I      intronic
chr4:2485411(+) A-I      intronic
chr4:2504320(+) A-I      intronic
chr4:2485267(+) A-I      intronic
chr4:2499410(+) A-I      intronic
chr4:2496292(+) A-I      intronic
chr4:2499406(+) A-I      intronic
chr4:2493429(+) A-I      intronic
chr4:2504695(+) A-I      intronic
chr4:2495767(+) A-I      intronic
chr4:2477205(+) A-I      intronic
chr4:2490070(+) A-I      intronic
chr4:2495254(+) A-I      intronic
chr4:2499975(+) A-I      intronic
chr4:2474959(+) A-I      intronic
chr4:2495406(+) A-I      intronic
chr4:2476703(+) A-I      intronic
chr4:2488976(+) A-I      intronic
chr4:2493969(+) A-I      intronic
chr4:2500124(+) A-I      intronic
chr4:2505762(+) A-I      intronic
chr4:2495753(+) A-I      intronic
chr4:2476914(+) A-I      intronic
chr4:2493103(+) A-I      intronic
chr4:2499425(+) A-I      intronic
chr4:2475456(+) A-I      intronic
chr4:2500189(+) A-I      intronic
chr4:2500120(+) A-I      intronic
chr4:2485439(+) A-I      intronic
chr4:2475729(+) A-I      intronic
chr4:2475978(+) A-I      intronic
chr4:2500804(+) A-I      intronic
chr4:2499448(+) A-I      intronic
chr4:2477019(+) A-I      intronic
chr4:2495383(+) A-I      intronic
chr4:2499370(+) A-I      intronic
chr4:2476993(+) A-I      intronic
chr4:2476568(+) A-I      intronic
chr4:2504491(+) A-I      intronic
chr4:2508517(+) A-I      intronic
chr4:2485440(+) A-I      intronic
chr4:2500762(+) A-I      intronic
chr4:2479081(+) A-I      intronic
chr4:2478626(+) A-I      intronic
chr4:2479059(+) A-I      intronic
chr4:2504598(+) A-I      intronic
chr4:2496206(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED RNF4
chr4:2500469(+) A-I intron -    22327324
chr4:2504657(+) A-I intron -    22327324
chr4:2472719(+) A-G exon 5'UTR    22484847
chr4:2472724(+) A-G exon 5'UTR    22484847
chr4:2472794(+) A-G exon 5'UTR    22484847
chr4:2472811(+) A-G exon 5'UTR    22484847
chr4:2472954(+) A-G intron -    22484847
chr4:2474964(+) A-G intron -    22484847
chr4:2474968(+) A-G intron -    22484847
chr4:2474980(+) A-G intron -    22484847
chr4:2475285(+) A-G intron -    22484847
chr4:2475391(+) A-G intron -    22484847
chr4:2475418(+) A-G intron -    22484847
chr4:2475470(+) A-G intron -    22484847
chr4:2475493(+) A-G intron -    22484847
chr4:2475634(+) A-G intron -    22484847
chr4:2475637(+) A-G intron -    22484847
chr4:2475978(+) A-G intron -    22484847
chr4:2475994(+) A-G intron -    22484847
chr4:2476037(+) A-G intron -    22484847
chr4:2476510(+) A-G intron -    22484847
chr4:2476651(+) A-G intron -    22484847
chr4:2476686(+) A-G intron -    22484847
chr4:2477018(+) A-G intron -    22484847
chr4:2477019(+) A-G intron -    22484847
chr4:2477032(+) A-G intron -    22484847
chr4:2477195(+) A-G intron -    22484847
chr4:2477205(+) A-G intron -    22484847
chr4:2478191(+) A-G intron -    22484847
chr4:2478361(+) A-G intron -    22484847
chr4:2478626(+) A-G intron -    22484847
chr4:2478683(+) A-G intron -    22484847
chr4:2478709(+) A-G intron -    22484847
chr4:2478761(+) A-G intron -    22484847
chr4:2479080(+) A-G intron -    22484847
chr4:2479081(+) A-G intron -    22484847
chr4:2479130(+) A-G intron -    22484847
chr4:2479153(+) A-G intron -    22484847
chr4:2479165(+) A-G intron -    22484847
chr4:2479191(+) A-G intron -    22484847
chr4:2482260(+) A-G intron -    22484847
chr4:2485267(+) A-G intron -    22484847
chr4:2485269(+) A-G intron -    22484847
chr4:2485273(+) A-G intron -    22484847
chr4:2485276(+) A-G intron -    22484847
chr4:2485384(+) A-G intron -    22484847
chr4:2485392(+) A-G intron -    22484847
chr4:2485411(+) A-G intron -    22484847
chr4:2485440(+) A-G intron -    22484847
chr4:2488976(+) A-G intron -    22484847
chr4:2489036(+) A-G intron -    22484847
chr4:2489955(+) C-T intron -    22484847
chr4:2490070(+) A-G intron -    22484847
chr4:2492668(+) A-G intron -    22484847
chr4:2492694(+) A-G intron -    22484847
chr4:2492725(+) A-G intron -    22484847
chr4:2493050(+) A-G intron -    22484847
chr4:2493063(+) A-G intron -    22484847
chr4:2493064(+) A-G intron -    22484847
chr4:2493081(+) A-G intron -    22484847
chr4:2493103(+) A-G intron -    22484847
chr4:2493144(+) A-G intron -    22484847
chr4:2493299(+) A-G intron -    22484847
chr4:2493369(+) A-G intron -    22484847
chr4:2493553(+) T-C intron -    22484847
chr4:2493578(+) A-G intron -    22484847
chr4:2493600(+) A-G intron -    22484847
chr4:2493805(+) A-G intron -    22484847
chr4:2493969(+) A-G intron -    22484847
chr4:2495292(+) A-G intron -    22484847
chr4:2495350(+) A-G intron -    22484847
chr4:2495351(+) A-G intron -    22484847
chr4:2495377(+) A-G intron -    22484847
chr4:2495753(+) A-G intron -    22484847
chr4:2495767(+) A-G intron -    22484847
chr4:2496230(+) A-G intron -    22484847
chr4:2496292(+) A-G intron -    22484847
chr4:2496314(+) A-G intron -    22484847
chr4:2499370(+) A-G intron -    22484847
chr4:2499385(+) A-G intron -    22484847
chr4:2499406(+) A-G intron -    22484847
chr4:2499410(+) A-G intron -    22484847
chr4:2499425(+) A-G intron -    22484847
chr4:2499448(+) A-G intron -    22484847
chr4:2499466(+) A-G intron -    22484847
chr4:2499479(+) A-G intron -    22484847
chr4:2499491(+) A-G intron -    22484847
chr4:2499568(+) A-G intron -    22484847
chr4:2499622(+) A-G intron -    22484847
chr4:2499967(+) A-G intron -    22484847
chr4:2499975(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500004(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500011(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500028(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500040(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500050(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500098(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500112(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500115(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500120(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500124(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500598(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500653(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500666(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500668(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500669(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500723(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500737(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500738(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500748(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500777(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500803(+) A-G intron -    22484847
chr4:2500804(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501104(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501107(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501121(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501133(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501183(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501186(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501194(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501210(+) T-C intron -    22484847
chr4:2501255(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501635(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501680(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501696(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501711(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501765(+) A-G intron -    22484847
chr4:2501820(+) G-C intron -    22484847
chr4:2504157(+) A-G intron -    22484847
chr4:2504158(+) A-G intron -    22484847
chr4:2504163(+) A-G intron -    22484847
chr4:2504225(+) A-G intron -    22484847
chr4:2504235(+) A-G intron -    22484847
chr4:2504300(+) A-G intron -    22484847
chr4:2504301(+) A-G intron -    22484847
chr4:2504314(+) G-A intron -    22484847
chr4:2504609(+) A-G intron -    22484847
chr4:2504657(+) A-G intron -    22484847
chr4:2504792(+) A-G intron -    22484847
chr4:2504854(+) A-G intron -    22484847
chr4:2504870(+) A-G intron -    22484847
chr4:2505714(+) A-G intron -    22484847
chr4:2505715(+) A-G intron -    22484847
chr4:2506748(+) G-A intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase RNF4
chr4:2464311-2464312(+) m6A 5'UTR       27773536
chr4:2464410-2464411(+) m6A intron       27773536
chr4:2470595-2470596(+) m6A 5'UTR//intron       27371828//27773536
chr4:2470612-2470613(+) m6A 5'UTR//intron       27773536
chr4:2470897-2470898(+) m1A 5'UTR//exon//intron       26863196
chr4:2470940-2470941(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24981863
chr4:2515578-2515579(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr4:2515586-2515587(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr4:2515637-2515638(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr4:2515648-2515649(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr4:2515667-2515668(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr4:2515728-2515729(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr4:2515962-2515963(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//25456834//24981863
chr4:2516023-2516024(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr4:2516035-2516036(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//22608085
chr4:2516121-2516122(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//22608085
chr4:2516299-2516300(+) m6A 3'UTR//intron       24284625
chr4:2516337-2516338(+) m6A 3'UTR//intron       24284625
chr4:2516551-2516552(+) m6A 3'UTR//intron       24284625
chr4:2516676-2516677(+) m6A 3'UTR//intron       24284625
chr4:2516831-2516832(+) Y 3'UTR//intron       26075521
chr4:2516868-2516869(+) m6A 3'UTR//intron       24284625
chr4:2516890-2516891(+) m6A 3'UTR//intron       24284625

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-374a-3p
Exosome Plasma     23663360
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Colon cancer cell line (LIM1863)|Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
RNF4
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)     -
Ribosome HEK-293 cells     22199352
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-374a-3p
Interactor2: RNF4

Evidence Support:


Weak-Evidence PAR-CLIP
Support Database ViRBase

References:


PMID 22291592 Target region 3'UTR
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells Interactor2 expression None
Description We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.

Starting a new search, please wait ...