Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00064906

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-30c-2-3p:  MIMAT0004550          TENT2:  NM_001388106     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-30c-2-3p	TENT2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004550	167153
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	APD4//GLD2//PAPD4//TUT2

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-30c-2-3p	rs1262929323 chr6:71376964    A/G rs1413659455 chr6:71376968    T/C rs1421032991 chr6:71376975    C/A rs1421032991 chr6:71376975    C/G rs1488181071 chr6:71376967    G/T rs747913643 chr6:71376976    C/A rs760276048 chr6:71376974    G/C rs775896072 chr6:71376969    A/G

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	TENT2	chr5:78922777(+) A-I      intronic chr5:78922769(+) A-I      intronic chr5:78922757(+) A-I      intronic chr5:78935985(+) A-I      intronic chr5:78922737(+) A-I      intronic chr5:78922722(+) A-I      intronic chr5:78922400(+) A-I      intronic chr5:78922315(+) A-I      intronic chr5:78944076(+) A-I      intronic chr5:78972370(+) A-I      intronic chr5:78972355(+) A-I      intronic chr5:78972310(+) A-I      intronic chr5:78922306(+) A-I      intronic chr5:78922297(+) A-I      intronic chr5:78979043(+) A-I      intronic chr5:78979021(+) A-I      intronic chr5:78972269(+) A-I      intronic chr5:78972261(+) A-I      intronic chr5:78972252(+) A-I      intronic chr5:78972250(+) A-I      intronic chr5:78972248(+) A-I      intronic chr5:78972247(+) A-I      intronic chr5:78972226(+) A-I      intronic chr5:78972213(+) A-I      intronic chr5:78967770(+) A-I      intronic chr5:78967740(+) A-I      intronic chr5:78967719(+) A-I      intronic chr5:78967716(+) A-I      intronic chr5:78967711(+) A-I      intronic chr5:78967701(+) A-I      intronic chr5:78965921(+) A-I      intronic chr5:78967671(+) A-I      intronic chr5:78929900(+) A-I      intronic chr5:78923408(+) A-I      intronic chr5:78923395(+) A-I      intronic chr5:78923383(+) A-I      intronic chr5:78923373(+) A-I      intronic chr5:78944051(+) A-I      intronic chr5:78942831(+) A-I      intronic chr5:78965922(+) A-I      intronic chr5:78942827(+) A-I      intronic chr5:78942661(+) A-I      intronic chr5:78936036(+) A-I      intronic chr5:78966289(+) A-I      intronic chr5:78966331(+) A-I      intronic chr5:78966420(+) A-I      intronic chr5:78967302(+) A-I      intronic chr5:78935855(+) A-I      intronic chr5:78935830(+) A-I      intronic chr5:78933330(+) A-I      intronic chr5:78933305(+) A-I      intronic chr5:78980699(+) A-I      intronic chr5:78980694(+) A-I      intronic chr5:78979622(+) A-I      intronic chr5:78979606(+) A-I      intronic chr5:78979586(+) A-I      intronic chr5:78979584(+) A-I      intronic chr5:78979484(+) A-I      intronic chr5:78979048(+) A-I      intronic chr5:78979015(+) A-I      intronic chr5:78979006(+) A-I      intronic chr5:78933273(+) A-I      intronic chr5:78978342(+) A-I      intronic chr5:78978328(+) A-I      intronic chr5:78978220(+) A-I      intronic chr5:78978203(+) A-I      intronic chr5:78932961(+) A-I      intronic chr5:78931478(+) A-I      intronic chr5:78930706(+) A-I      intronic chr5:78930299(+) A-I      intronic chr5:78929871(+) A-I      intronic chr5:78929799(+) A-I      intronic chr5:78929798(+) A-I      intronic chr5:78922192(+) A-I      intronic chr5:78922186(+) A-I      intronic chr5:78922088(+) A-I      intronic chr5:78970130(+) A-I      intronic chr5:78970051(+) A-I      intronic chr5:78925798(+) A-I      intronic chr5:78922058(+) A-I      intronic chr5:78922052(+) A-I      intronic chr5:78929797(+) A-I      intronic chr5:78922038(+) A-I      intronic chr5:78925797(+) A-I      intronic chr5:78925780(+) A-I      intronic chr5:78921833(+) A-I      intronic chr5:78967331(+) A-I      intronic chr5:78929789(+) A-I      intronic chr5:78929730(+) A-I      intronic chr5:78925773(+) A-I      intronic chr5:78925683(+) A-I      intronic chr5:78970050(+) A-I      intronic chr5:78970047(+) A-I      intronic chr5:78921832(+) A-I      intronic chr5:78921818(+) A-I      intronic chr5:78921791(+) A-I      intronic chr5:78921752(+) A-I      intronic chr5:78921672(+) A-I      intronic chr5:78917963(+) A-I      intronic chr5:78925552(+) A-I      intronic chr5:78925529(+) A-I      intronic chr5:78967811(+) A-I      intronic chr5:78967492(+) A-I      intronic chr5:78917953(+) A-I      intronic chr5:78917948(+) A-I      intronic chr5:78974998(+) A-I      intronic chr5:78965796(+) A-I      intronic chr5:78929727(+) A-I      intronic chr5:78965919(+) A-I      intronic chr5:78925499(+) A-I      intronic chr5:78921849(+) A-I      intronic chr5:78967468(+) A-I      intronic chr5:78967357(+) A-I      intronic chr5:78929381(+) A-I      intronic chr5:78929286(+) A-I      intronic chr5:78926259(+) A-I      intronic chr5:78926236(+) A-I      intronic chr5:78926161(+) A-I      intronic chr5:78925907(+) A-I      intronic chr5:78967332(+) A-I      intronic chr5:78923435(+) A-I      intronic chr5:78923412(+) A-I      intronic chr5:78922908(+) A-I      intronic chr5:78922874(+) A-I      intronic chr5:78925801(+) A-I      intronic chr5:78925799(+) A-I      intronic chr5:78922849(+) A-I      intronic chr5:78922842(+) A-I      intronic chr5:78961912(+) A-I      intronic chr5:78962657(+) A-I      intronic chr5:78929765(+) A-I      intronic chr5:78922801(+) A-I      intronic chr5:78974828(+) A-I      intronic chr5:78974803(+) A-I      intronic chr5:78922800(+) A-I      intronic chr5:78922794(+) A-I      intronic chr5:78962672(+) A-I      intronic chr5:78967491(+) A-I      intronic chr5:78917525(+) A-I      intronic chr5:78929491(+) A-I      intronic chr5:78931543(+) A-I      intronic chr5:78973708(+) A-I      intronic chr5:78925837(+) A-I      intronic chr5:78944043(+) A-I      intronic chr5:78932987(+) A-I      intronic chr5:78922211(+) A-I      intronic chr5:78966222(+) A-I      intronic chr5:78950265(+) A-I      intronic chr5:78921793(+) A-I      intronic chr5:78972839(+) A-I      intronic chr5:78980876(+) A-I      intronic chr5:78930780(+) A-I      intronic chr5:78930741(+) A-I      intronic chr5:78929869(+) A-I      intronic chr5:78967807(+) A-I      intronic chr5:78978189(+) A-I      intronic chr5:78980126(+) A-I      intronic chr5:78933376(+) A-I      intronic chr5:78962669(+) A-I      intronic chr5:78930301(+) A-I      intronic chr5:78966314(+) A-I      intronic chr5:78978370(+) A-I      intronic chr5:78935958(+) A-I      intronic chr5:78929722(+) A-I      intronic chr5:78935981(+) A-I      intronic chr5:78921727(+) A-I      intronic chr5:78931567(+) A-I      intronic chr5:78980810(+) A-I      intronic chr5:78922494(+) A-I      intronic chr5:78926349(+) A-I      intronic chr5:78917852(+) A-I      intronic chr5:78929845(+) A-I      intronic chr5:78961822(+) A-I      intronic chr5:78922413(+) A-I      intronic chr5:78926160(+) A-I      intronic chr5:78973709(+) A-I      intronic chr5:78921781(+) A-I      intronic chr5:78921683(+) A-I      intronic chr5:78972836(+) A-I      intronic chr5:78966179(+) A-I      intronic chr5:78978242(+) A-I      intronic chr5:78932916(+) A-I      intronic chr5:78930208(+) A-I      intronic chr5:78967434(+) A-I      intronic chr5:78955252(+) A-I      intronic chr5:78922337(+) A-I      intronic chr5:78930707(+) A-I      intronic chr5:78949195(+) A-I      intronic chr5:78922028(+) A-I      intronic chr5:78967747(+) A-I      intronic chr5:78917320(+) A-I      intronic chr5:78980218(+) A-I      intronic chr5:78961978(+) A-I      intronic chr5:78931653(+) A-I      intronic chr5:78935851(+) A-I      intronic chr5:78960242(+) A-I      intronic chr5:78925484(+) A-I      intronic chr5:78962073(+) A-I      intronic chr5:78929721(+) A-I      intronic chr5:78980146(+) A-I      intronic chr5:78980774(+) A-I      intronic chr5:78965887(+) A-I      intronic chr5:78944027(+) A-I      intronic chr5:78923438(+) A-I      intronic chr5:78926400(+) A-I      intronic chr5:78980700(+) A-I      intronic chr5:78962271(+) A-I      intronic chr5:78980268(+) A-I      intronic chr5:78966348(+) A-I      intronic chr5:78967805(+) A-I      intronic chr5:78967283(+) A-I      intronic chr5:78967500(+) A-I      intronic chr5:78930745(+) A-I      intronic chr5:78980734(+) A-I      intronic chr5:78929482(+) A-I      intronic chr5:78926321(+) A-I      intronic chr5:78925945(+) A-I      intronic chr5:78931561(+) A-I      intronic chr5:78932946(+) A-I      intronic chr5:78929419(+) A-I      intronic chr5:78932910(+) A-I      intronic chr5:78935932(+) A-I      intronic chr5:78967742(+) A-I      intronic chr5:78967685(+) A-I      intronic chr5:78955103(+) A-I      intronic chr5:78930758(+) A-I      intronic chr5:78967328(+) A-I      intronic chr5:78966350(+) A-I      intronic chr5:78926182(+) A-I      intronic chr5:78923327(+) A-I      intronic chr5:78933379(+) A-I      intronic chr5:78931495(+) A-I      intronic chr5:78972246(+) A-I      intronic chr5:78932942(+) A-I      intronic chr5:78922700(+) A-I      intronic chr5:78921732(+) A-I      intronic chr5:78922196(+) A-I      intronic chr5:78931517(+) A-I      intronic chr5:78923505(+) A-I      intronic chr5:78980130(+) A-I      intronic chr5:78921881(+) A-I      intronic chr5:78979022(+) A-I      intronic chr5:78933669(+) A-I      intronic chr5:78967248(+) A-I      intronic chr5:78962052(+) A-I      intronic chr5:78930798(+) A-I      intronic chr5:78922059(+) A-I      intronic chr5:78925396(+) A-I      intronic chr5:78944106(+) A-I      intronic chr5:78944008(+) A-I      intronic chr5:78930770(+) A-I      intronic chr5:78944075(+) A-I      intronic chr5:78980371(+) A-I      intronic chr5:78973654(+) A-I      intronic chr5:78965797(+) A-I      intronic chr5:78921889(+) A-I      intronic chr5:78965987(+) A-I      intronic chr5:78978172(+) A-I      intronic chr5:78978164(+) A-I      intronic chr5:78973736(+) A-I      intronic chr5:78921708(+) A-I      intronic chr5:78923448(+) A-I      intronic chr5:78930342(+) A-I      intronic chr5:78926229(+) A-I      intronic chr5:78978133(+) A-I      intronic chr5:78922076(+) A-I      intronic chr5:78923488(+) A-I      intronic chr5:78923331(+) A-I      intronic chr5:78965986(+) A-I      intronic chr5:78979027(+) A-I      intronic chr5:78966398(+) A-I      intronic chr5:78930691(+) A-I      intronic chr5:78936020(+) A-I      intronic chr5:78980331(+) A-I      intronic chr5:78922044(+) A-I      intronic chr5:78921893(+) A-I      intronic chr5:78925942(+) A-I      intronic chr5:78917487(+) A-I      intronic chr5:78926355(+) A-I      intronic chr5:78926183(+) A-I      intronic chr5:78931601(+) A-I      intronic chr5:78922559(+) A-I      intronic chr5:78923372(+) A-I      intronic chr5:78929899(+) A-I      intronic chr5:78926307(+) A-I      intronic chr5:78972314(+) A-I      intronic chr5:78942672(+) A-I      intronic chr5:78922104(+) A-I      intronic chr5:78933019(+) A-I      intronic chr5:78931617(+) A-I      intronic chr5:78932979(+) A-I      intronic chr5:78921738(+) A-I      intronic chr5:78979596(+) A-I      intronic chr5:78922868(+) A-I      intronic chr5:78967878(+) A-I      intronic chr5:78967748(+) A-I      intronic chr5:78926325(+) A-I      intronic chr5:78933274(+) A-I      intronic chr5:78931544(+) A-I      intronic chr5:78930253(+) A-I      intronic chr5:78966313(+) A-I      intronic chr5:78925890(+) A-I      intronic chr5:78929422(+) A-I      intronic chr5:78935825(+) A-I      intronic chr5:78972328(+) A-I      intronic chr5:78932914(+) A-I      intronic chr5:78980206(+) A-I      intronic chr5:78931558(+) A-I      intronic chr5:78921835(+) A-I      intronic chr5:78961951(+) A-I      intronic chr5:78965783(+) A-I      intronic chr5:78930234(+) A-I      intronic chr5:78930711(+) A-I      intronic chr5:78935824(+) A-I      intronic chr5:78980745(+) A-I      intronic chr5:78962416(+) A-I      intronic chr5:78936054(+) A-I      intronic chr5:78980760(+) A-I      intronic chr5:78921911(+) A-I      intronic chr5:78960164(+) A-I      intronic chr5:78922260(+) A-I      intronic chr5:78922699(+) A-I      intronic chr5:78930345(+) A-I      intronic chr5:78921924(+) A-I      intronic chr5:78979028(+) A-I      intronic chr5:78967815(+) A-I      intronic chr5:78930397(+) A-I      intronic chr5:78935809(+) A-I      intronic chr5:78930422(+) A-I      intronic chr5:78979196(+) A-I      intronic

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-30c-2-3p	Exosome B cell line (Raji)|Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438 Exosome Plasma     23663360 Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Seminal plasma     23539611 Microvesicle Serum     24797360 Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     - Mitochondrion Cell line (HEK-293|HeLa)     22984580
	TENT2	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352 Ribosome Colon cancer cells     24393600

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID	Function	Link
RNAInter	hsa-miR-30c-2-3p	Gemcitabine 60750 Drug interaction    RC00006870 Eloxatine 5310940 Drug interaction    RC00006871 5-Fluorouracil 3385 Drug interaction    RC00006869

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID	PMID
NoncoRNA	hsa-miR-30c-2-3p	Cisplatin 5702198       27506865

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-30c-2-3p
Interactor2: TENT2

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	None
Description	We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.