Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00064492

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-29b-2-5p:  MIMAT0004515          KCTD20:  NM_001286579     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-29b-2-5p	KCTD20
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004515	222658
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	C6orf69//dJ108K11.3

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-29b-2-5p	rs1389711693 chr1:207802500    C/A rs200396959 chr1:207802497    C/T rs971770488 chr1:207802503    T/A

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	KCTD20	chr6:36414500(+) A-I      intronic chr6:36412661(+) A-I      intronic chr6:36414483(+) A-I      intronic chr6:36438453(+) A-I      intronic chr6:36435373(+) A-I      intronic chr6:36441330(+) A-I      intronic chr6:36441122(+) A-I      intronic chr6:36441086(+) A-I      intronic chr6:36445398(+) A-I      intronic chr6:36445374(+) A-I      intronic chr6:36445322(+) A-I      intronic chr6:36443183(+) A-I      intronic chr6:36443147(+) A-I      intronic chr6:36443103(+) A-I      intronic chr6:36443096(+) A-I      intronic chr6:36451457(+) A-I      intronic chr6:36451190(+) A-I      intronic chr6:36432953(+) A-I      intronic chr6:36432922(+) A-I      intronic chr6:36432917(+) A-I      intronic chr6:36432270(+) A-I      intronic chr6:36432234(+) A-I      intronic chr6:36432195(+) A-I      intronic chr6:36432170(+) A-I      intronic chr6:36428334(+) A-I      intronic chr6:36428263(+) A-I      intronic chr6:36428220(+) A-I      intronic chr6:36428217(+) A-I      intronic chr6:36428214(+) A-I      intronic chr6:36428142(+) A-I      intronic chr6:36427020(+) A-I      intronic chr6:36426991(+) A-I      intronic chr6:36426974(+) A-I      intronic chr6:36426930(+) A-I      intronic chr6:36426913(+) A-I      intronic chr6:36426912(+) A-I      intronic chr6:36426882(+) A-I      intronic chr6:36426558(+) A-I      intronic chr6:36426534(+) A-I      intronic chr6:36426065(+) A-I      intronic chr6:36426051(+) A-I      intronic chr6:36425971(+) A-I      intronic chr6:36425387(+) A-I      intronic chr6:36424837(+) A-I      intronic chr6:36424836(+) A-I      intronic chr6:36424809(+) A-I      intronic chr6:36424670(+) A-I      intronic chr6:36424507(+) A-I      intronic chr6:36424444(+) A-I      intronic chr6:36424253(+) A-I      intronic chr6:36424239(+) A-I      intronic chr6:36424173(+) A-I      intronic chr6:36424155(+) A-I      intronic chr6:36424136(+) A-I      intronic chr6:36424042(+) A-I      intronic chr6:36423972(+) A-I      intronic chr6:36423106(+) A-I      intronic chr6:36423070(+) A-I      intronic chr6:36423064(+) A-I      intronic chr6:36423038(+) A-I      intronic chr6:36423024(+) A-I      intronic chr6:36423023(+) A-I      intronic chr6:36423003(+) A-I      intronic chr6:36423001(+) A-I      intronic chr6:36422986(+) A-I      intronic chr6:36422965(+) A-I      intronic chr6:36422929(+) A-I      intronic chr6:36422362(+) A-I      intronic chr6:36422358(+) A-I      intronic chr6:36422299(+) A-I      intronic chr6:36422260(+) A-I      intronic chr6:36422258(+) A-I      intronic chr6:36422236(+) A-I      intronic chr6:36422222(+) A-I      intronic chr6:36422219(+) A-I      intronic chr6:36422140(+) A-I      intronic chr6:36451187(+) A-I      intronic chr6:36451100(+) A-I      intronic chr6:36451089(+) A-I      intronic chr6:36451156(+) A-I      intronic chr6:36451131(+) A-I      intronic chr6:36451355(+) A-I      intronic chr6:36421549(+) A-I      intronic chr6:36421508(+) A-I      intronic chr6:36421431(+) A-I      intronic chr6:36421418(+) A-I      intronic chr6:36421356(+) A-I      intronic chr6:36421312(+) A-I      intronic chr6:36421310(+) A-I      intronic chr6:36420515(+) A-I      intronic chr6:36420512(+) A-I      intronic chr6:36420495(+) A-I      intronic chr6:36420489(+) A-I      intronic chr6:36420481(+) A-I      intronic chr6:36420451(+) A-I      intronic chr6:36420444(+) A-I      intronic chr6:36419788(+) A-I      intronic chr6:36419777(+) A-I      intronic chr6:36419717(+) A-I      intronic chr6:36419688(+) A-I      intronic chr6:36419687(+) A-I      intronic chr6:36419604(+) A-I      intronic chr6:36419549(+) A-I      intronic chr6:36419502(+) A-I      intronic chr6:36419501(+) A-I      intronic chr6:36419464(+) A-I      intronic chr6:36419453(+) A-I      intronic chr6:36419365(+) A-I      intronic chr6:36419352(+) A-I      intronic chr6:36418193(+) A-I      intronic chr6:36418134(+) A-I      intronic chr6:36418089(+) A-I      intronic chr6:36417678(+) A-I      intronic chr6:36415413(+) A-I      intronic chr6:36415412(+) A-I      intronic chr6:36415286(+) A-I      intronic chr6:36415247(+) A-I      intronic chr6:36414286(+) A-I      intronic chr6:36413921(+) A-I      intronic chr6:36413904(+) A-I      intronic chr6:36413868(+) A-I      intronic chr6:36413847(+) A-I      intronic chr6:36413826(+) A-I      intronic chr6:36412928(+) A-I      intronic chr6:36412784(+) A-I      intronic chr6:36412783(+) A-I      intronic chr6:36412775(+) A-I      intronic chr6:36448439(+) A-I      intronic chr6:36420351(+) A-I      intronic chr6:36451941(+) A-I      intronic chr6:36422515(+) A-I      intronic chr6:36435320(+) A-I      intronic chr6:36434974(+) A-I      intronic chr6:36434965(+) A-I      intronic chr6:36434964(+) A-I      intronic chr6:36434932(+) A-I      intronic chr6:36434929(+) A-I      intronic chr6:36434909(+) A-I      intronic chr6:36434898(+) A-I      intronic chr6:36432994(+) A-I      intronic chr6:36432962(+) A-I      intronic chr6:36423025(+) A-I      intronic chr6:36438519(+) A-I      intronic chr6:36451773(+) A-I      intronic chr6:36418009(+) A-I      intronic chr6:36418016(+) A-I      intronic chr6:36418018(+) A-I      intronic chr6:36418026(+) A-I      intronic chr6:36420364(+) A-I      intronic chr6:36424182(+) A-I      intronic chr6:36424217(+) A-I      intronic chr6:36424404(+) A-I      intronic chr6:36424418(+) A-I      intronic chr6:36426893(+) A-I      intronic chr6:36426903(+) A-I      intronic chr6:36441338(+) A-I      intronic chr6:36441361(+) A-I      intronic chr6:36441367(+) A-I      intronic chr6:36441370(+) A-I      intronic chr6:36441371(+) A-I      intronic chr6:36441387(+) A-I      intronic chr6:36441388(+) A-I      intronic chr6:36441390(+) A-I      intronic chr6:36441398(+) A-I      intronic chr6:36441407(+) A-I      intronic chr6:36448361(+) A-I      intronic chr6:36448402(+) A-I      intronic chr6:36448408(+) A-I      intronic chr6:36448418(+) A-I      intronic chr6:36450513(+) A-I      intronic chr6:36450522(+) A-I      intronic chr6:36450524(+) A-I      intronic chr6:36450570(+) A-I      intronic chr6:36450779(+) A-I      intronic chr6:36451371(+) A-I      intronic chr6:36451760(+) A-I      intronic chr6:36450802(+) A-I      intronic chr6:36450680(+) A-I      intronic chr6:36450673(+) A-I      intronic chr6:36450629(+) A-I      intronic chr6:36450552(+) A-I      intronic chr6:36450285(+) A-I      intronic chr6:36450223(+) A-I      intronic chr6:36450215(+) A-I      intronic chr6:36450209(+) A-I      intronic chr6:36450187(+) A-I      intronic chr6:36450182(+) A-I      intronic chr6:36450153(+) A-I      intronic chr6:36450142(+) A-I      intronic chr6:36450075(+) A-I      intronic chr6:36448530(+) A-I      intronic chr6:36448469(+) A-I      intronic chr6:36443052(+) A-I      intronic chr6:36448459(+) A-I      intronic chr6:36448403(+) A-I      intronic chr6:36448400(+) A-I      intronic chr6:36441048(+) A-I      intronic chr6:36440979(+) A-I      intronic chr6:36440955(+) A-I      intronic chr6:36438869(+) A-I      intronic chr6:36438778(+) A-I      intronic chr6:36438772(+) A-I      intronic chr6:36445793(+) A-I      intronic chr6:36445720(+) A-I      intronic chr6:36445498(+) A-I      intronic chr6:36438767(+) A-I      intronic chr6:36445485(+) A-I      intronic chr6:36442998(+) A-I      intronic chr6:36441403(+) A-I      intronic chr6:36438725(+) A-I      intronic chr6:36438539(+) A-I      intronic chr6:36438495(+) A-I      intronic chr6:36438478(+) A-I      intronic chr6:36458369(+) A-I      3'UTR chr6:36458370(+) A-I      3'UTR chr6:36458375(+) A-I      3'UTR chr6:36458391(+) A-I      3'UTR chr6:36458415(+) A-I      3'UTR chr6:36458392(+) A-I      3'UTR chr6:36458353(+) A-I      3'UTR chr6:36422248(+) A-I      intronic chr6:36441435(+) A-I      intronic chr6:36419614(+) A-I      intronic chr6:36450576(+) A-I      intronic chr6:36438763(+) A-I      intronic chr6:36450678(+) A-I      intronic chr6:36425915(+) A-I      intronic chr6:36441295(+) A-I      intronic chr6:36451090(+) A-I      intronic chr6:36425909(+) A-I      intronic chr6:36450571(+) A-I      intronic chr6:36438908(+) A-I      intronic chr6:36435064(+) A-I      intronic chr6:36445412(+) A-I      intronic chr6:36426966(+) A-I      intronic chr6:36445704(+) A-I      intronic chr6:36415339(+) A-I      intronic chr6:36419450(+) A-I      intronic chr6:36444307(+) A-I      intronic chr6:36450275(+) A-I      intronic chr6:36439886(+) A-I      intronic chr6:36417739(+) A-I      intronic chr6:36426060(+) A-I      intronic chr6:36451510(+) A-I      intronic chr6:36450742(+) A-I      intronic chr6:36418103(+) A-I      intronic chr6:36451392(+) A-I      intronic chr6:36425294(+) A-I      intronic chr6:36419396(+) A-I      intronic chr6:36441294(+) A-I      intronic chr6:36434938(+) A-I      intronic chr6:36450774(+) A-I      intronic chr6:36419406(+) A-I      intronic chr6:36425370(+) A-I      intronic chr6:36450626(+) A-I      intronic chr6:36444311(+) A-I      intronic chr6:36432914(+) A-I      intronic chr6:36422913(+) A-I      intronic chr6:36424976(+) A-I      intronic chr6:36438849(+) A-I      intronic chr6:36432152(+) A-I      intronic chr6:36424189(+) A-I      intronic chr6:36453953(+) A-I      intronic chr6:36422485(+) A-I      intronic chr6:36422540(+) A-I      intronic chr6:36420376(+) A-I      intronic chr6:36424884(+) A-I      intronic chr6:36422518(+) A-I      intronic chr6:36438807(+) A-I      intronic chr6:36425380(+) A-I      intronic chr6:36424946(+) A-I      intronic chr6:36415499(+) A-I      intronic chr6:36422480(+) A-I      intronic chr6:36415577(+) A-I      intronic chr6:36418036(+) A-I      intronic chr6:36425933(+) A-I      intronic chr6:36451570(+) A-I      intronic chr6:36433939(+) A-I      intronic chr6:36451999(+) A-I      intronic chr6:36423984(+) A-I      intronic chr6:36441044(+) A-I      intronic chr6:36423091(+) A-I      intronic chr6:36422588(+) A-I      intronic chr6:36445886(+) A-I      intronic chr6:36451974(+) A-I      intronic chr6:36458167(+) A-I      3'UTR chr6:36458135(+) A-I      3'UTR chr6:36451896(+) A-I      intronic chr6:36426879(+) A-I      intronic chr6:36434852(+) A-I      intronic chr6:36425282(+) A-I      intronic chr6:36425947(+) A-I      intronic chr6:36420384(+) A-I      intronic chr6:36450119(+) A-I      intronic chr6:36445721(+) A-I      intronic chr6:36445444(+) A-I      intronic chr6:36451315(+) A-I      intronic chr6:36451913(+) A-I      intronic chr6:36441429(+) A-I      intronic chr6:36424434(+) A-I      intronic chr6:36419393(+) A-I      intronic chr6:36423965(+) A-I      intronic chr6:36423140(+) A-I      intronic chr6:36447643(+) A-I      intronic chr6:36450563(+) A-I      intronic chr6:36450076(+) A-I      intronic chr6:36451516(+) A-I      intronic chr6:36441362(+) A-I      intronic chr6:36423134(+) A-I      intronic chr6:36441078(+) A-I      intronic chr6:36425916(+) A-I      intronic chr6:36450219(+) A-I      intronic chr6:36424810(+) A-I      intronic chr6:36420498(+) A-I      intronic chr6:36425344(+) A-I      intronic chr6:36445338(+) A-I      intronic chr6:36451385(+) A-I      intronic chr6:36424034(+) A-I      intronic chr6:36419286(+) A-I      intronic chr6:36450541(+) A-I      intronic chr6:36419392(+) A-I      intronic chr6:36422930(+) A-I      intronic chr6:36426535(+) A-I      intronic chr6:36441545(+) A-I      intronic chr6:36425341(+) A-I      intronic chr6:36450527(+) A-I      intronic chr6:36425929(+) A-I      intronic chr6:36424466(+) A-I      intronic chr6:36415164(+) A-I      intronic chr6:36445523(+) A-I      intronic chr6:36451846(+) A-I      intronic chr6:36451142(+) A-I      intronic chr6:36450489(+) A-I      intronic chr6:36432175(+) A-I      intronic chr6:36451318(+) A-I      intronic chr6:36438458(+) A-I      intronic chr6:36445418(+) A-I      intronic chr6:36432182(+) A-I      intronic chr6:36425303(+) A-I      intronic chr6:36418106(+) A-I      intronic chr6:36450608(+) A-I      intronic chr6:36451843(+) A-I      intronic chr6:36424720(+) A-I      intronic chr6:36451975(+) A-I      intronic chr6:36419541(+) A-I      intronic chr6:36415695(+) A-I      intronic chr6:36450773(+) A-I      intronic chr6:36439832(+) A-I      intronic chr6:36451108(+) A-I      intronic chr6:36450547(+) A-I      intronic chr6:36450062(+) A-I      intronic chr6:36451107(+) A-I      intronic chr6:36422907(+) A-I      intronic chr6:36451173(+) A-I      intronic chr6:36423135(+) A-I      intronic chr6:36426197(+) A-I      intronic chr6:36432238(+) A-I      intronic chr6:36423078(+) A-I      intronic chr6:36432173(+) A-I      intronic chr6:36440816(+) A-I      intronic chr6:36441039(+) A-I      intronic chr6:36424156(+) A-I      intronic chr6:36424265(+) A-I      intronic chr6:36417775(+) A-I      intronic chr6:36426880(+) A-I      intronic chr6:36419327(+) A-I      intronic chr6:36440995(+) A-I      intronic chr6:36426978(+) A-I      intronic chr6:36419727(+) A-I      intronic chr6:36425450(+) A-I      intronic chr6:36419823(+) A-I      intronic chr6:36451167(+) A-I      intronic chr6:36424716(+) A-I      intronic chr6:36424245(+) A-I      intronic chr6:36419657(+) A-I      intronic chr6:36419646(+) A-I      intronic chr6:36425315(+) A-I      intronic chr6:36445423(+) A-I      intronic chr6:36426833(+) A-I      intronic chr6:36438856(+) A-I      intronic chr6:36422699(+) A-I      intronic chr6:36425284(+) A-I      intronic chr6:36424095(+) A-I      intronic chr6:36451356(+) A-I      intronic chr6:36445719(+) A-I      intronic chr6:36435255(+) A-I      intronic chr6:36424851(+) A-I      intronic chr6:36413956(+) A-I      intronic chr6:36425930(+) A-I      intronic chr6:36450603(+) A-I      intronic chr6:36450147(+) A-I      intronic chr6:36451129(+) A-I      intronic chr6:36443073(+) A-I      intronic chr6:36426828(+) A-I      intronic chr6:36438883(+) A-I      intronic chr6:36422532(+) A-I      intronic chr6:36440498(+) A-I      intronic chr6:36425881(+) A-I      intronic chr6:36441272(+) A-I      intronic chr6:36426582(+) A-I      intronic chr6:36426239(+) A-I      intronic chr6:36424075(+) A-I      intronic chr6:36424482(+) A-I      intronic chr6:36435073(+) A-I      intronic chr6:36419382(+) A-I      intronic chr6:36424714(+) A-I      intronic chr6:36434394(+) A-I      intronic chr6:36419535(+) A-I      intronic chr6:36423020(+) A-I      intronic chr6:36433014(+) A-I      intronic chr6:36419377(+) A-I      intronic chr6:36424849(+) A-I      intronic chr6:36440742(+) A-I      intronic chr6:36422302(+) A-I      intronic chr6:36413933(+) A-I      intronic chr6:36419771(+) A-I      intronic chr6:36451210(+) A-I      intronic chr6:36426512(+) A-I      intronic chr6:36427072(+) A-I      intronic chr6:36433030(+) A-I      intronic chr6:36438808(+) A-I      intronic chr6:36441100(+) A-I      intronic chr6:36419368(+) A-I      intronic chr6:36440877(+) A-I      intronic chr6:36425430(+) A-I      intronic chr6:36426827(+) A-I      intronic chr6:36438817(+) A-I      intronic chr6:36451176(+) A-I      intronic chr6:36424459(+) A-I      intronic chr6:36443154(+) A-I      intronic chr6:36440771(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	KCTD20	chr6:36414505(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chr6:36414507(+) A-I intron -    22327324 chr6:36425344(+) A-I intron -    22327324 chr6:36451918(+) A-I intron -    22327324 chr6:36432152(+) A-I intron -    21960545 chr6:36432173(+) A-I intron -    21960545 chr6:36432189(+) A-I intron -    21960545 chr6:36432196(+) A-I intron -    21960545 chr6:36432238(+) A-I intron -    21960545 chr6:36438495(+) A-I intron -    21960545 chr6:36438517(+) A-I intron -    21960545 chr6:36413933(+) A-G intron -    22484847 chr6:36415164(+) A-G intron -    22484847 chr6:36415695(+) A-G intron -    22484847 chr6:36415699(+) T-C intron -    22484847 chr6:36417739(+) A-G intron -    22484847 chr6:36417820(+) A-G intron -    22484847 chr6:36418118(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419315(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419368(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419377(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419382(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419392(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419393(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419396(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419406(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419408(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419535(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419614(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419646(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419657(+) A-G intron -    22484847 chr6:36419712(+) T-C intron -    22484847 chr6:36419771(+) A-G intron -    22484847 chr6:36420498(+) A-G intron -    22484847 chr6:36420503(+) T-C intron -    22484847 chr6:36421309(+) G-T intron -    22484847 chr6:36421392(+) A-G intron -    22484847 chr6:36421409(+) A-G intron -    22484847 chr6:36421421(+) A-G intron -    22484847 chr6:36422248(+) A-G intron -    22484847 chr6:36422321(+) A-G intron -    22484847 chr6:36422393(+) A-G intron -    22484847 chr6:36422532(+) A-G intron -    22484847 chr6:36422534(+) T-C intron -    22484847 chr6:36422659(+) A-G intron -    22484847 chr6:36422907(+) A-G intron -    22484847 chr6:36422913(+) A-G intron -    22484847 chr6:36422930(+) A-G intron -    22484847 chr6:36423020(+) A-G intron -    22484847 chr6:36423117(+) A-G intron -    22484847 chr6:36423134(+) A-G intron -    22484847 chr6:36423135(+) A-G intron -    22484847 chr6:36423140(+) A-G intron -    22484847 chr6:36423965(+) A-G intron -    22484847 chr6:36423979(+) A-G intron -    22484847 chr6:36423984(+) A-G intron -    22484847 chr6:36424075(+) A-G intron -    22484847 chr6:36424095(+) A-G intron -    22484847 chr6:36424156(+) A-G intron -    22484847 chr6:36424189(+) A-G intron -    22484847 chr6:36424245(+) A-G intron -    22484847 chr6:36424265(+) A-G intron -    22484847 chr6:36424466(+) A-G intron -    22484847 chr6:36424714(+) A-G intron -    22484847 chr6:36424716(+) A-G intron -    22484847 chr6:36424722(+) A-G intron -    22484847 chr6:36424780(+) A-G intron -    22484847 chr6:36424849(+) A-G intron -    22484847 chr6:36424946(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425246(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425284(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425294(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425344(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425364(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425370(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425371(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425380(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425393(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425430(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425450(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425853(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425888(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425929(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425930(+) A-G intron -    22484847 chr6:36425947(+) A-G intron -    22484847 chr6:36426197(+) A-G intron -    22484847 chr6:36426512(+) A-G intron -    22484847 chr6:36426535(+) A-G intron -    22484847 chr6:36426586(+) A-G intron -    22484847 chr6:36426685(+) A-G intron -    22484847 chr6:36426827(+) A-G intron -    22484847 chr6:36426828(+) A-G intron -    22484847 chr6:36426833(+) A-G intron -    22484847 chr6:36426880(+) A-G intron -    22484847 chr6:36426918(+) A-G intron -    22484847 chr6:36426966(+) A-G intron -    22484847 chr6:36428150(+) A-G intron -    22484847 chr6:36432142(+) T-C intron -    22484847 chr6:36432173(+) A-G intron -    22484847 chr6:36432189(+) A-G intron -    22484847 chr6:36432196(+) A-G intron -    22484847 chr6:36432914(+) A-G intron -    22484847 chr6:36432920(+) A-G intron -    22484847 chr6:36432969(+) A-G intron -    22484847 chr6:36432984(+) A-G intron -    22484847 chr6:36432987(+) T-C intron -    22484847 chr6:36433014(+) A-G intron -    22484847 chr6:36433939(+) A-G intron -    22484847 chr6:36434843(+) A-G intron -    22484847 chr6:36434938(+) A-G intron -    22484847 chr6:36438551(+) A-G intron -    22484847 chr6:36438763(+) A-G intron -    22484847 chr6:36438807(+) A-G intron -    22484847 chr6:36438839(+) A-G intron -    22484847 chr6:36438873(+) A-G intron -    22484847 chr6:36438878(+) A-G intron -    22484847 chr6:36438883(+) A-G intron -    22484847 chr6:36440877(+) A-G intron -    22484847 chr6:36440995(+) A-G intron -    22484847 chr6:36441039(+) A-G intron -    22484847 chr6:36441044(+) A-G intron -    22484847 chr6:36441073(+) A-G intron -    22484847 chr6:36441100(+) A-G intron -    22484847 chr6:36441429(+) A-G intron -    22484847 chr6:36443073(+) A-G intron -    22484847 chr6:36443076(+) A-G intron -    22484847 chr6:36444299(+) C-T intron -    22484847 chr6:36444300(+) G-A intron -    22484847 chr6:36444307(+) A-G intron -    22484847 chr6:36445327(+) A-G intron -    22484847 chr6:36445338(+) A-G intron -    22484847 chr6:36445396(+) A-G intron -    22484847 chr6:36445418(+) A-G intron -    22484847 chr6:36445718(+) A-G intron -    22484847 chr6:36445725(+) A-G intron -    22484847 chr6:36450062(+) A-G intron -    22484847 chr6:36450076(+) A-G intron -    22484847 chr6:36450119(+) A-G intron -    22484847 chr6:36450143(+) A-G intron -    22484847 chr6:36450147(+) A-G intron -    22484847 chr6:36450219(+) A-G intron -    22484847 chr6:36450489(+) A-G intron -    22484847 chr6:36450541(+) A-G intron -    22484847 chr6:36450547(+) A-G intron -    22484847 chr6:36450563(+) A-G intron -    22484847 chr6:36450576(+) A-G intron -    22484847 chr6:36450626(+) A-G intron -    22484847 chr6:36450678(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451167(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451169(+) T-C intron -    22484847 chr6:36451176(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451210(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451356(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451385(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451392(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451510(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451516(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451781(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451843(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451846(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451896(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451913(+) A-G intron -    22484847 chr6:36451918(+) A-G intron -    22484847 chr6:36458132(+) T-C intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	KCTD20	chr6:36411233-36411234(+) m6A 5'UTR//exon//intron       - chr6:36452580-36452581(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24209618//24981863 chr6:36454854-36454855(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr6:36454894-36454895(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr6:36455046-36455047(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr6:36455250-36455251(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:36455358-36455359(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:36455363-36455364(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:36455399-36455400(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:36455478-36455479(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:36455556-36455557(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr6:36455566-36455567(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr6:36455617-36455618(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr6:36455648-36455649(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085 chr6:36455675-36455676(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr6:36455696-36455697(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:36455748-36455749(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr6:36455801-36455802(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//22575960//22608085 chr6:36455836-36455837(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr6:36455876-36455877(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22608085 chr6:36455958-36455959(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085 chr6:36457942-36457943(+) m6A 3'UTR       24209618 chr6:36457961-36457962(+) m6A 3'UTR       24209618 chr6:36458112-36458113(+) m6A 3'UTR       24209618 chr6:36458135-36458136(+) m6A 3'UTR       24209618 chr6:36458225-36458226(+) m6A 3'UTR       24981863 chr6:36458234-36458235(+) m6A 3'UTR       24981863 chr6:36458303-36458304(+) m6A 3'UTR       24981863 chr6:36458425-36458426(+) m6A 3'UTR       24981863 chr6:36458470-36458471(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-29b-2-5p	Exosome Plasma     23663360 Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Seminal plasma     23539611 Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     - Mitochondrion Skeletal muscle myoblasts     21637849
	KCTD20	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-29b-2-5p
Interactor2: KCTD20

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	None
Description	We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.