Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00063968

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-99a-3p:  MIMAT0004511          TMPO:  NM_001307975     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-99a-3p	TMPO
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004511	7112
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CMD1T//LAP2//LEMD4//PRO0868//TP

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-99a-3p	rs1214222916 chr21:16539147    T/C rs1419616925 chr21:16539158    T/A rs763134262 chr21:16539151    A/G rs766428664 chr21:16539153    G/A rs774748688 chr21:16539159    G/C rs950382507 chr21:16539154    G/A rs1271070422 chr21:16539142    C/T rs913397001 chr21:16539145    G/A

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	TMPO	chr12:98943127(+) A-I      3'UTR chr12:98923433(+) A-I      intronic chr12:98942882(+) A-I      3'UTR chr12:98943082(+) A-I      3'UTR chr12:98943106(+) A-I      3'UTR chr12:98923462(+) A-I      intronic chr12:98921042(+) A-I      intronic chr12:98921027(+) A-I      intronic chr12:98923463(+) A-I      intronic chr12:98923973(+) A-I      intronic chr12:98923981(+) A-I      intronic chr12:98936521(+) A-I      intronic chr12:98943161(+) A-I      3'UTR chr12:98936542(+) A-I      intronic chr12:98940356(+) A-I      intronic chr12:98917549(+) A-I      intronic chr12:98936478(+) A-I      intronic chr12:98917580(+) A-I      intronic chr12:98921015(+) A-I      intronic chr12:98921014(+) A-I      intronic chr12:98919318(+) A-I      intronic chr12:98915625(+) A-I      intronic chr12:98934365(+) A-I      intronic chr12:98936473(+) A-I      intronic chr12:98940438(+) A-I      intronic chr12:98913838(+) A-I      intronic chr12:98922172(+) A-I      intronic chr12:98921271(+) A-I      intronic chr12:98921099(+) A-I      intronic chr12:98919451(+) A-I      intronic chr12:98922579(+) A-I      intronic chr12:98922608(+) A-I      intronic chr12:98924016(+) A-I      intronic chr12:98922720(+) A-I      intronic chr12:98922885(+) A-I      intronic chr12:98922237(+) A-I      intronic chr12:98918634(+) A-I      intronic chr12:98918632(+) A-I      intronic chr12:98918615(+) A-I      intronic chr12:98918607(+) A-I      intronic chr12:98918569(+) A-I      intronic chr12:98922184(+) A-I      intronic chr12:98918553(+) A-I      intronic chr12:98936615(+) A-I      intronic chr12:98918546(+) A-I      intronic chr12:98918537(+) A-I      intronic chr12:98922943(+) A-I      intronic chr12:98918489(+) A-I      intronic chr12:98940342(+) A-I      intronic chr12:98922262(+) A-I      intronic chr12:98915150(+) A-I      intronic chr12:98923085(+) A-I      intronic chr12:98923109(+) A-I      intronic chr12:98918476(+) A-I      intronic chr12:98923393(+) A-I      intronic chr12:98918471(+) A-I      intronic chr12:98923454(+) A-I      intronic chr12:98918467(+) A-I      intronic chr12:98915142(+) A-I      intronic chr12:98923860(+) A-I      intronic chr12:98922315(+) A-I      intronic chr12:98923934(+) A-I      intronic chr12:98918200(+) A-I      intronic chr12:98923965(+) A-I      intronic chr12:98924000(+) A-I      intronic chr12:98924008(+) A-I      intronic chr12:98934296(+) A-I      intronic chr12:98932235(+) A-I      intronic chr12:98918165(+) A-I      intronic chr12:98932270(+) A-I      intronic chr12:98918127(+) A-I      intronic chr12:98932292(+) A-I      intronic chr12:98932803(+) A-I      intronic chr12:98932817(+) A-I      intronic chr12:98917731(+) A-I      intronic chr12:98917727(+) A-I      intronic chr12:98922329(+) A-I      intronic chr12:98917639(+) A-I      intronic chr12:98932831(+) A-I      intronic chr12:98917634(+) A-I      intronic chr12:98932839(+) A-I      intronic chr12:98933312(+) A-I      intronic chr12:98917583(+) A-I      intronic chr12:98919317(+) A-I      intronic chr12:98922503(+) A-I      intronic chr12:98910674(+) A-I      intronic chr12:98934234(+) A-I      intronic chr12:98934274(+) A-I      intronic chr12:98917517(+) A-I      intronic chr12:98917221(+) A-I      intronic chr12:98915726(+) A-I      intronic chr12:98934283(+) A-I      intronic chr12:98915691(+) A-I      intronic chr12:98934322(+) A-I      intronic chr12:98915608(+) A-I      intronic chr12:98940873(+) A-I      intronic chr12:98915703(+) A-I      intronic chr12:98933474(+) A-I      intronic chr12:98940953(+) A-I      intronic chr12:98914250(+) A-I      intronic chr12:98940907(+) A-I      intronic chr12:98933435(+) A-I      intronic chr12:98915769(+) A-I      intronic chr12:98922555(+) A-I      intronic chr12:98933413(+) A-I      intronic chr12:98932899(+) A-I      intronic chr12:98922639(+) A-I      intronic chr12:98922468(+) A-I      intronic chr12:98940993(+) A-I      intronic chr12:98932814(+) A-I      intronic chr12:98932819(+) A-I      intronic chr12:98941042(+) A-I      intronic chr12:98922547(+) A-I      intronic chr12:98932818(+) A-I      intronic chr12:98936456(+) A-I      intronic chr12:98918203(+) A-I      intronic chr12:98917216(+) A-I      intronic chr12:98915530(+) A-I      intronic chr12:98915097(+) A-I      intronic chr12:98917070(+) A-I      intronic chr12:98915688(+) A-I      intronic chr12:98923914(+) A-I      intronic chr12:98922587(+) A-I      intronic chr12:98936447(+) A-I      intronic chr12:98924004(+) A-I      intronic chr12:98925156(+) A-I      intronic chr12:98922551(+) A-I      intronic chr12:98923558(+) A-I      intronic chr12:98917302(+) A-I      intronic chr12:98919528(+) A-I      intronic chr12:98922973(+) A-I      intronic chr12:98934286(+) A-I      intronic chr12:98914573(+) A-I      intronic chr12:98936493(+) A-I      intronic chr12:98917620(+) A-I      intronic chr12:98922488(+) A-I      intronic chr12:98940983(+) A-I      intronic chr12:98940954(+) A-I      intronic chr12:98923605(+) A-I      intronic chr12:98922880(+) A-I      intronic chr12:98915782(+) A-I      intronic chr12:98940931(+) A-I      intronic chr12:98910762(+) A-I      intronic chr12:98923611(+) A-I      intronic chr12:98936458(+) A-I      intronic chr12:98941067(+) A-I      intronic chr12:98918517(+) A-I      intronic chr12:98925275(+) A-I      intronic chr12:98940971(+) A-I      intronic chr12:98933544(+) A-I      intronic chr12:98942810(+) A-I      3'UTR chr12:98942827(+) A-I      3'UTR chr12:98942878(+) A-I      3'UTR chr12:98942831(+) A-I      3'UTR chr12:98942833(+) A-I      3'UTR chr12:98942635(+) A-I      3'UTR chr12:98943046(+) A-I      3'UTR chr12:98942851(+) A-I      3'UTR chr12:98942687(+) A-I      3'UTR chr12:98942692(+) A-I      3'UTR chr12:98942713(+) A-I      3'UTR chr12:98943214(+) A-I      3'UTR chr12:98942910(+) A-I      3'UTR chr12:98942690(+) A-I      3'UTR chr12:98943149(+) A-I      3'UTR chr12:98943083(+) A-I      3'UTR chr12:98943096(+) A-I      3'UTR chr12:98942847(+) A-I      3'UTR chr12:98943216(+) A-I      3'UTR chr12:98943202(+) A-I      3'UTR chr12:98942903(+) A-I      3'UTR chr12:98942880(+) A-I      3'UTR chr12:98943011(+) A-I      3'UTR chr12:98942904(+) A-I      3'UTR chr12:98942752(+) A-I      3'UTR chr12:98942695(+) A-I      3'UTR chr12:98942888(+) A-I      3'UTR chr12:98915164(+) A-I      intronic chr12:98917238(+) A-I      intronic chr12:98916028(+) A-I      intronic chr12:98915835(+) A-I      intronic chr12:98918235(+) A-I      intronic chr12:98932778(+) A-I      intronic chr12:98936362(+) A-I      intronic chr12:98936455(+) A-I      intronic chr12:98915674(+) A-I      intronic chr12:98921021(+) A-I      intronic chr12:98932230(+) A-I      intronic chr12:98940349(+) A-I      intronic chr12:98933352(+) A-I      intronic chr12:98918472(+) A-I      intronic chr12:98940354(+) A-I      intronic chr12:98915770(+) A-I      intronic chr12:98915647(+) A-I      intronic chr12:98932210(+) A-I      intronic chr12:98924034(+) A-I      intronic chr12:98933486(+) A-I      intronic chr12:98936515(+) A-I      intronic chr12:98917215(+) A-I      intronic chr12:98936448(+) A-I      intronic chr12:98932351(+) A-I      intronic chr12:98932820(+) A-I      intronic chr12:98914433(+) A-I      intronic chr12:98933391(+) A-I      intronic chr12:98920527(+) A-I      intronic chr12:98933432(+) A-I      intronic chr12:98918191(+) A-I      intronic chr12:98917663(+) A-I      intronic chr12:98917637(+) A-I      intronic chr12:98932248(+) A-I      intronic chr12:98939785(+) A-I      intronic chr12:98934419(+) A-I      intronic chr12:98917172(+) A-I      intronic chr12:98922643(+) A-I      intronic chr12:98932715(+) A-I      intronic chr12:98917571(+) A-I      intronic chr12:98913855(+) A-I      intronic chr12:98932414(+) A-I      intronic chr12:98922538(+) A-I      intronic chr12:98936525(+) A-I      intronic chr12:98934185(+) A-I      intronic chr12:98918497(+) A-I      intronic chr12:98919363(+) A-I      intronic chr12:98940346(+) A-I      intronic chr12:98936551(+) A-I      intronic chr12:98932884(+) A-I      intronic chr12:98922585(+) A-I      intronic chr12:98919263(+) A-I      intronic chr12:98933526(+) A-I      intronic chr12:98923847(+) A-I      intronic chr12:98933369(+) A-I      intronic chr12:98915637(+) A-I      intronic chr12:98936401(+) A-I      intronic chr12:98932906(+) A-I      intronic chr12:98917593(+) A-I      intronic chr12:98932764(+) A-I      intronic chr12:98922728(+) A-I      intronic chr12:98915527(+) A-I      intronic chr12:98936516(+) A-I      intronic chr12:98918096(+) A-I      intronic chr12:98940387(+) A-I      intronic chr12:98936489(+) A-I      intronic chr12:98936529(+) A-I      intronic chr12:98920609(+) A-I      intronic chr12:98922888(+) A-I      intronic chr12:98916055(+) A-I      intronic chr12:98932257(+) A-I      intronic chr12:98932180(+) A-I      intronic chr12:98918513(+) A-I      intronic chr12:98932393(+) A-I      intronic chr12:98924992(+) A-I      intronic chr12:98933417(+) A-I      intronic chr12:98917176(+) A-I      intronic chr12:98920482(+) A-I      intronic chr12:98934339(+) A-I      intronic chr12:98922925(+) A-I      intronic chr12:98933355(+) A-I      intronic chr12:98922105(+) A-I      intronic chr12:98914343(+) A-I      intronic chr12:98932231(+) A-I      intronic chr12:98918465(+) A-I      intronic chr12:98936425(+) A-I      intronic chr12:98922622(+) A-I      intronic chr12:98923539(+) A-I      intronic chr12:98932260(+) A-I      intronic chr12:98932169(+) A-I      intronic chr12:98936385(+) A-I      intronic chr12:98921159(+) A-I      intronic chr12:98940381(+) A-I      intronic chr12:98933491(+) A-I      intronic chr12:98940391(+) A-I      intronic chr12:98940424(+) A-I      intronic chr12:98917518(+) A-I      intronic chr12:98936557(+) A-I      intronic chr12:98933282(+) A-I      intronic chr12:98915697(+) A-I      intronic chr12:98911844(+) A-I      intronic chr12:98925204(+) A-I      intronic chr12:98922630(+) A-I      intronic chr12:98934237(+) A-I      intronic chr12:98930315(+) A-I      intronic chr12:98922932(+) A-I      intronic chr12:98934226(+) A-I      intronic chr12:98933462(+) A-I      intronic chr12:98918555(+) A-I      intronic chr12:98922586(+) A-I      intronic chr12:98917242(+) A-I      intronic chr12:98934257(+) A-I      intronic chr12:98932185(+) A-I      intronic chr12:98923988(+) A-I      intronic chr12:98934256(+) A-I      intronic chr12:98936384(+) A-I      intronic chr12:98933294(+) A-I      intronic chr12:98918243(+) A-I      intronic chr12:98917719(+) A-I      intronic chr12:98940364(+) A-I      intronic chr12:98924777(+) A-I      intronic chr12:98936494(+) A-I      intronic chr12:98923366(+) A-I      intronic chr12:98918295(+) A-I      intronic chr12:98940404(+) A-I      intronic chr12:98932957(+) A-I      intronic chr12:98917248(+) A-I      intronic chr12:98917733(+) A-I      intronic chr12:98932835(+) A-I      intronic chr12:98924772(+) A-I      intronic chr12:98917197(+) A-I      intronic chr12:98932867(+) A-I      intronic chr12:98910772(+) A-I      intronic chr12:98940379(+) A-I      intronic chr12:98923428(+) A-I      intronic chr12:98911801(+) A-I      intronic chr12:98918097(+) A-I      intronic chr12:98917554(+) A-I      intronic chr12:98922614(+) A-I      intronic chr12:98918301(+) A-I      intronic chr12:98918395(+) A-I      intronic chr12:98916054(+) A-I      intronic chr12:98932874(+) A-I      intronic chr12:98917587(+) A-I      intronic chr12:98922590(+) A-I      intronic chr12:98918475(+) A-I      intronic chr12:98933442(+) A-I      intronic chr12:98917611(+) A-I      intronic chr12:98934251(+) A-I      intronic chr12:98917619(+) A-I      intronic chr12:98940386(+) A-I      intronic chr12:98940410(+) A-I      intronic chr12:98936378(+) A-I      intronic chr12:98932923(+) A-I      intronic chr12:98934430(+) A-I      intronic chr12:98924072(+) A-I      intronic chr12:98943140(+) A-I      3'UTR chr12:98943103(+) A-I      3'UTR chr12:98942808(+) A-I      3'UTR chr12:98942886(+) A-I      3'UTR chr12:98943187(+) A-I      3'UTR chr12:98942885(+) A-I      3'UTR chr12:98942819(+) A-I      3'UTR chr12:98942778(+) A-I      3'UTR chr12:98943137(+) A-I      3'UTR chr12:98943058(+) A-I      3'UTR chr12:98943200(+) A-I      3'UTR chr12:98942820(+) A-I      3'UTR chr12:98942849(+) A-I      3'UTR chr12:98943201(+) A-I      3'UTR chr12:98942811(+) A-I      3'UTR chr12:98942824(+) A-I      3'UTR chr12:98943182(+) A-I      3'UTR chr12:98943042(+) A-I      3'UTR chr12:98942698(+) A-I      3'UTR chr12:98942912(+) A-I      3'UTR chr12:98943021(+) A-I      3'UTR chr12:98942797(+) A-I      3'UTR chr12:98943107(+) A-I      3'UTR chr12:98942696(+) A-I      3'UTR chr12:98942909(+) A-I      3'UTR chr12:98942643(+) A-I      3'UTR chr12:98943162(+) A-I      3'UTR chr12:98942805(+) A-I      3'UTR chr12:98943003(+) A-I      3'UTR chr12:98943018(+) A-I      3'UTR chr12:98942844(+) A-I      3'UTR chr12:98943033(+) A-I      3'UTR chr12:98942644(+) A-I      3'UTR chr12:98942688(+) A-I      3'UTR chr12:98942621(+) A-I      3'UTR chr12:98943102(+) A-I      3'UTR chr12:98942665(+) A-I      3'UTR

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	TMPO	chr12:98942688(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324 chr12:98942695(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324 chr12:98943018(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324 chr12:98943033(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324 chr12:98943042(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324 chr12:98922630(+) A-I intron -    22327324 chr12:98932899(+) A-I intron -    22327324 chr12:98940386(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942643(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942805(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942820(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942824(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942831(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942885(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942886(+) A-I intron -    22327324 chr12:98943011(+) A-I intron -    22327324 chr12:98943102(+) A-I intron -    22327324 chr12:98943103(+) A-I intron -    22327324 chr12:98943182(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942819(+) A-I intron -    21960545 chr12:98929408(+) C-A intron -    21725310 chr12:98917518(+) A-G intron -    22484847 chr12:98920609(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922630(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922728(+) A-G intron -    22484847 chr12:98923366(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932814(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932819(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932835(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932899(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932923(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933435(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933462(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936448(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936493(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936494(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936515(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936516(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936525(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936529(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940386(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940387(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940404(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942621(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942643(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942688(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942690(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942695(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942696(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942698(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942805(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942820(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942824(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942847(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942878(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942880(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942885(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942886(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942888(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942904(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942912(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943011(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943018(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943021(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943033(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943042(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943083(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943096(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943102(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943103(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943137(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943149(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943182(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943187(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943201(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943202(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943214(+) A-G intron -    22484847 chr12:98913165(+) A-C intron -    22484847 chr12:98913855(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915097(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915527(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915530(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915637(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915647(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915674(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915703(+) A-G intron -    22484847 chr12:98916028(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917070(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917215(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917216(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917238(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917248(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917554(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917571(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917587(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917593(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917611(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917619(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917620(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917637(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917663(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917719(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917733(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918096(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918191(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918203(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918235(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918243(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918295(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918301(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918465(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918472(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918475(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918497(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918513(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918517(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918555(+) A-G intron -    22484847 chr12:98919363(+) A-G intron -    22484847 chr12:98920482(+) A-G intron -    22484847 chr12:98920527(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922468(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922551(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922555(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922585(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922586(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922587(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922590(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922614(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922622(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922639(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922643(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922880(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922888(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922925(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922932(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922973(+) A-G intron -    22484847 chr12:98924797(+) C-T intron -    22484847 chr12:98925128(+) T-C intron -    22484847 chr12:98925233(+) G-A intron -    22484847 chr12:98932173(+) G-A intron -    22484847 chr12:98932185(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932231(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932257(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932351(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932820(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932867(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933355(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933369(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933391(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933413(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933432(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933474(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933486(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933526(+) A-G intron -    22484847 chr12:98934257(+) A-G intron -    22484847 chr12:98934286(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936447(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936455(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936458(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936462(+) T-C intron -    22484847 chr12:98936472(+) G-A intron -    22484847 chr12:98936551(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940349(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940354(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940364(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940379(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940381(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940391(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940424(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940954(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940971(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942808(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942819(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943107(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943140(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943195(+) T-C intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	TMPO	chr12:98909664-98909665(+) m6A CDS//intron       24284625//24981863//27371828//27773536//22575960 chr12:98909685-98909686(+) m6A CDS//intron       24284625//24981863//26404942//27371828//27773536//22575960 chr12:98909835-98909836(+) m6A CDS//exon       24981863//27371828//27773536//22575960 chr12:98909842-98909843(+) Cm CDS//exon       - chr12:98910209-98910210(+) m6A exon//intron       24284625//24981863//27371828//27773536 chr12:98910244-98910245(+) m6A exon//intron       24284625//24981863//27371828//27773536 chr12:98921619-98921620(+) m6A exon//intron       24981863 chr12:98921650-98921651(+) m6A exon//intron       24981863 chr12:98921678-98921679(+) m6A CDS//exon       26404942 chr12:98921686-98921687(+) m6A CDS//exon       26404942 chr12:98921692-98921693(+) m6A CDS//exon       26404942 chr12:98925459-98925460(+) m6A CDS//exon       26404942//27773535 chr12:98925494-98925495(+) m6A CDS//exon       27773535 chr12:98925503-98925504(+) m6A CDS//exon       27773535 chr12:98925510-98925511(+) m6A CDS//exon       27773535 chr12:98925700-98925701(+) m6A exon//intron       24284625//24981863//27773535 chr12:98929406-98929407(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863 chr12:98931286-98931287(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535 chr12:98931308-98931309(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535 chr12:98931460-98931461(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr12:98938034-98938035(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98938043-98938044(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98938066-98938067(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98938112-98938113(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98938225-98938226(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//27773535 chr12:98938233-98938234(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//27773535 chr12:98938285-98938286(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98938439-98938440(+) m6A exon//intron       24981863 chr12:98938795-98938796(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98938820-98938821(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98940148-98940149(+) m6A CDS//exon       24981863 chr12:98941365-98941366(+) m6A CDS//exon       24981863 chr12:98941398-98941399(+) m6A CDS//exon       24284625 chr12:98941483-98941484(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960 chr12:98941576-98941577(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22575960 chr12:98941692-98941693(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr12:98941721-98941722(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:98941775-98941776(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:98941794-98941795(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:98941815-98941816(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:98941822-98941823(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:98941873-98941874(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:98941968-98941969(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98942697-98942698(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:98942720-98942721(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:98942796-98942797(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:98942819-98942820(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:98943161-98943162(+) m6A 3'UTR       - chr12:98943305-98943306(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98943369-98943370(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98943382-98943383(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98943914-98943915(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98943924-98943925(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98943945-98943946(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98944048-98944049(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-99a-3p	Exosome Plasma     23663360 Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     - Mitochondrion Skeletal muscle myoblasts     21637849
	TMPO	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-99a-3p
Interactor2: TMPO

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	None
Description	We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.