Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-99a-3p | PPP2CA |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0004511 | 5515 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | NEDLBA//PP2Ac//PP2CA//PP2Calpha//RP-C |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-99a-3p |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | PPP2CA |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | PPP2CA |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | PPP2CA |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | ||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-99a-3p |
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PPP2CA |
Interactor1: hsa-miR-99a-3p | Interactor2: PPP2CA |
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Weak-Evidence | PAR-CLIP | |
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Support Database | ViRBase |
PMID | 22291592 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells | Interactor2 expression | None |
Description | We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs. |