Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00063038

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-19b-1-5p:           ANXA4:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-19b-1-5p ANXA4
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0004491 307
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - ANX4//HEL-S-274//P32.5//PAP-II//PIG28//PP4-X//ZAP36

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-19b-1-5p
rs1330845252 chr13:91351221    G/A
rs771220050 chr13:91351229    C/T
rs1259633726 chr13:91351212    T/G
rs1279688822 chr13:91351213    G/T

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR ANXA4
chr2:69984193(+) A-I      intronic
chr2:70037262(+) A-I      intronic
chr2:69978413(+) A-I      intronic
chr2:70030239(+) A-I      intronic
chr2:69977743(+) A-I      intronic
chr2:69971380(+) A-I      intronic
chr2:70036776(+) A-I      intronic
chr2:69976873(+) A-I      intronic
chr2:69971404(+) A-I      intronic
chr2:70030212(+) A-I      intronic
chr2:69999901(+) A-I      intronic
chr2:70049297(+) A-I      intronic
chr2:69978519(+) A-I      intronic
chr2:70049306(+) A-I      intronic
chr2:69977684(+) A-I      intronic
chr2:69985502(+) A-I      intronic
chr2:69978525(+) A-I      intronic
chr2:69984176(+) A-I      intronic
chr2:69976959(+) A-I      intronic
chr2:69976966(+) A-I      intronic
chr2:69985534(+) A-I      intronic
chr2:69978414(+) A-I      intronic
chr2:69984195(+) A-I      intronic
chr2:69978482(+) A-I      intronic
chr2:69984200(+) A-I      intronic
chr2:69984204(+) A-I      intronic
chr2:69986045(+) A-I      intronic
chr2:69970479(+) A-I      intronic
chr2:69970633(+) A-I      intronic
chr2:69971261(+) A-I      intronic
chr2:69971384(+) A-I      intronic
chr2:69972713(+) A-I      intronic
chr2:69972727(+) A-I      intronic
chr2:69972732(+) A-I      intronic
chr2:69977010(+) A-I      intronic
chr2:70028736(+) A-I      intronic
chr2:70028716(+) A-I      intronic
chr2:70028694(+) A-I      intronic
chr2:70028686(+) A-I      intronic
chr2:70028666(+) A-I      intronic
chr2:70028636(+) A-I      intronic
chr2:70021834(+) A-I      intronic
chr2:70021824(+) A-I      intronic
chr2:70021794(+) A-I      intronic
chr2:70021764(+) A-I      intronic
chr2:70021756(+) A-I      intronic
chr2:69988073(+) A-I      intronic
chr2:69988036(+) A-I      intronic
chr2:69987207(+) A-I      intronic
chr2:69987104(+) A-I      intronic
chr2:69987082(+) A-I      intronic
chr2:69986213(+) A-I      intronic
chr2:69986189(+) A-I      intronic
chr2:69986188(+) A-I      intronic
chr2:69986153(+) A-I      intronic
chr2:69985987(+) A-I      intronic
chr2:69985738(+) A-I      intronic
chr2:69985719(+) A-I      intronic
chr2:69985419(+) A-I      intronic
chr2:69985379(+) A-I      intronic
chr2:69985354(+) A-I      intronic
chr2:69985244(+) A-I      intronic
chr2:70015816(+) A-I      intronic
chr2:70015782(+) A-I      intronic
chr2:69989517(+) A-I      intronic
chr2:69996940(+) A-I      intronic
chr2:69997042(+) A-I      intronic
chr2:69998095(+) A-I      intronic
chr2:69988098(+) A-I      intronic
chr2:69988108(+) A-I      intronic
chr2:70037326(+) A-I      intronic
chr2:69985076(+) A-I      intronic
chr2:69984980(+) A-I      intronic
chr2:69984976(+) A-I      intronic
chr2:69984827(+) A-I      intronic
chr2:69984667(+) A-I      intronic
chr2:69984666(+) A-I      intronic
chr2:69984665(+) A-I      intronic
chr2:69984604(+) A-I      intronic
chr2:69984587(+) A-I      intronic
chr2:69982647(+) A-I      intronic
chr2:69982646(+) A-I      intronic
chr2:69982604(+) A-I      intronic
chr2:69982551(+) A-I      intronic
chr2:69981578(+) A-I      intronic
chr2:69978590(+) A-I      intronic
chr2:69978589(+) A-I      intronic
chr2:69978551(+) A-I      intronic
chr2:69976949(+) A-I      intronic
chr2:69976898(+) A-I      intronic
chr2:69976878(+) A-I      intronic
chr2:69970630(+) A-I      intronic
chr2:70028745(+) A-I      intronic
chr2:70029634(+) A-I      intronic
chr2:70029635(+) A-I      intronic
chr2:70029682(+) A-I      intronic
chr2:70030065(+) A-I      intronic
chr2:70030119(+) A-I      intronic
chr2:70030128(+) A-I      intronic
chr2:70030130(+) A-I      intronic
chr2:70030143(+) A-I      intronic
chr2:70031008(+) A-I      intronic
chr2:70035874(+) A-I      intronic
chr2:70035949(+) A-I      intronic
chr2:70036056(+) A-I      intronic
chr2:70036068(+) A-I      intronic
chr2:70036070(+) A-I      intronic
chr2:69972767(+) A-I      intronic
chr2:69973163(+) A-I      intronic
chr2:69973224(+) A-I      intronic
chr2:69973243(+) A-I      intronic
chr2:69970429(+) A-I      intronic
chr2:69973283(+) A-I      intronic
chr2:69974075(+) A-I      intronic
chr2:69974930(+) A-I      intronic
chr2:69974935(+) A-I      intronic
chr2:69975305(+) A-I      intronic
chr2:69976032(+) A-I      intronic
chr2:69998111(+) A-I      intronic
chr2:69998205(+) A-I      intronic
chr2:69998240(+) A-I      intronic
chr2:69999873(+) A-I      intronic
chr2:70000051(+) A-I      intronic
chr2:70000055(+) A-I      intronic
chr2:70000064(+) A-I      intronic
chr2:70000130(+) A-I      intronic
chr2:70001540(+) A-I      intronic
chr2:70001610(+) A-I      intronic
chr2:70007407(+) A-I      intronic
chr2:70007413(+) A-I      intronic
chr2:70007511(+) A-I      intronic
chr2:70015521(+) A-I      intronic
chr2:70052131(+) A-I      intronic
chr2:70052078(+) A-I      intronic
chr2:70052016(+) A-I      intronic
chr2:70051930(+) A-I      intronic
chr2:70051108(+) A-I      intronic
chr2:70049307(+) A-I      intronic
chr2:70049302(+) A-I      intronic
chr2:70048813(+) A-I      intronic
chr2:70048793(+) A-I      intronic
chr2:70048695(+) A-I      intronic
chr2:70037432(+) A-I      intronic
chr2:70037397(+) A-I      intronic
chr2:70037335(+) A-I      intronic
chr2:70037332(+) A-I      intronic
chr2:70037257(+) A-I      intronic
chr2:70036872(+) A-I      intronic
chr2:70036844(+) A-I      intronic
chr2:70036819(+) A-I      intronic
chr2:70036771(+) A-I      intronic
chr2:70036727(+) A-I      intronic
chr2:70015525(+) A-I      intronic
chr2:70015552(+) A-I      intronic
chr2:70015583(+) A-I      intronic
chr2:70029722(+) A-I      intronic
chr2:69970449(+) A-I      intronic
chr2:70007452(+) A-I      intronic
chr2:69977612(+) A-I      intronic
chr2:70037393(+) A-I      intronic
chr2:69978497(+) A-I      intronic
chr2:70007427(+) A-I      intronic
chr2:69976996(+) A-I      intronic
chr2:69976936(+) A-I      intronic
chr2:70048666(+) A-I      intronic
chr2:69973270(+) A-I      intronic
chr2:70037258(+) A-I      intronic
chr2:69986079(+) A-I      intronic
chr2:69984198(+) A-I      intronic
chr2:69985524(+) A-I      intronic
chr2:69985491(+) A-I      intronic
chr2:70029763(+) A-I      intronic
chr2:69970530(+) A-I      intronic
chr2:70051963(+) A-I      intronic
chr2:69985604(+) A-I      intronic
chr2:69975936(+) A-I      intronic
chr2:69971275(+) A-I      intronic
chr2:70036755(+) A-I      intronic
chr2:70036775(+) A-I      intronic
chr2:70035813(+) A-I      intronic
chr2:69976801(+) A-I      intronic
chr2:69971307(+) A-I      intronic
chr2:69986010(+) A-I      intronic
chr2:69977781(+) A-I      intronic
chr2:70052119(+) A-I      intronic
chr2:69977606(+) A-I      intronic
chr2:69982616(+) A-I      intronic
chr2:69985040(+) A-I      intronic
chr2:69971418(+) A-I      intronic
chr2:69985993(+) A-I      intronic
chr2:69984931(+) A-I      intronic
chr2:69977564(+) A-I      intronic
chr2:69985613(+) A-I      intronic
chr2:69972756(+) A-I      intronic
chr2:69970489(+) A-I      intronic
chr2:69984115(+) A-I      intronic
chr2:70037497(+) A-I      intronic
chr2:69984612(+) A-I      intronic
chr2:69971359(+) A-I      intronic
chr2:69986218(+) A-I      intronic
chr2:69985539(+) A-I      intronic
chr2:69984679(+) A-I      intronic
chr2:70036793(+) A-I      intronic
chr2:69984890(+) A-I      intronic
chr2:69986063(+) A-I      intronic
chr2:70048846(+) A-I      intronic
chr2:69986064(+) A-I      intronic
chr2:69976088(+) A-I      intronic
chr2:69982497(+) A-I      intronic
chr2:69976008(+) A-I      intronic
chr2:69975937(+) A-I      intronic
chr2:70001692(+) A-I      intronic
chr2:69989472(+) A-I      intronic
chr2:69970589(+) A-I      intronic
chr2:70035906(+) A-I      intronic
chr2:69986179(+) A-I      intronic
chr2:69977018(+) A-I      intronic
chr2:69973183(+) A-I      intronic
chr2:69977584(+) A-I      intronic
chr2:70036884(+) A-I      intronic
chr2:69986115(+) A-I      intronic
chr2:69974095(+) A-I      intronic
chr2:70036632(+) A-I      intronic
chr2:69977576(+) A-I      intronic
chr2:70036848(+) A-I      intronic
chr2:69976054(+) A-I      intronic
chr2:69976937(+) A-I      intronic
chr2:69998020(+) A-I      intronic
chr2:69975015(+) A-I      intronic
chr2:69984880(+) A-I      intronic
chr2:70037371(+) A-I      intronic
chr2:70000002(+) A-I      intronic
chr2:70051962(+) A-I      intronic
chr2:69985485(+) A-I      intronic
chr2:69995999(+) A-I      intronic
chr2:70000038(+) A-I      intronic
chr2:69976080(+) A-I      intronic
chr2:69986148(+) A-I      intronic
chr2:69971262(+) A-I      intronic
chr2:69976802(+) A-I      intronic
chr2:69988803(+) A-I      intronic
chr2:69977563(+) A-I      intronic
chr2:69971354(+) A-I      intronic
chr2:70007799(+) A-I      intronic
chr2:70049246(+) A-I      intronic
chr2:69973324(+) A-I      intronic
chr2:69974015(+) A-I      intronic
chr2:69985570(+) A-I      intronic
chr2:69984944(+) A-I      intronic
chr2:70049311(+) A-I      intronic
chr2:69978478(+) A-I      intronic
chr2:69971281(+) A-I      intronic
chr2:70020197(+) A-I      intronic
chr2:70006083(+) A-I      intronic
chr2:70048621(+) A-I      intronic
chr2:69971373(+) A-I      intronic
chr2:69977657(+) A-I      intronic
chr2:69975960(+) A-I      intronic
chr2:70048701(+) A-I      intronic
chr2:69975984(+) A-I      intronic
chr2:69972205(+) A-I      intronic
chr2:69974081(+) A-I      intronic
chr2:69970176(+) A-I      intronic
chr2:69981603(+) A-I      intronic
chr2:69984158(+) A-I      intronic
chr2:69971254(+) A-I      intronic
chr2:69973170(+) A-I      intronic
chr2:69974009(+) A-I      intronic
chr2:70048798(+) A-I      intronic
chr2:69970231(+) A-I      intronic
chr2:69975390(+) A-I      intronic
chr2:70037331(+) A-I      intronic
chr2:69986121(+) A-I      intronic
chr2:69975865(+) A-I      intronic
chr2:69975990(+) A-I      intronic
chr2:70028623(+) A-I      intronic
chr2:69985553(+) A-I      intronic
chr2:69974144(+) A-I      intronic
chr2:69984954(+) A-I      intronic
chr2:69984159(+) A-I      intronic
chr2:69981666(+) A-I      intronic
chr2:69975907(+) A-I      intronic
chr2:69985284(+) A-I      intronic
chr2:69981599(+) A-I      intronic
chr2:70028637(+) A-I      intronic
chr2:70028709(+) A-I      intronic
chr2:69970256(+) A-I      intronic
chr2:69984968(+) A-I      intronic
chr2:70035850(+) A-I      intronic
chr2:70028771(+) A-I      intronic
chr2:69999895(+) A-I      intronic
chr2:69984939(+) A-I      intronic
chr2:70007794(+) A-I      intronic
chr2:69985225(+) A-I      intronic
chr2:70020277(+) A-I      intronic
chr2:69971394(+) A-I      intronic
chr2:69986161(+) A-I      intronic
chr2:69997967(+) A-I      intronic
chr2:69977686(+) A-I      intronic
chr2:69977690(+) A-I      intronic
chr2:70028804(+) A-I      intronic
chr2:69999889(+) A-I      intronic
chr2:69998138(+) A-I      intronic
chr2:69982527(+) A-I      intronic
chr2:70020198(+) A-I      intronic
chr2:70001693(+) A-I      intronic
chr2:70028676(+) A-I      intronic
chr2:70030222(+) A-I      intronic
chr2:69977808(+) A-I      intronic
chr2:69970212(+) A-I      intronic
chr2:69997993(+) A-I      intronic
chr2:69982649(+) A-I      intronic
chr2:69995985(+) A-I      intronic
chr2:69988798(+) A-I      intronic
chr2:69978552(+) A-I      intronic
chr2:70036890(+) A-I      intronic
chr2:70037370(+) A-I      intronic
chr2:69971258(+) A-I      intronic
chr2:70036722(+) A-I      intronic
chr2:70037330(+) A-I      intronic
chr2:70052008(+) A-I      intronic
chr2:69985392(+) A-I      intronic
chr2:69984970(+) A-I      intronic
chr2:70007426(+) A-I      intronic
chr2:69988079(+) A-I      intronic
chr2:69985421(+) A-I      intronic
chr2:70007420(+) A-I      intronic
chr2:69981576(+) A-I      intronic
chr2:69975404(+) A-I      intronic
chr2:70015433(+) A-I      intronic
chr2:70051550(+) A-I      intronic
chr2:69976018(+) A-I      intronic
chr2:69986055(+) A-I      intronic
chr2:69977766(+) A-I      intronic
chr2:69973961(+) A-I      intronic
chr2:69975413(+) A-I      intronic
chr2:69986001(+) A-I      intronic
chr2:70000061(+) A-I      intronic
chr2:69975860(+) A-I      intronic
chr2:69984893(+) A-I      intronic
chr2:69976097(+) A-I      intronic
chr2:69985679(+) A-I      intronic
chr2:69998105(+) A-I      intronic
chr2:70039272(+) A-I      intronic
chr2:70048702(+) A-I      intronic
chr2:70029636(+) A-I      intronic
chr2:69973987(+) A-I      intronic
chr2:69974918(+) A-I      intronic
chr2:69975345(+) A-I      intronic
chr2:69975361(+) A-I      intronic
chr2:69984136(+) A-I      intronic
chr2:69974903(+) A-I      intronic
chr2:69970612(+) A-I      intronic
chr2:69984542(+) A-I      intronic
chr2:69976900(+) A-I      intronic
chr2:69982622(+) A-I      intronic
chr2:69997078(+) A-I      intronic
chr2:69977043(+) A-I      intronic
chr2:69986217(+) A-I      intronic
chr2:69985714(+) A-I      intronic
chr2:69973194(+) A-I      intronic
chr2:69974055(+) A-I      intronic
chr2:69973983(+) A-I      intronic
chr2:69998146(+) A-I      intronic
chr2:70001655(+) A-I      intronic
chr2:70028611(+) A-I      intronic
chr2:69989408(+) A-I      intronic
chr2:69988814(+) A-I      intronic
chr2:69985603(+) A-I      intronic
chr2:70015587(+) A-I      intronic
chr2:69985674(+) A-I      intronic
chr2:69985274(+) A-I      intronic
chr2:70005732(+) A-I      intronic
chr2:69984929(+) A-I      intronic
chr2:70037276(+) A-I      intronic
chr2:69985380(+) A-I      intronic
chr2:69970584(+) A-I      intronic
chr2:69971290(+) A-I      intronic
chr2:69972937(+) A-I      intronic
chr2:69999996(+) A-I      intronic
chr2:69977706(+) A-I      intronic
chr2:70036767(+) A-I      intronic
chr2:70007759(+) A-I      intronic
chr2:69988061(+) A-I      intronic
chr2:69973261(+) A-I      intronic
chr2:69986040(+) A-I      intronic
chr2:69972150(+) A-I      intronic
chr2:69973341(+) A-I      intronic
chr2:69985607(+) A-I      intronic
chr2:69973144(+) A-I      intronic
chr2:70001636(+) A-I      intronic
chr2:69998099(+) A-I      intronic
chr2:69976810(+) A-I      intronic
chr2:69975955(+) A-I      intronic
chr2:70036878(+) A-I      intronic
chr2:70036032(+) A-I      intronic
chr2:69975253(+) A-I      intronic
chr2:70020264(+) A-I      intronic
chr2:69971364(+) A-I      intronic
chr2:70007753(+) A-I      intronic
chr2:69984835(+) A-I      intronic
chr2:69972802(+) A-I      intronic
chr2:70036752(+) A-I      intronic
chr2:69998019(+) A-I      intronic
chr2:70028617(+) A-I      intronic
chr2:70037364(+) A-I      intronic
chr2:70036749(+) A-I      intronic
chr2:69975873(+) A-I      intronic
chr2:69985245(+) A-I      intronic
chr2:70006161(+) A-I      intronic
chr2:70028719(+) A-I      intronic
chr2:70028770(+) A-I      intronic
chr2:70001564(+) A-I      intronic
chr2:69978501(+) A-I      intronic
chr2:70007500(+) A-I      intronic
chr2:69982542(+) A-I      intronic
chr2:69974063(+) A-I      intronic
chr2:69974887(+) A-I      intronic
chr2:70031979(+) A-I      intronic
chr2:69975252(+) A-I      intronic
chr2:69978477(+) A-I      intronic
chr2:70051939(+) A-I      intronic
chr2:70036029(+) A-I      intronic
chr2:69972155(+) A-I      intronic
chr2:69998183(+) A-I      intronic
chr2:70037344(+) A-I      intronic
chr2:70048767(+) A-I      intronic
chr2:69974921(+) A-I      intronic
chr2:70020263(+) A-I      intronic
chr2:70020299(+) A-I      intronic
chr2:69985520(+) A-I      intronic
chr2:69976028(+) A-I      intronic
chr2:70037241(+) A-I      intronic
chr2:69985623(+) A-I      intronic
chr2:70000034(+) A-I      intronic
chr2:69985406(+) A-I      intronic
chr2:69972865(+) A-I      intronic
chr2:69999993(+) A-I      intronic
chr2:69970279(+) A-I      intronic
chr2:69974032(+) A-I      intronic
chr2:69984532(+) A-I      intronic
chr2:69974045(+) A-I      intronic
chr2:70037271(+) A-I      intronic
chr2:69978542(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED ANXA4
chr2:69995985(+) A-I intron -    15258596
chr2:69997078(+) A-I intron -    15258596
chr2:69997967(+) A-I intron -    15258596
chr2:69997972(+) A-I intron -    15258596
chr2:69997993(+) A-I intron -    15258596
chr2:69998006(+) A-I intron -    15258596
chr2:69998019(+) A-I intron -    15258596
chr2:69998020(+) A-I intron -    15258596
chr2:69998030(+) A-I intron -    15258596
chr2:69976866(+) A-I intron -    22327324
chr2:69981576(+) A-I intron -    22327324
chr2:69985491(+) A-I intron -    22327324
chr2:69985524(+) A-I intron -    22327324
chr2:70007799(+) A-I intron -    22327324
chr2:70035850(+) A-I intron -    22327324
chr2:70037370(+) A-I intron -    22327324
chr2:69970411(+) A-G intron -    22484847
chr2:69970430(+) A-G intron -    22484847
chr2:69970452(+) A-G intron -    22484847
chr2:69970489(+) A-G intron -    22484847
chr2:69970584(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971258(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971262(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971281(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971290(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971293(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971301(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971319(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971354(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971358(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971359(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971364(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971394(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971396(+) A-G intron -    22484847
chr2:69971418(+) A-G intron -    22484847
chr2:69972205(+) A-G intron -    22484847
chr2:69972686(+) A-G intron -    22484847
chr2:69972719(+) A-G intron -    22484847
chr2:69972756(+) A-G intron -    22484847
chr2:69972763(+) A-G intron -    22484847
chr2:69972865(+) A-G intron -    22484847
chr2:69973170(+) A-G intron -    22484847
chr2:69973237(+) A-G intron -    22484847
chr2:69973244(+) A-G intron -    22484847
chr2:69973261(+) A-G intron -    22484847
chr2:69973270(+) A-G intron -    22484847
chr2:69973273(+) A-G intron -    22484847
chr2:69973285(+) A-G intron -    22484847
chr2:69973324(+) A-G intron -    22484847
chr2:69973341(+) A-G intron -    22484847
chr2:69974009(+) A-G intron -    22484847
chr2:69974032(+) A-G intron -    22484847
chr2:69974033(+) A-G intron -    22484847
chr2:69974055(+) A-G intron -    22484847
chr2:69974063(+) A-G intron -    22484847
chr2:69974080(+) A-G intron -    22484847
chr2:69974081(+) A-G intron -    22484847
chr2:69974887(+) A-G intron -    22484847
chr2:69974921(+) A-G intron -    22484847
chr2:69974922(+) A-G intron -    22484847
chr2:69975015(+) A-G intron -    22484847
chr2:69975253(+) A-G intron -    22484847
chr2:69975261(+) A-G intron -    22484847
chr2:69975330(+) A-G intron -    22484847
chr2:69975345(+) A-G intron -    22484847
chr2:69975364(+) A-G intron -    22484847
chr2:69975390(+) A-G intron -    22484847
chr2:69975404(+) A-G intron -    22484847
chr2:69975936(+) A-G intron -    22484847
chr2:69975937(+) A-G intron -    22484847
chr2:69975990(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976026(+) G-T intron -    22484847
chr2:69976028(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976054(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976067(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976079(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976080(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976084(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976097(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976110(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976119(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976802(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976810(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976866(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976937(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976963(+) A-G intron -    22484847
chr2:69976996(+) A-G intron -    22484847
chr2:69977018(+) A-G intron -    22484847
chr2:69977563(+) A-G intron -    22484847
chr2:69977564(+) A-G intron -    22484847
chr2:69977576(+) A-G intron -    22484847
chr2:69977584(+) A-G intron -    22484847
chr2:69977588(+) T-A intron -    22484847
chr2:69977706(+) A-G intron -    22484847
chr2:69977781(+) A-G intron -    22484847
chr2:69978478(+) A-G intron -    22484847
chr2:69978497(+) A-G intron -    22484847
chr2:69978509(+) A-G intron -    22484847
chr2:69981576(+) A-G intron -    22484847
chr2:69981603(+) A-G intron -    22484847
chr2:69981624(+) A-G intron -    22484847
chr2:69981666(+) A-G intron -    22484847
chr2:69982497(+) A-G intron -    22484847
chr2:69982542(+) A-G intron -    22484847
chr2:69982616(+) A-G intron -    22484847
chr2:69982622(+) A-G intron -    22484847
chr2:69982649(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984079(+) A-T intron -    22484847
chr2:69984136(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984139(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984158(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984159(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984198(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984529(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984532(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984612(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984617(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984835(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984857(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984890(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984903(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984944(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984954(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984968(+) A-G intron -    22484847
chr2:69984970(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985040(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985225(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985245(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985284(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985294(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985306(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985380(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985392(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985421(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985491(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985524(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985553(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985570(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985604(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985607(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985613(+) A-G intron -    22484847
chr2:69985623(+) A-G intron -    22484847
chr2:69986040(+) A-G intron -    22484847
chr2:69986051(+) A-G intron -    22484847
chr2:69986064(+) A-G intron -    22484847
chr2:69986148(+) A-G intron -    22484847
chr2:69986161(+) A-G intron -    22484847
chr2:69986175(+) A-G intron -    22484847
chr2:69986222(+) A-G intron -    22484847
chr2:69987171(+) A-G intron -    22484847
chr2:69988798(+) A-G intron -    22484847
chr2:69988803(+) A-G intron -    22484847
chr2:69988814(+) A-G intron -    22484847
chr2:69988820(+) A-G intron -    22484847
chr2:69998099(+) A-G intron -    22484847
chr2:69998105(+) A-G intron -    22484847
chr2:69999879(+) A-G intron -    22484847
chr2:69999889(+) A-G intron -    22484847
chr2:69999895(+) A-G intron -    22484847
chr2:69999896(+) A-G intron -    22484847
chr2:70000002(+) A-G intron -    22484847
chr2:70000034(+) A-G intron -    22484847
chr2:70000038(+) A-G intron -    22484847
chr2:70000069(+) A-G intron -    22484847
chr2:70001564(+) A-G intron -    22484847
chr2:70001570(+) A-G intron -    22484847
chr2:70001593(+) T-C intron -    22484847
chr2:70001692(+) A-G intron -    22484847
chr2:70001746(+) A-G intron -    22484847
chr2:70005652(+) A-G intron -    22484847
chr2:70007420(+) A-G intron -    22484847
chr2:70007426(+) A-G intron -    22484847
chr2:70007427(+) A-G intron -    22484847
chr2:70007753(+) A-G intron -    22484847
chr2:70007759(+) A-G intron -    22484847
chr2:70007799(+) A-G intron -    22484847
chr2:70015587(+) A-G intron -    22484847
chr2:70028535(+) G-T intron -    22484847
chr2:70028546(+) C-T intron -    22484847
chr2:70028611(+) A-G intron -    22484847
chr2:70028623(+) A-G intron -    22484847
chr2:70028637(+) A-G intron -    22484847
chr2:70028676(+) A-G intron -    22484847
chr2:70028678(+) A-G intron -    22484847
chr2:70028719(+) A-G intron -    22484847
chr2:70028770(+) A-G intron -    22484847
chr2:70028771(+) A-G intron -    22484847
chr2:70028804(+) A-G intron -    22484847
chr2:70029660(+) A-G intron -    22484847
chr2:70029722(+) A-G intron -    22484847
chr2:70029763(+) A-G intron -    22484847
chr2:70030222(+) A-G intron -    22484847
chr2:70035817(+) A-G intron -    22484847
chr2:70035850(+) A-G intron -    22484847
chr2:70035977(+) A-G intron -    22484847
chr2:70036029(+) A-G intron -    22484847
chr2:70036054(+) G-A intron -    22484847
chr2:70036749(+) A-G intron -    22484847
chr2:70036752(+) A-G intron -    22484847
chr2:70036755(+) A-G intron -    22484847
chr2:70036793(+) A-G intron -    22484847
chr2:70036845(+) A-G intron -    22484847
chr2:70036878(+) A-G intron -    22484847
chr2:70036884(+) A-G intron -    22484847
chr2:70036890(+) A-G intron -    22484847
chr2:70037258(+) A-G intron -    22484847
chr2:70037271(+) A-G intron -    22484847
chr2:70037329(+) A-G intron -    22484847
chr2:70037330(+) A-G intron -    22484847
chr2:70037331(+) A-G intron -    22484847
chr2:70037340(+) A-G intron -    22484847
chr2:70037344(+) A-G intron -    22484847
chr2:70037354(+) A-G intron -    22484847
chr2:70037364(+) A-G intron -    22484847
chr2:70037370(+) A-G intron -    22484847
chr2:70037371(+) A-G intron -    22484847
chr2:70037393(+) A-G intron -    22484847
chr2:70048702(+) A-G intron -    22484847
chr2:70048767(+) A-G intron -    22484847
chr2:70048798(+) A-G intron -    22484847
chr2:70048846(+) A-G intron -    22484847
chr2:70049311(+) A-G intron -    22484847
chr2:70051971(+) A-G intron -    22484847
chr2:69970301(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase ANXA4
chr2:69871565-69871566(+) m6A exon       22608085
chr2:69871675-69871676(+) m6A exon       24981863//22608085
chr2:69871712-69871713(+) m6A exon       24981863//22608085
chr2:69871720-69871721(+) m6A exon       24981863//22608085
chr2:69871763-69871764(+) m6A exon       24284625//24981863//22608085
chr2:69871789-69871790(+) m6A exon       24284625//24981863//22608085
chr2:69871867-69871868(+) m6A exon       24284625//24981863//22608085
chr2:69871894-69871895(+) m6A exon       24284625//24981863//22608085
chr2:69871996-69871997(+) m6A exon       24981863
chr2:69880166-69880167(+) m6A exon       24284625//24981863//22608085
chr2:69880204-69880205(+) m6A exon       24284625//24981863//22608085
chr2:69880248-69880249(+) m6A exon       24981863//22608085
chr2:69880270-69880271(+) m6A exon       24981863//22608085
chr2:69969179-69969180(+) m6A 5'UTR//intron       24981863
chr2:69969189-69969190(+) m6A 5'UTR//intron       24981863
chr2:69969239-69969240(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24981863
chr2:70008304-70008305(+) m6A exon//intron       24981863
chr2:70015245-70015246(+) m6A CDS//exon//intron       26404942
chr2:70030529-70030530(+) m6A exon//intron       26404942
chr2:70030540-70030541(+) m6A exon//intron       26404942
chr2:70030556-70030557(+) m6A exon//intron       26404942
chr2:70030566-70030567(+) m6A exon//intron       26404942
chr2:70030585-70030586(+) m6A exon//intron       26404942
chr2:70030592-70030593(+) m6A exon//intron       26404942
chr2:70030643-70030644(+) m6A exon//intron       26404942
chr2:70031732-70031733(+) m6A CDS//exon       26404942//22575960
chr2:70033542-70033543(+) m6A CDS//exon       26404942//22575960
chr2:70033607-70033608(+) Am CDS//exon//intron       -
chr2:70035085-70035086(+) m6A CDS//exon       26404942
chr2:70035115-70035116(+) m6A CDS//exon       26404942
chr2:70039828-70039829(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       -
chr2:70045770-70045771(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942
chr2:70045789-70045790(+) m6A CDS//exon       26404942
chr2:70046426-70046427(+) m6A CDS//exon       26404942
chr2:70047919-70047920(+) m6A CDS//exon       26404942
chr2:70052603-70052604(+) m6A CDS//exon       26404942
chr2:70052665-70052666(+) m6A 3'UTR//exon       26404942
chr2:70053261-70053262(+) m6A 3'UTR       26404942
chr2:70053275-70053276(+) m6A 3'UTR       26404942
chr2:70053302-70053303(+) m6A 3'UTR       26404942
chr2:70053324-70053325(+) m6A 3'UTR       26404942
chr2:70053337-70053338(+) m6A 3'UTR       26404942

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-19b-1-5p
Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Mesenchymal stem cells     -
ANXA4
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)     -
Exosome Blood     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells     -
Ribosome HEK-293 cells     22199352
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-19b-1-5p
Interactor2: ANXA4

Evidence Support:


Weak-Evidence PAR-CLIP
Support Database ViRBase

References:


PMID 22291592 Target region 3'UTR
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells Interactor2 expression None
Description We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.

Starting a new search, please wait ...