Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
---|---|---|
Symbol | hsa-miR-16-1-3p | ABCF3 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0004489 | 55324 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | EST201864 |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
miRNASNP-v3 | hsa-miR-16-1-3p |
|
Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RMBase | ABCF3 |
|
Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RNALocate | hsa-miR-16-1-3p |
|
|||||||||||
ABCF3 |
Interactor1: hsa-miR-16-1-3p | Interactor2: ABCF3 |
---|
Weak-Evidence | PAR-CLIP | |
---|---|---|
Support Database | ViRBase |
PMID | 22291592 | Target region | 3'UTR |
---|---|---|---|
Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells | Interactor2 expression | None |
Description | We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs. |