Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00062769

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-16-1-3p:           EIF2AK2:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-16-1-3p EIF2AK2
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0004489 5610
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - EIF2AK1//LEUDEN//PKR//PPP1R83//PRKR

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-16-1-3p
rs377111580 chr13:50048986    C/T
rs769728617 chr13:50048992    CA/C
rs1460126106 chr13:50049003    C/A
rs1460126106 chr13:50049003    C/T
rs1468155921 chr13:50049001    T/C

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR EIF2AK2
chr2:37355129(-) A-I      intronic
chr2:37355122(-) A-I      intronic
chr2:37355109(-) A-I      intronic
chr2:37355088(-) A-I      intronic
chr2:37343200(-) A-I      intronic
chr2:37343204(-) A-I      intronic
chr2:37355079(-) A-I      intronic
chr2:37355064(-) A-I      intronic
chr2:37355060(-) A-I      intronic
chr2:37327631(-) A-I      3'UTR
chr2:37327650(-) A-I      3'UTR
chr2:37327651(-) A-I      3'UTR
chr2:37327653(-) A-I      3'UTR
chr2:37327659(-) A-I      3'UTR
chr2:37327660(-) A-I      3'UTR
chr2:37327668(-) A-I      3'UTR
chr2:37327675(-) A-I      3'UTR
chr2:37327676(-) A-I      3'UTR
chr2:37346777(-) A-I      intronic
chr2:37346802(-) A-I      intronic
chr2:37346803(-) A-I      intronic
chr2:37327698(-) A-I      3'UTR
chr2:37346948(-) A-I      intronic
chr2:37327630(-) A-I      3'UTR
chr2:37327624(-) A-I      3'UTR
chr2:37327615(-) A-I      3'UTR
chr2:37328000(-) A-I      3'UTR
chr2:37328005(-) A-I      3'UTR
chr2:37328058(-) A-I      3'UTR
chr2:37328067(-) A-I      3'UTR
chr2:37327979(-) A-I      3'UTR
chr2:37328076(-) A-I      3'UTR
chr2:37328081(-) A-I      3'UTR
chr2:37327613(-) A-I      3'UTR
chr2:37329191(-) A-I      3'UTR
chr2:37332281(-) A-I      3'UTR
chr2:37328140(-) A-I      3'UTR
chr2:37380781(-) A-I      intronic
chr2:37329253(-) A-I      3'UTR
chr2:37343224(-) A-I      intronic
chr2:37380807(-) A-I      intronic
chr2:37329336(-) A-I      3'UTR
chr2:37329345(-) A-I      3'UTR
chr2:37346811(-) A-I      intronic
chr2:37330630(-) A-I      3'UTR
chr2:37327642(-) A-I      3'UTR
chr2:37331174(-) A-I      3'UTR
chr2:37331226(-) A-I      3'UTR
chr2:37331460(-) A-I      3'UTR
chr2:37331464(-) A-I      3'UTR
chr2:37331520(-) A-I      3'UTR
chr2:37331539(-) A-I      3'UTR
chr2:37327635(-) A-I      3'UTR
chr2:37331632(-) A-I      3'UTR
chr2:37331658(-) A-I      3'UTR
chr2:37343178(-) A-I      intronic
chr2:37343199(-) A-I      intronic
chr2:37381832(-) A-I      intronic
chr2:37382940(-) A-I      intronic
chr2:37382918(-) A-I      intronic
chr2:37380546(-) A-I      intronic
chr2:37380544(-) A-I      intronic
chr2:37380517(-) A-I      intronic
chr2:37379521(-) A-I      intronic
chr2:37379492(-) A-I      intronic
chr2:37355152(-) A-I      intronic
chr2:37335959(-) A-I      intronic
chr2:37335964(-) A-I      intronic
chr2:37355179(-) A-I      intronic
chr2:37346951(-) A-I      intronic
chr2:37347008(-) A-I      intronic
chr2:37350582(-) A-I      intronic
chr2:37355052(-) A-I      intronic
chr2:37370115(-) A-I      intronic
chr2:37369471(-) A-I      intronic
chr2:37365166(-) A-I      intronic
chr2:37365153(-) A-I      intronic
chr2:37364623(-) A-I      intronic
chr2:37359570(-) A-I      intronic
chr2:37359550(-) A-I      intronic
chr2:37357423(-) A-I      intronic
chr2:37382939(-) A-I      intronic
chr2:37355112(-) A-I      intronic
chr2:37355103(-) A-I      intronic
chr2:37355098(-) A-I      intronic
chr2:37355078(-) A-I      intronic
chr2:37355073(-) A-I      intronic
chr2:37354087(-) A-I      intronic
chr2:37354017(-) A-I      intronic
chr2:37350593(-) A-I      intronic
chr2:37350591(-) A-I      intronic
chr2:37350584(-) A-I      intronic
chr2:37350538(-) A-I      intronic
chr2:37350529(-) A-I      intronic
chr2:37350228(-) A-I      intronic
chr2:37350202(-) A-I      intronic
chr2:37350081(-) A-I      intronic
chr2:37345466(-) A-I      intronic
chr2:37344666(-) A-I      intronic
chr2:37344463(-) A-I      intronic
chr2:37343128(-) A-I      intronic
chr2:37335950(-) A-I      intronic
chr2:37335851(-) A-I      intronic
chr2:37335785(-) A-I      intronic
chr2:37335748(-) A-I      intronic
chr2:37381841(-) A-I      intronic
chr2:37383021(-) A-I      intronic
chr2:37381842(-) A-I      intronic
chr2:37335284(-) A-I      intronic
chr2:37381815(-) A-I      intronic
chr2:37381405(-) A-I      intronic
chr2:37379548(-) A-I      intronic
chr2:37379536(-) A-I      intronic
chr2:37379501(-) A-I      intronic
chr2:37379460(-) A-I      intronic
chr2:37381868(-) A-I      intronic
chr2:37373169(-) A-I      intronic
chr2:37373060(-) A-I      intronic
chr2:37373033(-) A-I      intronic
chr2:37373028(-) A-I      intronic
chr2:37371943(-) A-I      intronic
chr2:37371898(-) A-I      intronic
chr2:37371757(-) A-I      intronic
chr2:37370908(-) A-I      intronic
chr2:37370887(-) A-I      intronic
chr2:37370810(-) A-I      intronic
chr2:37370792(-) A-I      intronic
chr2:37382921(-) A-I      intronic
chr2:37381908(-) A-I      intronic
chr2:37382927(-) A-I      intronic
chr2:37370782(-) A-I      intronic
chr2:37370754(-) A-I      intronic
chr2:37335213(-) A-I      intronic
chr2:37335206(-) A-I      intronic
chr2:37370255(-) A-I      intronic
chr2:37370224(-) A-I      intronic
chr2:37370146(-) A-I      intronic
chr2:37370127(-) A-I      intronic
chr2:37382944(-) A-I      intronic
chr2:37331635(-) A-I      3'UTR
chr2:37331638(-) A-I      3'UTR
chr2:37331667(-) A-I      3'UTR
chr2:37331028(-) A-I      3'UTR
chr2:37331679(-) A-I      3'UTR
chr2:37331114(-) A-I      3'UTR
chr2:37331712(-) A-I      3'UTR
chr2:37331731(-) A-I      3'UTR
chr2:37331164(-) A-I      3'UTR
chr2:37331196(-) A-I      3'UTR
chr2:37331245(-) A-I      3'UTR
chr2:37331257(-) A-I      3'UTR
chr2:37331279(-) A-I      3'UTR
chr2:37331528(-) A-I      3'UTR
chr2:37331552(-) A-I      3'UTR
chr2:37331619(-) A-I      3'UTR
chr2:37331630(-) A-I      3'UTR
chr2:37331631(-) A-I      3'UTR
chr2:37329357(-) A-I      3'UTR
chr2:37329163(-) A-I      3'UTR
chr2:37329226(-) A-I      3'UTR
chr2:37329239(-) A-I      3'UTR
chr2:37329333(-) A-I      3'UTR
chr2:37330415(-) A-I      3'UTR
chr2:37329381(-) A-I      3'UTR
chr2:37329383(-) A-I      3'UTR
chr2:37330342(-) A-I      3'UTR
chr2:37330367(-) A-I      3'UTR
chr2:37330411(-) A-I      3'UTR
chr2:37330447(-) A-I      3'UTR
chr2:37330460(-) A-I      3'UTR
chr2:37330527(-) A-I      3'UTR
chr2:37330532(-) A-I      3'UTR
chr2:37330533(-) A-I      3'UTR
chr2:37330571(-) A-I      3'UTR
chr2:37383001(-) A-I      intronic
chr2:37335944(-) A-I      intronic
chr2:37373007(-) A-I      intronic
chr2:37381385(-) A-I      intronic
chr2:37382976(-) A-I      intronic
chr2:37359726(-) A-I      intronic
chr2:37350264(-) A-I      intronic
chr2:37335837(-) A-I      intronic
chr2:37383069(-) A-I      intronic
chr2:37379602(-) A-I      intronic
chr2:37350607(-) A-I      intronic
chr2:37344558(-) A-I      intronic
chr2:37381898(-) A-I      intronic
chr2:37351420(-) A-I      intronic
chr2:37362999(-) A-I      intronic
chr2:37371848(-) A-I      intronic
chr2:37354991(-) A-I      intronic
chr2:37353895(-) A-I      intronic
chr2:37364725(-) A-I      intronic
chr2:37365981(-) A-I      intronic
chr2:37365071(-) A-I      intronic
chr2:37371840(-) A-I      intronic
chr2:37335126(-) A-I      intronic
chr2:37346745(-) A-I      intronic
chr2:37351239(-) A-I      intronic
chr2:37366060(-) A-I      intronic
chr2:37338746(-) A-I      intronic
chr2:37335067(-) A-I      intronic
chr2:37380567(-) A-I      intronic
chr2:37383077(-) A-I      intronic
chr2:37364651(-) A-I      intronic
chr2:37353943(-) A-I      intronic
chr2:37379531(-) A-I      intronic
chr2:37359490(-) A-I      intronic
chr2:37355049(-) A-I      intronic
chr2:37370204(-) A-I      intronic
chr2:37331171(-) A-I      3'UTR
chr2:37331107(-) A-I      3'UTR
chr2:37330476(-) A-I      3'UTR
chr2:37330373(-) A-I      3'UTR
chr2:37331565(-) A-I      3'UTR
chr2:37331531(-) A-I      3'UTR
chr2:37331037(-) A-I      3'UTR
chr2:37330534(-) A-I      3'UTR
chr2:37334102(-) A-I      3'UTR
chr2:37331662(-) A-I      3'UTR
chr2:37329320(-) A-I      3'UTR
chr2:37331510(-) A-I      3'UTR
chr2:37331135(-) A-I      3'UTR
chr2:37331236(-) A-I      3'UTR
chr2:37329180(-) A-I      3'UTR
chr2:37329228(-) A-I      3'UTR
chr2:37330620(-) A-I      3'UTR
chr2:37331641(-) A-I      3'UTR
chr2:37329314(-) A-I      3'UTR
chr2:37331515(-) A-I      3'UTR
chr2:37330606(-) A-I      3'UTR
chr2:37331019(-) A-I      3'UTR
chr2:37330404(-) A-I      3'UTR
chr2:37331220(-) A-I      3'UTR
chr2:37329377(-) A-I      3'UTR
chr2:37331207(-) A-I      3'UTR
chr2:37331038(-) A-I      3'UTR
chr2:37331595(-) A-I      3'UTR
chr2:37331711(-) A-I      3'UTR
chr2:37331642(-) A-I      3'UTR
chr2:37331269(-) A-I      3'UTR
chr2:37329248(-) A-I      3'UTR
chr2:37330514(-) A-I      3'UTR
chr2:37331102(-) A-I      3'UTR
chr2:37329350(-) A-I      3'UTR
chr2:37330540(-) A-I      3'UTR
chr2:37331560(-) A-I      3'UTR
chr2:37331145(-) A-I      3'UTR
chr2:37329307(-) A-I      3'UTR
chr2:37331627(-) A-I      3'UTR
chr2:37329213(-) A-I      3'UTR
chr2:37334181(-) A-I      3'UTR
chr2:37330406(-) A-I      3'UTR
chr2:37331277(-) A-I      3'UTR
chr2:37330467(-) A-I      3'UTR
chr2:37331089(-) A-I      3'UTR
chr2:37330516(-) A-I      3'UTR
chr2:37331525(-) A-I      3'UTR
chr2:37330518(-) A-I      3'UTR
chr2:37331119(-) A-I      3'UTR
chr2:37330366(-) A-I      3'UTR
chr2:37330611(-) A-I      3'UTR
chr2:37331221(-) A-I      3'UTR
chr2:37334020(-) A-I      3'UTR
chr2:37329300(-) A-I      3'UTR
chr2:37329243(-) A-I      3'UTR
chr2:37330507(-) A-I      3'UTR
chr2:37329296(-) A-I      3'UTR
chr2:37334139(-) A-I      3'UTR
chr2:37331239(-) A-I      3'UTR
chr2:37329261(-) A-I      3'UTR
chr2:37331681(-) A-I      3'UTR
chr2:37331023(-) A-I      3'UTR
chr2:37329211(-) A-I      3'UTR
chr2:37330506(-) A-I      3'UTR
chr2:37331614(-) A-I      3'UTR
chr2:37329214(-) A-I      3'UTR
chr2:37331281(-) A-I      3'UTR
chr2:37331159(-) A-I      3'UTR
chr2:37329273(-) A-I      3'UTR
chr2:37330566(-) A-I      3'UTR
chr2:37330587(-) A-I      3'UTR
chr2:37329283(-) A-I      3'UTR
chr2:37331568(-) A-I      3'UTR
chr2:37331666(-) A-I      3'UTR
chr2:37329179(-) A-I      3'UTR
chr2:37330344(-) A-I      3'UTR
chr2:37330450(-) A-I      3'UTR
chr2:37329331(-) A-I      3'UTR
chr2:37330576(-) A-I      3'UTR
chr2:37330614(-) A-I      3'UTR
chr2:37331093(-) A-I      3'UTR
chr2:37330517(-) A-I      3'UTR
chr2:37331640(-) A-I      3'UTR
chr2:37331535(-) A-I      3'UTR
chr2:37331025(-) A-I      3'UTR
chr2:37330368(-) A-I      3'UTR
chr2:37330371(-) A-I      3'UTR
chr2:37330445(-) A-I      3'UTR
chr2:37330391(-) A-I      3'UTR
chr2:37329313(-) A-I      3'UTR
chr2:37331030(-) A-I      3'UTR
chr2:37330521(-) A-I      3'UTR
chr2:37330503(-) A-I      3'UTR
chr2:37331250(-) A-I      3'UTR
chr2:37331639(-) A-I      3'UTR
chr2:37331728(-) A-I      3'UTR
chr2:37329347(-) A-I      3'UTR
chr2:37331651(-) A-I      3'UTR
chr2:37330345(-) A-I      3'UTR
chr2:37330435(-) A-I      3'UTR
chr2:37331745(-) A-I      3'UTR
chr2:37330386(-) A-I      3'UTR
chr2:37330612(-) A-I      3'UTR
chr2:37331746(-) A-I      3'UTR
chr2:37331643(-) A-I      3'UTR
chr2:37331065(-) A-I      3'UTR
chr2:37329235(-) A-I      3'UTR
chr2:37329227(-) A-I      3'UTR
chr2:37334058(-) A-I      3'UTR
chr2:37329234(-) A-I      3'UTR
chr2:37334146(-) A-I      3'UTR
chr2:37331016(-) A-I      3'UTR
chr2:37330515(-) A-I      3'UTR
chr2:37379606(-) A-I      intronic
chr2:37371002(-) A-I      intronic
chr2:37345374(-) A-I      intronic
chr2:37371888(-) A-I      intronic
chr2:37380557(-) A-I      intronic
chr2:37370806(-) A-I      intronic
chr2:37380556(-) A-I      intronic
chr2:37335877(-) A-I      intronic
chr2:37383002(-) A-I      intronic
chr2:37335984(-) A-I      intronic
chr2:37379208(-) A-I      intronic
chr2:37355014(-) A-I      intronic
chr2:37372340(-) A-I      intronic
chr2:37350675(-) A-I      intronic
chr2:37369508(-) A-I      intronic
chr2:37370927(-) A-I      intronic
chr2:37372450(-) A-I      intronic
chr2:37335141(-) A-I      intronic
chr2:37378979(-) A-I      intronic
chr2:37383079(-) A-I      intronic
chr2:37371862(-) A-I      intronic
chr2:37379487(-) A-I      intronic
chr2:37338610(-) A-I      intronic
chr2:37357427(-) A-I      intronic
chr2:37366375(-) A-I      intronic
chr2:37350066(-) A-I      intronic
chr2:37370919(-) A-I      intronic
chr2:37345269(-) A-I      intronic
chr2:37381789(-) A-I      intronic
chr2:37370951(-) A-I      intronic
chr2:37366077(-) A-I      intronic
chr2:37381801(-) A-I      intronic
chr2:37371962(-) A-I      intronic
chr2:37352021(-) A-I      intronic
chr2:37346981(-) A-I      intronic
chr2:37344541(-) A-I      intronic
chr2:37370809(-) A-I      intronic
chr2:37350129(-) A-I      intronic
chr2:37362973(-) A-I      intronic
chr2:37381819(-) A-I      intronic
chr2:37371971(-) A-I      intronic
chr2:37370805(-) A-I      intronic
chr2:37382962(-) A-I      intronic
chr2:37343484(-) A-I      intronic
chr2:37380643(-) A-I      intronic
chr2:37371014(-) A-I      intronic
chr2:37343177(-) A-I      intronic
chr2:37369381(-) A-I      intronic
chr2:37364660(-) A-I      intronic
chr2:37355024(-) A-I      intronic
chr2:37364741(-) A-I      intronic
chr2:37370289(-) A-I      intronic
chr2:37369370(-) A-I      intronic
chr2:37365131(-) A-I      intronic
chr2:37344673(-) A-I      intronic
chr2:37382912(-) A-I      intronic
chr2:37359500(-) A-I      intronic
chr2:37369449(-) A-I      intronic
chr2:37359478(-) A-I      intronic
chr2:37345280(-) A-I      intronic
chr2:37381368(-) A-I      intronic
chr2:37371827(-) A-I      intronic
chr2:37380623(-) A-I      intronic
chr2:37379603(-) A-I      intronic
chr2:37371818(-) A-I      intronic
chr2:37372532(-) A-I      intronic
chr2:37344234(-) A-I      intronic
chr2:37335916(-) A-I      intronic
chr2:37381800(-) A-I      intronic
chr2:37346952(-) A-I      intronic
chr2:37370835(-) A-I      intronic
chr2:37379597(-) A-I      intronic
chr2:37350478(-) A-I      intronic
chr2:37372558(-) A-I      intronic
chr2:37371933(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED EIF2AK2
chr2:37339925(-) A-I intron -    15545495
chr2:37339926(-) A-I intron -    15545495
chr2:37339928(-) A-I intron -    15545495
chr2:37339934(-) A-I intron -    15545495
chr2:37339937(-) A-I intron -    15545495   //21960545
chr2:37339938(-) A-I intron -    15545495   //21960545
chr2:37339968(-) A-I intron -    15545495   //21960545
chr2:37339977(-) A-I intron -    15545495   //21960545
chr2:37339995(-) A-I intron -    15545495   //21960545   //22327324
chr2:37339999(-) A-I intron -    15545495
chr2:37340003(-) A-I intron -    15545495
chr2:37340011(-) A-I intron -    15545495
chr2:37340013(-) A-I intron -    15545495
chr2:37340036(-) A-I intron -    15545495   //22327324
chr2:37335877(-) A-I intron -    22327324
chr2:37340034(-) A-I intron -    22327324
chr2:37380812(-) A-I intron -    22327324
chr2:37380852(-) A-I intron -    21960545   //22327324
chr2:37338311(-) A-I intron -    21960545
chr2:37338460(-) A-I intron -    21960545
chr2:37339918(-) A-I intron -    21960545
chr2:37339919(-) A-I intron -    21960545
chr2:37339935(-) A-I intron -    21960545
chr2:37339960(-) A-I intron -    21960545
chr2:37380708(-) A-I intron -    21960545
chr2:37380756(-) A-I intron -    21960545
chr2:37338311(-) A-G intron -    22484847
chr2:37338326(-) A-G intron -    22484847
chr2:37338420(-) A-G intron -    22484847
chr2:37338460(-) A-G intron -    22484847
chr2:37339977(-) A-G intron -    22484847
chr2:37339995(-) A-G intron -    22484847
chr2:37340011(-) A-G intron -    22484847
chr2:37340034(-) A-G intron -    22484847
chr2:37340036(-) A-G intron -    22484847
chr2:37380812(-) A-G intron -    22484847
chr2:37380813(-) A-G intron -    22484847
chr2:37380852(-) A-G intron -    22484847
chr2:37333961(-) A-C exon 3'UTR    22484847
chr2:37334181(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr2:37334182(-) G-A exon 3'UTR    22484847
chr2:37334185(-) A-T exon 3'UTR    22484847
chr2:37335067(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335177(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335837(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335841(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335850(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335877(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335916(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335944(-) A-G intron -    22484847
chr2:37338639(-) A-G intron -    22484847
chr2:37344486(-) T-C intron -    22484847
chr2:37345269(-) A-G intron -    22484847
chr2:37345272(-) A-G intron -    22484847
chr2:37345397(-) A-G intron -    22484847
chr2:37345465(-) T-A intron -    22484847
chr2:37345466(-) A-T intron -    22484847
chr2:37346873(-) A-G intron -    22484847
chr2:37346952(-) A-G intron -    22484847
chr2:37346981(-) A-G intron -    22484847
chr2:37347001(-) A-G intron -    22484847
chr2:37347010(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350066(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350129(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350203(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350264(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350477(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350478(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350534(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350657(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350675(-) A-G intron -    22484847
chr2:37353928(-) G-A intron -    22484847
chr2:37353943(-) A-G intron -    22484847
chr2:37365981(-) A-G intron -    22484847
chr2:37369381(-) A-G intron -    22484847
chr2:37370250(-) A-G intron -    22484847
chr2:37370288(-) A-G intron -    22484847
chr2:37370289(-) A-G intron -    22484847
chr2:37370776(-) A-G intron -    22484847
chr2:37370806(-) A-G intron -    22484847
chr2:37370835(-) A-G intron -    22484847
chr2:37371840(-) A-G intron -    22484847
chr2:37371862(-) A-G intron -    22484847
chr2:37371933(-) A-G intron -    22484847
chr2:37371971(-) A-G intron -    22484847
chr2:37373007(-) A-G intron -    22484847
chr2:37378959(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379487(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379510(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379531(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379597(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379601(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379602(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379603(-) A-G intron -    22484847
chr2:37380557(-) A-G intron -    22484847
chr2:37381368(-) A-G intron -    22484847
chr2:37381465(-) A-G intron -    22484847
chr2:37381800(-) A-G intron -    22484847
chr2:37381819(-) A-G intron -    22484847
chr2:37381898(-) A-G intron -    22484847
chr2:37381899(-) A-G intron -    22484847
chr2:37382912(-) A-G intron -    22484847
chr2:37382936(-) A-G intron -    22484847
chr2:37382962(-) A-G intron -    22484847
chr2:37382976(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383001(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383002(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383008(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383027(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383050(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383069(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383077(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383079(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase EIF2AK2
chr2:37326356-37326357(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37326480-37326481(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37326721-37326722(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37327157-37327158(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37328215-37328216(-) m6A 3'UTR       24981863
chr2:37328220-37328221(-) m6A 3'UTR       24981863
chr2:37328231-37328232(-) m6A 3'UTR       24981863
chr2:37328246-37328247(-) m6A 3'UTR       24981863
chr2:37328275-37328276(-) m6A 3'UTR       -
chr2:37328305-37328306(-) m6A 3'UTR       -
chr2:37330189-37330190(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37330208-37330209(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37331678-37331679(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37332334-37332335(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37332364-37332365(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37332376-37332377(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37332438-37332439(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37332521-37332522(-) m6A 3'UTR       -
chr2:37332536-37332537(-) m6A 3'UTR       -
chr2:37332938-37332939(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37332956-37332957(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37333072-37333073(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37333219-37333220(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37333308-37333309(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37333327-37333328(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37333349-37333350(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37333416-37333417(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37333432-37333433(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37333484-37333485(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37333981-37333982(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37336406-37336407(-) m6A CDS//exon       22575960
chr2:37336424-37336425(-) m6A CDS//exon       22575960
chr2:37341876-37341877(-) m6A CDS       27773535
chr2:37341899-37341900(-) m6A CDS       27773535
chr2:37341914-37341915(-) m6A CDS       27773535
chr2:37341948-37341949(-) m6A CDS       27773535
chr2:37341955-37341956(-) m6A CDS       24981863
chr2:37341972-37341973(-) m6A CDS       24981863
chr2:37347161-37347162(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37347170-37347171(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37347189-37347190(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37347194-37347195(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37347224-37347225(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37347232-37347233(-) m6A CDS       27773535
chr2:37347274-37347275(-) m6A CDS       27773535
chr2:37349666-37349667(-) m6A CDS       27773535
chr2:37353465-37353466(-) m6A CDS//intron       27773535
chr2:37353484-37353485(-) m6A CDS//intron       27773535
chr2:37362632-37362633(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37362648-37362649(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37363930-37363931(-) m6A exon//intron       27773535
chr2:37363988-37363989(-) m6A exon//intron       27773535
chr2:37366875-37366876(-) m6A CDS//exon       27773535
chr2:37368727-37368728(-) m6A CDS//exon       27773535
chr2:37368745-37368746(-) m6A CDS//exon       27773535
chr2:37384112-37384113(-) m6A 5'UTR       24981863
chr2:37384119-37384120(-) m6A 5'UTR       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-16-1-3p
Exosome Plasma     23663360
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
EIF2AK2
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)     -
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Colon cancer cells     24393600
Nucleus HCC cell line (HepG2)     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-16-1-3p
Interactor2: EIF2AK2

Evidence Support:


Weak-Evidence PAR-CLIP
Support Database ViRBase

References:


PMID 22291592 Target region 3'UTR
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells Interactor2 expression None
Description We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.

Starting a new search, please wait ...