Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00060628

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-573:  MIMAT0003238          CASP8AP2:  NM_001137668     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-573	CASP8AP2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003238	9994
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CED-4//FLASH//RIP25

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-573	rs1203521332 chr4:24520263    C/T rs1262008333 chr4:24520263    C/CACA rs1323507871 chr4:24520254    G/T rs373452545 chr4:24520267    T/C rs554771730 chr4:24520260    T/C rs562847917 chr4:24520264    A/G rs760302615 chr4:24520257    C/T rs776058506 chr4:24520265    C/T rs1371079024 chr4:24520270    C/T rs1447248378 chr4:24520261    TACACATC/T rs899607846 chr4:24520271    T/C

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position
Lncediting	CASP8AP2	chr6: 90567059     chr6: 90541028     chr6: 90540993     chr6: 90541020

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	CASP8AP2	chr6:90581768(+) A-I      intronic chr6:90581776(+) A-I      intronic chr6:90555971(+) A-I      intronic chr6:90559600(+) A-I      intronic chr6:90567900(+) A-I      intronic chr6:90567871(+) A-I      intronic chr6:90559609(+) A-I      intronic chr6:90554817(+) A-I      intronic chr6:90554820(+) A-I      intronic chr6:90582648(+) A-I      intronic chr6:90568463(+) A-I      intronic chr6:90551594(+) A-I      intronic chr6:90551589(+) A-I      intronic chr6:90541568(+) A-I      intronic chr6:90556430(+) A-I      intronic chr6:90555085(+) A-I      intronic chr6:90555192(+) A-I      intronic chr6:90582639(+) A-I      intronic chr6:90582331(+) A-I      intronic chr6:90582172(+) A-I      intronic chr6:90582157(+) A-I      intronic chr6:90582127(+) A-I      intronic chr6:90582120(+) A-I      intronic chr6:90582072(+) A-I      intronic chr6:90582062(+) A-I      intronic chr6:90582038(+) A-I      intronic chr6:90582030(+) A-I      intronic chr6:90582003(+) A-I      intronic chr6:90581733(+) A-I      intronic chr6:90581702(+) A-I      intronic chr6:90581350(+) A-I      intronic chr6:90581344(+) A-I      intronic chr6:90580245(+) A-I      intronic chr6:90580227(+) A-I      intronic chr6:90579215(+) A-I      intronic chr6:90579106(+) A-I      intronic chr6:90575497(+) A-I      intronic chr6:90575484(+) A-I      intronic chr6:90555549(+) A-I      intronic chr6:90555586(+) A-I      intronic chr6:90556052(+) A-I      intronic chr6:90556068(+) A-I      intronic chr6:90556416(+) A-I      intronic chr6:90575056(+) A-I      intronic chr6:90575014(+) A-I      intronic chr6:90574979(+) A-I      intronic chr6:90574790(+) A-I      intronic chr6:90574787(+) A-I      intronic chr6:90574747(+) A-I      intronic chr6:90574683(+) A-I      intronic chr6:90574651(+) A-I      intronic chr6:90574380(+) A-I      intronic chr6:90574368(+) A-I      intronic chr6:90574365(+) A-I      intronic chr6:90574356(+) A-I      intronic chr6:90574338(+) A-I      intronic chr6:90574333(+) A-I      intronic chr6:90574300(+) A-I      intronic chr6:90574263(+) A-I      intronic chr6:90574257(+) A-I      intronic chr6:90571233(+) A-I      intronic chr6:90571221(+) A-I      intronic chr6:90568542(+) A-I      intronic chr6:90568488(+) A-I      intronic chr6:90568462(+) A-I      intronic chr6:90567961(+) A-I      intronic chr6:90567933(+) A-I      intronic chr6:90567682(+) A-I      intronic chr6:90567555(+) A-I      intronic chr6:90567261(+) A-I      intronic chr6:90565511(+) A-I      intronic chr6:90563470(+) A-I      intronic chr6:90563426(+) A-I      intronic chr6:90563414(+) A-I      intronic chr6:90563395(+) A-I      intronic chr6:90563369(+) A-I      intronic chr6:90562580(+) A-I      intronic chr6:90562457(+) A-I      intronic chr6:90562417(+) A-I      intronic chr6:90562043(+) A-I      intronic chr6:90560471(+) A-I      intronic chr6:90559546(+) A-I      intronic chr6:90559138(+) A-I      intronic chr6:90558760(+) A-I      intronic chr6:90558699(+) A-I      intronic chr6:90558221(+) A-I      intronic chr6:90558203(+) A-I      intronic chr6:90558188(+) A-I      intronic chr6:90558179(+) A-I      intronic chr6:90558173(+) A-I      intronic chr6:90558160(+) A-I      intronic chr6:90557657(+) A-I      intronic chr6:90557549(+) A-I      intronic chr6:90557522(+) A-I      intronic chr6:90557134(+) A-I      intronic chr6:90557129(+) A-I      intronic chr6:90541097(+) A-I      intronic chr6:90541149(+) A-I      intronic chr6:90543973(+) A-I      intronic chr6:90543978(+) A-I      intronic chr6:90543979(+) A-I      intronic chr6:90544002(+) A-I      intronic chr6:90544026(+) A-I      intronic chr6:90556525(+) A-I      intronic chr6:90544121(+) A-I      intronic chr6:90544276(+) A-I      intronic chr6:90544666(+) A-I      intronic chr6:90544669(+) A-I      intronic chr6:90545870(+) A-I      intronic chr6:90545908(+) A-I      intronic chr6:90546050(+) A-I      intronic chr6:90546068(+) A-I      intronic chr6:90546087(+) A-I      intronic chr6:90546653(+) A-I      intronic chr6:90547604(+) A-I      intronic chr6:90547691(+) A-I      intronic chr6:90547694(+) A-I      intronic chr6:90549162(+) A-I      intronic chr6:90549171(+) A-I      intronic chr6:90549237(+) A-I      intronic chr6:90549243(+) A-I      intronic chr6:90550007(+) A-I      intronic chr6:90554765(+) A-I      intronic chr6:90541028(+) A-I      5'UTR chr6:90541020(+) A-I      5'UTR chr6:90567059(+) A-I      3'UTR chr6:90581919(+) A-I      intronic chr6:90549971(+) A-I      intronic chr6:90555082(+) A-I      intronic chr6:90582327(+) A-I      intronic chr6:90580299(+) A-I      intronic chr6:90555482(+) A-I      intronic chr6:90555700(+) A-I      intronic chr6:90549198(+) A-I      intronic chr6:90581436(+) A-I      intronic chr6:90558336(+) A-I      intronic chr6:90574906(+) A-I      intronic chr6:90568618(+) A-I      intronic chr6:90567467(+) A-I      intronic chr6:90571139(+) A-I      intronic chr6:90565452(+) A-I      intronic chr6:90581178(+) A-I      intronic chr6:90567776(+) A-I      intronic chr6:90559509(+) A-I      intronic chr6:90575380(+) A-I      intronic chr6:90546917(+) A-I      intronic chr6:90571588(+) A-I      intronic chr6:90555895(+) A-I      intronic chr6:90561276(+) A-I      intronic chr6:90546696(+) A-I      intronic chr6:90574627(+) A-I      intronic chr6:90574425(+) A-I      intronic chr6:90581187(+) A-I      intronic chr6:90557035(+) A-I      intronic chr6:90581524(+) A-I      intronic chr6:90555958(+) A-I      intronic chr6:90581808(+) A-I      intronic chr6:90557028(+) A-I      intronic chr6:90563520(+) A-I      intronic chr6:90556529(+) A-I      intronic chr6:90581849(+) A-I      intronic chr6:90581517(+) A-I      intronic chr6:90544679(+) A-I      intronic chr6:90581522(+) A-I      intronic chr6:90558148(+) A-I      intronic chr6:90546978(+) A-I      intronic chr6:90581764(+) A-I      intronic chr6:90564388(+) A-I      intronic chr6:90555894(+) A-I      intronic chr6:90574339(+) A-I      intronic chr6:90559588(+) A-I      intronic chr6:90571254(+) A-I      intronic chr6:90581918(+) A-I      intronic chr6:90557029(+) A-I      intronic chr6:90558294(+) A-I      intronic chr6:90562703(+) A-I      intronic chr6:90543986(+) A-I      intronic chr6:90547926(+) A-I      intronic chr6:90574970(+) A-I      intronic chr6:90567844(+) A-I      intronic chr6:90549895(+) A-I      intronic chr6:90579204(+) A-I      intronic chr6:90541177(+) A-I      intronic chr6:90562697(+) A-I      intronic chr6:90555068(+) A-I      intronic chr6:90549227(+) A-I      intronic chr6:90579195(+) A-I      intronic chr6:90567128(+) A-I      intronic chr6:90564320(+) A-I      intronic chr6:90549307(+) A-I      intronic chr6:90549278(+) A-I      intronic chr6:90567867(+) A-I      intronic chr6:90581799(+) A-I      intronic chr6:90549247(+) A-I      intronic chr6:90558870(+) A-I      intronic chr6:90580158(+) A-I      intronic chr6:90570331(+) A-I      3'UTR chr6:90569322(+) A-I      3'UTR chr6:90570335(+) A-I      3'UTR chr6:90569347(+) A-I      3'UTR chr6:90570488(+) A-I      3'UTR chr6:90569520(+) A-I      3'UTR chr6:90570544(+) A-I      3'UTR chr6:90569507(+) A-I      3'UTR chr6:90540993(+) A-I      5'UTR chr6:90569393(+) A-I      3'UTR chr6:90569384(+) A-I      3'UTR chr6:90570466(+) A-I      3'UTR chr6:90570317(+) A-I      3'UTR chr6:90569546(+) A-I      3'UTR chr6:90569549(+) A-I      3'UTR chr6:90569396(+) A-I      3'UTR chr6:90569367(+) A-I      3'UTR chr6:90546972(+) A-I      intronic chr6:90567714(+) A-I      intronic chr6:90544408(+) A-I      intronic chr6:90549358(+) A-I      intronic chr6:90571133(+) A-I      intronic chr6:90562730(+) A-I      intronic chr6:90549716(+) A-I      intronic chr6:90571220(+) A-I      intronic chr6:90549333(+) A-I      intronic chr6:90551362(+) A-I      intronic chr6:90571314(+) A-I      intronic chr6:90555909(+) A-I      intronic chr6:90557645(+) A-I      intronic chr6:90558166(+) A-I      intronic chr6:90555228(+) A-I      intronic chr6:90544697(+) A-I      intronic chr6:90549626(+) A-I      intronic chr6:90583103(+) A-I      intronic chr6:90582712(+) A-I      intronic chr6:90567854(+) A-I      intronic chr6:90567845(+) A-I      intronic chr6:90555957(+) A-I      intronic chr6:90574733(+) A-I      intronic chr6:90564315(+) A-I      intronic chr6:90549119(+) A-I      intronic chr6:90579228(+) A-I      intronic chr6:90549583(+) A-I      intronic chr6:90571238(+) A-I      intronic chr6:90581920(+) A-I      intronic chr6:90546969(+) A-I      intronic chr6:90567798(+) A-I      intronic chr6:90562497(+) A-I      intronic chr6:90558262(+) A-I      intronic chr6:90557046(+) A-I      intronic chr6:90567909(+) A-I      intronic chr6:90545063(+) A-I      intronic chr6:90542659(+) A-I      intronic chr6:90544247(+) A-I      intronic chr6:90571473(+) A-I      intronic chr6:90549225(+) A-I      intronic chr6:90582345(+) A-I      intronic chr6:90579107(+) A-I      intronic chr6:90582558(+) A-I      intronic chr6:90583143(+) A-I      intronic chr6:90544344(+) A-I      intronic chr6:90555848(+) A-I      intronic chr6:90581813(+) A-I      intronic chr6:90571179(+) A-I      intronic chr6:90549281(+) A-I      intronic chr6:90555452(+) A-I      intronic chr6:90568920(+) A-I      intronic chr6:90560307(+) A-I      intronic chr6:90546069(+) A-I      intronic chr6:90581382(+) A-I      intronic chr6:90556022(+) A-I      intronic chr6:90574606(+) A-I      intronic chr6:90567270(+) A-I      intronic chr6:90544327(+) A-I      intronic chr6:90574759(+) A-I      intronic chr6:90554842(+) A-I      intronic chr6:90580192(+) A-I      intronic chr6:90555682(+) A-I      intronic chr6:90581462(+) A-I      intronic chr6:90581485(+) A-I      intronic chr6:90557548(+) A-I      intronic chr6:90549197(+) A-I      intronic chr6:90549379(+) A-I      intronic chr6:90544240(+) A-I      intronic chr6:90582033(+) A-I      intronic chr6:90551548(+) A-I      intronic chr6:90564387(+) A-I      intronic chr6:90558798(+) A-I      intronic chr6:90567246(+) A-I      intronic chr6:90549142(+) A-I      intronic chr6:90580267(+) A-I      intronic chr6:90563915(+) A-I      intronic chr6:90556064(+) A-I      intronic chr6:90549919(+) A-I      intronic chr6:90578970(+) A-I      intronic chr6:90579112(+) A-I      intronic chr6:90567886(+) A-I      intronic chr6:90583120(+) A-I      intronic chr6:90555655(+) A-I      intronic chr6:90581773(+) A-I      intronic chr6:90580228(+) A-I      intronic chr6:90544746(+) A-I      intronic chr6:90564305(+) A-I      intronic chr6:90581721(+) A-I      intronic chr6:90563475(+) A-I      intronic chr6:90546764(+) A-I      intronic chr6:90582400(+) A-I      intronic chr6:90557120(+) A-I      intronic chr6:90555296(+) A-I      intronic chr6:90581591(+) A-I      intronic chr6:90559506(+) A-I      intronic chr6:90545204(+) A-I      intronic chr6:90574750(+) A-I      intronic chr6:90549288(+) A-I      intronic chr6:90555869(+) A-I      intronic chr6:90574269(+) A-I      intronic chr6:90555908(+) A-I      intronic chr6:90565466(+) A-I      intronic chr6:90567435(+) A-I      intronic chr6:90555956(+) A-I      intronic chr6:90555284(+) A-I      intronic chr6:90583168(+) A-I      intronic chr6:90549961(+) A-I      intronic chr6:90582112(+) A-I      intronic chr6:90567444(+) A-I      intronic chr6:90567699(+) A-I      intronic chr6:90568620(+) A-I      intronic chr6:90562511(+) A-I      intronic chr6:90555654(+) A-I      intronic chr6:90568782(+) A-I      intronic chr6:90556023(+) A-I      intronic chr6:90558664(+) A-I      intronic chr6:90544312(+) A-I      intronic chr6:90544409(+) A-I      intronic chr6:90567424(+) A-I      intronic chr6:90580178(+) A-I      intronic chr6:90555120(+) A-I      intronic chr6:90555640(+) A-I      intronic chr6:90579172(+) A-I      intronic chr6:90583142(+) A-I      intronic chr6:90582539(+) A-I      intronic chr6:90555984(+) A-I      intronic chr6:90555514(+) A-I      intronic chr6:90555903(+) A-I      intronic chr6:90558271(+) A-I      intronic chr6:90541142(+) A-I      intronic chr6:90549148(+) A-I      intronic chr6:90579501(+) A-I      intronic chr6:90565316(+) A-I      intronic chr6:90545946(+) A-I      intronic chr6:90543865(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	CASP8AP2	chr6:90565242(+) A-I exon CDS    15342557 chr6:90569322(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90569393(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90569396(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90569494(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90569507(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90569549(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90569634(+) A-I intron -    15342557 chr6:90570317(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90570335(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90570382(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90570442(+) A-I intron -    15342557 chr6:90570459(+) A-I intron -    15342557 chr6:90570466(+) A-I intron -    15342557 chr6:90541167(+) A-G intron -    22484847 chr6:90541192(+) A-G intron -    22484847 chr6:90542629(+) G-A intron -    22484847 chr6:90543865(+) A-G intron -    22484847 chr6:90543986(+) A-G intron -    22484847 chr6:90544240(+) A-G intron -    22484847 chr6:90544312(+) A-G intron -    22484847 chr6:90544344(+) A-G intron -    22484847 chr6:90544409(+) A-G intron -    22484847 chr6:90544801(+) A-G intron -    22484847 chr6:90545063(+) A-G intron -    22484847 chr6:90545204(+) A-G intron -    22484847 chr6:90546069(+) A-G intron -    22484847 chr6:90547131(+) A-G intron -    22484847 chr6:90547301(+) T-C intron -    22484847 chr6:90549119(+) A-G intron -    22484847 chr6:90549142(+) A-G intron -    22484847 chr6:90549197(+) A-G intron -    22484847 chr6:90549281(+) A-G intron -    22484847 chr6:90549583(+) A-G intron -    22484847 chr6:90554775(+) A-G intron -    22484847 chr6:90554842(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555082(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555228(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555296(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555452(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555521(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555629(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555640(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555655(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555700(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555848(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555869(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555894(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555895(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555900(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555903(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555908(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555909(+) A-G intron -    22484847 chr6:90556058(+) A-G intron -    22484847 chr6:90556064(+) A-G intron -    22484847 chr6:90557548(+) A-G intron -    22484847 chr6:90558148(+) A-G intron -    22484847 chr6:90558798(+) A-G intron -    22484847 chr6:90558870(+) A-G intron -    22484847 chr6:90560307(+) A-G intron -    22484847 chr6:90562511(+) A-G intron -    22484847 chr6:90563398(+) A-G intron -    22484847 chr6:90563475(+) A-G intron -    22484847 chr6:90563520(+) A-G intron -    22484847 chr6:90564064(+) A-G intron -    22484847 chr6:90564305(+) A-G intron -    22484847 chr6:90567128(+) A-G intron -    22484847 chr6:90567145(+) A-G intron -    22484847 chr6:90567157(+) A-G intron -    22484847 chr6:90567699(+) A-G intron -    22484847 chr6:90569079(+) C-G intron -    22484847 chr6:90571254(+) A-G intron -    22484847 chr6:90574269(+) A-G intron -    22484847 chr6:90574339(+) A-G intron -    22484847 chr6:90574364(+) A-G intron -    22484847 chr6:90574627(+) A-G intron -    22484847 chr6:90574906(+) A-G intron -    22484847 chr6:90579195(+) A-G intron -    22484847 chr6:90580158(+) A-G intron -    22484847 chr6:90580184(+) A-G intron -    22484847 chr6:90580192(+) A-G intron -    22484847 chr6:90580228(+) A-G intron -    22484847 chr6:90581462(+) A-G intron -    22484847 chr6:90581522(+) A-G intron -    22484847 chr6:90581721(+) A-G intron -    22484847 chr6:90581726(+) A-G intron -    22484847 chr6:90581918(+) A-G intron -    22484847 chr6:90581919(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	CASP8AP2	chr6:90539624-90539625(+) m6A 5'UTR       24284625 chr6:90539685-90539686(+) m6A 5'UTR//exon//intron       - chr6:90566862-90566863(+) m6A CDS//exon       22608085 chr6:90566881-90566882(+) m6A CDS//exon       22608085 chr6:90570551-90570552(+) m6A intron       24981863//22608085 chr6:90571881-90571882(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90571890-90571891(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90571908-90571909(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90571956-90571957(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90572036-90572037(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90572087-90572088(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:90572180-90572181(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572202-90572203(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572221-90572222(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572249-90572250(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572285-90572286(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572312-90572313(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572319-90572320(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572403-90572404(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572434-90572435(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572453-90572454(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572462-90572463(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572512-90572513(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572540-90572541(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//27773535//22608085 chr6:90572560-90572561(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//27773535//22608085 chr6:90572686-90572687(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572698-90572699(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572743-90572744(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572751-90572752(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572761-90572762(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572825-90572826(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572832-90572833(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572855-90572856(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572912-90572913(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572925-90572926(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572937-90572938(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572946-90572947(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572966-90572967(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572975-90572976(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572982-90572983(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90573072-90573073(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573079-90573080(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573085-90573086(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573115-90573116(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573231-90573232(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573260-90573261(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573290-90573291(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573306-90573307(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573326-90573327(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573356-90573357(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573378-90573379(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573462-90573463(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573495-90573496(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573527-90573528(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573582-90573583(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573598-90573599(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573702-90573703(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//22608085 chr6:90573858-90573859(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr6:90573882-90573883(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr6:90573895-90573896(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr6:90573918-90573919(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr6:90573980-90573981(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr6:90574022-90574023(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//22575960//22608085 chr6:90575776-90575777(+) m6A CDS//exon//intron       22608085 chr6:90575838-90575839(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90575846-90575847(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90575910-90575911(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr6:90575953-90575954(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90575964-90575965(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90575985-90575986(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90576008-90576009(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90576036-90576037(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90576113-90576114(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085 chr6:90576117-90576118(+) Gm CDS//exon//intron       - chr6:90576149-90576150(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085 chr6:90576503-90576504(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90576513-90576514(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90576521-90576522(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90576562-90576563(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085 chr6:90576610-90576611(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085 chr6:90576667-90576668(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90576745-90576746(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr6:90576837-90576838(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr6:90576890-90576891(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr6:90576982-90576983(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90577026-90577027(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90577050-90577051(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90577679-90577680(+) m6A CDS//exon//intron       22608085 chr6:90577721-90577722(+) m6A CDS//exon//intron       22608085 chr6:90577745-90577746(+) m6A CDS//exon//intron       22608085 chr6:90577774-90577775(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085 chr6:90577807-90577808(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085 chr6:90577850-90577851(+) m6A CDS//exon//intron       22608085 chr6:90577869-90577870(+) m6A CDS//exon//intron       22608085 chr6:90577974-90577975(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578039-90578040(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578050-90578051(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578088-90578089(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:90578095-90578096(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:90578185-90578186(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90578290-90578291(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578356-90578357(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr6:90578385-90578386(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578490-90578491(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr6:90578521-90578522(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578552-90578553(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578565-90578566(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578589-90578590(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578597-90578598(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578796-90578797(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//22608085 chr6:90581062-90581063(+) m6A CDS//exon       22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-573	Exosome B cell lymphoma cell lines|EBV-transformed lymphoblastoid B cells     25242326 Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Cell lines(GBM46|GBM8|HaCaT|K562|MCF-10A|MCF-7|MGG75)|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocytes     -
	CASP8AP2	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Colon cancer cells     24393600 Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-573
Interactor2: CASP8AP2

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	None
Description	We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.