Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00057381

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-324-3p:           RBPJ:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-324-3p RBPJ
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0000762 3516
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - AOS3//CBF-1//CBF1//csl//IGKJRB//IGKJRB1//KBF2//RBP-J//RBP-J kappa//RBP-JK//RBPJK//RBPSUH//SUH

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-324-3p
rs1340228066 chr17:7223309    C/G
rs1347075046 chr17:7223308    C/A
rs377743856 chr17:7223321    G/A
rs747835655 chr17:7223319    T/A
rs747835655 chr17:7223319    T/C
rs781086398 chr17:7223310    A/C
rs1247285453 chr17:7223324    C/T
rs1421627841 chr17:7223326    G/GT
rs769542848 chr17:7223323    G/A
rs769542848 chr17:7223323    G/T
rs772900518 chr17:7223328    G/A

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR RBPJ
chr4:26335559(+) A-I      intronic
chr4:26339326(+) A-I      intronic
chr4:26339332(+) A-I      intronic
chr4:26339340(+) A-I      intronic
chr4:26340630(+) A-I      intronic
chr4:26380876(+) A-I      intronic
chr4:26380881(+) A-I      intronic
chr4:26380939(+) A-I      intronic
chr4:26339481(+) A-I      intronic
chr4:26380947(+) A-I      intronic
chr4:26381432(+) A-I      intronic
chr4:26360392(+) A-I      intronic
chr4:26360393(+) A-I      intronic
chr4:26339815(+) A-I      intronic
chr4:26368101(+) A-I      intronic
chr4:26368142(+) A-I      intronic
chr4:26368322(+) A-I      intronic
chr4:26368493(+) A-I      intronic
chr4:26368559(+) A-I      intronic
chr4:26380497(+) A-I      intronic
chr4:26395014(+) A-I      intronic
chr4:26400361(+) A-I      intronic
chr4:26409684(+) A-I      intronic
chr4:26368626(+) A-I      intronic
chr4:26368631(+) A-I      intronic
chr4:26368635(+) A-I      intronic
chr4:26368667(+) A-I      intronic
chr4:26368828(+) A-I      intronic
chr4:26369022(+) A-I      intronic
chr4:26339841(+) A-I      intronic
chr4:26339852(+) A-I      intronic
chr4:26339877(+) A-I      intronic
chr4:26339881(+) A-I      intronic
chr4:26339882(+) A-I      intronic
chr4:26339998(+) A-I      intronic
chr4:26369037(+) A-I      intronic
chr4:26409694(+) A-I      intronic
chr4:26340050(+) A-I      intronic
chr4:26411223(+) A-I      intronic
chr4:26340299(+) A-I      intronic
chr4:26340314(+) A-I      intronic
chr4:26340333(+) A-I      intronic
chr4:26341022(+) A-I      intronic
chr4:26341085(+) A-I      intronic
chr4:26341091(+) A-I      intronic
chr4:26341100(+) A-I      intronic
chr4:26341109(+) A-I      intronic
chr4:26341239(+) A-I      intronic
chr4:26329338(+) A-I      intronic
chr4:26341480(+) A-I      intronic
chr4:26341483(+) A-I      intronic
chr4:26341521(+) A-I      intronic
chr4:26341523(+) A-I      intronic
chr4:26341526(+) A-I      intronic
chr4:26342319(+) A-I      intronic
chr4:26412755(+) A-I      intronic
chr4:26412792(+) A-I      intronic
chr4:26413542(+) A-I      intronic
chr4:26342334(+) A-I      intronic
chr4:26343115(+) A-I      intronic
chr4:26348493(+) A-I      intronic
chr4:26348517(+) A-I      intronic
chr4:26348535(+) A-I      intronic
chr4:26349677(+) A-I      intronic
chr4:26349683(+) A-I      intronic
chr4:26349684(+) A-I      intronic
chr4:26340628(+) A-I      intronic
chr4:26340617(+) A-I      intronic
chr4:26340583(+) A-I      intronic
chr4:26355430(+) A-I      intronic
chr4:26413552(+) A-I      intronic
chr4:26330330(+) A-I      intronic
chr4:26330876(+) A-I      intronic
chr4:26330889(+) A-I      intronic
chr4:26331305(+) A-I      intronic
chr4:26331339(+) A-I      intronic
chr4:26331369(+) A-I      intronic
chr4:26331385(+) A-I      intronic
chr4:26331395(+) A-I      intronic
chr4:26414037(+) A-I      intronic
chr4:26414128(+) A-I      intronic
chr4:26349723(+) A-I      intronic
chr4:26349750(+) A-I      intronic
chr4:26349792(+) A-I      intronic
chr4:26349817(+) A-I      intronic
chr4:26350349(+) A-I      intronic
chr4:26331401(+) A-I      intronic
chr4:26350350(+) A-I      intronic
chr4:26350455(+) A-I      intronic
chr4:26350472(+) A-I      intronic
chr4:26357003(+) A-I      intronic
chr4:26350518(+) A-I      intronic
chr4:26360408(+) A-I      intronic
chr4:26360346(+) A-I      intronic
chr4:26369041(+) A-I      intronic
chr4:26369047(+) A-I      intronic
chr4:26376137(+) A-I      intronic
chr4:26376190(+) A-I      intronic
chr4:26353102(+) A-I      intronic
chr4:26355692(+) A-I      intronic
chr4:26355694(+) A-I      intronic
chr4:26355738(+) A-I      intronic
chr4:26355815(+) A-I      intronic
chr4:26356201(+) A-I      intronic
chr4:26356306(+) A-I      intronic
chr4:26376197(+) A-I      intronic
chr4:26343084(+) A-I      intronic
chr4:26343078(+) A-I      intronic
chr4:26376202(+) A-I      intronic
chr4:26357125(+) A-I      intronic
chr4:26357126(+) A-I      intronic
chr4:26360259(+) A-I      intronic
chr4:26360384(+) A-I      intronic
chr4:26360388(+) A-I      intronic
chr4:26376215(+) A-I      intronic
chr4:26376278(+) A-I      intronic
chr4:26331422(+) A-I      intronic
chr4:26376281(+) A-I      intronic
chr4:26343059(+) A-I      intronic
chr4:26343041(+) A-I      intronic
chr4:26341623(+) A-I      intronic
chr4:26341611(+) A-I      intronic
chr4:26380533(+) A-I      intronic
chr4:26380537(+) A-I      intronic
chr4:26380597(+) A-I      intronic
chr4:26380463(+) A-I      intronic
chr4:26380495(+) A-I      intronic
chr4:26380833(+) A-I      intronic
chr4:26380852(+) A-I      intronic
chr4:26331437(+) A-I      intronic
chr4:26332825(+) A-I      intronic
chr4:26332970(+) A-I      intronic
chr4:26332983(+) A-I      intronic
chr4:26334434(+) A-I      intronic
chr4:26334492(+) A-I      intronic
chr4:26334493(+) A-I      intronic
chr4:26334518(+) A-I      intronic
chr4:26334533(+) A-I      intronic
chr4:26334536(+) A-I      intronic
chr4:26335391(+) A-I      intronic
chr4:26335398(+) A-I      intronic
chr4:26335477(+) A-I      intronic
chr4:26335478(+) A-I      intronic
chr4:26335501(+) A-I      intronic
chr4:26342360(+) A-I      intronic
chr4:26355311(+) A-I      intronic
chr4:26338723(+) A-I      intronic
chr4:26338855(+) A-I      intronic
chr4:26397017(+) A-I      intronic
chr4:26341628(+) A-I      intronic
chr4:26384187(+) A-I      intronic
chr4:26337372(+) A-I      intronic
chr4:26357178(+) A-I      intronic
chr4:26330815(+) A-I      intronic
chr4:26341184(+) A-I      intronic
chr4:26348391(+) A-I      intronic
chr4:26368241(+) A-I      intronic
chr4:26335484(+) A-I      intronic
chr4:26414043(+) A-I      intronic
chr4:26380434(+) A-I      intronic
chr4:26343083(+) A-I      intronic
chr4:26350357(+) A-I      intronic
chr4:26390589(+) A-I      intronic
chr4:26357004(+) A-I      intronic
chr4:26343054(+) A-I      intronic
chr4:26338191(+) A-I      intronic
chr4:26392419(+) A-I      intronic
chr4:26330789(+) A-I      intronic
chr4:26389802(+) A-I      intronic
chr4:26356307(+) A-I      intronic
chr4:26343158(+) A-I      intronic
chr4:26385631(+) A-I      intronic
chr4:26350526(+) A-I      intronic
chr4:26376825(+) A-I      intronic
chr4:26376237(+) A-I      intronic
chr4:26340301(+) A-I      intronic
chr4:26334408(+) A-I      intronic
chr4:26332961(+) A-I      intronic
chr4:26362421(+) A-I      intronic
chr4:26362296(+) A-I      intronic
chr4:26380569(+) A-I      intronic
chr4:26368115(+) A-I      intronic
chr4:26380593(+) A-I      intronic
chr4:26338089(+) A-I      intronic
chr4:26385594(+) A-I      intronic
chr4:26349713(+) A-I      intronic
chr4:26349749(+) A-I      intronic
chr4:26376158(+) A-I      intronic
chr4:26364919(+) A-I      intronic
chr4:26341136(+) A-I      intronic
chr4:26332771(+) A-I      intronic
chr4:26338871(+) A-I      intronic
chr4:26338085(+) A-I      intronic
chr4:26354266(+) A-I      intronic
chr4:26376773(+) A-I      intronic
chr4:26342366(+) A-I      intronic
chr4:26368904(+) A-I      intronic
chr4:26332944(+) A-I      intronic
chr4:26342318(+) A-I      intronic
chr4:26362454(+) A-I      intronic
chr4:26350807(+) A-I      intronic
chr4:26409626(+) A-I      intronic
chr4:26330795(+) A-I      intronic
chr4:26385551(+) A-I      intronic
chr4:26395729(+) A-I      intronic
chr4:26381368(+) A-I      intronic
chr4:26357060(+) A-I      intronic
chr4:26354160(+) A-I      intronic
chr4:26380393(+) A-I      intronic
chr4:26326176(+) A-I      intronic
chr4:26412823(+) A-I      intronic
chr4:26342293(+) A-I      intronic
chr4:26330761(+) A-I      intronic
chr4:26354240(+) A-I      intronic
chr4:26339451(+) A-I      intronic
chr4:26376866(+) A-I      intronic
chr4:26362415(+) A-I      intronic
chr4:26368176(+) A-I      intronic
chr4:26337382(+) A-I      intronic
chr4:26350452(+) A-I      intronic
chr4:26341561(+) A-I      intronic
chr4:26414106(+) A-I      intronic
chr4:26334394(+) A-I      intronic
chr4:26357012(+) A-I      intronic
chr4:26396993(+) A-I      intronic
chr4:26381420(+) A-I      intronic
chr4:26340221(+) A-I      intronic
chr4:26337452(+) A-I      intronic
chr4:26381459(+) A-I      intronic
chr4:26416065(+) A-I      intronic
chr4:26376288(+) A-I      intronic
chr4:26376770(+) A-I      intronic
chr4:26343071(+) A-I      intronic
chr4:26368146(+) A-I      intronic
chr4:26349601(+) A-I      intronic
chr4:26338084(+) A-I      intronic
chr4:26341386(+) A-I      intronic
chr4:26329333(+) A-I      intronic
chr4:26364907(+) A-I      intronic
chr4:26348364(+) A-I      intronic
chr4:26368927(+) A-I      intronic
chr4:26330877(+) A-I      intronic
chr4:26360214(+) A-I      intronic
chr4:26376161(+) A-I      intronic
chr4:26350395(+) A-I      intronic
chr4:26380528(+) A-I      intronic
chr4:26350977(+) A-I      intronic
chr4:26330745(+) A-I      intronic
chr4:26335523(+) A-I      intronic
chr4:26385621(+) A-I      intronic
chr4:26369013(+) A-I      intronic
chr4:26412831(+) A-I      intronic
chr4:26338725(+) A-I      intronic
chr4:26334398(+) A-I      intronic
chr4:26338854(+) A-I      intronic
chr4:26369007(+) A-I      intronic
chr4:26376726(+) A-I      intronic
chr4:26337306(+) A-I      intronic
chr4:26345191(+) A-I      intronic
chr4:26380473(+) A-I      intronic
chr4:26381433(+) A-I      intronic
chr4:26338713(+) A-I      intronic
chr4:26341520(+) A-I      intronic
chr4:26330507(+) A-I      intronic
chr4:26335286(+) A-I      intronic
chr4:26331262(+) A-I      intronic
chr4:26330384(+) A-I      intronic
chr4:26380429(+) A-I      intronic
chr4:26376764(+) A-I      intronic
chr4:26350362(+) A-I      intronic
chr4:26368568(+) A-I      intronic
chr4:26350802(+) A-I      intronic
chr4:26350968(+) A-I      intronic
chr4:26368569(+) A-I      intronic
chr4:26368065(+) A-I      intronic
chr4:26341562(+) A-I      intronic
chr4:26411141(+) A-I      intronic
chr4:26343144(+) A-I      intronic
chr4:26341494(+) A-I      intronic
chr4:26330304(+) A-I      intronic
chr4:26357150(+) A-I      intronic
chr4:26376335(+) A-I      intronic
chr4:26392461(+) A-I      intronic
chr4:26413958(+) A-I      intronic
chr4:26338151(+) A-I      intronic
chr4:26341485(+) A-I      intronic
chr4:26341135(+) A-I      intronic
chr4:26341408(+) A-I      intronic
chr4:26381361(+) A-I      intronic
chr4:26341596(+) A-I      intronic
chr4:26330883(+) A-I      intronic
chr4:26332918(+) A-I      intronic
chr4:26376768(+) A-I      intronic
chr4:26329392(+) A-I      intronic
chr4:26368926(+) A-I      intronic
chr4:26376670(+) A-I      intronic
chr4:26385501(+) A-I      intronic
chr4:26368977(+) A-I      intronic
chr4:26329347(+) A-I      intronic
chr4:26330672(+) A-I      intronic
chr4:26326184(+) A-I      intronic
chr4:26413993(+) A-I      intronic
chr4:26353083(+) A-I      intronic
chr4:26380527(+) A-I      intronic
chr4:26340581(+) A-I      intronic
chr4:26368089(+) A-I      intronic
chr4:26341197(+) A-I      intronic
chr4:26376364(+) A-I      intronic
chr4:26338683(+) A-I      intronic
chr4:26335363(+) A-I      intronic
chr4:26343142(+) A-I      intronic
chr4:26376152(+) A-I      intronic
chr4:26413908(+) A-I      intronic
chr4:26350459(+) A-I      intronic
chr4:26356211(+) A-I      intronic
chr4:26334347(+) A-I      intronic
chr4:26356758(+) A-I      intronic
chr4:26414116(+) A-I      intronic
chr4:26360139(+) A-I      intronic
chr4:26385530(+) A-I      intronic
chr4:26380855(+) A-I      intronic
chr4:26411239(+) A-I      intronic
chr4:26330302(+) A-I      intronic
chr4:26380394(+) A-I      intronic
chr4:26338684(+) A-I      intronic
chr4:26330267(+) A-I      intronic
chr4:26334352(+) A-I      intronic
chr4:26395226(+) A-I      intronic
chr4:26341000(+) A-I      intronic
chr4:26339408(+) A-I      intronic
chr4:26348375(+) A-I      intronic
chr4:26329373(+) A-I      intronic
chr4:26386826(+) A-I      intronic
chr4:26343218(+) A-I      intronic
chr4:26343089(+) A-I      intronic
chr4:26350738(+) A-I      intronic
chr4:26348381(+) A-I      intronic
chr4:26376124(+) A-I      intronic
chr4:26384296(+) A-I      intronic
chr4:26332850(+) A-I      intronic
chr4:26381460(+) A-I      intronic
chr4:26348437(+) A-I      intronic
chr4:26380598(+) A-I      intronic
chr4:26412799(+) A-I      intronic
chr4:26350492(+) A-I      intronic
chr4:26411145(+) A-I      intronic
chr4:26413954(+) A-I      intronic
chr4:26350929(+) A-I      intronic
chr4:26368303(+) A-I      intronic
chr4:26330755(+) A-I      intronic
chr4:26353238(+) A-I      intronic
chr4:26341171(+) A-I      intronic
chr4:26342213(+) A-I      intronic
chr4:26360168(+) A-I      intronic
chr4:26339412(+) A-I      intronic
chr4:26413983(+) A-I      intronic
chr4:26385561(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED RBPJ
chr4:26330304(+) A-I intron -    22327324
chr4:26376670(+) A-I intron -    22327324
chr4:26330325(+) A-I intron -    21960545
chr4:26355275(+) A-I intron -    21960545
chr4:26381361(+) A-I intron -    21960545
chr4:26326176(+) A-G intron -    22484847
chr4:26326184(+) A-G intron -    22484847
chr4:26329333(+) A-G intron -    22484847
chr4:26329346(+) A-G intron -    22484847
chr4:26329347(+) A-G intron -    22484847
chr4:26329373(+) A-G intron -    22484847
chr4:26330267(+) A-G intron -    22484847
chr4:26330302(+) A-G intron -    22484847
chr4:26330304(+) A-G intron -    22484847
chr4:26330325(+) A-G intron -    22484847
chr4:26330351(+) A-G intron -    22484847
chr4:26330384(+) A-G intron -    22484847
chr4:26330507(+) A-G intron -    22484847
chr4:26330672(+) A-G intron -    22484847
chr4:26330755(+) A-G intron -    22484847
chr4:26330815(+) A-G intron -    22484847
chr4:26330883(+) A-G intron -    22484847
chr4:26331262(+) A-G intron -    22484847
chr4:26331353(+) A-G intron -    22484847
chr4:26332824(+) A-G intron -    22484847
chr4:26332850(+) A-G intron -    22484847
chr4:26332860(+) A-G intron -    22484847
chr4:26332929(+) A-G intron -    22484847
chr4:26332944(+) A-G intron -    22484847
chr4:26332961(+) A-G intron -    22484847
chr4:26334394(+) A-G intron -    22484847
chr4:26334491(+) A-G intron -    22484847
chr4:26335286(+) A-G intron -    22484847
chr4:26336987(+) A-G intron -    22484847
chr4:26337303(+) A-G intron -    22484847
chr4:26337306(+) A-G intron -    22484847
chr4:26337372(+) A-G intron -    22484847
chr4:26337382(+) A-G intron -    22484847
chr4:26337430(+) A-G intron -    22484847
chr4:26337435(+) T-C intron -    22484847
chr4:26337452(+) A-G intron -    22484847
chr4:26338089(+) A-G intron -    22484847
chr4:26338191(+) A-G intron -    22484847
chr4:26338192(+) A-G intron -    22484847
chr4:26338683(+) A-G intron -    22484847
chr4:26338684(+) A-G intron -    22484847
chr4:26338713(+) A-G intron -    22484847
chr4:26338723(+) A-G intron -    22484847
chr4:26338725(+) A-G intron -    22484847
chr4:26338854(+) A-G intron -    22484847
chr4:26339372(+) A-G intron -    22484847
chr4:26339388(+) A-G intron -    22484847
chr4:26339408(+) A-G intron -    22484847
chr4:26339842(+) A-G intron -    22484847
chr4:26339961(+) A-G intron -    22484847
chr4:26340221(+) A-G intron -    22484847
chr4:26340242(+) A-G intron -    22484847
chr4:26340336(+) A-G intron -    22484847
chr4:26340581(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341080(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341094(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341105(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341135(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341136(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341171(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341197(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341267(+) G-A intron -    22484847
chr4:26341386(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341403(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341408(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341494(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341562(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341570(+) T-G intron -    22484847
chr4:26341628(+) A-G intron -    22484847
chr4:26341629(+) A-G intron -    22484847
chr4:26342213(+) A-G intron -    22484847
chr4:26342226(+) A-G intron -    22484847
chr4:26342293(+) A-G intron -    22484847
chr4:26342318(+) A-G intron -    22484847
chr4:26342360(+) A-G intron -    22484847
chr4:26342361(+) A-G intron -    22484847
chr4:26342366(+) A-G intron -    22484847
chr4:26343004(+) A-G intron -    22484847
chr4:26343054(+) A-G intron -    22484847
chr4:26343116(+) A-G intron -    22484847
chr4:26343144(+) A-G intron -    22484847
chr4:26343218(+) A-G intron -    22484847
chr4:26345482(+) G-C intron -    22484847
chr4:26348358(+) A-G intron -    22484847
chr4:26348437(+) A-G intron -    22484847
chr4:26349601(+) A-G intron -    22484847
chr4:26349713(+) A-G intron -    22484847
chr4:26349749(+) A-G intron -    22484847
chr4:26349757(+) A-G intron -    22484847
chr4:26350357(+) A-G intron -    22484847
chr4:26350362(+) A-G intron -    22484847
chr4:26350426(+) A-G intron -    22484847
chr4:26350452(+) A-G intron -    22484847
chr4:26350491(+) G-A intron -    22484847
chr4:26350492(+) A-G intron -    22484847
chr4:26350819(+) A-G intron -    22484847
chr4:26350929(+) A-G intron -    22484847
chr4:26350941(+) A-G intron -    22484847
chr4:26353238(+) A-G intron -    22484847
chr4:26354160(+) A-G intron -    22484847
chr4:26354187(+) C-T intron -    22484847
chr4:26354240(+) A-G intron -    22484847
chr4:26354266(+) A-G intron -    22484847
chr4:26355275(+) A-G intron -    22484847
chr4:26355285(+) T-C intron -    22484847
chr4:26355311(+) A-G intron -    22484847
chr4:26356133(+) A-G intron -    22484847
chr4:26356211(+) A-G intron -    22484847
chr4:26356307(+) A-G intron -    22484847
chr4:26356308(+) A-G intron -    22484847
chr4:26356334(+) A-G intron -    22484847
chr4:26356758(+) A-G intron -    22484847
chr4:26357004(+) A-G intron -    22484847
chr4:26357178(+) A-G intron -    22484847
chr4:26360139(+) A-G intron -    22484847
chr4:26366247(+) C-T intron -    22484847
chr4:26366264(+) C-T intron -    22484847
chr4:26368065(+) A-G intron -    22484847
chr4:26368089(+) A-G intron -    22484847
chr4:26368099(+) A-G intron -    22484847
chr4:26368110(+) A-G intron -    22484847
chr4:26368115(+) A-G intron -    22484847
chr4:26368146(+) A-G intron -    22484847
chr4:26368147(+) A-G intron -    22484847
chr4:26368176(+) A-G intron -    22484847
chr4:26368249(+) A-G intron -    22484847
chr4:26368568(+) A-G intron -    22484847
chr4:26368569(+) A-G intron -    22484847
chr4:26368570(+) A-G intron -    22484847
chr4:26368927(+) A-G intron -    22484847
chr4:26369013(+) A-G intron -    22484847
chr4:26376101(+) C-T intron -    22484847
chr4:26376124(+) A-G intron -    22484847
chr4:26376152(+) A-G intron -    22484847
chr4:26376158(+) A-G intron -    22484847
chr4:26376161(+) A-G intron -    22484847
chr4:26376237(+) A-G intron -    22484847
chr4:26376288(+) A-G intron -    22484847
chr4:26376335(+) A-G intron -    22484847
chr4:26376670(+) A-G intron -    22484847
chr4:26376675(+) A-G intron -    22484847
chr4:26376773(+) A-G intron -    22484847
chr4:26376774(+) A-G intron -    22484847
chr4:26376779(+) A-G intron -    22484847
chr4:26376866(+) A-G intron -    22484847
chr4:26380393(+) A-G intron -    22484847
chr4:26380394(+) A-G intron -    22484847
chr4:26380429(+) A-G intron -    22484847
chr4:26380434(+) A-G intron -    22484847
chr4:26380501(+) A-G intron -    22484847
chr4:26380527(+) A-G intron -    22484847
chr4:26380528(+) A-G intron -    22484847
chr4:26380569(+) A-G intron -    22484847
chr4:26380598(+) A-G intron -    22484847
chr4:26380855(+) A-G intron -    22484847
chr4:26380871(+) A-G intron -    22484847
chr4:26380948(+) A-G intron -    22484847
chr4:26380955(+) A-G intron -    22484847
chr4:26381361(+) A-G intron -    22484847
chr4:26381433(+) A-G intron -    22484847
chr4:26381459(+) A-G intron -    22484847
chr4:26381460(+) A-G intron -    22484847
chr4:26384187(+) A-G intron -    22484847
chr4:26385551(+) A-G intron -    22484847
chr4:26385594(+) A-G intron -    22484847
chr4:26385621(+) A-G intron -    22484847
chr4:26389802(+) A-G intron -    22484847
chr4:26389816(+) A-G intron -    22484847
chr4:26392419(+) A-G intron -    22484847
chr4:26392461(+) A-G intron -    22484847
chr4:26395226(+) A-G intron -    22484847
chr4:26411141(+) A-G intron -    22484847
chr4:26411145(+) A-G intron -    22484847
chr4:26411239(+) A-G intron -    22484847
chr4:26412831(+) A-G intron -    22484847
chr4:26413954(+) A-G intron -    22484847
chr4:26413958(+) A-G intron -    22484847
chr4:26413983(+) A-G intron -    22484847
chr4:26413993(+) A-G intron -    22484847
chr4:26414106(+) A-G intron -    22484847
chr4:26414116(+) A-G intron -    22484847
chr4:26423087(+) G-A intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase RBPJ
chr4:26274375-26274376(+) m6A CDS//intron       25456834
chr4:26321317-26321318(+) m6A 5'UTR//intron       25456834
chr4:26321322-26321323(+) m6A 5'UTR//intron       25456834
chr4:26322239-26322240(+) m6A 5'UTR//intron       25456834//27371828
chr4:26322354-26322355(+) m6A 5'UTR//exon//intron       25456834//24981863//27371828
chr4:26322382-26322383(+) m6A CDS//exon//intron       25456834//24981863//27371828
chr4:26322588-26322589(+) m6A 5'UTR//intron       25456834//24981863
chr4:26432345-26432346(+) m6A CDS//exon       -
chr4:26432466-26432467(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr4:26432546-26432547(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085
chr4:26432552-26432553(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085
chr4:26432648-26432649(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr4:26432654-26432655(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr4:26432701-26432702(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr4:26432727-26432728(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr4:26432757-26432758(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr4:26432964-26432965(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr4:26432976-26432977(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr4:26433002-26433003(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr4:26433469-26433470(+) Y 3'UTR       25219674
chr4:26436486-26436487(+) m6A 3'UTR       27773535
chr4:26436533-26436534(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-324-3p
Cytoplasm Breast adenocarcinoma cells (MCF-7)|Cervical adenocarcinoma cells (HeLa)     24918059
Exosome Primary ovarian tumor cells|Serum     18589210
Exosome Primary dendritic cells|T cell line (J77)     21505438
Exosome Plasma     23663360
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Seminal plasma     23539611
Microvesicle Colon cancer cell line (LIM1863)|Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
Mitochondrion Myotube     27396686
Mitochondrion Skeletal muscle cells     27563705
Mitochondrion Skeletal muscle myoblasts     21637849
Nucleolus Cervical adenocarcinoma cells (HeLa)     24918059
Nucleus Breast adenocarcinoma cells (MCF-7)|Cervical adenocarcinoma cells (HeLa)     24918059
RBPJ
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)     -
Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Related Drug Information:


Resource Symbol Drug Name PubChem
ID
Function Link  
RNAInter hsa-miR-324-3p
Oxaliplatine 6857599 Drug interaction    RC00004444
Sunitinib 5329102 Drug interaction    RC00004443
5-Fluorouracil 3385 Drug interaction    RC00004442
Leucovorin 135403648 Drug interaction    RC00004445
Resource Symbol Drug Name PubChem ID
RNAactDrug hsa-miR-324-3p
Tanespimycin       6505803
l-685,458       5479543
Palbociclib       5330286
Paclitaxel       36314
5-Chloro-N4-(2-(isopropylsulfonyl)phenyl)-N2-(2-methoxy-4-(4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl)phenyl)pyrimidine-2,4-diamine       16038120
Crizotinib       11626560

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-324-3p
Interactor2: RBPJ

Evidence Support:


Weak-Evidence PAR-CLIP
Support Database ViRBase

References:


PMID 22291592 Target region 3'UTR
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells Interactor2 expression None
Description We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.

Starting a new search, please wait ...