Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-30e-3p | ALS2 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000693 | 57679 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | ALS2CR6//ALSJ//IAHSP//PLSJ |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||||||||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-30e-3p |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | ALS2 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | ALS2 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | ALS2 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-30e-3p |
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ALS2 |
Interactor1: hsa-miR-30e-3p | Interactor2: ALS2 |
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Weak-Evidence | PAR-CLIP | |
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Support Database | ViRBase |
PMID | 22291592 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells | Interactor2 expression | None |
Description | We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs. |