Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
---|---|---|
Symbol | hsa-miR-32-5p | TENT5A |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000090 | 55603 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | C6orf37//FAM46A//OI18//XTP11 |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
miRNASNP-v3 | hsa-miR-32-5p |
|
Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RNALocate | hsa-miR-32-5p |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
TENT5A |
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ncDR | hsa-miR-32-5p |
|
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RNAInter | hsa-miR-32-5p |
|
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID |
---|---|---|---|---|
NoncoRNA | hsa-miR-32-5p |
Interactor1: hsa-miR-32-5p | Interactor2: TENT5A |
---|
Weak-Evidence | HITS-CLIP | |
---|---|---|
Support Database | ViRBase |
PMID | 22473208 | Target region | None |
---|---|---|---|
Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | Jijoye cells | Interactor2 expression | None |
Description | Our HITS-CLIP data yield 1185 human 3'UTRs targeted by members of the miR-17~92 cluster in Jijoye cells. Comparison to the 1664 3'UTRs targeted by EBV miRNAs reveals 740 shared genes (44% of EBV targets and 62% of miR-17~92 targets; Figure 6B and Supplementary Table 7). Thus, EBV miRNAs co-target a majority of miR-17~92 regulated mRNAs, which are assigned to a variety of pathways, most notably regulating transcription, apoptosis, and the cell cycle (Figure 6C). Similarly, other abundant immunologically relevant miRNAs, 142-3p and miR-155, co-target with EBV miRNAs a large fraction of their Ago-bound 3'UTRs, representing ~60% of the targets for each of these host miRNAs (Supplementary Figure 5). |