Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | LINC00672 | TARDBP |
miRBase Accession/Entrez ID |
100505576 | 23435 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | lncRNA | mRNA |
Alias | - | ALS10//TDP-43 |
Resource | Symbol | Editing Position | ||
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Lncediting | LINC00672 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | TARDBP |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | TARDBP |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | LINC00672 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TARDBP |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||
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RNALocate | LINC00672 |
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TARDBP |
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | ||||||||||
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RNAactDrug | LINC00672 |
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Interactor1: LINC00672 | Interactor2: TARDBP |
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Weak-Evidence | RNA-Seq | |
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Prediction-Evidence | DIANA | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 31199512 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | 293 cells//C2089 cells//C22 cells | Interactor2 expression | None |
Description | Figure 5 Target genes of the EBV-related lncRNAs. Online software program search results demonstrated that four lncRNAs target two common genes, FUS and U2AF65; three lncRNAs commonly target UPF1; and five lncRNAs target one common gene, eIF4AIII, as indicated in the red boxes. Interactions were also predicted between lncRNAs and miRNAs. |