Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | MALAT1 | hsa-miR-146a-5p |
miRBase Accession/Entrez ID |
378938 | MIMAT0000449 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | lncRNA | miRNA |
Alias | HCN//LINC00047//NCRNA00047//NEAT2//PRO2853 | - |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-146a-5p |
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Resource | Symbol | Editing Position | |||
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Lncediting | MALAT1 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||
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RADAR | MALAT1 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | MALAT1 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | MALAT1 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | MALAT1 |
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hsa-miR-146a-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ncDR | hsa-miR-146a-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNAInter | MALAT1 |
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hsa-miR-146a-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID | ||||||||||||
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NoncoRNA | hsa-miR-146a-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNAactDrug | MALAT1 |
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Interactor1: MALAT1 | Interactor2: hsa-miR-146a-5p |
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Weak-Evidence | RNA-Seq | |
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Prediction-Evidence | DIANA | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 31199512 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | 293 cells//C2089 cells//C22 cells | Interactor2 expression | None |
Description | Figure 5 Target genes of the EBV-related lncRNAs. Online software program search results demonstrated that four lncRNAs target two common genes, FUS and U2AF65; three lncRNAs commonly target UPF1; and five lncRNAs target one common gene, eIF4AIII, as indicated in the red boxes. Interactions were also predicted between lncRNAs and miRNAs. |