Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | BCYRN1 | hsa-miR-20b-5p |
miRBase Accession/Entrez ID |
618 | MIMAT0001413 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | lncRNA | miRNA |
Alias | BC200//BC200a//LINC00004//NCRNA00004 | - |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-20b-5p |
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Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | PMID |
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LincSNP 3.0 | BCYRN1 |
Resource | Symbol | Editing Position | ||||||
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Lncediting | BCYRN1 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | BCYRN1 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | BCYRN1 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | BCYRN1 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | BCYRN1 |
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hsa-miR-20b-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ncDR | hsa-miR-20b-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNAInter | hsa-miR-20b-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNAactDrug | BCYRN1 |
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Interactor1: BCYRN1 | Interactor2: hsa-miR-20b-5p |
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Weak-Evidence | RNA-Seq | |
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Prediction-Evidence | DIANA | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 31199512 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | 293 cells//C2089 cells//C22 cells | Interactor2 expression | None |
Description | Figure 5 Target genes of the EBV-related lncRNAs. Online software program search results demonstrated that four lncRNAs target two common genes, FUS and U2AF65; three lncRNAs commonly target UPF1; and five lncRNAs target one common gene, eIF4AIII, as indicated in the red boxes. Interactions were also predicted between lncRNAs and miRNAs. |