Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-548ah-3p | HDAC4 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0020957 | 9759 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | AHO3//BDMR//HA6116//HD4//HDAC-4//HDAC-A//HDACA |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-548ah-3p |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | HDAC4 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | HDAC4 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | HDAC4 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||
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RNALocate | hsa-miR-548ah-3p |
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HDAC4 |
Interactor1: hsa-miR-548ah-3p | Interactor2: HDAC4 |
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Strong-Evidence | ChIP//Dual luciferase reporter assay//qPCR//Western blot | |
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Prediction-Evidence | miRanda//miRDB//Targetscan | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 30615846 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | Upregulation |
Tissue or cell line | HepG2 cells//HepG2.2.15 cells//Huh-7 cells | Interactor2 expression | None |
Description | We identified three binding sites of miRNA-548ah in the HDAC4 gene sequence (Supplemental Fig. 3). |