Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00026258

  Virus:  

Hantaan orthohantavirus (Hantaan virus 76-118)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.6040

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-1343-3p:           EIF2AK2:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-1343-3p EIF2AK2
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0019776 5610
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - EIF2AK1//LEUDEN//PKR//PPP1R83//PRKR

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-1343-3p
rs1030024806 chr11:34941897    C/T
rs1228966720 chr11:34941904    T/G
rs1335261302 chr11:34941900    G/A
rs568333985 chr11:34941898    C/G
rs748356067 chr11:34941908    G/A
rs950497159 chr11:34941907    C/T

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR EIF2AK2
chr2:37355129(-) A-I      intronic
chr2:37355122(-) A-I      intronic
chr2:37355109(-) A-I      intronic
chr2:37355088(-) A-I      intronic
chr2:37343200(-) A-I      intronic
chr2:37343204(-) A-I      intronic
chr2:37355079(-) A-I      intronic
chr2:37355064(-) A-I      intronic
chr2:37355060(-) A-I      intronic
chr2:37327631(-) A-I      3'UTR
chr2:37327650(-) A-I      3'UTR
chr2:37327651(-) A-I      3'UTR
chr2:37327653(-) A-I      3'UTR
chr2:37327659(-) A-I      3'UTR
chr2:37327660(-) A-I      3'UTR
chr2:37327668(-) A-I      3'UTR
chr2:37327675(-) A-I      3'UTR
chr2:37327676(-) A-I      3'UTR
chr2:37346777(-) A-I      intronic
chr2:37346802(-) A-I      intronic
chr2:37346803(-) A-I      intronic
chr2:37327698(-) A-I      3'UTR
chr2:37346948(-) A-I      intronic
chr2:37327630(-) A-I      3'UTR
chr2:37327624(-) A-I      3'UTR
chr2:37327615(-) A-I      3'UTR
chr2:37328000(-) A-I      3'UTR
chr2:37328005(-) A-I      3'UTR
chr2:37328058(-) A-I      3'UTR
chr2:37328067(-) A-I      3'UTR
chr2:37327979(-) A-I      3'UTR
chr2:37328076(-) A-I      3'UTR
chr2:37328081(-) A-I      3'UTR
chr2:37327613(-) A-I      3'UTR
chr2:37329191(-) A-I      3'UTR
chr2:37332281(-) A-I      3'UTR
chr2:37328140(-) A-I      3'UTR
chr2:37380781(-) A-I      intronic
chr2:37329253(-) A-I      3'UTR
chr2:37343224(-) A-I      intronic
chr2:37380807(-) A-I      intronic
chr2:37329336(-) A-I      3'UTR
chr2:37329345(-) A-I      3'UTR
chr2:37346811(-) A-I      intronic
chr2:37330630(-) A-I      3'UTR
chr2:37327642(-) A-I      3'UTR
chr2:37331174(-) A-I      3'UTR
chr2:37331226(-) A-I      3'UTR
chr2:37331460(-) A-I      3'UTR
chr2:37331464(-) A-I      3'UTR
chr2:37331520(-) A-I      3'UTR
chr2:37331539(-) A-I      3'UTR
chr2:37327635(-) A-I      3'UTR
chr2:37331632(-) A-I      3'UTR
chr2:37331658(-) A-I      3'UTR
chr2:37343178(-) A-I      intronic
chr2:37343199(-) A-I      intronic
chr2:37381832(-) A-I      intronic
chr2:37382940(-) A-I      intronic
chr2:37382918(-) A-I      intronic
chr2:37380546(-) A-I      intronic
chr2:37380544(-) A-I      intronic
chr2:37380517(-) A-I      intronic
chr2:37379521(-) A-I      intronic
chr2:37379492(-) A-I      intronic
chr2:37355152(-) A-I      intronic
chr2:37335959(-) A-I      intronic
chr2:37335964(-) A-I      intronic
chr2:37355179(-) A-I      intronic
chr2:37346951(-) A-I      intronic
chr2:37347008(-) A-I      intronic
chr2:37350582(-) A-I      intronic
chr2:37355052(-) A-I      intronic
chr2:37370115(-) A-I      intronic
chr2:37369471(-) A-I      intronic
chr2:37365166(-) A-I      intronic
chr2:37365153(-) A-I      intronic
chr2:37364623(-) A-I      intronic
chr2:37359570(-) A-I      intronic
chr2:37359550(-) A-I      intronic
chr2:37357423(-) A-I      intronic
chr2:37382939(-) A-I      intronic
chr2:37355112(-) A-I      intronic
chr2:37355103(-) A-I      intronic
chr2:37355098(-) A-I      intronic
chr2:37355078(-) A-I      intronic
chr2:37355073(-) A-I      intronic
chr2:37354087(-) A-I      intronic
chr2:37354017(-) A-I      intronic
chr2:37350593(-) A-I      intronic
chr2:37350591(-) A-I      intronic
chr2:37350584(-) A-I      intronic
chr2:37350538(-) A-I      intronic
chr2:37350529(-) A-I      intronic
chr2:37350228(-) A-I      intronic
chr2:37350202(-) A-I      intronic
chr2:37350081(-) A-I      intronic
chr2:37345466(-) A-I      intronic
chr2:37344666(-) A-I      intronic
chr2:37344463(-) A-I      intronic
chr2:37343128(-) A-I      intronic
chr2:37335950(-) A-I      intronic
chr2:37335851(-) A-I      intronic
chr2:37335785(-) A-I      intronic
chr2:37335748(-) A-I      intronic
chr2:37381841(-) A-I      intronic
chr2:37383021(-) A-I      intronic
chr2:37381842(-) A-I      intronic
chr2:37335284(-) A-I      intronic
chr2:37381815(-) A-I      intronic
chr2:37381405(-) A-I      intronic
chr2:37379548(-) A-I      intronic
chr2:37379536(-) A-I      intronic
chr2:37379501(-) A-I      intronic
chr2:37379460(-) A-I      intronic
chr2:37381868(-) A-I      intronic
chr2:37373169(-) A-I      intronic
chr2:37373060(-) A-I      intronic
chr2:37373033(-) A-I      intronic
chr2:37373028(-) A-I      intronic
chr2:37371943(-) A-I      intronic
chr2:37371898(-) A-I      intronic
chr2:37371757(-) A-I      intronic
chr2:37370908(-) A-I      intronic
chr2:37370887(-) A-I      intronic
chr2:37370810(-) A-I      intronic
chr2:37370792(-) A-I      intronic
chr2:37382921(-) A-I      intronic
chr2:37381908(-) A-I      intronic
chr2:37382927(-) A-I      intronic
chr2:37370782(-) A-I      intronic
chr2:37370754(-) A-I      intronic
chr2:37335213(-) A-I      intronic
chr2:37335206(-) A-I      intronic
chr2:37370255(-) A-I      intronic
chr2:37370224(-) A-I      intronic
chr2:37370146(-) A-I      intronic
chr2:37370127(-) A-I      intronic
chr2:37382944(-) A-I      intronic
chr2:37331635(-) A-I      3'UTR
chr2:37331638(-) A-I      3'UTR
chr2:37331667(-) A-I      3'UTR
chr2:37331028(-) A-I      3'UTR
chr2:37331679(-) A-I      3'UTR
chr2:37331114(-) A-I      3'UTR
chr2:37331712(-) A-I      3'UTR
chr2:37331731(-) A-I      3'UTR
chr2:37331164(-) A-I      3'UTR
chr2:37331196(-) A-I      3'UTR
chr2:37331245(-) A-I      3'UTR
chr2:37331257(-) A-I      3'UTR
chr2:37331279(-) A-I      3'UTR
chr2:37331528(-) A-I      3'UTR
chr2:37331552(-) A-I      3'UTR
chr2:37331619(-) A-I      3'UTR
chr2:37331630(-) A-I      3'UTR
chr2:37331631(-) A-I      3'UTR
chr2:37329357(-) A-I      3'UTR
chr2:37329163(-) A-I      3'UTR
chr2:37329226(-) A-I      3'UTR
chr2:37329239(-) A-I      3'UTR
chr2:37329333(-) A-I      3'UTR
chr2:37330415(-) A-I      3'UTR
chr2:37329381(-) A-I      3'UTR
chr2:37329383(-) A-I      3'UTR
chr2:37330342(-) A-I      3'UTR
chr2:37330367(-) A-I      3'UTR
chr2:37330411(-) A-I      3'UTR
chr2:37330447(-) A-I      3'UTR
chr2:37330460(-) A-I      3'UTR
chr2:37330527(-) A-I      3'UTR
chr2:37330532(-) A-I      3'UTR
chr2:37330533(-) A-I      3'UTR
chr2:37330571(-) A-I      3'UTR
chr2:37383001(-) A-I      intronic
chr2:37335944(-) A-I      intronic
chr2:37373007(-) A-I      intronic
chr2:37381385(-) A-I      intronic
chr2:37382976(-) A-I      intronic
chr2:37359726(-) A-I      intronic
chr2:37350264(-) A-I      intronic
chr2:37335837(-) A-I      intronic
chr2:37383069(-) A-I      intronic
chr2:37379602(-) A-I      intronic
chr2:37350607(-) A-I      intronic
chr2:37344558(-) A-I      intronic
chr2:37381898(-) A-I      intronic
chr2:37351420(-) A-I      intronic
chr2:37362999(-) A-I      intronic
chr2:37371848(-) A-I      intronic
chr2:37354991(-) A-I      intronic
chr2:37353895(-) A-I      intronic
chr2:37364725(-) A-I      intronic
chr2:37365981(-) A-I      intronic
chr2:37365071(-) A-I      intronic
chr2:37371840(-) A-I      intronic
chr2:37335126(-) A-I      intronic
chr2:37346745(-) A-I      intronic
chr2:37351239(-) A-I      intronic
chr2:37366060(-) A-I      intronic
chr2:37338746(-) A-I      intronic
chr2:37335067(-) A-I      intronic
chr2:37380567(-) A-I      intronic
chr2:37383077(-) A-I      intronic
chr2:37364651(-) A-I      intronic
chr2:37353943(-) A-I      intronic
chr2:37379531(-) A-I      intronic
chr2:37359490(-) A-I      intronic
chr2:37355049(-) A-I      intronic
chr2:37370204(-) A-I      intronic
chr2:37331171(-) A-I      3'UTR
chr2:37331107(-) A-I      3'UTR
chr2:37330476(-) A-I      3'UTR
chr2:37330373(-) A-I      3'UTR
chr2:37331565(-) A-I      3'UTR
chr2:37331531(-) A-I      3'UTR
chr2:37331037(-) A-I      3'UTR
chr2:37330534(-) A-I      3'UTR
chr2:37334102(-) A-I      3'UTR
chr2:37331662(-) A-I      3'UTR
chr2:37329320(-) A-I      3'UTR
chr2:37331510(-) A-I      3'UTR
chr2:37331135(-) A-I      3'UTR
chr2:37331236(-) A-I      3'UTR
chr2:37329180(-) A-I      3'UTR
chr2:37329228(-) A-I      3'UTR
chr2:37330620(-) A-I      3'UTR
chr2:37331641(-) A-I      3'UTR
chr2:37329314(-) A-I      3'UTR
chr2:37331515(-) A-I      3'UTR
chr2:37330606(-) A-I      3'UTR
chr2:37331019(-) A-I      3'UTR
chr2:37330404(-) A-I      3'UTR
chr2:37331220(-) A-I      3'UTR
chr2:37329377(-) A-I      3'UTR
chr2:37331207(-) A-I      3'UTR
chr2:37331038(-) A-I      3'UTR
chr2:37331595(-) A-I      3'UTR
chr2:37331711(-) A-I      3'UTR
chr2:37331642(-) A-I      3'UTR
chr2:37331269(-) A-I      3'UTR
chr2:37329248(-) A-I      3'UTR
chr2:37330514(-) A-I      3'UTR
chr2:37331102(-) A-I      3'UTR
chr2:37329350(-) A-I      3'UTR
chr2:37330540(-) A-I      3'UTR
chr2:37331560(-) A-I      3'UTR
chr2:37331145(-) A-I      3'UTR
chr2:37329307(-) A-I      3'UTR
chr2:37331627(-) A-I      3'UTR
chr2:37329213(-) A-I      3'UTR
chr2:37334181(-) A-I      3'UTR
chr2:37330406(-) A-I      3'UTR
chr2:37331277(-) A-I      3'UTR
chr2:37330467(-) A-I      3'UTR
chr2:37331089(-) A-I      3'UTR
chr2:37330516(-) A-I      3'UTR
chr2:37331525(-) A-I      3'UTR
chr2:37330518(-) A-I      3'UTR
chr2:37331119(-) A-I      3'UTR
chr2:37330366(-) A-I      3'UTR
chr2:37330611(-) A-I      3'UTR
chr2:37331221(-) A-I      3'UTR
chr2:37334020(-) A-I      3'UTR
chr2:37329300(-) A-I      3'UTR
chr2:37329243(-) A-I      3'UTR
chr2:37330507(-) A-I      3'UTR
chr2:37329296(-) A-I      3'UTR
chr2:37334139(-) A-I      3'UTR
chr2:37331239(-) A-I      3'UTR
chr2:37329261(-) A-I      3'UTR
chr2:37331681(-) A-I      3'UTR
chr2:37331023(-) A-I      3'UTR
chr2:37329211(-) A-I      3'UTR
chr2:37330506(-) A-I      3'UTR
chr2:37331614(-) A-I      3'UTR
chr2:37329214(-) A-I      3'UTR
chr2:37331281(-) A-I      3'UTR
chr2:37331159(-) A-I      3'UTR
chr2:37329273(-) A-I      3'UTR
chr2:37330566(-) A-I      3'UTR
chr2:37330587(-) A-I      3'UTR
chr2:37329283(-) A-I      3'UTR
chr2:37331568(-) A-I      3'UTR
chr2:37331666(-) A-I      3'UTR
chr2:37329179(-) A-I      3'UTR
chr2:37330344(-) A-I      3'UTR
chr2:37330450(-) A-I      3'UTR
chr2:37329331(-) A-I      3'UTR
chr2:37330576(-) A-I      3'UTR
chr2:37330614(-) A-I      3'UTR
chr2:37331093(-) A-I      3'UTR
chr2:37330517(-) A-I      3'UTR
chr2:37331640(-) A-I      3'UTR
chr2:37331535(-) A-I      3'UTR
chr2:37331025(-) A-I      3'UTR
chr2:37330368(-) A-I      3'UTR
chr2:37330371(-) A-I      3'UTR
chr2:37330445(-) A-I      3'UTR
chr2:37330391(-) A-I      3'UTR
chr2:37329313(-) A-I      3'UTR
chr2:37331030(-) A-I      3'UTR
chr2:37330521(-) A-I      3'UTR
chr2:37330503(-) A-I      3'UTR
chr2:37331250(-) A-I      3'UTR
chr2:37331639(-) A-I      3'UTR
chr2:37331728(-) A-I      3'UTR
chr2:37329347(-) A-I      3'UTR
chr2:37331651(-) A-I      3'UTR
chr2:37330345(-) A-I      3'UTR
chr2:37330435(-) A-I      3'UTR
chr2:37331745(-) A-I      3'UTR
chr2:37330386(-) A-I      3'UTR
chr2:37330612(-) A-I      3'UTR
chr2:37331746(-) A-I      3'UTR
chr2:37331643(-) A-I      3'UTR
chr2:37331065(-) A-I      3'UTR
chr2:37329235(-) A-I      3'UTR
chr2:37329227(-) A-I      3'UTR
chr2:37334058(-) A-I      3'UTR
chr2:37329234(-) A-I      3'UTR
chr2:37334146(-) A-I      3'UTR
chr2:37331016(-) A-I      3'UTR
chr2:37330515(-) A-I      3'UTR
chr2:37379606(-) A-I      intronic
chr2:37371002(-) A-I      intronic
chr2:37345374(-) A-I      intronic
chr2:37371888(-) A-I      intronic
chr2:37380557(-) A-I      intronic
chr2:37370806(-) A-I      intronic
chr2:37380556(-) A-I      intronic
chr2:37335877(-) A-I      intronic
chr2:37383002(-) A-I      intronic
chr2:37335984(-) A-I      intronic
chr2:37379208(-) A-I      intronic
chr2:37355014(-) A-I      intronic
chr2:37372340(-) A-I      intronic
chr2:37350675(-) A-I      intronic
chr2:37369508(-) A-I      intronic
chr2:37370927(-) A-I      intronic
chr2:37372450(-) A-I      intronic
chr2:37335141(-) A-I      intronic
chr2:37378979(-) A-I      intronic
chr2:37383079(-) A-I      intronic
chr2:37371862(-) A-I      intronic
chr2:37379487(-) A-I      intronic
chr2:37338610(-) A-I      intronic
chr2:37357427(-) A-I      intronic
chr2:37366375(-) A-I      intronic
chr2:37350066(-) A-I      intronic
chr2:37370919(-) A-I      intronic
chr2:37345269(-) A-I      intronic
chr2:37381789(-) A-I      intronic
chr2:37370951(-) A-I      intronic
chr2:37366077(-) A-I      intronic
chr2:37381801(-) A-I      intronic
chr2:37371962(-) A-I      intronic
chr2:37352021(-) A-I      intronic
chr2:37346981(-) A-I      intronic
chr2:37344541(-) A-I      intronic
chr2:37370809(-) A-I      intronic
chr2:37350129(-) A-I      intronic
chr2:37362973(-) A-I      intronic
chr2:37381819(-) A-I      intronic
chr2:37371971(-) A-I      intronic
chr2:37370805(-) A-I      intronic
chr2:37382962(-) A-I      intronic
chr2:37343484(-) A-I      intronic
chr2:37380643(-) A-I      intronic
chr2:37371014(-) A-I      intronic
chr2:37343177(-) A-I      intronic
chr2:37369381(-) A-I      intronic
chr2:37364660(-) A-I      intronic
chr2:37355024(-) A-I      intronic
chr2:37364741(-) A-I      intronic
chr2:37370289(-) A-I      intronic
chr2:37369370(-) A-I      intronic
chr2:37365131(-) A-I      intronic
chr2:37344673(-) A-I      intronic
chr2:37382912(-) A-I      intronic
chr2:37359500(-) A-I      intronic
chr2:37369449(-) A-I      intronic
chr2:37359478(-) A-I      intronic
chr2:37345280(-) A-I      intronic
chr2:37381368(-) A-I      intronic
chr2:37371827(-) A-I      intronic
chr2:37380623(-) A-I      intronic
chr2:37379603(-) A-I      intronic
chr2:37371818(-) A-I      intronic
chr2:37372532(-) A-I      intronic
chr2:37344234(-) A-I      intronic
chr2:37335916(-) A-I      intronic
chr2:37381800(-) A-I      intronic
chr2:37346952(-) A-I      intronic
chr2:37370835(-) A-I      intronic
chr2:37379597(-) A-I      intronic
chr2:37350478(-) A-I      intronic
chr2:37372558(-) A-I      intronic
chr2:37371933(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED EIF2AK2
chr2:37339925(-) A-I intron -    15545495
chr2:37339926(-) A-I intron -    15545495
chr2:37339928(-) A-I intron -    15545495
chr2:37339934(-) A-I intron -    15545495
chr2:37339937(-) A-I intron -    15545495   //21960545
chr2:37339938(-) A-I intron -    15545495   //21960545
chr2:37339968(-) A-I intron -    15545495   //21960545
chr2:37339977(-) A-I intron -    15545495   //21960545
chr2:37339995(-) A-I intron -    15545495   //21960545   //22327324
chr2:37339999(-) A-I intron -    15545495
chr2:37340003(-) A-I intron -    15545495
chr2:37340011(-) A-I intron -    15545495
chr2:37340013(-) A-I intron -    15545495
chr2:37340036(-) A-I intron -    15545495   //22327324
chr2:37335877(-) A-I intron -    22327324
chr2:37340034(-) A-I intron -    22327324
chr2:37380812(-) A-I intron -    22327324
chr2:37380852(-) A-I intron -    21960545   //22327324
chr2:37338311(-) A-I intron -    21960545
chr2:37338460(-) A-I intron -    21960545
chr2:37339918(-) A-I intron -    21960545
chr2:37339919(-) A-I intron -    21960545
chr2:37339935(-) A-I intron -    21960545
chr2:37339960(-) A-I intron -    21960545
chr2:37380708(-) A-I intron -    21960545
chr2:37380756(-) A-I intron -    21960545
chr2:37338311(-) A-G intron -    22484847
chr2:37338326(-) A-G intron -    22484847
chr2:37338420(-) A-G intron -    22484847
chr2:37338460(-) A-G intron -    22484847
chr2:37339977(-) A-G intron -    22484847
chr2:37339995(-) A-G intron -    22484847
chr2:37340011(-) A-G intron -    22484847
chr2:37340034(-) A-G intron -    22484847
chr2:37340036(-) A-G intron -    22484847
chr2:37380812(-) A-G intron -    22484847
chr2:37380813(-) A-G intron -    22484847
chr2:37380852(-) A-G intron -    22484847
chr2:37333961(-) A-C exon 3'UTR    22484847
chr2:37334181(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr2:37334182(-) G-A exon 3'UTR    22484847
chr2:37334185(-) A-T exon 3'UTR    22484847
chr2:37335067(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335177(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335837(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335841(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335850(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335877(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335916(-) A-G intron -    22484847
chr2:37335944(-) A-G intron -    22484847
chr2:37338639(-) A-G intron -    22484847
chr2:37344486(-) T-C intron -    22484847
chr2:37345269(-) A-G intron -    22484847
chr2:37345272(-) A-G intron -    22484847
chr2:37345397(-) A-G intron -    22484847
chr2:37345465(-) T-A intron -    22484847
chr2:37345466(-) A-T intron -    22484847
chr2:37346873(-) A-G intron -    22484847
chr2:37346952(-) A-G intron -    22484847
chr2:37346981(-) A-G intron -    22484847
chr2:37347001(-) A-G intron -    22484847
chr2:37347010(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350066(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350129(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350203(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350264(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350477(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350478(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350534(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350657(-) A-G intron -    22484847
chr2:37350675(-) A-G intron -    22484847
chr2:37353928(-) G-A intron -    22484847
chr2:37353943(-) A-G intron -    22484847
chr2:37365981(-) A-G intron -    22484847
chr2:37369381(-) A-G intron -    22484847
chr2:37370250(-) A-G intron -    22484847
chr2:37370288(-) A-G intron -    22484847
chr2:37370289(-) A-G intron -    22484847
chr2:37370776(-) A-G intron -    22484847
chr2:37370806(-) A-G intron -    22484847
chr2:37370835(-) A-G intron -    22484847
chr2:37371840(-) A-G intron -    22484847
chr2:37371862(-) A-G intron -    22484847
chr2:37371933(-) A-G intron -    22484847
chr2:37371971(-) A-G intron -    22484847
chr2:37373007(-) A-G intron -    22484847
chr2:37378959(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379487(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379510(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379531(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379597(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379601(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379602(-) A-G intron -    22484847
chr2:37379603(-) A-G intron -    22484847
chr2:37380557(-) A-G intron -    22484847
chr2:37381368(-) A-G intron -    22484847
chr2:37381465(-) A-G intron -    22484847
chr2:37381800(-) A-G intron -    22484847
chr2:37381819(-) A-G intron -    22484847
chr2:37381898(-) A-G intron -    22484847
chr2:37381899(-) A-G intron -    22484847
chr2:37382912(-) A-G intron -    22484847
chr2:37382936(-) A-G intron -    22484847
chr2:37382962(-) A-G intron -    22484847
chr2:37382976(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383001(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383002(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383008(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383027(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383050(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383069(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383077(-) A-G intron -    22484847
chr2:37383079(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase EIF2AK2
chr2:37326356-37326357(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37326480-37326481(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37326721-37326722(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37327157-37327158(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37328215-37328216(-) m6A 3'UTR       24981863
chr2:37328220-37328221(-) m6A 3'UTR       24981863
chr2:37328231-37328232(-) m6A 3'UTR       24981863
chr2:37328246-37328247(-) m6A 3'UTR       24981863
chr2:37328275-37328276(-) m6A 3'UTR       -
chr2:37328305-37328306(-) m6A 3'UTR       -
chr2:37330189-37330190(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37330208-37330209(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37331678-37331679(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37332334-37332335(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37332364-37332365(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37332376-37332377(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37332438-37332439(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37332521-37332522(-) m6A 3'UTR       -
chr2:37332536-37332537(-) m6A 3'UTR       -
chr2:37332938-37332939(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37332956-37332957(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37333072-37333073(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37333219-37333220(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37333308-37333309(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37333327-37333328(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37333349-37333350(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37333416-37333417(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37333432-37333433(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr2:37333484-37333485(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37333981-37333982(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:37336406-37336407(-) m6A CDS//exon       22575960
chr2:37336424-37336425(-) m6A CDS//exon       22575960
chr2:37341876-37341877(-) m6A CDS       27773535
chr2:37341899-37341900(-) m6A CDS       27773535
chr2:37341914-37341915(-) m6A CDS       27773535
chr2:37341948-37341949(-) m6A CDS       27773535
chr2:37341955-37341956(-) m6A CDS       24981863
chr2:37341972-37341973(-) m6A CDS       24981863
chr2:37347161-37347162(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37347170-37347171(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37347189-37347190(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37347194-37347195(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37347224-37347225(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37347232-37347233(-) m6A CDS       27773535
chr2:37347274-37347275(-) m6A CDS       27773535
chr2:37349666-37349667(-) m6A CDS       27773535
chr2:37353465-37353466(-) m6A CDS//intron       27773535
chr2:37353484-37353485(-) m6A CDS//intron       27773535
chr2:37362632-37362633(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37362648-37362649(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr2:37363930-37363931(-) m6A exon//intron       27773535
chr2:37363988-37363989(-) m6A exon//intron       27773535
chr2:37366875-37366876(-) m6A CDS//exon       27773535
chr2:37368727-37368728(-) m6A CDS//exon       27773535
chr2:37368745-37368746(-) m6A CDS//exon       27773535
chr2:37384112-37384113(-) m6A 5'UTR       24981863
chr2:37384119-37384120(-) m6A 5'UTR       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-1343-3p
Exosome Plasma     23663360
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
EIF2AK2
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)     -
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Colon cancer cells     24393600
Nucleus HCC cell line (HepG2)     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-1343-3p
Interactor2: EIF2AK2

Evidence Support:


Weak-Evidence RNA-Seq
Prediction-Evidence miRDB//miRTarBase//miRWalk//Targetscan
Support Database ViRBase

References:


PMID 32232013 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line HUVEC cells Interactor2 expression Upregulation
Description Then we predicted 320 target genes of these 16 DE miRNAs and constructed a miRNA-mRNA interaction network (Figure 5B, Table S5).

Starting a new search, please wait ...