Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00025893

  Virus:  

Hantaan orthohantavirus (Hantaan virus 76-118)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.6040

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-3182:  MIMAT0015062          SP100:  NM_001080391     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-3182	SP100
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0015062	6672
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	lysp100b

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-3182	rs1367036983 chr16:83508358    G/A rs564683390 chr16:83508360    G/A rs923654044 chr16:83508365    C/T

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	SP100	chr2:231389471(+) A-I      intronic chr2:231389492(+) A-I      intronic chr2:231389494(+) A-I      intronic chr2:231389495(+) A-I      intronic chr2:231389502(+) A-I      intronic chr2:231389512(+) A-I      intronic chr2:231388556(+) A-I      intronic chr2:231383247(+) A-I      intronic chr2:231388503(+) A-I      intronic chr2:231387219(+) A-I      intronic chr2:231388545(+) A-I      intronic chr2:231389516(+) A-I      intronic chr2:231389517(+) A-I      intronic chr2:231389538(+) A-I      intronic chr2:231389552(+) A-I      intronic chr2:231389585(+) A-I      intronic chr2:231383226(+) A-I      intronic chr2:231393678(+) A-I      intronic chr2:231397724(+) A-I      intronic chr2:231388474(+) A-I      intronic chr2:231387630(+) A-I      intronic chr2:231387604(+) A-I      intronic chr2:231387425(+) A-I      intronic chr2:231382290(+) A-I      intronic chr2:231388143(+) A-I      intronic chr2:231365779(+) A-I      intronic chr2:231365778(+) A-I      intronic chr2:231365771(+) A-I      intronic chr2:231387353(+) A-I      intronic chr2:231383258(+) A-I      intronic chr2:231389287(+) A-I      intronic chr2:231388132(+) A-I      intronic chr2:231388135(+) A-I      intronic chr2:231389291(+) A-I      intronic chr2:231389013(+) A-I      intronic chr2:231389006(+) A-I      intronic chr2:231389005(+) A-I      intronic chr2:231389003(+) A-I      intronic chr2:231388991(+) A-I      intronic chr2:231388980(+) A-I      intronic chr2:231388589(+) A-I      intronic chr2:231388544(+) A-I      intronic chr2:231388153(+) A-I      intronic chr2:231383248(+) A-I      intronic chr2:231383254(+) A-I      intronic chr2:231388423(+) A-I      intronic chr2:231393685(+) A-I      intronic chr2:231393717(+) A-I      intronic chr2:231393732(+) A-I      intronic chr2:231383469(+) A-I      intronic chr2:231383472(+) A-I      intronic chr2:231383488(+) A-I      intronic chr2:231388509(+) A-I      intronic chr2:231383489(+) A-I      intronic chr2:231383504(+) A-I      intronic chr2:231383512(+) A-I      intronic chr2:231389208(+) A-I      intronic chr2:231389218(+) A-I      intronic chr2:231388463(+) A-I      intronic chr2:231388466(+) A-I      intronic chr2:231393670(+) A-I      intronic chr2:231389220(+) A-I      intronic chr2:231389232(+) A-I      intronic chr2:231389237(+) A-I      intronic chr2:231393658(+) A-I      intronic chr2:231389238(+) A-I      intronic chr2:231389239(+) A-I      intronic chr2:231389256(+) A-I      intronic chr2:231389467(+) A-I      intronic chr2:231389258(+) A-I      intronic chr2:231389265(+) A-I      intronic chr2:231389271(+) A-I      intronic chr2:231389279(+) A-I      intronic chr2:231388167(+) A-I      intronic chr2:231388149(+) A-I      intronic chr2:231388148(+) A-I      intronic chr2:231388127(+) A-I      intronic chr2:231387766(+) A-I      intronic chr2:231387765(+) A-I      intronic chr2:231387752(+) A-I      intronic chr2:231387739(+) A-I      intronic chr2:231387710(+) A-I      intronic chr2:231387695(+) A-I      intronic chr2:231387679(+) A-I      intronic chr2:231387669(+) A-I      intronic chr2:231387663(+) A-I      intronic chr2:231387659(+) A-I      intronic chr2:231387656(+) A-I      intronic chr2:231387647(+) A-I      intronic chr2:231387483(+) A-I      intronic chr2:231387477(+) A-I      intronic chr2:231387464(+) A-I      intronic chr2:231387394(+) A-I      intronic chr2:231387388(+) A-I      intronic chr2:231387385(+) A-I      intronic chr2:231387365(+) A-I      intronic chr2:231387304(+) A-I      intronic chr2:231387284(+) A-I      intronic chr2:231387278(+) A-I      intronic chr2:231387268(+) A-I      intronic chr2:231387259(+) A-I      intronic chr2:231387247(+) A-I      intronic chr2:231387243(+) A-I      intronic chr2:231382388(+) A-I      intronic chr2:231382386(+) A-I      intronic chr2:231382334(+) A-I      intronic chr2:231382315(+) A-I      intronic chr2:231377255(+) A-I      intronic chr2:231377130(+) A-I      intronic chr2:231376694(+) A-I      intronic chr2:231376682(+) A-I      intronic chr2:231376681(+) A-I      intronic chr2:231376646(+) A-I      intronic chr2:231376603(+) A-I      intronic chr2:231366687(+) A-I      intronic chr2:231366683(+) A-I      intronic chr2:231365877(+) A-I      intronic chr2:231365867(+) A-I      intronic chr2:231360219(+) A-I      intronic chr2:231360195(+) A-I      intronic chr2:231360174(+) A-I      intronic chr2:231343669(+) A-I      intronic chr2:231343640(+) A-I      intronic chr2:231343636(+) A-I      intronic chr2:231342514(+) A-I      intronic chr2:231326680(+) A-I      intronic chr2:231326599(+) A-I      intronic chr2:231326430(+) A-I      intronic chr2:231326409(+) A-I      intronic chr2:231293419(+) A-I      intronic chr2:231293348(+) A-I      intronic chr2:231293339(+) A-I      intronic chr2:231293315(+) A-I      intronic chr2:231293297(+) A-I      intronic chr2:231293287(+) A-I      intronic chr2:231293275(+) A-I      intronic chr2:231293227(+) A-I      intronic chr2:231292902(+) A-I      intronic chr2:231292858(+) A-I      intronic chr2:231292850(+) A-I      intronic chr2:231292835(+) A-I      intronic chr2:231292705(+) A-I      intronic chr2:231292674(+) A-I      intronic chr2:231292668(+) A-I      intronic chr2:231292049(+) A-I      intronic chr2:231292042(+) A-I      intronic chr2:231292034(+) A-I      intronic chr2:231292018(+) A-I      intronic chr2:231292016(+) A-I      intronic chr2:231291981(+) A-I      intronic chr2:231291980(+) A-I      intronic chr2:231291977(+) A-I      intronic chr2:231366701(+) A-I      intronic chr2:231401949(+) A-I      intronic chr2:231401899(+) A-I      intronic chr2:231401894(+) A-I      intronic chr2:231401893(+) A-I      intronic chr2:231401859(+) A-I      intronic chr2:231401753(+) A-I      intronic chr2:231401745(+) A-I      intronic chr2:231401744(+) A-I      intronic chr2:231401723(+) A-I      intronic chr2:231400359(+) A-I      intronic chr2:231399078(+) A-I      intronic chr2:231398968(+) A-I      intronic chr2:231398967(+) A-I      intronic chr2:231398943(+) A-I      intronic chr2:231398922(+) A-I      intronic chr2:231398876(+) A-I      intronic chr2:231398867(+) A-I      intronic chr2:231397778(+) A-I      intronic chr2:231397770(+) A-I      intronic chr2:231397757(+) A-I      intronic chr2:231397679(+) A-I      intronic chr2:231397670(+) A-I      intronic chr2:231397662(+) A-I      intronic chr2:231397599(+) A-I      intronic chr2:231389050(+) A-I      intronic chr2:231389021(+) A-I      intronic chr2:231389020(+) A-I      intronic chr2:231388986(+) A-I      intronic chr2:231388983(+) A-I      intronic chr2:231388977(+) A-I      intronic chr2:231388964(+) A-I      intronic chr2:231388956(+) A-I      intronic chr2:231388951(+) A-I      intronic chr2:231388928(+) A-I      intronic chr2:231388924(+) A-I      intronic chr2:231388888(+) A-I      intronic chr2:231388887(+) A-I      intronic chr2:231388873(+) A-I      intronic chr2:231388863(+) A-I      intronic chr2:231388862(+) A-I      intronic chr2:231388808(+) A-I      intronic chr2:231388794(+) A-I      intronic chr2:231388793(+) A-I      intronic chr2:231388600(+) A-I      intronic chr2:231388599(+) A-I      intronic chr2:231388576(+) A-I      intronic chr2:231388569(+) A-I      intronic chr2:231388536(+) A-I      intronic chr2:231388533(+) A-I      intronic chr2:231388530(+) A-I      intronic chr2:231388526(+) A-I      intronic chr2:231388525(+) A-I      intronic chr2:231388517(+) A-I      intronic chr2:231388504(+) A-I      intronic chr2:231388501(+) A-I      intronic chr2:231388485(+) A-I      intronic chr2:231388477(+) A-I      intronic chr2:231388473(+) A-I      intronic chr2:231388472(+) A-I      intronic chr2:231388465(+) A-I      intronic chr2:231388464(+) A-I      intronic chr2:231388462(+) A-I      intronic chr2:231388374(+) A-I      intronic chr2:231388172(+) A-I      intronic chr2:231399033(+) A-I      intronic chr2:231376661(+) A-I      intronic chr2:231398859(+) A-I      intronic chr2:231398868(+) A-I      intronic chr2:231376850(+) A-I      intronic chr2:231398950(+) A-I      intronic chr2:231399010(+) A-I      intronic chr2:231398970(+) A-I      intronic chr2:231366637(+) A-I      intronic chr2:231376633(+) A-I      intronic chr2:231398971(+) A-I      intronic chr2:231398935(+) A-I      intronic chr2:231389019(+) A-I      intronic chr2:231398964(+) A-I      intronic chr2:231387321(+) A-I      intronic chr2:231388369(+) A-I      intronic chr2:231292799(+) A-I      intronic chr2:231397576(+) A-I      intronic chr2:231376630(+) A-I      intronic chr2:231376601(+) A-I      intronic chr2:231333545(+) A-I      intronic chr2:231293232(+) A-I      intronic chr2:231398956(+) A-I      intronic chr2:231398994(+) A-I      intronic chr2:231399023(+) A-I      intronic chr2:231388414(+) A-I      intronic chr2:231388568(+) A-I      intronic chr2:231342530(+) A-I      intronic chr2:231376605(+) A-I      intronic chr2:231292886(+) A-I      intronic chr2:231377144(+) A-I      intronic chr2:231365703(+) A-I      intronic chr2:231397625(+) A-I      intronic chr2:231341685(+) A-I      intronic chr2:231330740(+) A-I      intronic chr2:231387343(+) A-I      intronic chr2:231382271(+) A-I      intronic chr2:231387345(+) A-I      intronic chr2:231357957(+) A-I      intronic chr2:231397758(+) A-I      intronic chr2:231292861(+) A-I      intronic chr2:231293431(+) A-I      intronic chr2:231382359(+) A-I      intronic chr2:231341674(+) A-I      intronic chr2:231387257(+) A-I      intronic chr2:231375248(+) A-I      intronic chr2:231399006(+) A-I      intronic chr2:231382369(+) A-I      intronic chr2:231343600(+) A-I      intronic chr2:231342527(+) A-I      intronic chr2:231387370(+) A-I      intronic chr2:231388438(+) A-I      intronic chr2:231398974(+) A-I      intronic chr2:231293364(+) A-I      intronic chr2:231341714(+) A-I      intronic chr2:231376765(+) A-I      intronic chr2:231387465(+) A-I      intronic chr2:231382408(+) A-I      intronic chr2:231382333(+) A-I      intronic chr2:231397596(+) A-I      intronic chr2:231292736(+) A-I      intronic chr2:231366688(+) A-I      intronic chr2:231376711(+) A-I      intronic chr2:231382419(+) A-I      intronic chr2:231333337(+) A-I      intronic chr2:231388124(+) A-I      intronic chr2:231366632(+) A-I      intronic chr2:231382206(+) A-I      intronic chr2:231376856(+) A-I      intronic chr2:231376651(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	SP100	chr2:231377610(+) A-I intron -    22327324 chr2:231387257(+) A-I intron -    22327324 chr2:231388568(+) A-I intron -    22327324 chr2:231389250(+) A-I intron -    22327324 chr2:231389470(+) A-I intron -    22327324 chr2:231389580(+) A-I intron -    22327324 chr2:231389584(+) A-I intron -    22327324 chr2:231389587(+) A-I intron -    22327324 chr2:231389592(+) A-I intron -    22327324 chr2:231397596(+) A-I intron -    22327324 chr2:231398974(+) A-I intron -    22028664   //22327324 chr2:231399000(+) A-I intron -    22028664   //22327324 chr2:231398859(+) A-I intron -    22028664 chr2:231398868(+) A-I intron -    22028664 chr2:231398935(+) A-I intron -    22028664 chr2:231398950(+) A-I intron -    22028664 chr2:231398956(+) A-I intron -    22028664 chr2:231398964(+) A-I intron -    22028664 chr2:231398970(+) A-I intron -    22028664 chr2:231398971(+) A-I intron -    22028664 chr2:231398994(+) A-I intron -    22028664 chr2:231399010(+) A-I intron -    22028664 chr2:231399023(+) A-I intron -    22028664 chr2:231399033(+) A-I intron -    22028664 chr2:231378559(+) A-I intron -    21960545 chr2:231378565(+) A-I intron -    21960545 chr2:231381523(+) A-I intron -    21960545 chr2:231382827(+) A-I intron -    21960545 chr2:231383447(+) A-I intron -    21960545 chr2:231383512(+) A-I intron -    21960545 chr2:231350947(+) C-T intron -    22484847 chr2:231377610(+) A-G intron -    22484847 chr2:231378559(+) A-G intron -    22484847 chr2:231292060(+) A-G intron -    22484847 chr2:231292691(+) A-G intron -    22484847 chr2:231292736(+) A-G intron -    22484847 chr2:231292760(+) A-G intron -    22484847 chr2:231292799(+) A-G intron -    22484847 chr2:231292825(+) A-G intron -    22484847 chr2:231292861(+) A-G intron -    22484847 chr2:231292886(+) A-G intron -    22484847 chr2:231292894(+) A-G intron -    22484847 chr2:231293364(+) A-G intron -    22484847 chr2:231293431(+) A-G intron -    22484847 chr2:231329644(+) C-T intron -    22484847 chr2:231329756(+) T-G intron -    22484847 chr2:231337142(+) C-A intron -    22484847 chr2:231341654(+) T-C intron -    22484847 chr2:231341674(+) A-G intron -    22484847 chr2:231341685(+) A-G intron -    22484847 chr2:231341714(+) A-G intron -    22484847 chr2:231342527(+) A-G intron -    22484847 chr2:231342529(+) A-G intron -    22484847 chr2:231342530(+) A-G intron -    22484847 chr2:231343600(+) A-G intron -    22484847 chr2:231357957(+) A-G intron -    22484847 chr2:231365696(+) A-G intron -    22484847 chr2:231365703(+) A-G intron -    22484847 chr2:231365834(+) A-G intron -    22484847 chr2:231365836(+) A-G intron -    22484847 chr2:231366632(+) A-G intron -    22484847 chr2:231366637(+) A-G intron -    22484847 chr2:231366688(+) A-G intron -    22484847 chr2:231376601(+) A-G intron -    22484847 chr2:231376605(+) A-G intron -    22484847 chr2:231376630(+) A-G intron -    22484847 chr2:231376633(+) A-G intron -    22484847 chr2:231376651(+) A-G intron -    22484847 chr2:231376661(+) A-G intron -    22484847 chr2:231376711(+) A-G intron -    22484847 chr2:231376789(+) C-T intron -    22484847 chr2:231376850(+) A-G intron -    22484847 chr2:231377144(+) A-G intron -    22484847 chr2:231377246(+) A-C intron -    22484847 chr2:231382206(+) A-G intron -    22484847 chr2:231382208(+) A-G intron -    22484847 chr2:231382271(+) A-G intron -    22484847 chr2:231382333(+) A-G intron -    22484847 chr2:231382359(+) A-G intron -    22484847 chr2:231382408(+) A-G intron -    22484847 chr2:231382419(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	SP100	chr2:231305239-231305240(+) m6A 5'UTR//intron       24209618 chr2:231305266-231305267(+) m6A 5'UTR//intron       24209618 chr2:231307665-231307666(+) m6A CDS       24209618 chr2:231314263-231314264(+) m6A exon//intron       24981863 chr2:231314297-231314298(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:231314319-231314320(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:231314324-231314325(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:231314388-231314389(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:231314396-231314397(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:231314896-231314897(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:231338124-231338125(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:231339126-231339127(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr2:231339145-231339146(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr2:231358530-231358531(+) m6A exon//intron       24981863//27773535 chr2:231358602-231358603(+) m6A exon//intron       24981863 chr2:231358619-231358620(+) m6A exon//intron       24981863 chr2:231363187-231363188(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr2:231363200-231363201(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr2:231367799-231367800(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr2:231369000-231369001(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:231371019-231371020(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:231379800-231379801(+) m6A intron       - chr2:231379828-231379829(+) m6A CDS//intron       - chr2:231379887-231379888(+) m6A CDS//intron       24981863 chr2:231379936-231379937(+) m6A CDS//intron       24981863 chr2:231380120-231380121(+) m6A CDS//intron       - chr2:231380318-231380319(+) m6A CDS//intron       24981863//27773535 chr2:231380435-231380436(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr2:231380448-231380449(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr2:231380470-231380471(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr2:231407749-231407750(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr2:231407793-231407794(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr2:231408540-231408541(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr2:231408585-231408586(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr2:231408619-231408620(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr2:231408647-231408648(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr2:231408684-231408685(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr2:231408693-231408694(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr2:231408717-231408718(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr2:231408752-231408753(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr2:231408770-231408771(+) m6A 3'UTR//exon       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-3182	Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Cell lines(GBM46|GBM8|HaCaT|K562|MCF-10A|MCF-7|MGG75)|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocytes     -
	SP100	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-3182
Interactor2: SP100

Evidence Support:

Weak-Evidence	RNA-Seq
Prediction-Evidence	miRDB//miRTarBase//miRWalk//Targetscan
Support Database	ViRBase

References:

PMID	32232013	Target region	None
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	HUVEC cells	Interactor2 expression	Upregulation
Description	Then we predicted 320 target genes of these 16 DE miRNAs and constructed a miRNA-mRNA interaction network (Figure 5B, Table S5).