Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
---|---|---|
Symbol | hsa-miR-654-3p | CSF1 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0004814 | 1435 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | CSF-1//MCSF |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
miRNASNP-v3 | hsa-miR-654-3p |
|
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RADAR | CSF1 |
|
Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID |
---|---|---|---|---|---|---|
DARNED | CSF1 |
Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RMBase | CSF1 |
|
Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RNALocate | hsa-miR-654-3p |
|
|||||||||||
CSF1 |
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RNAInter | hsa-miR-654-3p |
|
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
---|---|---|---|
RNAactDrug | hsa-miR-654-3p |
Interactor1: hsa-miR-654-3p | Interactor2: CSF1 |
---|
Weak-Evidence | RNA-Seq | |
---|---|---|
Prediction-Evidence | miRDB//miRTarBase//miRWalk//Targetscan | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 32232013 | Target region | None |
---|---|---|---|
Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | HUVEC cells | Interactor2 expression | Upregulation |
Description | Then we predicted 320 target genes of these 16 DE miRNAs and constructed a miRNA-mRNA interaction network (Figure 5B, Table S5). |